2NRZA

Crystal structure of the c-terminal half of uvrc bound to its catalytic divalent cation
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
RGLRKEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHLQGKYTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIEQDHPDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLAKKEETVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSYHRKRREKESLRSVLDNVPGIGPIRKKKLIEHFGSLENIRSASLEEIARVIGSTEIARRVLDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UvrABC system protein C
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 76
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain 2nrzA02
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrzA01
4DFPA 5KFHA 4I2DA 4F3OA 4J9PA 2UVUA 3MDCA 5TZVA 1U49A 4J9RA 8ICUA 4QWAA 7ICQA 1ZQUA 1NJZA 4B9TA 3ISBA 1T7PA 2F1IA 4RQ8A 5J2AA 4PHEA 3PR5B 1NK7A 4K4GA 4QZBA 4UAWA 4EZ9A 4GXJA 1ZQKA 4R64A 1HUOA 2I1QA 3HWTA 1BPXA 4KLSA 5J0TA 1ZQWA 5DDYA 3C5GA 4TUPA 3MFHA 4YN4A 1U45A 1Z00B 4P4MA 4DQIA 4QZFA 4J9QA 2BQRA 5KFVA 4MFAA 2XC9A 3BJYA 2J6TA 8ICFA 9ICXA 3SI8A 4F4KA 4I2HA 2R8JA 1BVSA 5KG5A 5KFFA 4J9KA 4QW8A 4QW9A 4ED8A 4DQSA 4EYIB 2AGOA 1X9WA 4C8OA 9ICJA 1PZNA 4GLXA 4KLQA 3BQTA 4I2CA 4YR2A 5J2HA 4ECTA 4EEYA 1ZETA 7ICPA 1ZQFA 2KZMA 1NK8A 1ZQZA 4RUAA 3RB3A 4ELVA 2ALZA 1SKSA 5IIIA 3GIKA 3PV8A 1TK5A 1XSLA 5KT4A 1U4BA 4I2IA 5DKWA 4NY8A 4DLEA 9ICTA 4F50A 3RR8A 4M6WA 4I2FA 3V6JA 4DWIA 3RB0A 5DQHA 1NOMA 5DBAA 5BOLA 1S76D 4F5RA 1ZQJA 3N97B 4FBTA 5KFEA 5HHIA 4UAYA 1TVAA 2ZTCA 2V4QA 3V6KA 3RJFA 4EYHB 5IIJA 4YFKA 3HT3A 1SL0A 9ICKA 4KLDA 3PMNA 4KTQA 5J0OA 1K1QA 4NLGA 5HHHA 3UQ0A 4EBDA 5DGBA 3V72A 2FMQA 4JV0A 5J2BA 3RJGA 4KN7A 4DQQA 1JIHA 3GDXA 4KLLA 3C2KA 2XY6A 4QZ9A 2JZBA 2MUTA 4TQRA 3OHAA 4DL6A 4J9NA 4B9VA 4RQ4A 2HHXA 3PW2A 5JUMA 3M9NB 3TAQA 1V9PA 4C8KA 2NRWA 1S10A 4DS4A 5HP4A 8ICWA 4RNMA 2HVIA 4M47A 4EBCA 4DL7A 4O3RA 4UBCA 2ASJA 3PO5A 4DF8A 3OSNA 3Q8KA 5J2GA 2VANA 8ICEA 3HX0A 8ICIA 8ICAA 9ICSA 4FS2A 4KLFA 3RH5A 4J9MA 2BPCA 1XSNA 5J29A 8ICPA 4KLTA 4QZEA 4RQ5A 2ISOA 9ICBA 7ICVA 1NKCA 1ZQXA 1S0OA 2FPMA 1UA0A 2JEFA 1ZQVA 3GV5B 1SZPA 1X9SA 4O3PA 2NRXA 4ECRA 4KLIA 2W8KA 5D4BA 1K1SA 4MFFA 3Q8SB 3RB6A 4MF8A 3PX0A 3HPOA 1NK5A 3RJEA 2KN7A 4BWJA 3RRHA 5EWEA 4RT2A 2V9WA 7ICIA 1DOQA 5D46A 1ZQEA 1ZQAA 5KFLA 3FDSA 5KFRA 1NKBA 5J2JA 2ZJ5A 9ICAA 4ED3A 5KG0A 3RJIA 4YR3A 3MR3A 5HMMA 3PW5A 1L5UA 1NK0A 1IXRA 2JZBB 2MUTB 5KFDA 4Z6EA 5DBCA 4QZ8A 5DQIA 5HMLA 5J2DA 1SKWA 4EZ6A 5CP2A 4C8LA 2KFNA 4C8NA 4TUQA 3C1YA 3BQ0A 4J9SA 2VA2A 1RZTA 3C2LA 3EWAA 4FS1A 5DDMA 3AUOA 1RXVA 4P2HA 3RR7A 3M9MB 4J9LA 9ICRA 4MEXA 4YXMA 3N4MB 2UVVA 4E0DA 3T5JA 3AU6A 4IR9A 4DL4A 1JMSA 1TAQA 4FBUA 7ICTA 2NRZA 8ICXA 4YMMA 4M9JA 1ZQYA 5KFWA 1NJXA 3OJSA 5L1LA 2R8GA 4KLJA 8ICBA 2IMWP 1UA1A 5DG8A 4ED2A 1TV9A 3BQ1A 5L1KA 4F4WA 4IQWA 2BQ3A 3QZ8A 2C28A 2VA3A 1D9DA 5DB6A 4UQGA 4KMUA 5KG3A 2NRTA 1UT5A 2W8LA 2ZUCA 1S0NA 2PFOA 1B43A 1ZQPA 5DBBA 4RQ3A 2BKEA 4CCHA 1KFTA 3H8WA 9ICQA 1ZQMA 5KFCA 4JK1A 3C21A 2IHMA 3UPQA 5DB8A 4ED6A 4GXKA 3C1ZA 1KEJA 4PGYA 4QWBA 3T5KA 3SZ2A 1QSYA 4M2YA 3ZDBA 3C23A 4RUCA 1H38A 8ICGA 4F91B 3ISCA 4DSEA 2F1JA 2RDIA 5J0WA 2C2EA 1ZQCA 5J2EA 1ZQOA 5J2CA 4I2BA 4R65A 4BGDA 4RT3A 4GC6A 4Q8EA 3OSPA 3V7LA 5KFGA 2BDPA 5F9NA 4UB3A 2ATLA 4IRDA 3UXPA 2XY7A 7ICJA 4R8UA 4DO9A 4F5PA 3GIJA 1ZQDA 4I2JA 1U47A 4NXZA 2P6UA 1X9MA 3FYHA 4QZDA 4F5QA 4RU9A 5J2IA 5CB1A 2Y1JA 2VA8A 3JPQA 1SKRA 4KITB 2KZZA 8ICYA 5J0SA 3EW9A 3H7IA 4RNOA 2R8KA 2B21A 1TKDA 4QZCA 3ISDA 1ZQQA 3BQ2A 4DSFA 4F8RA 5KG6A 4X5VA 5KFSA 3KTQA 3GIIA 5KT3A 3EZ5A 4QZHA 2A1JB 1EXNA 2BCUA 4QZGA 3JPTA 4O5CA 3QEAZ 1ZQHA 3UQ2A 5IINA 4B9SA 1COOA 4RPYA 4B9LA 4XA5A 1D8LA 3ZDEA 3NTUA 3PW0A 3PW4A 2ISPA 2PFQA 2UVRA 8ICHA 4QWEA 5BOMA 3RRGA 5DB9A 2PI5A 4LZGA 4KLUA 1MQ3A 2BCQA 2FLPA 4M9GA 2AQ0A 4ED0A 1RPLA 3ZDDA 4NM2A 3ZDAA 4B9NA 5KFIA 1D9FA 4MF2A 8ICLA 7ICHA 3Q8PB 5IILA 1TK8A 1IM4A 2FMPA 9ICPA 2BCVA 3EPGA 4DF4A 4K4IA 1L3TA 4RQ0A 1U9LA 5DLGA 4BDPA 9ICGA 2PXIA 8ICNA 4R8UB 3B0YA 3Q8LA 4YMOA 2JEJA 2W9AA 4NM1A 4F5NA 8ICSA 5J0UA 2GWSA 3K4GA 3RAXA 2KFZA 4PH5A 9ICFA 3G6YA 5KG1A 4ECWA 1TAUA 5HNKA 4UB1A 7ICFA 4UAZA 1S9FA 4I27A 8ICJA 2M9NA 8ICRA 1BPZA 4F92B 1BPEA 5KFXA 3OJUA 3G6XA 3M8RA 4DFMA 1CEZA 2ZJ8A 4TURA 2FPLA 4RPZA 3IHQB 5D49A 4Z6FA 4F2SA 4PHDA 5J0PA 5DQGA 4ED7A 5KFTA 4YMNA 2BQUA 1ZQSA 1KFDA 2R8IA 4XUSA 3MFIA 4BXOB 7ICKA 4DL3A 4ECSA 2OWOA 2IBKA 5J0RA 4UBBA 3ZD9A 5IIKA 1L3UA 3GIMA 1ZQRA 2ZTEA 1ZQBA 1Z3EB 5KFMA 3MDAA 3KHHA 4F4ZA 5KFKA 4JV1A 4K4HA 4GXIA 3EYZA 1TK0A 1S0MA 2FLNA 3JPNA 5F9LA 3NGDA 9ICLA 3B0XA 1BPBA 4ELUA 2BGWA 3M9OB 2XGQA 2XCPA 3MR6A 2I9GA 3PMLA 3KHLA 2AGPA 2JEGA 3SYZA 1JN3A 2Y1IA 5KT2A 3H4DA 1MQ2A 1JXLA 2BCSA 5DG9A 2C2RA 2WTFA 9ICNA 5KG7A 3RAQA 4F93B 4DSJA 9ICIA 3QEBZ 4PHAA 2W9MA 3ZD8A 3QZ7A 5KT6A 1L3SA 1QTMA 4B9UA 5BPCA 4KLHA 4DLGA 1NK9A 3PR4A 1XS9D 3KHGA 4I28A 2XY5A 4YG2A 3PX6A 3ZDCA 5KT7A 3PVXA 8ICZA 4J9OA 3ORYA 2Q0ZX 1JXEA 2ASLA 3H8JA 1N48A 4MFCA 3GQCA 7ICOA 1ZJMA 5EOZA 1ZQLA 8ICVA 9ICHA 3JPRA 4O3SA 1S77D 2W9CA 4HYKA 1RYSA 4RQ1A 5DGAA 2A1JA 5CHGA 3K75D 4XQ8A 3EPIA 1NJYA 4DEZA 4PPXA 2JEIA 7ICLA 4XRHA 4RQ2A 3LK9A 3TARA 4ELTA 2ASDA 4YP3A 5KT5A 4QWDA 1RXWA 2F1HA 4RQ7A 2J6UA 1ZQTA 5CR0A 4ECXA 4KLMA 5KG2A 1ZQNA 4Z6DA 4F4YA 8ICMA 4YQWA 3G6VA 3RBDA 4DSKA 1Y88A 3AU2A 3M8SA 3PY8A 2DFLA 5C5JA 4R66A 3RJHA 2BR0A 2XO7A 1B22A 5KFQA 2P6RA 4O3OA 4DQPA 5KTQA 3JPPA 4IRCA 2NRVA 4YXJA 3GILA 4PGQA 3OHBA 5DLFA 1SL2A 5L1JA 2RDJA 8ICTA 7ICSA 4Q43A 3JPSA 4YVZA 5KFJA 1D8YA 3LDAA 4QZAA 4DQRA 3MGIA 2XCAA 1ZYQA 3PO4A 1QLNA 4DSLA 3HW8A 2HHUA 1L3VA 2W9BB 4YCXA 3PNCA 1KFSA 4ECYA 1LV5A 4DFKA 7ICUA 1WCNA 3H8SA 1HJPA 4O3QA 5DG7A 3RB4A 3RH4A 4NLNA 3C65A 4ED1A 5J2KA 1NK4A 2FMSA 1XU4A 4IQUA 4DOCA 9ICWA 5KFPA 3THVA 2W9CB 3QE9Y 3TI0A 2C22A 4BXOA 4F5OA 1A77A 4QZIA 1XO1A 1KDHA 4O9MA 4KN4A 3IM1A 5J0YA 4O3NA 4RQ6A 2AU0A 4F4XA 1X2IA 4B9MA 4IQVA 4YD1A 2LYHA 2ZUBA 3ETLA 2MAXA 4PGXA 5J2FA 4ECZA 1KLNA 3T5HA 1S97A 5KFNA 2ZUDA 3RBEA 2IHNA 3RJKA 2FPKA 9ICVA 9ICCA 5CWRA 4JV2A 3OGUA 5DB7A 3T5LA 3MGHA 4I2EA 1U48A 1TFRA 2HW3A 4DFJA 7ICNA 3MR2A 7ICGA 1HUZA 4LVSA 4M9NA 5IIMA 4EBEA 3SV4A 3JPOA 1T4GA 2HHQA 4M04A 4UB2A 3KHRA 1T3NA 3C2MA 3Q8MA 2BPGA 4O0IA 4IR1A 4NLKA 8ICKA 1MC8A 3RJJA 1KRPA 4JWMA 4PHPA 4O5EA 1XSPA 4JUZA 7ICEA 5KFAA 4C8MA 1KSPA 4I2GA 3GV7B 1S0VA 5IIOA 5L1IA 5L9XA 2PFNA 4KLEA 1BPDA 5CA7A 3GV8B 1CUKA 1BGXT 5EWGA 8ICOA 4KLGA 2DPJA 4DL5A 4IQTA 5KFZA 4I2AA 5CJ7A 1NKEA 4NLZA 2IA6A 4YD2A 1UT8A 7ICRA 4M6WB 2PFPA 2P66A 9ICUA 4DL2A 3UXNA 3TQ1A 4I29A 4UB5A 3T3FA 2C2DA 4GC7A 4YR0A 2ZJAA 3C5FA 1LB2B 3MABA 4TUSA 4ECQA 2PI4A 4P4OA 1A76A 3BDPA 1ZQGA 2AGQA 4Q8FA 5J0QA 4BWMA 1T8EA 4G3IA 2NRRA 4M9HA 4LZDA 5EWFA 1AROP 4DOAA 2AQ4A 1C7YA 5KG4A 3TFSA 3V6HA 3PW7A 1MSWD 3TFRA 3MBYA 2HVHA 2BCRA 2UVWA 1JX4A 4M0AA 4ZH4A 2KZ3A 1KTQA 5KFUA 4R63A 3TAPA 9ICMA 5KFOA 2HHVA 2ZTDA 3MR5A 2HHTA 2R8HA 2BPFA 1Z00A 1ZQIA 4FO6A 2HHSA 2V4RA 4ECUA 2BHNA 4MEYA 5KFBA 2W9BA 3GFKB 4Z6CA 3Q8RB 8ICCA 9ICEA 3LWLA 4KLOA 3LWMA 4DOBA 1DGSA 2H5XA 3V7JA 3H4BA 3HP6A 3RH6A 3Q8QB 4UB4A 1N56A 4IRKA 1QSLA 4JWNA 4RZRA 4P4PA 1XC9A 4M9LA 4DSIA 3RTVA 3PX4A 4DS5A 1NK6A 1ZJNA 2FLLA 4QWCA 3E2EA 2HHWA 4Q44A 4F2RA 2J6SA 4TQSA 5KFYA 9ICOA 8ICQA 1QSSA 1NJWA 4RPXA 3SV3A 1RYRA 3H40A 1BPYA 4O5KA 3V7KA 2AJQA 4RNNA 1WCLA 2XGPA 5J0XA 4ECVA 3TANA 2KTQA 3UXOA 2DPIA 4Q45A 7ICMA 1XWLA 1SL1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ONNA 5AKIA 2QI2A 4KH4A 3SR6A 5E84A 4CJRA 2UVUA 3NF9A 3MDCA 5TZVA 4QWAA 4FJ8A 1SZ2A 5KQ8A 2G8KA 2A42A 1NJZA 4B9TA 1ZD4A 2F1IA 2YV0X 4OVLA 4KFBA 4PHEA 3IKMA 3QEVA 4E1MA 3V9WA 4GXJA 4KB0A 4FJJA 2I1QA 2AXTU 3AO3A 2HMIA 1BPXA 1Z4OA 3F2BA 3QBXA 5DDYA 4UW9A 1C0GA 2Y9UA 3MFHA 1NMDA 1U45A 1WAJA 3AVCA 2JV3A 3H8MA 4P4MA 4J9QA 2BQRA 1XI1A 4MFAA 2YMPA 3L3VA 1RGIA 2AHOB 3SI8A 4I2HA 3AVBA 3J7ZO 1P90A 4Y2PA 5KFFA 4ED8A 4QW9A 4DQSA 1X9WA 5AQYA 3M1FA 3VQBA 4I2CA 3ZT3A 4NV0A 1YTAA 7ICPA 2Z1IA 4H0YB 2KZMA 3LDPA 5AJ3K 1QH9A 1HNVA 1ZQZA 4OD0A 3RB3A 3CRXA 2BUPA 4CEAA 5CEHA 4YOYA 4M3UA 2ZGZA 4IFYA 3GIKA 1O03A 3SQ2A 5DKWA 3WKDA 3KLEA 9ICTA 5AQJA 4DU1A 5F3XB 4DWIA 2I7NA 2W55A 5DQHA 4OKJA 4PKHA 3NS1A 5CZ2A 3TADA 5JLHA 5LMUK 5BOLA 2YNGA 3I55N 4F5RA 3N97B 5HROA 1RBTA 1UOCA 4UAYA 4M3XA 5ALXA 1TVAA 3OPXA 2B6AA 1ASUA 3SMVA 4Y2RA 4HUEA 4FE3A 2P9IB 2I5JA 3SQ0A 4DTRA 4EFHA 1K1QA 1J6ZA 5DGBA 3V72A 2FMQA 2AP1A 3RJGA 2I7PA 4KN7A 2FSNA 1JIHA 4M63C 3WUHA 3C2KA 5C2FA 2XY6A 3H6EA 2JZBA 3O4WA 3VEXA 4EP4A 3OYCA 3THYA 3Q7CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4DFP A;  5KFH A;  4I2D A;  4F3O A;  4J9P A;  2UVU A;  3MDC A;  5TZV A;  1U49 A;  4J9R A;  8ICU A;  4QWA A;  7ICQ A;  1ZQU A;  1NJZ A;  4B9T A;  3ISB A;  1T7P A;  2F1I A;  4RQ8 A;  5J2A A;  4PHE A;  3PR5 B;  1NK7 A;  4K4G A;  4QZB A;  4UAW A;  4EZ9 A;  4GXJ A;  1ZQK A;  4R64 A;  1HUO A;  2I1Q A;  3HWT A;  1BPX A;  4KLS A;  5J0T A;  1ZQW A;  5DDY A;  3C5G A;  4TUP A;  3MFH A;  4YN4 A;  1U45 A;  1Z00 B;  4P4M A;  4DQI A;  4QZF A;  4J9Q A;  2BQR A;  5KFV A;  4MFA A;  2XC9 A;  3BJY A;  2J6T A;  8ICF A;  9ICX A;  3SI8 A;  4F4K A;  4I2H A;  2R8J A;  1BVS A;  5KG5 A;  5KFF A;  4J9K A;  4QW8 A;  4QW9 A;  4ED8 A;  4DQS A;  4EYI B;  2AGO A;  1X9W A;  4C8O A;  9ICJ A;  1PZN A;  4GLX A;  4KLQ A;  3BQT A;  4I2C A;  4YR2 A;  5J2H A;  4ECT A;  4EEY A;  1ZET A;  7ICP A;  1ZQF A;  2KZM A;  1NK8 A;  1ZQZ A;  4RUA A;  3RB3 A;  4ELV A;  2ALZ A;  1SKS A;  5III A;  3GIK A;  3PV8 A;  1TK5 A;  1XSL A;  5KT4 A;  1U4B A;  4I2I A;  5DKW A;  4NY8 A;  4DLE A;  9ICT A;  4F50 A;  3RR8 A;  4M6W A;  4I2F A;  3V6J A;  4DWI A; 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 4I2A A;  5CJ7 A;  1NKE A;  4NLZ A;  2IA6 A;  4YD2 A;  1UT8 A;  7ICR A;  4M6W B;  2PFP A;  2P66 A;  9ICU A;  4DL2 A;  3UXN A;  3TQ1 A;  4I29 A;  4UB5 A;  3T3F A;  2C2D A;  4GC7 A;  4YR0 A;  2ZJA A;  3C5F A;  1LB2 B;  3MAB A;  4TUS A;  4ECQ A;  2PI4 A;  4P4O A;  1A76 A;  3BDP A;  1ZQG A;  2AGQ A;  4Q8F A;  5J0Q A;  4BWM A;  1T8E A;  4G3I A;  2NRR A;  4M9H A;  4LZD A;  5EWF A;  1ARO P;  4DOA A;  2AQ4 A;  1C7Y A;  5KG4 A;  3TFS A;  3V6H A;  3PW7 A;  1MSW D;  3TFR A;  3MBY A;  2HVH A;  2BCR A;  2UVW A;  1JX4 A;  4M0A A;  4ZH4 A;  2KZ3 A;  1KTQ A;  5KFU A;  4R63 A;  3TAP A;  9ICM A;  5KFO A;  2HHV A;  2ZTD A;  3MR5 A;  2HHT A;  2R8H A;  2BPF A;  1Z00 A;  1ZQI A;  4FO6 A;  2HHS A;  2V4R A;  4ECU A;  2BHN A;  4MEY A;  5KFB A;  2W9B A;  3GFK B;  4Z6C A;  3Q8R B;  8ICC A;  9ICE A;  3LWL A;  4KLO A;  3LWM A;  4DOB A;  1DGS A;  2H5X A;  3V7J A;  3H4B A;  3HP6 A;  3RH6 A;  3Q8Q B;  4UB4 A;  1N56 A;  4IRK A;  1QSL A;  4JWN A;  4RZR A;  4P4P A;  1XC9 A;  4M9L A;  4DSI A;  3RTV A;  3PX4 A;  4DS5 A;  1NK6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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