3TQVA

Structure of the nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from francisella tularensis.
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
280
structure length
276
Chain Sequence
NTDQINKVPNDIVTRLVRESLAEDIATGDITAQLAEDIDTTAFCITREEMILCGQDFANEVINQLDKNIQITWLYSDAQKVPANARIFELKGNVRSILTAERTILNFIQMLSGTATVTNKLVKLISQYKTKLLDTRKTIPGFRLAQKYAVRCGGGFNHRIGLFDAYLIKENHIGIAKAVTKAKKLDSNKVVEVEVTNLDELNQAIAAKADIVMLDNFSGEDIDIAVSIARGKVALEVSGNIDRNSIVAIAKTGVDFISVGAITKHIKAIDLSLQVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Rapid countermeasure discovery against Francisella tularensis based on a metabolic network reconstruction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
molecule tags Transferase
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
total genus 86
structure length 276
sequence length 280
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2011-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tqvA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3tqvA01
1MO0A 3M16A 3PULA 4FNTA 4NX5A 5DCDA 3MP5A 3RFAA 1AW2A 1DL3A 4AWTA 4XTDA 5J5RA 1ME9A 3TSBA 1TJPA 1GVFA 1L6WA 1EUNA 3NR0A 2A7NA 2BXVA 4FO4A 2Q3OA 4DBEA 2O7SA 1Q45A 4HIBA 2V0TA 3M7WA 3LHTA 2B7NA 2BLEA 1JCXA 3P74A 3B8DA 3B03A 3W1QA 2BZNA 2OCZA 3E12A 2B4GA 4LTSA 4UFKA 5AOUA 1G7VA 4ZQCA 4UTTC 3IRDA 4PC8A 5HULA 1B57A 2WV8A 2TSYA 2R8WA 1FWTA 1PHQA 1A50A 2I9EA 2GOUA 4UUIA 2NXHA 3I7SA 2Y61A 5DCEA 3PG8A 4JX4A 1UJPA 1Z48A 2V8ZA 3EXRA 3W7NA 4QAIA 4LVFA 1SPQA 4YLWA 1TPDA 4UTWA 1GVRA 2Y63A 1MEHA 3QYQA 1P4CA 4P61A 3LRMA 2A85A 3W86A 1VC4A 3CTLA 1OK6A 2ABAA 2GVGA 2V2CA 3DKJA 3S1UA 4TMBA 1E51A 3ZS4A 4NJGA 3C2VA 4UC5A 5CG7A 1JRCA 3QMSA 1YPIA 5HWMA 4N02A 1FXQA 4N9DA 2VEKA 1QNVA 2FIQA 1J2WA 3W2KA 1YXCA 2QDHA 3QH2A 2FB2A 3CC1A 3L21A 3NL2A 2FJKA 3IIZA 1XC4A 1A53A 4FNUA 1O60A 2I1OA 2QCLA 3TAKA 3HF3A 3TQVA 4C1KA 1GZGA 4Y6GA 4CQ9A 4RR4A 5LNRA 4Y90A 2E09A 1OHLA 1TMHA 1IIGA 3RF9A 1FY6A 3SY5A 4JDYA 3SI9A 3M44A 1RQBA 2V2DA 3S9YA 3C56A 4UTHA 2H3DA 3ZWTA 3LHWA 2BWGA 4M6QA 3EWZA 3GDKA 4R33A 4AMAA 3B06A 1U5JA 2Y7DA 2VFEA 1WOAA 4FIQA 3L5LA 1TPEA 2XFWA 2EGZA 4TR9A 3YPIA 1TPWA 5D2VA 3E0IA 3N34A 1FDJA 2OT0A 1OYAA 4O16A 3G1AA 4LRSA 4UR7A 4MZYA 3HQ1A 1H7WA 1W3TA 4GUIA 5KZMA 2C6QA 1A5BA 1ONRA 3DHFA 3WJYA 5FF2A 2FPVA 4LC6A 1KBJA 5HWJA 3OEXA 3KRSA 1FWWA 2P1FA 3BPWA 2Y6ZA 3RNDA 4KWWA 4TU1A 1LROA 5D09A 1RV8A 1SZGA 5CZTA 3F4WA 3B0UX 2CZEA 3W7QA 4QQ3A 3UPBA 1PV8A 3UY7A 4RZ6A 1H60A 4KKXA 4N2YA 4RXGA 3TDFA 2GPTA 4O57A 4PL2A 3WK2A 4WUIA 5DBTA 4UTWC 1OFRA 2QDGA 4Q33A 3E9AA 5CPMA 2YSWA 2TRSA 4MY9A 6TIMA 5G1TA 2RFGA 4JYFA 2EPHA 5G4EA 3V75A 1SFLA 3TKFA 3HGOA 1EIXA 1ZJIA 2ZRWA 2CW6A 1T8XA 3HPXA 4H3DA 1UBSA 3IV3A 4KWVA 1TREA 3NL5A 3FOKA 4TIMA 4FB7A 1KLZA 2R14A 1EUAA 4GUHA 1TPH1 4Y9AA 5D33A 4PODA 2Q8ZA 1TRDA 3T55A 3W2JA 1TPFA 1VLWA 1C9DA 4XBKA 2NUWA 4R53A 2WPBA 3NO5A 2E1DA 1B4EA 1O95A 3DGRA 2ZA3A 4JYEA 1DOSA 3W7OA 4K7YA 3Q37A 5DLCA 3A5FA 3OVPA 4LS0A 3CPRA 4NJKA 4WOQA 3HG3A 2GQAA 4YWIA 1DORA 4JTKA 5I3GA 4O28A 4XUGA 4NJIA 3L5AA 3UWZA 1J5TA 2NX3A 3W71A 4JGDA 5K2ZA 1PCWA 3HBLA 1RZMA 1TV8A 4WXYA 3IIPA 3DI1A 2V2HA 1PVNA 3VI2A 3N3MA 3IVTA 2G96A 1LBMA 1PCKA 2PRLA 4LUJA 3FKKA 3LCIA 5FF0A 4ZQMA 3S1WA 4NVTA 1FCUA 3MYOA 1TV5A 2J24A 2EF9A 1H7PA 2UV8G 4WX2A 4BI7A 1UUMA 3G3DA 3A5VA 5AHFA 1VGAA 3G0XA 4DPPA 1GG0A 3OBKA 3CWNA 1KFLA 4KFOA 1G7UA 4JTHA 4O4WA 1S3HA 1TTQA 3NQFA 4XZ9A 4EF8A 4XBSA 1O4UA 5C55A 3UWWA 4FEZA 1X1ZA 3C2RA 5CZ0A 5CSRA 3E49A 3W1AA 3NM3A 1FCQA 4Z0JA 2Y88A 1EA0A 3UXAA 4Y96A 2O7QA 1XXXA 5FESA 2Y85A 1P5BA 3HPSA 3GDLA 1LM1A 2ZRVA 4JEQA 3SGZA 1Q6LA 5HQEA 1YDNA 5AYYA 1R46A 2J88A 4AH7A 5HMSA 7TIMA 3C2FA 3NDOA 4CQAA 5BRBA 3MHUA 4WY0A 2X1SA 2H8ZA 4ZL1A 2ZCGA 1GJPA 3LHVA 3LHYA 2YYTA 2ATSA 3VCRA 2G95A 1K03A 1XDMA 3QEZA 4OQVA 3IIXA 4DO6A 4ZMGA 3PY2A 3P60A 5LNSA 3GKAA 5KZEA 1YLVA 1T99A 2WJZA 3M6YA 5BMXA 1EEPA 3GK0A 4RKAA 4CCDA 5J5DA 1YXDA 3LDVA 1WBJA 2ZZ5A 2NWSA 5A5WA 3UPWA 1QO5A 4H6KA 3NG3A 3S42A 1FUYA 1SO5A 4UTJA 5ABTA 2ISSA 5EY5A 3LXAA 3P62A 3JRKA 2VKZG 2FTPA 1OFAA 3VE7A 2J6XA 2Q3RA 3FA5A 1KLYA 4QM1A 4A2SA 2QR6A 2ZA2A 1LORA 4RZ4A 4EVZA 3LERA 4OV9A 1H7OA 3W1TA 4DEFA 4BI5A 5G2WA 3KVKA 1AK5A 2QCFA 3GDRA 1F6KA 3T40A 3R2GA 3N2XA 4HPJA 3PSVA 1W5QA 4MKNA 2WKJA 2ZQ0A 3M5ZA 3NQAA 5HUOA 5EYWA 4BF9A 3MP3A 3NPXA 4JTIA 2X30A 1VZWA 3GNNA 1V5XA 1JUBA 3RK8A 2Z0IA 4GNJA 1QDSA 4XKYA 4AWSA 1H7NA 1W3IA 2PC4A 1MEIA 4JICA 4HNTA 3LHZA 3W22A 3LBMA 4JS3A 4K6AA 1Q3NA 2A1YA 1QPNA 4I7UA 5AHNA 1FXPA 3B0PA 1VCFA 2AAMA 3DU0A 3OG3A 4Z1AA 3TQ0A 5LKYA 2E6YA 4JTFA 2BX7A 3BGJA 1VYRA 4RJEA 1N55A 2NV2A 3BG5A 1QPOA 4HPXA 1R2TA 1SUXA 3N73A 1CW2A 3QSTA 4FXSA 3ZWSA 1W54A 4NU7A 2A6LA 3HMJG 3MUXA 2CLKA 3F03K 4MFEA 1S5WA 4R7JA 5LHFA 3BW2A 4FIRA 2DZWA 2DZPA 1XFBA 3G1XA 4Z1DA 3DFNA 3FYPA 5FEPA 4A2RA 1S5VA 1W0MA 2JKEA 4UMBA 3P84A 4X9SA 1O94A 3G8EA 2CLEA 2V30A 3MWAA 4NXKA 3TR2A 4LVDA 3H53A 3HGSA 3JS3A 3EXTA 3QC3A 2TYSA 2X16A 1VH7A 2XN1A 3DENA 2VFIA 4MZ8A 5I3HA 4CNPA 2Y7GA 4LOCA 1K7FA 1BEUA 3E02A 1KBIA 5U4NA 2C19A 3NEVA 2PURA 4HNNA 2QCDA 2HS6A 1IXNA 2B0MA 2VFHA 2X1TA 3STEA 3MHFA 2CU0A 3MYPA 4DBDA 3NQ8A 4LS2A 1W31A 4JYDA 1GOXA 3O63A 5LGXA 3FS2A 1JULA 2CLOA 3KHJA 4GXMA 3U2OA 2TMDA 3L0KA 4DO4A 2QAPA 2QAFA 3DAQA 5D04C 3MJYA 4ADTA 5BMWA 3W1NA 4HN4A 4MPQA 1TPB1 3HG2A 4O1BA 4MUZA 2XN0A 2DZXA 4UTIA 4M7TA 3ABOA 1DQXA 1SO4A 4DO5A 3LCHA 3L0NA 1GVQA 1GEQA 3LI0A 4JXCA 5D37A 2YX0A 4GUFA 5G2HA 1FDYA 4ZQRA 1SO6A 2YR1A 4O52A 1X6UA 4QITA 3A21A 3S5YA 2R94A 5EBUA 4JX6A 2ZRYA 4NZJA 4JY8A 3C61A 5K9DA 3DXIA 1KFJA 1KW1A 5F1UA 3S8HA 3O16A 3CB8A 3PC0A 3TA6A 3R12A 3BW4A 1JR1A 4Q4KA 5F2GA 3FLUA 2WNQA 1W5MA 3USBA 1KM0A 2F7FA 4TO8A 1WBHA 3TE9A 2ZDRA 5AC7A 1FCBA 2W0UA 4UTKA 2E68A 4A22A 3ABRA 4LW7A 4KFPA 4JTJA 2YYUA 1IIHA 5D38A 1L2UA 3HIJA 3W1LA 4J9JA 3WFAA 4B5NA 3W7HA 3GNDA 3H54A 1Q6QA 1MZHA 3R13A 3SR7A 3UQNA 3L68A 4LT9A 4N4PA 2GVLA 1IXPA 3LCGA 2P10A 3LLFA 1G69A 4RX0A 1F74A 1OX5A 3L9CA 1YADA 5BW6A 2FFCA 3TUUA 4M6VA 3I7RA 1CX9A 2Z1BA 1XKYA 1ZALA 2QJHA 3FJ6A 3W87A 3UZ5A 4PFMA 1LLZA 3LI1A 1OABA 3QSRA 5FEZA 3N14A 1LTDA 1ZENA 4DELA 3F4NA 4O54A 3DI0A 1VHNA 3T4CA 4BWLA 1VCGA 5I3KA 4GUJA 2KZHA 2LLEA 1KM3A 2FB3A 1TJRA 2YFOA 4HNVA 4KFNA 3W23A 1BWKA 1KM5A 2QEZA 3TK7A 3MI6A 5BOOA 2DJLA 5AC6A 4JIPA 5I3FA 5E0KA 3NA8A 4O18A 1TPVA 1VRDA 4ADUA 3KRZA 3I6RA 4HT3A 1O5XA 2NXIA 2ALDA 4N6EA 1TSIA 3CHVA 1I8JA 3W83A 2J9YA 1K8YA 4UXDA 4LC8A 1XBZA 3W7DA 4JR5A 3MBFA 1G67A 3WK3A 1W5NA 3UWUA 4G1KA 3QFEA 3PWAA 5D05A 4WOZA 1WV2A 3W70A 3CM4A 3SGUA 4MIMA 1XI3A 1F5ZA 2CLIA 4O17A 4OU1A 3UD6A 4OV4A 2CLFA 4AXKA 5C2XA 1KFCA 3PG9A 4FNPA 3TC6A 4ZVJA 4S2BA 2XN2A 3ZR4A 2Z6JA 3JR2A 3W7EA 3TC7A 3W7KA 1S5TA 3LB0A 1GYLA 3LTPA 3UXDA 3FKRA 2CWNA 3TFXA 4DF2A 2JK2A 1XUZA 1P1XA 4IGHA 1TYGA 4N6FA 1F76A 3C0JA 4S1FA 3STGA 3GKFA 4E2BA 2E5CA 5EMUA 2E6AA 5EA9A 2A4AA 2JKAA 4O1DA 3W1MA 3VNDA 1KM1A 1GG1A 1ZNNA 3HG4A 2B7PA 2YCEA 3KOFA 5AHIA 1LDCA 5LNUA 2BSLA 3CT7A 1B9BA 3GAYA 2FPTA 1OFEA 2YGYA 3EX3A 3CEUA 5CZJA 1L6SA 3R8RA 1JCYA 4BWLC 1N7KA 1SU5A 4D2JA 3O06A 3UWYA 5LSMA 2YPIA 3LBCA 3QQ1A 5LNWA 3IVUA 2R91A 3NM1A 1I2NA 5F1VA 4IMGA 3W7RA 2QF7A 2PRHA 3M9YA 4QISA 3TSDA 2I14A 3MI2A 1KV8A 1F2JA 1FX6A 4MLRA 3P82A 3HPZA 4WXZA 4OBTA 1ICPA 3DHDA 4BR1A 1M6JA 2RHGA 2ZTJA 5G5IA 1QWGA 4EF9A 4JIQA 3R89A 1K7EA 3QF0A 1BTMA 3F1QA 3UY8A 2Z6IA 4MY8A 3CWOX 1EB3A 3NPWA 3ZFHA 2NX9A 1JQXA 1FQ0A 2A7RA 2QUUA 1FBAA 1OX4B 1UASA 3NQ7A 2A5HA 3S5ZA 5KMYA 2YXGA 5FF3A 4GE8A 1KM6A 1EWDA 4N9EA 2YFNA 4POCA 2V81A 4O13A 3HOJA 2VENA 1ALDA 1GQNA 2C13A 2E77A 1IF2A 2ZTKA 4WY0F 3SIZA 3EKLA 1TO3A 3IEBA 2JBMA 3LRKA 2V9DA 3IGSA 1I4NA 4LWWA 1ZY9A 1OFDA 4O0ZA 1OF8A 4L4MA 5KTLA 2NZLA 4UFJA 1I2OA 4A3UA 4H4IA 4JTUA 3OA3A 4AF0B 3QMRA 3TFCA 4WZHA 1V7YA 3TX9A 3M5VA 3EX6A 1IGSA 4NX0A 4JDBA 1HL2A 1G4SA 3NYZA 3KVMA 4MYAA 2Q8LA 4ALDA 4IPJA 2ZRZA 2ZFAA 3M43A 3MP4A 1ZAHA 1W1ZA 3TW7A 4DXVA 4FX6M 3C6CA 3NPVA 2F84A 3VKJA 3CU2A 4JNMA 3RLUA 3N9SA 1GVSA 3W3OA 5D02A 2WO5A 1LP6A 3DZ1A 3NQVA 1NEYA 3DH7A 1H1YA 1L6YA 3PAJA 3G3MA 1LCOA 2ZZ2A 4NZFA 4JY9A 1KTCA 3GX9A 4O4VA 3L5MA 1QCWA 1DVJA 4MYXA 3HG5A 1XBYA 3STFA 2WOQA 3EXSA 2NUXA 1TB3A 3SJ3A 1TTIA 3PB0A 4IX2A 1HG3A 5AHEA 3CQ0A 1QPQA 4Y8FA 3THQA 3LCXA 1YDVA 1IXQA 1VLIA 5IM51 2YZRA 4IMCA 1OF6A 2WSYA 1H51A 1RD5A 1LRTA 4UFMA 3G1SA 3DFQA 4YMZA 5I3IA 3PF3A 4E2DA 3ABSA 2A0NA 3R5EA 1HO4A 1SW7A 1XUUA 4P2VA 3LGEA 4IX0A 4UR8A 3HB9A 1VR6A 3SSJA 2ZZ4A 1JUEA 3TH6A 5AHMA 2VEPA 3A9IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1A53 A;  3P2V A;  4FNU A;  1O60 A;  2I1O A;  2QCL A;  3TAK A;  1XLH A;  5FL0 A;  1GZG A;  4RR4 A;  3ZR5 A;  1CIU A;  1JD7 A;  5LNR A;  4L65 A;  2E09 A;  1OHL A;  3MV0 1;  1IIG A;  3LPO A;  2WC4 A;  4R7W A;  3UXL A;  3BL3 A;  4TQT A;  5CBI A;  3H12 A;  4K3Z A;  3SCN A;  1RQB A;  5CBJ A;  1V02 E;  3WNK A;  1US0 A;  3B06 A;  1U5J A;  1WOA A;  2OR2 A;  1W1B 1;  3K5X A;  2IS7 A;  2EGZ A;  3E0I A;  4MF4 A;  1ZBW A;  1N63 B;  3TN5 A;  2D0G A;  1H7W A;  2DIE A;  1KBL A;  4LUS B;  3WF1 A;  3DHF A;  1GOI A;  2FPV A;  4MNM A;  1PUD A;  3N4F A;  1XLL A;  2P1F A;  3BPW A;  4O0Q A;  1LRO A;  1SZG A;  3B0U X;  2ESC A;  2XUC A;  3UPB A;  1PV8 A;  1H60 A;  4YIW A;  3WK2 A;  4CNT A;  5DBT A;  1UKO A;  2WHK A;  2CBI A;  2GVY A;  2OMD A;  4RW3 A;  1WKE A;  1J18 A;  2J7C A;  3P93 A;  3RPD A;  1V7A A;  3BDK A;  4Q6J A;  2QEX H;  4BF5 A;  4JYF A;  2QIW A;  5G4E A;  3V75 A;  1W6T A;  3HGO A;  2WHL A;  3UCD A;  4KW2 A;  2QPU A;  4C5Z A;  2R1N A;  4IQE A;  1TRE A;  2GGJ A;  3FOK A;  4FLQ A;  4TIM A;  4FB7 A;  2ZKM X; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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