3L0GA

Crystal structure of nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from ehrlichia chaffeensis at 2.05a resolution
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
ISFSEIIHNALKEDLGDKGDITTNSILINEKVNFAINTRENLVVCGIPILEEVFNMNKEHVKYEIHKKDGDITGKNSTLVSGEALAIYLLPIERVILNFIQHASGIASITRQFVDEVSGTKVKIRSTRKTTPGLRMLDKYSVCIGGGESYRDNLCDGVLIKDNHIASCGSITLAIQRLRKNLKNEYIAIECDNISQVEESLSNNVDMILLDNMSISEIKKAVDIVNGKSVLEVSGCVNIRNVRNIALTGVDYISIGCITNSFQNKDIGLDIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from Ehrlichia chaffeensis at 2.05A resolution
rcsb
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
molecule tags Transferase
source organism Ehrlichia chaffeensis
total genus 97
structure length 272
sequence length 272
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2009-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l0gA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3l0gA01
3UPBA 1QDSA 1SZFA 2Y62A 4JN6A 4GWEA 4MY1A 1PIIA 3N73A 3DBPA 1OFAA 3LV5A 1GOXA 3U2OA 3BLFA 1BKSA 1T0OA 2ZZ6A 3EXSA 4OV4A 2XN1A 5DBUA 4P2VA 4JTJA 3HGJA 3FYOA 4M7SA 3QMSA 3O16A 1UBSA 2AAMA 2ZZ3A 2VC6A 1JRCA 3GKFA 3NNTA 2A0NA 1GVQA 4MZ1A 3O6CA 5D37A 4O4VA 4A21A 5CZTA 5KINA 1LTDA 2V81A 3KX6A 4YCPA 4AWSA 3GR7A 3S8HA 3IVTA 2FFCA 4NNAA 4IX2A 4KFOA 4FHAA 3G8EA 3G1SA 3B8DA 1XM3A 2EPHA 4P61A 1HFBA 4DBEA 4JGDA 3BPWA 1JR1A 4KWWA 3CM4A 3LCGA 2C14A 3CB8A 4AB4A 3OA3A 5TBOA 5CZ0A 2EHHA 4ZQCA 5D32A 4I7UA 1H7NA 4UR8A 1H51A 3NO5A 2ZRWA 2QUTA 5DXYA 3L9CA 4IMFA 3LV6A 1H60A 4LWWA 1H7OA 3TJXA 1ZAJA 3GDRA 3W1QA 3G1XA 2GQ8A 3W71A 4JYEA 3MUXA 5KTLA 3P84A 2FQIA 5LNVA 3ZS4A 3NQ7A 2H8ZA 4K8EA 1KTCA 3LTPA 2VFHA 4PEKA 5FEXA 2QDHA 4M6PA 1I8JA 3KRSA 4K6AA 1DQXA 4WD0A 1W54A 4L4LA 5D30A 5F1VA 3PBVA 1ZJIA 1B4KA 2CU0A 3UD6A 3P8JA 3DFNA 3E0IA 4FXSA 1BWKA 1C9DA 5DELA 5AHEA 2DP3A 2DZUA 3O05A 1HO1A 1DL3A 4N4QA 1SUXA 3BLEA 2Q3OA 4XZ9A 3S1WA 5D04C 1ZAIA 5J5DA 1H7RA 3NM1A 4PL2A 3EWBX 5FEWA 2W6RA 4UTMA 3CPRA 2CLKA 3O06A 4N2YA 1OF8A 1RR2A 1GG0A 2GJLA 2YCEA 3Q58A 4HNVA 5FF4A 2DU2A 2E6YA 3DI0A 1AG1O 4JTFA 1JQXA 3DFQA 3K30A 4YWIA 3BVJA 4LW7A 3TNOA 2D73A 4JDYA 3W9ZA 4PL1A 5LHFA 3GX9A 4MUZA 4AF0B 2GVJA 3O63A 4BI6A 3LHWA 2Z2UA 1X1OA 3M1ZA 4DEFA 2FPVA 4NXKA 4NQ1A 2VXNA 1G4SA 3CHVA 3PF3A 3L5MA 3VE9A 3HGSA 4A2RA 2YFNA 4XBKA 4IMDA 1P0KA 1RQBA 4OV9A 3V75A 2CW6A 1D3GA 3IVSA 3JR2A 2A85A 1RV8A 2WNQA 1WXJA 4JDBA 4DPPA 2JKAA 3O07A 3LCIA 3RLVA 1EA0A 3W7GA 1PV8A 1XUZA 3L0NA 3W74A 1O94A 4MLRA 2OZ0A 1CW2A 3VKJA 4QIUA 4IMEA 1JRBA 1OF6A 5DY2A 3I7SA 3QW3A 4XUGA 2ZRZA 1TPH1 4UNKA 2JKEA 2RDWA 5HNRA 3C8FA 3MW7A 5D38A 5G2IA 1LLWA 5DLCA 4Y8FA 4MJZA 3B0VC 1HG3A 4XTIA 1H61A 1YADA 2BSLA 1JCJA 5C5YA 3KVMA 4LVBA 4OQVA 1ZHAA 3P5YA 5LGZA 2O7SA 2VEIA 1GVRA 2ZRXA 3R13A 1D3HA 4Z1BA 3NL5A 5LNWA 4PA8A 5CSSA 1THFD 4Y96A 5A5WA 4N9CA 4ORMA 4CCDA 1TPWA 2TPSA 4JS3A 3W7QA 3ATYA 4K38A 1R47A 4WJEA 3DHDA 3UWWA 2ZZ2A 3W7EA 5BMXA 3KXQA 5G5IA 2YW3A 2ZFAA 1L9WA 2YXGA 4FNPA 2RH9A 3IGSA 1MEIA 3FA5A 5K7JA 5U7SA 3QW4B 3TIMA 1PCWA 2TMDA 1OX5A 1XCFA 3FS2A 4LS0A 3RK8A 3HGOA 4FB7A 3M5VA 4N4PA 4EF8A 4UTTA 1TTIA 1KM1A 3OVQA 4TO8A 4FNUA 2P0OA 2BXVA 4H4IA 3W84A 3FKRA 4GBUA 3TW6A 2QJHA 2VOMA 1UUMA 3A5VA 5AOUA 4XWUA 2FDSA 4W9TA 1SFJA 5DN1A 1LBLA 2QCDB 3VI2A 3KRUA 1H5YA 1TRIA 1LOLA 3UNDA 4LU0A 5AYYA 1FX6A 3NA8A 4JX5A 4R7JA 2YSWA 1FCUA 2Y7EA 1FBAA 4O15A 4AVFA 3ABQA 1OX4B 1V5XA 3G8RA 4GRSA 3EX3A 2ABAA 1VZWA 1KFLA 4QQ3A 3A23A 1WBHA 3NM3A 2FB3A 4FNSA 4EWND 2P1FA 1OK6A 3GLCA 3HPXA 3UWUA 2QEZA 4DF2A 3S5YA 2YPIA 1PCKA 3R8RA 5J5RA 1KFEA 3B05A 5L9FA 1F7BA 1O5KA 2Y85A 5D05A 3IIZA 3T78A 2A21A 3W1PA 3QJAA 4A3UA 3GDTA 3QEZA 1LOSA 3BK0A 5EKYA 3DFTA 3PG8A 1EP1A 2V5BA 2H90A 2VEPA 1UB3A 4FIRA 3NAVA 1KV5A 5F2MA 4HIBA 4HT3A 3LCXA 3O6YX 4O18A 4JX4A 4M6QA 2ZTJA 3TDFA 2NUXA 1SSDA 3HG5A 4Z0SA 4OBTA 3DAQA 1G7UA 1B57A 3EWWA 4O4WA 2C16A 2H3BA 1Q6LA 4O8RA 4QNWA 3NL3A 1ONRA 3W70A 1ICQA 3D0CA 1F73A 4UC5A 1UCWA 3SGZA 2WQPA 1H7WA 3PS7A 3LTYA 4UTWC 1LRNA 2HMCA 3GNNA 1H62A 5F4WA 1EPXA 5DCBA 1HUVA 4GFSA 1LBFA 2B7OA 2E6FA 4UIOA 4EVZA 1EUNA 3EWXA 3C6CA 2G96A 4UFHA 2QCLA 1KM4A 3R5EA 4IXXA 3FIGA 4RXGA 3LGEA 3M0ZA 2QCFA 4HPXA 5D2VA 3G1FA 3QSTA 3C2VA 2X16A 3LHUA 2DZPA 3VFLA 1JCYA 3Q37A 2GQAA 3IIVA 3W1TA 4DF0A 1XC4A 1SZNA 3AJXA 4JY8A 3TMLA 4UMAA 1TTPA 2OT1A 5FEZA 3W7CA 2QAPA 3NQMA 5F2IA 3RU6A 5A8GA 2QCHA 2ZA2A 1MXSA 3QPZA 2Y63A 2J9ZA 3V1PA 5HINA 1I2QA 3W7PA 4KWVA 5HWMA 4LVFA 2JBMA 3QQ1A 3NOEA 3W7IA 4RZ5A 2B7NA 2ALDA 1S5WA 2QUUA 1G67A 2V5LA 2X1UA 2QCNA 2LLEA 4E38A 4I7VA 5FF2A 1B4EA 1HTIA 5TIMA 3NPXA 4UTJA 1TPUA 3WK0A 1WOAA 2DZVA 3CTLA 4R33A 3A24A 2AQWA 3EEGA 3PBWA 2ATMA 5D2WA 2PCQA 3NR0A 1ME7A 3P80A 3DXIA 4HN4A 5AN7A 3N2MA 3BW3A 4MOZA 4KFNA 1OG0A 1LROA 3W1UA 3BV4A 3NZ1A 1QO2A 3EXTA 2V2CA 1QMLA 2V2HA 1GQNA 2JGYA 2WO5A 1WX0A 1AW2A 1W5OA 3EWUA 3P5ZA 3IVUA 2FTPA 3HB9A 1GVFA 3EKZA 2HSAA 3I65A 3O15A 3C2EA 3E02A 3C3NA 4BWLC 4LUJA 2YR1A 3PWAA 3NXFA 1WYIA 1MEHA 5FF7A 3W7NA 3UXAA 4PFMA 5EBUA 2VFGA 3W2MA 1FDYA 3SFKA 1DORA 1Q6RA 2BX7A 1QPRA 3OHIA 1JUBA 3HPZA 3USBA 2R94A 3W7HA 3P67A 4OGZA 3W2NA 2E68A 3B0PA 2UV8G 1VS1A 5G4EA 5HMSA 1WBJA 3PBUA 3SZ8A 3F1QA 3QZEA 4WY0B 4H3DA 1TJRA 2OMAA 3NQ8A 3C56A 5I3JA 3NPWA 3HJZA 1KBJA 4ZQRA 1KM0A 1TV5A 2DORA 2A7RA 3HF3A 5LNRA 1SPQA 1EX5A 3N9RA 5F2GA 3W22A 3UXDA 5F1UA 3L21A 3B0UX 2CZDA 3KVKA 3RNDA 4LC8A 4RX0A 2QDGA 4MPQA 4XBSA 1ICSA 1O95A 3HBLA 1ME9A 5ABTA 5C55A 1I2PA 3W76A 2CZFA 1SFLA 1W8SA 3ATZA 3C0JA 3R89A 4O1AA 3KVJA 3INPA 1QNVA 4RZ6A 3C4UA 3CC1A 2ZRVA 5BMWA 1SO5A 1IIHA 2F84A 4NX0A 1JCXA 5DBTA 3FJ6A 5AHNA 3MP5A 1PE1A 1FUYA 4JYFA 3S6DA 1L6SA 1FWRA 3W23A 3L5AA 3L68A 1XI3A 1U83A 3I68A 1M7OA 2BWGA 4N9DA 3MO7A 1RPXA 3PSWA 2Q8LA 4XTDA 3TC6A 1FDJA 2RHGA 3WJWA 1XBVA 4O28A 1LORA 3THQA 2W79A 4X3ZA 1AL7A 3TSBA 4XKYA 3G0XA 5IM51 2NLIA 4CCEA 3KOFA 2FIQA 4GXMA 3W1AA 4JTLA 2QCCA 3A22A 4Y90A 3M16A 1QR7A 2O7QA 4DO6A 3GXNA 4R53A 3W2UA 5C54A 4UMCA 2B7PA 3BW4A 3B4UA 2ZYFA 3G1DA 1TTQA 3GAYA 4O50A 4IUOA 3QM3A 1FWNA 3GK0A 5CZSA 4O53A 1VCFA 5D03A 1TV7A 4IPIA 3DKLA 4FX7A 1LBMA 2VFEA 4YL2A 5EYWA 4A2SA 5G4WA 3Q94A 4GNJA 4C1LA 3LCHA 3PUDA 1A5BA 2OCZA 3A21A 1W0MA 2WSRA 3MP4A 3LM7A 3I7QA 2GOUA 4FNQA 3M5ZA 1DBTA 4E2DA 1TJPA 4B5NA 4HPJA 1P5BA 4WOQA 2NUWA 5EL1A 2Z6JA 1LLZA 3LI1A 1TQXA 5KITA 5LZLA 2V30A 4JNMA 3PVFA 1ZCOA 4LY8A 2Z6IA 4MY9A 4YXGA 3GDKA 4UFKA 1ICPA 3VCRA 4AAJA 2Y6ZA 3W72A 1J4EA 4K8HA 2V9DA 3L66A 4K37A 2HTMA 4EOUA 2TSYA 5I3HA 5CSRA 3L5LA 2JKPA 1AW1A 5H2ZA 1SW0A 4ADTA 3W2LA 1EP3A 4Y6GA 3I6RA 1QO5A 3LXAA 1TPC1 3G22A 1HO4A 2QCMA 2Y88A 1I2RA 1R2TA 1GT8A 2DZSA 1KM3A 2CLIA 1EB3A 3EWYA 3E9AA 1TV8A 3FJLA 2J9YA 3TX9A 1XFBA 4M7TA 4OWGA 1P1XA 1K8XA 2GVLA 3M43A 3LCLA 3TXZA 4YLWA 3KFTA 1S3HA 1YLVA 3BG9A 3T55A 5K2ZA 3CWNA 1VYPX 3CEPA 3MYPA 4H6KA 5FF3A 3NPVA 3DGRA 1R2RA 5K3VA 3LTSA 2G97A 4RXFA 5AHFA 1OFQA 3M6YA 2Y7GA 1OYBA 4O13A 1MEWA 3CLMA 1N8FA 4LRSA 3ZWSA 1EWEA 5K9CA 4FX6M 3W6YA 3ELFA 3TE9A 3NQEA 2H3DA 7TIMA 1QFEA 2ZCGA 1JQVA 3NDOA 1FY6A 4HHPA 4DF1A 1XBZA 3MJYA 4FIQA 1TMHA 2ZZ4A 1T8XA 5EY5A 1XXXA 5CZJA 5T26A 5FEPA 3M41A 3W7JA 2C3ZA 2VKZG 2V2DA 2CZ5A 1G7VA 4AHQA 1KTNA 4CCCA 4ORIA 3L0GA 4PODA 3LXCA 4Z0JA 1VCGA 1VLWA 1W5QA 3U8GA 5I3GA 1FWWA 1Q3NA 4CNNA 2V0TA 2ZZ1A 5G2HA 2TYSA 3CIWA 4NXSA 4UTLA 3WJYA 3QFEA 4MYAA 3UPWA 1VQTA 3HQ1A 3M9YA 1BEUA 3CQ0A 2B4GA 1YPFA 2A6NA 1IXOA 3CWOX 1QAPA 1GVOA 1S5VA 3FFSA 3G1YA 4R34A 2PRMA 1CI1A 4IX0A 4QSHA 3LCFA 1E51A 2P10A 2Y70A 1OYAA 1WQ5A 5KZMA 1ME8A 4IMCA 1OFPA 3RFAA 1RQHA 1LP6A 2WOQA 5C2XA 1SU5A 1IGSA 4GE8A 3PR2A 4O12A 4CNPA 2R14A 2ZQ0A 1FWSA 4UR7A 4WXYA 8TIMA 3IRDA 2DJLA 3UQNA 3LBMA 4O1CA 3CIXA 1XUUA 2ZA1A 4A22A 6TIMA 1SO6A 4EF9A 1VYRA 1XL9A 4BFAA 2YYUA 4AH7A 3GNDA 1TYGA 1SSGA 1UUOA 3C2OA 3NQVA 2Z0IA 3TAKA 1MZHA 1R46A 2CLFA 3G24A 4AF0A 5HULA 1WA3A 1UASA 4K7YA 3W07A 2PE4A 3M7WA 1T99A 4LVDA 2GUUA 4N6FA 5IBXA 1A5CA 2ISVA 3LBCA 4ZQNA 4NJIA 3N3MA 4NX5A 4MFDA 3IIXA 3WJSA 2GVGA 3QQ0A 4JXCA 3FLUA 4JIPA 4WXZA 3PSVA 3BLIA 4BK9A 5D2YA 2E6DA 2Q8ZA 2NWRA 3G1VA 2NXGA 1R30A 4JTSA 5K9XA 5K4ZA 2A6LA 1LYXA 1FQ0A 2NWSA 5AHLA 4HNUA 4MIMA 4RJEA 4O57A 3TFXA 3W7DA 4O54A 1YTKA 2NXIA 4O10A 3SY5A 2WNZA 2CLMA 4FXRA 1OVDA 4O14A 3IV3A 4NUWA 2E5CA 3PB2A 1NF7A 4IGHA 4M5PA 2F7FA 2CLHA 2I14A 4X2RA 2ISWA 1R2SA 4O52A 4RCXA 3YPIA 1MO0A 3TQVA 1D9EA 3OBKA 4DXVA 2QF7A 1WOBA 2GJNA 3QH2A 3S0CA 1G4PA 4Y9AA 1YDOA 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 3FKK A;  1H7P A;  4JTG A;  3W1N A;  1LRT A;  3WK3 A;  5FF0 A;  2CZE A;  4JY9 A;  1TPD A;  4UFM A;  4AEO A;  4NVT A;  1HL2 A;  3B04 A;  4TU1 A;  3DEN A;  1KFB A;  2J88 A;  3STE A;  3W3O A;  5DCE A;  4I9A A;  3UZ5 A;  4CLM A;  5EA9 A;  1F5Z A;  2QCG A;  4ADS A;  4NU7 A;  4UMB A;  4MLJ A;  5IBX C;  3PG9 A;  1W3I A;  1EIX A;  4LT9 A;  5D33 A;  3UWY A;  4E0C A;  4UTH A;  3W1X A;  2Y7F A;  4AHP A;  1K02 A;  3LX9 A;  1V7Y A;  3L65 A;  3G0S A;  3EX4 A;  2PC4 A;  2EF9 A;  5U4N A;  4JR5 A;  3OVR A;  4AXK A;  4MZY A;  1LDC A;  1DKW A;  2RDU A;  2FLI A;  3TU9 A;  4HKP A;  1N7K A;  5DY3 A;  4ICN A;  2CLE A;  2XN2 A;  2C1H A;  2FB2 A;  1W3N A;  1W37 A;  1GEQ A;  1DJN A;  1QWG A;  2RFG A;  4K7V A;  4YCO A;  3DI1 A;  4PH6 A;  3DU0 A;  1GPW A;  5BW6 A;  1I2O A;  4O1D A;  3LHZ A;  3N2X A;  4TR9 A;  1F6P A;  1OFO A;  1L6Y A;  4ZQP A;  1OFB A;  2DZW A;  3E96 A;  1IF2 A;  4IJB A;  3ZWT A;  1I2N A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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