2B7NA

Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from helicobacter pylori
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MEIRTFLERALKEDLGHGDLFERVLEKDFKATAFVRAKQEGVFSGEKYALELLEMTGIECVQTIKDKERFKPKDALMEIRGDFSMLLKVERTLLNLLQHSSGIATLTSRFVEALNSHKVRLLDTRKTRPLLRIFEKYSVLNGGASNHRLGLDDALMLKDTHLRHVKDLKSFLTHARKNLPFTAKIEIECESFEEAKNAMNAGADIVMCDNLSVLETKEIAAYRDAHYPFVLLEASGNISLESINAYAKSGVDAISVGALIHQATFIDMHMKMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from Helicobacter pylori
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
molecule tags Transferase
source organism Helicobacter pylori
total genus 88
structure length 273
sequence length 273
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2b7nA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2b7nA01
5HULA 4RXFA 3KOFA 5KSWA 4BR1A 3DFNA 5CPLA 3W1RA 4UTTA 3W7NA 3Q58A 4FX7A 4UC5A 1SR9A 3R8RA 1F73A 2A1YA 2NX1A 2O7QA 1OFQA 3IIOA 4A22A 2Y7GA 1W1ZA 3LTPA 1QPOA 2QCCA 4R34A 5G2IA 4O16A 5D33A 4Z1AA 3CIWA 1X7FA 3W7OA 1O4UA 1SW3A 3QSRA 4JTGA 3FA5A 2C3ZA 2WO5A 3WK0A 5TQLA 1HG3A 1R2TA 4MVAA 3KHJA 4JX5A 3P74A 4IXXA 3DFOA 1OK6A 2GJLA 1W56A 4UTLA 2NXIA 2BZNA 3CEUA 4JTKA 1UASA 3BG3A 3HG4A 3ANYA 1D3HA 4J9JA 3NG3A 3GK0A 1VCFA 3FYPA 3G1DA 3LBCA 1R2RA 5C54A 3RFAA 5ABTA 3QPYA 4N9CA 3NL6A 1R30A 1F5ZA 3TC6A 1PVNA 5HWNA 4JIQA 4RCXA 3W70A 1GTEA 3HG5A 1O5XA 1XUUA 2YZRA 3PY2A 3EKZA 1W5PA 2X1UA 3UXAA 1K8YA 3AO0A 4I7UA 4O17A 1TTJA 3OA3A 3PC0A 2GVLA 2R94A 5EBUA 1I2QA 2EGZA 3P81A 3CIXA 3SECA 2QCGA 3G3MA 2J9ZA 3O07A 3A5FA 1C8VA 2VELA 3IV3A 1VYSX 2A0NA 5CZJA 3W1TA 4HNNA 1HO1A 4H6KA 3W6YA 3C52A 3OEXA 3HBLA 3TW6A 5KTLA 3TV8A 4A2SA 3GDMA 4NX0A 3DHFA 3QQ1A 1SO3A 5BOOA 1G4EA 1QPRA 1UCWA 4MJMA 3I7QA 5LKYA 4ZZ9A 6ALDA 1FBAA 3S0CA 4UUIA 4L4MA 3LBMA 4LVFA 4A3UA 2EAWA 1W5MA 4ALDA 2G95A 2FJKA 1FQ0A 3NL3A 1FCUA 2A85A 2XN0A 1TMHA 4NT0A 2ZRUA 1B9BA 1Z44A 1VHCA 2ABBA 3HOJA 5IM51 5FF7A 4GXMA 5HWMA 1SPQA 1OABA 5HWJA 1SUXA 3QPZA 3WJZA 2A5HA 5KMYA 4IMFA 5LGXA 3BLFA 3C56A 3M41A 4AF0B 1EB3A 2BXVA 3PBYA 4QNWA 1G67A 3W1XA 3PSVA 3C6CA 1I8JA 3B05A 5CZTA 1PS9A 3P62A 1FXQA 5U7SA 4ORIA 2AGKA 1BEUA 1K02A 3G1YA 2CZEA 4BK9A 4NXSA 1LOSA 5K2ZA 4NU7A 4CNPA 4IMEA 3LDVA 4X3ZA 4PC8A 3CU2A 3MP4A 4FNTA 3W72A 2J9XA 2C16A 3C2VA 4X9SA 2NUXA 4YLWA 1TO3A 3S5ZA 3VFLA 2QCFA 1MSSA 1KTBA 1QAPA 2FFCA 4AWUA 1C29A 3R89A 4PTNA 3P7YA 1SO6A 3DFTA 3LI0A 4WY0A 3W71A 1VYRA 3W76A 3S8HA 1DORA 3FFSA 2DZXA 2QCLA 5E0KA 3U8GA 5G1TA 5AYXA 1F2JA 4O15A 4XBKA 2X16A 1Q6RA 4UIOA 1N7KA 4UTHA 2QCNA 5HR6A 4UFHA 4Z1DA 1F05A 2ZQ0A 4JD4A 3KX6A 5G5IA 3TAOA 3MI2A 2E5BA 4WOQA 2Z1BA 4RK8A 2Z2UA 3QEZA 4O18A 1NAL1 4E2BA 2A2IA 3HB9A 3W3OA 3N9RA 4O12A 1M7OA 4QM1A 1FWNA 5DCBA 2CLOA 3UZ5A 4ZVJA 1ME9A 2B7PA 1W54A 4AAJA 1TCDA 3BG9A 4N9DA 2VOMA 3HIJA 3GB6A 2ZZ5A 3FYOA 1WQ5A 3E49A 3EX3A 1RV8A 3NQGA 4JDYA 4M19A 4K39A 5FF3A 4UNKA 4BWLC 4S2BA 1X1ZA 5FI8A 5K4ZA 1QPNA 1JRBA 2CLKA 3NQAA 1Z42A 4X22A 3L5AA 5FESA 5LNVA 3GDLA 5TIMA 3G18A 2OT1A 4LTSA 3NYZA 4O53A 5AHFA 2Y6ZA 3CQ0A 3R13A 1KM6A 1NF0A 1AK5A 4PCFA 4IPJA 1VYPX 2ZZ1A 1NVMA 3TJXA 3PBUA 2DP3A 2QCDB 5A8GA 3FKKA 3KVJA 5EMUA 4UTKA 1VC4A 4Y8FA 4N6EA 1FWWA 3NA8A 1VLIA 4Q32A 3FKRA 4POCA 1EP1A 2PRMA 1TQJA 2H90A 4LOCA 1TPVA 4NNCA 1H60A 4O0ZA 4Z1BA 5MHBA 3THAA 3NZRA 2NV2A 3W7HA 3O6CA 1TRDA 3TE9A 4EWND 3BVJA 1AW5A 1DKWA 1JULA 4GNJA 5FEXA 1GOXA 4N9EA 1H7NA 2HS8A 5L6UA 4LVAA 3OIXA 1TPDA 2V2HA 4W9TA 1IXPA 2E6FA 3KVMA 3P82A 1FWSA 1JUKA 3IIXA 1H51A 4HT3A 3F4NA 3EX2A 2V5BA 1YTEA 4WD0A 1EWDA 4O4WA 2AAMA 4LU0A 1XBVA 5CSSA 3DENA 5KZEA 2YFOA 1KM3A 3MWAA 5CPOA 3IRDA 4K38A 2YDAA 3GKAA 2YFNA 1T0OA 4EIVA 1TTPA 4B5NA 5KITA 2Y62A 4TMBA 2CZDA 1EA0A 2BX7A 3W07A 3W9ZA 4NJJA 1UBSA 4FIRA 3TH6A 4JTTA 4AMAA 1AW2A 4AHPA 1DBTA 3NAVA 1TREA 4DO4A 3GXPA 1FWTA 3N2MA 2Z6JA 3N73A 1WA3A 4KFNA 2QJIA 4O54A 1D9EA 1SZGA 3K30A 5K9CA 1CI1A 2OZ0A 4GJ1A 1G4PA 5CKSA 3DGRA 4TIMA 1W5NA 3PAJA 5AN7A 1Z41A 4QAIA 2P10A 3LXCA 5EY5A 3W1QA 4JXCA 4TR9A 4LY8A 4S2CA 1LOQA 1JCLA 3FJLA 3L65A 3MBDA 1VCGA 3GDKA 4NVTA 3TW7A 5J5RA 2X1RA 2A6LA 4LS2A 3S1UA 1OF6A 4MZYA 2QDGA 1IF2A 2ZZ4A 3MI6A 3NNTA 4A21A 2H3DA 2W6RA 2VEIA 3UWUA 1Q3NA 2VC6A 3NOEA 2Q8ZA 1OX5A 3LCLA 4MZ1A 4CQAA 3BPWA 3UY8A 3W22A 3EXSA 3LLDA 5CPMA 4E2DA 1GG0A 4PEKA 3A23A 3U6WA 2Q3OA 1B4KA 5AHEA 1JCXA 1SZFA 3GR8A 3W7LA 3A5VA 2DORA 4ML9A 2B4GA 1B57A 3S5OA 1H50A 3A9IA 2WKJA 3Q37A 5BW6A 3L0GA 1LROA 2V8ZA 4O57A 5CGQA 3KRSA 1TIMA 3QH2A 1ME8A 1THFD 4QNEA 1I45A 1ZJIA 2F84A 3GIYA 4E38A 1ZHAA 3KRUA 3LRLA 4IGHA 3MYOA 2QCEA 2XN1A 2ZA2A 1JCYA 4OWGA 3W73A 1G7VA 1MEWA 3G0SA 3MUXA 3T55A 2EF9A 3EWUA 3LM7A 4AEOA 2DZTA 2YX0A 4AHOA 8TIMA 1O94A 3P60A 1DQXA 2GQ8A 3O16A 5AHLA 3P5ZA 1ZAIA 2CLMA 4QSHA 2V5LA 1E51A 4JTJA 4IMDA 3F03K 2YGYA 4TU1A 2VFHA 4FB7A 1Q6LA 1ADOA 5K9DA 1W8SA 2EHHA 2I1OA 3PUDA 4KKXA 1ALDA 4Z0SA 3TMLA 3PR2A 1QMLA 4CCEA 3LRKA 5C2XA 3O06A 1FUYA 2OMAA 3V75A 1T96A 5G2HA 4KFOA 3MMTA 3BV4A 4CLMA 3UZJA 2UV8G 1TYGA 2B7QA 3TDFA 5F1VA 1WDWA 3PULA 4HIBA 4JX6A 2RDUA 1ZY9A 1NFBA 2EKCA 3NQFA 3Q2DA 1IGSA 1C9DA 1YDNA 3GR7A 4BWLA 1YTKA 3NL2A 5EKYA 1JUBA 2FDSA 3QMTA 2GQ9A 1ICQA 3TQKA 1WX0A 3R12A 2Y70A 4LUIA 2ZDRA 1TB3A 2B7NA 1F74A 3ATYA 3G1HA 1GEQA 2G5WA 1QOPA 2BTMA 1DV7A 4NNBA 3E0IA 3TX9A 3NPWA 4K36A 1KM2A 4UTIA 4LRTA 1QO2A 2OJPA 3BLEA 4ZQNA 3T44A 1AMKA 2QCHA 1TV5A 2ZRZA 1KFJA 3OVQA 1PL9A 2V2DA 3M1ZA 1LOLA 1L6SA 2CW6A 5HUPA 2C6QA 4YXGA 5KZDA 1YXCA 1A5CA 2I9EA 3NPUA 1GG1A 3L0NA 3B0VC 2ZZ3A 3PG8A 3DAQA 3UWVA 2PRHA 2RFGA 1H7OA 2HSAA 3LCWA 1BTMA 4XUGA 1G6CA 3UD6A 1LLZA 3TUUA 4FNSA 1ZENA 4XZ9A 1SFLA 2YXGA 3LCIA 3EXTA 5DY2A 3TAKA 4R53A 2VFEA 4LVBA 4Z0JA 4FNRA 3F1QA 3G1XA 4NNAA 2X1SA 4CCDA 3IVSA 1YPIA 3NM1A 2QCMA 3T78A 3JRKA 1YXYA 1KFEA 2Y7DA 3WFAA 3P8IA 4O13A 4U28A 2CLFA 1FDJA 2R14A 5DN1A 3V1PA 1UJPA 2YW4A 5AC7A 3OVPA 4N2YA 3H53A 1RZMA 1OJXA 1OX4B 4FX6M 4O8RA 1TTQA 1QNVA 4FXSA 5G1YA 1KV8A 2QCDA 3BGJA 2BLEA 5FEZA 4MY1A 2WOQA 1KM0A 3L66A 3QRHA 3TIMA 1OFDA 3S6DA 3THQA 5HUOA 3SI9A 1IIGA 1IIHA 4XKYA 2Y63A 3EWYA 3DH7A 1RR2A 2RDTA 3G1VA 3QSTA 1BWLA 3QQ0A 3SIZA 2O7SA 3PM6A 3TXVA 3W2MA 3EKLA 4MLRA 2OCZA 1EPXA 2V0TA 1FCQA 3DHDA 4MUZA 4HNTA 1BKSA 3RK8A 4XBSA 1RQEA 1H1ZA 4X2RA 3B06A 1W5QA 2YR1A 3BLIA 2ISWA 2RHGA 2JGQA 3D0CA 1SO5A 3CWOX 4K7VA 3M5ZA 1DL3A 3G22A 4UMBA 4MYAA 3HO8A 4ZQCA 4JTFA 3HGOA 2WPBA 3LCHA 1VCVA 2CZ5A 3A24A 1A5BA 1EX5A 3IIZA 1FWRA 1QDSA 5DBUA 3GNDA 4GUJA 1OVDA 3T40A 4NJIA 3GKFA 3HPZA 1A50A 3DFSA 3TR2A 2ZZ2A 2FPVA 2Q8LA 2DJXA 1JQXA 3P67A 4HNVA 1DVJA 1JQVA 5FEWA 4YMZA 3I65A 2DZPA 3L21A 3L67A 3W7PA 1KBJA 3W1PA 4YL2A 4RR4A 5F2LA 3OVRA 3N19B 4JTSA 1JVNA 4UTMA 3UWWA 3SR7A 2FPTA 5DELA 2RH9A 3T7VA 3MI3A 1TPC1 3TC7A 2QEZA 3NM3A 6TIMA 4MFEA 3ABSA 2C19A 2F7FA 2CLHA 4MPQA 1SW7A 3LV5A 1XM3A 2JK2A 2G97A 4WQ6A 3G3DA 4ZQMA 2VXNA 3HJZA 4PODA 1TJPA 4K8EA 1FXPA 1Y0EA 2EPHA 2VEPA 1KLZA 1D3GA 4FHAA 4RKAA 5FF2A 1I2NA 3NQ2A 1RQBA 1TPB1 3B0PA 2DZSA 2ZRWA 3HGRA 2YYTA 4WY0F 2WSYA 3QMSA 1VZWA 3WJYA 5AYYA 5LSMA 4HN4A 1OFAA 3TU9A 1P0NA 4IMCA 3UPWA 4Q33A 3W23A 5I3GA 2FQIA 5KINA 4LRSA 5F2GA 3TK7A 2PC4A 5D2VA 3ZWSA 1RPXA 1TSIA 1QCWA 2CLLA 1TQXA 1Z48A 3NQMA 3S5YA 1PHQA 4JN6A 3GYEA 3B0UX 1LRNA 1EUAA 3W75A 2WSRA 3RF9A 4HNUA 2VFFA 4O4VA 2TYSA 1VPXA 3M7WA 3N2XA 1UB3A 4O28A 2W0UA 2FB2A 4UR7A 2QUUA 1V5XA 4U4MA 3TQ0A 2H8XA 3M5VA 1K8XA 1I2RA 1XKYA 1YADA 1P4CA 4XTIA 2ZA3A 5DLCA 1KBIA 3UNDA 3HPXA 2YYUA 5C5YA 5LZLA 3EB2A 1LBMA 4LC8A 5AOUA 1KLYA 2YPIA 4IPIA 3QJAA 3NZ1A 3C3NA 3YPIA 3G0UA 1SZNA 1J2WA 1F7BA 5I3KA 2RDWA 2WNZA 4RZ5A 1OHLA 1H61A 1GYNA 1O60A 3DFQA 2X1TA 4LV4A 2V81A 3W86A 5BRBA 1K7EA 4QIUA 3DI1A 2V2CA 4Y6GA 3TMQA 4DPQA 4AXKA 1WBJA 2GVJA 1J4EA 1LZOA 3LERA 1DHPA 4OV9A 3W1NA 1GVOA 2GUUA 2QAFA 3L68A 3ABQA 4XWUA 1RD5A 1VS1A 2X30A 1FY6A 1LYXA 2CLIA 5J5DA 4UMAA 2DU2A 3QFEA 5I3IA 1ZCOA 4ZL1A 5F2MA 3SJ3A 2NWRA 1GYLA 1L9WA 4QJ1A 4TO8A 5F2IA 4AH7A 1A53A 1PCKA 3SGZA 3MBFA 4OT7A 3ZS4A 4FIQA 3VKJA 2QAPA 2C14A 4LUJA 3IGUA 4L4LA 1H7WA 4KWWA 1K7FA 2NXHA 4Z1CA 3N34A 4ZQPA 3W7IA 5AC6A 1ICPA 3E02A 3OG3A 2QDHA 1OFEA 3EEGA 1DJQA 3UWYA 3WK3A 5G4WA 4O10A 1VR6A 1G4TA 5AHNA 1WV2A 4ADSA 1WOBA 1ZFJA 4MKNA 4YCPA 1K03A 1KTCA 1G7UA 1PHWA 2Y7EA 1NEYA 3LTYA 3EWXA 3TNOA 4NXKA 5L9FA 1O5KA 3LHUA 5F4WA 3M5YA 1OFOA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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