1QAPA

Quinolinic acid phosphoribosyltransferase with bound quinolinic acid
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
289
structure length
289
Chain Sequence
DDRRDALLERINLDIPAAVAQALREDLGGEVDAGNDITAQLLPADTQAHATVITREDGVFCGKRWVEEVFIQLAGDDVRLTWHVDDGDAIHANQTVFELQGPARVLLTGERTALNFVQTLSGVASEVRRYVGLLAGTQTQLLDTRKTLPGLRTALKYAVLCGGGANHRLGLTDAFLIKENHIIASGSVRQAVEKAFWLHPDVPVEVEVENLDELDDALKAGADIIMLDNFNTDQMREAVKRVNGQARLEVSGNVTAETLREFAETGVDFISVGALTKHVRALDLSMRFC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A new function for a common fold: the crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords QUINOLINIC ACID PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE
molecule tags Glycosyltransferase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 77
structure length 289
sequence length 289
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 1996-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qapA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 1qapA01
1RQEA 3KRZA 3NM1A 4Y6GA 2Z0IA 1DQXA 1VGAA 1B57A 1XKYA 1ALDA 3S5OA 3STEA 1F7BA 1KFCA 5I3HA 3QPZA 3QPYA 2V5LA 4LRSA 3B0UX 4FF7A 4NXSA 2NUYA 1YPFA 3EXTA 1I2PA 4HN4A 3A22A 1MEHA 3W1RA 1KM4A 1NAL1 1HG3A 4JDYA 1X6UA 3I7QA 5AYXA 3H53A 3BLIA 1ICPA 2QUVA 3UWQA 1G6CA 1S3HA 2NX9A 1OK4A 2W0UA 2VOMA 2XN1A 4O54A 4U4MA 1EUNA 4O57A 4UTTA 1VCFA 1TV8A 1DORA 1P4CA 2WSRA 3TMQA 4H3DA 2AQWA 2ZTJA 4JICA 2EAWA 4N4PA 4MY1A 3MI3A 4KFPA 3LV6A 1J5TA 3EB2A 2VEMA 3PWAA 1E51A 1TV5A 4IMDA 3MMTA 4LVAA 1H60A 4AF0B 3TV8A 2X1RA 4Z1DA 5K4XA 1TPVA 1WQ5A 4N9BA 2EF9A 1O95A 3JRKA 4X3ZA 4A29A 1IF2A 4ZVJA 5H91A 4I7UA 4O1CA 4RV8A 4DF2A 1H61A 2ZTKA 4MVAA 4JNMA 5KMYA 3P82A 2WOQA 5A8GA 2BSLA 1JUBA 3W88A 3MBFA 4GNJA 3ABSA 4BI7A 4HNVA 5FEPA 1F5ZA 5FF0A 4MIMA 2NLIA 1I4NA 1K7XA 3LI0A 1VRDA 4MJZA 3G1FA 4ADUA 2A7RA 3M41A 3LHWA 5D05A 5D02A 1GVFA 2Z1BA 1UUMA 4NNBA 3N34A 1GVRA 1TPDA 4X9SA 4FO4A 4GUIA 1JQVA 4UR8A 2CU0A 3U6WA 3W7LA 1QDSA 1FDZA 1A5AA 5KINA 1FDJA 3OHIA 3MWAA 1SFLA 1H62A 1R30A 3PR2A 1YTDA 1RQHA 4BWLA 1M7OA 1T8XA 2B4GA 4O4VA 2Q3OA 5F4XA 5KZDA 2V8ZA 3T7VA 5L9FA 1LOQA 2X16A 4BI5A 4PH6A 3W22A 1QPQA 4Z1CA 3FYPA 1W1ZA 2A4AA 1MEWA 3S5YA 4XBSA 4NZJA 4O15A 3P84A 5SWUA 2CLLA 1SO6A 4GUFA 3TXZA 2V0TA 4FIRA 1KV8A 2ZZ3A 2QAFA 1EIXA 3LXBA 3TR2A 3EX1A 4NXKA 3O6YX 1W54A 4A2RA 1ONRA 4LUJA 1S5TA 4IMGA 2QCEA 2GJLA 2QAPA 1OFPA 2JBMA 5AHFA 4MYXA 3QMRA 1WDWA 4QAIA 4DF1A 1H7RA 1A53A 1ZNNA 1JCNA 2QCDA 2FLIA 3P74A 2R94A 1YTEA 1OF6A 2CZDA 1SQ7A 3LM7A 2E5BA 1IXOA 1TTPA 5G4EA 2JKAA 1DJQA 2V2HA 1QR7A 2V82A 2XN2A 4CNOA 5TBOA 3G22A 2WJZA 2H6RA 3B04A 4NUWA 1SW0A 4DBEA 5K9DA 4UMAA 3INPA 4O0KA 5HQEA 2VEKA 4FNPA 4BI6A 3VCRA 1W5PA 3NXFA 4TU1A 3S1WA 1IXQA 3NL3A 2C1HA 1GQNA 1VCGA 2QCGA 3G0UA 1GTHA 5K9XA 2DU2A 2JGYA 4NQ1A 2ABAA 5DY2A 4O11A 5CPMA 1JQXA 4XWUA 2VC6A 4XBKA 5LGZA 3DI1A 4YWIA 2OZ0A 4UTTC 1TQJA 2EHHA 3V1PA 3IVSA 3N2XA 3PS7A 1X1ZA 1JCJA 3W2JA 1XDMA 3V75A 4Z0SA 2PE4A 1FCUA 3EXSA 3GR8A 3RLVA 1TTIA 3LX9A 2FPYA 4OV9A 5DXXA 3T78A 1OG0A 1Q6QA 3EWBX 2FQIA 4FXRA 4NVTA 2H3DA 1RR2A 3C0JA 3WFAA 4HPJA 1FBAA 1FUYA 4ALDA 4OGZA 3SIZA 3IGUA 3HPSA 1VS1A 4KWVA 4O0ZA 3W2MA 3GDKA 3O6CA 1TJPA 2PC4A 4EIVA 3AJXA 1HO4A 3QJAA 4UR7A 5E0KA 4UFKA 4ZQNA 4CCCA 3DBPA 3UPBA 2ZQ0A 5AHMA 3HO8A 3N73A 2X1SA 1JVNA 2WNQA 4LS2A 2JK2A 3SI9A 4E0CA 3W2LA 2ZZ2A 4BK9A 2G95A 5LNWA 5BRBA 5CPNA 1M6JA 2RH9A 4JTIA 1TTJA 4NJKA 3B0PA 2Y6ZA 1AL8A 1WA3A 3W7QA 4E2DA 5EYWA 3NZRA 1EP1A 5CG7A 1W31A 4JTGA 5J5DA 3QW4B 5CPOA 2F7FA 2WV8A 2ZZ5A 3MHFA 3OVQA 2FB3A 1DV7A 4UNLA 1TPWA 2O7QA 3JR2A 3MJYA 5D33A 1PE1A 2DZUA 3BGJA 4QQ3A 3A21A 3IV3A 3WJYA 1VZWA 4U28A 1OFRA 4JYEA 5LHFA 4QIUA 2GQ9A 1TRDA 1UASA 4K7VA 2I14A 2RDWA 4OWGA 4UXDA 3OA3A 5AHNA 3NL2A 3P61A 1SZNA 2NXGA 3O8AA 2I9EA 1H7PA 4JTUA 3UXDA 4WOQA 3KFTA 3N3MA 3W2KA 4EOUA 4JN6A 3WK3A 5AC6A 1DKWA 1EUAA 1TPH1 2Z2UA 3W3OA 1YADA 3SZ8A 3LXAA 5AHIA 1VYRA 3R5EA 4UFHA 2VFIA 4LV4A 3LOTA 1O5KA 5HUOA 4OV4A 3RF9A 2C3ZA 5U4NA 3G18A 4CQAA 2Y7EA 1YPIA 5CSSA 3S5NA 4DBDA 2CZFA 3W07A 4BF9A 1DQWA 4UFJA 3WJXA 3WJWA 2YGYA 1J4EA 4O1AA 4OHQA 1P5BA 3E0IA 1EWEA 3PBVA 3LLDA 3R8RA 2B7PA 4X22A 4OU1A 2A6NA 1RVGA 5D09A 4FNRA 1AMKA 1VQTA 3T4CA 2Z6IA 3QQ1A 5D2WA 4B5NA 3L2IA 2O7SA 1G4SA 3LBCA 1IXPA 4RR4A 4ZQOA 2WKJA 5FI8A 2QDGA 2Q8LA 2GJNA 1WOBA 3Q37A 8TIMA 2CZ5A 3QRHA 3HGSA 4ZQCA 3S1XA 3L68A 2VFDA 4YCPA 4R33A 1F2JA 4KFOA 4RCXA 2BTMA 4IQLA 2WNZA 4LV9A 2ZRZA 4O10A 1VYSX 2QCLA 4I7VA 1LOLA 3Q94A 1AW2A 3L66A 1WV2A 2I1OA 1I45A 1DOSA 1ML1A 3HMJG 4HNUA 4S1FA 1NF0A 4PCFA 1KTBA 4JEQA 4BFAA 2QJIA 2J6XA 3EWXA 2WNNA 4N4QA 4M7TA 3PBYA 5MHBA 3TKFA 1A5CA 4JD4A 4ICNA 4RXGA 4RZ5A 1EEPA 3FKRA 3IIZA 2E6AA 1IIHA 3LHUA 2YSWA 1ZAIA 3E96A 4AH7A 2GQ8A 3LCWA 3GKAA 1S5WA 1XUZA 2R91A 3I7SA 1MO0A 3IEBA 3NNTA 1SW7A 5D2VA 2ZA1A 3CEPA 4JYFA 4OBTA 1BKSA 1FCVA 3CB8A 1XM3A 4UTHA 3IIPA 4WXZA 4NNAA 1QO2A 3GXPA 3SGZA 2RKXA 3FLUA 3FEMA 3L67A 5F4SA 3TC7A 1W8SA 5ABTA 1TTQA 1RD5A 1OF8A 2V2CA 5D37A 2Y89A 3BW3A 3HQ1A 5CGQA 4UTWC 2VKZG 3DFQA 4IMFA 1N8FA 1FWWA 1AL7A 3BVJA 3WK0A 5E93A 4LOCA 1YYAA 3W84A 1AW5A 1XBYA 1JR1A 4NJJA 3LERA 1W0MA 1KTCA 1OFEA 2YXGA 3MO7A 1SPQA 1VLIA 5DBUA 3KXQA 4UFMA 1K7FA 3G8RA 4EWND 3HBLA 1JCMP 3TAKA 3C6CA 1FWRA 2YR1A 3OG3A 4O4WA 4NX5A 4K38A 2Y88A 1SO4A 1FXPA 3W1XA 1S5VA 4N02A 2X30A 1R2RA 3D0CA 4OT7A 4WUIA 3PUOA 2NWRA 3VE7A 1OFQA 4IPIA 3WK1A 2DP3A 3BARA 4WXYA 1K3UA 3QH2A 1Z44A 2ZZ4A 3EEGA 4XKYB 1H63A 2CZEA 3NQAA 3LTPA 3B8DA 5IBXA 1UJPA 4N9CA 3MP4A 4PC8A 3UZJA 1GJPA 4Y96A 3L5LA 4JTHA 3Q58A 2C19A 5DXYA 3IRDA 2CLFA 2ISSA 3G8EA 2NX1A 2A2IA 4JTKA 4J9JA 4M5PA 5FF7A 4LNYA 2Q8ZA 1LM1A 3GAYA 3DFPA 1PVNA 2CLHA 3BLFA 3W86A 3R12A 3TSBA 3HIJA 2ZRVA 1LORA 1TPB1 1N7KA 5F2LA 5TIMA 4I7WA 2P0OA 3GIYA 1A50A 2OT0A 3SR7A 1SZEA 3L21A 1DHPA 4O1DA 1XXXA 1GVQA 3NA8A 2YFOA 3NZ1A 1OVDA 2ZDRA 3DXIA 5HULA 3UQNA 3FFSA 3TA6A 3SW6A 1LZOA 1HUVA 4GC4A 4MFEA 3NYZA 1PHWA 1H7NA 3FS2A 1F6PA 3N9RA 3HG3A 4RJEA 3ZWSA 4AAJA 2Y62A 3RU6A 4O18A 4LU0A 1H1YA 1U83A 4R7JA 1O94A 1I8JA 4UMBA 2A7NA 3G1XA 1FX6A 1GVSA 2J9YA 4MLJA 5F1VA 2JGQA 4AHQA 4IX2A 2X2GA 3BGGA 2VEIA 3EWZA 1DJNA 3IVTA 1D3HA 3TXVA 3W72A 4UTMA 1VPXA 2H90A 3NQ7A 1LP6A 5LNSA 1SUXA 4JTLA 3TFCA 1KV5A 2B7QA 4ORMA 4O8RA 4WOZA 3CT7A 5HUPA 2TPSA 3W75A 4LRTA 4AMAA 5KITA 3G24A 3EWYA 3A5VA 1WYIA 2X1UA 2ZBTA 3FJ6A 2DZXA 3W7PA 5FESA 1M7PA 4POCA 4X2RA 2W79A 3QMSA 1OK6A 2Y7GA 3PBUA 4HPXA 4MOZA 3KHJA 1OFAA 3EX3A 1L9WA 5AOUA 1KFEA 1TIMA 2QCMA 2CLOA 4M7SA 3LCIA 1ME8A 1GPWA 1B3OA 1B4EA 1FWTA 2H8ZA 2Z6JA 1T96A 3GYEA 4CCDA 3LRKA 5I3GA 1FWSA 4LVBA 4UTIA 1J2WA 1GYNA 3TMLA 3WK2A 3CM4A 3NM3A 3LGEA 4DF0A 1YXDA 4Y90A 1K03A 4HSNA 3QEZA 4Z1BA 3GNDA 3UWWA 5I3KA 4PA8A 2TSYA 2V9DA 4LW7A 4NJIA 1UUOA 4NNCA 1I2RA 4R34A 1TMHA 2FJKA 4A2SA 3P7YA 3M6YA 4IXXA 3BW2A 4AEOA 2FDSA 2OX1A 1RZMA 4D2JA 1TYGA 4O19A 3UZ5A 3W76A 3LHYA 3HG2A 3TW7A 3G1HA 3NR0A 5K9CA 3C2RA 2NUXA 4M6QA 2YW4A 4MLRA 1P0NA 5FF3A 3VE9A 2DZWA 1Q3NA 5HWJA 4UTKA 3S1VA 3OEXA 2VFGA 4H4IA 4RKAA 3W1NA 5E1QA 5K7JA 5F2MA 4C1LA 3KVMA 2C0AA 5AC8A 3P81A 5CSRA 4P2VA 2PRLA 5G5IA 4FNSA 1GYLA 3GX9A 4Q33A 5G4WA 3DKLA 1P0KA 3G3DA 3GLCA 5AC7A 3W1UA 4JTEA 5F2IA 5IBXC 3NQVA 3HF3A 4JX5A 3M0ZA 3TC6A 4AXKA 5I3FA 2H3BA 1A5BA 4XUGA 4LVFA 2XFWA 1CW2A 1KM2A 1KW1A 2C16A 3SY5A 2A6LA 1NFBA 2AGKA 3GAKA 3UWVA 3ELFA 2VENA 1W5MA 3M5YA 1LBMA 3TU9A 4UUIA 2Y61A 3LRMA 3MW7A 1OJXA 1P1XA 3N9SA 3GK0A 2ZRWA 4JXCA 1EPXA 3IGXA 2WQPA 2C18A 3PG9A 3P62A 3DAQA 3VI2A 4QM1A 1MEIA 1PV8A 2RDUA 3A24A 4WQ6A 3KRSA 5HR6A 5AYYA 2XN0A 6ALDA 1H1ZA 2V30A 2E6FA 1K02A 4QSHA 3S8HA 4XKYA 1X7FA 1W5NA 1C29A 1YDVA 4JTSA 5C2XA 2X1TA 2UV8G 1LRTA 1TRIA 2V5BA 3E49A 1KFLA 1JCXA 3GDRA 2A0NA 2DJLA 1KLZA 4JIPA 5BNKA 2YDAA 3W83A 3G1VA 3S6DA 4LC8A 3PC0A 4JTJA 4XZ9A 4RX0A 1QNVA 4K36A 4GUGA 3WJSA 1UCWA 2CW6A 4G1KA 5HJLA 2G5WA 4WY0B 3MYOA 4O1BA 2P1FA 4C1KA 1W37A 3G1DA 4O12A 3G0XA 1QPRA 3W1TA 3ZFHA 1V7YA 2Y70A 4QNWA 4ZZ9A 5C6MA 5EY5A 3TCEA 3W7HA 1VJIA 5GVJA 3PG8A 2DORA 3A5FA 1XL9A 3PY2A 2NWSA 3EX2A 4O28A 2Q3RA 1OYBA 1M5WA 1SO3A 1D9EA 4AF0A 1G4EA 3L0KA 3LI1A 4YL2A 5FEZA 3LLFA 1OX4B 1JUEA 4N6FA 1W5QA 2Y63A 2WO5A 4BWLC 4MY9A 5DCDA 3GZ3A 2ATSA 1XFBA 5KTLA 2FTPA 1TPFA 3FOKA 5CZSA 4EF8A 3PUDA 4AVFA 1XC4A 2J24A 3NPXA 4IX0A 3IIXA 4N6EA 1ADOA 4LS0A 2NZLA 4UCGA 2V2DA 3DENA 2YFNA 4LC6A 3U8GA 1KM0A 5IM51 2C13A 3LCGA 4UFIA 4FIQA 3CTLA 3MP3A 2BX7A 1LOSA 1Z42A 2YYTA 3IGSA 3DHFA 3S9YA 2ALDA 1UBSA 2YCEA 1C8VA 3MP5A 3TQ0A 3M7WA 2GVGA 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 1HTI A;  2PCQ A;  1TSI A;  4CNN A;  2OT1 A;  3SSJ A;  2E5D A;  1WBJ A;  4XTD A;  2A5H A;  2NXH A;  5HIN A;  1EA0 A;  1LLW A;  2PUR A;  5F4W A;  1G67 A;  1PCK A;  5FEW A;  3GVG A;  2A7P A;  1WBH A;  3FIG A;  3LDV A;  2QCD B;  3C4U A;  3NEV A;  1DL3 A;  5AHE A;  3O05 A;  3M44 A;  3E02 A;  1ICQ A;  3O07 A;  4FNT A;  4MPQ A;  1R47 A;  1FY6 A;  3STF A;  3W1Q A;  3WJZ A;  4ZQM A;  4M19 A;  4KKX A;  3LHZ A;  3FKK A;  3UY8 A;  3G0S A;  4FB7 A;  4UNK A;  3U2O A;  3CIX A;  3DFS A;  4WZH A;  4AHO A;  4O53 A;  3TIM A;  4NJG A;  1G4T A;  3LB0 A;  1JCL A;  3C2E A;  4KWW A;  3UXA A;  1VLW A;  2QJH A;  2E6D A;  4HKP A;  1LBL A;  3F4W A;  4GXM A;  2FFC A;  3BW4 A;  4YLW A;  1U5J A;  4K8E A;  4PTN A;  1JJK A;  3BG5 A;  5FF4 A;  4IXH A;  1YXC A;  1A5S A;  3W70 A;  1VR6 A;  4QNE A;  3NQC A;  3P5Z A;  4S2B A;  3P80 A;  2VFF A;  3RK8 A;  1N55 A;  3NQM A;  3QW3 A;  2CLK A;  3MHU A;  1TV7 A;  4N9D A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4IID A;  3B9E A;  2ZE0 A;  1RQH A;  1CGY A;  5XIA A;  1UZ1 A;  3FHA A;  4JEJ A;  3PN8 A;  2Q3O A;  2V8Z A;  3TOP A;  2Q02 A;  2X40 A;  3VNL A;  3CZK A;  3W22 A;  4PUN A;  3FYP A;  2VZT A;  4PEE A;  4XBS A;  4Q8U A;  4FR6 A;  4XSL A;  4Y9N A;  3S6T A;  2CLL A;  3WD2 A;  3TXZ A;  4ATW A;  4GZE A;  3RR4 A;  3U9I A;  4WCE J;  3MUY 1;  1EIX A;  3TR2 A;  3EX1 A;  3BOX A;  3QR1 A;  2OQL A;  1W54 A;  4DLF A;  1ONR A;  1S5T A;  4KEZ A;  3KWS A;  2QAP A;  3S2N A;  3NSM A;  2VCA A;  3R4I A;  1JPK A;  1X1N A;  4QAI A;  3WN6 A;  3ARP A;  4DF1 A;  2EKG A;  4PCS A;  1WKY A;  7CGT A;  1JCN A;  4X0N A;  2BOD X;  2R94 A;  1YTE A;  2CZD A;  3HZ3 A;  1GVI A;  3LM7 A;  3UVA A;  3WQD A;  3L12 A;  4XZW A;  1QR7 A;  1NDW A;  3ERP A;  4GVF A;  5CZK A;  2WJZ A;  1V6Y A;  4NI3 A;  3T0T A;  4DBE A;  5K9D A;  5KZ6 A;  5HQE A;  4GVH A;  2PDN A;  3F2D A;  1GQN A;  4C7Y A;  2QCG A;  3G0U A;  2DU2 A;  1BG9 A;  4HMD A;  5GJM A;  4QE1 A;  3T42 A;  3VZX A;  3N29 A;  4XWU A;  4XBK A;  3DI1 A;  2OZ0 A;  2ZKM X;  1TQJ A;  3CV1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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