2B7PA

Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from helicobacter pylori with phthalic acid
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MEIRTFLERALKEDLGHGDLFERVLEKDFKATAFVRAKQEGVFSGEKYALELLEMTGIECVQTIKDKERFKPKDALMEIRGDFSMLLKVERTLLNLLQHSSGIATLTSRFVEALNSHKVRLLDTRKTRPLLRIFEKYSVLNGGASNHRLGLDDALMLKDTHLRHVKDLKSFLTHARKNLPFTAKIEIECESFEEAKNAMNAGADIVMCDNLSVLETKEIAAYRDAHYPFVLLEASGNISLESINAYAKSGVDAISVGALIHQATFIDMHMKMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
publication title Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from Helicobacter pylori
pubmed doi rcsb
source organism Helicobacter pylori
total genus 86
structure length 273
sequence length 273
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2b7pA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2b7pA01
1XM3A 3EWUA 4N4PA 1VYSX 4PTNA 4LVFA 3NQ2A 4N2YA 3MHFA 3KRZA 4C1KA 1FDZA 1PS9A 5G4EA 4FIRA 3P61A 3V75A 1AW1A 4E0CA 4ZQRA 2D73A 3TC6A 1L6WA 1KFKA 3E49A 3VNDA 3O1NA 3DH7A 1D3GA 1LLWA 3R5EA 2RDWA 1UCWA 2AQWA 3C52A 4HT3A 2C14A 2WQPA 2GQAA 4K37A 3IIVA 2DP3A 4TR9A 2EHHA 1JULA 3EWBX 3EB2A 3W7QA 1WBHA 2W6RA 3CEUA 4FNTA 2VFHA 2WJZA 3CPRA 3B4UA 1H7PA 2OX1A 4J9JA 3LV6A 1SUXA 2CZFA 3QMSA 3NR0A 1AW5A 3SSJA 2VEPA 3MP4A 1RQEA 5EMUA 5TIMA 3FS2A 4WXYA 4UMBA 3QMTA 3W22A 2F84A 3GDRA 5LHEA 1FUYA 3CIWA 3OVQA 3SY5A 1P1XA 3W7KA 4FX8A 4GRSA 1OABA 1Z42A 5FI8A 1FCVA 1SW3A 4XTDA 1LP6A 2FB2A 4LVDA 4H3DA 4XTIA 1GPWA 1OK6A 5DCDA 2Q3OA 1EPXA 1SO6A 4JIQA 3W23A 2ALDA 3PF3A 3SIZA 5EKYA 4QISA 2NXHA 5FEXA 4FNPA 3NZRA 1H7OA 1LM1A 4IUOA 3N2MA 4JXCA 3UXAA 1OJXA 4Z1BA 4IPJA 2EAWA 2RDTA 4WJEA 2C6QA 3TU9A 4FNUA 1BEUA 1ME7A 3TJLA 2FQIA 2Q3RA 3S0CA 3PC0A 2Y6ZA 1QMLA 1TREA 4IQLA 3P5YA 1ZAIA 3LXCA 3L2IA 1GVQA 3M16A 2X2GA 3ZS4A 3NL2A 2BSLA 3B03A 3T40A 1T99A 1S5WA 2VFGA 4Z1CA 1XUUA 3M43A 3INPA 3LCWA 4W9TA 5A5WA 4N9DA 4Y90A 4WQ6A 1H5YA 4I7WA 2C15A 1V5XA 4NQ1A 4FXRA 4KFOA 4UTHA 1RZMA 1TRDA 2Z6JA 3N9SA 2RKXA 4TU1A 4UR7A 2DZTA 5CPOA 5K9DA 3DFOA 2C0AA 1KM1A 4UIOA 3P8JA 4JEQA 1JUEA 2NWRA 3S8HA 1AL8A 4MIMA 3IGUA 3MI2A 1UB3A 3TE9A 1MSSA 3SI9A 3KAOA 5HR7A 5EA9A 2AAMA 1VH7A 1MEHA 3TSMA 3NL3A 4UTTA 1Q6LA 5KSWA 3UQNA 1L2UA 3LX9A 2X1RA 3MJYA 3U8GA 7TIMA 5C54A 3EX2A 5HINA 1GG1A 5LHFA 1YXCA 3C3NA 4AWTA 4Z0SA 2RDUA 4GUJA 2Z0IA 4OHQA 3UWZA 4MY1A 4M7SA 4O57A 3WJWA 3ELFA 2ZZ7A 3N9RA 4WZHA 3B0VC 4JTUA 2VELA 4JX4A 1JJKA 1GVRA 1OFAA 1J4EA 3NPXA 1XUZA 1L6SA 2H3DA 1OK4A 2C18A 3U2OA 1W31A 1XC4A 1X1OA 3O06A 1LDCA 4DXVA 1TPFA 4QSHA 3NNTA 3G1AA 2TRSA 3NL5A 4YL2A 1BTMA 1FXPA 2OJPA 2B7PA 1THFD 4NZJA 4WY0B 4IMCA 5F4SA 3GK0A 2YR1A 2DZWA 5J5RA 3HG5A 1WA3A 4HSOA 1R2SA 2YSWA 1UUMA 4KFNA 4CQ9A 1JQVA 3MHUA 4FF7A 4NT0A 1SZFA 2Y61A 4UR8A 3PBUA 5I3FA 1JCXA 5CZ0A 1GT8A 5CKSA 4DO5A 3S9YA 2QCEA 1TTQA 2DORA 3SJ3A 3O15A 4ONVA 3ABRA 3Q37A 1TTPA 4MVAA 2QUUA 4K38A 2NXGA 4UFLA 2X1TA 4MYXA 3FKKA 3TQ0A 4MFEA 3R12A 3TDFA 1R46A 3S6DA 1GVSA 3M6YA 1BKSA 2WSRA 5T26A 2V8ZA 5EPDA 3W1RA 1WBJA 3HGSA 1OFOA 3KVKA 1VYRA 4NZFA 1W5QA 2XN1A 3LCXA 4UTIA 3GLCA 4UFMA 4GXMA 1I2NA 2ZZ5A 3S42A 4U4MA 2BXVA 4IMGA 2H90A 5DLCA 1ICQA 3I68A 1RVGA 3H55A 2WOQA 3FOKA 4I9AA 4NJHA 3TUUA 5IM51 1UUOA 2O7QA 5AC8A 1O5XA 2EF9A 3BVJA 4UC5A 4NJJA 1QOPA 1W8SA 3DFSA 5BMWA 3BW2A 2QJIA 5DBUA 1TIMA 3TROA 3LRKA 4CNPA 5F2MA 1G4TA 3EX6A 5BRBA 3P84A 4MPQA 3G1XA 1TQJA 1YDVA 5A8GA 1R30A 3CT7A 3E02A 4XZ9A 3M5YA 4RCXA 4RXFA 4TMBA 2TPSA 4AXKA 1D9EA 4JX5A 5G1TA 1AG1O 1GG0A 2YPIA 3BLFA 4UNLA 5D2WA 5EYWA 3WK3A 4O0KA 4Z0JA 1QDSA 1YXDA 1J2WA 4CCCA 2QF7A 3W86A 1KTCA 1TMHA 2ZBTA 1YTDA 1DJNA 5FESA 2A1YA 3NL6A 4MZ8A 4JY8A 3NQGA 4EF8A 3N14A 2Z6IA 1VLIA 4JICA 5CPNA 1N7KA 1J5TA 1T96A 3MHGA 1YDOA 1OYAA 3M1ZA 2Y89A 1G69A 2VOMA 3TXVA 1SW0A 5LGXA 1A5AA 3CM4A 3TAOA 1O95A 5TQLA 1ICSA 1H7WA 3L5AA 4N9EA 1YLVA 3MP3A 1TPEA 2GPTA 4TX9A 4I7VA 3E9AA 2QCCA 5CPMA 5LNUA 4XBSA 1GVOA 4MZ1A 1FDJA 1CX9A 2OT0A 1M6JA 1KW1A 2YYTA 2H8ZA 3SW6A 5HUPA 3VFLA 2JKPA 3DENA 1Q6RA 4GWEA 4DPQA 3QZEA 2O7SA 2PURA 5K3VA 2ZTKA 1M7PA 3HPXA 3O16A 1GJPA 3LHYA 4NXSA 3NQ8A 4PL1A 1SR9A 3FJ6A 2R94A 2E6YA 5HWMA 4LS2A 5FEZA 2I14A 3S1VA 3G0UA 4LC8A 4FHAA 1G7VA 1C9DA 3GNNA 3EXRA 4LVGA 1K02A 3DFQA 3ABOA 3PUEA 4UFKA 2A5HA 3Q94A 4JNMA 1B4KA 4QNWA 3TA6A 2X16A 3IVTA 3GXTA 1KFBA 1SZNA 2QJGA 3N2XA 4O16A 5DCBA 4XQ6A 5D33A 5G2IA 1VCFA 2FIQA 2BWGA 1I4NA 1DV7A 3TJXA 5I3KA 1TTIA 3QYQA 2DZUA 4K8EA 3LBCA 4EIVA 1CI1A 4XWUA 2VFEA 4DBEA 3G1DA 1F73A 4WY0A 3H54A 1QFEA 1ZHAA 3NAVA 3P81A 4NX5A 4IMDA 4M6PA 2GVGA 2YFOA 3C6CA 3G1YA 5AOUA 3UZ5A 1TJPA 4O11A 1EX5A 3WJYA 1TV5A 1XBZA 1Q6QA 3C2FA 3DZ1A 3TK7A 1IXNA 2WSYA 3DKLA 1LOQA 1W1ZA 1LOLA 5LSMA 1W0MA 2A7PA 4N4QA 3CB8A 1SSDA 2PRLA 3LM7A 1TTJA 2H3BA 3UD6A 4LS0A 5F2IA 2G96A 4MJMA 5AC7A 3GX9A 5U4NA 2Y63A 4FB7A 5F2GA 3O07A 1PE1A 3HO8A 1DKWA 3RNDA 3W71A 4TO8A 1KLYA 3QF0A 1G4SA 4WOZA 2CWNA 3QW4B 1VZWA 3LXAA 5K2ZA 1VJIA 4LW7A 4JTSA 3R13A 2GOUA 4WOQA 3TXZA 2Y62A 4CCDA 1IIHA 1MEIA 3NA8A 1ADOA 2FTPA 1SFLA 3G1VA 4JTLA 5AHMA 4O15A 3W76A 4X2RA 3M7WA 5F1VA 1OFRA 4Z1AA 4RZ6A 4POCA 4B5NA 4OGZA 1EIXA 4LV4A 5FF0A 3B8DA 1EUAA 2YDAA 5BOOA 1G67A 2Y7FA 4CQAA 1NF7A 3RMJA 2X30A 1JCYA 3FIGA 1KM5A 1Y0EA 2DJLA 1JRCA 1MZHA 2ZA3A 3LBMA 1F6KA 1LBFA 4OU1A 3STFA 1TB3A 3G1FA 3MI6A 4O28A 4O12A 3PULA 4GUFA 3LCIA 3HJZA 1GVFA 2FB3A 2TMDA 5AYYA 2W79A 2J9XA 1R2TA 2Y7EA 2VFIA 3THAA 2CLMA 1D3HA 3GAYA 4FX7A 1KM6A 4A2RA 5LKYA 2ZZ3A 2NUXA 4IWWA 1SU5A 1VLWA 5D2VA 1YTEA 1ZNNA 2JGYA 4A2SA 2Y88A 1NSJA 2I1OA 3BO9A 2CLFA 3KHJA 4MY8A 1KM0A 2QUVA 1B3OA 4PODA 2QCDB 4UTTC 3EX4A 1LRNA 1OFEA 3UPWA 5DY2A 3W1UA 1WOAA 3W84A 1U5JA 2NXIA 5CSRA 1RPXA 3IGSA 3LHVA 3QSTA 2V82A 4JX6A 2B0MA 3VKJA 1S5VA 1MXSA 3UWVA 1G6CA 3BGGA 4RV8A 2ZRVA 3HPZA 1A5SA 2ZZ1A 4QJ1A 2DU2A 3ZWTA 2QCHA 4WY0F 3STGA 1QNVA 1EA0A 3M41A 3A22A 4R7JA 4LC6A 3C61A 3BG9A 2X1SA 1K8XA 2C19A 3LTPA 5IBXC 4BI7A 1KA9F 1QO5A 3TMQA 5CSSA 3L0NA 3V1PA 3WJXA 4ZL1A 4GE8A 2ATSA 2CLHA 3TMLA 3DFPA 1KM2A 3EWXA 3PUOA 1A5CA 3K30A 3LB0A 4I7UA 3TH6A 1FCBA 3N19B 3PB2A 5AHFA 3SZ8A 2NX3A 1F05A 1B57A 1W54A 4DF0A 3MBFA 3KRSA 4DQWA 5DY3A 3O8AA 1N55A 2QUTA 3LXBA 2ZRZA 4GUGA 1OX4B 2QAPA 2FLIA 3EKLA 1E51A 3W2UA 1I2RA 2QCFA 4UTWA 3MUXA 5AYZA 1DORA 3GZ3A 1GEQA 5F4XA 1VHNA 1I8JA 5D04C 4E38A 4H6KA 3W7CA 4MFDA 1T0OA 2CZEA 3GB6A 4JD4A 4JTHA 4KFPA 3U6WA 1Z41A 3GR7A 3NZ1A 3R89A 3UWYA 3P60A 3N34A 5AHLA 2VC6A 1F5ZA 5K4ZA 3T4CA 2ABBA 2ZTJA 5KITA 3DHFA 3ATYA 3W75A 3QQ0A 3KRUA 4O54A 1P4CA 1GTEA 1OX5A 2HTMA 3N73A 2RFGA 1RD5A 1FXQA 3TFCA 1V7YA 4UUIA 2LLEA 3L9CA 1HUVA 3B06A 2V30A 2PC4A 1PCWA 4IMFA 5C2XA 4HIBA 2G5WA 5FEWA 1DL3A 4JTFA 5I3JA 4Z1DA 1XDMA 3QSRA 3E96A 3SECA 1LYXA 1DQXA 3W7HA 4UXDA 3CEPA 2C3ZA 2HMCA 3CLMA 4YMZA 3W7PA 4QNEA 1C8VA 1IIGA 4YCOA 4JY9A 1FWRA 3I65A 4PH6A 1M7OA 1W5PA 4GFSA 4NNAA 1Z44A 1LROA 3L0GA 4RJEA 4HNTA 2PRMA 3SR7A 3I6RA 5I3HA 4HHPA 4AWSA 3DI1A 4XKYA 1KBIA 3G0SA 3W2KA 4GC4A 3WJZA 4LWWA 5IBXA 4AHQA 4DF1A 2YFNA 3GVGA 1FDYA 3MYOA 4KWVA 3QM3A 2IQTA 4TMCA 1FCQA 1OF8A 5D2TA 1X1ZA 3P7YA 4ALDA 3FJLA 1Q6OA 1RQBA 5CZSA 5HNRA 4KWWA 2NV1A 2CFFA 3G0XA 3STEA 3WK1A 3LLFA 3PVFA 3RF9A 4OQVA 1SO5A 1PVNA 3EWWA 3TKFA 4AHPA 3WK0A 2C16A 1TO3A 3RLUA 1BWKA 1O60A 1SO4A 1O94A 3HF3A 1H7XA 3DAQA 3KVLA 5D03A 3KXQA 3O05A 1KFJA 1PHQA 1L9WA 5D02A 3BARA 2YCEA 3MI3A 3BW4A 3OG3A 2FPTA 3KVMA 4L4MA 2W0UA 5KZDA 1F2JA 4FO4A 3W87A 2QCDA 1HG3A 2I9EA 1JVNA 1XFBA 2ISWA 3L66A 4LUJA 3BW3A 3PBWA 3S5ZA 4UTKA 1P0NA 3NXFA 2EKCA 5HWJA 4ZQCA 5HUOA 4LVBA 2J6XA 3LCFA 3MBDA 1ME9A 2YW4A 3SGUA 5SWUA 1XXXA 3LOTA 1IXOA 3EX1A 1WDWA 3FLUA 3QMRA 1C29A 4AAJA 4RXGA 4Q32A 3T78A 3W6YA 2OMAA 1K8YA 3OEXA 2V5BA 5K9CA 2EGZA 4LRTA 1H1YA 4UTJA 4EVZA 4PEKA 3BPWA 3ZFHA 3F03K 1KTNA 2Y85A 2QCLA 2Y7GA 5KINA 1LOSA 2QKFA 2BLEA 1IXQA 1H7RA 4ZVJA 1X7FA 2NZLA 2GJNA 3NQAA 4NXKA 4NNCA 1A5BA 3UXDA 2WPBA 1EP3A 3A23A 1FQ0A 3P67A 2P0OA 4XBKA 4LNYA 2KZHA 3HIJA 3UYCA 1KV5A 3L5LA 4XUGA 1X8FA 4RLIA 2JBMA 5I3IA 3C2RA 1H60A 1TYGA 3GNDA 1QO2A 5BW6A 3EX3A 1OX4A 2ABAA 4UFJA 3RK8A 4EWND 3LCHA 3NQ6A 3AO0A 3HOJA 3HBLA 2Q8ZA 3M5XA 4K39A 5CPLA 1G4EA 1LLZA 1GZGA 4O53A 3W7OA 4X3ZA 3O6YX 2Y70A 4JTKA 1I2OA 2HS8A 4JYDA 3YPIA 3T55A 2YZRA 3F4NA 3P74A 4PL2A 1K03A 3VE9A 3LERA 4RK8A 3NQFA 5D37A 3TC7A 3W2MA 3IRDA 4O1DA 2GQ8A 1ZFJA 3PSVA 3JRKA 1JCNA 1F76A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2OZ0 A;  4M7T A;  3MYP A;  3TSB A;  1KFL A;  4DPP A;  1OYC A;  3DI0 A;  4JYF A;  4LUI A;  1XL9 A;  5DN1 A;  3W7L A;  3TCE A;  3P5Z A;  5CZJ A;  4X22 A;  5AFD A;  3HG3 A;  3W7R A;  3TFX A;  4HNU A;  4K8H A;  4O18 A;  1LCO A;  4OT7 A;  3CWO X;  3SGZ A;  4HSN A;  1K7X A;  3W7I A;  4RZ4 A;  1LRT A;  1W37 A;  4FXS A;  4CCE A;  3PS7 A;  3UZJ A;  2FFC A;  3M5V A;  4C1L A;  1W5M A;  3HMJ G;  3TAK A;  4Q33 A;  2QCM A;  5D30 A;  1WAU A;  3KX6 A;  4IX2 A;  4U28 A;  1A53 A;  1DHP A;  1YPI A;  2E6D A;  1DVJ A;  4NJG A;  5K4X A;  1EWE A;  3S1X A;  3W1M A;  3ATZ A;  2QCN A;  1NVM A;  4YXG A;  2JKE A;  3NM3 A;  1P0K A;  3M47 A;  3QPZ A;  1VRD A;  1FWN A;  3EEG A;  5KZM A;  3QW3 A;  1K7F A;  1SFJ A;  4IPI A;  4XKY B;  4Y96 A;  4BI5 A;  1JCJ A;  4O52 A;  1YTK A;  3W1X A;  4O13 A;  4ZZ9 A;  2CLO A;  4NNB A;  3B0P A;  5DXX A;  4JN6 A;  1TV7 A;  5FF3 A;  3Q2D A;  1PV8 A;  4DO6 A;  1FWW A;  3IV3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3PC0 A;  3AML A;  2Y6Z A;  3E1F 1;  3P5Y A;  1ZAI A;  2XM1 A;  1S2W A;  4F0L A;  2BSL A;  3BMW A;  3T40 A;  4JHO A;  1T99 A;  1TG7 A;  4WF7 A;  1B31 A;  3SUV A;  2Y2W A;  3UZZ A;  3EPO A;  4N9D A;  1PSC A;  4FXR A;  4UTH A;  2RKX A;  5DRI A;  1RLC L;  4PFH A;  4H41 A;  2DZT A;  1UKQ A;  4LAZ A;  3DEC A;  2BOD X;  3N18 A;  1KM1 A;  1CB7 B;  3P8J A;  3S8H A;  3P3B A;  2HRW A;  3XIN A;  4IJR A;  2RGL A;  3BE7 A;  2H9A A;  4A8I A;  1VH7 A;  1GEH A;  2PTZ A;  1M1K J;  4F9J A;  1H0I A;  3H2N A;  2WCA A;  3WUG A;  4KW2 A;  4XKM A;  3GTN A;  3NL3 A;  1EPV A;  1Q6L A;  5KSW A;  3ZJ7 A;  2WXD M;  2X1R A;  2V3G A;  2CXE A;  2WK2 A;  4QFU A;  4YS1 A;  3ARW A;  2ZVR A;  5HIN A;  5FL1 A;  4HJW A;  5LHF A;  3VTR A;  4GUJ A;  1Z32 X;  4PUN A;  4H9Z A;  8XIM A;  1V6U A;  1XH1 A;  3D6N A;  2VEL A;  2WZT A;  4KWO A;  4JZ5 A;  4WKA A;  1OK4 A;  3SQM A;  1XC4 A;  2X7W A;  1X1O A;  2XGB A;  4BY3 A;  4DXV A;  3KCJ A;  4ZO8 A;  4ZOD A;  1KKR A;  1NJJ A;  2OLA A;  3OP2 A;  1CEO A;  3ZR6 A;  1THF D;  4PMO A;  3G6L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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