2I14A

Crystal structure of nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from pyrococcus furiosus
Total Genus 111

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
389
structure length
389
Chain Sequence
MKRFYIANEDEIKAGKTTDVYFLRTKKILEVKNIRKKVLADVTTTSLPNNWRWGVLVGVEEVAKLLEGIPVNVYAMPEGTIFHPYEPVLQIEGDYADFGIYETALLGMLSQASGIATAALRIKIAAKFKPVYSFGIRHMHPAIAPMIDRAAFIGGCDGVSGVLGAEMMGEKAVGTMPHALIITVGDQVKAWKYFDEVIEEEVPRIALVDTFYDEKVEAVMAAEALGKKLFAVRLDTPSSRRGNFRKIIEEVRWELKVRGYDWVKIFVSGGLDEEKIKEIVDVVDAFGVGGAIASAKPVDFALDIVEVEGKPIAKRGKLSGRKQVYRCENGHYHVVPANKKLERCPVCNAKVEPLLKPIIENGEIVVEFPKAREIREYVLEQAKKFNLEI
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Pyrococcus furiosus
publication title Crystal structure of nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from Pyrococcus furiosus
rcsb
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
total genus 111
structure length 389
sequence length 389
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
A PF17956 NAPRTase_C Nicotinate phosphoribosyltransferase C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2i14A02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2i14A01
3QH2A 2DORA 5EL1A 3CWNA 1O5XA 1XBXA 1DORA 1VC4A 1FWNA 2QEZA 4LRSA 1OG0A 1EUAA 3TIMA 3LHZA 5I3IA 3UXDA 5D2YA 3OVPA 4ZMGA 2KZHA 3GNNA 4B5NA 3NQ2A 1FX6A 3M47A 2VFDA 4Z1AA 4JTGA 1OFPA 4O8RA 4TU1A 1K8XA 2YZRA 3W1PA 2ZZ3A 4J9JA 1W37A 1VYRA 1F73A 4BI5A 4UTHA 3PBWA 1F05A 1YADA 5F2IA 3TU9A 5LNSA 4UMBA 4TO8A 2P1FA 4IGHA 4RX0A 3G18A 1K3UA 1OK6A 5HWJA 4JICA 1LOLA 1FCBA 1I8JA 5TBOA 4JEQA 3L5LA 4JS3A 1W5PA 2NX3A 3L66A 2A7PA 3HB9A 3QRHA 1YTDA 4N9BA 4LVAA 4NJIA 4AAJA 4AH7A 1DKWA 3MI2A 1VHNA 4O17A 3W2UA 3BK0A 1A5SA 1L6YA 3G1YA 4YCOA 1S5WA 3B06A 1K02A 3M1ZA 4GC4A 4K8EA 4Z0SA 3S1UA 3W75A 5F4XA 3GDTA 3R2GA 3LCFA 3O6CA 1QO2A 5G5IA 5DY2A 2QCDB 5DN1A 5G4WA 4N4PA 5CZTA 3DENA 3RFAA 1PIIA 4PL1A 3WJYA 2ZFAA 3RNDA 1SSGA 3M6YA 4O1BA 3CTLA 1DQWA 2J88A 5KTLA 1F7BA 4JY9A 3MBFA 4JX6A 5C55A 1FXQA 3S8HA 3CQ0A 4HSOA 4MY9A 5T26A 4UFJA 3G8EA 4O16A 3DFPA 5I3HA 2NXGA 2E6DA 5CZ0A 5BMWA 2Y85A 3CIXA 3QYQA 1I2QA 5U7SA 4AHQA 1LP6A 5F2LA 3KAOA 3W2KA 1YDNA 3MUXA 4NJGA 3UXAA 3EWYA 1KM6A 4FNUA 2ZRUA 4OHQA 5FEXA 1JCNA 1KM0A 2DZTA 3TXZA 5EKYA 1KM4A 3G0SA 3MHFA 2VFGA 4CQAA 4C1LA 3NPXA 1IF2A 4WD0A 1KM3A 1ME8A 3W23A 3VE7A 4QSHA 4RXFA 2FJKA 3V1PA 2P0OA 4DF0A 2VFHA 3W7DA 4C1KA 1B4EA 3EX3A 1PE1A 2B7NA 1PL9A 2EHHA 2R14A 3PUDA 1K7EA 4NXKA 3T78A 5D03A 3PM6A 1FBAA 3BG3A 1OX6A 3T7VA 3S1WA 4MUZA 2WNQA 1FWSA 8TIMA 3EXSA 5CG7A 1W3TA 1TPDA 3DFQA 5AHIA 2V0TA 3P82A 3DFNA 1O94A 2ZRZA 3IEBA 3C2EA 1OX5A 2QF7A 4O19A 4JTEA 3TUUA 1PHWA 3W1UA 3TJLA 4MYXA 4RK8A 3UPWA 2FB2A 5HR6A 3EEGA 4UMCA 2Q3RA 4LS1A 3NL6A 5CZSA 3W22A 1G69A 3SIZA 3T40A 4LOCA 5EY5A 5K7JA 1WDWA 2FDSA 3DHDA 4NT0A 3O07A 4WZHA 1AW5A 1VHCA 3INPA 3NPWA 4MOZA 4RCXA 3TH6A 3IGUA 1KFLA 3NVTA 5IBXC 3PB2A 3GYEA 3W1MA 1B3OA 1R2RA 2NV2A 2ZZ5A 4JTIA 5AB3A 4LUIA 1H60A 3IIXA 5BNKA 1SZNA 4WXZA 3M9YA 3CC1A 4W9TA 4FX7A 2RDUA 4TX9A 4E38A 1KFJA 2V5BA 3ZWTA 4GUJA 5D33A 1Z48A 3IIZA 1LRQA 4JYDA 5HNRA 3TNOA 3R5EA 1TTPA 5GVJA 3AJXA 3EXTA 3S1VA 2F84A 2DJLA 4MYAA 2WSRA 4Q33A 3MP5A 4OE7A 1JUEA 4BFAA 4QNWA 3BW2A 3I65A 1EUNA 3HOJA 2OMAA 1TTQA 1O95A 3T4CA 3PY2A 4JXCA 5I3JA 4AHOA 3G1XA 4UTWA 2QCLA 2Y89A 3PBYA 4XZ9A 1H51A 3HQ1A 3GIYA 2HSAA 5SWUA 1TTJA 4LC6A 3TV8A 4OT7A 3G22A 1DJQA 1F6PA 4KFNA 1CW2A 3EWBX 4RLIA 3LI1A 3TAOA 5D2VA 3SY5A 3O63A 1H5YA 1KW1A 2H3BA 4JX4A 1DOSA 1UUMA 4JN6A 3MHUA 3NZ1A 1LDCA 1WOAA 1Z41A 2E6FA 2QDGA 3EX4A 1S5VA 2E6YA 3W72A 4IMDA 1GVFA 3W1TA 5KZMA 1JRBA 1X1OA 1JQVA 2YPIA 2I9EA 5DELA 3PBVA 3UY7A 2VENA 5D37A 1DVJA 2UV8G 1GTEA 3G1HA 3UYCA 2GPTA 3E9AA 1TQXA 3P8IA 5D04C 4M7TA 2PRLA 1O5KA 1VJIA 2CU0A 1VGAA 1MZHA 2JKAA 2YFNA 3NQFA 2FPYA 3BLEA 1A5AA 4M6QA 3MP4A 1G7UA 3GKFA 5FF3A 3ZFHA 3IRDA 1LZOA 3PSVA 4LW7A 1OFDA 1S5TA 2ZZ7A 4GUHA 2CLLA 2BZNA 4NNBA 1KV8A 4NJHA 4ZQRA 4JTLA 1ZALA 1T96A 3W2JA 1DHPA 1TRIA 2G95A 5D2XA 3G8RA 4IX0A 4N6EA 2NWRA 1FQ0A 3HGRA 1F5ZA 2C16A 3FJLA 2ISVA 1LLWA 3PULA 3C4UA 4UNKA 3GAYA 1YXYA 1TQJA 4MIMA 2VOMA 4O0ZA 3OVRA 3QW3A 3QPYA 4UTLA 2RH9A 3TC7A 3NQCA 3GNDA 1WX0A 5AC8A 1OVDA 4UTUA 2ZA3A 3UD6A 1LOSA 3QSTA 2YYTA 4JTTA 5FF2A 3NO5A 5DY3A 3STGA 3S6DA 3EB2A 3L5MA 1VCFA 4UFIA 4UUIA 2VEKA 4JTJA 4UCGA 2X1SA 4WY0A 5LKYA 2Y62A 2A21A 4PL2A 4N6FA 3OBKA 5I3GA 2A6NA 4ADUA 1G67A 1QWGA 5A5WA 1G6CA 4IOTA 4HIBA 1KM1A 3PUEA 4LS0A 3E12A 3W86A 4Z1CA 4CNPA 2GQ9A 2H3DA 3H55A 3F1QA 3QFEA 2JKPA 4GXMA 2EF9A 3I7QA 3EKZA 1Q3NA 3OVQA 1C8VA 1EEPA 4ZQNA 3TMLA 2FPTA 4ADTA 3F03K 3G0UA 4UTIA 1W3NA 4FEZA 1D9EA 2NXIA 2Z1BA 2RHGA 3E0IA 4GUIA 1GQNA 3O6YX 1TV7A 1BWLA 2PRHA 1W56A 3N3MA 3LRMA 2X1RA 3R8RA 2HS8A 3OEXA 5D02A 2Z6JA 1XDMA 3ELFA 2PE4A 4WJEA 1KTNA 2EGZA 1IIGA 3IIVA 1BTMA 1Q6OA 1WOBA 1W3IA 1DQXA 3C2RA 4M5PA 4K37A 3N73A 3LXBA 2WKJA 1RZMA 2G96A 5K9DA 3LLFA 4IXXA 2FPVA 3ZS4A 2VFEA 5DBTA 3M5VA 3C61A 4AWSA 2J24A 5D05A 1SW0A 1EA0A 1P0KA 1WXJA 2OCZA 3S5ZA 2Y70A 3KFTA 2VEMA 5DLCA 1H63A 1TV8A 1SR9A 3W87A 4QITA 3GXTA 1KA9F 3IV3A 3IIOA 4DPPA 1RD5A 1GZGA 1LYXA 4MY8A 1JQXA 1VS1A 1OYAA 4LUJA 4X3ZA 2DZVA 3DAQA 4UTWC 5F1VA 3VE9A 4HKPA 3W7JA 2E77A 1YYAA 5D2TA 3DFOA 4K8HA 2CLHA 2VELA 1LOQA 2QAPA 2NUYA 2RDWA 1MXSA 3LBMA 3W7QA 4GUFA 5KITA 3NL5A 4U28A 3MW7A 3TE9A 3NQ8A 4YWIA 4LV4A 4MY1A 1W54A 1OYBA 1ZAIA 4E2BA 5G2IA 1VPXA 3PR2A 3PUOA 4UMAA 1AW2A 2FTPA 2YGYA 3LX9A 2BSLA 4Z1BA 4O13A 2CWNA 1YTEA 1H1YA 4NX0A 3HPZA 3B05A 4R34A 3FEMA 1IXOA 3H54A 4HPXA 2X16A 2WOQA 1RQEA 2NV1A 6TIMA 3LV6A 3GAKA 5IBXA 1UASA 1LROA 3N9RA 3LRKA 1YPFA 5HUOA 3LOTA 3SFKA 2P10A 1GG0A 5KSWA 1QPOA 1SQ7A 5LGZA 3HG4A 4K36A 1L6SA 1LBMA 1QNVA 2PCQA 2NZLA 5G4EA 3SR7A 4IMCA 3T44A 3FFSA 1Q6RA 4MZ8A 5D38A 2H90A 3W7RA 3NDOA 2QJIA 4LVBA 2WQPA 1TPFA 1DL3A 2NX1A 1CI1A 3E02A 2B4GA 2VEPA 5CZJA 4Y8FA 3W7PA 5DXYA 1GWJA 4BI7A 3WJXA 4HNUA 4LC8A 2ZRWA 3CM4A 2QR6A 3JR2A 1OFQA 3PB0A 5HQEA 1SO5A 3UWQA 1PS9A 1QOQA 4NZJA 4YLWA 1OX4B 3G1VA 2E5CA 4PODA 3OHIA 2WV8A 1V7YA 4XTDA 3G1SA 1KFBA 4UTMA 2Y7FA 4K39A 2E5DA 4UR8A 5HJLA 1NEYA 3GZ3A 3KXQA 2A4AA 4ORMA 1R47A 4PFMA 3JRKA 2ZBTA 1ALDA 4OGZA 5D30A 1TPH1 4MZ1A 1VLWA 1XKYA 1FDZA 2RKXA 2QAFA 3MWAA 3W7HA 4O4WA 1GYNA 3C6CA 2HS6A 5DCBA 3ATZA 1SUXA 5G1YA 3N14A 4POCA 3NM3A 4X9SA 3K30A 2YSWA 5CGQA 5LNRA 1D3HA 1HL2A 5KMYA 3CPRA 4JTKA 3BO9A 3P5YA 4IUOA 4O14A 2NXHA 1OABA 1ICSA 2GJLA 1FXPA 4O11A 4O54A 2DZXA 4QQ3A 3TSDA 3F4NA 3QW4B 5I3KA 4M6PA 4S2CA 1I2NA 3VI2A 1GTHA 3Q94A 2OT0A 2V8ZA 4I9AA 5AHMA 4X22A 3OA3A 4QIUA 4FNQA 3O15A 3W84A 2O7QA 2ZZ2A 3Q2DA 3FKKA 2YW3A 3LDVA 3BPWA 4X2RA 1B9BA 5K4XA 3T55A 2J9ZA 5C2XA 3KHJA 1LTDA 4ZZ9A 1N8FA 1Q6LA 3ZR4A 4MKNA 3YPIA 3L65A 1JVNA 1R46A 3CT7A 2A6LA 5CPLA 3NQAA 3W7CA 3CU2A 3NQVA 1EP3A 3QF0A 4DBDA 2J6XA 1TO3A 4JTUA 4JGDA 2ABAA 1M7PA 2GVJA 1GVSA 1FY6A 3FLUA 3IVTA 1GVQA 1SO4A 1NF0A 2OZ0A 4A2SA 5AC6A 4JIQA 4HNVA 2C14A 5G2WA 3I68A 4ICNA 3QJAA 4R53A 1H7NA 3TXVA 4MLRA 3SSJA 3W88A 5E1QA 2WPBA 3PAJA 1H7PA 3TW7A 1U5JA 3LCLA 3STEA 3QMTA 1F76A 4RJEA 4M19A 2WJZA 4NZFA 4Y96A 1W0MA 4UTKA 1OYCA 4WY0F 1P4CA 4IXHA 3U6WA 1THFD 3TC6A 4I7WA 3BW4A 3I6RA 2YFOA 2ZZ4A 3B03A 3W1NA 4DXVA 4O53A 1TPUA 2E5BA 1UUOA 1P5BA 1AL7A 3W1QA 3NQGA 1FCVA 1WBHA 1WAUA 4ADSA 1U83A 4ORIA 2LLEA 2PC4A 1FWWA 4MFDA 5CPOA 3NZRA 3STCA 3A24A 2J9YA 2PURA 3FIGA 3TDFA 3MI3A 4UFMA 4U4MA 3NEVA 3LCWA 3JS3A 1KLYA 3BV4A 4O1AA 3G1FA 2WNNA 3QZEA 2FLIA 1VYSX 3WK3A 1AG1O 4LU0A 3G1AA 4S2BA 1K7FA 3S9YA 1L6WA 3FYOA 4CCCA 1QO5A 5BMXA 1OFOA 5K4ZA 5LGXA 3G24A 1IXPA 1GT8A 3KVLA 1KM2A 1QMLA 1TIMA 3FYPA 2WNZA 1WV2A 3S5YA 3EX2A 3BW3A 3A5FA 2FIQA 3BARA 3GXNA 2Q8LA 1W5QA 4N02A 4E2DA 4DO6A 2Z2UA 3O1NA 2A0NA 2YXGA 2QUTA 4O1DA 4TR9A 1KFEA 2GVGA 1QR7A 3G3DA 3P62A 2G5WA 2CLKA 5HR7A 4UTTC 3PG8A 1XI3A 4K7VA 5AYZA 1WQ5A 4BWLC 2XN2A 3QM3A 3P81A 3THAA 3ATYA 4FB7A 4JTSA 1ZNNA 2ZDRA 2NX9A 2YCEA 1PHQA 4TMCA 1QDSA 3SZ8A 1H62A 2DJXA 2V2DA 3DI0A 1N7KA 1P1XA 3LLDA 4ZQPA 3LHVA 5CPMA 1ADOA 2FQIA 3TFCA 3LGEA 1LM1A 3HO8A 4O15A 3UZJA 2QCCA 1LBFA 5EA9A 4YMZA 3EWXA 1TJPA 3NA8A 2CLEA 3DKJA 2Y88A 3QPZA 3W83A 1BKSA 3W74A 4KWVA 3LCXA 3W7IA 3C2VA 5FESA 1FDYA 3C8FA 3HPXA 3P8JA 3HGOA 1H7WA 3BGJA 3HIJA 4ONVA 7TIMA 4A29A 4JD4A 4M7SA 1MSSA 1A5CA 3TQ0A 5F4SA 4FIRA 4D2JA 4EF9A 1L9WA 2BTMA 5HUPA 2DP3A 5IM51 3A21A 3O16A 3IIPA 3S42A 1KFCA 1T99A 2RDTA 3NQ7A 2ZYFA 4LVDA 4LRTA 4AWTA 3W2MA 1MEHA 5FF0A 5HWNA 3LTYA 1HO4A 3O8AA 3TQVA 2Q3OA 3NG3A 3P84A 2A7RA 3DXIA 4UNLA 3TR2A 2Y63A 3RF9A 3DHFA 2A85A 4Q32A 1L2UA 4N9CA 3A5VA 2QCHA 2ZZ6A 5MHBA 3DFSA 4DF1A 4NXSA 1HUVA 3C2FA 3SJ3A 1R30A 1IXNA 4O4VA 4XKYA 1QOPA 4RKAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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