2NRZA

Crystal structure of the c-terminal half of uvrc bound to its catalytic divalent cation
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
RGLRKEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHLQGKYTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIEQDHPDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLAKKEETVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSYHRKRREKESLRSVLDNVPGIGPIRKKKLIEHFGSLENIRSASLEEIARVIGSTEIARRVLDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UvrABC system protein C
total genus 76
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain 2nrzA02
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrzA01
5IIIA 4GLXA 2RDJA 1JXLA 4QZIA 3LK9A 4DL5A 1S9FA 8ICIA 2ISOA 5J0WA 4DWIA 4JV1A 4ECRA 1X9WA 4P4OA 4B9UA 1Z3EB 4IQVA 1TK5A 3RB3A 3RRGA 9ICHA 3ZDBA 4I2AA 4TUPA 4DQIA 4NXZA 5KFLA 2BPGA 4YR0A 5KFHA 1EXNA 4J9SA 1KTQA 5J2GA 5J2CA 1ZYQA 3M9NB 5HMMA 4TUSA 3MDAA 3ORYA 5J2DA 4QW9A 4PGQA 3C1ZA 2I9GA 4J9RA 4RUCA 3M9MB 4IQUA 3H7IA 4RT2A 2BR0A 1T3NA 1S97A 4P4MA 1XSPA 4IR1A 4I2EA 3H8JA 3OGUA 4YMNA 5JUMA 2P6RA 3IHQB 4C8LA 4Z6FA 4DL6A 1MQ2A 4BWJA 2VA8A 3RJFA 5KFQA 4MFCA 4DL2A 8ICAA 4PGXA 3ETLA 2IA6A 4DL7A 4EZ6A 4UB4A 3GIJA 1KEJA 3C65A 5DB8A 3GV8B 1L5UA 1CEZA 5KFDA 4M04A 1T4GA 3HP6A 4XUSA 3H40A 8ICTA 2W9MA 8ICNA 3NGDA 4ELVA 2JEIA 3RRHA 4DQSA 4QWCA 3ZDDA 1ZQVA 3G6YA 2ALZA 4DSFA 2J6TA 4P2HA 4ECZA 4RQ3A 2J6UA 4O3RA 5DG9A 3LDAA 3GFKB 4EYIB 3B0XA 2AGQA 1ZQTA 2DPJA 4QWAA 2HHUA 4PPXA 4C8KA 8ICZA 4DLEA 5KT3A 2BDPA 2BCVA 2HHWA 1NKCA 5J29A 1ZQPA 4BGDA 2BPFA 2VANA 3SV3A 2FMPA 4B9MA 3RB0A 1NK0A 1RXWA 5DQIA 4BDPA 1RZTA 4LZGA 1ZETA 4Z6DA 9ICGA 4F5PA 1D8YA 3EPIA 5J2BA 4YD1A 8ICSA 1ZQYA 9ICNA 5DB7A 5J0SA 4KLSA 1KFTA 4YQWA 5DB9A 3RJHA 4O3SA 4UBCA 3AU6A 4ECQA 5KT4A 1ZJMA 4M9GA 4ECWA 2R8GA 3V6KA 2HHSA 1MSWD 4JWMA 3HX0A 4F5NA 1DOQA 1BPZA 3M9OB 2KFZA 1XC9A 1U49A 3TFSA 4QZAA 3M8SA 3BQ2A 4NLZA 4KLUA 2ZUCA 4RPYA 4QZHA 3V6JA 2IBKA 4PHPA 1COOA 4F5QA 4PH5A 2V4RA 3PW7A 3MGHA 1TK8A 5KT7A 5DB6A 2HW3A 3FYHA 1TFRA 4YFKA 5KFSA 4J9PA 3ZD8A 1TV9A 7ICFA 5J2IA 4DLGA 2ZJAA 2R8HA 4J9KA 4NLNA 1ZJNA 4KLOA 3ISCA 2AJQA 3IM1A 4TUQA 3JPNA 4IRCA 4QZCA 1Z00A 4QZ9A 4XRHA 3MBYA 5L1LA 3Q8LA 3RBDA 2C2RA 2J6SA 1ZQMA 4NLKA 3PY8A 1CUKA 1NJZA 4R8UA 2XC9A 3TFRA 3RJEA 1B43A 4Z6CA 2C2EA 2BHNA 9ICBA 3T5JA 2R8JA 4KLEA 9ICTA 1L3TA 3PMLA 9ICKA 1SKWA 5J0YA 4C8OA 1XU4A 4M9HA 9ICOA 5KFYA 1XSLA 3QE9Y 5KFMA 1JXEA 5DGBA 4F4ZA 2XY5A 2BCQA 5BPCA 3H4DA 5KFNA 4M6WB 1T8EA 9ICMA 3RAXA 2PI4A 4ELTA 4O0IA 3MR2A 5EOZA 4IRDA 4NLGA 4DFJA 1NJYA 4ECUA 9ICQA 3HT3A 5DLFA 5DLGA 2UVUA 1ZQOA 4UB2A 2GWSA 4KLGA 4MFFA 4J9MA 2A1JB 1RPLA 2FPKA 3C2KA 3RH4A 3H8WA 3PNCA 3MR6A 2B21A 4QZBA 3RH5A 9ICAA 8ICVA 5IIOA 2Y1JA 2JEGA 1KRPA 2PI5A 2KZZA 7ICTA 2W8LA 4UAWA 1B22A 7ICOA 5F9LA 3KHLA 9ICLA 3SZ2A 4ECSA 4ED7A 4Q44A 1SKRA 4K4IA 3GIIA 2JEFA 4O5KA 1D8LA 5BOMA 9ICFA 4FS1A 3AUOA 1ZQBA 3BQ1A 3GIKA 4F4WA 3LWLA 8ICPA 4UAZA 3TAQA 1SZPA 5KFIA 1ZQDA 2XCPA 4UB5A 3OHBA 1ZQZA 5J0QA 4YMOA 4ED3A 5KFZA 1BPXA 4MF2A 4BXOA 4RPZA 4FO6A 4XQ8A 4DFMA 1IXRA 5KG0A 5IIMA 2ZTDA 1ZQFA 2V9WA 3SYZA 2UVRA 5J2KA 2XGQA 9ICIA 4K4HA 2HHQA 1K1QA 3JPPA 8ICMA 3H4BA 3RB4A 1KSPA 5HNKA 8ICLA 4X5VA 2Q0ZX 4DEZA 5KFAA 5CHGA 2BQ3A 3RJJA 1U48A 4YG2A 2KFNA 2PFPA 4YCXA 9ICVA 3LWMA 4JV2A 4QZDA 2BCUA 5KFRA 1S0NA 4P4PA 8ICUA 1XO1A 1ZQQA 5DBCA 4I2IA 2C22A 2VA2A 5KG1A 1K1SA 3Q8PB 2BQRA 3BDPA 2HVIA 4M2YA 4YR2A 2XY6A 2HVHA 3C5FA 7ICMA 2KZMA 2BQUA 4LVSA 1X2IA 8ICFA 5DQHA 1JX4A 1TAUA 2ATLA 2W9BA 1S0OA 1LB2B 5KFCA 3GV7B 4QZEA 1S76D 1NKEA 4O9MA 4F5OA 1A77A 5DQGA 4GC7A 3N97B 2VA3A 2BGWA 4KN7A 2F1IA 2WTFA 4EYHB 3PVXA 4CCHA 2AQ0A 4RQ1A 4I2HA 1XS9D 1UT5A 3MFHA 4J9LA 8ICKA 4F4YA 7ICRA 5KFFA 1ZQHA 2FLPA 7ICPA 4QWDA 1RXVA 1X9SA 8ICYA 1KLNA 3JPOA 3G6VA 4DSIA 3BQTA 5KG2A 1SL1A 2ZUDA 3PMNA 1L3UA 2ZUBA 2R8KA 5J0XA 4I2BA 1S0VA 3ZD9A 5KFBA 5DG7A 1H38A 2MAXA 4F2SA 4MFAA 4R64A 2DFLA 2ZJ5A 2NRTA 2R8IA 4B9LA 4M9NA 3JPRA 3PR4A 3MFIA 5DDYA 4UQGA 2JEJA 2BKEA 9ICWA 1WCLA 4DFPA 2HHXA 9ICCA 8ICCA 4GXIA 5KFUA 4EBEA 3TI0A 5L1IA 3RB6A 3EZ5A 3MGIA 2KZ3A 3OHAA 4M0AA 3KHGA 3ZDEA 3B0YA 4DF8A 5HP4A 4RQ5A 3C2LA 3Q8KA 1HUZA 5KT2A 4ELUA 7ICVA 8ICJA 4RZRA 2FPLA 2FLNA 7ICUA 4Q43A 2NRVA 4PHEA 3MDCA 3N4MB 4C8MA 2BPCA 4B9SA 4Q45A 2IMWP 1JN3A 4ED2A 4RNMA 1BPYA 8ICXA 4RQ6A 4F4XA 4FBUA 3OJSA 1TVAA 3PW0A 8ICHA 2RDIA 3TAPA 1IM4A 3HW8A 1NK8A 1C7YA 1ZQNA 4O3PA 9ICJA 5CP2A 4KLMA 1Z00B 2UVWA 8ICBA 3RJGA 4YR3A 2W8KA 3PW5A 4Z6EA 2P66A 4F8RA 2MUTA 4R8UB 3OSNA 2NRXA 8ICOA 2NRZA 2XGPA 5HMLA 1NK6A 3QZ7A 7ICIA 3MR3A 4DSLA 4KLFA 7ICQA 4HYKA 1ZQSA 4B9VA 4KLJA 3C23A 2Y1IA 1WCNA 4YMMA 1LV5A 5J2HA 3TQ1A 4M9JA 2NRRA 4JUZA 2LYHA 3G6XA 4ECVA 5J2EA 3BQ0A 1U47A 2IHMA 5L9XA 3PX0A 3C5GA 5KG6A 2JZBA 1X9MA 2ZTEA 2W9CA 1BGXT 1DGSA 5J2AA 2HHVA 9ICXA 4UBBA 2PFQA 1RYRA 3RJKA 9ICUA 4J9NA 3MABA 3K75D 1U9LA 4PHDA 4MEXA 5KG4A 5KFGA 3NTUA 4O3OA 5KT6A 5DBBA 4F3OA 2F1JA 3OSPA 2KTQA 4DS4A 1QLNA 1BPEA 5DG8A 4DOBA 1ZQRA 7ICEA 5KFOA 1NK7A 4YXMA 3H8SA 5TZVA 4DQRA 3GQCA 1ZQUA 4ED6A 1NKBA 1HUOA 3RR8A 3GDXA 4RT3A 5CJ7A 4RQ8A 8ICEA 3T5HA 4DS5A 5CA7A 3OJUA 3MR5A 1ZQLA 4IRKA 4B9TA 4F4KA 4F93B 3GIMA 4IQTA 3SV4A 1HJPA 4PHAA 3GV5B 4F92B 4RNNA 4BXOB 4LZDA 4ZH4A 5HHHA 5KTQA 3V7JA 5J0TA 4R66A 4R63A 2ASJA 4Q8FA 1ZQXA 1JMSA 2W9AA 4F91B 2HHTA 4RUAA 2XCAA 3Q8MA 4GXKA 3EWAA 5CR0A 1UT8A 4O5EA 8ICWA 4R65A 3JPQA 3THVA 7ICHA 4EEYA 4NM1A 4RNOA 3QEBZ 3SI8A 5CWRA 4JK1A 4GXJA 4YD2A 5KFXA 4RQ7A 5IINA 1ZQKA 1D9FA 3C1YA 2P6UA 4I2DA 4DL4A 4ED0A 3PV8A 4RQ2A 4QZFA 4DSJA 4O3NA 1TKDA 4J9OA 4NM2A 7ICNA 5KFWA 4I27A 4QWBA 4J9QA 4IQWA 4C8NA 1ZQCA 3GILA 2H5XA 2AU0A 3ISDA 5HHIA 1PZNA 4QZGA 3Q8RB 3E2EA 3RTVA 4I2JA 4UB1A 3ISBA 5F9NA 4DQQA 4Q8EA 1NJXA 5IILA 3PW4A 2W9BB 5KT5A 4O5CA 4KITB 3Q8SB 1D9DA 1XWLA 4F50A 4PGYA 4FBTA 4ED1A 1SL0A 3PO4A 2C28A 5KFJA 5DDMA 2KN7A 1XSNA 4JV0A 1NJWA 2DPIA 4QWEA 4DFKA 3ZDAA 3HWTA 1S10A 5L1JA 9ICEA 4DSKA 5EWGA 5IIJA 5L1KA 3EYZA 3C2MA 3QZ8A 4I2GA 4YP3A 5D46A 5DGAA 3RJIA 2AQ4A 3JPTA 3TARA 4I28A 3KTQA 2ZJ8A 7ICLA 1N48A 1L3SA 2ASLA 1BPBA 2I1QA 1SKSA 1MQ3A 3UPQA 4ECXA 4ECYA 4MF8A 7ICGA 4QZ8A 5KFPA 5J2JA 5D4BA 4KN4A 1NK9A 3FDSA 3EPGA 2XO7A 4DOAA 3Q8QB 3UQ0A 5J0RA 1BVSA 4BWMA 5KFKA 3M8RA 3BJYA 3T5LA 3PR5B 4YVZA 5KFTA 4TQRA 1UA0A 2FPMA 1MC8A 2FMSA 5J0PA 1ZQAA 1BPDA 2BCSA 4E0DA 3V7KA 2ASDA 4TQSA 1NK5A 4DOCA 3AU2A 3PX4A 5KG3A 5BOLA 3RAQA 1KDHA 4FS2A 4F2RA 4IR9A 3PX6A 5J0OA 4RQ4A 2BCRA 3QEAZ 1QTMA 4I2FA 4NY8A 4KTQA 1V9PA 8ICQA 2PXIA 7ICSA 2ISPA 1QSSA 1KFSA 1ZQWA 1NOMA 5D49A 3PW2A 1S77D 3JPSA 1UA1A 4KLDA 5KFEA 4YXJA 5J2FA 1A76A 3HPOA 5EWFA 4K4GA 3V6HA 3C21A 4GC6A 2XY7A 4KLHA 4MEYA 3UQ2A 2IHNA 5DBAA 4ECTA 5DKWA 1TK0A 4G3IA 7ICKA 3K4GA 1QSYA 4DQPA 4KMUA 2MUTB 3RR7A 3RBEA 3EW9A 4EZ9A 4DF4A 2AGPA 4YN4A 5IIKA 5KG7A 1ZQJA 4QW8A 3KHHA 1Y88A 2FMQA 2OWOA 5EWEA 4RPXA 4DSEA 1U4BA 2F1HA 5C5JA 1TAQA 5KFVA 2PFOA 4M6WA 4JWNA 3T5KA 4DL3A 3V7LA 3UXNA 2UVVA 4EBCA 2AGOA 3V72A 1QSLA 3ZDCA 4O3QA 4KLLA 2A1JA 2JZBB 1NK4A 9ICPA 4UB3A 2W9CB 4RQ0A 4EBDA 2C2DA 5CB1A 3RH6A 1KFDA 1S0MA 1N56A 5KG5A 5J0UA 4KLQA 2PFNA 2NRWA 2FLLA 1ZQIA 1RYSA 1AROP 1U45A 4M9LA 9ICSA 3T3FA 4KLIA 2V4QA 1ZQEA 1T7PA 1ZQGA 1JIHA 8ICRA 3PO5A 3TANA 4KLTA 2ZTCA 3UXPA 7ICJA 1L3VA 3KHRA 4B9NA 4M47A 8ICGA 4TURA 4I29A 4F5RA 4RU9A 4UAYA 4ED8A 2M9NA 4XA5A 4DO9A 1SL2A 9ICRA 3UXOA 4I2CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E19A 4AHCA 2HBJA 2RDJA 3DJCA 4QZIA 3MWPA 3LK9A 4FZZA 4DL5A 4DCCA 1B4FA 4JV1A 2H3QA 1S9EA 1KBUA 4CK2A 4QCLA 4B9UA 4CVNE 1JCGA 4OGCA 3K58A 3RB3A 3ZDBA 4A5BA 4I2AA 4CZJA 4NXZA 5AKIA 3SAFA 4RW7A 1VLBA 1RT1A 4Z4FA 2G8UA 3MN7A 2F8SA 2KICA 1Z05A 1ZYQA 3DLBA 3VQDA 5F1XA 3ORYA 4NJ8A 4FWMA 3TAGA 5J2DA 2D4WA 4PGQA 4CK3A 4FFDA 5HRNA 4J9RA 1PUZA 4IR1A 2W03A 1T3NA 4B8CA 4P4MA 2RHFA 3OGUA 5JUMA 1RT4A 3NGYA 3U9ZA 3IHQB 4C8LA 3VQ5A 1VQKN 2ZIUA 4CF8A 3RJFA 4DTRA 8ICAA 3UMGA 4PGXA 4FLZA 3O9RA 1V38A 4YNQA 1OKJA 1QVFM 1KEJA 4OD0A 3C65A 5AKGA 5DB8A 3I0RA 4DV0K 1RNHA 1VSMA 3H40A 1BIZA 3U8XA 4FYDA 4IKFA 2JEIA 4QWCA 3DDHA 1ZQVA 3G6YA 3L2RA 2ALZA 5CR4A 4P2HA 5AQPA 3K0SA 1NGFA 2J6UA 3SMPA 2EH9A 1GO3F 5DG9A 3LDAA 1ZQTA 2LBOA 2DPJA 4A2AA 2JWLA 4OJPA 5KNIA 5CY4A 3J81O 1K9MO 2WTUA 4FK2A 2HHWA 2FSJA 3SUNA 3S9HA 4IDHA 2ZE2A 2EANA 2VANA 4GY2B 2KJ9A 4B9MA 1JUDA 4JKBA 4CGZA 3IP4B 1NJIO 1S8OA 4B1ZA 3M6KA 4Z6DA 2BTFA 1VK0A 3EN9A 2O8EA 3H0MB 3K5MA 1ZQYA 1QQNA 4YQWA 5DB9A 2YKNA 3RJHA 4CZMA 1VSJA 4UBCA 1FFUA 4A61A 1NOYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5III A;  4GLX A;  2RDJ A;  1JXL A;  4QZI A;  3LK9 A;  4DL5 A;  1S9F A;  8ICI A;  2ISO A;  5J0W A;  4DWI A;  4JV1 A;  4ECR A;  1X9W A;  4P4O A;  4B9U A;  1Z3E B;  4IQV A;  1TK5 A;  3RB3 A;  3RRG A;  9ICH A;  3ZDB A;  4I2A A;  4TUP A;  4DQI A;  4NXZ A;  5KFL A;  2BPG A;  4YR0 A;  5KFH A;  1EXN A;  4J9S A;  1KTQ A;  5J2G A;  5J2C A;  1ZYQ A;  3M9N B;  5HMM A;  4TUS A;  3MDA A;  3ORY A;  5J2D A;  4QW9 A;  4PGQ A;  3C1Z A;  2I9G A;  4J9R A;  4RUC A;  3M9M B;  4IQU A;  3H7I A;  4RT2 A;  2BR0 A;  1T3N A;  1S97 A;  4P4M A;  1XSP A;  4IR1 A;  4I2E A;  3H8J A;  3OGU A;  4YMN A;  5JUM A;  2P6R A;  3IHQ B;  4C8L A;  4Z6F A;  4DL6 A;  1MQ2 A;  4BWJ A;  2VA8 A;  3RJF A;  5KFQ A;  4MFC A;  4DL2 A;  8ICA A;  4PGX A;  3ETL A;  2IA6 A;  4DL7 A;  4EZ6 A;  4UB4 A;  3GIJ A;  1KEJ A;  3C65 A;  5DB8 A;  3GV8 B;  1L5U A;  1CEZ A;  5KFD A;  4M04 A;  1T4G A;  3HP6 A;  4XUS A;  3H40 A;  8ICT A;  2W9M A;  8ICN A;  3NGD A;  4ELV A;  2JEI A;  3RRH A;  4DQS A;  4QWC A;  3ZDD A;  1ZQV A;  3G6Y A;  2ALZ A;  4DSF A;  2J6T A; 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 4IR9 A;  3PX6 A;  5J0O A;  4RQ4 A;  2BCR A;  3QEA Z;  1QTM A;  4I2F A;  4NY8 A;  4KTQ A;  1V9P A;  8ICQ A;  2PXI A;  7ICS A;  2ISP A;  1QSS A;  1KFS A;  1ZQW A;  1NOM A;  5D49 A;  3PW2 A;  1S77 D;  3JPS A;  1UA1 A;  4KLD A;  5KFE A;  4YXJ A;  5J2F A;  1A76 A;  3HPO A;  5EWF A;  4K4G A;  3V6H A;  3C21 A;  4GC6 A;  2XY7 A;  4KLH A;  4MEY A;  3UQ2 A;  2IHN A;  5DBA A;  4ECT A;  5DKW A;  1TK0 A;  4G3I A;  7ICK A;  3K4G A;  1QSY A;  4DQP A;  4KMU A;  2MUT B;  3RR7 A;  3RBE A;  3EW9 A;  4EZ9 A;  4DF4 A;  2AGP A;  4YN4 A;  5IIK A;  5KG7 A;  1ZQJ A;  4QW8 A;  3KHH A;  1Y88 A;  2FMQ A;  2OWO A;  5EWE A;  4RPX A;  4DSE A;  1U4B A;  2F1H A;  5C5J A;  1TAQ A;  5KFV A;  2PFO A;  4M6W A;  4JWN A;  3T5K A;  4DL3 A;  3V7L A;  3UXN A;  2UVV A;  4EBC A;  2AGO A;  3V72 A;  1QSL A;  3ZDC A;  4O3Q A;  4KLL A;  2A1J A;  2JZB B;  1NK4 A;  9ICP A;  4UB3 A;  2W9C B;  4RQ0 A;  4EBD A;  2C2D A;  5CB1 A;  3RH6 A;  1KFD A;  1S0M A;  1N56 A;  5KG5 A;  5J0U A;  4KLQ A;  2PFN A;  2NRW A;  2FLL A;  1ZQI A;  1RYS A;  1ARO P; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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