2I1OA

Crystal structure of a nicotinate phosphoribosyltransferase from thermoplasma acidophilum
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
389
structure length
389
Chain Sequence
MNVFNTASDEDIKKGLASDVYFERTISAIGDKCNDLRVAMEATVSGPLDTWINFTGLDEVLKLLEGLDVDLYAIPEGTILFPRDANGLPVPFIRVEGRYCDFGMYETAILGFICQASGISTKASKVRLAAGDSPFFSFGIRRMHPAISPMIDRSAYIGGADGVSGILGAKLIDQDPVGTMPHALSIMLGDEEAWKLTLENTKNGQKSVLLIDTYMDEKFAAIKIAEMFDKVDYIRLDTPSSRRGNFEALIREVRWELALRGRSDIKIMVSGGLDENTVKKLREAGAEAFGVGTSISSAKPFDFAMDIVEVNGKPETKRGKMSGRKNVLRCTSCHRIEVVPANVQEKTCICGGSMQNLLVKYLSHGKRTSEYPRPKEIRSRSMKELEYFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a zinc ion bound Nicotinate Phosphoribosyltransferase from Thermoplasma acidophilum
rcsb
molecule keywords Nicotinate Phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase
source organism Thermoplasma acidophilum
total genus 129
structure length 389
sequence length 389
ec nomenclature ec 6.3.4.21: Nicotinate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2006-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2i1oA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2i1oA01
2RDTA 1JJKA 2ZYFA 3OG3A 1J2WA 1BEUA 4HPJA 3WJSA 4UFJA 4CCDA 3M16A 3L5MA 3QH2A 3MBDA 1PV8A 3QPYA 5KMYA 2A21A 1QAPA 1OFRA 1ZHAA 5CSSA 4A21A 1TTIA 4PL2A 2B7PA 2H90A 1TPFA 3LHTA 1JUKA 4LUIA 1KTNA 4Z1BA 2RDUA 3NQEA 4S1FA 5HJLA 3P8IA 4O1DA 1B3OA 2I1OA 4FEZA 1MEIA 2A7PA 4XQ6A 3UXAA 2WNQA 2XN1A 3HOJA 3G3MA 3JR2A 4QNEA 1BWLA 4KFNA 4O19A 4KWWA 3FYOA 2B7QA 2GQ8A 3P61A 1WOBA 4MY1A 4N4QA 3QYQA 3A23A 1TREA 1W5MA 2JK2A 3TKFA 2QDGA 3TJLA 3F4WA 1QFEA 1EB3A 5BMXA 1G69A 1SO3A 1A5AA 1SZFA 2X1TA 3NQMA 2E68A 4ZVJA 3NA8A 3B06A 3WK3A 1XBYA 1F6KA 2NUYA 5EMUA 4ZZ9A 2P0OA 4FHAA 2JGYA 2VEKA 3MYOA 2PE4A 4ZMGA 3S5ZA 3M0ZA 2QCHA 1TSIA 4TR9A 4UTLA 2V8ZA 3S8HA 3LM7A 3SFKA 3C2EA 3P80A 2A4AA 3GDTA 3PBWA 4PL1A 4TU1A 4FB7A 4RK8A 2ZZ5A 4HN4A 3VNDA 3GR7A 3G22A 3IIZA 3R5EA 4X3ZA 3CM4A 1QPOA 4MLJA 4Z08A 3W7MA 2PCQA 1YLVA 2CLKA 1OYBA 3FLUA 5G2HA 3USBA 3W75A 1IGSA 3LCXA 3M5VA 1GVQA 4AAJA 3DFSA 3C2FA 1PL9A 1W0MA 4JTKA 3L67A 4O4WA 3PB2A 2BSLA 3N19B 2J27A 3K30A 1Q6LA 2WQPA 3TIMA 4ZQPA 1L9WA 3M6YA 2GJNA 1GTHA 4QITA 4JR5A 3PBYA 4FO4A 4M7TA 4CCEA 2NX3A 2YFOA 1JCXA 4I9AA 2P1FA 2Z1BA 5G4EA 5CPLA 2NUXA 4LVAA 1RD5A 3W7IA 3E0IA 1L6YA 4JTTA 4O1CA 4TIMA 3NZRA 4I7UA 1LRTA 1SU5A 3HPXA 2Y89A 5CSRA 2V81A 1I2RA 1VYSX 2DZSA 2X2GA 3WJXA 4NJGA 2ZZ6A 3LCFA 3I7RA 3M1ZA 3STEA 3A9IA 1PHWA 5F2MA 4AWTA 3PULA 5D09A 1FQ0A 1OABA 5GVJA 1W5OA 3O8AA 4KFOA 2FFCA 4E2DA 3KXQA 4NNAA 3M9YA 1YDVA 4TMCA 1CW2A 3MI2A 3LBCA 2DZUA 4AVFA 1LROA 1W3IA 5IBXC 4X9SA 4BI7A 1OFBA 1OFAA 2ISVA 1OVDA 3HGSA 5CZ0A 2FQIA 3FFSA 1QO5A 5AB3A 1TJPA 1ME9A 3TDFA 4CNNA 2O7SA 5I3JA 2DP3A 3DHFA 3S5NA 1KM3A 1Y0EA 1YPFA 3CLMA 2AAMA 2G95A 4UUIA 2JBMA 3NQ2A 4J9JA 3RMJA 1H5YA 2QCLA 2H8XA 2WNZA 1VCGA 1QCWA 2C14A 1P0NA 1MEWA 2TSYA 1KTBA 4N02A 3ABQA 5TIMA 3QPZA 1XFBA 2X16A 4Z1CA 3HO8A 1F76A 4IJBA 1D3GA 1H7OA 2QEZA 2VKZG 3QJAA 3TW6A 1FX6A 1ME8A 1G4TA 1SW3A 5TBOA 1I45A 1XCFA 4UC5A 3GDLA 3T40A 1UUOA 1YTEA 3GVGA 1Z48A 4HNTA 3B0PA 3EB2A 5FEXA 1TMHA 4JY9A 4FNRA 1JULA 4HHPA 3VE7A 1MO0A 1ZJIA 1OFOA 4JS3A 4O0ZA 1K8ZA 1ICSA 3UWVA 1I2QA 2YZRA 1TPWA 4IMEA 1O95A 3A24A 1TV8A 1PCWA 4LVBA 4JIQA 4FNQA 4A2SA 3LRLA 4RXGA 4XKYA 2F84A 4K7YA 3PUDA 3DXIA 2ZRZA 3DHDA 3W7RA 1ICPA 3IGXA 3MW7A 3HQ1A 3W2MA 1EA0A 1V7YA 4N4PA 4PEKA 3LHZA 1SZNA 1MEHA 3QEZA 4IX2A 4EF8A 4S2BA 2ALDA 3B05A 2ZFAA 1ZAHA 3HGRA 3BPWA 3E9AA 4NX5A 1XL9A 4WY0B 3UWYA 1EWEA 4QNWA 3W2KA 1M7OA 2RHGA 2YX0A 1K3UA 5I3FA 1MSSA 1UBSA 4ONVA 3I7SA 4MPQA 4K8HA 1KFJA 3MYPA 1VYPX 2V5LA 3C52A 5D2YA 4ZL1A 4WZHA 3S1VA 3MP4A 3BVJA 2NUWA 3BG9A 2TYSA 1GG1A 2RFGA 3P8JA 2GPTA 3W7JA 4UCGA 3SW6A 5AOUA 3G1XA 1HTIA 3LHVA 3RF9A 1VCVA 3HGOA 3S0CA 4QAIA 5LKYA 3LRKA 2G97A 4PODA 1VRDA 5D04C 3T55A 1GVRA 4UFMA 1QNVA 4DF0A 3VKJA 2ZRUA 1DORA 3TQ0A 1W56A 4LOCA 2VOMA 2GVGA 1KW1A 3STCA 2E09A 1ML1A 2ABAA 3UQNA 4C1KA 1I2PA 2WO5A 1TRDA 4A29A 1DQWA 3C3NA 3NL5A 3E02A 5C55A 1B57A 3DFPA 4OV4A 3EWUA 3HMJG 1SW7A 2WSRA 3FKKA 3FJLA 1ZENA 4DELA 2V0TA 4JTLA 3QQ0A 4BI6A 1JUBA 5J5RA 4JIPA 5KITA 3W2NA 2FTPA 1W5PA 3NR0A 3TW7A 3EX6A 1VZWA 4GUFA 2RDWA 4O53A 3W7PA 1AK5A 5D02A 3BLEA 1TV5A 2C16A 2HTMA 5HR6A 1JR1A 3SECA 3EX2A 5HUPA 1VHCA 1SO6A 4CQAA 1VH7A 2DJXA 2Y85A 3IGSA 3LRMA 4KFPA 1LBMA 4A3UA 1K02A 2VEPA 1GJPA 5LGZA 3NL3A 1GVFA 3NGJA 5HMSA 1XBVA 3INPA 4IMGA 4O17A 4OBTA 2Y62A 3THQA 2J9XA 3EXRA 1QPNA 5G4WA 3NM1A 4M5PA 3NOEA 1QDSA 4LUJA 1KFEA 4M6VA 1PE1A 3IIXA 1OHLA 1GPWA 4UTUA 2Y7GA 4LRTA 4NNCA 3SSJA 5K3VA 3IIOA 2CZFA 2WJZA 2EAWA 2OCZA 1M6JA 3NPXA 3W1UA 1C9DA 1OFQA 3PM6A 1HG3A 3OHIA 5EA9A 4JYDA 2C15A 2DZPA 3L68A 4RV8A 3GAKA 5D2WA 2ZZ4A 3TROA 3UD6A 4OU1A 5CGQA 2QCCA 3EWZA 4P61A 2QR6A 3DAQA 3C4UA 3ZS4A 2DZTA 3OVPA 3LLDA 3BW4A 3G1AA 3W7LA 5U7SA 4K8EA 5EY5A 1RR2A 2G96A 4YXGA 1GZGA 1KTCA 3GDRA 3NZ1A 4WUIA 5I3GA 1TRIA 3MHFA 3NL6A 3LCIA 1SO4A 2GQAA 3L0NA 3PSWA 4P2VA 5HUOA 4MVAA 4OHQA 4LU0A 3LOTA 3TH6A 5DELA 2JKAA 3TMQA 3LV6A 4O1AA 4UTJA 1XI3A 5DXYA 4MY8A 5CPMA 4O4VA 4JYFA 1Z41A 3HGJA 1H7RA 1B9BA 1G6CA 3UZ5A 5FF7A 3NQ8A 4LS2A 5FF2A 2A1YA 4DPQA 1L6WA 4EWND 3TU9A 1EUNA 1VC4A 5EPDA 1JCMP 3GAYA 4CNPA 1ZAIA 1ZNNA 4NZJA 2YCEA 4DF2A 4IQLA 1KA9F 5G2IA 4O10A 2QAPA 3KRSA 2OJPA 2VFFA 3G1SA 3NQDA 5LNVA 4JICA 3R12A 2J6XA 5HNRA 2Y63A 5BMWA 2CFFA 5IBXA 3Q2DA 4AMAA 2EGZA 3NEVA 3TQKA 4ADSA 5K4XA 5EKYA 1OFPA 4LC8A 5DBUA 2ZDRA 4UTWC 1P4CA 4Z0SA 3N2XA 1QO2A 1EUAA 2Q3OA 3CHVA 3TAKA 3F4NA 3LHUA 1ICQA 5MHBA 2VFGA 5FEZA 1ZCOA 3KRUA 1F73A 4LS1A 4GRSA 3LTSA 2GJLA 5H91A 3W1XA 3LTPA 2DZWA 3RK8A 4O14A 3SR7A 3TNOA 3G1VA 5DY3A 3S1UA 1A53A 3BLIA 4UTKA 5H2ZA 1LYXA 3Q58A 2A0NA 3NO5A 2ZZ3A 3UPWA 4H3DA 4MZ8A 1KV5A 4HPXA 2V2HA 3GNDA 3OEXA 5CZTA 3G8RA 1X1OA 3G1FA 4AF0A 1EP2A 3P62A 1HL2A 1AW2A 1QMLA 1TPB1 4GUGA 3WK0A 1YDOA 3L2IA 3TAOA 3C56A 1GT8A 1JVNA 1LRQA 3FJ6A 5F2GA 3LDVA 3A21A 1G4PA 3W85A 3O6CA 4H4IA 1LTDA 1GYNA 1EWDA 3CU2A 5AHLA 3LXBA 4TMBA 1HO4A 1H7PA 2H3DA 1K7XA 3AO0A 3O63A 2QUUA 3DU0A 2W0UA 2ZA2A 3T44A 3W1MA 5I3HA 3NQ6A 1G7VA 1OYCA 2GVJA 3I68A 5DXXA 1FCUA 3W7DA 2TRSA 3EEGA 3W7OA 3NM3A 3L65A 3YPIA 1KV8A 1PVNA 2A2IA 1UJPA 3B8DA 5AYYA 1KM0A 1XM3A 5LHFA 1LOLA 2VXNA 3EKLA 2Y7DA 1A5CA 1OX4A 2PRHA 3A5VA 4ALDA 1H1YA 2VFDA 2F7FA 4UTMA 2FB3A 3TA6A 2JKEA 4Z1AA 4Y9AA 2B7OA 3IRDA 1O60A 1SFJA 2NV2A 3L9CA 3PBUA 1DHPA 1LP6A 3CIWA 4M6PA 3UXDA 4R33A 5BRBA 4WD0A 3ELFA 3EXTA 5LZLA 1W3TA 3TE9A 1GG0A 4LC6A 5BOOA 3KVKA 2WNNA 1P0KA 5K2ZA 3P82A 4H6KA 3VE9A 1C29A 1UCWA 4UNKA 5DCDA 5C2XA 1LBFA 1LOSA 3W7EA 1KBJA 2VELA 3BW3A 3P5ZA 1U83A 3MHGA 2H3BA 1TIMA 1AL8A 4D2JA 2Y6ZA 5D2XA 3GK0A 3G1DA 5D37A 5HWNA 2R14A 5KZMA 2J88A 2H6RA 3L5AA 1A5SA 2B0MA 1KM5A 4GC4A 1WQ5A 3BARA 3L0GA 1BKSA 1T96A 3KRZA 1YXCA 5F4XA 3N34A 1X7FA 3GR8A 2I14A 3D0CA 3SY5A 4YWIA 2XN0A 1XBZA 1FCQA 1H50A 3E49A 2DJLA 5C5YA 3TFXA 2WOQA 3UNDA 4RXFA 1KLYA 3W7NA 4W9TA 3LHWA 2EHHA 1JCYA 3RNDA 2C6QA 3EXSA 5J5DA 1RV8A 3FEMA 3U2OA 1SZEA 3LBMA 4X2RA 4FNPA 2VFIA 2WV8A 5G1YA 5LNWA 3UWUA 3PR2A 3N9RA 2NWSA 1SW0A 1FWWA 3IEBA 4JXCA 3DZ1A 3G8EA 4JTEA 1FY6A 2VEMA 4ADUA 4FX6M 1TV7A 2Z2UA 4JX4A 4R34A 5F2LA 3C8FA 2V2CA 1J5TA 4JN6A 3W9ZA 4AWSA 5LHEA 1A5BA 4LT9A 1H7NA 4C1LA 1AW5A 3B0VC 3LCLA 1DVJA 4LW7A 2YXGA 3N73A 5F2IA 5AHFA 4K37A 1JRBA 3W83A 2QDHA 3HG5A 3M41A 1NSJA 1H63A 2Q3RA 1OX4B 4UMBA 1PCKA 4LRSA 3GX9A 3N2MA 4NJKA 3TSMA 3EWYA 1RQEA 1YADA 3DI0A 2X1RA 3GZ3A 3O05A 3IVSA 1GWJA 4IUOA 4Q33A 1DOSA 1KLZA 4S2CA 4JTGA 1Q6RA 4BR1A 4YL2A 2QCDA 3OA3A 3H55A 3QMRA 4JDBA 3R8RA 1DV7A 3PAJA 3M5YA 2Y88A 4JYEA 3MP3A 4WJEA 1DBTA 1LBLA 1NF7A 3TCEA 2Q8LA 1F7BA 3LCWA 3LLFA 3NQCA 3DFTA 4O11A 4BWLC 4AHOA 3TV8A 1DQXA 3S5YA 3THAA 1AG1O 1PS9A 3TUUA 3IV3A 1XC4A 3U6WA 1I2NA 4HIBA 4GJ1A 3WJWA 3UY8A 1W5QA 1SR9A 3W73A 4LVDA 4MKNA 4RX0A 4TX9A 4CCCA 3TFCA 1FDYA 4UXDA 4IXXA 1DKWA 4DF1A 4IWWA 1R2TA 1W37A 3O1NA 1CX9A 3QMSA 4UTTA 4UTHA 3KVJA 3NVTA 3V1PA 3PUOA 4RCXA 1BWKA 4UTWA 2CLOA 1MXSA 1SZGA 3BG5A 5DY2A 4JY8A 3NPWA 1TJRA 3PG9A 3ZWSA 1G67A 1H60A 1LLWA 3FOKA 5T26A 2YW3A 4BFAA 4UFHA 2YDAA 3HPZA 1BTMA 3G1HA 4FX8A 1GEQA 2ATSA 4Y96A 3O16A 4R7JA 5D2TA 3KOFA 5CZJA 2CWNA 4YCPA 4Q4KA 3R2GA 4BI5A 3LV5A 4WY0F 3IVUA 4ZQNA 4PCFA 4YMZA 3W86A 1K7EA 5FI8A 1GYLA 1VJIA 3C2RA 2CLLA 3GIYA 2NX9A 4HKPA 3TC7A 3TR2A 4O13A 2NLIA 2DZXA 3G3DA 2Y7EA 2WSYA 5KINA 4RZ5A 2AQWA 3DKJA 2NX1A 1HFBA 2QJIA 3O6DA 1LRNA 2ZRWA 3SI9A 4WX2A 2I9EA 1G7UA 3T7VA 5FF4A 4FIRA 1TPC1 3ABSA 4O28A 1KM6A 1L2UA 2IQTA 1R47A 2A5HA 3RLVA 3FA5A 1RPXA 2GVLA 5AHEA 3SZ8A 3W71A 1OX6A 3GKAA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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