3C2EA

Crystal structure at 1.9a of the apo quinolinate phosphoribosyl transferase (bna6) from saccharomyces cerevisiae
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
294
structure length
267
Chain Sequence
PVYEHLLPVNGAWRQDVTNWLSEDVPSFDFGGYVVGSDLKEANLYCKQDGMLCGVPFAQEVFNQCELQVEWLFKEGSFLEPSKNDSGKIVVAKITGPAKNILLAERTALNILSRSSGIATASHKIISLARSTGYKGTIAGTRKTTPGLRRLEKYSMLVGGCDTHRYDLSSMVMLKDNHIWATGSITNAVKNARAVCGFAVKIEVECLSEDEATEAIEAGADVIMLDNHFLLECSGGLNLLCDDIDIYSTSSIHQGTPVIDFSLKLAH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comprehensive X-ray Structural Studies of the Quinolinate Phosphoribosyl Transferase (BNA6) from Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 84
structure length 267
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2008-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3c2eA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3c2eA01
3OVRA 4HNUA 1JCNA 4TU1A 4K38A 3HGSA 3W2LA 1FUYA 3M41A 2J24A 4K37A 2ZRVA 3SW6A 4NZFA 4O1DA 1RQBA 1XBYA 1X8FA 4NJHA 1TRDA 5G2HA 4GUFA 1S3HA 2XFWA 1D3GA 4JTIA 5DLCA 3A21A 1K7XA 2QF7A 5D32A 4EOUA 3B4UA 3LLDA 4JIPA 4O16A 5BMWA 5HINA 2ZFAA 1DORA 4UFKA 1TTIA 1VYSX 1YPIA 3GNNA 2B0MA 4WY0A 5CPOA 1QPNA 3LHYA 1B4KA 2H3BA 4FIRA 5CZTA 1R2TA 1FCBA 2YW4A 4YCOA 2A6NA 3LBCA 5I3IA 4MKNA 1R30A 4FO4A 4L4MA 3TSDA 2Q8ZA 3GVGA 2CW6A 3KVLA 1OG0A 4LRSA 2CZFA 3CC1A 1SU5A 4JYFA 4U28A 3T40A 3N9RA 4XKYB 1H7WA 2YZRA 3A9IA 3QMRA 4BI5A 1F7BA 2GQAA 5G1TA 3LRLA 1TTQA 4I9AA 1KFBA 4ICNA 4UFIA 1ZCOA 4UFJA 1EIXA 3PBVA 3KVKA 4XBKA 2H8XA 1KLYA 3CLMA 4TO8A 3GDLA 2RDWA 4QSHA 2ALDA 4WD0A 1I45A 1LDCA 4NUWA 4UCGA 3C61A 4HSNA 3L0GA 2P0OA 3IVTA 3RMJA 1MZHA 4LC6A 4N9EA 2DJXA 2ABBA 3WK2A 3PUOA 1X1ZA 4NX5A 5F2MA 1ALDA 1EWDA 1HTIA 4RK8A 1F74A 3OIXA 1UASA 3W75A 1OFPA 3GNDA 4KWVA 3NQGA 1TIMA 3QPZA 2EPHA 3UWQA 4LW7A 2O7QA 1UBSA 4UR8A 4AEOA 4Z08A 1Q3NA 1ZY9A 4O17A 4HKPA 3UNDA 2WNQA 4BI7A 1FWSA 1CI1A 1OF8A 4JD4A 4DF2A 3TROA 3C2OA 4MY8A 3NL3A 2C0AA 1XDLA 4LWWA 4POCA 1GVSA 1FWWA 3BGGA 1JULA 4ZQRA 4DF1A 4M6QA 1SR9A 3MUXA 5H2ZA 3S5ZA 2IQTA 1CX9A 3W84A 4YXGA 3JS3A 1G67A 4WY0B 3KVJA 1QR7A 1G69A 2C15A 2G95A 5FI8A 2NV1A 4E38A 1BTMA 2RFGA 4KFNA 4IXHA 4E0CA 4WX2A 2YPIA 4NT0A 3MI3A 3GDTA 2TRSA 4WOZA 2GVJA 3O07A 2X1SA 2WNNA 1KTNA 1EX5A 3NQ6A 3I65A 4FX6M 5AHFA 4FIQA 1TQJA 1X7FA 3G22A 1AK5A 1W8SA 3TQ0A 3W07A 1TPUA 4MLJA 3W86A 4IJBA 4B5NA 5E1QA 1ZHAA 5D09A 1VHNA 2CLHA 3IIVA 4ZQCA 1W5MA 1TJPA 3M16A 3NZ1A 3RF9A 3GKFA 3W71A 4NZJA 3LOTA 1EB3A 3TX9A 2NXHA 3QQ0A 1MEIA 1UUMA 3M43A 3A23A 3OA3A 1K8XA 2NXGA 3INPA 3WK3A 2Q3RA 5AC8A 3KRSA 4CNNA 1H7RA 1SQ7A 2PRMA 2DZTA 1JQXA 3QZEA 3W7HA 4FB7A 1LM1A 2DJLA 3O15A 3EKLA 1J2WA 3H53A 1HG3A 3NZRA 3GB6A 3W1QA 3HGRA 3W1RA 3BPWA 1G6CA 4K7VA 3EX1A 4UFHA 5FF3A 4QNEA 3UPBA 1HL2A 3TQVA 1DBTA 4MIMA 5DXXA 1C29A 1SSDA 1K8YA 4IX0A 4JGDA 4MPQA 3TCEA 1DOSA 4XZ9A 1ME7A 4KKXA 1WQ5A 1CW2A 2HSAA 3E9AA 5G4EA 3W1AA 4FNQA 3S6DA 2NWRA 3V1PA 3TK7A 2DZSA 2DZXA 5AHNA 1PCWA 3TE9A 1P4CA 4M7TA 1P0KA 2GJLA 1LRTA 1I2NA 5FF7A 4Z1BA 1I4NA 1LRNA 1PHQA 1EP3A 3W7KA 5K9CA 2QDGA 1A5CA 3KOFA 4NXSA 3IIPA 4MZYA 3G24A 3S1XA 4BR1A 1QAPA 4RLIA 1OJXA 1LOLA 2YFOA 2OJPA 2VFIA 2GQ8A 2V0TA 3HG5A 3JRKA 2WSQA 5FESA 3GX9A 4JTUA 4FEZA 1C9DA 4UTUA 1WAUA 3O8AA 3W7GA 2ZTJA 4HSOA 1DHPA 1SZFA 3LHUA 4MFDA 1DV7A 3FEMA 4UXDA 1OX6A 1F05A 4AH7A 2V2CA 3M5VA 5GVJA 2QJGA 3TKFA 3U8GA 1KM4A 3NPWA 1K02A 2NX3A 2R8WA 5DCBA 4N02A 1YPFA 3L68A 5CGQA 4JXCA 1VH7A 3CTLA 2FPYA 4O0ZA 1OVDA 4Z1AA 1JVNA 4DPPA 3CM4A 1R2SA 1R46A 3MYOA 5FEXA 5H91A 1TYGA 5BW6A 2E5CA 4PODA 3GDKA 1R47A 4W9TA 3LRMA 4RKAA 4N9DA 4ZL1A 3VFLA 3NQVA 4IQLA 2UV8G 5HR6A 3W7CA 2H90A 1EPXA 3DBPA 3O6CA 4UNLA 2QEZA 2F7FA 3LV6A 3NYZA 2NX1A 3HG2A 5AHEA 4PH6A 3A22A 4H3DA 3WFAA 3W7PA 2CLMA 5K9DA 4DEFA 4ALDA 3VI2A 1XBXA 3BW2A 4Y96A 4MJZA 2VC6A 2RKXA 3JR2A 2FFCA 3B06A 3BLIA 3TH6A 4M6VA 1ZAIA 3R89A 5AFDA 3NQDA 4MYAA 1YTKA 1SPQA 3LERA 5I3GA 4O10A 4P2VA 1XC4A 4O57A 3LCWA 4QIUA 3WJXA 3IV3A 2WNZA 3H54A 3N73A 3P7YA 4NX0A 3M0ZA 1G4PA 1Q6LA 1DKWA 1Q6QA 3PC0A 5IBXC 4U4MA 4XTIA 4DO4A 3DHDA 5U7SA 1VPXA 5AYZA 3W7DA 1ONRA 5KTLA 1M5WA 2PRLA 1I2OA 2ZZ3A 5F4SA 4CQ9A 4JTLA 3K30A 2KZHA 3S42A 5F1VA 4DO6A 2NLIA 3W7IA 4Q32A 1SFLA 3W23A 4AWSA 1J4EA 5D37A 4LC8A 3O6YX 1JRCA 3MP5A 1F5ZA 3GK0A 5LGZA 1JRBA 4QISA 1YXDA 2Y63A 2A7PA 1NAL1 2YFNA 3C3NA 4LS1A 1VYPX 4JTEA 1OABA 3W7QA 1LORA 4Y9AA 1EP1A 3RNDA 3TAOA 2E6DA 1UCWA 3MHFA 3EWZA 3PB0A 1O4UA 2Y89A 3W9ZA 3HG3A 5LNRA 3P60A 2CWNA 1ICSA 4R53A 4HNNA 1VGAA 4OHQA 1LOQA 1PVNA 3HOJA 3LXBA 1RVGA 3TV8A 3M47A 1VS1A 1TPC1 5IBXA 3N34A 3SI9A 3Q2DA 2VFDA 3R12A 2WSRA 4JY9A 1W0MA 1OX4A 4TX9A 4ZQNA 2I1OA 1A50A 4ZQMA 1GPWA 4RXFA 4ZZ9A 3EXTA 4O1CA 4K7YA 1VQTA 3HO8A 5D05A 3CU2A 3NQ2A 3STCA 1YDNA 3C8FA 2EKCA 2B7QA 2NXIA 2Y88A 2CLOA 4JN6A 4Q4KA 3UWVA 5A8GA 1B3OA 1T0OA 1TPDA 2YYUA 1YTEA 3NPUA 5HWJA 2P10A 1Q6RA 1H7XA 1AMKA 1RR2A 2A21A 4PC8A 1KLZA 4IUOA 3KX6A 1DL3A 5D38A 1WV2A 1KV8A 2PRHA 2V81A 3LCFA 5FEPA 3N3MA 3S1WA 3TA6A 5MHBA 3PAJA 3QW3A 2JKEA 3THAA 5LNSA 1O60A 3BK0A 5LNUA 3DFPA 3TC6A 2Y62A 3I7RA 1KFKA 1TPEA 4GUGA 5U4NA 4AHQA 1RQHA 3QMSA 2EGZA 3HPXA 3SIZA 4FXRA 4PCFA 4O12A 1H1YA 1GVOA 1OFAA 3E12A 3QPYA 2G97A 3SECA 4G1KA 1QOQA 1ML1A 3VCRA 1Z42A 1PCKA 3SR7A 5K4ZA 2QAFA 2YGYA 3QSRA 3LTYA 3UWYA 3DAQA 3EX3A 5EMUA 4JYEA 3GXTA 3QQ1A 2ZZ5A 1XCFA 2C18A 1X6UA 2I9EA 2TMDA 3W76A 1D9EA 2ZDRA 2ISWA 4N4QA 1EEPA 3QM3A 4C1LA 3LLFA 5CKSA 4BFAA 3ZWSA 3UQNA 3D0CA 1N8FA 5LHFA 2PCQA 1TPH1 2Y61A 3LCIA 3EWBX 2D73A 1G7UA 4MY1A 3BG5A 1JCYA 1SO3A 4JNMA 4LUJA 5G2IA 4IWWA 4H6KA 2R94A 3KHJA 3NGJA 3TW7A 1M7OA 1OX4B 3C2EA 2JGQA 4LS0A 3ABSA 3BARA 4AHPA 8TIMA 4UTKA 1ME8A 1ZAJA 1KBJA 4D2JA 3I6RA 5CSRA 1EWEA 3LCGA 1SO4A 5D04C 2E6YA 2JGYA 1ZJIA 3TQKA 1J5TA 1EP2A 4K39A 3SFKA 2VKZG 3P84A 3CWNA 4M5PA 5LNVA 2EAWA 3LCLA 4O50A 4DF0A 1Q6OA 4DBDA 4AAJA 4JTTA 2A85A 3RU6A 1F6KA 2HS8A 2QUVA 5I3FA 2W0UA 2X30A 1LBMA 4WOQA 5C54A 1ICPA 2EHHA 3TIMA 1SFJA 4M19A 3W2NA 3GZ3A 1LLZA 3R5EA 1V7YA 3O1NA 5E0KA 1GEQA 1TRIA 1ZENA 3EKZA 1KTBA 1LYXA 3BG9A 4UFLA 1A5SA 1OFQA 5D33A 1MXSA 1H63A 4LVDA 3LB0A 2BWGA 1ICQA 5CZJA 2ZTKA 4FNSA 3EWYA 2E5BA 1XBVA 3MBFA 3TXZA 2YX0A 3VE7A 1TPB1 1JCLA 5D2VA 4UUIA 3F4NA 1KFLA 1MO0A 4MY9A 3GYEA 1L6SA 1NF7A 1OHLA 1VLIA 3THQA 3P8JA 1QMLA 4S2BA 5CZSA 3NG3A 3MJYA 5BRBA 4JX5A 4PFMA 2GPTA 2QCHA 1GG0A 3EWWA 2QCNA 3BG3A 4X9SA 3W6YA 3ZS4A 1I2QA 4IMCA 2CLLA 1S5VA 4EIVA 1P1XA 4I7VA 3CHVA 4AB4A 4O0KA 1TMHA 1FCQA 1OYBA 1OYAA 2A6LA 3FJLA 3PG8A 4O4VA 1H5YA 1X1OA 3CPRA 3NM3A 3NA8A 4TR9A 3BLFA 3P5YA 3A5FA 2QUUA 5EL1A 3P8IA 1OYCA 1XM3A 3WK0A 4Z1CA 3W7LA 1H60A 3G18A 4XUGA 2PURA 3W83A 2HS6A 3NQ8A 1JCMP 1ZAHA 5TBOA 2P1FA 3M9YA 1H7NA 2G5WA 2V2HA 3IIOA 2JKPA 3EEGA 3PM6A 1W31A 5CG7A 3PR2A 5C55A 3AJXA 5F2GA 1FBAA 4AVFA 5HWNA 3E02A 2ZZ7A 4O4WA 4FX8A 2EF9A 2C19A 3LI1A 4CCDA 1A53A 5KZEA 2V8ZA 3C4UA 2BSLA 1KFEA 2E68A 2ZA1A 1TTPA 2PC4A 3UYCA 4LVGA 1B57A 2V82A 4CCEA 5DBTA 3KRZA 3ABOA 5LKYA 1S5WA 1TSIA 2QCMA 3G8EA 1G4SA 4AXKA 3EXRA 3EB2A 5ABTA 1OFOA 1OFEA 4GJ1A 4O15A 3ATZA 1SW7A 2FPVA 3CB8A 3QRHA 1YTDA 4JX4A 5K7JA 4JICA 3F4WA 2J9ZA 4OV4A 3W1LA 4S2CA 3LRKA 4ADTA 5KITA 3ABQA 5G4WA 4O18A 4BI6A 3BLEA 5EPDA 1HFBA 4RJEA 1YDVA 2JBMA 3E96A 1FCUA 4ZQPA 1RZMA 3DI0A 2AGKA 5AC6A 4LTSA 2ZZ2A 3TSBA 5CPNA 3NQAA 3B0VC 3TMLA 4UMAA 5BNKA 5T26A 3PSVA 1F2JA 2Y70A 4FF7A 5AYYA 3PULA 2Z1BA 4O19A 3HG4A 2DP3A 4OBTA 5BOOA 2W79A 3LHWA 2ZA3A 4TIMA 3W3OA 3PB2A 4Y90A 2OX1A 3RLVA 4JYDA 4AHOA 1GG1A 1K3UA 1FXPA 3W2KA 1MEHA 2C6QA 2VFFA 4AWTA 3IGUA 5AOUA 2CZDA 3N2MA 3T78A 5DY2A 3W73A 4NNBA 2C14A 3TSMA 3OG3A 4CNOA 4O53A 2CFFA 3P80A 4HN4A 3HMJG 4UR7A 5EKYA 5G2WA 3W1NA 1LZOA 1TPFA 2VEMA 3TC7A 2NUWA 1DJQA 3UPWA 1MSSA 4LU0A 3L65A 3RLUA 4MYXA 1T96A 2VELA 1XFBA 4R34A 1W37A 2GUUA 1YADA 1G4TA 2C16A 2E5DA 3FFSA 1WBHA 4N9BA 3KAOA 3PF3A 4CQAA 2H8ZA 2NWSA 1VC4A 3G3DA 4Q33A 3W7MA 3WJYA 3WJZA 1O5KA 2ZZ1A 5K3VA 5E93A 2AAMA 3S5YA 3QC3A 4N9CA 2VXNA 4GUIA 2GVLA 3MBDA 1FDYA 1EA0A 2QAPA 4K6AA 4EWND 1UB3A 3Q58A 1V5XA 4UIOA 5J5DA 3UXAA 1GTEA 2DZPA 3GIYA 5D2YA 3TR2A 4C1KA 3R2GA 4DXVA 5HNRA 4RX0A 1F76A 2V2DA 3B04A 2ZYFA 2TYSA 3QYQA 4TMBA 6ALDA 2CZEA 1HO4A 1GOXA 3C2FA 2ZCGA 5HR7A 5TIMA 3CIWA 3NNTA 4QNWA 1O95A 4GWEA 3MMTA 3UWUA 1ADOA 2X1RA 4TMCA 3OBKA 3BVJA 4BWLC 1VRDA 4O13A 3C0JA 4ORMA 1FDJA 3QEZA 4WZHA 2QCDA 2VFGA 4H4IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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