2B7NA

Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from helicobacter pylori
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MEIRTFLERALKEDLGHGDLFERVLEKDFKATAFVRAKQEGVFSGEKYALELLEMTGIECVQTIKDKERFKPKDALMEIRGDFSMLLKVERTLLNLLQHSSGIATLTSRFVEALNSHKVRLLDTRKTRPLLRIFEKYSVLNGGASNHRLGLDDALMLKDTHLRHVKDLKSFLTHARKNLPFTAKIEIECESFEEAKNAMNAGADIVMCDNLSVLETKEIAAYRDAHYPFVLLEASGNISLESINAYAKSGVDAISVGALIHQATFIDMHMKMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
publication title Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from Helicobacter pylori
pubmed doi rcsb
source organism Helicobacter pylori
total genus 88
structure length 273
sequence length 273
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2b7nA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2b7nA01
1Q6LA 1DVJA 4WXYA 2J9YA 4XTIA 5AHNA 3VFLA 2VXNA 3PUEA 1R2RA 4CNPA 4Q4KA 1YTEA 3GB6A 4ZQPA 3NPUA 3UPWA 4EOUA 2IQTA 2OCZA 3IIPA 2TYSA 3NNTA 5D2YA 4DF0A 3BVJA 4GNJA 1ZCOA 5AFDA 3SGZA 5AC6A 1NF7A 3BW4A 4AWUA 2GJNA 1H63A 4O4VA 1JCXA 3ANYA 4GJ1A 1T8XA 1WXJA 1N55A 3L21A 2V9DA 4FX7A 5D38A 4O13A 1D3HA 3M5XA 1GTHA 3O16A 2Q3OA 1WBHA 3UD6A 5G1TA 2RDWA 3KVLA 2BX7A 3TQKA 3W1AA 4IPJA 1YDOA 1SUXA 3W70A 3GDRA 1LRNA 1YTKA 4ICNA 3FYPA 1Q3NA 1W31A 1SO3A 4PODA 4CQ8A 4M7SA 4JIQA 4M5PA 1Z48A 1VLIA 1L9WA 3FIGA 3GDKA 3P80A 5CZ0A 2CWNA 3TAKA 3O63A 2BLEA 3W73A 4DF2A 3JR2A 3T40A 1AK5A 4G1KA 4FXRA 3WJWA 4TX9A 4TO8A 1QMLA 1Q6OA 3AO0A 3PBYA 5TBOA 3W7QA 2V2DA 1W5OA 3W7MA 2TMDA 1FCQA 4FF7A 2QR6A 1O60A 3L5MA 4JTTA 1WAUA 3UY8A 3HPXA 1UBSA 1VS1A 3N9RA 5EMUA 2VEKA 3P61A 1JUEA 3W2KA 3HGOA 2WNNA 4Y90A 1U83A 3LHZA 3TAOA 2A7RA 1W56A 3O07A 2WPBA 2H3BA 5F2IA 4K7VA 4N4QA 1SSGA 2YZRA 2Z6IA 1KM3A 2E6FA 3CHVA 1OFBA 4FB7A 1G4PA 3C2EA 4ALDA 3LBCA 4CNOA 1S5VA 3MI3A 4OE7A 3W6YA 3GAYA 1F7BA 2ZZ1A 2GQ8A 3I65A 2WKJA 5AOUA 4AMAA 2Q8ZA 4BI6A 4CCDA 2RFGA 1XXXA 1RPXA 4LVDA 5HR7A 2KZHA 3NQ8A 1S5WA 3LXBA 3B0PA 4IMDA 4JX6A 4LVAA 3M47A 1TPH1 4LY8A 4MOZA 1KA9F 4ORIA 2QCMA 5CZTA 2ZA3A 4GC4A 1TTPA 4JX5A 3UY7A 2A7PA 1ICQA 1C8VA 4A2RA 2OT0A 3LDVA 4JIPA 1H7NA 3EB2A 3PBWA 4R34A 6TIMA 1P5BA 1IGSA 4HSOA 2H90A 2Y7DA 2QAFA 3G1AA 1ML1A 1GQNA 1SO4A 3QMTA 4CCEA 5LNRA 2H6RA 3QFEA 2R94A 3N19B 4I7VA 4NU7A 4UFHA 3NEVA 1OG0A 4QIUA 4KFPA 3TROA 3Q37A 3L66A 1AL7A 2GVGA 1FDYA 3K30A 1YADA 3M0ZA 4XQ6A 1K7XA 1MO0A 1TV8A 3NQEA 3G0XA 2DP3A 3FOKA 3NR0A 2GJLA 3WJSA 3EWZA 1YPFA 3G1XA 5BOOA 1RQEA 3HGRA 5CSRA 3TX9A 3MHFA 2WSYA 4U4MA 1JCYA 3KXQA 4OU1A 4GUIA 4WOZA 1LBMA 2LLEA 1SZGA 3WK1A 5AN7A 3N2XA 1TTJA 3LERA 3TJXA 4MY1A 4U28A 2G95A 4UTIA 2WJZA 4FO4A 4A21A 3QW3A 3HBLA 1ZENA 2VC6A 3NGJA 1IXOA 4JS3A 4P2VA 4RZ4A 5CSSA 3KVKA 3QSRA 1KM2A 2QCNA 3IRDA 3NQFA 1KFLA 4QM1A 3U6WA 2HS8A 1G67A 2WNQA 5IBXA 1FUYA 1EP3A 1LLWA 4GFSA 3LHTA 4K6AA 2GQ9A 1TPEA 2JK2A 1JQVA 3EWUA 3SY5A 2CW6A 1X1ZA 1LDCA 3PWAA 3R89A 2I1OA 5FI8A 3N14A 1WX0A 1YDVA 3W1LA 2FIQA 3PAJA 4JTEA 3DI0A 1JUBA 4O14A 1TYGA 3UNDA 3NG3A 5F4SA 1KFCA 1KTBA 4JX4A 1DKWA 4HNNA 3PF3A 1H7OA 5U7SA 1AG1O 5C6MA 1NAL1 3EX4A 4LC8A 1Y0EA 3HGSA 3O1NA 2Y63A 1FY6A 4PCFA 1OX5A 2X1RA 1XUZA 1NSJA 2QJIA 4CNNA 1TREA 2E5BA 2FTPA 2NLIA 3B0UX 2ZRVA 2G96A 1F73A 3PR2A 1A50A 3W2LA 2UV8G 4FNQA 5CPNA 3T78A 3G18A 3P84A 3GVGA 4N6EA 1HO4A 3W1XA 1BEUA 4RXFA 3UWZA 1X8FA 4LW7A 4O1BA 1THFD 2ABBA 4QISA 1SU5A 3DFNA 1DQWA 3WK2A 3M43A 4HKPA 5HNRA 4EIVA 1MSSA 1Q6RA 1JCLA 5H91A 1K7FA 5CPLA 3CTLA 4RX0A 1H1ZA 1ADOA 4O16A 2J6XA 3TC6A 1JQXA 3DFSA 2CFFA 2ZRYA 4QQ3A 4WUIA 2BTMA 1SW3A 4IOTA 1W5NA 1I2PA 2YSWA 4CQAA 1Z44A 4WY0B 4UTWC 3F4WA 4YCOA 1T0OA 5TQLA 1PCWA 3QPYA 3IIVA 2Z2UA 4O15A 4O10A 2ABAA 2G5WA 1Q45A 1OFOA 1TJRA 3NL3A 3QSTA 2Q3RA 5AB3A 1OVDA 3HPZA 1AW2A 2Z6JA 5FEWA 5DY3A 3GXPA 4MFDA 1ZY9A 2OMAA 4FX8A 4UTKA 1BTMA 2R91A 4UFMA 3NPWA 3W7NA 3GXTA 5EY5A 1B9BA 3PC0A 1BWKA 2NUWA 4GUGA 1OYCA 2CLHA 4RCXA 3LI0A 5CZSA 3W72A 2FQIA 4DF1A 3STFA 4LT9A 4AWSA 2G97A 1W5PA 5K7JA 3G3DA 1TPFA 1CI1A 1A53A 3PB2A 2E77A 3LLDA 3LCWA 3PVFA 5KZMA 1WQ5A 1F76A 5AHFA 1JCNA 2YYTA 4EF8A 4UNKA 2H8XA 1GVQA 2E5CA 4GRSA 4RZ6A 1SW0A 3O06A 4HNUA 2XFWA 1G4EA 4K8HA 4E38A 5FF7A 4LS0A 2E6DA 4QITA 1DJQA 4HHPA 1ZALA 4WXZA 1DOSA 3E0IA 3DFTA 4AVFA 3PSWA 4Z1DA 1K03A 3LRMA 4WZHA 5HUOA 2C15A 1B3OA 1S5TA 4Z1BA 1GG1A 5FF3A 1H7XA 5DXYA 1ICPA 1XCFA 1P0KA 1RV8A 5MHBA 3H55A 1KBIA 1I4NA 2O7SA 4FEZA 1KFJA 3BLEA 4CQ9A 1JRCA 2V5LA 3NOEA 1FDZA 3KAOA 1RQBA 1KW1A 3SW6A 3HB9A 3ZFHA 2B7PA 1O95A 1TJPA 3KFTA 4BFAA 5K4XA 2ZFAA 1HO1A 1YXCA 2FDSA 3W71A 1QPQA 4O52A 5D03A 5KMYA 1WV2A 1O94A 3L5AA 4JYDA 3W1QA 1FX6A 3GDTA 4FNTA 3EXTA 4UMBA 3MP5A 4Z0JA 2ATSA 2E6YA 3P81A 3LV5A 2V2CA 4R7JA 3T4CA 5G2HA 1OX6A 3R5EA 1OFRA 5F2GA 2CLKA 2ZTKA 3H54A 3PUOA 4RJEA 3W2NA 3FKKA 4LOCA 3HO8A 1D9EA 3LCFA 3NDOA 3CM4A 2ZZ4A 3BG5A 4ORMA 4DO6A 4LC6A 1L6WA 1SFJA 1XL9A 3UXAA 4IMFA 1I2NA 3G24A 2JGYA 3W1RA 2X2GA 2VEIA 3SJ3A 3BW2A 2F84A 4JNMA 2C0AA 3T44A 1A5SA 2GVJA 4MPQA 5IBXC 3C2VA 1VHCA 1PVNA 3A24A 4QSHA 2WO5A 3W7HA 1QPNA 3TR2A 1R47A 3SSJA 3NAVA 2QCLA 4MYAA 1EUNA 2TPSA 5G1YA 4ZQCA 3QYQA 3W7PA 3OVPA 4NJHA 2A6NA 2EF9A 3L0NA 1HFBA 3T7VA 3OIXA 1GEQA 4UTTA 2V2HA 3PUDA 4O1AA 1GWJA 4MFEA 4IMGA 4UNLA 4TR9A 4E2DA 4ML9A 3W83A 3NPXA 3MBDA 3W74A 1W54A 1PV8A 3W7LA 4PTNA 4O17A 5K3VA 1A5CA 1M6JA 2P1FA 3L67A 1K8YA 1HL2A 1IXNA 3G8EA 2GUUA 1KFBA 4K39A 2PE4A 2RDTA 4K38A 5DCEA 2Q8LA 2DZWA 1EPXA 5I3JA 2J9ZA 3L65A 2HTMA 1S3HA 1E51A 4JTJA 1KM0A 4DQWA 5C2XA 4UXDA 3WJXA 3HPSA 3G1FA 4PL2A 2Y7EA 2YFOA 5AC7A 3R13A 5AHEA 1HTIA 4JN6A 5EPDA 2VOMA 1GTEA 3THQA 4LVFA 1XFBA 4LRSA 3W75A 3GR8A 1WA3A 4MY8A 4UFLA 1QR7A 4N6FA 3EWYA 5AYZA 5CKSA 2VEPA 4PH6A 3R8RA 3QF0A 4JR5A 3CU2A 1LTDA 4WY0A 3FLUA 3IIOA 1VLWA 2J27A 5HINA 5HR6A 3BARA 2DU2A 5AC8A 1MXSA 3S42A 4QAIA 1F2JA 1TRDA 3HG4A 5CGQA 3CWNA 4WJEA 1LBFA 4LUJA 2R8WA 4Y6GA 2W79A 2YCEA 3EX1A 3QC3A 1L6YA 1R2TA 1QO2A 2YW3A 2ZZ2A 2TSYA 5A8GA 3WK0A 3LM7A 1ZAIA 3KRUA 5LNVA 3V75A 3GR7A 3W3OA 3I6RA 1OYBA 3HG2A 2VKZG 4KFNA 1P1XA 3A5VA 3O05A 1D3GA 4H6KA 1OFAA 2B7QA 4UMCA 3OHIA 5I3FA 1BWLA 2ZCGA 3PG8A 3UWYA 1WYIA 3CPRA 1RZMA 3U8GA 5DLCA 2C19A 4ZVJA 2WNZA 3G1YA 3HOJA 4IUOA 2AGKA 1LZOA 2Y7FA 4RV8A 3G8RA 3VKJA 4RLIA 3M7WA 4JXCA 3W7OA 5K9CA 2ZRZA 3HGJA 5I3IA 4QNEA 3U2OA 1TPC1 3I7RA 5F1VA 1EUAA 3LHUA 3TC7A 2JKAA 4AHQA 3TKFA 4Y9AA 1LOQA 3HG5A 4MJMA 4WQ6A 1NFBA 3LB0A 4LV9A 1OK4A 3UZ5A 3ZWSA 3CIWA 1OFPA 4Z08A 3S5YA 1YDNA 4LTSA 1VGAA 2FLIA 2V30A 3TMLA 2P10A 4NJGA 3M5ZA 3CEPA 3KVJA 4S2BA 2CLLA 1TIMA 2RDUA 1GVFA 5CPMA 1FBAA 3TE9A 3IEBA 6ALDA 2ISSA 1JVNA 4POCA 3G1VA 1LROA 1P4CA 2A6LA 3WK3A 1JCMP 4TU1A 3MBFA 4A29A 3THAA 1F74A 3M6YA 1C29A 1LRTA 1SR9A 3CB8A 1VCGA 2E1DA 3RFAA 4MIMA 1ME9A 4M6VA 1AW1A 3E9AA 1PE1A 2NXGA 3P67A 1WOAA 3DZ1A 1QWGA 3MWAA 4AAJA 5I3HA 1GPWA 1XDLA 4N2YA 1JR1A 5HWNA 4QJ1A 1A5AA 1PL9A 4EWND 3A21A 4IQLA 3P82A 4I7UA 5C54A 1OFQA 2CLOA 2EGZA 1VQTA 1VC4A 3O15A 1J2WA 2ZDRA 5D33A 1H7PA 2FPTA 2HMCA 2VFIA 3BG9A 1A5BA 3M9YA 2VFFA 3P5YA 3W2JA 2CZEA 2OX1A 2EHHA 3S1XA 2B7OA 4HPXA 4UMAA 2QEZA 3P74A 4MUZA 4DEFA 1X7FA 1ZAJA 4YLWA 4A22A 2Y62A 3NO5A 3S9YA 3NL2A 2QJHA 3P5ZA 1N8FA 5K4ZA 4JTGA 1T96A 3S5OA 2DORA 3GNDA 3C52A 3KRSA 3NQVA 1TMHA 1AMKA 1FWSA 4MZ1A 4NX5A 4ONVA 4Z0SA 3EEGA 3WJZA 5L9FA 3SECA 2QCEA 3S6DA 4LU0A 2A85A 4UTLA 1G4SA 1XBXA 3QJAA 1VCFA 1FCUA 5BMWA 4BI5A 1OHLA 3MHGA 3DFOA 4K36A 3IIZA 4XBKA 3M41A 1G7VA 3D0CA 3LHWA 3CT7A 3DGRA 3DU0A 5KTLA 2F7FA 3GDLA 4DBEA 3ABOA 3EWWA 5FEPA 3CIXA 5KSWA 1EWDA 4N9BA 1TPWA 8TIMA 3FJ6A 3L5LA 1MZHA 3ATZA 1GZGA 1KV8A 5T26A 1B57A 1GVRA 5K9DA 4IPIA 4LUIA 2QDGA 2W0UA 4X9SA 3TCEA 3PSVA 1TTQA 2ZZ5A 4UFIA 5G5IA 3WFAA 2ALDA 4M7TA 4ZQOA 3P60A 3KX6A 3G1SA 2PRHA 5F1UA 3GZ3A 1TPVA 3LHYA 4NNAA 5DELA 4M6PA 4XUGA 1ZFJA 2GOUA 2Y61A 1VR6A 2ISVA 3I68A 4MLRA 1SQ7A 3C8FA 3PB0A 2JKEA 3R2GA 2XN2A 4LVBA 1QOQA 1C9DA 1UB3A 3WJYA 4UFKA 3TFXA 3GIYA 4YXGA 5I3GA 3V1PA 4GBUA 3KVMA 2XN0A 3S8HA 1EA0A 1UCWA 3O6CA 3QMSA 5CPOA 1H50A 3W7JA 4RR4A 3M44A 5D2VA 2NV2A 1VYPX 5LHEA 1W8SA 3E12A 2BWGA 1W5QA 1R30A 2OJPA 4MYXA 1SSDA 4N9CA 3UZJA 3B03A 3EWBX 1X6UA 1KLZA 3E02A 1DORA 4IMEA 1IXQA 2EAWA 3TV8A 4EVZA 2Y85A 2CU0A 1PHWA 2QJGA 3GYEA 1YXDA 3LTYA 1PS9A 4LS1A 1LOSA 4NXSA 4NJKA 1WDWA 3MYPA 4IWWA 5HULA 1RD5A 1WOBA 3DHFA 4UR8A 4MKNA 2E68A 4XZ9A 2DJLA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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 3LCH A;  2HS6 A;  4AEO A;  4ZMG A;  4PL1 A;  4CLM A;  3CEU A;  2PCQ A;  4FNS A;  2V5B A;  1H60 A;  1GG0 A;  1TB3 A;  3ZR4 A;  2DZU A;  3UWQ A;  5BRB A;  4N9E A;  3TSM A;  5E1Q A;  2X1U A;  2X16 A;  2YW4 A;  2ZRW A;  3EXS A;  4I7W A;  5KIN A;  2D73 A;  2H3D A;  4XKY A;  1FWW A;  2YXG A;  1YTD A;  1HG3 A;  1QPR A;  2EPH A;  4L4M A;  3OEX A;  1ZNN A;  3YPI A;  2AQW A;  1SO6 A;  5K2Z A;  5LSM A;  5D2X A;  3S1W A;  4PEK A;  5FEZ A;  1AW5 A;  4B5N A;  3RU6 A;  4X22 A;  3MYO A;  1SZN A;  2QCH A;  2A5H A;  2WV8 A;  3NL6 A;  4LRT A;  3OA3 A;  4ZL1 A;  3KHJ A;  4C1L A;  2A7N A;  5EL1 A;  3PBU A;  3W2U A;  2QKF A;  4DO4 A;  4GUJ A;  1OAB A;  1VJI A;  4HN4 A;  1LM1 A;  3LI1 A;  4YL2 A;  5DXX A;  3A23 A;  4J9J A;  4S2C A;  3DKL A;  4JYE A;  3BPW A;  1EEP A;  4LV4 A;  5DCD A;  1LBL A;  2DZV A;  2QCD A;  4UTM A;  5LGX A;  4IMC A;  3TNO A;  3Q94 A;  1KV5 A;  1NEY A;  4JTH A;  3EX2 A;  2VEM A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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