2JBMA

Qprtase structure from human
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
289
structure length
289
Chain Sequence
MDAEGLALLLPPVTLAALVDSWLREDCPGLNYAALVSGAGPSQAALWAKSPGVLAGQPFFDAIFTQLNCQVSWFLPEGSKLVPVARVAEVRGPAHCLLLGERVALNTLARCSGIASAAAAAVEAARGAGWTGHVAGTRKTTPGFRLVEKYGLLVGGAASHRYDLGGLVMVKDNHVVAAGGVEKAVRAARQAADFALKVEVECSSLQEAVQAAEAGADLVLLDNFKPEELHPTATVLKAQFPSVAVEASGGITLDNLPQFCGPHIDVISMGMLTQAAPALDFSLKLFAKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords NICOTINATE-NUCLEOTIDE PYROPHOSPHORYLASE
publication title Structural and Kinetic Characterization of Quinolinate Phosphoribosyltransferase (Hqprtase) from Homo Sapiens.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 289
sequence length 289
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2006-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2jbmA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2jbmA01
3HGJA 3VKJA 3UXAA 4O12A 1RPXA 1G4SA 3G8EA 2DU2A 3C6CA 1TYGA 1OABA 3EXRA 5LNSA 1LRNA 1JCMP 3G1FA 3IVTA 1YXCA 1D3GA 4TIMA 1ZHAA 4POCA 3E96A 3N2XA 1FXQA 3W70A 5AHNA 3MBFA 5HR6A 3MMTA 3NNTA 2QCEA 3ATYA 3STFA 1XXXA 4GUHA 2CLEA 4CNPA 3NQDA 3W76A 4WD0A 3BVJA 5HQEA 2R8WA 4JDBA 1SUXA 3FKKA 2VC6A 3G0SA 2J88A 1W3IA 3A22A 3ZS4A 3EWYA 4QIUA 4O1DA 3KRZA 4FHAA 1PS9A 1KV5A 1UB3A 3G3DA 4LV9A 3WK2A 3S5YA 4N02A 3TH6A 5CZSA 4CNOA 4I7VA 3P74A 5HR7A 3OA3A 4GUGA 4YCOA 3GXNA 5KZEA 1W31A 2CZ5A 1VLIA 4FX7A 2WNQA 1F05A 5FF3A 1IIGA 4ZZ9A 1MEWA 3TQ0A 3BV4A 2V2DA 4H4IA 3W85A 3ABQA 4PH6A 3KRSA 6ALDA 1H50A 3B05A 2A21A 1LYXA 4AWSA 3P5ZA 2ZZ3A 1AG1O 2CLKA 1XUZA 1O5XA 5FEWA 3TQVA 4C1KA 1XBZA 4HNVA 1ICQA 5G2IA 3B0PA 4ZQPA 1TPVA 3A9IA 4MZ1A 3IVSA 4Z1BA 5AYYA 3MWAA 4Q33A 4Y8FA 1EWDA 3ZFHA 3W75A 1IF2A 4MOZA 5AYZA 2WOQA 2X30A 3OVRA 3LM7A 2GVJA 2A7RA 3TAKA 2X16A 4MJZA 2DZXA 1NF0A 3PUOA 4N6EA 2ZFAA 1KFJA 3SSJA 3LTYA 1LRQA 4I7UA 1K8XA 4ALDA 1I2RA 3PBUA 1W5MA 4E2DA 4KKXA 4WY0F 3I7RA 4GUIA 1MXSA 5TQLA 4OT7A 4OU1A 3W71A 1Q6QA 1THFD 1TTIA 4DEFA 1SQ7A 5DXYA 3N14A 4PODA 5BMWA 1G7UA 3IIPA 3QPZA 3O1NA 5D02A 4RV8A 1M5WA 4RK8A 3GDTA 2FTPA 5I3GA 3NPVA 3R8RA 2CWNA 3HB9A 4EVZA 4DPPA 5HJLA 1QNVA 2J6XA 2YXGA 3UPWA 2ZRXA 2QJHA 4UNLA 4L4MA 2E6AA 3C52A 4LS0A 3L66A 1QOQA 3KRUA 3T40A 2Y61A 3NEVA 5D30A 3CLMA 1FWWA 1U83A 1SZEA 3NR0A 1JCLA 4A21A 5HWMA 4XTIA 4RR4A 1H7OA 3E0IA 4O52A 3TX9A 3BG9A 3QMRA 3NZRA 1OVDA 1W5OA 1RQBA 1W5NA 4ML9A 3SY5A 1JR1A 3ZWTA 1VZWA 1H63A 5KZDA 1WOAA 3L0GA 3NQVA 2OJPA 4BI7A 3TV8A 1VRDA 4GRSA 1FXPA 4H3DA 3PM6A 2EF9A 4FEZA 3FJLA 5K4XA 4E0CA 3R12A 1H7XA 5K2ZA 1GG0A 1WA3A 3AO0A 2QDGA 4QAIA 1XDLA 3LGEA 3FJ6A 4A2RA 3R2GA 3IGUA 5DXXA 1EPXA 4ZVJA 1YTDA 1TPWA 2P0OA 2ZRVA 2ZTKA 2CW6A 3PVFA 3CWOX 3S8HA 4CCCA 3EWZA 4JY8A 1IGSA 3BGJA 4EIVA 2I1OA 1EP1A 4M6PA 1KM1A 3NQ6A 3G3MA 5SWUA 4IMCA 2FQIA 1PCWA 2V8ZA 5D33A 1R30A 3MP4A 1GQNA 4LVGA 3OG3A 2O7QA 1TSIA 4MY9A 1GEQA 4QNWA 3O15A 2YDAA 2QF7A 2YR1A 3DENA 5TIMA 3VFLA 5D2XA 3QM3A 1ZALA 3C56A 3LHVA 1G4PA 1JUBA 1V5XA 4DXVA 3GX9A 3NVTA 4Z1DA 3W86A 1JCXA 1ZJIA 1W3NA 5I3FA 1J2WA 5E1QA 4PEKA 4XZ9A 3PBWA 4NJJA 1FCQA 2NX1A 3CIWA 3CU2A 2B7QA 4O0KA 1WAUA 4WOZA 1YDVA 3H54A 3M5YA 6TIMA 2EKCA 1M7OA 5FESA 2WPBA 3W1MA 3W7LA 2BLEA 2ALDA 2E6DA 1VCFA 3PSWA 4O0ZA 5HUOA 3TW6A 4M7TA 1L6WA 1EEPA 2CZDA 3EEGA 3M47A 3UQNA 2GQAA 3G24A 3PBVA 3TC6A 2V9DA 1K3UA 1PV8A 2FPVA 1VQTA 4X2RA 4NNCA 4K8EA 4X22A 3TMQA 3MP5A 2D73A 5FI8A 4DO5A 4EOUA 3EWWA 4MY1A 1SO6A 3RK8A 1SFLA 3TK7A 4KFPA 1OF8A 3NXFA 3EWBX 3W2LA 2J9YA 1IXNA 4UTTA 2ZRYA 1TV7A 2QJGA 4CLMA 3P8JA 3FFSA 1KFLA 1G4TA 3A21A 3HG2A 3H53A 3FA5A 3L68A 3MI6A 4JY9A 5C2XA 2W0UA 1X1ZA 4HKPA 4DF2A 2G97A 3O6YX 4UFLA 5CPNA 4HNTA 4Z1AA 4NQ1A 2VFIA 3W7HA 3A5FA 1TO3A 3FYPA 1FWSA 3U8GA 5CZ0A 5D04C 4HSNA 1YPIA 1T8XA 3G1SA 1R2TA 4CQAA 5K9CA 1FWRA 3PC0A 5CPLA 1DBTA 3OVQA 1ME9A 4RZ6A 3G1HA 3FKRA 2ZQ0A 1UUOA 1PVNA 1LDCA 4A29A 1H7PA 3ZR4A 5AN7A 5KITA 3TJLA 3QSRA 3UWVA 2OX1A 2YZRA 1XC4A 1VYPX 3IV3A 1ZAHA 1BWKA 4UUIA 1GOXA 1GT8A 1GVQA 2FB3A 4O50A 3CC1A 5BW6A 4O4VA 1EP2A 4MYXA 1TV5A 1SSDA 3NDOA 1B9BA 5F1VA 3P7YA 2DORA 1DORA 2LLEA 3GXTA 2JGQA 1C29A 2DZVA 2OT0A 1TTQA 5FF7A 1P0NA 5AHIA 3KXQA 1PCKA 3P67A 1F74A 4OV4A 1O60A 3QW4B 1DOSA 4FXSA 4NX0A 1JUEA 5AHMA 2FPTA 4HPJA 1DJNA 1L6YA 2VEMA 1LROA 3DH7A 3SR7A 1LRTA 4NJGA 4JTLA 1F6PA 1R46A 3PULA 3RFAA 4JTUA 4JTSA 1KV8A 3HPSA 5CGQA 1D3HA 1EWEA 4LVFA 2WJZA 3JRKA 2A5HA 1FX6A 3K30A 3QFEA 1XKYA 3WJSA 2ZA2A 4AEOA 2B7PA 2C13A 1VHCA 5D2WA 2WNZA 4XKYA 1RD5A 3W1PA 2NXGA 1LOLA 3NYZA 4K6AA 3W2MA 3LXBA 4NJIA 2V5LA 5D32A 3NQGA 2ZZ6A 1TJRA 3DI0A 3B0VC 3Q2DA 3NQEA 4IMGA 1AW1A 3W83A 4EWND 2YCEA 4RX0A 2E68A 2XN1A 3LBMA 4EF8A 1R2SA 3C0JA 3G1YA 2ZRZA 3RLUA 3NA8A 4GFSA 5A5WA 5LGZA 1JCNA 4Z08A 1FWNA 2JKEA 4DQWA 4N6FA 5LNUA 1YYAA 7TIMA 2H8ZA 4FIQA 3LHWA 3UXDA 4GUJA 4ICNA 4QQ3A 1H7RA 1TPEA 5BOOA 2HSAA 4BF9A 2KZHA 3TXZA 3W7QA 3E49A 4UMBA 1BEUA 2ISVA 1T99A 2QCMA 4CCDA 2A85A 1M7PA 4WX2A 3OIXA 4FF7A 2GJLA 3C8FA 5EMUA 3DFOA 3GDLA 4LRTA 4IMFA 3O07A 1AW5A 4LC8A 3IGSA 3P81A 3DBPA 4UTUA 2NV1A 3IEBA 4AH7A 3MHFA 3PWAA 1FCUA 3GK0A 4YMZA 4LVBA 1KFEA 3HMJG 1B4KA 2HTMA 4WUIA 3PB0A 3KVLA 4JDYA 3LHZA 4Z1CA 3UZ5A 3O06A 4AHOA 1SPQA 3QQ1A 4MFEA 2GOUA 2Z6JA 1S5TA 3QC3A 3STCA 1KLYA 2BX7A 3G18A 3KOFA 1TJPA 3NZ1A 3OHIA 5G4WA 3WK3A 1KBJA 1QWGA 2WNNA 3L2IA 1VHNA 1W1ZA 1H1YA 2TPSA 3NOEA 4K38A 3PY2A 1LOSA 1K7EA 2QCLA 2Z6IA 4JTEA 1ME7A 3EX4A 1CW2A 2E5CA 3PAJA 5HMSA 2CLFA 2C19A 2CLLA 1L9WA 1G69A 2ZZ4A 3CWNA 4UR7A 3T4CA 5CZTA 2NUXA 5C55A 4GNJA 3M5XA 3VI2A 2C0AA 3TMLA 1JVNA 5E0KA 3SJ3A 4XQ6A 3TJXA 3QRHA 2V2HA 3S9YA 4M5PA 4O11A 4XBKA 3DKJA 4QITA 3DFNA 3L9CA 1W5QA 2NX3A 2YFOA 5LZLA 3MP3A 3L67A 2C16A 3W9ZA 5G1YA 2V5BA 1EUNA 3C2FA 4O19A 3W2JA 2IQTA 3NQMA 3SIZA 4PFMA 3RMJA 1ZNNA 2I9EA 4RZ4A 1KFCA 2GJNA 4IOTA 1SO3A 3PUEA 3NPWA 4Y6GA 4FNTA 1ADOA 1SZFA 4JYEA 3C2EA 1SW7A 4AXKA 5C6MA 1NF7A 3P62A 4AWUA 3B0UX 4DF0A 4IXXA 1HL2A 4NU7A 3PS7A 2PURA 2A7NA 3L5LA 4M19A 1B4EA 3DFTA 4UXDA 1I2QA 3LCIA 5HNRA 4NJHA 3TCEA 1S5VA 4ZQNA 3M16A 4JTIA 4GE8A 2EGZA 2RDTA 4JX5A 3LTSA 3QYQA 3M43A 3G22A 1DVJA 1VCVA 1KM0A 1YTKA 3CQ0A 4N9DA 1G7VA 4TO8A 2CLMA 5L6UA 2H3BA 4KFNA 1QPNA 4HNUA 5LKYA 4A22A 2YFNA 1RV8A 3W7IA 1HO1A 2NUWA 1M6JA 1ZY9A 4OHQA 1VCGA 4GJ1A 1JULA 3BLFA 3NM1A 2C3ZA 1OX5A 2GVLA 1GPWA 3AJXA 3L5MA 1XDMA 2Y6ZA 1XFBA 2A1YA 1DJQA 4ORMA 1TTJA 3JR2A 5J5RA 3C4UA 1B57A 3W7JA 4X3ZA 2RDUA 1YLVA 1YDNA 5CPMA 1KW1A 5D2TA 4ADSA 3G1DA 4LY8A 5K3VA 5HULA 1LBLA 4NNBA 3CIXA 5J5DA 5LHEA 4UTWA 3QSTA 4D2JA 2CZEA 3MJYA 4UFMA 4WXYA 1UUMA 3DHFA 4PCFA 1OFEA 3N2MA 3TW7A 3GKAA 5K9XA 3G1AA 5AC7A 3GNNA 1W56A 4MZYA 1VJIA 5FF0A 1KM6A 5BRBA 1OFDA 2QCGA 2E6FA 4JGDA 5LNWA 1C8VA 4JTGA 4ZQOA 4OV9A 2Y7FA 1JQXA 5CSRA 3GR8A 2ZYFA 5U4NA 4JX6A 4UTKA 4O13A 3BG3A 4G1KA 1A53A 3HJZA 1Z41A 1K8YA 2NWRA 1QPQA 5F2MA 3LXCA 4PL2A 3FS2A 1AW2A 5FEZA 4GUFA 2GQ8A 5I3IA 2C15A 4CNNA 5DBUA 2QAPA 4AHPA 3NL5A 1FWTA 4CQ8A 3TR2A 2Y7DA 1O5KA 4FNRA 5I3JA 5KMYA 2H6RA 1TTPA 1W37A 2WO5A 3TC7A 1BTMA 2E6YA 3G0XA 3GZ3A 2J24A 3W72A 4HPXA 3A24A 1OX6A 1TRDA 1LM1A 2TYSA 5LNVA 1WDWA 5DY3A 3N73A 4TX9A 4YWIA 2FDSA 1LLWA 5ABTA 1TCDA 3H55A 5LNRA 4XUGA 1YTEA 1W0MA 1GVOA 1AMKA 5BNKA 3HOJA 4NZFA 5EA9A 3W74A 1ALDA 1P1XA 5F4SA 1SO5A 2QDHA 3YPIA 1OFOA 3S0CA 2WSRA 1SW3A 1NAL1 3TQKA 1GYNA 4ORIA 4RJEA 4NXKA 5DELA 4UCGA 5CKSA 4GXMA 5FF2A 2F84A 4M6QA 1SFJA 5F4XA 1ME8A 3LHYA 2VFEA 3UWZA 3BW2A 4Y90A 1Q6LA 3ABRA 1ML1A 3F1QA 2NLIA 2P10A 1BKSA 2TSYA 2ZA3A 3QQ0A 3HG5A 4JXCA 4S2BA 2TMDA 1XL9A 1KM4A 3BLIA 2PCQA 3CPRA 3INPA 1H7WA 3WJXA 1Z42A 4JICA 3LCFA 5F2GA 3W7MA 4KWWA 3GDMA 2RH9A 2ATSA 4YLWA 3BK0A 4QSHA 5FEPA 4TMCA 4XBSA 1A5SA 4W9TA 4AAJA 1JCJA 3NQ2A 3B8DA 2G5WA 2X1UA 4ZL1A 2QCCA 3TU9A 5DBTA 4C1LA 4O15A 3L0NA 2CZFA 4U28A 2ZBTA 4UFKA 2VFFA 2PRLA 4UTIA 4E2BA 4JN6A 5L9FA 1EX5A 5E93A 3W07A 3NM3A 1H7NA 3IIXA 3VE7A 5F2IA 3L0KA 4HN4A 3HQ1A 1SO4A 2AAMA 1QCWA 1OX4B 4N9CA 3F4NA 2Z1BA 1YXYA 1R2RA 1OFAA 3MW7A 1O94A 1FDYA 1VLWA 2J9XA 3TKFA 2Y85A 2VELA 2PC4A 3UPBA 5AC6A 5G1TA 3RF9A 3Q94A 2BXVA 3LX9A 2R14A 3T7VA 4GBUA 3TFCA 1F5ZA 3DAQA 1RVGA 2NXHA 1ZFJA 3THQA 3A5VA 2VFHA 4JTHA 1QAPA 1Z44A 2BTMA 5D2VA 2DZSA 4MYAA 2WV8A 3LLDA 3ZWSA 1VS1A 1U5JA 1WX0A 1QFEA 1XM3A 2QCDB 2Y70A 5I3KA 1L6SA 1RR2A 1UJPA 4LRSA 1TPH1 1F2JA 2CLOA 3NL6A 4IWWA 3TFXA 5IBXC 1GZGA 5H91A 3T78A 3IIVA 2E5DA 2A4AA 1PE1A 3M0ZA 2HS6A 1XUUA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2JBM A;  3EX3 A;  1H60 A;  3NL3 A;  3S6D A;  4I7W A;  4LVD A;  1MZH A;  2ISS A;  4BK9 A;  3ELF A;  3CEU A;  5AYX A;  1HFB A;  2RHG A;  4DF1 A;  1RQH A;  1A5A A;  4ADT A;  3GVG A;  1KTC A;  3WFA A;  1TPB 1;  4MLR A;  3W7G A;  3FIG A;  3MO7 A;  1VR6 A;  4L4L A;  4UTJ A;  3STE A;  3TRO A;  2P1F A;  3MYO A;  1WBH A;  4XKY B;  2Y88 A;  3IIZ A;  4TU1 A;  2VEK A;  2GVG A;  4S1F A;  4OGZ A;  2ATM A;  1SZG A;  3EX6 A;  2RKX A;  5D38 A;  2WSY A;  1PII A;  4P2V A;  1VH7 A;  1EB3 A;  3LLF A;  3EKZ A;  4YCP A;  3PF3 A;  5KZM A;  3PB2 A;  4N9E A;  3EXS A;  4WXZ A;  3W6Y A;  3B06 A;  2X1R A;  3T55 A;  1F73 A;  3KAO A;  4DO4 A;  5D09 A;  5F1U A;  4CQ9 A;  2ZDR A;  3CT7 A;  1OYC A;  2A6N A;  2C6Q A;  2DZU A;  3QMT A;  4BFA A;  1H5Y A;  2WKJ A;  3NPX A;  1T0O A;  1D9E A;  8TIM A;  1TPU A;  1I45 A;  1I8J A;  4BWL A;  4MPQ A;  3NPU A;  1JCY A;  3HIJ A;  3W1A A;  1QDS A;  4DBD A;  2VFG A;  4A2S A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3GTX A;  2XH2 A;  1OT1 A;  4WY0 F;  3N4A A;  2FHB A;  1Y8B A;  3WLQ A;  4ZO8 A;  1THF D;  1RY8 A;  3W27 A;  1TTI A;  1WKE A;  2O9T A;  1DJW A;  4LCR A;  3VGF A;  4NZ1 A;  1SQ7 A;  4DEF A;  1IEI A;  4WFA J;  3N29 A;  4G7E B;  4RV8 A;  2ZOX A;  2OYL A;  3GDT A;  3PJT A;  3NPV A;  3HB9 A;  1RPK A;  1QVB A;  2XSA A;  4DJD D;  1C9W A;  4L4M A;  2E6A A;  3C52 A;  3H4X A;  1E6Q M;  2XFR A;  3NEV A;  3SUV A;  1U83 A;  3U3H A;  4BF5 A;  3RDK A;  1YE4 A;  3CK5 A;  1WDP A;  5AVN A;  3VIG A;  4XTI A;  4RR4 A;  3GNO A;  3E0I A;  3MUA A;  2PP1 A;  3NZR A;  1W5O A;  1TML A;  1RQB A;  4Q4R A;  1P7T A;  1VZW A;  5KZD A;  4LEF A;  5H8P A;  4ZEN A;  3L0G A;  3TV8 A;  3SY1 A;  3ME3 A;  4XZL X;  4H3D A;  3PM6 A;  4FEZ A;  4JEJ A;  2YCL B;  4GH1 A;  3R79 A;  1UKS A;  1KQY A;  3CXC H;  1JDE A;  3IGU A;  1V51 A;  1EPX A;  2WMK A;  3BOX A;  7TAA A;  2CW6 A;  3PVF A;  2QS8 A;  2MAN A;  4JY8 A;  4TVD A;  3CCV H;  3W53 A;  4R27 A;  4M6P A;  1FHU A;  4RE3 A;  3ZZ1 A;  4LX4 A;  3NQ6 A;  2OOG A;  4IMC A;  4RW3 A;  1CB2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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