1QPNA

Quinolinate phosphoribosyl transferase from mycobacterium tuberculosis in complex with ncnn
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
284
structure length
284
Chain Sequence
GLSDWELAAARAAIARGLDEDLRYGPDVTTLATVPASATTTASLVTREAGVVAGLDVALLTLNEVLGTNGYRVLDRVEDGARVPPGEALMTLEAQTRGLLTAERTMLNLVGHLSGIATATAAWVDAVRGTKAKIRDTRKTLPGLRALQKYAVRTGGGVNHRLGLGDAALIKDNHVAAAGSVVDALRAVRNAAPDLPCEVEVDSLEQLDAVLPEKPELILLDNFAVWQTQTAVQRRDSRAPTVMLESSGGLSLQTAATYAETGVDYLAVGALTHSVRVLDIGLDM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from Mycobacterium tuberculosis: a potential TB drug target.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (QUINOLINATE PHOSPHORIBOSYL TRANSFERASE)
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis h37rv
total genus 95
structure length 284
sequence length 284
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 1998-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qpnA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 1qpnA01
4UTUA 2C1HA 3QEZA 4ORIA 3A5FA 4NX0A 3T4CA 2EHHA 2NX9A 3CLMA 3IVUA 2QDHA 1GTEA 4RKAA 1R2RA 3LHTA 1NF0A 3EX3A 1H61A 2LLEA 4RZ4A 4RXFA 3BO9A 4JYEA 4AAJA 3KXQA 2DZSA 2A5HA 1TTPA 1ME8A 1ZCOA 3P80A 2PCQA 3KVMA 4LVFA 4N02A 3NZRA 3E96A 1DV7A 4AMAA 3W6YA 4JD4A 5HNRA 4HT3A 3NQVA 4AB4A 4XTDA 2RFGA 1H7XA 3IGSA 3P81A 3W83A 1XDLA 2Y7FA 5I3IA 2EF9A 3LI0A 5LNUA 3GXPA 1QMLA 5C6MA 2VXNA 2ALDA 4O16A 3ATYA 1J2WA 1OG0A 1LLWA 3W7GA 2GUUA 2J9ZA 4ZL1A 1TPUA 4UIOA 1VHCA 1OFAA 4GUIA 2QEZA 1EWDA 3LHWA 2H90A 4K7YA 5LSMA 1KV8A 4LVGA 2DZXA 4MY8A 3LCLA 3W7OA 3HG4A 2Z6IA 1RZMA 3CWOX 2J9YA 2E6AA 2YSWA 2B7OA 5J5DA 5D38A 1V7YA 3GLCA 4IQLA 1KM6A 3AJXA 3CQ0A 3T44A 3NQ7A 1S5TA 2BX7A 3TXZA 5ABTA 2QJIA 1H50A 4R34A 1AW2A 3U8GA 2ZFAA 3OEXA 1YDNA 1KFLA 5E0KA 4I7VA 4IXXA 3OVPA 5K3VA 3LHVA 1OK6A 5I3HA 1S3HA 1JVNA 1H51A 2F84A 1GVRA 3TA6A 1W54A 5D37A 1Q45A 2A2IA 1H7NA 4AHPA 5SWUA 2WNNA 3CT7A 3DXIA 3QPZA 3T78A 4OT7A 3A24A 3VCRA 3TUUA 5AHMA 2WNZA 3SY5A 2V82A 2CFFA 3JS3A 3KFTA 4RXGA 1F6PA 1W37A 3ZWSA 1KM1A 4O1AA 3P61A 1Q6LA 2ZZ3A 1TPB1 3LGEA 4TMCA 2A1YA 3RF9A 1RD5A 2NX1A 1B9BA 3NQCA 4TR9A 1TV7A 4PEKA 1LOQA 4ONVA 2QR6A 3L5MA 4IMCA 4QM1A 3NPXA 4QIUA 3O05A 4O13A 4AF0A 1X8FA 1I2RA 1F05A 1GG0A 3PWAA 3UWZA 4QQ3A 2V2CA 4ADTA 1YYAA 3Q37A 3W2UA 4CCEA 4PL1A 4DXVA 3GX9A 4O53A 1F76A 3PSVA 5TBOA 4JNMA 3TJLA 1LORA 3L65A 4UR7A 3TX9A 5KTLA 3U6WA 1WDWA 2R8WA 1WAUA 2QCDB 5CZSA 4O0ZA 4AWTA 1QPNA 3W71A 4N9DA 3W1PA 1OHLA 2V5BA 3S42A 3UNDA 3S0CA 4O52A 1VHNA 5G5IA 1SZNA 3R5EA 1IIHA 2EKCA 5F4XA 1TPH1 2NZLA 1LBFA 2WSRA 4N4QA 1DOSA 3EXTA 3W1XA 3ZWTA 1A53A 4RR4A 4IPJA 4R53A 3TQVA 3HGOA 2YFNA 3TJXA 3F4WA 4BFAA 1LYXA 1OABA 2V81A 2JK2A 2CLMA 1GYNA 3YPIA 4X3ZA 4FIQA 3EX1A 1I4NA 5AYZA 4NX5A 1LBMA 1LP6A 3W2MA 3G1VA 5KITA 4IPIA 3T55A 4GWEA 3SR7A 3QPYA 1RVGA 3EB2A 3NYZA 1W8SA 3NL5A 1LROA 1KLYA 1B4EA 2NXIA 1VH7A 3LERA 1LOSA 3C6CA 3U2OA 2YYUA 5LNVA 2H8XA 1R47A 4HPXA 2NUXA 3LTYA 3DENA 5L9FA 1GG1A 2C6QA 2CU0A 5EMUA 2YGYA 1O4UA 2Y70A 3EXRA 3QMRA 2G5WA 2QUUA 2C15A 5F2MA 3MJYA 3P82A 2DU2A 5LKYA 1TREA 1W0MA 4R33A 2WNQA 3PUDA 4BI7A 3HG5A 3W7NA 4K39A 4DQWA 4RK8A 3TFXA 1S5VA 2ZYFA 3C2VA 1VR6A 2X30A 2X16A 4LNYA 3MP4A 4A2SA 2ISWA 1KLZA 4GXMA 2OT0A 1EPXA 3W1TA 4IXHA 1OX6A 1T99A 3W3OA 4CQ9A 1BKSA 5HJLA 3MMTA 4E38A 2R14A 4I9AA 4XBSA 4ZQNA 2GVLA 3NQ2A 4UNLA 1LCOA 1JCJA 4MKNA 4N9BA 1BWLA 2W6RA 3O6YX 2QDGA 1OYAA 4LUIA 3F1QA 3EWZA 3QH2A 4KFOA 5AHNA 4BF9A 3HMJG 3S1WA 4UTTC 1GPWA 3NQFA 3BARA 4TMBA 1DBTA 4ZZ9A 4UFMA 3HF3A 1I2QA 1SW7A 3A22A 2YDAA 5CZ0A 2BSLA 3UWWA 4MJMA 1GVOA 4KWVA 3G1DA 2OZ0A 1DORA 4QAIA 1LRTA 2A6NA 4FXSA 4M19A 4DO4A 3RU6A 1OFDA 2HMCA 3KVJA 2ZRWA 3QC3A 4OWGA 3UPWA 3L21A 4O11A 1H63A 3S1XA 3ANYA 4JTKA 4N6FA 2Q3OA 2YCEA 3DU0A 1TIMA 2C13A 1YXYA 3L66A 1FUYA 4WX2A 4PODA 3H55A 5HWNA 4HPJA 4Y90A 3NXFA 4QSHA 4DF0A 3N2XA 5D05A 3S6DA 4LT9A 2ZRUA 4JEQA 4UC5A 4CCDA 6TIMA 1OF8A 1H5YA 3INPA 4FEZA 2QF7A 1OYCA 2VKZG 1R2TA 1QPRA 3BG5A 3MWAA 2AAMA 3PUEA 2V0TA 3TQKA 1SZGA 1FY6A 5CGQA 3QRHA 2A7NA 4MZ1A 3BW4A 3LX9A 1R2SA 1GVQA 3MHFA 3SFKA 4ML9A 4JTFA 3IGXA 4YMZA 3W7DA 2XN0A 3MBFA 1YXCA 3G8EA 2FFCA 4AVFA 3LRMA 5BMWA 1T96A 1KW1A 1FWRA 4OHQA 4O4VA 5HR6A 1DVJA 1ICQA 3DHDA 1C8VA 1K7EA 1GZGA 1XBYA 3BK0A 3R8RA 3BGJA 4H4IA 4B5NA 4BI5A 1JUBA 2FPYA 3W1LA 4K6AA 2V9DA 1TQJA 3SJ3A 4RZ5A 4WJEA 3W7KA 5FF2A 3M43A 2YXGA 4LVDA 1G4PA 3KOFA 3DH7A 3W72A 3I7QA 1EP1A 4S2CA 1MEHA 3PBVA 3WK0A 3O07A 1TV8A 5EBUA 1M5WA 3IIOA 1UUOA 5FF7A 1VPXA 1L2UA 1DQXA 3LCFA 4PC8A 1RV8A 4Z08A 2TYSA 1PV8A 3FYPA 4ICNA 1QO2A 4FNPA 4GJ1A 4IX2A 3ZS4A 3LDVA 4C1KA 5HWMA 2ZTJA 4Z1CA 3B8DA 3W7JA 2GQ8A 2FTPA 3T7VA 3TU9A 1E51A 1KM5A 1Z48A 4LV9A 3DKJA 2VOMA 2ISVA 2X1UA 1L6SA 1A5BA 1I2PA 1GJPA 3M41A 4IWWA 1G4SA 3STEA 1W3NA 4BK9A 5G1TA 1ZHAA 1I45A 1ZNNA 3HGJA 5K9XA 1XBZA 3NR0A 3KVKA 3TMQA 2OCZA 5J5RA 3IIPA 2DJXA 3L68A 3W1QA 1CI1A 3PULA 3NGJA 4DF1A 4HSOA 2YX0A 4WD0A 4NJKA 1VLIA 5CZJA 1HO4A 4R7JA 3IRDA 3W84A 3EWWA 1JUEA 1XFBA 3C0JA 3Q2DA 4HNNA 2VFFA 5EPDA 5GVJA 4XQ6A 2V2DA 1ONRA 1YLVA 1ZAJA 1H7PA 2AGKA 2XFWA 1VZWA 1TPWA 1K8ZA 4O4WA 1ZFJA 1SW0A 4X9SA 1NSJA 4OBTA 4O17A 3S5OA 2ZZ4A 4HNVA 3DHFA 4NXSA 3DFOA 4LS0A 2YW4A 2ZRXA 2VFIA 3WJSA 1KM0A 3DFSA 2J6XA 1L9WA 1ZY9A 3W76A 4JICA 1Y0EA 1KTNA 2R94A 3B06A 3WK3A 4O19A 1A5AA 2BXVA 3HO8A 2HTMA 2CZEA 2Y61A 1TPVA 1DL3A 3LTSA 1H1ZA 4X22A 5F1UA 2WQPA 1XI3A 1W5OA 4O0KA 4DEFA 3A21A 4G1KA 4MOZA 1ML1A 1W56A 2H6RA 3LXBA 1CW2A 3PB2A 2HSAA 2RDWA 3CEUA 3NPWA 4OV9A 1PVNA 4NJHA 3O63A 5DLCA 2VEMA 1FXQA 3LLDA 4FIRA 3ABSA 5A8GA 1H7OA 1AW5A 2ZA3A 3W74A 2CLLA 3QYQA 5CSSA 3FEMA 1VCFA 4MFDA 1GEQA 1Q3NA 4RX0A 3W88A 1VRDA 1XUUA 1IIGA 2XN2A 5K4ZA 3PM6A 3QF0A 4FNRA 3PSWA 1IXPA 2B4GA 4LV4A 1H62A 3P7YA 5IBXA 2GJLA 2OT1A 2I1OA 1TSIA 3W2KA 3CM4A 2QAFA 2NWSA 1A50A 1EP3A 3RNDA 4JX5A 4ADUA 4NVTA 3GYEA 1L6YA 4N6EA 1SO6A 1GVFA 1M7OA 2VELA 5FESA 2JBMA 2RDTA 2QUVA 3W2NA 3FKRA 3RK8A 5EA9A 5D33A 4UXDA 3LV6A 3N34A 2BLEA 3S5NA 3PB0A 2V30A 5G2HA 2E6YA 2VFGA 4LRSA 4MY9A 3I7SA 5HMSA 5U4NA 3EEGA 5LGZA 1VC4A 4N2YA 2B7PA 3PVFA 3VI2A 1MSSA 2CLFA 3IEBA 5EL1A 1YDVA 2DORA 1TMHA 2Y6ZA 3N3MA 2BTMA 3WJZA 1WXJA 3FA5A 4HN4A 1XM3A 4Y8FA 2A7PA 3GKAA 3CTLA 3IVTA 1TCDA 5BW6A 2QCGA 4UTLA 2ZZ1A 1JQVA 3L0GA 3B0UX 3G3MA 3E9AA 1TPEA 1EUAA 4IOTA 4LU0A 4FX6M 1DQWA 3LHUA 4MYAA 1M6JA 4QNEA 4JY8A 1OFOA 3GVGA 4JTGA 3QM3A 5D2VA 2ZA1A 3E0IA 3DI0A 4MYXA 1Z41A 3UXAA 3TXVA 4OGZA 3DFNA 2Y89A 5AYXA 4WZHA 3CU2A 1ICPA 1OF6A 4OV4A 4U28A 4I7WA 1GT8A 3CPRA 4LS2A 3TC6A 3W7PA 4EOUA 2YYTA 3G1XA 1EWEA 3FJLA 1ME9A 3NQMA 5HWJA 4WY0B 1FCQA 5FEZA 2Z2UA 1W3TA 3C8FA 5AHLA 5CPOA 4LS1A 6ALDA 4YCPA 1W1ZA 3KVLA 3QFEA 1KM3A 5AOUA 1D3HA 3AO0A 1EP2A 3GR8A 3NL2A 2QCLA 4IMFA 4OE7A 3M1ZA 4LC8A 5AC7A 1DJQA 3FFSA 3PG8A 3C2EA 5DBTA 1GVSA 4UMBA 4KKXA 2ZZ7A 3B04A 4PCFA 4OQVA 2WSYA 1JUKA 3R12A 2J24A 2TRSA 1FDYA 3BW3A 1O94A 3OVRA 3TSMA 5D09A 2PRHA 4YL2A 1VLWA 1W31A 5K4XA 4GUHA 3OHIA 4GE8A 4MZYA 1QPQA 1MEWA 5AHFA 2C18A 1FXPA 2R91A 4NZJA 3JR2A 3RLVA 4YWIA 3WJWA 4NU7A 4JN6A 3LI1A 3QMTA 3PBYA 2OMAA 3P74A 4ALDA 1TTQA 5TQLA 4O15A 3PY2A 1F2JA 3LCXA 3PR2A 2I14A 3A23A 1JR1A 2A0NA 4JIQA 1FBAA 3ZR4A 1XUZA 2EGZA 1UCWA 2E5CA 3IIVA 4GNJA 5AHEA 1T8XA 1N8FA 3UWQA 2ZQ0A 3LCIA 2C0AA 1QCWA 4DF2A 2E5BA 2VC6A 5C2XA 4UTWC 3EX6A 2OJPA 4IX0A 3R13A 3G1HA 2G95A 3TV8A 1SO3A 1UJPA 3C56A 3MO7A 3QJAA 4L4LA 3SIZA 3W70A 3PAJA 1QO5A 5LHEA 3OA3A 4O10A 4W9TA 5H91A 5FEPA 2QCNA 4JY9A 4RV8A 5F2LA 3TCEA 1JRBA 1TPFA 4EF9A 2EAWA 5D02A 1H60A 3LCHA 3W2LA 1UUMA 5BMXA 4UFLA 2ZBTA 1YTKA 3TH6A 3EWYA 2F7FA 1YADA 3QSRA 3UPBA 1ZAIA 3TK7A 4J9JA 5FF4A 4MLJA 4C1LA 3HQ1A 1OFPA 1THFD 1YDOA 3NQEA 3EWUA 3GDRA 1I2OA 3KAOA 2Y62A 2Y7EA 3BLIA 5K9CA 1SFLA 1QDSA 3NZ1A 3N73A 2NXGA 3CWNA 4MFEA 1JCLA 3UXDA 1S5WA 3M5VA 2GOUA 1N55A 2Z0IA 1ZALA 1NF7A 3VFLA 2QCFA 3VE7A 1Q6QA 5I3FA 3LXAA 2WPBA 2YFOA 3TAOA 1OX4A 5DN1A 1SFJA 1HG3A 3M9YA 1FX6A 2ZZ6A 2J9XA 5I3JA 2NUWA 5KMYA 3G0UA 3EKZA 1XCFA 4JR5A 2ATSA 4WXZA 4Q33A 2YPIA 3UWYA 1RPXA 4K38A 5DY2A 1HFBA 4E2BA 3G22A 2VEIA 2P10A 3I68A 3LM7A 4BWLC 2DZWA 3IV3A 2ZZ2A 4K7VA 3ABRA 3O06A 5AN7A 3W7LA 3IIXA 3N2MA 4FX8A 3NAVA 3W1UA 5G2WA 5KZMA 2V2HA 3G8RA 4CNNA 1HO1A 2ZA2A 3MP3A 4QJ1A 3SW6A 5LGXA 2J88A 3S1VA 1H7RA 3TR2A 1SO5A 3STCA 2NLIA 2YZRA 3CHVA 3G3DA 1P5BA 3O16A 1SR9A 4E2DA 3FKKA 4P2VA 4LOCA 5HUOA 4KFNA 2WOQA 5LZLA 1QR7A 3NQ6A 4UFHA 1EUNA 1WX0A 4JX6A 4NXKA 4HKPA 4Q4KA 3W07A 3LXCA 4PA8A 4IMDA 4A22A 4AWUA 5CPNA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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