2NRZA

Crystal structure of the c-terminal half of uvrc bound to its catalytic divalent cation
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
RGLRKEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHLQGKYTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIEQDHPDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLAKKEETVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSYHRKRREKESLRSVLDNVPGIGPIRKKKLIEHFGSLENIRSASLEEIARVIGSTEIARRVLDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
molecule keywords UvrABC system protein C
total genus 76
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain 2nrzA02
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrzA01
4KLSA 2Y1JA 2KFZA 1U47A 2AQ0A 3C2MA 4PGXA 5D4BA 4YVZA 3OHBA 9ICGA 5KT5A 1BPEA 3RJJA 4KLHA 1UA0A 2JZBA 5HMMA 2DPJA 4RT3A 4MFFA 4O3SA 2P66A 2W8LA 3N4MB 4ECTA 5CP2A 4DOBA 4ELTA 3UXOA 3RTVA 2HHVA 1T4GA 3Q8PB 3TFSA 2BPGA 1KFTA 2XGQA 5J2AA 5KFVA 2WTFA 4MEXA 5DBAA 3KHHA 2PXIA 3RBDA 1NK5A 2P6RA 4M0AA 7ICJA 3MR5A 4MEYA 5J2FA 3T5HA 3NGDA 2R8KA 4O0IA 4QW8A 1ZQPA 5J2KA 4FBTA 3BQ1A 3SV4A 1NK7A 1S0NA 1Z00B 3GQCA 4C8MA 3V6HA 1RZTA 1XSPA 1SKWA 4B9TA 4M9GA 3MR3A 5EWGA 4M9NA 2KZMA 3IHQB 2JZBB 4J9MA 2BPFA 1T8EA 2FLNA 4DL2A 2V4RA 1NJZA 1S10A 1MQ2A 8ICNA 1L5UA 3PX6A 3B0XA 4NY8A 5KFEA 4DFKA 1KDHA 1S0MA 1BGXT 3C5FA 1QTMA 2IA6A 5KFRA 1NK6A 3C21A 1NK0A 1BPZA 5DG8A 3V7JA 2BPCA 9ICAA 4Z6CA 1BPDA 1DOQA 4LZGA 7ICNA 4Q8EA 4RQ7A 9ICCA 4RUAA 3UXPA 9ICIA 3IM1A 1KLNA 4I29A 9ICHA 4XRHA 1CEZA 3M9MB 2R8JA 5DGBA 1ZJNA 1UA1A 1TK5A 3M8RA 3RAQA 1ZQDA 1L3UA 2F1HA 2Q0ZX 3NTUA 3M8SA 3GIMA 1U9LA 3B0YA 5DQGA 4O5EA 5J0WA 5J2CA 4O5KA 4ECRA 5CHGA 3KHGA 2NRWA 1U4BA 3JPQA 1D8YA 4CCHA 3PMLA 3ISBA 5KFQA 5KG4A 3ZDBA 4KLIA 4JWNA 1L3SA 3RR8A 1ZQVA 5L1KA 1JN3A 2PFOA 5DQHA 4YN4A 5DB9A 3RJKA 2NRVA 4PHDA 3LK9A 3PX4A 1H38A 3UXNA 1LV5A 2J6SA 3RB3A 7ICGA 4JUZA 5IIIA 1N56A 2W8KA 4DQQA 8ICEA 4MFAA 3ISCA 5KG2A 2JEJA 8ICPA 4QWCA 3LWLA 4RNNA 4QWEA 1A76A 1WCNA 3GILA 4QWDA 1ZQSA 5IIMA 1KFSA 2PFQA 3PMNA 4TQSA 2FPLA 2J6TA 2PFPA 4O9MA 3C23A 5KFKA 4DF8A 4RQ6A 3MFIA 4C8LA 3G6VA 4MF2A 4J9KA 3ZDAA 4DSJA 3V7KA 3V6JA 5DDMA 4DFMA 3Q8SB 4B9LA 1A77A 3T3FA 4B9SA 1ZYQA 4M2YA 2I9GA 1NJXA 1RXVA 3G6YA 1BPYA 5EOZA 5KT3A 5KFNA 2HHXA 5L1JA 8ICRA 4EYHB 4YMNA 2ASLA 1ZQRA 3PW2A 4O3NA 9ICBA 8ICGA 2UVWA 3PY8A 4DWIA 1UT8A 2KZ3A 2ZUDA 2ZJ8A 4R64A 2HVHA 3BQTA 4FO6A 4PGYA 3V72A 4YXMA 3JPTA 4P2HA 4B9NA 4YR3A 5DGAA 3RRGA 4UB2A 2R8GA 4F2RA 5J0UA 2ALZA 1KEJA 4J9QA 8ICLA 3OJSA 3C1ZA 3JPOA 5J0XA 8ICMA 1KTQA 3EZ5A 1TK0A 3FDSA 2PI5A 3PNCA 1ZQOA 3TAPA 3K4GA 4I2IA 1NOMA 3PR5B 1XO1A 4YXJA 5IIKA 4J9NA 3QEBZ 4K4HA 3H4DA 2HVIA 5BOMA 4GXKA 2ISOA 4I2BA 5HMLA 1QSLA 4KLQA 3OSNA 1X9MA 9ICRA 4X5VA 8ICVA 1BVSA 5EWEA 1RYRA 4I2AA 5KFJA 3G6XA 5DLGA 1SL0A 4J9SA 4Z6DA 1HUOA 2BQRA 4E0DA 5HHHA 1U48A 9ICVA 3GIJA 4I2JA 2ASDA 4M6WB 1TVAA 4KITB 4R63A 1JXEA 8ICBA 3RJIA 3K75D 1X9SA 2W9AA 4DO9A 2JEGA 2XY7A 4ELUA 4Q8FA 4YD2A 2BKEA 4TUQA 4ECZA 5D46A 4I2CA 8ICAA 1S77D 3GV7B 2FMSA 2JEIA 8ICKA 5C5JA 2FMQA 4PHAA 4EBCA 1U49A 3PV8A 2XY6A 4PH5A 5KFCA 5KFYA 1ZJMA 1QLNA 5CJ7A 3RB0A 4KLTA 4ED2A 4RQ2A 3RB6A 2FPKA 4F93B 4QZDA 5BOLA 3EW9A 4IQWA 2NRRA 5KFZA 5J0SA 4RQ1A 4QZBA 2H5XA 1ZQEA 7ICVA 4DEZA 4HYKA 4KLMA 5IILA 2W9CA 4IR9A 4DS5A 4I28A 1UT5A 7ICQA 4JV1A 4J9RA 5CB1A 2V9WA 3HPOA 4Z6EA 5DKWA 2XCPA 4KLJA 8ICXA 4ELVA 3GDXA 5J2DA 4EBDA 4QZGA 4DS4A 1ZQBA 2BDPA 1ZQUA 1SL2A 2FMPA 5J0YA 1BPBA 1JIHA 5DDYA 3AUOA 3SI8A 1HJPA 1B22A 5J0RA 2XCAA 1KSPA 3GIIA 2IHMA 4RUCA 3ETLA 4DL4A 3RJFA 4BDPA 4TQRA 4DL7A 1X9WA 1LB2B 4IQTA 4DOAA 2ZTEA 4C8NA 4BWJA 9ICWA 8ICCA 2HHSA 1S76D 1U45A 4DLEA 4DF4A 8ICFA 4F4KA 5KFOA 4KN4A 1DGSA 1ZQHA 7ICLA 9ICMA 5KG5A 4QZFA 3LWMA 2XGPA 3V7LA 2C2DA 1JX4A 2VA8A 7ICFA 1Z3EB 1TFRA 4ECVA 4IQUA 4F91B 2FPMA 3MR2A 3AU6A 5KT7A 1ZQYA 3C1YA 4NLZA 4F4YA 4JK1A 3M9NB 1ZQMA 4YR2A 3UPQA 2UVUA 5DB8A 4F5RA 4FS2A 2XC9A 2W9MA 4RPZA 3RH6A 4F4WA 3RAXA 8ICZA 4RU9A 2BCUA 4DQPA 4ED6A 4YP3A 1NJYA 1NKEA 1ZQFA 4KLDA 3ZDEA 2B21A 5KFBA 3QE9Y 2ISPA 1KFDA 2ZJ5A 3H8SA 1K1SA 4RZRA 4GC6A 9ICKA 2W9BA 2BCSA 9ICUA 4YQWA 4B9MA 1D9DA 4NLNA 1ZQIA 3JPNA 3SZ2A 5HHIA 5KG0A 4RPXA 5L9XA 2VANA 2DPIA 8ICIA 4XA5A 2AGPA 5JUMA 1NKBA 4R66A 5KFLA 3PW4A 4I2GA 2HHWA 4QW9A 1S97A 3T5LA 3LDAA 1ZQXA 2A1JA 4PHPA 1NK4A 2BCRA 2ZJAA 1QSYA 1AROP 3BQ2A 4DQSA 1JXLA 5BPCA 1QSSA 9ICNA 1D8LA 4F4ZA 2KZZA 4NM2A 1TV9A 5J2JA 1NJWA 4F5OA 3PX0A 4UB4A 4F8RA 4C8KA 3V6KA 4RQ4A 1PZNA 2ZUCA 3TQ1A 2W9BB 4I27A 4M47A 3MBYA 5DQIA 4ED7A 3EPIA 4EBEA 3PW0A 2BGWA 1ZQQA 8ICTA 1NK8A 3SV3A 1ZETA 1IXRA 9ICEA 7ICMA 2HHUA 4Q43A 4NLKA 4UBBA 5KFTA 5KFAA 2AGOA 4ED1A 3KTQA 1EXNA 4M9JA 4BGDA 3ORYA 4P4OA 5J0OA 2A1JB 5IIOA 9ICOA 5CA7A 2DFLA 4M04A 4K4GA 3KHRA 2MUTA 4UBCA 9ICLA 4O3OA 3UQ0A 5KFDA 3M9OB 7ICIA 4F4XA 2BCVA 2JEFA 1NKCA 4GC7A 5KT6A 2C28A 2R8IA 2PFNA 4ECWA 8ICQA 2HHTA 4JV0A 5KFGA 5TZVA 3GV8B 3EPGA 4KTQA 7ICOA 4KLUA 4RQ0A 2C22A 4ZH4A 1BPXA 4DSIA 4PHEA 4I2FA 3Q8QB 2M9NA 3TFRA 4RQ5A 5HP4A 3RRHA 5DB6A 4F50A 4QZAA 3PR4A 1TAUA 1COOA 4FS1A 2I1QA 2RDJA 1ZQCA 7ICPA 4ED3A 4IRCA 1S9FA 5L1LA 1RXWA 4DSLA 3RH5A 1N48A 4NM1A 3BJYA 4EZ9A 4IRKA 3JPPA 1T3NA 1HUZA 1ZQJA 2KTQA 4R8UA 1NK9A 1XSNA 4DOCA 2AU0A 1Z00A 1TAQA 5J0PA 4UB3A 4QWAA 2ATLA 4F3OA 2BR0A 4ECYA 3Q8RB 4QWBA 4O3PA 5F9NA 1ZQKA 3PW5A 4ECSA 4BXOA 5J2EA 7ICEA 4UQGA 2BCQA 4PPXA 4RNMA 1CUKA 9ICSA 8ICHA 4ECXA 4KMUA 4MF8A 5J29A 4DSFA 3H7IA 4Z6FA 5DBCA 3RH4A 5J2IA 5J0TA 4ED0A 3H40A 5KG3A 2OWOA 4RNOA 5CR0A 2NRXA 2NRZA 4UAWA 4DFJA 5DG7A 4EEYA 3QZ8A 5KG6A 4KLOA 4RQ3A 1IM4A 2UVRA 3E2EA 3EWAA 5J2HA 4M9HA 3GFKB 3HX0A 3OJUA 8ICUA 2P6UA 4R8UB 4LZDA 4IQVA 5DB7A 5D49A 5KG7A 1TKDA 1C7YA 2XO7A 3THVA 4K4IA 5KFWA 1XS9D 3RR7A 3ISDA 4BXOB 4Q45A 3HP6A 4I2DA 2AQ4A 5KFXA 4O3RA 7ICHA 9ICTA 2VA3A 3PO4A 5DBBA 2AGQA 3BDPA 8ICYA 2HW3A 2Y1IA 2W9CB 4C8OA 1ZQTA 4YMMA 3RJEA 2RDIA 3T5JA 3Q8MA 4UAZA 4I2EA 5EWFA 3OSPA 1SKSA 4QZIA 1ZQZA 1KRPA 4TUPA 3MDCA 2AJQA 3BQ0A 2C2EA 3SYZA 4F5PA 4F5QA 5KFHA 4RQ8A 3RBEA 9ICQA 3OGUA 3PVXA 5KFMA 5KT2A 5J2BA 2ASJA 2FLLA 4QZHA 4XQ8A 4RT2A 3TARA 4EZ6A 1Y88A 4XUSA 2BQ3A 2GWSA 4M9LA 4KLFA 4Q44A 8ICOA 8ICWA 1MC8A 1ZQLA 2FLPA 7ICUA 5KTQA 4TUSA 3HWTA 4DL6A 3HW8A 2MAXA 3C65A 2KFNA 4DFPA 3RJGA 1MSWD 4J9LA 4TURA 2NRTA 7ICSA 3ZDDA 4YD1A 3C5GA 5DLFA 2J6UA 4KLGA 5HNKA 5F9LA 4PGQA 1ZQWA 1MQ3A 2PI4A 5KFFA 3JPRA 4YG2A 1RPLA 5KT4A 4IR1A 5J2GA 4UB1A 4R65A 4QZEA 1ZQGA 1K1QA 4P4MA 3MDAA 4LVSA 2ZUBA 5IIJA 4DL3A 2IMWP 3ZDCA 5IINA 4QZCA 1XSLA 4NXZA 3GV5B 1D9FA 1T7PA 2IBKA 2XY5A 1ZQNA 4B9UA 3TANA 2LYHA 3TAQA 4YFKA 4O5CA 2C2RA 4KLLA 3UQ2A 3GIKA 4YCXA 4JV2A 2HHQA 4DSEA 7ICTA 3AU2A 4RPYA 3MGIA 4YMOA 4UB5A 2ZTCA 7ICKA 3MABA 1JMSA 5DG9A 2BQUA 4QZ8A 1S0VA 4B9VA 3HT3A 3H8JA 3C2LA 1RYSA 1S0OA 8ICSA 3RJHA 9ICPA 2BHNA 4UAYA 4JWMA 3RB4A 4ECQA 1WCLA 1SKRA 1V9PA 4ECUA 2F1JA 1XC9A 3ZD9A 5KFPA 2V4QA 3H4BA 4EYIB 4GXJA 3T5KA 1L3TA 5KFSA 5L1IA 3MR6A 1SL1A 4G3IA 8ICJA 3PO5A 1X2IA 3H8WA 4DSKA 4GLXA 4YR0A 1B43A 4O3QA 4QZ9A 4BWMA 3OHAA 3C2KA 7ICRA 4M6WA 1ZQAA 4I2HA 9ICJA 2IHNA 5KFIA 4P4PA 3MGHA 4DQIA 3Q8LA 3MFHA 4GXIA 5CWRA 9ICFA 3Q8KA 3KHLA 2VA2A 1L3VA 2R8HA 4F2SA 4KLEA 1SZPA 5J0QA 3EYZA 3FYHA 3QEAZ 4J9OA 4DLGA 4IRDA 3ZD8A 4F5NA 1XU4A 2UVVA 4DL5A 5KFUA 3TI0A 2ZTDA 2KN7A 2F1IA 4KN7A 4FBUA 4NLGA 3JPSA 4J9PA 4DQRA 1TK8A 4F92B 1XWLA 5KG1A 4MFCA 2MUTB 9ICXA 3QZ7A 4ED8A 3N97B 3PW7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HM9A 1B0XA 3O9RA 1Q18A 1C0TA 4OPAA 2E5LK 1L7NA 3OHBA 3O9TA 1KCFA 2ZIVA 3KWGA 3AGKA 1SZHA 5T7BA 3WKDA 4O3SA 2P66A 1RTHA 4ECTA 5CP2A 1WNSA 2P9PB 4CZEA 4R79A 3RWUA 1RTDA 1JKHA 1T4GA 4Y2QA 3K9JA 3VTIA 3DLEA 1HIWA 4DTJA 3RSEB 2BPGA 1X6IA 1SZ2A 4L3QA 2WTFA 4CEZA 3AVAA 4YDUC 1VQ9N 2ZG6A 3EKSA 4CJVA 1IJJA 3HSCA 4IFVA 1WBDA 4FBTA 1YXQA 2G08A 3SV4A 1NK7A 3ONNA 2X74A 2ASPA 2FJ6A 3N7RC 5KPRA 1SKWA 4B1WB 4DU1A 4FWNA 3HTVA 5EWGA 3DOLA 2JZBB 4J9MA 4Z4FA 4CHNA 1SB3C 1ATSA 4FZXC 1MDUB 3ENOA 2QA4N 2F8SA 5KFEA 4FWSA 1NZPA 5LJWA 3HOSA 2PY5A 2IA6A 3NVMA 5KFRA 3T1HK 2YX8A 1CZAN 4LF8K 3OHRA 2WOMA 2KEYA 1J2MA 4Z6CA 4X64K 3MEGA 1S6QA 1C0FA 5ALYA 5KPZA 2K8BB 3HRDD 9ICHA 4YOWA 2L5YA 4YOUA 1RBTA 2ZJRL 2K4EA 3TABA 3NVKA 3RAQA 1D4XA 2PYJA 2Q0ZX 1BNOA 2NZTA 2OCEA 4O5EA 4O5KA 5J2CA 1P8ZA 3OTOK 5AQQA 3HPGA 3KHGA 2NRWA 3E9LA 1L6NA 4CZFA 3PMLA 3ISBA 1NJIO 4BGBA 3NGZA 5ALKA 1C0UA 4GY2B 4OPKA 5L1KA 1YVNA 5DB9A 3OS0A 2NRVA 3LK9A 3PX4A 2FSJA 4BREA 2J6SA 3C6HA 5AI5A 4UB6U 4JUZA 4UY8O 5MLCQ 1ZRMA 4WYBA 5IIIA 2W8KA 2Q3SA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4KLS A;  2Y1J A;  2KFZ A;  1U47 A;  2AQ0 A;  3C2M A;  4PGX A;  5D4B A;  4YVZ A;  3OHB A;  9ICG A;  5KT5 A;  1BPE A;  3RJJ A;  4KLH A;  1UA0 A;  2JZB A;  5HMM A;  2DPJ A;  4RT3 A;  4MFF A;  4O3S A;  2P66 A;  2W8L A;  3N4M B;  4ECT A;  5CP2 A;  4DOB A;  4ELT A;  3UXO A;  3RTV A;  2HHV A;  1T4G A;  3Q8P B;  3TFS A;  2BPG A;  1KFT A;  2XGQ A;  5J2A A;  5KFV A;  2WTF A;  4MEX A;  5DBA A;  3KHH A;  2PXI A;  3RBD A;  1NK5 A;  2P6R A;  4M0A A;  7ICJ A;  3MR5 A;  4MEY A;  5J2F A;  3T5H A;  3NGD A;  2R8K A;  4O0I A;  4QW8 A;  1ZQP A;  5J2K A;  4FBT A;  3BQ1 A;  3SV4 A;  1NK7 A;  1S0N A;  1Z00 B;  3GQC A;  4C8M A;  3V6H A;  1RZT A;  1XSP A;  1SKW A;  4B9T A;  4M9G A;  3MR3 A;  5EWG A;  4M9N A;  2KZM A;  3IHQ B;  2JZB B;  4J9M A;  2BPF A;  1T8E A;  2FLN A;  4DL2 A;  2V4R A;  1NJZ A;  1S10 A;  1MQ2 A;  8ICN A;  1L5U A;  3PX6 A;  3B0X A;  4NY8 A;  5KFE A;  4DFK A;  1KDH A;  1S0M A;  1BGX T;  3C5F A;  1QTM A;  2IA6 A;  5KFR A;  1NK6 A;  3C21 A;  1NK0 A;  1BPZ A;  5DG8 A;  3V7J A;  2BPC A;  9ICA A;  4Z6C A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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