2B7QA

Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from helicobacter pylori with nicotinate mononucleotide
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MEIRTFLERALKEDLGHGDLFERVLEKDFKATAFVRAKQEGVFSGEKYALELLEMTGIECVQTIKDKERFKPKDALMEIRGDFSMLLKVERTLLNLLQHSSGIATLTSRFVEALNSHKVRLLDTRKTRPLLRIFEKYSVLNGGASNHRLGLDDALMLKDTHLRHVKDLKSFLTHARKNLPFTAKIEIECESFEEAKNAMNAGADIVMCDNLSVLETKEIAAYRDAHYPFVLLEASGNISLESINAYAKSGVDAISVGALIHQATFIDMHMKMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from Helicobacter pylori
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
molecule tags Transferase
source organism Helicobacter pylori
total genus 66
structure length 273
sequence length 273
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2b7qA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2b7qA01
3IIXA 4AHQA 2FPYA 1UBSA 1ZENA 1ZHAA 3ZWSA 1WDWA 3LHWA 4I7VA 1TRDA 1M7OA 4AB4A 3W73A 3G1DA 3THQA 4Q32A 3T78A 3HG3A 1R2SA 1WYIA 1FCQA 1OFEA 2QCGA 3A5FA 4RXFA 4HHPA 3G3MA 3BG9A 3HGSA 3CM4A 3W7JA 1W5PA 2ISSA 3O6YX 3W70A 2W79A 4UTJA 2Y7FA 1LOSA 4N9DA 3LXAA 1NF0A 5LZLA 3MHGA 1YDVA 5G1TA 3LI1A 1YDNA 4IGHA 5G4WA 4WOQA 2P0OA 3HG5A 1IIGA 3MP4A 1EX5A 1THFD 3P60A 1GWJA 1JUKA 1QPQA 1KA9F 3P5YA 1LLZA 3FLUA 1GYLA 3G1YA 3PAJA 1IXOA 2R94A 1FCBA 3QC3A 1ZALA 4EWND 2ZA1A 1OFOA 4BF9A 1XXXA 3F4NA 4NZJA 1LRNA 2GOUA 5EBUA 1JR1A 3ZFHA 3NA8A 3LLFA 5HULA 2VENA 1EPXA 4YCOA 4NJGA 2YZRA 2PCQA 4LV9A 1TPUA 5AHIA 1VGAA 1VLWA 3NQCA 4OV9A 4I7UA 4NZFA 4PC8A 4TIMA 3G3DA 3C3NA 3W1AA 4GC4A 4RZ5A 1OFQA 4IX0A 2I14A 4LVFA 4ZQNA 1N55A 1YLVA 2YR1A 1I4NA 2PRLA 1UJPA 1JULA 1DHPA 1FQ0A 1OHLA 1KTCA 4QITA 4KKXA 1SSGA 2YYUA 5HR6A 3BLIA 1S3HA 3CU2A 3S5ZA 2NWRA 1UUOA 1ML1A 3LM7A 3OIXA 1FXQA 1PE1A 3USBA 1SU5A 3IRDA 4Z1AA 3B0VC 2QJGA 2WV8A 4MIMA 4UMBA 4Q33A 2CLLA 3W71A 1PS9A 1A5SA 1HG3A 1ZY9A 5FF7A 3L0KA 3W86A 4B5NA 4FX6M 4O4VA 1JQVA 1C8VA 2DZPA 1ADOA 5E1QA 5LNVA 2QDHA 5DLCA 3PR2A 3NM1A 1W3NA 3MP3A 1TTQA 1WOAA 3W1XA 1TSIA 2NXHA 1WAUA 1DQWA 3L21A 5FF3A 5G5IA 4FNRA 4LUIA 1WQ5A 2YFNA 3FJLA 1NAL1 3GXNA 3LCFA 3QW3A 1KBJA 4IMFA 3PWAA 2O7QA 4MYXA 3BGJA 2CLKA 3QM3A 4MOZA 3TCEA 3LOTA 4YWIA 2OT1A 1TRIA 2ISWA 4ML9A 3GAKA 3L0NA 1FWNA 2VEIA 3CB8A 4LC8A 3TFXA 4KWVA 4Z08A 1H5YA 3KOFA 4LVDA 3TROA 5DCDA 3S42A 1H1ZA 4P2VA 2EGZA 3GK0A 1KLZA 3FS2A 5C55A 4CQ9A 1VHCA 3NQDA 4BI6A 5D2XA 1P5BA 4DF0A 1HO1A 1XDLA 1QNVA 1VH7A 2H90A 3C6CA 5I3HA 3FKRA 1D9EA 2CLOA 5U4NA 4BFAA 3LI0A 3ZS4A 5AHEA 4CNPA 2AQWA 2NUXA 2C15A 4O11A 3S1WA 4K38A 4HIBA 5DN1A 3UQNA 3S9YA 3WJYA 2V2DA 4MUZA 1CI1A 3LCXA 3LHVA 2C3ZA 2FB3A 2VFGA 1W5QA 3W74A 2QCCA 1EEPA 2PE4A 1OVDA 1XDMA 2BWGA 2CZEA 3W7CA 1MEHA 4A21A 1R2RA 3MYOA 1FX6A 2Z6JA 1T0OA 1YPFA 3NQ6A 3NZ1A 2A7PA 2BX7A 3PBWA 4IWWA 2A2IA 1SO5A 1OFPA 2F7FA 1RR2A 1XBYA 4UTTC 4UFMA 2CLFA 2GPTA 1U83A 3DKJA 3UXDA 3PB2A 3DFSA 2BSLA 1DL3A 1S5VA 3P62A 2WNZA 3W22A 3H53A 1XL9A 4XTIA 2VEKA 5BOOA 3W7DA 2J27A 5HUOA 3SGUA 3QMSA 4R33A 4O0KA 2V5LA 3OVPA 5EL1A 1GYNA 4ZVJA 2E5CA 1OK6A 1L6WA 1OF8A 5D37A 4NX0A 2B7OA 4UTUA 1P0KA 4FNPA 4CQ8A 2I9EA 4J9JA 3N9RA 3TFCA 3N2XA 1QDSA 1H61A 2D73A 3B8DA 3U2OA 3M0ZA 1OX4B 2XN0A 4Z0SA 4Z0JA 1BWLA 5IBXA 5F4WA 4DF1A 3IIZA 1H63A 1QO2A 4ORIA 3M44A 3NQVA 3UZ5A 1SSDA 2F84A 4WX2A 1DOSA 5LGZA 4YCPA 2YPIA 5IBXC 1RQBA 1XUUA 3HQ1A 2GUUA 3DHFA 1J5TA 4Y8FA 1H50A 4JTUA 5F2IA 2V81A 2WPBA 1LBLA 3BW3A 3R5EA 3HGRA 4U28A 3DXIA 1AL7A 3MBFA 4JTIA 1AL8A 1SFLA 1TPEA 3QPZA 3NQ8A 4JTLA 3QH2A 4S1FA 1PV8A 4GUJA 3UZJA 3W2NA 2EHHA 2YFOA 3DI1A 4M7SA 4UNLA 1LTDA 3F4WA 2G95A 1KM3A 3E9AA 1G67A 3PUDA 5DXYA 5HMSA 2GQAA 1IXQA 1G7UA 4JR5A 5G2HA 3MI3A 2JBMA 2BLEA 5A5WA 5EMUA 3S1UA 4OHQA 1WX0A 4AVFA 2Y85A 2NUYA 3G0UA 3W1PA 3OEXA 3HJZA 3JR2A 3NL5A 5LHEA 3R13A 4C1KA 4GFSA 5F2MA 3BPWA 4LOCA 2CU0A 4N4QA 2DORA 2VFHA 3QW4B 4R34A 5FF4A 2DZUA 1DV7A 5EPDA 3TW7A 4M6VA 3Q37A 1FCVA 4JYFA 3CEUA 1R46A 4WY0F 5DCEA 3K30A 4NJJA 4MKNA 1TQXA 2A1YA 2CFFA 1TPDA 5MHBA 5CPLA 4JN6A 1GTHA 4FHAA 1KM0A 3P80A 2FJKA 1YTKA 4MPQA 4DPQA 2YW4A 5CZ0A 5I3IA 3STCA 2EAWA 1I2RA 4QM1A 4DEFA 1SW7A 3DGRA 2X1RA 2VFEA 3BGGA 5IM51 3M9YA 5K2ZA 4ADUA 3CC1A 1G4TA 3TXZA 3IEBA 3EKZA 1AW2A 4AWTA 3G18A 1VPXA 1Q3NA 4FEZA 4O8RA 4WQ6A 1LM1A 3P82A 3CWNA 1H7OA 1VCVA 1N7KA 1JCXA 5AHFA 5BW6A 3TC7A 1RZMA 1XC4A 1ONRA 2P10A 4FIRA 3FFSA 4GBUA 3LGEA 1FBAA 3G8EA 3QMRA 2GQ9A 4MLJA 2WNNA 1G7VA 1TCDA 4MZYA 3TSBA 1FWTA 4IMEA 4EOUA 4YL2A 2NUWA 3GYEA 3NO5A 4XKYB 4Y6GA 3DFOA 4GNJA 1LRTA 3IGUA 3P67A 2A5HA 5C2XA 3PF3A 5CSSA 3SI9A 3TQ0A 3EWZA 3NPXA 1LBMA 1M6JA 1PL9A 5FEXA 2DZWA 3NXFA 1OYCA 3TV8A 3CHVA 3E49A 3FKKA 4O1AA 4ONVA 3M6YA 3B04A 4JTEA 3OHIA 1WA3A 3EWUA 1G69A 3O07A 4N4PA 2FLIA 4N9CA 3NNTA 3TMLA 3P7YA 2NX1A 2QDGA 3RK8A 4UFIA 3WJXA 2TYSA 1QCWA 3PBVA 4GJ1A 1H7WA 1ICPA 1H7NA 2VEMA 3W7GA 1R47A 3O6CA 3LHYA 3G8RA 1OJXA 1OX6A 1KFEA 3N19B 3INPA 4O57A 3W1TA 2G5WA 1MO0A 4AHOA 1TTJA 3SGZA 1EP2A 1KFKA 3I65A 4JTHA 1AW5A 4IXHA 2WKJA 5AFDA 2QCLA 2QEZA 4O53A 4PTNA 4S2CA 4HNTA 1SZGA 1W3TA 5FEPA 5D2VA 2ZRVA 2X1SA 3GAYA 1KLYA 3GKAA 4JY8A 3PSVA 2Y63A 1EA0A 4O10A 4RZ6A 2Y7DA 2A4AA 2ABBA 1ICQA 4WJEA 2V0TA 5DXXA 5I3KA 2RDTA 2WSYA 4ZQCA 2Q3RA 4LVBA 2HMCA 2ZFAA 5KZMA 5C6MA 1JCYA 3EXRA 4C1LA 4GUHA 5LNRA 3KAOA 3A24A 2ZA3A 2A85A 1OX5A 4IOTA 1JQXA 1LOLA 3EWBX 1KM2A 1V7YA 4K7YA 1Q6OA 3GB6A 4ZL1A 4OGZA 2C1HA 3RMJA 4NX5A 3L66A 1VCGA 5ABTA 1OABA 3MJYA 5H91A 4RKAA 3SZ8A 1VYRA 2RKXA 3TAOA 3HGJA 3HB9A 3CWOX 5CGQA 4UIOA 3FYOA 5KZDA 3STFA 4XTDA 2Y70A 2VOMA 1JCNA 3HMJG 3LB0A 4O54A 4XWUA 3WJZA 4GXMA 4UR8A 3P61A 2DJXA 4X2RA 4QQ3A 1DBTA 1QPNA 1G4EA 4MY8A 3CIXA 1D3HA 4Q4KA 4A2SA 4ORMA 3E0IA 1SQ7A 5CZTA 1VYSX 4AXKA 1H7PA 3L5LA 1J4EA 1YXDA 5KINA 2ZRZA 1FY6A 4E2BA 3W2UA 1DORA 3DFPA 3PB0A 3G0XA 4MZ8A 3BW2A 1W5OA 3UXAA 2QAPA 5KTLA 4FB7A 3C2FA 2IQTA 4DXVA 2NX9A 1VS1A 3W1NA 4UTKA 3MW7A 1QFEA 1IXPA 3P8JA 3QQ0A 1NFBA 3W85A 1V5XA 1SUXA 3LLDA 3C0JA 4DBEA 1GVRA 4X9SA 1PCKA 4DPPA 3NGJA 2UV8G 1SR9A 3WFAA 4XZ9A 3HBLA 4ZZ9A 4K36A 3UPBA 4Y96A 2WSRA 3OVQA 4JEQA 5KMYA 5FF2A 3I68A 3EX4A 3LHTA 3SFKA 4BI5A 1Q6LA 3GIYA 1YADA 5K3VA 3LRKA 3NQ2A 4HPXA 4BWLA 3KVJA 3HIJA 4RK8A 4HSNA 1G4PA 4M6PA 5AHLA 2OJPA 4KFPA 3BG3A 4FF7A 5FEWA 4TO8A 1XKYA 3RF9A 3FJ6A 4JNMA 1M7PA 3DH7A 1TQJA 4BWLC 3QSTA 3UD6A 3W1UA 1GVFA 5CKSA 1GVOA 3S1VA 3TJXA 2ZYFA 2ZTJA 3HG2A 5DY2A 3SY5A 3DFNA 3M43A 4FNQA 1YDOA 1MSSA 3SR7A 3TQVA 4PODA 1GT8A 1KTNA 4DQWA 2E6AA 4MFEA 1GPWA 3B06A 3PBUA 5HR7A 1KW1A 2TPSA 2FIQA 3ATZA 4M19A 4N6EA 3HF3A 3IVTA 4JYDA 1H7XA 1O94A 5SWUA 3FIGA 3GNDA 2NZLA 3C2VA 1O5XA 1E51A 3DHDA 3M1ZA 3G1VA 5HWMA 5I3GA 1Q45A 4PL2A 3GR8A 3ANYA 1SPQA 3LTSA 4HPJA 1F73A 3C56A 2QR6A 5TQLA 1JVNA 1O4UA 2Z6IA 8TIMA 4O50A 1PVNA 3BO9A 5C54A 5CPOA 1HUVA 4LRSA 1I2PA 1Z48A 4NT0A 5AHNA 2ALDA 1SZNA 4LS2A 3AJXA 3IGXA 2QJIA 1VHNA 3L68A 4Z1CA 1H51A 3EKLA 4O4WA 3WK0A 2YSWA 2ZRYA 2OT0A 1DJNA 4G1KA 4IPIA 3PUEA 4FXSA 3NL6A 4CLMA 4YLWA 1Z42A 4TU1A 2QCHA 5T26A 4R53A 4LRTA 2E09A 3PBYA 2CLHA 1D3GA 5G2IA 3ATYA 1S5TA 3NM3A 2GVGA 3ELFA 3UYCA 2EF9A 2VXNA 1O95A 3TE9A 4MY9A 3W7EA 2CW6A 4EF9A 2ATMA 3QF0A 2ZRWA 1XI3A 4O12A 1FDZA 3NR0A 5BMXA 3VCRA 5L6UA 4ZQMA 1EWEA 4NNAA 1TTPA 3M5VA 2JKEA 3Q2DA 4JIQA 3JS3A 3MI6A 4JTGA 1JCLA 4X3ZA 4LY8A 3N2MA 2EPHA 5D2WA 1GJPA 1OF6A 3W75A 2B7NA 1TPH1 4M7TA 3B05A 5J5DA 1ZJIA 3A5VA 1JUEA 3NQAA 1T8XA 1LBFA 1KFJA 1B3OA 3ABQA 4AHPA 4DO5A 2WJZA 3VNDA 3W7RA 3PG9A 4GE8A 2H6RA 1XM3A 4IJBA 3A9IA 1A5AA 3MWAA 2ZCGA 1SZEA 3A23A 2A7NA 2DU2A 4UNKA 1L6YA 3LCIA 5FF0A 1TV7A 4JIPA 1LDCA 1F5ZA 5AB3A 5G4EA 3HOJA 1RPXA 3QJAA 4HT3A 1KM4A 1TPC1 2B0MA 4LTSA 3I6RA 3W23A 3UWWA 1XFBA 2BTMA 1FUYA 4ICNA 4EIVA 4O52A 3EB2A 4DO6A 1IIHA 5KITA 4LNYA 3DAQA 4AWUA 1FWRA 3A21A 4GUFA 1SFJA 4I7WA 2DZXA 2ZDRA 1VLIA 4R7JA 5J5RA 4BK9A 1W5NA 5D09A 4YXGA 2B7PA 3O63A 4N2YA 1MEWA 2J6XA 3V75A 5G2WA 4JYEA 3TC6A 2V5BA 3KVLA 3U8GA 3W88A 4IQLA 3CLMA 3LV6A 3QMTA 3HPXA 1I2NA 1Z44A 2VFIA 2ABAA 4WY0B 4OE7A 5BNKA 3CPRA 1MEIA 4FNSA 2YDAA 1EUAA 1A5CA 1C29A 4O1CA 3NAVA 1WBJA 2NV2A 3PVFA 2V2HA 5EYWA 2ZZ6A 2FQIA 5AYXA 5DBUA 3IVSA 1GEQA 2RDWA 4POCA 2RDUA 5EA9A 1A53A 1JRBA 3EX1A 2A7RA 2WSQA 4L4MA 3GDLA 4PA8A 2XN2A 3IIPA 2A0NA 3B0UX 3T44A 1UCWA 4O1DA 2J24A 1TB3A 2CLIA 2Y61A 3LX9A 2BZNA 1P1XA 4QJ1A 1OFAA 2VKZG 5U7SA 2E68A 1OX4A 5D32A 3LDVA 2TMDA 4MY1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5K4Z A;  3L65 A;  3GXP A;  1UB3 A;  1P0N A;  1VYP X;  4IMG A;  4Y90 A;  3UY7 A;  2FPT A;  1KFL A;  5AHM A;  3C2O A;  2B4G A;  1FDJ A;  1LZO A;  4MJZ A;  5LKY A;  3NDO A;  1TV5 A;  3GNN A;  4AEO A;  4K39 A;  5A8G A;  4PFM A;  1UAS A;  3BG5 A;  3SEC A;  3I7S A;  3FYP A;  4AF0 A;  3L5M A;  5FES A;  2FDS A;  4LU0 A;  2C18 A;  3IV3 A;  4K37 A;  4UFL A;  4AAJ A;  3G22 A;  3QPY A;  4BR1 A;  5LNS A;  5HNR A;  4CNO A;  3EXS A;  3O15 A;  3NVT A;  1TO3 A;  3IVU A;  3N73 A;  4O19 A;  3W1L A;  5BMW A;  2CLM A;  1K7E A;  1JUB A;  2YYT A;  3HPZ A;  2J88 A;  1BWK A;  2JKP A;  2PRM A;  5D02 A;  3LHU A;  3IIO A;  3QQ1 A;  4RR4 A;  4MVA A;  5DEL A;  5LHF A;  3I7R A;  1Q6Q A;  3B0P A;  2X30 A;  1TIM A;  6ALD A;  5EY5 A;  2RH9 A;  1PHQ A;  1XCF A;  2JK2 A;  2E5B A;  5D33 A;  1ICS A;  3R8R A;  4M5P A;  3WK2 A;  4JGD A;  4UMC A;  4HKP A;  1H7R A;  3TJL A;  2JGY A;  3W1Q A;  3UWZ A;  3LHZ A;  3CIW A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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