1QAPA

Quinolinic acid phosphoribosyltransferase with bound quinolinic acid
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
289
structure length
289
Chain Sequence
DDRRDALLERINLDIPAAVAQALREDLGGEVDAGNDITAQLLPADTQAHATVITREDGVFCGKRWVEEVFIQLAGDDVRLTWHVDDGDAIHANQTVFELQGPARVLLTGERTALNFVQTLSGVASEVRRYVGLLAGTQTQLLDTRKTLPGLRTALKYAVLCGGGANHRLGLTDAFLIKENHIIASGSVRQAVEKAFWLHPDVPVEVEVENLDELDDALKAGADIIMLDNFNTDQMREAVKRVNGQARLEVSGNVTAETLREFAETGVDFISVGALTKHVRALDLSMRFC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Glycosyltransferase
molecule keywords QUINOLINIC ACID PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE
publication title A new function for a common fold: the crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 77
structure length 289
sequence length 289
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 1996-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qapA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 1qapA01
4LV4A 4BWLA 1VJIA 1TPEA 4UC5A 3TX9A 1XBYA 2TRSA 4IMDA 2RDTA 1QWGA 2E6FA 4JTFA 4JNMA 3W1MA 4XKYA 1SW7A 3S1XA 1OX6A 1MSSA 2JKEA 1YXYA 3DFOA 4BI7A 3Q58A 4OT7A 1C9DA 2QEZA 2XN2A 4BF9A 4ZQMA 2CU0A 3NXFA 4DPPA 4K7VA 1H7XA 3W7OA 4GC4A 2TYSA 1GG0A 3M1ZA 3AO0A 1VPXA 3W9ZA 2JK2A 4JTJA 3ZS4A 3B4UA 4MZYA 3M41A 1JUKA 3L2IA 2I9EA 4ONVA 3PB0A 4AHOA 4CQAA 2QCDA 2WSQA 1A5AA 2H3DA 4WXZA 3L68A 2ZZ6A 1N7KA 4OBTA 1JCJA 3NPUA 3W88A 2C14A 3W70A 5CZTA 3NL5A 1LROA 5HR7A 3VE9A 4FXRA 2NUWA 2QAFA 2R14A 4FB7A 1BWKA 3KFTA 1SSGA 1W54A 3CIWA 1XBXA 5AB3A 1X7FA 5HUOA 3HG5A 2X1TA 1IXNA 2ALDA 2QCHA 3LDVA 1MO0A 2NV2A 3G0UA 3MHGA 3KVMA 3W1NA 4O10A 4RCXA 3L67A 4GJ1A 4XKYB 2V81A 4QIUA 4RXGA 3NZRA 4O1AA 3BLEA 4GUJA 2PCQA 1G4PA 2A5HA 3PR2A 3FIGA 2E6DA 5HINA 3SR7A 2DZSA 3W7NA 1YDOA 1K02A 3KHJA 1TSIA 4JIQA 2WOQA 2C3ZA 2QCLA 3C2FA 5BMWA 3HG4A 4PTNA 4NT0A 5BOOA 1K8XA 2YR1A 5CGQA 5L6UA 4UTWC 5G4EA 3R13A 2BTMA 3DKJA 4HNVA 4JTIA 2QCDB 3TR2A 4MZ1A 4UMAA 1H5YA 3CU2A 1Q3NA 3LRKA 4RR4A 4FNSA 1VLWA 2E6AA 2QUTA 1JQXA 2WSRA 1PL9A 3UWWA 1H51A 1F74A 1BKSA 2R94A 1IIHA 1NFBA 3L5AA 3A22A 3LV6A 4Y96A 4UFIA 1R2SA 3KVJA 3QW4B 3M6YA 4XTDA 3WK3A 1G4EA 4N9EA 2HS6A 4FO4A 5I3GA 3S5ZA 3S6DA 3DFTA 3HQ1A 3M47A 4EIVA 5FEZA 5HQEA 4GUHA 1TJRA 1XM3A 3AJXA 1YDVA 2B7PA 3LCWA 3PAJA 2BLEA 3B05A 3W1TA 1VCFA 1XCFA 3IIVA 2TPSA 5K2ZA 2FB3A 3NPXA 3HGJA 2Q8ZA 3A9IA 4LOCA 3DFNA 3T7VA 4AB4A 3FS2A 3N73A 3TU9A 2CZEA 1NEYA 3N19B 3QMSA 2ZZ3A 4JY9A 2FLIA 3DENA 1B3OA 1PV8A 4GUGA 2OCZA 3TE9A 2CFFA 3DHDA 4MIMA 4WUIA 2CLMA 1E51A 4JTHA 5K9DA 5G1TA 4AHPA 1JULA 1W37A 5L9FA 2ZRXA 1A5CA 5HNRA 4FXSA 3GK0A 1SZFA 1JCMP 3WJZA 3WJWA 1D3GA 1GZGA 3C0JA 3F4NA 4ZQOA 4O15A 3HG2A 5DELA 3H54A 4YCOA 2Y62A 5K7JA 4AAJA 3I7RA 3KRZA 2YYUA 3UWQA 1KM6A 4LVFA 3MI3A 3IIXA 2Y88A 5AFDA 1FCUA 4C1LA 2H6RA 3OHIA 1EP1A 3EWYA 3EB2A 2C13A 4M7TA 3B0PA 1K8YA 3ABRA 3A5FA 3BVJA 4N9CA 2FFCA 2ZQ0A 3W22A 3EX4A 1YTDA 3NL6A 3UXDA 1YPFA 1LRQA 1O4UA 2YYTA 3TK7A 2CLFA 5CPLA 3W73A 2VFIA 5D05A 1BTMA 4FHAA 2GQAA 4YMZA 1XUZA 5CZ0A 3LXBA 1KTNA 2Z1BA 3T40A 1GG1A 1GQNA 3FA5A 3RLVA 3N9SA 3W72A 3PVFA 5EYWA 3SW6A 3P84A 3TSDA 3LLFA 1JUEA 1KLZA 4AWTA 1FWSA 5J5RA 3OG3A 4PFMA 4UNLA 1DHPA 1OABA 3IIPA 4O54A 2Q8LA 4DF2A 4EVZA 3N3MA 1FY6A 3NAVA 1LCOA 1QOPA 4IXHA 3UPBA 3P61A 2AAMA 3LM7A 3PWAA 6TIMA 1N55A 1KW1A 1WOAA 3G8EA 3LGEA 2PC4A 4ZMGA 1JRBA 4UTIA 3UZ5A 3G0SA 1S5TA 4KWWA 3GXPA 5HMSA 1VYRA 4AWUA 1KFCA 1DORA 3GLCA 1RZMA 4AVFA 4KFOA 1F6KA 3A24A 3NZ1A 2R91A 5U4NA 1YPIA 3C8FA 3ZR4A 4JICA 3MW7A 1A53A 2QJGA 3W84A 4UFHA 2O7SA 2WNZA 2ZCGA 2NLIA 1EX5A 1TTQA 4QJ1A 3GDLA 4EF8A 5BRBA 2VOMA 3LBMA 1ADOA 1C8VA 3H55A 4Y6GA 2ZRWA 1YTEA 2A6LA 3FEMA 3W7PA 1V5XA 2Y7DA 1SO4A 3C4UA 3LHVA 4RKAA 1JCNA 4OE7A 3LOTA 4A29A 4WX2A 2ABAA 3HJZA 1NF0A 5T26A 3V75A 1FWRA 4IX2A 1KBIA 4JTKA 4UTHA 2H3BA 3FJLA 1B57A 4MY9A 2DORA 1OJXA 1GTEA 2A2IA 4JTLA 3W1LA 3GR7A 3S1VA 1VC4A 1OFDA 1G67A 5G1YA 3U6WA 1Q6QA 5DN1A 1WXJA 3C3NA 4MJMA 1SW0A 5LHEA 2QUVA 2Y7GA 1AK5A 4MFDA 2Y63A 4DO4A 3PULA 1WBJA 3LCGA 1IXOA 3QFEA 3QF0A 8TIMA 3L0GA 5DBTA 2ZTKA 3CPRA 3MI6A 3TUUA 1SZEA 4LVBA 1L2UA 4IQLA 3O6CA 4CCDA 3HO8A 4LRTA 3C2EA 1VLIA 2ZFAA 2C16A 1AW2A 5HWNA 4YWIA 3TAOA 1WV2A 5KTLA 3LTSA 4ZQRA 5AC6A 4NQ1A 2FPTA 3WJYA 1JCXA 3EX6A 3NL2A 3UWYA 2VFFA 3W1RA 2EHHA 2G97A 2Y7EA 2GVJA 2Z2UA 1UBSA 4AF0A 1TV5A 3MUXA 4CNOA 1OFBA 1QO5A 3I68A 2JKPA 4UUIA 5D2YA 3LRMA 3IVTA 4O12A 3TJLA 3W7CA 3CEPA 3W07A 5DCEA 1MEWA 3TQKA 1AW5A 2QF7A 3VKJA 3LV5A 4O50A 4ORIA 5H2ZA 3PB2A 4I9AA 1LDCA 3TMLA 4GUFA 3OIXA 1ALDA 3N34A 3O07A 3B0UX 1TB3A 1QR7A 1FWWA 2PURA 4AEOA 3WJXA 1P1XA 1T96A 3RFAA 3HGSA 1DQWA 3W7HA 3L0KA 4WZHA 4GBUA 4MLRA 4Y9AA 2YFOA 5KINA 4FNUA 3PSVA 1W3IA 3FOKA 1HO4A 5CPOA 5F4XA 4UTLA 2V5BA 3S5YA 3CM4A 1SSDA 3MMTA 1HTIA 4BR1A 2LLEA 3A5VA 4LVDA 1GWJA 4YLWA 4DPQA 1RV8A 1MEIA 5HULA 4JEQA 3W7MA 1EUAA 4PC8A 3NQ8A 3P7YA 4X3ZA 3P8IA 4YL2A 2RFGA 2NUXA 1K7FA 4AF0B 3P8JA 3R2GA 4N6EA 1F6PA 3PC0A 3G1SA 3W2KA 3LXAA 5D02A 3R89A 1EWEA 5K4ZA 2A1YA 1YYAA 4O1DA 4HSNA 3ATZA 1TRDA 2DU2A 1W5QA 2EAWA 3L5MA 4UXDA 1XBVA 1TPB1 5E0KA 2FTPA 4CQ9A 2GVGA 3M5VA 2BX7A 1XUUA 4OWGA 2GJNA 1I4NA 4QNEA 4X9SA 4OU1A 4NNCA 4O14A 4NU7A 2CWNA 3W87A 2NXHA 5A5WA 1SPQA 1GJPA 5G5IA 4E2BA 2EKCA 1W56A 3B06A 2HTMA 1OYCA 1EPXA 3EX1A 1LP6A 4R34A 5FF2A 1GVSA 4O52A 1TQXA 2CZFA 4RJEA 5CPMA 5LNVA 4GFSA 1CW2A 5EKYA 1HFBA 5FF4A 2ZRZA 3R5EA 4DF1A 1JVNA 4IMGA 4B5NA 1JUBA 2ZBTA 2FDSA 3OEXA 4O0KA 4O53A 1X6UA 1AL7A 5TBOA 5BNKA 3C2VA 3GDRA 5FEPA 1FDZA 1ICPA 3DZ1A 3UQNA 3USBA 5DY2A 4J9JA 4NX5A 4MOZA 3RK8A 2V8ZA 5C55A 2ZA3A 2WSYA 2V30A 5MHBA 3O1NA 2JGQA 4DEFA 4RLIA 1W1ZA 1QOQA 2PRMA 5LNUA 4WOQA 3M5ZA 5G2HA 3E96A 3S1WA 5E93A 4FNRA 4UIOA 1TMHA 4QISA 1XDLA 3LCFA 4LS0A 4A2SA 1OFPA 4JX5A 2AGKA 4GWEA 2Y70A 4IGHA 4M6QA 5DBUA 1KM3A 3EWBX 2DZTA 2VEMA 1DJQA 2ZZ1A 5D2TA 1SFLA 2ZDRA 1S5VA 4Y8FA 4IJBA 5AHNA 2Y6ZA 3P74A 2Z6JA 2E68A 2ABBA 1H60A 2H8XA 2WNNA 3B8DA 1YXCA 2YW4A 4MPQA 3U8GA 3ANYA 3N14A 3IIOA 3JR2A 4GE8A 5G2WA 1SQ7A 3TQ0A 3NO5A 1KLYA 1WBHA 2DP3A 1P0KA 2Y89A 3TIMA 1DKWA 1SO3A 1F5ZA 2VFHA 3NM3A 2FPVA 2GOUA 3BG9A 3TCEA 4DQWA 3QSTA 4Z1AA 4JTUA 4CCCA 1I2QA 4RX0A 3BW2A 4QNWA 1F76A 2JBMA 2VEKA 4UTWA 1H1ZA 3EKLA 5F1UA 4FNQA 4IWWA 1W0MA 1IXPA 2QCFA 4N2YA 2NXGA 2E09A 5LSMA 3N2MA 2ZTJA 3ATYA 3M43A 3OVQA 1LORA 3EWXA 3W85A 2EF9A 2NWSA 2J9YA 3G0XA 4LVAA 4A22A 3O6YX 3MO7A 1C29A 2C18A 4IXXA 1ZAHA 4K39A 1J5TA 1QCWA 1I2PA 3M16A 2WQPA 1PHQA 5HWJA 3KAOA 1XKYA 3PUDA 3BG3A 1S3HA 3W2MA 1Z42A 3JRKA 3DHFA 1DOSA 1H1YA 1EWDA 3DGRA 3W74A 4GUIA 3SSJA 4O28A 1WDWA 4M19A 3L65A 2Z0IA 1EIXA 5D38A 1VYSX 1P4CA 3GAYA 4TO8A 1SZGA 3MHFA 3NQCA 3LHWA 3MI2A 3BPWA 1VCGA 6ALDA 3U2OA 3P62A 4MZ8A 1GVQA 4LRSA 3QJAA 4Z0JA 2JKAA 1DJNA 3M9YA 2RDUA 5GVJA 5D03A 4TMCA 3TXVA 3TQVA 4C1KA 1DQXA 3W2NA 4P2VA 3G1DA 2H8ZA 4UFLA 1QPOA 4O4WA 3UPWA 3ABSA 1ZY9A 4TX9A 4HNUA 3DXIA 1UB3A 3SECA 1ZFJA 5A8GA 1KFKA 5F1VA 3C52A 3WK0A 2NWRA 2WV8A 1P0NA 1KFJA 4ML9A 2E77A 2PE4A 3PBYA 4JY8A 2ZZ5A 3HF3A 1PS9A 5FEXA 1NAL1 4O17A 1LTDA 1WYIA 3ZWSA 1VHNA 4MYAA 1OFEA 4NXSA 5KZMA 5I3KA 1THFD 3UY8A 1TTPA 4PL2A 1I2OA 4CNPA 4K6AA 1NVMA 3KVKA 3CT7A 2YDAA 4NJHA 4I7VA 1KFEA 3W7GA 4LUIA 3SI9A 1DV7A 4JTEA 1Q45A 1SUXA 1X8FA 5K4XA 4BI5A 2E6YA 4FNTA 2C15A 1OF8A 3I7QA 4A21A 3C56A 4JTSA 1I8JA 4JYFA 5HUPA 4WXYA 2Y61A 3TA6A 3PSWA 2XN0A 4IX0A 3BK0A 3FFSA 1GTHA 3ABOA 3O05A 3G3DA 1SO5A 2E5BA 3W6YA 3NQ7A 2ZRVA 4PL1A 1O5KA 3IVUA 2YW3A 4RV8A 4AXKA 2I1OA 4X2RA 3NOEA 1AMKA 3Q94A 3G18A 5KSWA 2X2GA 1RVGA 3EX3A 3E12A 4LWWA 4OV4A 3W86A 4DO5A 2WJZA 1LOLA 4PA8A 3S5OA 2ZRYA 4JYEA 3CTLA 3W1PA 4POCA 2A6NA 2CZDA 2OZ0A 5DCBA 3KOFA 4LS1A 2QUUA 1FCBA 4CCEA 4JR5A 2F7FA 1EB3A 2VFEA 1UJPA 4BFAA 3L5LA 3LCHA 1DL3A 1A5SA 3GXTA 5TQLA 2ZZ2A 4HPJA 2A7NA 4LS2A 3VFLA 3W7DA 2B7OA 5AC7A 1ZHAA 1A50A 1Q6RA 4S2BA 4XBSA 5IBXC 4AWSA 3NQDA 2G5WA 3NPWA 1JR1A 1SFJA 3LX9A 3NEVA 1F05A 3B03A 2GJLA 3M5XA 3SZ8A 4BK9A 3IGUA 3NQGA 4DXVA 3QMRA 3W75A 3Q37A 3W1UA 3UD6A 1RQBA 4UTUA 4QQ3A 2DZXA 2ZRUA 4OQVA 4O19A 2W0UA 1VH7A 1YDNA 2VKZG 2WPBA 3QMTA 3ELFA 3G1YA 3QSRA 5IM51 2TSYA 1H63A 3EWWA 4O11A 1ME8A 3EKZA 3LLDA 3IRDA 2C0AA 2X1SA 3QYQA 1KM5A 2CLLA 3GDMA 2VENA 2P10A 4KFPA 2OMAA 2B7QA 2XFWA 3TFCA 2J27A 2V2DA 1ONRA 2QCNA 2RH9A 3P67A 3V1PA 3STEA 2J9ZA 1YLVA 5LGZA 2B0MA 3LB0A 4M7SA 5D30A 2V0TA 3W7KA 5CKSA 1R2TA 2YX0A 4N6FA 2DJLA 2YXGA 3MBDA 1K7XA 3TC6A 1JJKA 4X22A 5F4WA 4RZ5A 3STGA 4LY8A 3THAA 1K7EA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3STF A;  1AW1 A;  4O1C A;  5K9C A;  1PVN A;  2ZZ4 A;  1FCQ A;  5AHE A;  1K3U A;  1B9B A;  3L21 A;  1VZW A;  3FKR A;  4A2R A;  5C54 A;  4L4L A;  1X1Z A;  1K03 A;  3W2U A;  2FPY A;  1TPH 1;  3NYZ A;  3DBP A;  3HOJ A;  4K38 A;  4Z08 A;  2V2H A;  1Q6L A;  1ICQ A;  5F2I A;  1TPD A;  3L0N A;  3PBU A;  3M7W A;  3G1H A;  1VYP X;  4IMC A;  1ICS A;  5FF7 A;  4L4M A;  4WD0 A;  2QCC A;  4UR8 A;  1P5B A;  4JTG A;  4LT9 A;  4HN4 A;  2HMC A;  3OVR A;  3YPI A;  5D09 A;  4UCG A;  4LNY A;  5KZD A;  4DBE A;  4JIP A;  2OX1 A;  4UTJ A;  1H7O A;  3P81 A;  1FXQ A;  3EWZ A;  1FXP A;  1FBA A;  2BSL A;  1W5M A;  1IF2 A;  4JN6 A;  4I7U A;  1HO1 A;  1WA3 A;  3LCI A;  4TU1 A;  4O0Z A;  3QH2 A;  2A7R A;  3TC7 A;  2X16 A;  3DKL A;  1VQT A;  4JGD A;  3NQA A;  4UFK A;  4ZZ9 A;  5DXY A;  2YGY A;  7TIM A;  3LXC A;  4IUO A;  2OT0 A;  3G1V A;  4LW7 A;  2ISW A;  2H90 A;  3GAK A;  3MYO A;  3E9A A;  1KA9 F;  1ZCO A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3NVZ C;  3IJ6 A;  4NI8 A;  3GXF A;  3FX4 A;  3VMP A;  1M68 A;  3SCS A;  4DBS A;  1QNP A;  2Y8K A;  3A22 A;  3WLQ A;  5CGM A;  3OYX A;  1G4E A;  3OO2 A;  4FO4 A;  3S83 A;  4AG0 A;  3SRK A;  1CLX A;  3S6D A;  1WPC A;  4S3A A;  4BZY A;  1A0C A;  4GUH A;  3VZY A;  2HV5 A;  2PDP A;  3W1T A;  2A3B A;  2FB3 A;  2XU2 A;  4KEM A;  2Q8Z A;  3CZJ A;  4U3C A;  4C7Y A;  3T7V A;  3HJE A;  4AB4 A;  3K2G A;  3GU2 A;  3N73 A;  1AZ1 A;  3TU9 A;  2CZE A;  3SM0 A;  4US8 A;  2DSZ A;  3N19 B;  3QMS A;  2RGM A;  4PRR A;  1SIJ A;  3DEN A;  2Q01 A;  3MY9 A;  1H49 A;  5A2C A;  3B9J C;  2J6V A;  1NFG A;  2CFF A;  3UCQ A;  2AQV A;  4WF9 J;  3DLL J;  2BGS A;  4JKM A;  5L9F A;  5HNR A;  4FXS A;  1GPF A;  1JCM P;  5EMK A;  4EPK A;  3WDJ A;  1ZBK A;  3HPF A;  4US5 D;  3F4N A;  1E9I A;  3H54 A;  3DUG A;  5K7J A;  1F9C A;  4AAJ A;  2YYU A;  3UET A;  3UWQ A;  2Z2B A;  5IFP A;  4F0H A;  2X2Y A;  3GG7 A;  1IE7 C;  3OHI A;  4DNH A;  3EWY A;  2EXO A;  6TAA A;  3ICJ A;  2X05 A;  5B7Z A;  3EX4 A;  1CGY A;  3HFY A;  3ES8 A;  2I57 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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