2NRZA

Crystal structure of the c-terminal half of uvrc bound to its catalytic divalent cation
Total Genus 76

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
RGLRKEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHLQGKYTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIEQDHPDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLAKKEETVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSYHRKRREKESLRSVLDNVPGIGPIRKKKLIEHFGSLENIRSASLEEIARVIGSTEIARRVLDIL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UvrABC system protein C
total genus 76
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain 2nrzA02
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrzA01
4UB5A 1S97A 3ISCA 1NJXA 3C21A 3JPPA 3T3FA 4BGDA 8ICMA 4P2HA 4QWDA 2RDJA 2ZUBA 5J2HA 1U49A 1DOQA 4DLEA 3AU2A 1S0OA 2FPMA 4XRHA 2J6TA 1KEJA 2UVVA 2R8GA 3ISDA 3IM1A 4FO6A 4YMMA 1N48A 3PO4A 4M9HA 2AQ4A 3OHBA 3HW8A 1COOA 4EEYA 2HHUA 3Q8RB 3ZDEA 3PO5A 3UQ0A 2JEGA 3RAQA 4J9MA 5IIOA 1D9FA 4B9TA 2BHNA 5KG7A 4M9LA 4QZBA 3MFHA 2HHXA 5KFEA 8ICOA 3HX0A 9ICKA 9ICHA 4DEZA 5L1JA 3MR3A 4QWAA 9ICVA 2BCUA 4GXIA 2PI4A 4O3OA 4YP3A 3KHHA 4I2DA 4KITB 2VANA 2ZUDA 4ED8A 2B21A 4I2GA 4M9JA 2KFNA 1H38A 2R8JA 3RJHA 7ICFA 1B22A 1RPLA 1UT5A 5L1LA 3GFKB 1ZQKA 5KFXA 5KFLA 1WCNA 3RBEA 1SL2A 1ZQHA 4J9KA 2BCRA 4KLHA 2P66A 4RQ7A 4P4PA 5HNKA 7ICVA 3HP6A 3PW5A 8ICCA 4Z6FA 4F50A 4ECSA 4YN4A 2MAXA 4YR0A 2I1QA 2XC9A 4PGXA 2ZTCA 4IQTA 1MSWD 5KFDA 3C2LA 4KTQA 1BPZA 4P4OA 9ICEA 5J2BA 3KHGA 1EXNA 4QWEA 4RPZA 9ICJA 4BXOB 4MF2A 1L3SA 4K4IA 5IIJA 3ZD9A 1ZQTA 3MDAA 5KFMA 4M04A 4PGYA 3M9NB 3UQ2A 2ZJ8A 4R8UB 4F91B 1N56A 4DFKA 9ICCA 3HWTA 4PGQA 4YFKA 3RBDA 3GIIA 4RQ3A 4P4MA 2XGQA 5IIKA 4QZEA 5J0XA 4I2JA 3G6VA 2IMWP 4DSJA 1XC9A 1NK4A 3RJFA 4RQ4A 4CCHA 2KTQA 2V4RA 4R65A 4DO9A 5DQGA 4DSLA 2R8KA 8ICXA 4YD1A 3KHLA 4DL2A 3BQ1A 1LB2B 3T5HA 2PFPA 3KTQA 5J0TA 4O3QA 3SI8A 3TI0A 4I2AA 1SZPA 4KLMA 3NTUA 5CHGA 4HYKA 3TARA 5J2AA 1Z00B 1S9FA 1L5UA 3MGIA 3MR5A 4QWCA 2ZTDA 2DPIA 4I29A 3EPIA 4IR1A 3H8WA 4RNMA 1UA0A 5DDYA 5CWRA 2IHNA 2J6UA 4MF8A 5KG1A 4ED2A 1NK5A 4KLLA 1TK5A 3Q8MA 5KFPA 2AQ0A 1U47A 8ICUA 3GV8B 4K4HA 4UBCA 1HUZA 3EZ5A 5DDMA 1ZQRA 4O3RA 1C7YA 3OJSA 4F4YA 4DL5A 5KFCA 4F5QA 1NK7A 4O3NA 3N97B 4RNOA 5KG0A 3UPQA 5KFZA 4YCXA 1SKRA 4XUSA 3JPSA 1Y88A 4X5VA 1Z3EB 5J2IA 4QWBA 2V9WA 7ICRA 4ECQA 1U45A 3KHRA 3C5FA 1L3TA 3BDPA 4J9RA 1D9DA 2VA2A 4ELUA 4C8NA 1KDHA 4B9MA 4KLUA 9ICAA 5KT7A 3RH4A 4RQ0A 3FYHA 5EOZA 4NLKA 2FMQA 3Q8KA 5HHHA 5DG7A 7ICUA 3QEAZ 2NRWA 4IQUA 3GILA 1A76A 1ZETA 4TURA 2PFNA 1NK6A 2IBKA 5J0WA 8ICTA 4F5PA 1CUKA 3BQTA 2HHSA 4M0AA 3V6KA 2ASLA 4FBTA 2XY7A 4KLJA 4YR2A 3SYZA 4RU9A 5KFFA 3JPTA 1MQ2A 2UVWA 4NM2A 2WTFA 3PW7A 4DLGA 3IHQB 1XSNA 3PX4A 1XS9D 3PY8A 3GQCA 1T8EA 3V7JA 3C1ZA 4F5NA 2AGQA 1T7PA 9ICOA 2ZTEA 3LK9A 4DQSA 4PHEA 7ICQA 4EBCA 3T5KA 1U4BA 5KFWA 2W9CB 3JPQA 3FDSA 3PW2A 5KTQA 5DQIA 2JEFA 3THVA 1ZQQA 4J9OA 4I27A 4C8MA 4YQWA 4PHAA 1ZQUA 4TQSA 3SV4A 1KSPA 9ICUA 2MUTA 4E0DA 2R8IA 4M2YA 3RR7A 4C8KA 4XA5A 2MUTB 3HPOA 5CR0A 4F4WA 5IIIA 1SKSA 2W8KA 1X9MA 4M47A 3RJIA 2C2RA 1KFDA 2JEJA 9ICBA 3RH6A 5J0PA 3MABA 3GV5B 2ISOA 5KT2A 5J0YA 1ZQIA 2UVRA 4NLGA 5KFSA 4UAYA 1TV9A 2BCSA 5KFRA 3UXNA 3EW9A 3RJGA 8ICEA 3RRHA 2FLLA 4YMNA 3OHAA 4ED3A 4YMOA 1RZTA 4YR3A 1ZQYA 2BKEA 4NLNA 5BOMA 1JMSA 4KLQA 2LYHA 1ZQNA 2Q0ZX 4DL7A 2DPJA 4KLFA 5KG4A 2HHQA 3PR5B 4GC6A 3MDCA 9ICTA 1ZQSA 1ZQGA 9ICWA 3MBYA 4DL3A 3NGDA 3LWMA 9ICSA 4DFJA 1ZQLA 4I2FA 2PI5A 1RYSA 3MR2A 5KG2A 9ICPA 1ZQZA 1NKEA 1SKWA 5KFJA 3V72A 2W9AA 4TUSA 4QZCA 1JN3A 4UB3A 3EYZA 3GIKA 5J2JA 4YXJA 1ZYQA 3V7LA 4RQ2A 9ICGA 3H8SA 5KFTA 4I2EA 8ICFA 3T5LA 4ECWA 3EPGA 4DFMA 2P6UA 5DGBA 3QE9Y 2NRTA 5DKWA 4UB1A 3LWLA 3V6HA 5KFHA 5L1IA 4ECZA 1K1QA 2ASDA 4GXKA 2AGPA 4O5EA 3BQ2A 2F1IA 5CJ7A 4QZHA 4MFAA 4DOBA 1NJYA 3RJJA 2JZBA 3H40A 2M9NA 3C65A 3RB4A 1BVSA 3GIMA 7ICSA 2W8LA 4UAWA 4EYHB 4ECVA 1JX4A 2JZBB 8ICRA 5BPCA 1ZQEA 1NJWA 3RB6A 4J9QA 1BPDA 1NKBA 5DB6A 4RPXA 4DSEA 5KT5A 1BPBA 9ICRA 4DF4A 3RR8A 2F1HA 4YXMA 5KFKA 2HHVA 5KFYA 1S0NA 3ZDCA 4MFFA 1AROP 4M9GA 2FLNA 2W9MA 3AU6A 4PHDA 4RPYA 3Q8SB 4PH5A 5HMMA 1NOMA 5HP4A 4DWIA 4UQGA 4QZGA 2C2DA 1ZQOA 4EZ9A 4F2RA 4QZ9A 4F3OA 9ICXA 4GXJA 4FS2A 7ICLA 9ICLA 2ALZA 4I28A 4NM1A 8ICSA 5HHIA 7ICNA 1JXLA 1QSYA 4O5CA 4DSFA 1NK8A 1HJPA 5BOLA 3V6JA 3B0YA 5KFBA 5EWFA 3Q8LA 2XGPA 4ECXA 1X9SA 4QW9A 8ICWA 5KFUA 4YD2A 1U48A 4ED0A 4NXZA 1MC8A 3HT3A 4J9NA 3RB3A 1X9WA 4KLIA 4O3SA 1NK9A 4KLDA 2NRXA 5J2DA 8ICAA 3G6XA 2XCPA 5DB7A 2XO7A 2BGWA 1ZQFA 2AGOA 4GC7A 3QZ7A 4I2IA 4R64A 3BQ0A 4IR9A 5DBBA 3C1YA 3TAQA 4LZDA 3MFIA 3ZD8A 4FS1A 2C2EA 5J0RA 5KFIA 3H8JA 1XSLA 1JIHA 4RNNA 1U9LA 4Q45A 4QZFA 3PR4A 4R63A 4RUCA 1X2IA 1XSPA 1XO1A 8ICVA 2VA8A 4ECRA 3E2EA 5J2KA 4DL6A 1TVAA 3MGHA 3ISBA 1XU4A 4UAZA 2J6SA 1UT8A 2JEIA 4ECYA 1ZQJA 4DL4A 4B9VA 3T5JA 5C5JA 4KLSA 5DGAA 5D4BA 1IM4A 5KFQA 2NRRA 5KFVA 5KFOA 5DB9A 1S10A 3ZDDA 4F2SA 4ELVA 7ICMA 2RDIA 3EWAA 5J0QA 2KZZA 5J0OA 3TFRA 1ZJNA 5J29A 5J2CA 2FMSA 4Z6CA 2FMPA 4JWNA 2FLPA 3H4DA 2C22A 1TK8A 1L3UA 4LZGA 4RT3A 5KG3A 2Y1IA 4KMUA 1QSSA 4NLZA 2VA3A 4KLGA 9ICFA 4RQ8A 4R66A 4IRKA 1QSLA 1HUOA 1ZQAA 5F9NA 4B9LA 1B43A 2NRVA 1DGSA 2XCAA 4O9MA 4GLXA 4UBBA 1ZQWA 3Q8PB 3RRGA 5J2GA 4NY8A 3PX6A 3RAXA 3H7IA 5D49A 3JPNA 3SV3A 2BQ3A 9ICIA 1TAQA 4O3PA 2ZUCA 3QZ8A 3C2MA 4J9SA 4F4ZA 3M9OB 2ZJ5A 1IXRA 4DOAA 4MEXA 8ICLA 4DSKA 8ICGA 2BPGA 5EWEA 4DS4A 2HVHA 3C2KA 2KN7A 3G6YA 1BGXT 1KFSA 2GWSA 2PXIA 2UVUA 3UXPA 3Q8QB 7ICKA 5IILA 2HHWA 5DBCA 4BWJA 2BPCA 5TZVA 5JUMA 4F93B 2XY5A 2FPKA 7ICTA 9ICNA 1ZQVA 5DBAA 4J9PA 4I2HA 1ZQXA 3BJYA 2BCQA 4B9SA 4IQWA 4PHPA 1MQ3A 4EBEA 3PNCA 4YVZA 3H4BA 1BPXA 1ZQPA 4C8OA 3RB0A 4BDPA 3PMNA 2KZ3A 3GV7B 1TK0A 4I2BA 2HHTA 1K1SA 5KFGA 1RYRA 3JPRA 8ICIA 4ECUA 4B9UA 5DB8A 4JV1A 3N4MB 7ICJA 5HMLA 2IA6A 4TQRA 8ICZA 2BDPA 4ED7A 2ZJAA 2ASJA 5KT3A 5DLFA 4DFPA 4RQ6A 5KFAA 4RQ1A 3TFSA 2OWOA 1S76D 4JV0A 2AJQA 3RH5A 4Z6DA 4Q8EA 4RUAA 4JWMA 2F1JA 2NRZA 4MFCA 5KFNA 4ED1A 4BWMA 5J2FA 1ZQDA 4KN4A 4EZ6A 1A77A 4BXOA 8ICHA 5KG5A 4TUQA 8ICBA 4JK1A 4M6WA 5L1KA 4G3IA 4KLEA 3RTVA 1QTMA 4R8UA 3LDAA 1XWLA 3PMLA 1SL0A 4M6WB 2DFLA 5CA7A 2W9BA 1T3NA 3M8RA 2BQRA 3C5GA 4RQ5A 7ICIA 7ICOA 4F92B 2IHMA 4RZRA 1CEZA 2W9BB 1NKCA 3ORYA 4C8LA 3TANA 2AU0A 4DS5A 1LV5A 3TAPA 8ICQA 4O5KA 1D8LA 5D46A 3QEBZ 3K4GA 3ZDAA 2XY6A 3PW4A 4MEYA 4ZH4A 4O0IA 4F4XA 1Z00A 2H5XA 1ZQMA 3GIJA 4ECTA 5DG9A 2ISPA 2R8HA 3RJKA 1PZNA 4QZIA 4Q44A 3PV8A 3PVXA 5KG6A 2I9GA 4PPXA 2HVIA 4M9NA 2BR0A 7ICGA 3K75D 5KT4A 3GDXA 2HW3A 3M8SA 3M9MB 1SL1A 2PFOA 3OGUA 4LVSA 4JUZA 3V7KA 5J0SA 4QW8A 4IRDA 8ICNA 1BPEA 5KT6A 4QZ8A 5DG8A 5CB1A 4JV2A 4DF8A 1KFTA 5CP2A 4J9LA 1ZQCA 4DSIA 2KFZA 5L9XA 4UB2A 1BPYA 4K4GA 1KTQA 1TAUA 3SZ2A 1KRPA 1S0VA 4DOCA 4F5OA 1TKDA 4KLTA 3OJUA 3UXOA 8ICJA 5IINA 5DLGA 5EWGA 2C28A 4DQIA 2FPLA 1S77D 3JPOA 1QLNA 3RJEA 3C23A 1RXWA 1KLNA 1TFRA 4F5RA 7ICHA 4KLOA 4IQVA 4UB4A 1NJZA 7ICEA 4EYIB 4KN7A 2ATLA 1T4GA 4DQPA 1UA1A 4FBUA 9ICMA 3MR6A 8ICPA 3PW0A 4RT2A 4I2CA 3PX0A 2BPFA 2PFQA 4Q43A 3ETLA 1ZQBA 3B0XA 1WCLA 5DQHA 1NK0A 8ICKA 4YG2A 4DQQA 1S0MA 4F8RA 4TUPA 2KZMA 5F9LA 8ICYA 5J0UA 1ZJMA 4IRCA 7ICPA 9ICQA 2A1JA 1L3VA 3AUOA 1V9PA 1D8YA 4EBDA 2Y1JA 4B9NA 4QZDA 3OSPA 5J2EA 1JXEA 2A1JB 4F4KA 4ELTA 4Q8FA 3TQ1A 1RXVA 2W9CA 2P6RA 3OSNA 2BCVA 3ZDBA 5IIMA 4XQ8A 4ED6A 2BQUA 4QZAA 4Z6EA 2V4QA 4DQRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KD1A 4WFBL 1LWFA 1S97A 3C21A 3JPPA 3EE8A 8ICMA 4BRPA 1HYZA 1IJJA 5AQQA 4QWDA 3VESA 2G8KA 1U49A 4KRFA 1SV0A 1LW0A 2B0CA 2FLOA 3V9WA 3MEDA 1ECWA 1N48A 2NRHA 3NAEA 5BPNA 1SAZA 2X6SA 4FLWA 2WFAA 4OKEA 3VQEA 2HHHK 3CFPA 2HHUA 3CJ9A 2HOFA 3NVMA 2JEGA 1DTQA 2K8AA 1UAXA 2BHNA 2HHXA 5KFEA 3HX0A 5KAIU 1NBWA 4DEZA 2J4RA 5L1JA 1JCEA 4JKEA 3VQCA 3KJVA 4GXIA 4B1YB 2F44A 4O3OA 1UQVA 4QJFB 3KHHA 4I2GA 2WONA 2VANA 2KFNA 1T03A 1H38A 2R8JA 2O6KA 4FJJA 1R59O 5EOYA 4BJQA 5I9EB 5ALWA 5KFXA 1DK2A 3MAQA 2BCRA 4G9ZA 4KLHA 1P8ZA 4CD3A 3VGMA 1R0AA 4U7CA 3AY9A 3F2KA 4A5BA 4CF1A 4Z6FA 2W11A 4YN4A 2MAXA 4P0PB 5KQ8A 4H5VA 3LL3A 1HNZK 3RSEA 2W6KA 2PYJA 2F2AB 3C2LA 4KTQA 1BPZA 4P4OA 4A2BA 2O8BB 5J2BA 5J2PA 3TR8A 4DMNA 1A5WA 5AK4A 4QWEA 4FK4A 2OH2A 1FO4A 5M1OA 4MF2A 4CGDA 4CE6A 3WU2U 3D2FA 4US8A 4PGYA 2CGLA 3ULEA 5GIOA 3ULDA 4CBWA 4JI0K 2B4JA 1RQLA 1N5XA 3HWTA 4YFKA 1IG6A 5EE1A 2N1RA 4GY2B 2FJ6A 2GH1A 1NK4A 4JB3A 4RQ4A 3L2QA 4HUEA 4R65A 5T14A 5DQGA 8ICXA 3D2EA 4JEPA 5AQWA 4BRKA 1GLLO 3BQ1A 3KD5E 4CJVA 3OYKA 2AHOB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4UB5 A;  1S97 A;  3ISC A;  1NJX A;  3C21 A;  3JPP A;  3T3F A;  4BGD A;  8ICM A;  4P2H A;  4QWD A;  2RDJ A;  2ZUB A;  5J2H A;  1U49 A;  1DOQ A;  4DLE A;  3AU2 A;  1S0O A;  2FPM A;  4XRH A;  2J6T A;  1KEJ A;  2UVV A;  2R8G A;  3ISD A;  3IM1 A;  4FO6 A;  4YMM A;  1N48 A;  3PO4 A;  4M9H A;  2AQ4 A;  3OHB A;  3HW8 A;  1COO A;  4EEY A;  2HHU A;  3Q8R B;  3ZDE A;  3PO5 A;  3UQ0 A;  2JEG A;  3RAQ A;  4J9M A;  5IIO A;  1D9F A;  4B9T A;  2BHN A;  5KG7 A;  4M9L A;  4QZB A;  3MFH A;  2HHX A;  5KFE A;  8ICO A;  3HX0 A;  9ICK A;  9ICH A;  4DEZ A;  5L1J A;  3MR3 A;  4QWA A;  9ICV A;  2BCU A;  4GXI A;  2PI4 A;  4O3O A;  4YP3 A;  3KHH A;  4I2D A;  4KIT B;  2VAN A;  2ZUD A;  4ED8 A;  2B21 A;  4I2G A;  4M9J A;  2KFN A;  1H38 A;  2R8J A;  3RJH A;  7ICF A;  1B22 A;  1RPL A;  1UT5 A;  5L1L A;  3GFK B;  1ZQK A;  5KFX A;  5KFL A;  1WCN A;  3RBE A;  1SL2 A;  1ZQH A;  4J9K A;  2BCR A;  4KLH A;  2P66 A;  4RQ7 A;  4P4P A;  5HNK A;  7ICV A;  3HP6 A;  3PW5 A;  8ICC A;  4Z6F A;  4F50 A;  4ECS A;  4YN4 A;  2MAX A;  4YR0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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