3TQVA

Structure of the nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from francisella tularensis.
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
280
structure length
276
Chain Sequence
NTDQINKVPNDIVTRLVRESLAEDIATGDITAQLAEDIDTTAFCITREEMILCGQDFANEVINQLDKNIQITWLYSDAQKVPANARIFELKGNVRSILTAERTILNFIQMLSGTATVTNKLVKLISQYKTKLLDTRKTIPGFRLAQKYAVRCGGGFNHRIGLFDAYLIKENHIGIAKAVTKAKKLDSNKVVEVEVTNLDELNQAIAAKADIVMLDNFSGEDIDIAVSIARGKVALEVSGNIDRNSIVAIAKTGVDFISVGAITKHIKAIDLSLQVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Rapid countermeasure discovery against Francisella tularensis based on a metabolic network reconstruction.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
total genus 86
structure length 276
sequence length 280
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2011-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tqvA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3tqvA01
3NR0A 1ML1A 3QMTA 3CLMA 5I3FA 4K8HA 1AG1O 2WJZA 3HOJA 2YW3A 1EX5A 1XBVA 1SR9A 3W1QA 3VI2A 3EKZA 2B7PA 5CPOA 1Q45A 3HG4A 4O10A 2GVJA 5FEWA 1ME9A 1HUVA 1FBAA 4JTEA 1IXOA 2VOMA 3VCRA 3NOEA 1KV8A 3G0SA 4IX2A 2CLMA 1LBMA 4WY0A 3LBMA 2QCMA 1WYIA 3A24A 1ZNNA 3QSRA 4RZ4A 3E49A 2QDGA 3TAKA 3GXPA 3B05A 3W83A 2ISWA 3GAYA 3WJYA 4IMDA 2HS8A 1X8FA 1LYXA 2JGYA 1OFOA 3PG8A 1LLZA 1N8FA 3W23A 4OU1A 4BFAA 2ZZ6A 1C9DA 3BG5A 3A9IA 3LI0A 3SZ8A 5ABTA 2E09A 1EWEA 5I3GA 2C18A 4WJEA 1WBJA 1TREA 3DFTA 1VPXA 3G22A 2ZZ1A 5DY2A 1LDCA 2NZLA 3HB9A 1YTDA 3M5VA 3Q2DA 2FPYA 1A50A 4LWWA 4O16A 3TK7A 2OX1A 3P82A 4O54A 3TJXA 2QAFA 4OV9A 3W1RA 3QPZA 3S5ZA 5D2VA 1ICSA 1GVQA 4Z0JA 4GC4A 2ZZ4A 4LS0A 3M43A 5LSMA 4JTJA 5LNWA 1NF0A 4HPJA 4N9BA 5BMXA 4H4IA 3UD6A 1YLVA 3W07A 5D2WA 3BW3A 4IX0A 4WXZA 3KVJA 1I2NA 4GNJA 3QSTA 3LOTA 4FB7A 2Q3OA 3KX6A 3P8JA 3EEGA 4MPQA 2VFEA 1L6WA 5LHEA 1QWGA 3UNDA 1TSIA 5G4WA 3T55A 4LS2A 4DELA 2H3DA 3CIWA 3DHFA 1XBZA 3B0PA 4LRSA 1TTPA 2VFHA 5DCBA 3EWYA 1ZAJA 2G96A 3M5YA 1GTEA 2RDWA 4JTKA 4ADUA 3NPUA 1IXQA 3GK0A 4ZQRA 1GZGA 1W3IA 4NZJA 2V2CA 3HG5A 4E2BA 4ZQNA 2Y7EA 3DBPA 4GWEA 1RPXA 1UASA 3S5OA 1F73A 1QAPA 1S5VA 3ZWTA 4OE7A 1VZWA 5HULA 4UFIA 3KVKA 4D2JA 1I2QA 3L0NA 3LCLA 4UUIA 4CQ8A 1O94A 5BRBA 3DI1A 5CZTA 1AW5A 3W7CA 2GQAA 1M5WA 3G8RA 1NFBA 3D0CA 3TW7A 3OVQA 4UNKA 3GVGA 3NQ2A 4LY8A 3G0XA 5LGXA 1FDYA 2A21A 2E77A 1FWRA 1MO0A 1JQXA 1RZMA 1W3NA 3DU0A 3S1WA 3FJ6A 5CKSA 4EIVA 4O1DA 3UPBA 3KOFA 1SW0A 2ZCGA 2RFGA 3N73A 1THFD 2PRHA 3W2MA 1EPXA 2W6RA 1HO4A 3B04A 2B0MA 2P10A 4RXFA 3LBCA 4HPXA 4HNTA 4IMFA 3TXVA 4HNVA 1A53A 3M47A 4A3UA 1OF6A 4ADTA 2OJPA 1R2TA 4DBDA 2CZDA 1TJPA 2NWSA 2NXIA 3YPIA 2ZZ2A 2V5LA 2C14A 4DQWA 2XN1A 1S5WA 4E2DA 3TROA 2F7FA 3U2OA 3WJZA 2Y62A 1SSGA 1YPFA 3HG3A 3LV6A 4POCA 1N55A 4HT3A 3LCXA 3NM1A 4LV4A 2G95A 4O28A 4I7UA 1IIHA 5BOOA 1JRBA 1K7FA 1V5XA 3GIYA 1W5OA 1T8XA 3BO9A 3TR2A 3W88A 5C6MA 3L5AA 3CTLA 1LRTA 1ZAHA 3R89A 3W7RA 4TO8A 3TCEA 1XDLA 3W87A 2TMDA 1I2PA 3OHIA 4NX0A 3BV4A 2ZZ7A 4UFJA 1G4EA 3LHWA 3MBFA 3L0GA 3S1UA 4JTSA 2Q8LA 4JIQA 3ELFA 3THAA 4FNTA 3ZR4A 3DFSA 2E5CA 3W7DA 2VELA 3LTSA 2E6AA 4UXDA 4C1LA 1Q6RA 1G4PA 4BR1A 3A23A 4GUHA 4IXXA 4O11A 4O17A 1LCOA 4Q33A 2YPIA 3NQVA 4DPQA 5EYWA 1F6KA 3WJWA 3FKRA 2BXVA 3LRMA 3O07A 2NUXA 3QC3A 3M16A 4K39A 2Y89A 2FFCA 2Z0IA 5D2TA 2F84A 3FEMA 3NA8A 3EX6A 5HWMA 2GOUA 4CCDA 3MYOA 1GVOA 3G24A 3L2IA 4AVFA 2ZA2A 3MMTA 4BI5A 2GUUA 4P61A 1YXYA 5C2XA 3V1PA 1YYAA 1QOPA 1W5MA 2AAMA 1JUKA 3KFTA 5CG7A 3NEVA 3W6YA 1ZY9A 5HQEA 2GJNA 3QPYA 4XUGA 5DXYA 3BW2A 2VKZG 4FX7A 3QM3A 3STEA 1GYLA 3NPXA 3NZ1A 2R91A 2DZWA 1BEUA 3LHTA 2NUWA 3SSJA 5AHEA 3FYOA 4MY9A 3SW6A 4PL2A 4RV8A 3V75A 2W79A 3ABQA 1B4KA 2V8ZA 4N02A 1RQHA 4WD0A 3MHFA 1K7EA 2GPTA 2QDHA 2Z1BA 1Q6LA 4FNQA 2WNZA 3IIXA 3T44A 1QDSA 3SY5A 1D9EA 1SZGA 1TRDA 3G0UA 3EB2A 6TIMA 3NQ6A 4UMBA 3STFA 4LVAA 1TPDA 4U28A 3H54A 2C13A 1EA0A 1I2OA 3LX9A 1WAUA 4O15A 4LS1A 3EX2A 4UTJA 4MIMA 1VH7A 4UMCA 4RZ6A 5CZSA 2GJLA 4CNNA 2J9XA 3EWUA 2A4AA 4ML9A 2OCZA 2YX0A 3NZRA 1E51A 3LTYA 2WV8A 1FCUA 4MZYA 3S6DA 4IOTA 3VKJA 1Q6QA 1Q3NA 4M7TA 4FNUA 4AB4A 1VLIA 5K9DA 2QCHA 3MI3A 3PBYA 3P5ZA 3GDLA 4C1KA 4IUOA 1JUEA 3C0JA 3N2XA 4Y96A 4GRSA 1TRIA 3GNNA 1WV2A 5HR7A 2DP3A 5J5DA 4UFKA 1EUNA 3NQAA 3UWZA 1VHNA 1KBJA 2ZA3A 3N14A 1FY6A 4O52A 2QCDA 1ZAIA 5AYYA 3DGRA 3S9YA 1ZHAA 3NYZA 1SO3A 1MSSA 3EXTA 3W7OA 4OT7A 5U7SA 3M9YA 3W9ZA 3C8FA 4PC8A 2YDAA 1ICQA 1K8XA 3KRUA 3NO5A 1WQ5A 2QCLA 5KZEA 3W7PA 1HG3A 1KV5A 2HMCA 1G4TA 4LVBA 3WK2A 4KFNA 5DBTA 1GG0A 1A5BA 4AHOA 3HGJA 1K3UA 3E96A 1G4SA 4TMCA 3KXQA 3KRSA 2PE4A 3QW3A 4DXVA 3IGXA 3NQ7A 4NX5A 1GEQA 1A5CA 1LP6A 2BTMA 1JVNA 4JTGA 2YCEA 1H7RA 1KW1A 2VXNA 4HN4A 3F4WA 4XKYB 1FCVA 2DZTA 3LCHA 3S5YA 4MYAA 4GJ1A 4AWUA 3UY7A 2A7PA 1TPH1 4R7JA 5IM51 3P74A 1PCWA 1TTJA 1TV8A 4ONVA 1J4EA 5FEXA 4O0KA 1XBYA 4Q4KA 3TV8A 4R34A 2O7QA 3PULA 5D2YA 3BPWA 4GXMA 4ALDA 1K7XA 3S0CA 1LOLA 5E93A 3OVPA 5G4EA 3T78A 3WJSA 4GUJA 1OFQA 5F2GA 3AO0A 5HWJA 4UTTC 4AHPA 5CPLA 5D33A 3GYEA 1TIMA 4K7YA 3PC0A 5DCEA 3S42A 4UCGA 2QEZA 1L9WA 4O4WA 1KM3A 4NNAA 2C16A 4PFMA 2E5BA 2VFGA 3RNDA 1BTMA 2ATMA 3O8AA 2CLLA 5TBOA 3VE9A 1WOAA 1RVGA 3PUEA 3FA5A 2A6LA 2ZRUA 1GVFA 3F03K 2BWGA 4LC6A 5EBUA 3TXZA 3OIXA 1NAL1 3W71A 4ZZ9A 2VEPA 1PS9A 2QUTA 3C2FA 1SUXA 3QW4B 3TSDA 1PE1A 4OBTA 3FYPA 3NAVA 3HO8A 4N2YA 3USBA 1QR7A 4GFSA 4FHAA 3PY2A 4Z0SA 2UV8G 4R33A 4TX9A 4MUZA 5D02A 3N9SA 2X2GA 5HWNA 4NU7A 3NL2A 3M1ZA 1H1YA 1W0MA 1JCXA 2V30A 4XTDA 1WDWA 4K8EA 1KM2A 2DU2A 3TQKA 4ZQOA 3UQNA 1ZALA 1HTIA 3A21A 3NQGA 4UFLA 2ISSA 3GXNA 3KVMA 5AB3A 1EUAA 1P1XA 2X16A 1OYAA 2CZFA 4MVAA 2V82A 5D38A 3BARA 3TA6A 3DH7A 1BKSA 5KTLA 2WOQA 4NNBA 2Q3RA 4MJZA 4MFEA 3MI6A 1LBFA 1WXJA 4O12A 4K38A 3EWBX 1I45A 4NJGA 3O63A 3ATYA 4O18A 4GUGA 4IJBA 2C19A 1OFRA 4M6PA 2VC6A 1KTBA 3EX1A 3PUDA 4DEFA 3PB0A 5A5WA 1GOXA 5HNRA 3KAOA 5LKYA 5LNSA 4JTHA 4Y90A 3W7KA 3ZS4A 1S5TA 4J9JA 1BWKA 1EEPA 1R46A 2RDUA 1W5PA 4E38A 2JGQA 5HINA 3BG9A 1KFBA 2JBMA 1OFEA 5I3HA 1XM3A 4Z08A 4M6VA 3ANYA 1GWJA 1H7PA 1ONRA 3TC7A 3C2VA 2CLEA 4JICA 4DF2A 1H50A 4ZVJA 1GPWA 2DZUA 3SGUA 2RH9A 3W74A 1W5NA 3CIXA 1HFBA 2EAWA 3SI9A 1QPRA 2Y6ZA 1YXDA 3TFXA 3L9CA 5FF4A 1SPQA 4FIRA 4PODA 1GVSA 5LHFA 1ME8A 4WY0F 3WFAA 2NX9A 2A5HA 3QQ0A 5AFDA 3ABOA 1Z42A 3LLDA 2NUYA 5I3KA 1QNVA 2WQPA 3P81A 4KWVA 3M0ZA 1DV7A 3CEUA 3UPWA 4BK9A 2ZRWA 1M7PA 1DOSA 4O4VA 3T4CA 4QISA 2OZ0A 4JXCA 1XCFA 3M44A 3P62A 3E9AA 1SO6A 2E6FA 4N6EA 1ALDA 4HHPA 4YCPA 4JX4A 1X1ZA 1IIGA 5FEPA 2Y7GA 1TPVA 2VEMA 3HPXA 3F1QA 4ZQPA 3LGEA 2BLEA 4O19A 2CLFA 4JTFA 3THQA 1M7OA 1XL9A 1ME7A 4OGZA 1DHPA 2C6QA 3B8DA 4AF0A 3BLFA 3PBVA 1OFPA 2ZRVA 4OHQA 4R53A 1YTKA 3TH6A 4XKYA 1D3HA 5FI8A 1FXQA 1SFLA 2CFFA 1JUBA 1XBXA 2ZZ3A 1QPQA 4NXKA 3H55A 1YDNA 4DO4A 2FIQA 1MEIA 1OFAA 2FTPA 4UTUA 3NXFA 1LLWA 3EXRA 3C6CA 3P60A 1QO5A 2PCQA 5BW6A 3AJXA 4UMAA 5LGZA 4HNNA 5D32A 3W2NA 3TKFA 1UB3A 3NPWA 3EWXA 3PBWA 4NJJA 1MZHA 3LCGA 1OYBA 2J88A 2ZYFA 4NJHA 3HPZA 3IIZA 1AW2A 1W54A 1B57A 2CW6A 3TMLA 4ORIA 2A1YA 1VYRA 2ZTKA 2B4GA 1H7XA 3L21A 5G5IA 2NV1A 3VFLA 1VQTA 3UWQA 1MXSA 4M7SA 1T0OA 1FWNA 1G69A 5F1UA 3W7QA 1FWTA 4ZL1A 3HBLA 1GVRA 1QOQA 1U83A 2ISVA 5AHLA 5KZDA 3QMRA 3C4UA 1FDZA 3CPRA 3I65A 2EGZA 3UWYA 4FNRA 1I2RA 4UTWC 1SO4A 2XN2A 1KBIA 3B0UX 3M7WA 4UTTA 3HJZA 1NVMA 1SO5A 5KITA 4JY9A 4G1KA 1DQXA 1LRNA 2QCGA 2PRLA 3LM7A 4LUJA 2I9EA 3HG2A 3RK8A 3T40A 5MHBA 2ATSA 2X1UA 4CNPA 2H6RA 4JR5A 4UTIA 4RCXA 1QPNA 3RFAA 3CM4A 2HTMA 2FPTA 4JY8A 4WX2A 3STGA 5L6UA 4X2RA 3PF3A 3DXIA 1TV5A 3F4NA 2QAPA 3QEZA 2QCCA 3GXTA 2B7OA 1AMKA 1LTDA 3A5VA 1AL7A 1P4CA 4FXRA 3LXAA 3TQVA 3ZFHA 3GDTA 3QJAA 1TMHA 4QM1A 4PTNA 1ZJIA 1OX4B 4LU0A 3LHVA 1S3HA 1QPOA 4LUIA 5KINA 2QR6A 5K9XA 5F1VA 2CLHA 4O50A 4FX6M 5EKYA 3ATZA 2CU0A 3NNTA 1UUMA 3N19B 1RD5A 1A5AA 3MWAA 4TR9A 3S8HA 5AYXA 2DZVA 4MFDA 5FESA 3QH2A 2BZNA 4LVDA 2X1RA 3W7LA 3G1XA 2YGYA 2GQ9A 3R12A 3TE9A 1EWDA 4HSOA 2QF7A 2ZFAA 3N2MA 5HJLA 2FLIA 3TJLA 4QJ1A 5G2HA 4JTTA 1TPC1 1BWLA 2ABBA 4NXSA 4M5PA 2Y70A 3NL6A 3Q94A 4IMEA 1R30A 1KFJA 3Q58A 1R47A 5CSRA 3BW4A 4EF9A 1ZCOA 3DENA 1O95A 2CLOA 1KFKA 3PG9A 2VENA 5DCDA 1EP1A 2Y85A 1OK4A 5K4XA 3NPVA 1VYSX 3NDOA 3GLCA 1TQXA 2FPVA 1ADOA 1AK5A 3W70A 1SZNA 3GZ3A 4O1BA 1EIXA 3IEBA 1G67A 5AHFA 2E5DA 1F74A 3CC1A 1NEYA 3B0VC 1LOSA 4O14A 2ZRZA 5EL1A 1SQ7A 5LNUA 3IIPA 4DO6A 4WY0B 2Y7DA 1VJIA 2NLIA 4A2SA 2QJGA 2J27A 4H3DA 4DPPA 3CB8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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