2B7PA

Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from helicobacter pylori with phthalic acid
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MEIRTFLERALKEDLGHGDLFERVLEKDFKATAFVRAKQEGVFSGEKYALELLEMTGIECVQTIKDKERFKPKDALMEIRGDFSMLLKVERTLLNLLQHSSGIATLTSRFVEALNSHKVRLLDTRKTRPLLRIFEKYSVLNGGASNHRLGLDDALMLKDTHLRHVKDLKSFLTHARKNLPFTAKIEIECESFEEAKNAMNAGADIVMCDNLSVLETKEIAAYRDAHYPFVLLEASGNISLESINAYAKSGVDAISVGALIHQATFIDMHMKMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from Helicobacter pylori
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
molecule tags Transferase
source organism Helicobacter pylori
total genus 86
structure length 273
sequence length 273
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2b7pA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2b7pA01
1ZJIA 1F05A 2WPBA 3C52A 4PC8A 2J27A 1H61A 5DCBA 1RPXA 4AF0B 4R53A 4RR4A 1H7RA 3NPWA 4O15A 1XCFA 3TXZA 5AHIA 1KM0A 1THFD 3TAKA 1LLWA 3H53A 3MYPA 1S5WA 1QMLA 1K7FA 1QPQA 3QPZA 5AOUA 3BG3A 1JR1A 1X7FA 3W74A 5KZDA 2XN1A 3W7JA 4X9SA 3MP4A 5LNUA 4R7JA 2YFNA 4JN6A 4K7YA 3NO5A 1OK6A 1RQHA 1YADA 4O18A 3TH6A 2F7FA 3USBA 1U83A 4UFMA 1Q45A 1QPOA 3O15A 4FX8A 5CZSA 4YCPA 4HNUA 5F2MA 1RVGA 4IMCA 1I2PA 2C13A 2YR1A 4O16A 4O10A 4AEOA 3CQ0A 3MW7A 3P84A 4TMCA 3SFKA 1Z41A 2VFIA 4MY9A 3HG4A 2DZPA 4DO4A 3WK0A 2ZCGA 4R34A 3AO0A 3LCHA 1W56A 1CX9A 3A5FA 5BW6A 6ALDA 3GZ3A 4RZ4A 4HKPA 5HR6A 4JICA 1F74A 2QAFA 3P67A 5L6UA 3TIMA 1PIIA 1OFBA 3QF0A 4GRSA 4M6VA 5HINA 5BMXA 5F1VA 2VC6A 3L0GA 1PL9A 3BARA 5D2XA 4UMBA 4ZQPA 2V0TA 5C54A 4LVDA 2JKAA 4MY8A 1LBMA 5D2TA 4NXSA 2WNZA 4IUOA 7TIMA 1A5CA 1KBIA 3IGXA 3LB0A 1S3HA 3G18A 3N2XA 3TX9A 4UMCA 3SY5A 4XKYB 3TCEA 3LXAA 2A85A 4DBDA 4UTWC 5AC6A 4GWEA 1DL3A 3G0XA 2J9XA 1OJXA 4Q32A 3HG5A 3M5YA 1K7XA 3EX4A 2A6LA 3TU9A 1OX6A 2A4AA 3JS3A 3LBCA 1NF7A 3FKRA 3B06A 4IMFA 1W0MA 3C56A 2C1HA 1H7PA 4RZ6A 3PBUA 4AXKA 1T99A 1FCQA 2ZZ5A 4FNQA 5KSWA 1K03A 3B8DA 1JUBA 1WBJA 5C2XA 3RNDA 3IGUA 4JDYA 3PG8A 1WDWA 1VCVA 4M7SA 2ZA2A 2NV1A 1EX5A 1FXPA 5K4ZA 3KRUA 2GVLA 1S5VA 1UJPA 3MI3A 5DLCA 1QOQA 1OX4B 1TTPA 3NGJA 3L67A 4AH7A 4ADSA 4K6AA 1DHPA 4HPJA 1AL8A 2CFFA 4MUZA 3GXPA 2OX1A 4DQWA 1BWKA 1IXPA 3LCFA 3C8FA 3W7MA 3K30A 4EF8A 3PULA 2CLOA 3LRMA 1FCVA 1J5TA 4FNPA 1EWDA 3LCWA 1S5TA 4LRTA 4N9DA 3E0IA 3O06A 3SECA 4M6PA 3W2NA 3P5ZA 3G1AA 3KXQA 2ZRXA 3LX9A 1DJNA 3A21A 1TB3A 5DY3A 3DU0A 3GB6A 2Q3RA 3S5OA 1TPUA 5F2LA 4FF7A 1TV8A 3GIYA 2A7RA 5LHEA 3DXIA 4N9CA 3DFPA 1B9BA 5I3GA 1M7PA 2HS8A 3DENA 1W3TA 1G4TA 1K8XA 3PUEA 5AYYA 4BWLA 3NL2A 5LNSA 5E93A 3EWWA 5G2WA 5D02A 1SW7A 5U4NA 3KVKA 2PRMA 3A23A 1EP1A 8TIMA 1WA3A 1VCFA 3OBKA 3ZR4A 3BLIA 1VYSX 2B7QA 1IF2A 3P5YA 2PRHA 3W86A 2VEKA 3A22A 3W07A 1PHQA 4JD4A 2NZLA 1D9EA 1KV5A 1HTIA 2Y7EA 4JS3A 4O13A 2JGQA 2CLIA 4OE7A 5HQEA 2FTPA 5D2YA 5DBTA 4Q33A 3ZWTA 4GUIA 2ABAA 2YDAA 3W7QA 3LXCA 1H7XA 3VE9A 5CPOA 5DY2A 2A1YA 4O53A 3DHFA 4HSOA 4LRSA 3RLVA 2Z6JA 3AJXA 1KM4A 1OF8A 3KVJA 3W7KA 1ADOA 3UWWA 3HPZA 3MHUA 1PVNA 1SU5A 2YGYA 4UC5A 3GR7A 1HL2A 1VLIA 2DORA 3MBFA 4E38A 1SZFA 4LS1A 3TW6A 4ADUA 1RR2A 3EXSA 4MJMA 1FDJA 2VFDA 1JRBA 1D3HA 1TTJA 5KTLA 3CHVA 4JTEA 1P0NA 4O52A 1VPXA 1SR9A 3BVJA 1LTDA 3L5MA 4I7UA 1SO5A 1RD5A 1TV7A 1Y0EA 4OQVA 3TQVA 1B57A 4YCOA 1OFEA 4BFAA 3P60A 3I65A 4IOTA 3W7HA 4IX0A 2E6DA 1A5BA 4CNOA 5CSRA 3LCIA 3DFTA 2TSYA 1ALDA 1GG1A 3H54A 4GXMA 1I2QA 4WUIA 2PURA 4UFKA 4XUGA 5AB3A 2GJNA 4AWUA 2CZ5A 1TJPA 3NPUA 1EP3A 4S2CA 2QCDA 3W84A 3G0UA 3WJYA 2OCZA 3NL6A 3UY7A 1SSDA 3GDKA 1OYAA 2H8XA 5AHEA 4WXYA 1H1ZA 4KFNA 3QRHA 4RK8A 1NEYA 4WJEA 3S1WA 1JULA 3EEGA 3FJ6A 4OBTA 1YXDA 4OV4A 3CLMA 4POCA 2J9YA 4WX2A 2RDWA 3G3MA 2ZA1A 2I14A 2ZZ1A 3HBLA 5EMUA 1XFBA 6TIMA 1I8JA 1SFJA 1TPC1 2B7PA 4Z1BA 4TR9A 2ZA3A 5G1YA 3N73A 3B4UA 3JRKA 4RX0A 2ISWA 3LCLA 1TREA 3EX6A 5FF4A 3SZ8A 4WD0A 2BTMA 4UTLA 1QCWA 4LS0A 2YPIA 3R13A 5IBXA 4NNCA 2WOQA 4MOZA 2WKJA 4W9TA 1BEUA 3UPWA 4MVAA 2H6RA 1SO4A 4Y9AA 4DEFA 2C18A 3CT7A 3GK0A 3W22A 3QYQA 4RLIA 4NJHA 3FFSA 3S1XA 3L0NA 3A24A 2VENA 1YXYA 5G4WA 2H3DA 1J4EA 1GEQA 3HGJA 5LGZA 3QMTA 4UTKA 2B7NA 2WSQA 1SQ7A 3N9RA 1AW5A 1XKYA 2J6XA 4S1FA 1XUUA 3TSDA 2NWSA 3QQ0A 3MYOA 4KFOA 3L68A 1OFOA 1GTEA 3W2JA 2FIQA 2Q3OA 4NZJA 1FWRA 1W5QA 3DFQA 4NVTA 4N4QA 5I3IA 3GR8A 1WXJA 4MPQA 2RDUA 5HWNA 4IJBA 1ZENA 4Y90A 1TCDA 4UTTC 3IGSA 3W23A 3W70A 2E5BA 3W1AA 2B0MA 2EHHA 3TE9A 3LHZA 3B04A 4LUIA 1AW2A 2R91A 1TQXA 3M16A 3EX1A 1FQ0A 3WK3A 4Z0SA 1H50A 3G1VA 3W1NA 3E49A 1Q6OA 4JTTA 2YSWA 1R2RA 3QW4B 3E96A 3UPBA 1VR6A 3W2KA 5LNVA 1D3GA 1H60A 1UUMA 3O63A 1LP6A 2CLLA 4JTLA 3T78A 5D33A 4WQ6A 4JIPA 2FPVA 2ZDRA 2LLEA 3TC7A 3O8AA 1ICQA 3KVLA 3O1NA 4FIQA 4MKNA 2DJXA 3MWAA 5CKSA 3PY2A 5CPNA 3UZJA 3BG5A 3LCGA 3STGA 1TYGA 2H8ZA 2QCLA 2YW3A 5EKYA 1O95A 3NQEA 1JUKA 2VOMA 4FB7A 1HFBA 4P61A 1SW3A 2G5WA 4K37A 3S5YA 1JCMP 4ORIA 3W73A 1LRNA 3NL3A 4JTKA 5EY5A 3EXRA 3HGRA 1KV8A 2DZSA 3EWYA 1F6KA 1U5JA 4B5NA 3NQ6A 4MY1A 4UTIA 5F1UA 1LCOA 2AQWA 2NV2A 2ZFAA 4RCXA 2E09A 1EA0A 2QCMA 2ZYFA 1FX6A 4GE8A 1GG0A 4OU1A 5C6MA 4UTWA 3TSMA 1HO4A 4M19A 3PB0A 5IBXC 3SJ3A 1K3UA 4O1BA 5D38A 4YLWA 1B3OA 3GNDA 2A7NA 2ISVA 2R8WA 2WQPA 1YYAA 3QW3A 3W2MA 1Z42A 1ME9A 4K8EA 5EBUA 1YDNA 3SSJA 1XBZA 3G1SA 5AN7A 4AVFA 4HT3A 3ZWSA 1FWWA 3OHIA 5LKYA 2FPYA 5AHLA 1JCLA 4A21A 1TPB1 4RV8A 4TO8A 4DF2A 3PR2A 1W8SA 5FF7A 3MJYA 4FNSA 1KTCA 4DF1A 2DZTA 2V9DA 4LOCA 1EUNA 2ZRYA 3TUUA 2NX9A 3M6YA 3KFTA 3LCXA 4ALDA 1WYIA 1IXNA 3G22A 4JY9A 5AFDA 2X30A 1OFDA 3LTPA 1DQWA 1TQJA 1I2RA 5CG7A 2O7QA 1SZEA 3MMTA 3BGJA 4XTDA 3N14A 3VKJA 3M47A 1UB3A 2EKCA 3EKLA 1PCWA 5HULA 1GVRA 2E6AA 3NA8A 5T26A 3IVUA 3F1QA 4KWVA 2GQAA 3G1XA 1W37A 3MP3A 2NX1A 1VHCA 2ZRZA 4DPPA 1GVOA 4C1KA 5C5YA 2C6QA 1O4UA 1R2SA 3SR7A 3FYOA 4NJGA 1K8ZA 2DZUA 1SFLA 3VFLA 3I7QA 1QPNA 4Q4KA 3T55A 1Q6QA 4IMDA 1C8VA 1LDCA 2WJZA 2NWRA 1NF0A 4NU7A 1LZOA 2ZRVA 2DZVA 1XL9A 3LV6A 3CTLA 3TJLA 3FKKA 2XN0A 2Y62A 3P82A 3PWAA 3HMJG 3WJSA 4Z1CA 3RK8A 4BF9A 1ZY9A 1VYPX 2P0OA 3SI9A 4NUWA 3BGGA 4MJZA 2H90A 3O6DA 1XXXA 1A50A 3LXBA 3O6YX 3DKLA 2J88A 1TIMA 1W1ZA 1TV5A 4FO4A 3QSRA 2QCGA 2E5DA 3ABQA 3IVSA 5EL1A 2VFEA 2V81A 3LLFA 3BK0A 3B0PA 3OEXA 4MFEA 1TPVA 3CB8A 1FWNA 2PCQA 4LVBA 2KZHA 2BSLA 4XBKA 5DBUA 1N7KA 3BLEA 4UTMA 5SWUA 2Q8ZA 3KRZA 2FDSA 3QSTA 3QH2A 5HWJA 4WZHA 2DP3A 4JXCA 1IIGA 3ZS4A 2PRLA 3UY8A 1JCXA 3ABRA 1W3IA 4AHPA 2DU2A 3TAOA 3BG9A 4TMBA 2WNQA 3L5AA 4WOQA 2J9ZA 1HG3A 4O28A 1PE1A 1SUXA 4RXFA 4IMGA 5KZMA 2QUVA 3G3DA 4EIVA 5D37A 3LLDA 1G69A 5K7JA 3TV8A 5G1TA 2B7OA 4O1CA 1R46A 2NX3A 2WV8A 2Z1BA 3WK1A 4PEKA 3I68A 3PUOA 3C2FA 3G8EA 4JYEA 2QCHA 1TRIA 3TQ0A 4DBEA 3GNNA 4MLJA 3N2MA 1LOLA 1QR7A 3LHVA 4EWND 3MI2A 2WSRA 4MYXA 3FYPA 2FQIA 2Y7FA 1TMHA 3LBMA 5D09A 2Z2UA 3HG3A 4JEQA 1P4CA 2W6RA 3S1VA 2V30A 3CEUA 3GLCA 2FB3A 4WY0F 2QJHA 4DF0A 1KM6A 5FI8A 2ZRWA 3UQNA 3HF3A 4BI6A 3IEBA 3NOEA 4CCDA 2G97A 5TBOA 4XTIA 2ATMA 5TIMA 3NL5A 5LHFA 3VNDA 1Q6RA 4O1AA 1UUOA 5K9DA 3W85A 4BI7A 4L4MA 2OJPA 2EAWA 4AWSA 2Y88A 3MHGA 3TKFA 2X1TA 4N9BA 3M7WA 4FNRA 3O6CA 4A29A 3CIXA 2DZXA 3NXFA 1H7NA 2A2IA 2GOUA 3L5LA 3M5ZA 3W1LA 5CGQA 2Y63A 5D05A 2RFGA 2TYSA 3LOTA 4P2VA 3NYZA 4R33A 4GUJA 3QM3A 3QPYA 1KM3A 3W88A 1E51A 4ZZ9A 3RFAA 3TQKA 3W1TA 1W54A 4UIOA 4JX6A 3S8HA 2BXVA 3GVGA 4A2SA 2A6NA 3TFXA 2F84A 3W7RA 3QFEA 3M5VA 1V7YA 1KFEA 2TMDA 4JX5A 3LTYA 1DVJA 3TJXA 3DZ1A 3GX9A 1LRTA 3LRLA 4DPQA 2ISSA 3C4UA 3UWVA 1M6JA 5H91A 1WQ5A 4ZQOA 4GNJA 3HPSA 4IMEA 3F4WA 5CZJA 4ZQCA 2BWGA 2VFHA 4L4LA 3CIWA 3O16A 1GVQA 4WXZA 2C16A 2QCNA 3W1PA 3W1QA 3W76A 2CLFA 3DFOA 2HTMA 4QNEA 3W87A 4ML9A 1FUYA 1NVMA 3DHDA 2VEPA 4JTUA 4Z0JA 4N4PA 1OFQA 1TPEA 3IVTA 3P61A 1EPXA 1ZCOA 3PC0A 3PBVA 4MYAA 3SW6A 1MO0A 2FFCA 5DXYA 4WY0A 3GKAA 5DXXA 1EEPA 1FCUA 5H2ZA 4DELA 1KFJA 1PV8A 4UNKA 3TSBA 3PF3A 3P8JA 1SZGA 3B05A 4U4MA 3HB9A 3NR0A 2NUXA 4UTTA 4FNUA 3IIVA 1JUEA 4XBSA 1L9WA 3N9SA 3U6WA 4RKAA 3KHJA 3YPIA 4JTIA 4RXGA 1SPQA 2ZQ0A 4A22A 1GQNA 2CLMA 4AMAA 4QISA 1W5MA 5LNRA 4LVFA 3PS7A 3V75A 5KITA 3W1UA 1F6PA 5G5IA 4O4WA 5LGXA 5D2VA 1KFBA 3QC3A 3NQFA 2V2HA 1LM1A 1Q6LA 2JGYA 2Y89A 4IX2A 2VFGA 3TMQA 3LERA 2R94A 4KFPA 4H6KA 4N9EA 2WNNA 1VS1A 1R47A 2VELA 1YPIA 3N3MA 1DQXA 2CW6A 1TO3A 5HNRA 4O17A 2CZDA 1ZAIA 1QDSA 1P1XA 3LHYA 3CWOX 1ZFJA 1DV7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1ZJI A;  1F05 A;  2WPB A;  3C52 A;  4PC8 A;  2J27 A;  1H61 A;  5DCB A;  1RPX A;  4AF0 B;  4R53 A;  4RR4 A;  1H7R A;  3NPW A;  4O15 A;  1XCF A;  3TXZ A;  5AHI A;  1KM0 A;  1THF D;  3TAK A;  1LLW A;  3H53 A;  3MYP A;  1S5W A;  1QML A;  1K7F A;  1QPQ A;  3QPZ A;  5AOU A;  3BG3 A;  1JR1 A;  1X7F A;  3W74 A;  5KZD A;  2XN1 A;  3W7J A;  4X9S A;  3MP4 A;  5LNU A;  4R7J A;  2YFN A;  4JN6 A;  4K7Y A;  3NO5 A;  1OK6 A;  1RQH A;  1YAD A;  4O18 A;  3TH6 A;  2F7F A;  3USB A;  1U83 A;  4UFM A;  1Q45 A;  1QPO A;  3O15 A;  4FX8 A;  5CZS A;  4YCP A;  4HNU A;  5F2M A;  1RVG A;  4IMC A;  1I2P A;  2C13 A;  2YR1 A;  4O16 A;  4O10 A;  4AEO A;  3CQ0 A;  3MW7 A;  3P84 A;  4TMC A;  3SFK A;  1Z41 A;  2VFI A;  4MY9 A;  3HG4 A;  2DZP A;  4DO4 A;  3WK0 A;  2ZCG A;  4R34 A;  3AO0 A;  3LCH A;  1W56 A;  1CX9 A;  3A5F A;  5BW6 A;  6ALD A;  3GZ3 A;  4RZ4 A;  4HKP A;  5HR6 A;  4JIC A;  1F74 A;  2QAF A;  3P67 A;  5L6U A;  3TIM A;  1PII A;  1OFB A;  3QF0 A;  4GRS A;  4M6V A;  5HIN A;  5BMX A;  5F1V A;  2VC6 A;  3L0G A;  1PL9 A; 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