3C2OA

Crystal structure of the quinolinate phosphoribosyl transferase (bna6) from sachharomyces cerevisiae complexed with quinolinate
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
293
structure length
265
Chain Sequence
PVYEHLLPVNGAWRQDVTNWLSEDVPSFDFGGYVVGSDLKEANLYCKQDGMLCGVPFAQEVFNQCELQVEWLFKEGSFLEPSKNDSGKIVVAKITGPAKNILLAERTALNILSRSSGIATASHKIISLARSTGYKGTIAGTRKTTPGLRRLEKYSMLVGGCDTHRYDLSSMVMLKDNHIWATGSITNAVKNARAVCGFAVKIEVECLSEDEATEAIEAGADVIMLDNHFLLECSGGLNLCDDIDIYSTSSIHQGTPVIDFSLKLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comprehensive X-ray Structural Studies of the Quinolinate Phosphoribosyl Transferase (BNA6) from Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 88
structure length 265
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2008-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3c2oA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3c2oA01
1I2PA 1ZAJA 4NNAA 2CLEA 2VFHA 5DCBA 4HNUA 4FIQA 1VPXA 4M7SA 4IX2A 3EX6A 1MEWA 5AB3A 3STEA 1XCFA 1CW2A 4GE8A 3KRZA 3NO5A 1PS9A 3B0UX 3S5YA 2WPBA 1X6UA 3VI2A 1IXNA 2G95A 5FEXA 3C61A 1UJPA 1K8ZA 5L6UA 1G4SA 1PVNA 5DELA 5F2LA 4WY0B 2QCDA 4BF9A 4NZJA 1H1YA 2FDSA 2WQPA 1P0NA 1XL9A 1XI3A 4FO4A 1EUNA 2Q3RA 4G1KA 1QPOA 3STFA 5AHMA 4AHQA 3L21A 4JX4A 3GLCA 2FB2A 4ZZ9A 5DBTA 1VS1A 3GXNA 5GVJA 3S0CA 4RCXA 3U6WA 2PRMA 1WDWA 1SSGA 4AHPA 4N02A 2IQTA 1GT8A 5C2XA 5LZLA 5E93A 1HUVA 1D3HA 3L0NA 2QCDB 3LV5A 3PG8A 2BTMA 3W88A 2X1RA 2VKZG 1ZAIA 3N9RA 3QYQA 2QUTA 1GPWA 1IXOA 3R12A 2XN0A 4EWND 3QPYA 3KAOA 4O53A 5HMSA 4TMBA 1FCQA 1A53A 2BWGA 2EF9A 1KFCA 3C0JA 3T7VA 4RXGA 3NQVA 2VOMA 3S5ZA 4QJ1A 4K8HA 1LP6A 1HO1A 3TFXA 4NVTA 5F2IA 4WOQA 4LW7A 2WSYA 3TQ0A 3NL6A 3ZFHA 1F05A 1E51A 2NV1A 2CLLA 3TV8A 4JXCA 1W54A 4RX0A 4ORIA 4M7TA 1F6KA 4C1KA 1W1ZA 4M19A 4UTWC 2NWSA 4CCDA 1OVDA 3TR2A 3UWVA 4KWWA 1SR9A 1JCNA 3SW6A 2ZA1A 2VEMA 4DEFA 1GVFA 1SZGA 3C2VA 5CPOA 4Y96A 1XDMA 2Y85A 3LV6A 4Y9AA 1K3UA 4NZFA 1W5QA 4FX6M 4N4QA 1W5MA 3O8AA 4UTHA 2UV8G 5IM51 1QAPA 3DZ1A 3TIMA 1FWSA 3L66A 3IGSA 4O0KA 1K8XA 1H50A 3MW7A 4OE7A 1W5PA 2DZXA 3HPXA 3PSWA 3EB2A 4UTMA 1O60A 3R89A 3FLUA 4RJEA 4HSOA 3W7NA 4DF2A 4JDYA 4LS1A 3QMRA 2C6QA 5D2TA 4AXKA 2ZFAA 3LHUA 3WJYA 4FNRA 1OK4A 3LRKA 1F7BA 1J5TA 1XXXA 2JKPA 2QUVA 4UC5A 1QNVA 1JULA 3Q2DA 3V1PA 3LLDA 3QC3A 4UFKA 1WBHA 1YXCA 3GIYA 2VC6A 3CM4A 4XQ6A 1K03A 1TSIA 3MYPA 4R53A 1S5WA 1YDOA 4MZ8A 3G8RA 1AW1A 3EWXA 4DF1A 1EX5A 1C29A 4J9JA 2I14A 5KMYA 2C14A 2A85A 1M7OA 3FJLA 1ZENA 2DZPA 2ATSA 1F5ZA 4QQ3A 3W84A 1J2WA 3B04A 1GVSA 4JYFA 3PBWA 3RK8A 1XUUA 3UQNA 2A7PA 1YTEA 4C1LA 4TU1A 3A24A 1BEUA 3EKLA 2CLHA 5HUOA 5F4WA 1GVRA 5F2GA 4JYEA 3RNDA 1L6SA 4PEKA 1WXJA 5AHLA 5LNRA 3LXBA 1ICSA 1H7NA 5T26A 3UY7A 2ZDRA 2C16A 1S5TA 3PVFA 3PR2A 3QZEA 1K02A 5K9DA 1H7RA 4O8RA 1GVQA 2FQIA 4AWUA 4E0CA 2BLEA 5D02A 3OEXA 3BK0A 3P8IA 1AW5A 3LXCA 1TPUA 4A29A 3RU6A 2OZ0A 2WSQA 1Y0EA 5AN7A 3GDTA 3LHZA 2H90A 3NPVA 4IQLA 1TPDA 4JS3A 4JTKA 3W3OA 1KM5A 2PRHA 2Z2UA 1UUOA 4MLRA 3PG9A 2QCNA 3W7KA 5K9XA 4NJIA 4OQVA 1JUKA 2E6YA 3LX9A 3LBCA 1QCWA 1ZAHA 2BZNA 2B7PA 3IVTA 5L9FA 3NL3A 2WSRA 4RLIA 4O18A 4KKXA 1DKWA 1NF0A 4NNBA 1ZHAA 2OX1A 4OT7A 3C8FA 2QEZA 5F1UA 3W70A 5HJLA 1SFJA 5I3GA 3W1NA 3ATZA 3TU9A 4O12A 2V2CA 1O94A 1R30A 3B0VC 3RLVA 2DP3A 3GDRA 2A6LA 3BW4A 3A5FA 4WQ6A 1B4EA 5D04C 1LOLA 3L65A 4OWGA 1OF6A 3QMSA 2OCZA 1SUXA 3GDKA 2HSAA 2ZTJA 3QH2A 4JTIA 3LBMA 5BNKA 1LYXA 3M9YA 4WOZA 1JCLA 1N8FA 1RPXA 5EY5A 3H54A 1KM1A 5FESA 3UWUA 3TAKA 2GUUA 3LGEA 3SZ8A 4E2DA 4ALDA 4K39A 2YFOA 3MP4A 3BLEA 3L9CA 2RDUA 2ZRZA 2DORA 4K7YA 4RXFA 4YLWA 1MEIA 1KM4A 4JTUA 3FFSA 3SY5A 2FB3A 3ATYA 4QAIA 3NQFA 4JTHA 3NGJA 1R2RA 3O1NA 4NNCA 1YDVA 2E6FA 3QPZA 3N73A 2CWNA 1TTQA 4HNNA 4KFNA 3YPIA 3E96A 4UIOA 1B3OA 4O14A 5I3HA 3NPWA 3NG3A 1L6YA 4HSNA 4O50A 2Y6ZA 4N6FA 2DZWA 1C8VA 3NYZA 3I7QA 1HG3A 3GNDA 3ZWSA 3SJ3A 4OV9A 3NL5A 4DELA 1Z44A 4AF0A 4XBSA 3GYEA 2NZLA 3NM3A 2HMCA 4IJBA 1H63A 1I45A 4JEQA 4IUOA 2X16A 5AHFA 3NPUA 3TMQA 4X9SA 1W31A 1H7OA 1TTPA 1VJIA 3DFNA 5AHEA 4TX9A 3DI1A 3W7IA 1LOSA 1SFLA 4PODA 1WBJA 3CU2A 3LHVA 4LVBA 4UFHA 2DZSA 4HT3A 4TR9A 1H7WA 3SIZA 4IOTA 5F2MA 4I9AA 4W9TA 1KM0A 1Q45A 4AF0B 1OFBA 1LRTA 4A22A 2CU0A 4O16A 1YPFA 5HULA 2TRSA 4GJ1A 1DVJA 2FPTA 4UR8A 3A5VA 3MHFA 1U5JA 2AGKA 2R94A 3QQ0A 2BX7A 3PY2A 1OK6A 3QMTA 2V82A 3WJSA 3TXVA 5EKYA 4NJKA 4UMBA 3TQKA 3A22A 1UB3A 1PCKA 4JD4A 4H6KA 4O54A 3B8DA 4EF8A 4UCGA 1KA9F 3O05A 3HG4A 1W5OA 5EA9A 3QM3A 1JCJA 1OFOA 3W1RA 2VEPA 3HGRA 2I9EA 3GVGA 3M0ZA 3DI0A 2TPSA 3W2JA 1TV8A 3NQGA 1U83A 3Q94A 1RZMA 4HPJA 2NUXA 1OFEA 4MVAA 1XC4A 1I2RA 1LBLA 5DCDA 3NAVA 3NZ1A 4Z1BA 3P67A 2WNQA 4S1FA 2ATMA 1EWDA 3PWAA 1PHWA 1LRQA 3B06A 1F6PA 3KX6A 3TROA 2EPHA 1D9EA 4RZ5A 3KVJA 1FXQA 4AWTA 2AQWA 2X2GA 3OG3A 5HWMA 3R13A 2A1YA 3OBKA 3S1UA 1LBMA 1EB3A 3NDOA 4DO4A 1Z42A 4UXDA 4IMEA 1H51A 1SW7A 4FXRA 3PB0A 3QQ1A 1TO3A 2X1UA 1ZCOA 4P61A 1Q6QA 3WK0A 3W1TA 2V81A 4LV9A 4MY1A 3DENA 1FX6A 3O16A 4X3ZA 3DFPA 3ELFA 4UNLA 2YR1A 2PRLA 2GPTA 3NQMA 1GVOA 2C3ZA 3OHIA 3TXZA 1XBXA 2J9XA 1QOQA 2E5CA 5AYXA 3W76A 4WY0F 3UWYA 5I3FA 5F4XA 1W3NA 4LS0A 3I68A 3LCLA 2J9YA 1AG1O 2CW6A 4TO8A 3VNDA 2NX3A 4FHAA 2R91A 4MJMA 3FIGA 4K36A 2TSYA 5BW6A 3TDFA 3N34A 5K2ZA 2RKXA 4Z0SA 2G5WA 1TIMA 1ONRA 3W7EA 1NFBA 4UTKA 1QPQA 3W7CA 1O5KA 3WJZA 3A21A 4JY9A 5D09A 3EX3A 4H3DA 3MHUA 4FXSA 4AAJA 4OV4A 5D38A 2CLIA 2Y7DA 5DLCA 3LXAA 4GC4A 1R2SA 4JIQA 5CG7A 1SZFA 3P61A 2B7QA 2DU2A 3TW6A 1IIGA 1EP2A 3TUUA 5TQLA 3W7PA 1NSJA 2QAFA 5AC7A 3GAYA 5CPNA 1TCDA 3G1HA 1VCGA 4JN6A 3ZR4A 2QAPA 2J9ZA 3IVSA 4PH6A 2F84A 1PE1A 4NQ1A 3C2EA 1QPRA 3A23A 4K8EA 1YTKA 4YCOA 5CZTA 1PCWA 4N9BA 3U2OA 2QKFA 1NAL1 4O52A 4XKYA 1OABA 1XBVA 2VFFA 2QCGA 2RFGA 3W2NA 1B57A 4O10A 4S2BA 2YX0A 1TTJA 1KFEA 3JRKA 3NZRA 1H1ZA 5LKYA 4NXKA 5C5YA 5HQEA 2FFCA 2W79A 1G4PA 3NR0A 4IWWA 3GB6A 3HG5A 4UFIA 3W7LA 1SU5A 2E09A 2X1TA 3DXIA 3LTSA 2RDWA 1I2QA 4JIPA 3MMTA 4O1CA 1FY6A 4MYXA 1KLZA 4BWLA 4WZHA 3C2OA 1OG0A 4BFAA 4XKYB 5G4EA 3L5AA 5BRBA 3Q37A 1GQNA 3W22A 3QSRA 5C54A 2R14A 4QISA 2YW3A 3CC1A 3W7GA 3IEBA 1WV2A 4LWWA 1TJPA 5BMXA 5FF0A 3O6CA 3DFTA 2QDHA 3FYOA 4EVZA 5K9CA 3CPRA 3W2MA 1NEYA 4DPQA 4JR5A 3HOJA 3ABQA 3R8RA 5CKSA 1MO0A 1MEHA 2C15A 4LC8A 2ZTKA 3KVLA 5H2ZA 3EXTA 3W1PA 3O07A 1XBYA 3TJLA 4CNOA 3THQA 1QMLA 2ZZ4A 2QCHA 1ZALA 1IXQA 4MPQA 4P2VA 1O95A 1T8XA 2ABAA 3GDLA 2QCMA 3H53A 4QNWA 4A21A 3G0SA 1P4CA 5AC8A 2ISVA 3SECA 6TIMA 2B7OA 2Y7FA 2RDTA 1JCXA 1UBSA 3B0PA 3MP5A 4RZ4A 3HQ1A 3TC7A 2J24A 3BG5A 1AL7A 2HTMA 4O13A 4CCCA 2GJLA 3MJYA 1YTDA 5FF4A 5EMUA 3M47A 1G69A 4MFDA 3DU0A 3ABSA 4ZQRA 1FCVA 3DFQA 3O06A 3EXSA 4N9DA 3UWQA 1DOSA 2GVGA 2VEKA 3TKFA 4HIBA 1KFBA 5C55A 1TRDA 4WX2A 3KXQA 4ZQPA 1I2NA 1W56A 3HG3A 1DJQA 1TPFA 4N9CA 4LUJA 4FNTA 4Y6GA 3DH7A 3M44A 1YXYA 2QUUA 5AYYA 3N3MA 3W2KA 1SQ7A 1X7FA 2QJGA 3A9IA 3PC0A 3G8EA 5D2WA 3QEZA 1TRIA 3GZ3A 4ZMGA 4NT0A 1AL8A 1F74A 1MZHA 2Z6JA 5IBXA 4IX0A 4IGHA 5CPMA 2FPVA 3CIXA 2O7SA 3QF0A 3UWWA 4LT9A 1KFJA 5U4NA 3GR7A 5LHFA 2A21A 4RV8A 1CI1A 4GWEA 1K8YA 1H62A 1XKYA 1FUYA 2DZVA 1O4UA 3GK0A 4JYDA 4N9EA 3NQDA 3TFCA 2GQAA 1GTEA 3EWYA 2E5DA 3G0XA 1SO3A 1R2TA 4Z0JA 1A50A 2ZA3A 3LRLA 2ZRVA 5FF3A 1P5BA 1OX4A 3E49A 2X1SA 5J5DA 2ISSA 1W37A 4XTDA 4ADSA 1MXSA 5EL1A 3G1AA 5HWJA 1TPH1 3S5OA 3I7RA 3TMLA 3USBA 3W74A 1OFQA 1L6WA 3EWWA 3GAKA 3F03K 4I7WA 3DHFA 1F76A 3NL2A 3N19B 3KHJA 7TIMA 2CLOA 1TQXA 3P7YA 3TC6A 1OX4B 4OHQA 4O4WA 3G22A 1T99A 5LGXA 3LB0A 4E38A 1EP3A 1RQHA 3P81A 3GXTA 1JVNA 3BLFA 2HS6A 3E9AA 1VRDA 5E0KA 2F7FA 2Y88A 3W7DA 5D03A 4O0ZA 4Z1CA 4LU0A 1JCMP 1ME9A 4OU1A 3CLMA 3W7HA 3HF3A 3FYPA 3PB2A 3TJXA 4ADTA 4UTTC 4NU7A 3BPWA 1LLZA 4GXMA 4S2CA 4POCA 5CZ0A 3S42A 3UXDA 3B03A 1JQVA 2B4GA 4RR4A 4JTJA 3GXPA 3MBDA 4ADUA 1R46A 3ABOA 1LROA 4LC6A 6ALDA 1DV7A 3H55A 4N6EA 2A0NA 3R2GA 1R47A 1KW1A 4IXHA 2H3BA 1JRCA 1IXPA 3DFSA 1T96A 1SO6A 2GVJA 2YZRA 2HS8A 3OA3A 4JX5A 3THAA 1PHQA 1SW0A 3L5LA 4U28A 3BGGA 4UFMA 1ME7A 1QO5A 2NLIA 5D32A 5KSWA 3NM1A 5HR7A 3CB8A 3NQ6A 5I3IA 3NQ8A 4IMCA 3IGUA 1JJKA 4AB4A 3KOFA 3TW7A 5I3JA 2RHGA 4XWUA 2VXNA 5G1YA 3SI9A 2CZFA 1OJXA 4LVGA 1HTIA 3W7QA 5DBUA 4X2RA 3G1DA 3NQCA 3KVKA 3RF9A 3W86A 1WAUA 1L9WA 3P62A 3EX1A 1SPQA 3PUDA 2CFFA 2B0MA 2PCQA 4LRTA 3BARA 1LOQA 2A7NA 2JKAA 3AO0A 4O1DA 3W1UA 3VKJA 4AHOA 2E1DA 4UTWA 2A5HA 1TB3A 3T55A 3WFAA 2FIQA 1EPXA 2FPYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3BW2 A;  1GOX A;  4M6Q A;  5LSM A;  4HHP A;  2J27 A;  2YW4 A;  2LLE A;  3E0I A;  3PF3 A;  3OVR A;  1LCO A;  1GTH A;  1KLY A;  2JGQ A;  4UTJ A;  3W73 A;  4UTT A;  1OYC A;  1UAS A;  2J6X A;  1I4N A;  4L4L A;  2E6D A;  3LHY A;  1THF D;  4IMD A;  4Z08 A;  3HBL A;  1K7F A;  4D2J A;  5KIN A;  1G4T A;  4H4I A;  3VFL A;  3M1Z A;  1ZJI A;  3LM7 A;  4FB7 A;  2OJP A;  4TMC A;  4HNV A;  3TCE A;  1OFP A;  1FCU A;  1M7P A;  1KTB A;  4NUW A;  1VR6 A;  4BI7 A;  3PS7 A;  3W7J A;  5MHB A;  5G2I A;  3FOK A;  2CLK A;  3QST A;  2H8Z A;  4AWS A;  1FCB A;  1T0O A;  3BGJ A;  4IMG A;  4O1A A;  3VE7 A;  4CNN A;  3IIV A;  4LVF A;  3P74 A;  1S5V A;  2VEN A;  3NEV A;  3ANY A;  3G1S A;  2V5B A;  3S1W A;  5F4S A;  5D05 A;  1JUE A;  3IIX A;  4EF9 A;  2NXH A;  3HB9 A;  3P84 A;  4IMF A;  4LVA A;  3FEM A;  4GUF A;  4WY0 A;  2Y61 A;  4UMC A;  1OX6 A;  3M5V A;  2C0A A;  1V7Y A;  3JS3 A;  4GRS A;  3TA6 A;  4YL2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2VEM A;  1R9Z A;  3ARV A;  1QNS A;  4AIO A;  2YBV A;  5FA5 A;  4BEQ A;  2ZUN A;  3L66 A;  1K8X A;  1H50 A;  4MJ4 A;  4OE7 A;  2DZX A;  3HPX A;  4G9P A;  2VZV A;  3PSW A;  3I3E A;  1O60 A;  3R89 A;  4AMC A;  4HSO A;  4DF2 A;  4JDY A;  2XZ7 A;  2J74 A;  4GD0 A;  2PF8 A;  2REQ B;  2C6Q A;  1IEI A;  1VQM H;  3LHU A;  1OK4 A;  3LRK A;  1B0I A;  4G2D A;  4XVD A;  5CPT A;  3Q2D A;  3V1P A;  4H00 A;  4X9Y A;  4AW7 A;  3ZLG A;  3KM8 A;  4JIH A;  2OEJ A;  4WFA J;  5A2A A;  4R53 A;  1CGY A;  1S5W A;  7CGT A;  1YDO A;  2VL4 A;  2OLH A;  1WZK A;  1AW1 A;  3G77 A;  4YYY A;  5CEW A;  3H5Q A;  4NZ4 A;  4B92 A;  3FJL A;  2PWH A;  3AHZ A;  3GYC A;  1OM0 A;  3URA A;  2ATS A;  1F5Z A;  4QQ3 A;  3W84 A;  1J2W A;  2E9M A;  2Z1S A;  2TPT A;  1WDR A;  4JYF A;  1WZA A;  1A4L A;  4NRR A;  3AI0 A;  2HK1 A;  4X0V A;  3UT0 A;  3WLO A;  3WQP A;  4PCS A;  3EKL A;  2XH4 A;  4EE9 A;  1GVR A;  1KKR A;  2NQH A;  1ICS A;  4PUJ A;  2ZDR A;  2C16 A;  3QZE A;  3T0B A;  5K9D A;  1H7R A;  4LUT A;  4O8R A;  4AWU A;  4E0C A;  2BLE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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