1O4UA

Crystal structure of a nicotinate nucleotide pyrophosphorylase (tm1645) from thermotoga maritima at 2.50 a resolution
Total Genus 88

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
273
structure length
265
Chain Sequence
MEKILDLLMSFVKEDEGKLDLASFPLRNTTAGAHLLLKTENVVASGIEVSRMFLEKMGLLSKFNVEDGEYLEGTGVIGEIEGNTYKLLVAERTLLNVLSVMFSVATTTRRFAEKLKHAKIAATRKILPGLGVLQKIAVVHGGGDCVMIKDNHLKMYGSAERAVQEVRKIIPFTTKIEVEVENLEDALRAVEAGADIVMLDNLSPEEVKDISRRIKDINPNVIVEVSGGITEENVSLYDFETVDVISSSRLTLQEVFVDLSLEIQR

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH1 (1-16)AH3 (84-114)3H1 (21-26)TIV2 (17-20)S5 (75-83)TI1 (26-29)S1 (30-37)TIV5 (258-261)EMPTYS2 (41-44)TII1 (66-69)S4 (69-72)S11 (252-255)S10 (230-235)TIV3 (115-118)3H2 (242-245)O1 (124-126)TI2 (179-182)AH6 (167-176)S8 (184-188)AH7 (191-200)TI3 (226-229)TVIII1 (202-205)S9 (204-208)AH8 (212-225)TI4 (238-241)TI6 (247-250)3H3 (256-258)AH2 (47-57)S3 (60-63)AH4 (130-141)TII2 (127-130)AH5 (158-164)TIV4 (207-210)O2 (245-247)S6 (119-122)S7 (154-156)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
publication title Crystal structure of a type II quinolic acid phosphoribosyltransferase (TM1645) from Thermotoga maritima at 2.50 A resolution
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type II quinolic acid phosphoribosyltransferase
total genus 88
structure length 265
sequence length 273
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1o4uA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 1o4uA01
3M6YA 2HMCA 1ML1A 4NZFA 1ALDA 4O1DA 1X7FA 2DZVA 3C2VA 1AW2A 3QJAA 1U83A 3I7QA 1B3OA 4LRTA 4JEQA 4UTLA 3PWAA 2OCZA 2E1DA 3O1NA 3ZWSA 3TQKA 1GG0A 1LBMA 3BGJA 3GLCA 3NQEA 3M44A 3C52A 3SI9A 4H6KA 5AOUA 2YW3A 3G1HA 5EYWA 2RFGA 1SSDA 1MEIA 3CM4A 3GDKA 4OWGA 4Q32A 4PODA 3F4WA 5CPOA 3W7DA 4O10A 4O16A 3M16A 2FTPA 2FPVA 2ZTKA 2WO5A 4QIUA 1QDSA 4JIPA 5LSMA 1UUOA 1P0KA 3EWYA 1AL7A 5AC8A 1QWGA 1H62A 4AEOA 3LCGA 3T7VA 1NEYA 3HJZA 1EUAA 1AW1A 2QCLA 3IEBA 3DENA 1F05A 4FIQA 3F03K 3TQ0A 1RQEA 4WOQA 3W22A 2YW4A 3NVTA 3T40A 3S5NA 3V1PA 1XBVA 2CLIA 1YXDA 3T55A 1LROA 2H6RA 4FNQA 1YYAA 1ZAHA 5LNRA 5AHMA 5IBXC 3W87A 2GQ8A 3H53A 4JTUA 3DFPA 3TJXA 4M5PA 1VJIA 5L6UA 2WSYA 1G7UA 1VQTA 4NU7A 3W7RA 4NZJA 3C2OA 3P8JA 5G2IA 3TDFA 3PG9A 5CSSA 1Q3NA 1TJPA 3LI0A 1OFRA 2E6DA 4O4VA 3W2NA 3ZR4A 4M6VA 2J24A 4FHAA 4UIOA 2WSRA 1TPEA 3Q2DA 2Y62A 5KZMA 3LHUA 3UZJA 3GDRA 3NPUA 1SFJA 1FWNA 4I7WA 3UQNA 2EF9A 4LVBA 4NJHA 1QPRA 4L4MA 4FB7A 3KVMA 1FDYA 2WSQA 1TTIA 1J5TA 4FX7A 2Y89A 5K9CA 2YYTA 4BWLA 3U2OA 3G0XA 3W88A 4CQ8A 1R47A 4XBKA 3SIZA 4ZMGA 1H60A 1W5MA 2C14A 4MY9A 4IPIA 3LXAA 1F74A 1JUKA 3UNDA 1VRDA 3ZS4A 2QCFA 3HGOA 3W76A 3EWZA 4BI7A 1TYGA 4HNUA 4UTTA 1XBYA 5CSRA 1OX4B 1QOQA 4H4IA 2DP3A 2I14A 3W1PA 3U8GA 4M6PA 3TUUA 2Y7EA 3PVFA 4YWIA 1JR1A 1LCOA 3M0ZA 3WJSA 3GXTA 3R5EA 4LUIA 3W7JA 3EKLA 4FXSA 3W7PA 1W1ZA 3C3NA 1SZNA 1LBLA 1LYXA 4BI6A 3KXQA 4IMEA 3L5AA 4WY0F 4Z1BA 4CLMA 4I7UA 5F4SA 2JKAA 2C19A 1QO5A 4K36A 1OFDA 1UCWA 3LRMA 4RCXA 3MMTA 3NYZA 1PVNA 3C6CA 3DKJA 3QH2A 1HL2A 4WJEA 4MY8A 1RD5A 3GB6A 4GJ1A 3W1MA 3G1FA 4O19A 1KA9F 4DBEA 1XUUA 5C2XA 1JCYA 2CZDA 1BWLA 1RV8A 1QOPA 5D30A 1OFBA 3BGGA 1TV5A 1GVSA 1OYBA 4BK9A 4BI5A 1LORA 5I3IA 4O1AA 1ICPA 4LVAA 4XKYA 1H61A 2ZZ4A 3KHJA 3TH6A 5HR7A 1R2TA 4HSOA 5EPDA 4QM1A 3A23A 3W1RA 2F84A 3MI6A 3IIPA 4JN6A 1H7OA 4AVFA 2QCDB 1DQXA 5D33A 3DZ1A 3W75A 3I6RA 3EX1A 3VCRA 1NAL1 4N02A 2A6LA 4RXFA 1XBZA 3KAOA 3TAOA 4FNSA 4A21A 4PH6A 1WA3A 3NGJA 3NM1A 3LLFA 3A5FA 3W85A 1F6KA 3TMQA 3BG3A 3JS3A 4YXGA 4ZQNA 1VCGA 1PCKA 1Q45A 4U28A 1MEHA 1I2RA 2VFEA 3FJ6A 2QCNA 3BK0A 3HOJA 1W5OA 3HGRA 1L6YA 1H1YA 1LBFA 3CB8A 5D2VA 1SO5A 4IPJA 4KWVA 2VELA 1W56A 4LWWA 4FO4A 4JICA 3L0NA 2ZDRA 3CLMA 2GQAA 1X8FA 1JJKA 3P8IA 3CC1A 5EL1A 5DY3A 1T99A 3G3DA 3LHVA 1K7FA 1FDJA 1GVRA 1A5BA 2CLFA 3EX2A 1IXOA 2NV1A 4UTMA 2V5LA 5KZDA 3M7WA 3N73A 1HTIA 3W7QA 1PV8A 4IGHA 3GYEA 2QEZA 4NVTA 3P62A 1K7EA 3T44A 5MHBA 2GOUA 3VE9A 2YXGA 3HQ1A 4FX6M 2HTMA 4FNRA 1LLZA 1ZY9A 5F2LA 2VFGA 3GDLA 2OT1A 1DV7A 4NJJA 4UFHA 1DJQA 2QCHA 4O54A 1VGAA 1VS1A 3BLIA 3HMJG 3CWOX 1ZJIA 1K03A 5F2GA 4K37A 2YFOA 1TB3A 5FF3A 1G67A 3FFSA 2H8XA 4IUOA 2AAMA 2DZSA 1MSSA 1VCVA 2DJXA 1NFBA 5FEPA 4PFMA 2CWNA 1LM1A 3A21A 3WK3A 4ICNA 3C0JA 4IMDA 2YPIA 1MXSA 2JKEA 1OX4A 3M5XA 2CLKA 1Z48A 4NXKA 1I2OA 2CLLA 3FLUA 3G24A 3RLVA 1A53A 1JCJA 5F4XA 1YPFA 1PHWA 4GUGA 2QJIA 3A22A 3DFQA 4LC6A 1I2QA 3GDTA 5CPNA 3VI2A 5C5YA 4YMZA 4AWTA 3Q94A 2A21A 2FPYA 3WK2A 3NDOA 1H7RA 2CZFA 5BRBA 1T8XA 3LBMA 4CCDA 4DEFA 3NQ6A 4JTEA 3E12A 4O11A 2JGQA 3LCWA 4FF7A 1TPC1 5TQLA 5ABTA 1FWTA 4GNJA 1QAPA 3NEVA 1YTKA 7TIMA 3G8EA 3G0SA 4Y9AA 3LLDA 3I68A 3O07A 4IMCA 4LY8A 2QDGA 4JD4A 3PAJA 4LS2A 1Y0EA 1WOBA 1EP1A 3OA3A 3W7IA 1ZENA 4MOZA 1TQJA 2CZEA 3LCXA 3T4CA 2JBMA 4M19A 1TPWA 1KM2A 4M7SA 3S0CA 1A5CA 1QPOA 2C3ZA 3VFLA 4BF9A 2QCDA 4JX4A 4KFNA 1L6WA 1N7KA 2TPSA 2VFDA 3V75A 2QCGA 1K02A 3JRKA 2PURA 1EA0A 3NO5A 1W37A 4WD0A 3IIXA 4Y90A 2ZA2A 4JYEA 5I3KA 5DBUA 5AYYA 3ABQA 4Z1AA 2A6NA 1YTDA 3ZWTA 4NJIA 1K8ZA 1GTHA 3G1AA 5C54A 2DU2A 1OHLA 3TJLA 2NXGA 3WK1A 3OG3A 1OFOA 5L9FA 1TTJA 2ISVA 5EBUA 4GC4A 4S2BA 5DELA 1QCWA 3TK7A 4CNNA 1JUBA 1ME8A 4RR4A 2QCEA 2TSYA 5BMWA 3LHZA 4RKAA 4GRSA 1XKYA 1P0NA 2VEIA 2RHGA 4CCEA 2X1RA 1F5ZA 5DCEA 3L5LA 1XL9A 4GXMA 1GOXA 2NXHA 4EF8A 3R89A 2CLMA 1I2PA 1GG1A 4HN4A 2CLHA 2X1UA 1ONRA 2V81A 1FWRA 1LP6A 3SJ3A 5LGXA 3NL5A 4UTWC 3B04A 2W6RA 1DQWA 4LS1A 3TAKA 4E0CA 3UY7A 1B9BA 3TA6A 4DPPA 4FX8A 2PE4A 1N8FA 1Z41A 1M5WA 4UC5A 5DXXA 4TU1A 4LRSA 1GVQA 5E93A 4EF9A 2PRHA 1AW5A 2G97A 4UTIA 3W7KA 3KRZA 2FDSA 4N9DA 4XTIA 4H3DA 4O12A 4LV9A 3M47A 4K39A 1JVNA 2H8ZA 4NNBA 3S6DA 3FJLA 3QZEA 3A5VA 1P4CA 2QF7A 2Q3RA 1F2JA 2QUUA 2NUXA 3SR7A 1W3IA 2ZCGA 4NT0A 1ZHAA 3OVPA 4FNUA 2E77A 1LLWA 1GYNA 3NL6A 3GKFA 2P10A 1QFEA 4UFKA 3TFCA 5LHFA 1SSGA 1IXPA 3WJYA 1GWJA 1GEQA 3W1AA 3QQ1A 3G1XA 5FF2A 4UMCA 1YTEA 3NZ1A 2ZQ0A 1ZFJA 2X1TA 1LDCA 1EX5A 3IIVA 1N55A 2GQ9A 1WX0A 1H51A 1Q6LA 2A4AA 2BXVA 1MEWA 2VFHA 1ZAIA 4Y8FA 5KTLA 4RJEA 3GAKA 2E6AA 1OYCA 3AJXA 4M7TA 3RU6A 3GXPA 3L5MA 5U4NA 4JIQA 2ATMA 2Y63A 4N9EA 5K3VA 4HNNA 1K8YA 5H91A 3EXRA 5D2XA 1U5JA 3B4UA 3W3OA 4N6FA 2ZRYA 3MYPA 3KVLA 1ICSA 2E5BA 1VH7A 3R2GA 3G3MA 3EX3A 4X22A 1X1ZA 3AO0A 1XUZA 2DZXA 1EIXA 5AN7A 3RNDA 5KMYA 3NQFA 3GNNA 3FIGA 2X2GA 1T0OA 2OX1A 1NF0A 2ABBA 3NQ2A 2A7PA 1TPB1 2Z2UA 1TTPA 1O5XA 3N2XA 3WJXA 4JNMA 3IV3A 3D0CA 3TNOA 3TQVA 2YGYA 3LRKA 5HUPA 3W74A 2PCQA 4LNYA 5E0KA 5DN1A 2ZZ1A 3DAQA 4LT9A 3W7LA 3BPWA 1V7YA 3N2MA 1GTEA 1SW7A 2H3BA 1R2RA 2B7NA 3MI2A 2ZZ3A 1VHCA 2E68A 3S42A 1YDVA 3FA5A 5J5DA 5A8GA 2DORA 3IGUA 1VLWA 3MP3A 3P5YA 3O6CA 4JTLA 4UR7A 3B05A 4UFMA 5D2WA 4MUZA 4POCA 2EHHA 5D38A 3GK0A 3ZFHA 2ALDA 2A5HA 3N9SA 4DXVA 2XN2A 4EIVA 1IGSA 4U4MA 2JK2A 2ABAA 3QC3A 2CZ5A 1FWWA 3I65A 1TO3A 4O8RA 5SWUA 1H50A 2X16A 2C15A 3BLEA 4IX2A 3EWUA 5F2MA 5C6MA 5D09A 1VPXA 3B03A 5LZLA 1QNVA 4JR5A 3STGA 5D04C 5CZJA 3NR0A 4A3UA 2TMDA 1QPQA 5TBOA 1TPVA 4MJZA 4CCCA 1L6SA 3N9RA 3HGJA 3DU0A 5LNWA 2VFFA 4OQVA 4DBDA 1XI3A 3BO9A 5FF4A 4HPXA 5H2ZA 5D02A 3ABRA 4PA8A 3HB9A 4ORMA 5AYXA 1VCFA 1GT8A 2GVLA 3QW3A 3SSJA 2QDHA 1JRCA 5HINA 5D05A 3VE7A 1Q6RA 3TX9A 5G4WA 2KZHA 3EX6A 1ME7A 2JGYA 3DFNA 3RLUA 3W1UA 1DHPA 1K3UA 4O15A 3UWWA 3O63A 1H5YA 4JTKA 4O50A 4RZ4A 3HPSA 3M41A 2NWRA 5KINA 1ADOA 3RMJA 3HG4A 4FNPA 1KFEA 3IGSA 3O05A 5CPLA 2J9ZA 4WQ6A 3ABOA 4OT7A 3LXCA 3BARA 2JKPA 2ZBTA 3QMTA 3NQAA 2B7QA 4ZZ9A 5AB3A 4NX5A 4UTHA 2Z0IA 3L66A 1W5NA 5BNKA 3S9YA 4MFEA 3KOFA 3M5VA 5DY2A 4ADTA 2ZZ5A 3GX9A 5AHLA 4X9SA 1C8VA 1SW3A 3DI1A 1L2UA 1OFEA 2YFNA 1PL9A 1A5SA 2TYSA 2VEKA 3E49A 4GUIA 4RZ5A 4K7VA 1BTMA 2YYUA 4ZQOA 2OMAA 3NL2A 5GVJA 4HKPA 4XTDA 1FXQA 5G1TA 4MZ1A 2A7NA 4UTKA 2A85A 1KLYA 4HSNA 4JTHA 2W0UA 1NVMA 5IBXA 1GYLA 3U6WA 3I7RA 1TPDA 2PRLA 2PC4A 2Y7GA 3INPA 2LLEA 3GNDA 3O6YX 3N19B 3ELFA 1Z42A 4O4WA 4W9TA 2DJLA 2RDUA 4YCPA 3NPVA 5IM51 5LHEA 1W3NA 4DF0A 5G1YA 4RX0A 1A50A 3CEPA 3C61A 2Y85A 1PCWA 3P67A 4UMBA 3G8RA 4QJ1A 1LZOA 3R12A 2YX0A 4MYXA 5LGZA 4WXZA 1FUYA 2OZ0A 1NSJA 3WK0A 3PSVA 3MBFA 3G22A 1SUXA 3L65A 1OFQA 2DZWA 4UFLA 5TIMA 5EY5A 1SQ7A 3DGRA 3M5ZA 3DHDA 5DXYA 3L21A 3O06A 3O8AA 1J2WA 4DO6A 1B4KA 1SU5A 4OBTA 2CLOA 5G2WA 1D3GA 5F4WA 2ZRVA 2Y61A 2J6XA 2EGZA 4AB4A 3TMLA 3NL3A 2J27A 3USBA 5FF7A 1R2SA 2Y70A 1W8SA 1HO4A 4GUFA 4QITA 1AL8A 3IVUA 3DI0A 2V2HA 1KBJA 3RF9A 3FS2A 4O0KA 1VHNA 4CNPA 2QUTA 4AWUA 4PL1A 1G4EA 3F1QA 3W71A 1KM0A 5AYZA 3PR2A 2J88A 1TPFA 3QW4B 1VR6A 3SECA 4ZQMA 4AWSA 3NNTA 3NOEA 5D32A 3A9IA 1DVJA 3P7YA 4ZVJA 3S1VA 2V2DA 4TX9A 3SFKA 2I9EA 3IIZA 5CPMA 2VENA 1OF8A 2RH9A 5CZ0A 2QKFA 3UPWA 4O18A 4E38A 3NAVA 3W07A 4N4PA 1TPUA 1XDMA 1W0MA 3W2LA 3W72A 2QCMA 3O6DA 1FWSA 1BEUA 3IGXA 1YPIA 1QO2A 1FCBA 4I9AA 2BX7A 4ZQRA 1VYPX 1OFAA 3LHWA 2YCEA 3DFSA 4K6AA 1M7PA 1TJRA 1FX6A 3PBVA 3E0IA 3EWBX 4GE8A 1S5TA 5HULA 2GJLA 4Z1CA 1SR9A 3G1DA 3UYCA 3QPZA 2A7RA 1EPXA 4HHPA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4HN8 A;  1N8I A;  4IM4 A;  3LI0 A;  3WD0 A;  4EPE C;  5IFT A;  1OCN A;  1GKR A;  3CUG A;  4A8R A;  3AIV A;  3PZM A;  3UZJ A;  3NPU A;  1SFJ A;  4PUD A;  4I7W A;  5E5C A;  4NJH A;  5D9P A;  2P8B A;  4MB4 A;  3VNJ A;  4FB7 A;  4I5U A;  1FDY A;  1TTI A;  3QR3 A;  5K9C A;  3WSU A;  5CBB A;  2JE8 A;  1TKK A;  4GH3 A;  5A8P A;  1UWU A;  1CGX A;  4F3H A;  1W5M A;  1UD5 A;  3B8U A;  3PTK A;  1EFZ A;  3LU2 A;  3UND A;  1JDD A;  2QCF A;  3N13 A;  3GE7 A;  3HGO A;  3V3W A;  1XBY A;  1OX4 B;  1Y69 K;  3L4W A;  2R1K A;  4KGJ A;  3TUU A;  5H1S O;  4IOA J;  1BYA A;  3PVF A;  4YWI A;  1XFC A;  1LCO A;  3M0Z A;  3WJS A;  3R5E A;  3R4I A;  2PDM A;  5LA2 A;  1IT0 A;  4PBF A;  1LYX A;  4IME A;  1ZJB A;  4AVO A;  4WY0 F;  4CLM A;  2JKA A;  2C19 A;  1QO5 A;  1XLB A;  1L2Q A;  4AZ6 A;  3LRM A;  3NYZ A;  3QH2 A;  2EPN A;  3MY9 A;  1Z6K A;  1KA9 F;  2GK1 B;  5DAN A;  3TNB A;  3CCE H;  1RY0 A;  1E1C A;  3EMC A;  3L2M A;  4MMW A;  1RV8 A;  3BGG A;  4BK9 A;  1GVS A;  4BI5 A;  3CC4 H;  4LVA A;  4NAS A;  3KHJ A;  1Y7V A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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