1O4UA

Crystal structure of a nicotinate nucleotide pyrophosphorylase (tm1645) from thermotoga maritima at 2.50 a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
273
structure length
265
Chain Sequence
MEKILDLLMSFVKEDEGKLDLASFPLRNTTAGAHLLLKTENVVASGIEVSRMFLEKMGLLSKFNVEDGEYLEGTGVIGEIEGNTYKLLVAERTLLNVLSVMFSVATTTRRFAEKLKHAKIAATRKILPGLGVLQKIAVVHGGGDCVMIKDNHLKMYGSAERAVQEVRKIIPFTTKIEVEVENLEDALRAVEAGADIVMLDNLSPEEVKDISRRIKDINPNVIVEVSGGITEENVSLYDFETVDVISSSRLTLQEVFVDLSLEIQR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a type II quinolic acid phosphoribosyltransferase (TM1645) from Thermotoga maritima at 2.50 A resolution
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type II quinolic acid phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
total genus 88
structure length 265
sequence length 273
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1o4uA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 1o4uA01
4AWTA 3TJXA 2BWGA 2H8XA 1N7KA 2E6YA 2O7SA 2ZRVA 2QEZA 4JX6A 1FX6A 4ML9A 1Z48A 2EF9A 2DORA 4UTJA 2ZFAA 4X3ZA 5AHLA 2JKPA 1RD5A 1HO4A 4GBUA 5G4EA 1AL8A 3M44A 3B0UX 1EEPA 1OFOA 3BLEA 3MYPA 5J5RA 3W1NA 2EKCA 4NZJA 4TO8A 4Q33A 2V0TA 3LRKA 2WNQA 2ZZ7A 3TNOA 3S5NA 3UWZA 2A4AA 3W84A 3GDTA 3LM7A 4I7VA 2GQ9A 3ATZA 1TPC1 2VEIA 2NX9A 3IVSA 3W74A 2XFWA 4E38A 3NQ7A 3PBYA 1ME8A 1MEHA 3TV8A 3LCHA 5E0KA 4NX0A 5LNUA 3A24A 3EEGA 3GAYA 3UWUA 3HPZA 4HN4A 5ABTA 4IMDA 1VQTA 3W1RA 3F03K 3UWWA 4I7WA 4UFIA 1W37A 3HGOA 5CG7A 2A85A 3C56A 2NWSA 2V2DA 4Z0JA 4WY0A 1F05A 5DN1A 4RR4A 1KM2A 1SR9A 1SSDA 3IIZA 4MY9A 2JBMA 4ZQPA 1VJIA 3BARA 5CZ0A 3GDMA 2OX1A 2IQTA 2TPSA 4N4PA 1QPOA 3L66A 3E96A 3UPWA 2GUUA 8TIMA 3HOJA 1OFAA 2I9EA 3NPXA 3NVTA 2PRLA 4Z0SA 1TPUA 4O28A 4A22A 3IGSA 2Y70A 3R2GA 2QAFA 1J5TA 1PIIA 4A29A 5EY5A 1LOLA 3D0CA 3TR2A 1NF7A 1SPQA 5TQLA 2QR6A 3CWNA 3L5AA 2QJIA 1K7EA 1XBVA 1F7BA 1ZAHA 5G1TA 5CSRA 3M0ZA 4NU7A 4NNBA 1P5BA 3L5LA 4N9EA 2H8ZA 2G5WA 4QNEA 2WQPA 2A6LA 1YXCA 4TU1A 1FWSA 1OF6A 2PC4A 3HIJA 4O15A 1M7OA 4S2CA 4O12A 2NUWA 3S1XA 3G1AA 3JR2A 1TB3A 4FNQA 4HPXA 1DKWA 3NQDA 5K4ZA 1OX5A 1ZAJA 3E02A 3O6CA 4JTJA 3FKKA 5DCEA 4LRTA 4MY8A 3NQMA 3H53A 3EX4A 1S5VA 2HS8A 4UC5A 1Z44A 3WJZA 5IBXC 1IXQA 4NJHA 3NQ8A 1H1ZA 1A5AA 5FEWA 4MZ8A 4MVAA 3MBFA 2Y85A 2ISVA 4UTKA 3PM6A 3KFTA 2ZTJA 1IXOA 3O6DA 3P8IA 2C16A 3GDKA 4Y8FA 3G1HA 3QF0A 1PE1A 5AC6A 4AMAA 1EPXA 3OA3A 2B7PA 1MXSA 4NVTA 4EWND 1KM5A 4R33A 2ZA3A 2FB2A 1R2SA 1OFBA 1OK4A 1TYGA 4DELA 4OBTA 2BSLA 3C0JA 5LNSA 3FLUA 2CLIA 6TIMA 3QMRA 3EWUA 2P10A 4IXXA 4NJGA 1A5CA 1IGSA 5IM51 1TO3A 2W0UA 2DU2A 2J6XA 5H2ZA 1FCUA 2H6RA 4WZHA 4EF9A 1EP3A 4JTFA 5K9XA 5HWJA 4JTGA 3W1XA 1RZMA 4ZQRA 1NSJA 3IVTA 4IXHA 3LI1A 5AC7A 2CLOA 4RLIA 3QH2A 5CZTA 1OYAA 1LROA 4GJ1A 1R46A 2FPTA 3O05A 2VFFA 3W7EA 2R91A 2OCZA 3L0GA 2QCFA 2EPHA 1OHLA 2YW4A 1N8FA 1KV8A 2YSWA 2QUUA 1ML1A 3MI6A 1LOSA 4O50A 2RDWA 4WD0A 4LRSA 3SECA 2X1UA 3EWYA 1OG0A 2V5BA 4OGZA 1UASA 4LC6A 2RFGA 3S1VA 3RLUA 1ZCOA 2YGYA 4IPJA 3M5VA 2NLIA 3G1FA 3NQEA 1ME7A 3LLFA 5EMUA 3EWXA 4LUIA 3USBA 5F2LA 1TPB1 4FNUA 4LV4A 4A3UA 3KOFA 2PRHA 4LC8A 4M19A 5D32A 4MKNA 4N02A 1TJPA 1UCWA 1DL3A 2GJLA 1LRTA 1OFPA 3W1UA 2QCCA 2RHGA 5FEPA 4O52A 3C3NA 3HGRA 5HMSA 4DXVA 4POCA 2NWRA 4GUFA 2LLEA 4AHOA 4BK9A 3LOTA 5K7JA 5F4WA 5F2IA 1SFLA 3MHUA 4CNNA 1WOAA 5TIMA 5CGQA 2QJGA 2WSRA 5K2ZA 5J5DA 4Z1CA 2V2HA 3LHVA 3W88A 3FKRA 2FQIA 4CQ8A 3U2OA 1FUYA 2ZZ3A 2G96A 3V75A 4BR1A 3RNDA 3A22A 1FXQA 4ALDA 5F2GA 2QJHA 4CCEA 4KFNA 3HF3A 1IF2A 3TC7A 3DFNA 3M5YA 1OYBA 2Z1BA 3P7YA 4MJMA 3BW3A 2VENA 3TX9A 2FLIA 1LOQA 2A6NA 3QSTA 5D37A 5LSMA 1Q6LA 3BK0A 4JTIA 2A5HA 3PULA 3UZJA 1L6YA 3WK2A 1GVOA 3BO9A 4EVZA 4N6FA 3PUDA 1EP1A 2J27A 1SW7A 4NJIA 3LTPA 1H7RA 3LCLA 2B4GA 4QQ3A 3W1LA 1KW1A 4XZ9A 1I8JA 3EWWA 4LVBA 1XM3A 3KVJA 3I7QA 1H60A 4PH6A 1LBFA 3QJAA 5C6MA 3NPUA 3MBDA 4ZZ9A 2BLEA 1VCGA 2YR1A 2EAWA 1ICQA 3EXTA 3G1XA 1P4CA 2ZA2A 1Y0EA 5E93A 4XQ6A 3PUOA 1HTIA 1GQNA 3W1QA 3U6WA 4M6PA 5L6UA 3W72A 3UZ5A 3SGUA 3ABQA 1G7VA 1VHCA 3I7SA 1B9BA 1TTQA 4O17A 5K3VA 1WX0A 2V30A 4M6QA 2X2GA 3R5EA 1IIGA 1TPDA 5D02A 1QCWA 1O94A 2A7RA 5DY3A 3TK7A 3S1WA 3NQAA 1W5MA 4UMCA 3S5OA 2NXIA 2HSAA 4UTHA 4UMBA 1ALDA 3A5FA 3TSDA 4G1KA 1G7UA 3GVGA 5F1UA 3HGJA 3GB6A 4GRSA 1AW5A 3PS7A 3QRHA 1PVNA 1VZWA 4S1FA 1DJQA 1ICPA 3FEMA 4JD4A 2QKFA 3B8DA 3IEBA 1QR7A 2QCNA 4JYDA 1VC4A 3O6YX 4J9JA 1FCQA 2RH9A 1F74A 2J9ZA 3C8FA 3I68A 3RK8A 1RPXA 3HG3A 2QDHA 3SW6A 1JQVA 1S5TA 3W7DA 4IX0A 1V7YA 1B57A 4S2BA 5AYYA 1TRDA 3MHFA 2Y7EA 3Q94A 4JXCA 3W7JA 3M1ZA 3B0VC 3DFPA 2ZQ0A 5FF2A 1L9WA 4IX2A 3GAKA 1KFKA 1Q6RA 4HHPA 1JUKA 2QCLA 4IPIA 4K8EA 5BOOA 1M7PA 4MLJA 4JIQA 4JTEA 4N9BA 3W2JA 2C15A 4UTMA 4YWIA 2ZYFA 2AQWA 3LCGA 1SW0A 2UV8G 3LCFA 1O5XA 1LLWA 3PF3A 4FNRA 2I1OA 4LS2A 3SZ8A 4UNKA 4L4MA 3VI2A 3UNDA 1A5SA 2ZZ2A 3LX9A 3P82A 1H1YA 4ONVA 1TIMA 3W2UA 1UUMA 3VNDA 3G1SA 4P61A 3C61A 2YFNA 1W1ZA 2NV1A 1ADOA 3BV4A 5FF4A 4O57A 3O1NA 2C18A 2PCQA 1GVFA 1WBJA 1X7FA 5LHEA 1QPNA 3HB9A 1U5JA 4GUGA 2RDUA 3NZRA 4MY1A 2CZ5A 3GXPA 1DBTA 3T78A 1KFCA 1VH7A 5D2YA 2C0AA 4JX4A 3VE9A 3QQ0A 1TSIA 2YXGA 5KZEA 3NQGA 3GKAA 5EL1A 5LNWA 1W5OA 3CIXA 3IVUA 4Q32A 4YL2A 1G4PA 4ZQMA 4GWEA 4YCPA 3DFTA 2Y7GA 3QZEA 3L0KA 3DHFA 3SFKA 1VGAA 1LYXA 3HO8A 4GNJA 4Q4KA 2Q3RA 1VHNA 3O63A 2ISSA 1W31A 4AH7A 4AEOA 1Q6OA 3DFSA 2JK2A 3EWZA 4X9SA 1V5XA 1FDJA 4WUIA 2Y6ZA 1GG1A 4TX9A 2VFEA 5FEZA 1YDOA 2C14A 3BLFA 1OX6A 2QCMA 5LKYA 4RXGA 2TMDA 5HJLA 3R89A 1XBZA 3GK0A 4QIUA 3IRDA 3LXCA 1G4TA 1KA9F 4C1KA 5C54A 4K7VA 3W1MA 2ZRUA 3NO5A 1T96A 1W3NA 4Y9AA 3JRKA 4QISA 2ZTKA 3G8RA 1WAUA 1T8XA 4PTNA 3W7GA 5C55A 1DOSA 1TMHA 4XKYA 3OVPA 4H6KA 2QCDB 3KVKA 1RQEA 1I2PA 3W75A 4UFJA 1VR6A 3CHVA 5EYWA 3UWVA 3KVMA 1K3UA 3FA5A 1YDVA 4KWVA 4LNYA 1FCBA 4UMAA 5CKSA 2V5LA 4FIQA 1VS1A 3GDLA 4DEFA 2TSYA 5AYZA 3INPA 4JY9A 1EA0A 2ZZ5A 1H63A 2DZVA 2H3DA 4OE7A 4UFLA 1SO3A 3GXNA 3TAOA 2V9DA 4O8RA 4N6EA 1DORA 4BWLA 1F5ZA 4E2BA 1R47A 3G0SA 1TV8A 3UXAA 3P81A 2GQAA 4UTTA 3DH7A 3PSVA 5I3GA 1VRDA 3LDVA 2X30A 4UCGA 4QSHA 1JUEA 1KBIA 2Z6IA 1I2NA 4PL2A 3L21A 5U4NA 1FY6A 3W3OA 4ZQOA 4HNUA 1KM1A 3NAVA 4OHQA 2WPBA 2GVJA 2J24A 4W9TA 4M7SA 2VFHA 3S0CA 1W54A 1SFJA 3TMLA 1WYIA 3EKZA 4PODA 1WOBA 3BGJA 2NUXA 3HPSA 3EXSA 3B03A 1HG3A 3GR7A 1XCFA 4NNAA 2BZNA 3MP4A 2ISWA 3WJWA 3VE7A 5HNRA 2DZPA 4MFEA 5HINA 1HUVA 1I4NA 2P1FA 4IWWA 4JTSA 2NUYA 4O16A 1DVJA 4OT7A 4K38A 3QW3A 4O11A 2E6AA 1QPRA 4CCCA 1RQHA 5KSWA 3FS2A 3A23A 3IV3A 1WQ5A 3I6RA 3MWAA 2VC6A 4O4VA 3S9YA 5DLCA 1SZFA 3LRMA 3UY8A 2VEPA 3LXBA 4K36A 4FNSA 3W2MA 3QW4B 3NQFA 1YXYA 1RVGA 1F73A 2D73A 3I7RA 3T44A 4JX5A 3W71A 4JGDA 4BI6A 4DF0A 1W5PA 2VEMA 3SGZA 4AF0A 3NL2A 4LWWA 2CLKA 2JGYA 2DJXA 3LXAA 3QMTA 3W7OA 5HUPA 2A1YA 2WO5A 1SZEA 1OF8A 2OT0A 2Y7FA 1WXJA 1D3HA 2XN1A 4QITA 4B5NA 1P0KA 3O07A 4JR5A 2WSYA 2BXVA 5DXYA 1A53A 3TA6A 5G2WA 5HR7A 3P67A 1I45A 1L6SA 3MO7A 5AC8A 3TH6A 1E51A 3FJLA 3AJXA 4FEZA 2TYSA 3MW7A 1TRIA 2FDSA 1PHWA 4K39A 4O1BA 2YW3A 1O5KA 4CQAA 3HQ1A 1GEQA 3W70A 2VOMA 4HNNA 2O7QA 5F1VA 4IUOA 5EA9A 4ZVJA 1HL2A 4K7YA 1GJPA 1H50A 2Y7DA 1AW1A 2WSQA 2QDGA 3OVQA 5A5WA 4HT3A 2C6QA 4UR7A 4TMCA 5KINA 3LHUA 3EX1A 3T7VA 4DPPA 2W6RA 3RMJA 5D04C 1GVQA 5AFDA 3QPZA 3W83A 1RR2A 3TKFA 4JTUA 1H7XA 3KRUA 3Q2DA 3SJ3A 1X1ZA 4WJEA 3V1PA 1OJXA 2QAPA 4NJJA 5U7SA 3GXTA 1TPFA 3E9AA 1VLWA 2WOQA 3DKLA 1B4KA 4WXZA 3P60A 2DZWA 1G6CA 3QM3A 4IJBA 1JCYA 2CZDA 1A50A 4UTIA 5CPLA 1AL7A 4AXKA 1THFD 3PR2A 3LI0A 4YMZA 5KTLA 1XBXA 2Y88A 4HKPA 3BGGA 3G3DA 2E6FA 2Q8LA 5D38A 2R8WA 3FOKA 4ORMA 3W7IA 5C5YA 3G3MA 3LBCA 3MYOA 2YFOA 4LOCA 3DENA 1W5QA 1K8XA 5C2XA 4UTWC 4O1CA 2WJZA 1XDLA 2FTPA 4UTLA 3NL5A 5DCDA 3TU9A 3LERA 1JRCA 3EXRA 5HULA 2E5CA 4WX2A 4PFMA 2GJNA 2C3ZA 1ZAIA 2B7NA 3CTLA 3IIOA 4O13A 3TW7A 3C4UA 1EP2A 3PBWA 1PV8A 1QMLA 3EX2A 4GFSA 3TW6A 3NG3A 2GQ8A 1DJNA 3N2XA 1FWWA 4K6AA 1YTKA 1O60A 1I2QA 2WNNA 3RFAA 2GOUA 1AMKA 4MFDA 2Z2UA 4HSOA 4LS1A 3TDFA 3KRSA 3TJLA 1VCVA 3DHDA 5D05A 3UWYA 3FFSA 3NM1A 3F4NA 4A2RA 2CZFA 2B0MA 1QWGA 1LRNA 1P1XA 2FJKA 1ZY9A 3QFEA 4Z1BA 4HIBA 2A7PA 3QMSA 3NXFA 4ADSA 5FEXA 1KTNA 4Y6GA 3OBKA 4NXSA 2EGZA 1QFEA 3B0PA 2ATSA 2OMAA 4LUJA 3N14A 1J2WA 2ZZ4A 1TPVA 5HUOA 1K7XA 4ORIA 1R30A 5DBUA 1Z41A 3QSRA 4K37A 1KFEA 4AHPA 1LORA 1GT8A 1GZGA 3S6DA 1BWLA 4YLWA 4GC4A 1G67A 1W5NA 1JCNA 1ZALA 1J4EA 5EKYA 3WK0A 1K8ZA 3PB0A 3LHWA 4M6VA 1MSSA 5F4SA 3N34A 4Y96A 3UYCA 4WY0B 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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