1X1O | Genus

Total Genus 98

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	98
sequence length	277
structure length	277
Chain Sequence	WQGGLEEALRAWLREDLGQGDLTSLLVVPEDLEGEAVILAKEGGVLAGLWVAERVFALADPRTAFTPLVAEGARVAEGTEVARVRGPLRGILAGERLALNLLQRLSGIATLTRAYVEALAGTKAQILDTRKTTPGLRALEKYAVRVGGGRNHRYGLFDGILLKENHVRAAGGVGEAVRRAKARAPHYLKVEVEVRSLEELEEALEAGADLILLDNFPLEALREAVRRVGGRVPLEASGNMTLERAKAAAEAGVDYVSVGALTHSAKALDLSLLVVRP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
molecule keywords	nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
publication title	Crystal structure of project ID TT0268 from Thermus thermophilus HB8 rcsb
source organism	Thermus thermophilus
total genus	98
structure length	277
sequence length	277
chains with identical sequence	B, C
ec nomenclature	ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date	2005-04-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01729	QRPTase_C	Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A	PF02749	QRPTase_N	Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1x1oA02
3.90.1170.20	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Aldehyde Oxidoreductase; domain 3	Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain	1x1oA01

2IQTA 3KVLA 4DF2A 4JTTA 4E2BA 4Y8FA 1H7WA 2H6RA 1TPH1 3DI0A 1SFJA 2WSRA 1UB3A 4O18A 3I65A 3S6DA 3LI0A 2Q3OA 5A5WA 4NUWA 3TJXA 3KFTA 5F4XA 3MI3A 1ADOA 5CSSA 3BLEA 2WSQA 4WOQA 2KZHA 1QFEA 2QUTA 2FJKA 3OEXA 1FDZA 4LRSA 4HNUA 4ZQMA 1KM0A 3JR2A 3CTLA 3PSWA 4C1LA 1FX6A 2VFEA 1D3GA 3TSMA 1M7PA 3R89A 1K3UA 2OMAA 1B9BA 4RXGA 1M7OA 3M6YA 1I2PA 1T99A 1RZMA 2BTMA 3G22A 5HUPA 1DJQA 2Y88A 2VFFA 2X30A 3KX6A 1SFLA 4R7JA 1OFRA 1TTQA 3PS7A 1QNVA 1LLWA 3LCGA 3C6CA 2V0TA 2ZZ3A 4PFMA 4AEOA 4Y90A 3V1PA 3S8HA 4QNWA 4NT0A 4P61A 3OVRA 2V2CA 2ZYFA 3W1QA 3W1NA 1QPNA 3O05A 4GUFA 3MP3A 3KVKA 4M7SA 5AYXA 4A2SA 1GVSA 3W87A 2Z2UA 3L0NA 1GG1A 2FTPA 2WSYA 2XN1A 3GAKA 2E5BA 3DBPA 3EX3A 3MWAA 3LCXA 2ZTJA 2CLOA 3EEGA 3NEVA 4LOCA 1G6CA 1RVGA 3U8GA 4ONVA 1LP6A 3NL6A 3W2JA 3I7RA 4JR5A 4WQ6A 3W75A 1GPWA 3RNDA 1Z42A 1WQ5A 3VKJA 1LBMA 3NQGA 3I6RA 2G95A 4AAJA 3DU0A 5KSWA 3M43A 4YWIA 3SECA 5AB3A 3GB6A 1EWDA 2VFIA 3C8FA 2ABAA 4QM1A 3G8RA 4JTKA 4N2YA 1QOPA 3W1XA 3M16A 1G69A 1FCUA 2G96A 4I7WA 1I2QA 3P60A 3WK2A 3BARA 3RLUA 3WJWA 2NXIA 2WNNA 3E49A 3QMTA 3THQA 2H8XA 3QRHA 4G1KA 5AFDA 3T7VA 1D9EA 3MI2A 4JGDA 4NJGA 3TV8A 4AVFA 1EEPA 1H1YA 5F2MA 1G4PA 1OX4A 3TNOA 1JR1A 1TJPA 2E09A 5HINA 5G4EA 2CLHA 5LNRA 4Q33A 1OX5A 4DPPA 3WJXA 1WA3A 3PG8A 3LLFA 4I7VA 4JTIA 5K9CA 2Y85A 3LBMA 5ABTA 1GVFA 5TIMA 1DORA 4ZQRA 4IOTA 2ZDRA 1VC4A 2CZ5A 3G3MA 1TTIA 2OCZA 4PC8A 1FCBA 3CWNA 5D30A 2CLLA 1O4UA 3M9YA 2EGZA 4M6QA 3L0GA 4UFJA 2QCLA 5BMXA 4MUZA 4ORMA 3LCLA 4GRSA 2NUXA 3EX2A 3K30A 1WX0A 2V82A 1AK5A 3LLDA 2CW6A 4N9CA 1TRDA 2QJIA 4RK8A 5F4SA 3TDFA 1Q6QA 4OE7A 1W5MA 4CCEA 4UTMA 1VLWA 3T78A 4M6PA 2G97A 5AOUA 4FNSA 3N3MA 3R5EA 4MJMA 2CLEA 2B7PA 3IIZA 2O7QA 3SIZA 3WJZA 3FKRA 1CX9A 1HO1A 1G67A 1JUBA 1Z41A 1OYBA 2A7RA 5G2HA 3H55A 1A5CA 4A22A 2Q3RA 4A3UA 2H90A 2VEMA 3L66A 3NQVA 2QCGA 4HSNA 4O57A 1TTPA 3NQEA 3RK8A 2QAFA 5EL1A 3C2RA 4O19A 2QEZA 4PL2A 3UPBA 5F2IA 3GIYA 2X1TA 2NX1A 3WJSA 2JBMA 2A2IA 3O07A 2J24A 3TH6A 3W07A 3P82A 4HT3A 3HG2A 1DV7A 2VELA 1UBSA 2R14A 5FF2A 4O16A 3S1WA 3QMSA 4NNCA 3G8EA 4ADSA 1MO0A 3G1XA 4WOZA 1JCJA 2PRLA 1NAL1 1SQ7A 2QR6A 3QEZA 4HSOA 2NUWA 5BNKA 3M1ZA 2RKXA 3OVQA 4FX6M 1OF6A 4CQ9A 3TW7A 3A5FA 1OG0A 3DZ1A 4UMCA 4Z1BA 2ZA3A 3M7WA 5K9XA 3MP4A 1BWKA 3C4UA 1X6UA 1OX6A 2ZQ0A 3O1NA 1H5YA 3HB9A 1W1ZA 4N9BA 4M6VA 3TSDA 3CIWA 5H2ZA 4JDBA 4O54A 3VNDA 1P4CA 3N9RA 5D37A 1Z44A 1PVNA 3W7GA 3NQFA 3GDTA 2E6FA 3HPZA 4W9TA 4TMBA 3BLFA 3NOEA 2Y61A 2B4GA 3NQ7A 1BEUA 3NVTA 4GJ1A 1I2RA 3I7SA 4MFEA 1EP2A 4IUOA 3DFTA 1TRIA 4WXYA 4LT9A 4KFPA 3GYEA 1IXNA 3W7KA 4JYEA 4WXZA 5KZEA 5HWMA 3C2FA 4R33A 3LI1A 1O95A 4YMZA 2H3DA 3MBDA 3W2LA 3SGZA 4JY9A 2Y62A 4TMCA 3ZFHA 3PUDA 2P0OA 3MYPA 4KFNA 5LHEA 4K37A 4A21A 4O4WA 3P74A 1HO4A 1XI3A 3TC6A 3WK0A 3SSJA 1GJPA 2VOMA 4MLRA 3IVUA 3YPIA 4HNTA 1KLZA 2GJNA 1SU5A 3DXIA 1I2OA 1KBIA 1M6JA 3MP5A 4NX5A 4WUIA 2YR1A 2JGYA 4UXDA 4A29A 1FXQA 3QFEA 4WY0B 3ELFA 4MYXA 1UUMA 1ZFJA 2O7SA 4Y6GA 3FS2A 5CZSA 4EWND 1OJXA 3NQ8A 4IPIA 1Q6RA 1B4EA 1XUZA 4RZ4A 1FBAA 2NLIA 4Q32A 4TX9A 1YYAA 1LYXA 3STCA 4JS3A 3CPRA 3LXBA 1G4SA 3TC7A 2E6AA 4NVTA 3L9CA 5KINA 5HWJA 1PE1A 1P0KA 4EIVA 3L5LA 3FIGA 5E93A 1OF8A 4DXVA 3S1UA 1PHQA 2Q8ZA 2Y63A 2ZZ5A 4OWGA 1H63A 4NXSA 1S5WA 3NG3A 3P5YA 5F4WA 4EF8A 1HL2A 1RV8A 4OU1A 1BWLA 5U4NA 4HNVA 3KVJA 4UMBA 2J27A 3IGXA 4AHOA 1JRBA 3S5OA 5EKYA 1U5JA 3EB2A 3BVJA 3OVPA 4FHAA 1OABA 4OV9A 3KRUA 3PB0A 1RQBA 3W71A 4MOZA 1YTKA 3F1QA 2CFFA 1WOBA 5I3HA 2VFDA 3LGEA 3CC1A 3FKKA 3GXPA 2WNZA 4O0KA 1B57A 3TKFA 2BZNA 3O06A 2JKEA 1KM5A 3TIMA 1O60A 3PBUA 1JRCA 4LC8A 4Z1CA 5BW6A 3EWBX 4MYAA 2C1HA 1EA0A 1ZAIA 3M41A 5F2GA 3RLVA 1K7EA 4XTDA 3TQKA 1GT8A 1E51A 1S5TA 2C13A 3S5NA 1LRTA 4J9JA 3LV6A 3GDRA 1CW2A 2CLFA 3MHGA 4GUHA 3TSBA 1KFBA 2Y6ZA 2V2HA 2ATMA 5AHEA 1FWSA 1PL9A 1RQEA 4CLMA 3HIJA 2V5BA 5C54A 1WXJA 2E77A 2Y7FA 1MEHA 1QR7A 3NPXA 2E6YA 4YCPA 4JTHA 4MY9A 1OFPA 3E0IA 1IXPA 5HUOA 5LGXA 1LBFA 8TIMA 1W5PA 3TQ0A 5DCBA 2QCHA 3MHUA 3S0CA 3F4NA 4NZFA 3UWVA 4L4LA 4IXHA 4JEQA 2V5LA 1XDMA 1ZALA 1LM1A 3M44A 1TTJA 1GWJA 3EKLA 3NQ2A 5BMWA 4UTJA 3W2UA 2AGKA 2NX9A 4JX4A 2QCEA 1OFAA 3NO5A 2WOQA 3QF0A 2B0MA 5LZLA 3VE9A 1XXXA 5CZ0A 4ADUA 1H60A 1PCKA 1LOSA 4MZ1A 2WQPA 3N2MA 3G1SA 1JVNA 1OFBA 3SJ3A 2W6RA 4K7YA 1G4EA 3LTYA 4DO5A 3NGJA 1XC4A 4IJBA 1FY6A 3NL5A 1SSGA 1SO6A 5DBUA 4U4MA 3TAKA 3UZ5A 1GVRA 1VGAA 3LHTA 3CIXA 1OVDA 3FA5A 3G1DA 1I45A 3KAOA 2P1FA 1OFQA 3TK7A 1HFBA 2QCNA 2NXHA 2I9EA 3DFSA 3IVTA 3A23A 1YPFA 4S2BA 2V2DA 2DZUA 1H50A 4LVAA 3IIXA 3QSTA 3T4CA 4UR7A 4IMGA 4FX7A 3EX1A 5EYWA 3WJYA 4B5NA 4N9DA 4NJKA 3U6WA 1P1XA 4DO6A 3W74A 1TPWA 2ZZ2A 2C14A 4X3ZA 4OV4A 4N02A 3UWQA 1AL8A 2YW4A 4MY1A 1TB3A 3CEPA 3B0PA 4UFLA 1ME9A 1WV2A 5EBUA 1VCGA 2CLMA 1DL3A 2JK2A 1TV8A 5EPDA 3Q37A 3UY7A 3UWWA 3NQAA 2ALDA 3L67A 4CNOA 2RHGA 4JIQA 4O1BA 1F7BA 2ZRVA 1R2TA 5CPNA 2GPTA 1VPXA 2QJGA 3BW2A 2YDAA 3EXSA 4P2VA 1R2SA 1TPEA 4UTHA 3Q58A 1OX4B 3TUUA 4NJIA 2QCDA 3OA3A 1XCFA 4HPXA 4N4PA 2V81A 3L65A 3IIPA 2RH9A 4BI5A 1ICQA 2VXNA 1O5KA 4UUIA 1JJKA 2J9YA 2X1SA 3EX6A 4IPJA 1A5BA 1KM2A 2X16A 1IIGA 3DKJA 1QAPA 2A85A 4K6AA 1FWNA 5IBXA 5J5RA 2DJXA 4PA8A 4JTJA 4LWWA 1TPFA 3DHFA 1SW3A 3Q94A 3QW3A 3FYOA 3EKZA 3W76A 1PV8A 3EWWA 3W22A 1VRDA 2DZWA 4C1KA 1GVOA 4E0CA 3BG5A 4MIMA 3NQ6A 4DF1A 1ZAJA 2VEPA 5C2XA 5HR7A 4GNJA 3GDKA 1PIIA 1QOQA 1H7PA 3LXAA 4WJEA 5HWNA 5IM51 3EXRA 2WO5A 2ZBTA 1T8XA 3O8AA 1DOSA 3O15A 4NQ1A 2A6NA 4FXRA 4IQLA 3C3NA 3T44A 3P8JA 3N19B 5DN1A 2OT1A 2WPBA 3LCIA 3ATYA 2J9ZA 1XBXA 3B0VC 3LTSA 1XBZA 4Y96A 2FB3A 3GXTA 2NWSA 3VFLA 5DCDA 3W7EA 5C5YA 1RD5A 4NJHA 5CPLA 4PEKA 2ATSA 1VLIA 1TQXA 3M5XA 4TO8A 5D04C 3LHYA 7TIMA 4ZZ9A 1K8YA 1QDSA 4R53A 3C2VA 3FOKA 3SW6A 2DZXA 2GQ9A 2QDGA 3NXFA 4K39A 2CU0A 2C15A 1EUAA 4EOUA 4IGHA 1UUOA 3B4UA 3GR7A 1WOAA 2QKFA 3A24A 5FF3A 2JKAA 5I3GA 1RR2A 1ZENA 3LDVA 1OFOA 3UD6A 1F2JA 1IF2A 3LHZA 1OK4A 2F84A 3ABRA 5DCEA 5FEXA 3PULA 2ISWA 3PUOA 4WY0F 3QQ1A 5AC8A 3LHUA 1AG1O 1RPXA 4MFDA 1H7XA 4D2JA 3ABSA 3BO9A 3P8IA 1ZHAA 4EF9A 2A1YA 3G0XA 3N34A 3B05A 4N9EA 1H7OA 5T26A 3U2OA 1VH7A 3GDLA 5LNSA 1EP3A 5EMUA 4X9SA 2RDTA 2D73A 1LLZA 4JTSA 1LDCA 4IMEA 1TSIA 1XM3A 5K3VA 3JRKA 6ALDA 3C61A 3PAJA 3TCEA 1H61A 4LC6A 1J4EA 3W7HA 3MO7A 4WZHA 3IRDA 3W3OA 2CZDA 5G4WA 4DELA 3LOTA 1G7UA 3N73A 3KHJA 1VCFA 1PS9A 2ZFAA 3DHDA 4I9AA 1NVMA 2C19A 3S5YA 3LXCA 3W7DA 1YLVA 1J5TA 3TROA 4Z0SA 2C16A 2WKJA 4HPJA 1K8XA 3MBFA 4K38A 5D03A 5HULA 2EKCA 4UNKA 3FJLA 4X2RA 3W83A 2OJPA 2WJZA 2OT0A 3ANYA 3WFAA 4N6EA 5AHIA 1OFDA 5CPMA 3TE9A 1X1ZA 4L4MA 1ME7A 4AF0B 1QWGA 1NSJA 2E68A 3R12A 3W7MA 1JCYA 2ZRXA 4NNAA 3DKLA 1X1OA 4UTTC 3W7PA 3FEMA 4XBSA 2ZTKA 4E2DA 4XQ6A 3LRKA 5D2WA 1NF7A 1DQWA 4LS2A 1AMKA 1THFD 4GFSA 1SO5A 5DBTA 2A21A 1W31A 3P61A 3GDMA 5D2TA 3D0CA 1F5ZA 1GOXA 4GBUA 3TJLA 2YZRA 4QISA 4CCDA 1SZEA 2R91A 1Y0EA 3MI6A 3NPUA 4UMAA 1C8VA 1NFBA 5CZTA 2C3ZA 2P10A 3QQ0A 1SW7A 1R46A 4CNPA 4JTLA 3TR2A 1T96A 4RX0A 4UFHA 3PBYA 3IIVA 1KBJA 2AQWA 4NNBA 3GKAA 1KM3A 1TIMA 1B3OA 4BI6A 1IIHA 4CNNA 1AW1A 2EPHA 1BTMA 1OYCA 1SSDA 2CZFA 2DJLA 3UZJA 3W7LA 1FWRA 3M5ZA 3P81A 4FNUA 1VHNA 4O14A 2E1DA 4LS0A 2TYSA 4NXKA 4BI7A 4N6FA 4UTTA 1S5VA 1SO4A 3HF3A 3NQDA 4H3DA 4JTGA 2CWNA 2NXGA 2FB2A 1I8JA 1A5AA 2W79A 2VKZG 1JUEA 1LROA 3UPWA 3P5ZA 4MJZA 2OX1A 1L6YA 5FEZA 1KLYA 1VS1A 4MVAA 3CM4A 4O1DA 1M5WA 4RZ6A 3SFKA 3A9IA 5HMSA 3UWZA 1TPVA 4O4VA 3NZRA 3MHFA 1WDWA 3BG3A 4UTUA 3M47A 3QSRA 1RQHA 4R34A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1HJW A;  3AIW A;  3TDF A;  1W5M A;  1HZY A;  5FJT A;  4IL2 A;  5AOU A;  4FNS A;  1BF6 A;  4K1G A;  2ZUS A;  2CLE A;  1G5A A;  4IIB A;  5KET A;  3WJZ A;  1HO1 A;  2HNE A;  1G67 A;  1XWY A;  4R7W A;  1MW2 A;  1PJ9 A;  4CQD A;  1CYG A;  3L66 A;  3NQV A;  2QCG A;  1TVL A;  3TYD A;  1TTP A;  3OGV A;  2NX1 A;  1KO0 A;  2JBM A;  2CER A;  1YNY A;  4K2S A;  2J24 A;  3TH6 A;  2FTW A;  3P82 A;  2OSY A;  2VEL A;  1UBS A;  2R14 A;  4ENL A;  1K4H A;  4PRR A;  3W81 A;  5C8B B;  4GY1 A;  4A8I A;  4WOZ A;  1JCJ A;  2PRL A;  2QR6 A;  3QEZ A;  1QHP A;  2YLL A;  3M1Z A;  4GY0 A;  5FJJ A;  2XWD A;  3VDA A;  4XAZ A;  4AY1 A;  1OD0 A;  3PZQ A;  3A5F A;  2O92 A;  4XZB A;  5K9X A;  3MP4 A;  2ZQ0 A;  1H5Y A;  1T41 A;  1W1Z A;  3L7R A;  3TSD A;  4CNT A;  4JDB A;  2BV9 A;  3VND A;  1MFV A;  3SN1 A;  1Z44 A;  2JF7 A;  1GUV A;  1PVN A;  1MW0 A;  2OB3 A;  1POJ A;  3GDT A;  2G3N A;  1SIJ A;  5EB8 A;  4OOZ A;  4UQB A;  3NOE A;  5G1M A;  3DBN A;  3NQ7 A;  5IHR A;  3BAJ A;  3ZJK A;  1NIU A;  4H41 A;  4WXY A;  2GK1 B;  4GZI A; 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 3BGJ A;  3C8N A;  4L1X A;  3V0S A;  3CYJ A;  3COT A;  3DEN A;  3EXT A;  4JY8 A;  2VZV A;  3K4A A;  3UJS A;  1Q6G A;  2J47 A;  4W86 A;  1RBL A;  4QEE A;  5I2U A;  4FNP A;  5F1U A;  4AB4 A;  4FF7 A;  3W1M A;  1XLH A;  4GUJ A;  4ZOA A;  2Z25 A;  4B4F A;  3V75 A;  2Z00 A;  4YXG A;  5FAC A;  3DFN A;  3EWD A;  1JYW A;  1V7A A;  3BSH A;  2WHL A;  3BLI A;  1W3N A;  1ODZ A;  1JRP B;  4GKT A;  1TQJ A;  3AUO A;  3AJX A;  2EBN A;  1PHW A;  1DVJ A;  3GAY A;  1K77 A;  4BF7 A;  1C8Q A;  4P8U A;  1FO4 A;  1R87 A;  2E4T A;  3W38 A;  4I3G A;  4AWS A;  5G2W A;  3ITG A;  3LV5 A;  3TYU A;  3ABQ A;  3GIP A;  1QO2 A;  2E3T A;  1ZBW A;  1VQT A;  1DWF M;  5AZ1 A;  1SJC A;  4AYS A;  1EOM A;  1E55 A;  1EUN A;  2CZV A;  3ZWS A;  1N7K A;  3I55 H;  3STE A;  4YHE A;  3LX9 A;  2XDF A;  1BRL B;  4D6E A;  4H8N A;  1ICP A;  1P6C A;  1GOM A;  2W27 A;  1JFX A;  1MI3 A;  1XIN A;  1VYR A;  4LVD A;  3G1H A;  4O1F A;  3NQC A;  5KZD A;  2J7E A;  2QV4 A;  4ZQN A;  3UR5 A;  2H3B A;  4DLF A;  1PTG A;  3BPW A;  4R3U A;  1V93 A;  3W1A A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1X1OA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations