2NRZA

Crystal structure of the c-terminal half of uvrc bound to its catalytic divalent cation
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
RGLRKEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHLQGKYTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIEQDHPDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLAKKEETVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSYHRKRREKESLRSVLDNVPGIGPIRKKKLIEHFGSLENIRSASLEEIARVIGSTEIARRVLDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
molecule keywords UvrABC system protein C
total genus 76
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain 2nrzA02
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrzA01
3QE9Y 5DQHA 2W9BA 5KT3A 3BQ1A 3PW4A 3MGIA 3ETLA 3UPQA 4ECXA 4B9UA 3M9NB 3C5FA 2ZJ8A 1BPEA 2JEGA 4GLXA 4DOAA 4F92B 1Z3EB 1LV5A 7ICIA 4KLJA 3HT3A 4PGXA 4ECQA 5IINA 2A1JA 4RQ7A 4ED8A 4TQRA 4M2YA 4F93B 4XUSA 4F5OA 4GC6A 3H8SA 4QZFA 4QWDA 3ISCA 3V7KA 4J9RA 3PV8A 3HX0A 5KT4A 3T5JA 9ICOA 7ICHA 4DLGA 3B0XA 4TURA 1ZQRA 1S77D 4ED2A 2NRTA 3EWAA 7ICTA 4K4GA 5KFHA 3T5LA 1ZJNA 2XY7A 1U49A 4YQWA 9ICFA 3GDXA 5CB1A 4BGDA 2FLPA 1QSLA 3LWMA 5DB8A 4F8RA 2NRZA 4UB3A 4ECYA 3T3FA 7ICRA 1UA1A 2W9BB 3UXPA 1HJPA 3MFHA 5C5JA 4F2SA 4RT3A 1KSPA 4YMOA 1JX4A 5KFQA 4YMNA 3GV8B 4DSEA 4ECVA 5J2HA 1S0MA 4F4KA 3Q8RB 5KFKA 2BHNA 4KLQA 2ZJAA 4QZAA 3PY8A 4P4MA 3PO5A 4DF8A 4I2EA 8ICXA 5KFBA 8ICSA 3GIIA 2BR0A 5DBCA 8ICHA 4QWCA 4YCXA 7ICNA 1S0VA 3MR2A 4I2HA 1XWLA 5L1KA 4JWMA 3UXNA 4DFMA 3ISDA 3V72A 1B43A 4DQPA 4KLOA 4F5QA 4KN4A 5KTQA 5D49A 4DL3A 3RB6A 1NJZA 4O5EA 4MFCA 4FO6A 9ICWA 1RYSA 3HWTA 4O5KA 3G6YA 1C7YA 4R65A 1SL2A 5HMMA 1ZQMA 5KT7A 5BPCA 4RQ8A 5IIKA 4C8KA 2BQRA 1K1QA 3RR7A 3QZ7A 1A76A 9ICXA 3RH4A 2R8JA 2JEFA 4RQ2A 2KZMA 5DB9A 3V7JA 1SL0A 4DEZA 1ZQGA 1ZQHA 2KZZA 4QZ8A 5CWRA 1SL1A 2FPKA 1ZQKA 2ZTEA 5J2AA 1XO1A 5J0RA 9ICQA 3JPOA 1EXNA 4PHAA 1ZQDA 2UVWA 5KFPA 4GXIA 2AQ0A 4NM1A 7ICEA 2GWSA 3C2KA 5J2IA 3GV7B 1RZTA 2HW3A 3MDAA 3H4BA 1ZQQA 1DOQA 2F1JA 5KT5A 4ECUA 4DL2A 1ZJMA 2BPFA 4YR0A 1ZQXA 4ECTA 1BPXA 3ZDAA 3KTQA 2PI4A 3OHAA 1KFSA 3GIKA 1BPYA 2MAXA 5HNKA 1ZQVA 3EPIA 5KFCA 4LZGA 2FMQA 4KLUA 5KFJA 4M9GA 5KFUA 1U48A 3MABA 2R8KA 5J0WA 5KFTA 7ICUA 3ZDDA 2XY5A 3PW7A 8ICKA 2XGQA 3KHLA 3G6XA 5KFZA 3HPOA 3BDPA 5DLFA 2BGWA 4DOCA 4PHDA 4Q45A 2J6UA 3V6KA 4Z6CA 4RPYA 4B9VA 2ZUDA 5KG5A 5IIJA 4K4IA 2FMPA 5DQGA 1NK7A 3GV5B 4ECRA 3TANA 1NJWA 4QZHA 7ICPA 1T7PA 2AGPA 5DLGA 4NM2A 5DB6A 4RNMA 3NGDA 4EBDA 3OSPA 3H8WA 4RQ4A 2BCRA 3JPTA 5DDMA 4EYHB 3LDAA 4ED0A 2HHVA 4NXZA 3PX6A 3MR6A 4DFKA 1ZQLA 8ICZA 4TUPA 4E0DA 4UBCA 2NRWA 1T8EA 2W9CA 5KFGA 4ECWA 2V9WA 2Q0ZX 3H7IA 5HMLA 4ED6A 3V6HA 2V4QA 2BDPA 2PFNA 4RUCA 5KFVA 4UB2A 3JPRA 1NK8A 1COOA 1BPDA 4TUQA 9ICGA 4KN7A 4ED3A 3EYZA 1NKEA 1TKDA 4JV1A 4F5PA 9ICNA 3GFKB 5KG4A 4KLSA 1NJYA 4PHEA 2C2EA 3UXOA 3K75D 1QSYA 1L3SA 2XCPA 1X9SA 8ICVA 9ICBA 9ICLA 1H38A 4O3NA 4I29A 1UT5A 1WCNA 2R8IA 8ICOA 2H5XA 4YR2A 5KFSA 4F5NA 1QSSA 1Z00A 5J0XA 3GIMA 4RPXA 1N56A 3BJYA 4DWIA 1KFTA 2UVRA 4PPXA 4MEXA 1L3TA 4DOBA 2BQ3A 1CEZA 3RJFA 5KFWA 1AROP 4PGYA 4M6WB 3PR5B 1WCLA 5DDYA 3C2LA 3PW0A 1ZQYA 2ZTDA 4FBUA 5CJ7A 1ZQCA 7ICGA 4RQ0A 4UB1A 5J2JA 1NK9A 3NTUA 4B9SA 4QW8A 4I2AA 5KFAA 4RT2A 4C8LA 4EEYA 2BPGA 2HHUA 3N4MB 1S0OA 1NOMA 7ICJA 3PNCA 4R64A 4DQSA 3T5KA 2V4RA 4DQRA 2ASDA 3H4DA 4NLZA 2IHMA 5DG7A 4KLHA 4F2RA 1U45A 1ZQWA 4JV2A 1ZQUA 4YVZA 4I2GA 4KMUA 1BGXT 4C8NA 4J9LA 4BWJA 4UAYA 4F50A 3SI8A 3UQ0A 5BOLA 3SV3A 8ICTA 1Z00B 2A1JB 4DS4A 1MSWD 4BXOA 4QZEA 3JPNA 1S9FA 1K1SA 1MQ3A 2FLLA 4F4XA 5J0SA 1CUKA 2ISOA 3C1ZA 3RBEA 3Q8QB 1RYRA 2ZUCA 4RQ3A 2C28A 2IBKA 2P6RA 1TVAA 1IXRA 3M9OB 1TK5A 4HYKA 5KFNA 5KFOA 8ICIA 2MUTA 9ICVA 3HP6A 3JPQA 5J2CA 1LB2B 2ZTCA 1NK4A 5CR0A 4M47A 4EBCA 2KN7A 3B0YA 1BVSA 4O3PA 3MDCA 4Q8EA 4JUZA 4GXJA 3PX0A 4F4WA 3AUOA 4IR1A 1TV9A 3TARA 1N48A 1S76D 3RH5A 4MF8A 4I2CA 4YN4A 4DL4A 4X5VA 4CCHA 4R66A 2DPJA 3EPGA 3M8SA 3TAQA 4DO9A 4BDPA 3GILA 2FPLA 2FMSA 4K4HA 2F1IA 4FS1A 1JN3A 1SKRA 4PHPA 3RH6A 4YG2A 3PW2A 1S10A 3RJKA 4YXMA 4EZ6A 1XSLA 2J6SA 4BXOB 5KG2A 4O0IA 1ZQNA 2ATLA 1MQ2A 2VA2A 2XO7A 5KFXA 4B9LA 2HHQA 1SZPA 3RRGA 4IQTA 2PI5A 4R63A 3ZDEA 3Q8KA 2KZ3A 1HUZA 2KFZA 3THVA 4M9NA 2MUTB 4UB5A 4PGQA 4IQWA 4DFPA 4LZDA 4Q44A 4M04A 4DS5A 1KRPA 4DFJA 4RNOA 3MR5A 4BWMA 4IRCA 4RUAA 3MFIA 9ICPA 3RJGA 4ECSA 4ED1A 1XS9D 1NK6A 4EZ9A 4J9MA 3Q8PB 4RQ5A 4J9PA 1ZYQA 4YP3A 5KFDA 2ALZA 5J29A 4DL6A 2PFQA 4MF2A 4QZDA 4UBBA 4ELVA 1MC8A 1B22A 1L5UA 7ICVA 4QWAA 4XQ8A 2P66A 3RR8A 2VA3A 1ZQTA 4JWNA 3RB0A 5IIIA 5CA7A 2AGQA 5KFEA 4QZGA 3OJUA 8ICYA 8ICGA 4UAZA 3HW8A 1NKCA 4M9HA 3TI0A 3BQTA 2HHSA 1ZQEA 5KFLA 2PFOA 4I2JA 2JZBA 4O3QA 4YR3A 4RPZA 2F1HA 5F9NA 1U4BA 5J0OA 5L1IA 4QWEA 5JUMA 8ICRA 1ZQOA 5L1JA 5DKWA 4P4OA 3KHHA 4O3OA 3IM1A 4EYIB 1SKWA 3FDSA 1JIHA 5D4BA 4TUSA 3QEBZ 3ZD8A 5DGBA 8ICLA 1ZQSA 4NLKA 3LWLA 4R8UA 3RJJA 3AU6A 4KLGA 1KEJA 4QZBA 1Y88A 4F4ZA 2XY6A 9ICUA 3UQ2A 4RU9A 3V7LA 2AGOA 4ELUA 1S0NA 1KFDA 3EW9A 4EBEA 5L1LA 5IIOA 1U9LA 3PW5A 9ICHA 2PXIA 2ASLA 3JPSA 3C1YA 1ZETA 5J2DA 2XCAA 4KLFA 5J2KA 4DSKA 3RRHA 4KLTA 2ZUBA 4C8MA 4Z6EA 4UQGA 2BCQA 3EZ5A 3TFSA 1RXVA 3OHBA 2JZBB 2WTFA 3PO4A 5EWEA 4DLEA 3G6VA 3QZ8A 4IQVA 5DG9A 4Z6FA 3SYZA 5HHIA 3M9MB 5J0PA 3RAQA 2DPIA 5EOZA 2P6UA 4ED7A 2W9CB 2PFPA 2I1QA 2IMWP 4P4PA 2W9MA 4DQIA 4UB4A 4YD2A 8ICAA 1TK8A 2LYHA 1U47A 1TAUA 2IHNA 4R8UB 4M9JA 5CP2A 2Y1JA 4RQ1A 7ICKA 4DSLA 1D9DA 4ELTA 1KTQA 1X2IA 3FYHA 5J2EA 4O9MA 1NJXA 2B21A 1ZQZA 3C5GA 1SKSA 7ICOA 5KG7A 1XSNA 5HP4A 4GXKA 1IM4A 4DSFA 4KLMA 1XC9A 4Q43A 9ICRA 2VANA 3PR4A 9ICKA 4LVSA 9ICSA 3TQ1A 8ICBA 4DSJA 3H8JA 3RB4A 2RDIA 1JXLA 5EWGA 8ICEA 5KFYA 1JMSA 5IILA 4DL7A 3Q8LA 4DQQA 3Q8MA 4G3IA 5BOMA 8ICNA 1ZQBA 4J9SA 2XC9A 1ZQPA 3BQ0A 5KFMA 3C65A 9ICIA 4M0AA 1JXEA 4O3RA 4IR9A 4KTQA 3RJEA 5L9XA 2C2RA 1X9MA 1UT8A 2NRVA 4Z6DA 5J0YA 4J9OA 3N97B 7ICMA 4DSIA 1D8YA 4GC7A 3GIJA 4DF4A 4QZIA 4IQUA 2BCSA 2AQ4A 2Y1IA 2ZJ5A 5KG6A 5DG8A 9ICMA 2OWOA 1L3UA 4IRDA 3OSNA 3KHRA 1KLNA 4O5CA 1QLNA 1V9PA 3OJSA 1D9FA 4M9LA 3ZD9A 4IRKA 2W8LA 5CHGA 1UA0A 8ICQA 1ZQAA 4RNNA 4FS2A 8ICJA 3RAXA 2M9NA 2I9GA 2DFLA 2IA6A 7ICFA 5IIMA 2FPMA 3ISBA 4ECZA 3PVXA 2R8HA 2R8GA 5KFIA 2RDJA 1RXWA 4MEYA 9ICEA 4YXJA 5J2FA 3RJHA 4I28A 4NLGA 7ICLA 1BPZA 4I27A 3RTVA 8ICPA 4F91B 1D8LA 5F9LA 5DQIA 3MGHA 4PH5A 1T4GA 7ICQA 1RPLA 2BKEA 1NK5A 5KG3A 1ZQIA 4XA5A 2BCVA 2ISPA 3ZDBA 4NLNA 8ICFA 4ZH4A 5J2GA 5KG1A 5DBBA 3RB3A 2ASJA 2C22A 3LK9A 8ICMA 4B9NA 2HHXA 1S97A 4B9MA 4J9NA 2BCUA 4B9TA 1TAQA 2NRXA 4JV0A 5DBAA 1TFRA 3H40A 3TAPA 3KHGA 8ICCA 5HHHA 3MR3A 1KDHA 4J9KA 5KT2A 5EWFA 9ICCA 4QWBA 1PZNA 1HUOA 9ICAA 4UAWA 4I2IA 5J2BA 1L3VA 4I2FA 4XRHA 3RBDA 3MBYA 4C8OA 3ORYA 1XSPA 3OGUA 1A77A 3IHQB 2HVIA 3SV4A 9ICJA 2NRRA 1T3NA 3V6JA 2C2DA 5KT6A 2JEIA 5DB7A 4MFFA 2AU0A 3GQCA 3C2MA 2HVHA 2AJQA 2JEJA 4F5RA 4QZ9A 5DGAA 3T5HA 2KTQA 2VA8A 1X9WA 9ICTA 4I2DA 4YMMA 3E2EA 1NKBA 5KG0A 3C23A 4F3OA 4NY8A 4QZCA 4RQ6A 1TK0A 5KFFA 1BPBA 2UVUA 3JPPA 4KLDA 3Q8SB 4YD1A 4TQSA 4QW9A 5J0QA 3PX4A 1ZQFA 4FBTA 8ICWA 2FLNA 4DL5A 3BQ2A 3RJIA 4JK1A 4J9QA 3QEAZ 2W9AA 2W8KA 3C21A 4F4YA 8ICUA 1ZQJA 2J6TA 4I2BA 2HHTA 4O3SA 4MFAA 2BQUA 4YFKA 2XGPA 4M6WA 4KITB 5D46A 2KFNA 4KLLA 5J0TA 4KLIA 2UVVA 3PMLA 1QTMA 3TFRA 3K4GA 3SZ2A 1DGSA 3ZDCA 5TZVA 2HHWA 4P2HA 1XU4A 3AU2A 3PMNA 4Q8FA 5J0UA 2BPCA 4KLEA 7ICSA 3M8RA 1NK0A 4RZRA 5KFRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JCGA 3WEEB 4FJLA 2W9BA 4B9UA 4K25A 3ETLA 4JD2B 4DTPA 3UIQA 3FLCO 1NMDA 1KVBA 3CJCA 2OTLN 4DOAA 4BE1A 1T44A 4PGXA 4CHPA 2F9WA 3IKMA 2EH9A 1X9JA 4KI6A 1R59O 4F93B 4GC6A 4QWDA 4J9RA 1YTUA 2VGMA 4CJ4A 2QXFA 1FIQA 3B0XA 3TKAA 4LF6K 1ATNA 2E8OA 1BQMA 4I6MB 3L2WA 2A5XA 2I7NA 1WNSA 3PLAA 5K4LA 4LD0A 2KSOA 1ZJNA 2K8BB 1F5SA 3LM2A 1VQLN 2FLPA 3R3LA 2JMGA 3P83D 1K8KA 4EHTA 3NBPA 3CCQN 2LM1A 2OEHA 3SK3A 5G5GA 2EZZA 3AVLA 3T79A 2E5LK 3F73A 3R1XA 4JI0K 5J8YC 3TADC 3SCXA 2W9BB 4C4SA 1HJPA 3AVGA 2ZIVB 4FWKA 5KAFU 2YV0X 2KV2A 4PZOA 2G8KA 1KSPA 4YMOA 4FK4A 2Z7JA 2Q2RA 3L4QA 3I8BA 5J2HA 5ALLA 4AHUA 3TADA 3K59A 3MGVA 5KFKA 1K8AO 5CZ1A 1RFQA 2HMIA 2KQ2A 2G8FA 2NRHA 8ICHA 3QU2A 3ZSYA 1ZD3A 1VQ9N 2RKIA 2KSOB 3O9SA 3I56N 3MR2A 3A5LC 5HOOA 1XWLA 1XNSA 4JWMA 1WLJA 4JNEA 3UXNA 3VQDA 3ISDA 3V72A 4FWSA 4CK3A 4L8RB 4A5BA 2G8UA 4MFCA 3RB6A 4JKHA 2HOQA 1Q82O 4FO6A 4B08A 4BVPA 3HWTA 5J2QA 3SPZA 3G6YA 3S3NA 4CGHA 2YN4A 3NVZA 1ZQMA 4RQ8A 2QK9A 4UATA 1WSHA 2OCEA 2WF5A 3AAQA 3P38A 5DMRA 1S6PA 5DB9A 4P0PA 8ICFA 4QZ8A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3QE9 Y;  5DQH A;  2W9B A;  5KT3 A;  3BQ1 A;  3PW4 A;  3MGI A;  3ETL A;  3UPQ A;  4ECX A;  4B9U A;  3M9N B;  3C5F A;  2ZJ8 A;  1BPE A;  2JEG A;  4GLX A;  4DOA A;  4F92 B;  1Z3E B;  1LV5 A;  7ICI A;  4KLJ A;  3HT3 A;  4PGX A;  4ECQ A;  5IIN A;  2A1J A;  4RQ7 A;  4ED8 A;  4TQR A;  4M2Y A;  4F93 B;  4XUS A;  4F5O A;  4GC6 A;  3H8S A;  4QZF A;  4QWD A;  3ISC A;  3V7K A;  4J9R A;  3PV8 A;  3HX0 A;  5KT4 A;  3T5J A;  9ICO A;  7ICH A;  4DLG A;  3B0X A;  4TUR A;  1ZQR A;  1S77 D;  4ED2 A;  2NRT A;  3EWA A;  7ICT A;  4K4G A;  5KFH A;  3T5L A;  1ZJN A;  2XY7 A;  1U49 A;  4YQW A;  9ICF A;  3GDX A;  5CB1 A;  4BGD A;  2FLP A;  1QSL A;  3LWM A;  5DB8 A;  4F8R A;  2NRZ A;  4UB3 A;  4ECY A;  3T3F A;  7ICR A;  1UA1 A;  2W9B B;  3UXP A;  1HJP A;  3MFH A;  5C5J A;  4F2S A;  4RT3 A;  1KSP A;  4YMO A;  1JX4 A;  5KFQ A;  4YMN A;  3GV8 B;  4DSE A;  4ECV A;  5J2H A;  1S0M A;  4F4K A;  3Q8R B;  5KFK A;  2BHN A;  4KLQ A;  2ZJA A;  4QZA A;  3PY8 A;  4P4M A;  3PO5 A;  4DF8 A;  4I2E A;  8ICX A;  5KFB A;  8ICS A;  3GII A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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