3C2EA

Crystal structure at 1.9a of the apo quinolinate phosphoribosyl transferase (bna6) from saccharomyces cerevisiae
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
294
structure length
267
Chain Sequence
PVYEHLLPVNGAWRQDVTNWLSEDVPSFDFGGYVVGSDLKEANLYCKQDGMLCGVPFAQEVFNQCELQVEWLFKEGSFLEPSKNDSGKIVVAKITGPAKNILLAERTALNILSRSSGIATASHKIISLARSTGYKGTIAGTRKTTPGLRRLEKYSMLVGGCDTHRYDLSSMVMLKDNHIWATGSITNAVKNARAVCGFAVKIEVECLSEDEATEAIEAGADVIMLDNHFLLECSGGLNLLCDDIDIYSTSSIHQGTPVIDFSLKLAH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comprehensive X-ray Structural Studies of the Quinolinate Phosphoribosyl Transferase (BNA6) from Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 84
structure length 267
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2008-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3c2eA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3c2eA01
1LRTA 3UWYA 2ISSA 3KRSA 2J9ZA 3FA5A 1YTEA 4LC6A 3C8FA 4JTKA 3NQMA 4OHQA 3SIZA 4JEQA 1JULA 1UASA 3BARA 3G1FA 3N73A 1OFDA 3TC7A 4IMEA 3VE9A 4UTWA 1MXSA 1YYAA 2O7SA 3LM7A 3W7GA 2VFHA 3MHUA 3SFKA 3DFNA 3ABQA 4PFMA 3O6YX 4TU1A 1LOQA 2F7FA 2AAMA 4NZFA 3TUUA 3MUXA 4NJGA 3E0IA 3G1DA 1KA9F 3LCIA 4Y90A 4Y96A 2HMCA 2EPHA 1VPXA 4LU0A 3GLCA 1F05A 4L4LA 1OJXA 5KZDA 3W9ZA 1RQBA 1ME9A 1ICPA 6TIMA 4DO6A 3TFXA 5AHIA 1ZY9A 2RDUA 4XKYB 3LGEA 1LBFA 3EX6A 1K03A 4JX4A 2WNNA 1G4EA 1QPNA 3L5MA 2HS8A 4NJJA 3MJYA 1JQVA 5D03A 1T0OA 4WX2A 5K7JA 1M7PA 2DZUA 3UNDA 3S1XA 1Y0EA 2WOQA 1F2JA 1LBMA 3PSVA 2BXVA 1XM3A 1GOXA 3LLDA 3IGXA 4MKNA 3C2RA 3FKRA 5FF3A 4A2SA 3NPUA 3NQ8A 3I7QA 1YDVA 4LTSA 3PY2A 3PB0A 3I68A 3W3OA 4N6FA 5K9XA 2Y7EA 3DHFA 4O19A 3YPIA 3ZR4A 2AGKA 4UTUA 1G6CA 4A3UA 2OZ0A 1TPB1 4MZ8A 3P62A 3EXTA 4YWIA 4DO4A 1OFEA 3W88A 3JRKA 2V8ZA 3HQ1A 4GJ1A 2JGQA 2X1RA 3CQ0A 3L68A 3IVUA 4UTKA 2EHHA 3W70A 1D9EA 4Y8FA 3BLFA 1V5XA 1O95A 1H51A 3LHYA 3M5XA 3G1XA 1T8XA 3TU9A 3N19B 4UFKA 3NQ6A 1ZHAA 2E6YA 3PBWA 5D04C 3LBCA 3EEGA 1WV2A 5AB3A 3BGJA 1GVRA 1FCBA 4JIQA 3LXCA 3KOFA 1LOSA 2HTMA 1LTDA 4QIUA 3W1QA 3QEZA 2Y7GA 4WD0A 3B8DA 4AWTA 5CZJA 1LM1A 4ONVA 2VKZG 1WOBA 1W31A 5GVJA 2ATSA 1H7NA 1A53A 5F1UA 5D02A 2XN1A 1K8XA 1TIMA 3VE7A 1LDCA 4KWWA 1T96A 1X6UA 1MO0A 3GNDA 3O6DA 3RMJA 1DBTA 1OX5A 1N8FA 4UFJA 3FOKA 4ZVJA 1SU5A 1ADOA 3W7OA 4UTTA 1QAPA 3GDMA 3VFLA 5IBXC 4L4MA 2NXHA 3O8AA 4JTTA 1DHPA 2VFEA 3O6CA 3FEMA 3MWAA 1W8SA 3E49A 3GDRA 1BWKA 3MI6A 1XKYA 4FX8A 4DEFA 4FO4A 3UZ5A 4EF9A 3NPVA 1W5MA 4O0ZA 5AYZA 1JUEA 4OE7A 4O54A 3LRLA 4NXKA 4JTEA 3QRHA 4P2VA 1OABA 1O5XA 1OF8A 3GDLA 4JTUA 4K7VA 3W7CA 2ZZ4A 1OYCA 2IQTA 3TJLA 4RJEA 5DY2A 3I65A 1FXQA 1OFBA 1NEYA 4JIPA 2EGZA 3B0VC 1W5OA 4O18A 3TW7A 4UFLA 3HIJA 4XWUA 3CC1A 2KZHA 4XKYA 2NV1A 3W7PA 1Q45A 1HUVA 4LUJA 2XN0A 4DPPA 1HTIA 1ML1A 2V82A 3GXTA 4FIRA 4IOTA 2NX1A 3VKJA 2YX0A 2JKEA 3EX4A 5G1TA 3S8HA 4WJEA 4UTLA 4Q4KA 1ICSA 4QQ3A 4MJMA 3W1XA 5CSRA 2QCGA 1GVOA 2D73A 5CZTA 1OHLA 2GJLA 3EX3A 3DKJA 2ATMA 4A21A 2C15A 1C8VA 4HSNA 1QCWA 3MP5A 1X7FA 1VCVA 1AL8A 4BI6A 4IX0A 2A0NA 3HG4A 1FDJA 4RV8A 1LLWA 1TYGA 2G96A 2OMAA 5K9CA 2TSYA 4O16A 2FQIA 2P10A 3P80A 4FNSA 1TO3A 5H2ZA 1HL2A 4ZQCA 5K3VA 2NXIA 2CLEA 1TCDA 4JDYA 4WQ6A 1TQJA 3EWYA 3HB9A 1GYNA 2QDGA 3RLVA 1TPUA 3M47A 1DOSA 1PCWA 3G0UA 4DF1A 4XBKA 4WOQA 3O16A 1QPQA 3QC3A 3M5YA 1ZCOA 1I2RA 3IVSA 4LV9A 2I1OA 3KXQA 3WJSA 4DO5A 4G1KA 4Q33A 1EEPA 1YTKA 4NQ1A 3I7RA 1IGSA 4MY9A 5I3HA 3PM6A 3I7SA 3UPBA 4O12A 3R5EA 4AAJA 3CT7A 2QCDB 1F74A 2E77A 3VI2A 1KM3A 4ZQMA 1KV5A 1OFQA 4N9CA 4O1CA 4TMBA 3LHTA 2ZZ2A 2NWRA 1RVGA 1AK5A 2YYUA 3IIVA 2Y85A 1G4PA 3O06A 1QO2A 1UUOA 4H6KA 4JR5A 1KFKA 3TAKA 1PL9A 3A5VA 3GXPA 4RZ4A 4EWND 3LTYA 2PRLA 2QKFA 3M16A 2G5WA 4IMGA 2QAFA 5KZMA 3DXIA 1IXNA 4JTLA 4N6EA 4Z08A 1F6PA 3P74A 3HGOA 3BVJA 3NOEA 2CZDA 3C2VA 5C6MA 5DLCA 1JCYA 3HGRA 1KM2A 2Y70A 1SO4A 3G18A 1H1YA 1NVMA 4UIOA 1UB3A 2FTPA 4UR8A 3FIGA 1PV8A 1GEQA 1DQWA 1SFLA 3S5ZA 3TC6A 3QW3A 4X9SA 2E6AA 3DFOA 4A29A 1G69A 2V5LA 3NZRA 1C29A 1S5TA 1UBSA 1JCLA 1LOLA 3C2FA 5F4WA 4K8HA 4WZHA 3W7RA 3H54A 3LHUA 5BMXA 1ICQA 3TFCA 5LNWA 1IF2A 2DZVA 1GG0A 5I3FA 3B0UX 3HPSA 4Z1CA 3UXDA 2E68A 4ADSA 3BW2A 5F2MA 3C56A 3TK7A 3NZ1A 1XFBA 3IV3A 4S2BA 2QDHA 3W2JA 2FPTA 3WFAA 7TIMA 3TMLA 1GZGA 3STFA 2FB3A 5DXXA 3UWZA 3BLEA 1PHQA 3T78A 1LCOA 4UFMA 2DJXA 2B7PA 3TSMA 3QMTA 1PS9A 3G1YA 4RX0A 3QM3A 3CWOX 5IBXA 5U7SA 3W1MA 5CPNA 1HG3A 4ADTA 3W1RA 1SZGA 1FXPA 1A5SA 3ZWSA 4PODA 1JVNA 4M6PA 2WSQA 3ATYA 4JXCA 4HHPA 4XQ6A 1YLVA 3E12A 1IIGA 5HINA 3P5YA 2ZDRA 4PC8A 3GKAA 5EY5A 2C3ZA 3WK3A 2C13A 4GXMA 2JBMA 2W6RA 3W1UA 1KM4A 5F2LA 1RQHA 3B06A 5E1QA 1XUZA 4XBSA 1X1OA 2HSAA 4HIBA 3N14A 1EIXA 3TXZA 4AXKA 3UD6A 3VNDA 3G1HA 4AHOA 2VFFA 2E6DA 5LNUA 2ZFAA 4PEKA 4JDBA 1JQXA 1WAUA 4LC8A 1RPXA 5D2VA 3PUEA 1OF6A 2DZTA 2VEIA 4FXSA 5FF4A 4O1DA 3S1WA 2ABAA 3C6CA 2GQ8A 3SW6A 3QQ0A 1LYXA 2DORA 4AF0A 1CI1A 4QITA 3OA3A 2E5DA 3BW3A 1D3GA 1SPQA 4ALDA 1X1ZA 2J9XA 2A85A 3BO9A 5D2TA 4UTHA 2C1HA 3N34A 5EBUA 4NNAA 1EP2A 3GAKA 4MJZA 3DU0A 2B7NA 3NQCA 3RFAA 1AW5A 1GVQA 4NZJA 1F76A 2WO5A 2X1SA 3W2UA 4M6VA 3DFSA 3QMRA 1ONRA 3F1QA 1FDYA 5CKSA 1ZENA 4OQVA 4K37A 3TCEA 1QFEA 2YZRA 3E96A 1TMHA 2Q3OA 2H6RA 4HPXA 4Q32A 4TIMA 1U5JA 4RK8A 2RKXA 3TW6A 3S1VA 4LUIA 3D0CA 4K36A 1TPFA 3KVKA 4FEZA 2NXGA 5A8GA 4OU1A 1F6KA 5FEPA 3DHDA 1R47A 1HO1A 1NF0A 3NPXA 2Z2UA 5G4WA 1LORA 2QUUA 1WYIA 1OG0A 3N9SA 4WY0F 1VGAA 2PC4A 5AC8A 1TPC1 2Y6ZA 2ZZ7A 4HPJA 2I9EA 1BTMA 4K7YA 4OBTA 2Z6JA 4H3DA 3PC0A 3GDTA 1G67A 1KM1A 2VENA 2DZXA 3TAOA 4N9BA 2QCMA 5D2WA 1F5ZA 2QJHA 3PBUA 3QPZA 3PR2A 1XC4A 3GAYA 5BOOA 1YADA 1O60A 2ZYFA 2ZRVA 2Z1BA 1JUKA 5LSMA 1OFRA 1KTNA 2FFCA 3FYPA 3L0KA 2X16A 4QISA 1G7UA 4O17A 1VHCA 1EUAA 3W76A 5CG7A 1XDMA 2YFOA 8TIMA 1TSIA 2DZSA 1QDSA 2E5BA 4FNPA 4O52A 2V2HA 1O4UA 1VZWA 1B57A 2BX7A 4HNUA 3FS2A 2C0AA 1UJPA 1TQXA 2YCEA 4IPJA 1EWEA 3HG5A 4NUWA 2ZRXA 4YL2A 3W86A 2NUXA 1W54A 3W84A 4CCDA 4N9DA 3SZ8A 4O8RA 5EPDA 4ZZ9A 3LCFA 2VFIA 5LKYA 4K38A 4GUGA 3HPZA 3KX6A 1FCQA 3MW7A 4UXDA 5DCBA 3LI1A 3TH6A 3ABSA 1NFBA 2O7QA 2GQ9A 3IIXA 3EKLA 3W83A 4ZQPA 3NQVA 2YPIA 4UCGA 3S5NA 3WJYA 2Q8ZA 5I3GA 4KFNA 2CLIA 3EKZA 3HGSA 4UFIA 1B3OA 1W5QA 4FNTA 1K7FA 1P1XA 4FF7A 1SO3A 1DV7A 3QJAA 3FYOA 2GVJA 4WY0B 3BK0A 3UWUA 5LHFA 2OJPA 2WSYA 3N9RA 2ZBTA 1PVNA 3NDOA 3S5OA 3LHWA 3CEPA 1JCJA 3I6RA 1OK6A 1H7RA 2TRSA 1I4NA 2E09A 3SGZA 3GZ3A 3TQVA 1YXDA 5G2HA 1AW1A 3GX9A 1F7BA 1EUNA 3USBA 2J9YA 2PURA 3JR2A 2P1FA 1TRIA 1WDWA 1DORA 1RD5A 4NX0A 4GC4A 4PH6A 1FQ0A 4R7JA 3NNTA 2Z6IA 2OT1A 3QSRA 2H90A 2WQPA 5DELA 3NVTA 3PAJA 5HR6A 2QJGA 2V0TA 1ZNNA 1YPIA 3ABOA 3W2MA 4I9AA 3ZFHA 5D09A 3NO5A 4XUGA 4MLRA 4FNUA 3PG8A 2P0OA 3O1NA 2Y7DA 3TXVA 4UMBA 2C14A 5AC7A 3U6WA 3CM4A 2V2DA 1BWLA 2ZRZA 4IWWA 3W22A 1VH7A 3NYZA 2TYSA 1RR2A 4OT7A 5F4XA 1ZAIA 1VLIA 2PE4A 1P5BA 1KFJA 1DJNA 1SR9A 1B9BA 3UQNA 1FX6A 3DGRA 1OFOA 4DBEA 1SW3A 1GJPA 1H62A 1YDNA 3C2EA 1KFCA 2NX9A 4QSHA 2ABBA 4RKAA 1LROA 3PWAA 4C1LA 4R53A 1XBYA 1EPXA 5TBOA 4DELA 4JTSA 3HF3A 3C4UA 2NZLA 3R89A 3BW4A 3W2KA 1TPEA 2QUTA 1KM0A 2CLOA 4ZQNA 1OYBA 2ZTJA 4LVBA 3O05A 1W56A 3M43A 1R2RA 2J27A 3DENA 2X30A 3NGJA 2JK2A 4P61A 1AG1O 2E1DA 1GTEA 5AYXA 1L6SA 5LNSA 1FBAA 1GT8A 4UTJA 1VC4A 3MI2A 1HO4A 2QCEA 2CW6A 4HNNA 4AMAA 2WJZA 4O11A 2CLHA 3S1UA 4DBDA 2A4AA 1ZALA 5HQEA 1KW1A 1VJIA 1TJPA 4BK9A 1I2NA 3OVRA 3LI0A 5AOUA 4FB7A 1VLWA 3PG9A 5BRBA 1BKSA 1CX9A 4IJBA 4J9JA 3KAOA 3SR7A 1KM5A 3GYEA 1FWRA 1FUYA 1TPDA 1HFBA 3LDVA 3NM3A 3P82A 2JKPA 1J4EA 4LWWA 3W85A 3U2OA 5CZ0A 4CCCA 1TB3A 2Y63A 1WXJA 4NU7A 2A7RA 1B4KA 3DH7A 5HWJA 1YXCA 1ZAHA 3CB8A 3P81A 3NQEA 4WY0A 1DQXA 3G8RA 3WK0A 5FESA 3G3MA 4C1KA 4XTDA 1I2QA 3KHJA 5AYYA 4Z0SA 4N4QA 1GQNA 4O10A 5CGQA 1F73A 1XBVA 3G0XA 3NR0A 2XN2A 4NXSA 3B05A 3NXFA 2ZA3A 2V81A 3M41A 4IXHA 4MYAA 1DL3A 3W23A 5BNKA 3IRDA 4GWEA 4O15A 4BWLC 2DZWA 2WPBA 1P0NA 2YYTA 3GR8A 5KTLA 4MZYA 4GRSA 3DI1A 3P5ZA 2NV2A 2A2IA 5HWMA 4MY1A 2ZRWA 2A21A 3B4UA 4EF8A 3F4WA 1H61A 4JY8A 1FCUA 4ML9A 3LLFA 3QH2A 5FI8A 5LGXA 1LLZA 3UWWA 3CIWA 1XDLA 1QNVA 4MZ1A 4WOZA 3PF3A 4CNOA 4PA8A 2R94A 1SO6A 3DZ1A 4LW7A 4FHAA 3GXNA 1K7EA 4LT9A 4N9EA 4K8EA 3LRKA 3MBDA 4FX6M 2OT0A 1TTIA 3E9AA 2A6LA 3N3MA 3M6YA 1H7OA 1A50A 4CNPA 2GUUA 3LB0A 4JTIA 3GVGA 3INPA 5F2GA 4AF0B 1TPWA 3UY8A 3OEXA 4LVDA 1CW2A 4DF2A 5D2XA 1JRCA 3W7KA 4Y9AA 3W1LA 3N2MA 4O53A 3UZJA 4PL1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3G1V A;  3UYC A;  1OFP A;  3Q94 A;  2NLI A;  1VYP X;  4LRT A;  3EB2 A;  1M5W A;  3TNO A;  2GVL A;  3SY5 A;  1LRQ A;  4RLI A;  3FLU A;  3MBF A;  1ALD A;  4U28 A;  5FF2 A;  3MHF A;  4O57 A;  3BG5 A;  4WXZ A;  3HO8 A;  5D33 A;  2FLI A;  4BF9 A;  4OWG A;  5FF0 A;  5G5I A;  2Y88 A;  2RH9 A;  3THA A;  1LP6 A;  5HUP A;  4UMC A;  4ZQO A;  4OV9 A;  4IQL A;  1PE1 A;  1QPO A;  2E6F A;  3M1Z A;  3THQ A;  4HNV A;  5L9F A;  5LGZ A;  4LS2 A;  4O1B A;  2NX3 A;  3LCL A;  2FPV A;  5ABT A;  5EMU A;  3LCH A;  4JNM A;  2QF7 A;  1KM6 A;  2CZE A;  3PUL A;  3TSB A;  3VCR A;  1Z44 A;  3EWB X;  3M5Z A;  1L9W A;  3PUO A;  1XI3 A;  5SWU A;  3L67 A;  1YPF A;  1FDZ A;  4KKX A;  4WUI A;  3LXB A;  3TV8 A;  2QCH A;  1W3N A;  3MI3 A;  3DFT A;  4JD4 A;  4TR9 A;  2Y62 A;  1EB3 A;  1VRD A;  3LCX A;  3IVT A;  2VFD A;  3B04 A;  4MOZ A;  1GTH A;  3LX9 A;  1H7X A;  4X22 A;  4Z0J A;  5TIM A;  3E02 A;  1OX4 A;  1H1Z A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3N2O A;  3GQY A;  4MZ8 A;  1QI4 A;  3OBA A;  2PS2 A;  2ZJQ J;  3H22 A;  1OFE A;  4BEQ A;  3MO4 A;  2V8Z A;  3HQ1 A;  4MB5 A;  2CZV A;  2YIH A;  1V5X A;  3CME H;  3MKC A;  4CEX C;  1UZD A;  3NQ6 A;  1ZHA A;  1O12 A;  3VIH A;  1R3T A;  4RE3 A;  4E3T A;  4AEE A;  4JII X;  4Y9O A;  3VNI A;  4CGT A;  4AC1 X;  2HTM A;  3T2P A;  4D6H A;  3QEZ A;  4IG2 A;  4PMY A;  2Y7G A;  1XLI A;  1V6Y A;  4EAF A;  3CHD A;  2YA2 A;  4IPN B;  2VKZ G;  1WOB A;  4F2B A;  1W31 A;  1RLD A;  1UUQ A;  1RBO B;  1A53 A;  2PDC A;  5AZ0 A;  2HV5 A;  5H1S O;  1TIM A;  1X6U A;  3AXH A;  3ZJK A;  3GY1 A;  2PUZ A;  3GND A;  1UWT A;  3QR3 A;  2WVU A;  1DBT A;  1QXL A;  4UFJ A;  1N8F A;  5C71 A;  5CBJ A;  3FOK A;  1SU5 A;  3W7O A;  4UTT A;  2PDN A;  4G56 A;  3GDM A;  2R1K A;  2NXH A;  3VM5 A;  4JTT A;  3UJS A;  3VIL A;  1DHP A;  1RJR A;  2VFE A;  4LF2 A;  2PC8 A;  3L4V A;  3SDO A;  3CGT A;  3MI6 A;  2ZVR A;  1XKY A;  1G0C A;  3B40 A;  4W7U A;  1JUE A;  4HCH A;  1XIF A;  4F9D A;  2ZZ4 A;  1OFB A;  2PFH A;  4YTR A;  3B0V C;  3UCD A; 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 4LAM A;  4TR9 A;  1EB3 A;  4FXJ A;  1VRD A;  5FOO A;  3IVT A;  2EPM X;  1ZQ5 A;  4MOZ A;  3GG8 A;  1GTH A;  2VC7 A;  2EXO A;  3TNB A;  2ZX9 A;  1H7X A;  2ZJR J;  3C0L A;  3QV8 A;  3BZG A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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