3TQVA

Structure of the nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from francisella tularensis.
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
280
structure length
276
Chain Sequence
NTDQINKVPNDIVTRLVRESLAEDIATGDITAQLAEDIDTTAFCITREEMILCGQDFANEVINQLDKNIQITWLYSDAQKVPANARIFELKGNVRSILTAERTILNFIQMLSGTATVTNKLVKLISQYKTKLLDTRKTIPGFRLAQKYAVRCGGGFNHRIGLFDAYLIKENHIGIAKAVTKAKKLDSNKVVEVEVTNLDELNQAIAAKADIVMLDNFSGEDIDIAVSIARGKVALEVSGNIDRNSIVAIAKTGVDFISVGAITKHIKAIDLSLQVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Rapid countermeasure discovery against Francisella tularensis based on a metabolic network reconstruction.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
total genus 86
structure length 276
sequence length 280
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2011-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tqvA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3tqvA01
3EB2A 4RXFA 1OG0A 2VFFA 2GJLA 3O05A 1XBZA 1W8SA 4IOTA 5HR7A 3P7YA 3EX6A 3LGEA 2A0NA 4GWEA 3QPZA 2P10A 4RJEA 3LHVA 4OWGA 3NVTA 4MY9A 1VYPX 3W86A 2V2DA 5G1TA 3T7VA 2X2GA 2NUWA 4MY8A 4RV8A 3E12A 3NQFA 1ZJIA 4JNMA 4HSNA 2JGQA 2Z6JA 1LM1A 1SO6A 2E6FA 2TRSA 4QNEA 3O6DA 3L0KA 1GYNA 1JRBA 1T8XA 2EHHA 3EEGA 3FJ6A 4AWTA 3DU0A 4EIVA 1EP2A 4EWND 3LI1A 3NQGA 1XXXA 5AHFA 3KVKA 3PULA 4RR4A 4O12A 4FNQA 4JN6A 3UZJA 2WKJA 4NZFA 1Y0EA 4UTWA 2WQPA 3G18A 2RH9A 4JIQA 3UWQA 4NJKA 5I3GA 3TSDA 2ZA1A 1DKWA 2TPSA 1LLZA 3FS2A 1BEUA 3A24A 3NQ6A 3G0UA 3W22A 1NVMA 1LLWA 1WV2A 3W75A 1JCXA 1SSGA 2Z1BA 3W1QA 1PVNA 4FXSA 3FYOA 1O5KA 3SW6A 4ZVJA 1J5TA 3SSJA 3DBPA 1AL8A 4Z1BA 3C6CA 3F03K 3R12A 1TRDA 2Y7FA 1C9DA 4O10A 1KM3A 5U7SA 3FLUA 1G6CA 2CZ5A 5CPOA 5HMSA 2FB3A 3LXAA 4S1FA 1AW5A 3O1NA 3BGGA 2V5LA 1B4KA 1SU5A 2E5CA 3W1XA 3MP4A 3JR2A 2IQTA 1GTEA 2V30A 1P4CA 4LV4A 4ALDA 2E6AA 4JYDA 4O52A 1SO5A 3OHIA 3UPWA 1VGAA 1F74A 4A2RA 3R8RA 4ZQCA 3GYEA 1GZGA 3E49A 4N4QA 1W56A 1ZAHA 2YFNA 2A7PA 3MHUA 1TPB1 1IF2A 3M44A 3PY2A 3SY5A 2QF7A 2E5BA 4RXGA 2ZRYA 3MYOA 3NA8A 4NU7A 3M47A 1XKYA 3MBDA 3EWBX 1LDCA 3CPRA 4Z1DA 3PUDA 4DF0A 2TMDA 4ZZ9A 4UFLA 2VELA 2B0MA 2QJIA 4GC4A 3V75A 4WX2A 1TYGA 2YDAA 1O60A 1VR6A 3GNDA 1K8ZA 4WXYA 4HNTA 3OVRA 1XUUA 1I45A 3W70A 2QCGA 2CFFA 3H55A 1B9BA 3M6YA 3P80A 3NGJA 4JY8A 3TROA 5F2LA 3LXBA 5EBUA 3IRDA 1NAL1 3MMTA 3CEUA 3LI0A 3I68A 2OX1A 3SIZA 1M5WA 1EPXA 4UCGA 4O4WA 5DCEA 2C15A 2QDHA 3STCA 5D38A 3MUXA 4G1KA 3MYPA 3S5ZA 2G5WA 2W79A 4O19A 4N4PA 2OCZA 4QNWA 5F2GA 5FEZA 3QH2A 3NPWA 4K8EA 1DQXA 3C4UA 4PA8A 2FQIA 3OIXA 4BWLC 5KTLA 1YTKA 2QR6A 3ANYA 2PC4A 2AQWA 2RDWA 2Z0IA 5DXYA 1Q6OA 5DY2A 1R2SA 5D37A 5G4EA 2BZNA 1SZFA 1S5TA 3L5LA 1MEIA 4LVFA 4JGDA 3G1YA 2FDSA 3IIXA 3DHDA 1KM5A 3B06A 2HS8A 1W3TA 1HTIA 1VZWA 3P74A 3SECA 5BMXA 1WQ5A 1KTNA 2JKAA 4XZ9A 3SFKA 1S5VA 1QPNA 3QJAA 4LOCA 5K7JA 2GVLA 1J2WA 5D30A 4MJMA 3LOTA 1W5PA 3LLFA 2NXGA 1WX0A 4BR1A 2B7OA 2HTMA 3HOJA 1S3HA 5HWNA 3MP5A 2DZVA 5U4NA 3HG4A 3W07A 4O28A 3IIVA 4Q32A 1RVGA 1ZY9A 4AVFA 3W9ZA 5KZMA 1LROA 1AMKA 4JICA 4UR8A 4HNUA 3T78A 3W7RA 3P8JA 1YTDA 5BRBA 2ALDA 5K4XA 2F7FA 2AAMA 4AHPA 4KKXA 3S9YA 4AXKA 4CNNA 4M6QA 1W5OA 2EF9A 3NPUA 4K7YA 4E0CA 3FOKA 5H91A 5AC8A 1JQXA 4C1KA 3YPIA 1QOPA 4P61A 3A5VA 1WA3A 2CWNA 3NQ7A 3GDTA 4MFEA 1L6SA 4XBKA 3W2KA 4GUGA 2QUUA 3S0CA 2WJZA 3CB8A 1I2OA 1VHCA 5EA9A 3PBWA 3WK3A 4TO8A 2ZA2A 4HT3A 1YXDA 2CLLA 5AHIA 2ZBTA 4KFOA 2QUVA 5LHEA 1VS1A 1F7BA 1VH7A 5CZSA 3GX9A 2A5HA 4K37A 3B0VC 5EMUA 2ZDRA 1QR7A 5DELA 3F1QA 1KFKA 3S1VA 1IXPA 1H1ZA 1O4UA 5LNVA 5DBUA 4N2YA 1GJPA 1SW3A 4O50A 1A5BA 1XBYA 4Y96A 1ME8A 4C1LA 2Q8ZA 5D09A 4FO4A 2CZDA 3UQNA 3NM3A 3BW3A 3QW3A 1PV8A 2J9XA 2UV8G 4DXVA 2DU2A 3ZFHA 5CPMA 3A9IA 1S5WA 3G3DA 3H53A 2GQAA 2W6RA 3MWAA 4ZQMA 2A4AA 2Y6ZA 3M43A 1YXCA 2ZTKA 1X1OA 3DZ1A 1A5CA 2H6RA 3P8IA 3GAYA 1KFJA 1KTCA 4HSOA 4JTEA 3CWOX 3PC0A 3A21A 3KRUA 4QM1A 3O6CA 4UIOA 1ZALA 4OE7A 2C19A 4CCEA 1AW1A 2WNNA 3EWWA 5J5DA 2WSRA 4HPXA 2ZTJA 4FNSA 4LVAA 5LHFA 1EA0A 3UYCA 5CGQA 4JTSA 1WOAA 3PBYA 1FCUA 4LS0A 4Z1AA 1W31A 1O94A 1CI1A 2ZA3A 2ZZ1A 1LORA 4O16A 4H3DA 4NX5A 3G1DA 1L9WA 3Q58A 3ELFA 4DELA 5BNKA 3CQ0A 5F1VA 2J9ZA 1SZEA 3B8DA 1SW7A 4GNJA 3M41A 2VEMA 3HGSA 3BLEA 3W7DA 2ZZ4A 3HPSA 2J6XA 3L2IA 4UNKA 5FEWA 3FEMA 4EF8A 1M7OA 5FI8A 1DHPA 2Y85A 5E93A 4TIMA 4ZMGA 2YSWA 1BWKA 3NL5A 4ZQNA 1G7UA 3R13A 3S5OA 3UWYA 2RHGA 5J5RA 4MPQA 4R53A 3C2OA 3EKLA 4O11A 5G5IA 4YL2A 3Q2DA 5E1QA 1H63A 2PRHA 4IGHA 5HNRA 1OFQA 1NFBA 1TPH1 2Q3OA 4WY0A 2J9YA 1AL7A 1RR2A 4FNRA 3LHUA 1WAUA 3TA6A 1GT8A 4UTWC 1B3OA 3N2MA 1R46A 2QKFA 2ISSA 1BKSA 1H51A 3E9AA 3B05A 2Y7GA 3LDVA 2PRLA 3HPZA 1UCWA 2FPVA 1IXNA 2ZRZA 3QPYA 4GE8A 7TIMA 1TSIA 3TQVA 3LBMA 4X9SA 3TR2A 3TX9A 3Q37A 4LS1A 4RZ5A 1YLVA 1DOSA 2H3DA 4CNPA 3L5AA 1T99A 2O7QA 1JCYA 1RQHA 1K02A 1R30A 4UTLA 4HKPA 4R7JA 3TFXA 1FCQA 4M6PA 3F4WA 2CLEA 3W7LA 5C54A 3MHFA 3GR8A 2VFGA 3O06A 4UTKA 1YTEA 3STEA 1SW0A 3DFOA 3NL3A 3L67A 4NXKA 4EOUA 4Z0JA 1H62A 3NR0A 4R34A 4DPPA 4DPQA 4A2SA 3OVQA 3W1NA 3SGUA 1ZHAA 3EKZA 5GVJA 3RLVA 1KM6A 1UASA 4YMZA 4IPIA 3B03A 4EF9A 4MLRA 2XN2A 4XKYA 3IVTA 1DORA 3T55A 3CTLA 3TNOA 4UTJA 4GUHA 2H8ZA 5KINA 2VC6A 1DQWA 2QDGA 4HPJA 4RKAA 1GVRA 2Y63A 4LNYA 1UBSA 5CZJA 2CLOA 4IXHA 3QQ1A 1OYAA 4N02A 4GUJA 3M5YA 4O1AA 3ZWTA 4TMBA 3SGZA 1OX5A 2NWRA 3N73A 2FLIA 4HN4A 4IXXA 3FKKA 4DO4A 4POCA 4XTDA 2VFHA 4KWWA 1JCNA 1XM3A 1JRCA 4TU1A 3GVGA 5FF0A 2X1UA 3TSBA 4GFSA 3AO0A 2QCHA 1YPIA 3R89A 2TYSA 1ML1A 4XKYB 4IMCA 2BTMA 3M7WA 1FQ0A 1SFLA 1Z48A 2CZFA 3L0GA 3QMTA 2DORA 3LCFA 4GBUA 3VNDA 5AN7A 1SPQA 2LLEA 1RV8A 1KW1A 4QQ3A 3DFSA 1B57A 4CQAA 4A21A 2O7SA 1KA9F 2WO5A 1U5JA 1ZFJA 3W88A 4WOZA 1V7YA 5AC6A 1FWTA 5I3IA 1RQEA 5F2IA 2Q3RA 4CCCA 1K8XA 2Y61A 4AEOA 3LRLA 1F05A 3EWYA 3WK1A 3C8FA 2WNQA 1QFEA 2A2IA 2W0UA 3THAA 3O6YX 3T44A 3QZEA 1GPWA 2X1SA 3SJ3A 3TKFA 5HUOA 3FJLA 1CW2A 3CWNA 1Z41A 1QMLA 1QNVA 3TE9A 3R2GA 5CZTA 1P0NA 3K30A 3NDOA 1G67A 2ZQ0A 1TPFA 4FIRA 1LRQA 1AK5A 2J27A 4JTHA 3TW7A 4IQLA 3B4UA 3MP3A 5HINA 2BX7A 3W2LA 3RMJA 3BLIA 5AB3A 1WBJA 2NLIA 3DFPA 3E02A 4QJ1A 5D32A 1AW2A 4O54A 5AC7A 1VCGA 3NQ2A 2CLMA 3SZ8A 3ABSA 4IUOA 3I7RA 1K7EA 1GYLA 4Q4KA 4QITA 2QCDB 4E2BA 1GVOA 1XDLA 4ZQPA 4NT0A 3EX4A 2QCNA 2VKZG 2JKEA 3ABQA 4J9JA 4Z1CA 5EYWA 2C14A 3NNTA 3GDMA 2FPTA 3QMRA 4HNVA 1YADA 3W1UA 4JTJA 3CIXA 2V81A 1KLZA 4XWUA 3M0ZA 1QPRA 4BI6A 1OYCA 3MW7A 1DV7A 3QSRA 4LT9A 3GNNA 4WD0A 3USBA 2VEIA 1ONRA 1HUVA 3EWUA 2I1OA 5L6UA 3TIMA 1IIHA 3EXSA 1NF0A 3BLFA 3KOFA 3OG3A 2QJHA 3FYPA 4MFDA 2WSYA 2FB2A 5I3FA 4LRTA 1KFCA 2ZRXA 2DP3A 1L2UA 4ADUA 1YXYA 3P84A 4MJZA 1TPEA 4W9TA 5FF4A 4GUFA 3TDFA 3TUUA 2FFCA 3W7PA 1LOLA 3BG9A 4O13A 5FEPA 4JTKA 4L4MA 1IGSA 3KHJA 3LBCA 4Y9AA 2XN1A 3GLCA 4MIMA 1VCVA 1GVFA 2ZZ7A 4GJ1A 4WXZA 1LBLA 2DJLA 1SFJA 2OMAA 5T26A 4L4LA 1KM2A 1MO0A 3HG2A 3CIWA 2Q8LA 4LTSA 4AWUA 3E0IA 3INPA 5D2VA 4JTFA 3HG5A 1OABA 4MLJA 4PODA 1JUKA 2E6YA 3WJWA 3P81A 3SR7A 5D05A 2C13A 3A5FA 3HF3A 5SWUA 2GVJA 5TQLA 1XDMA 4FNUA 3FKRA 3TC6A 3G24A 4JX5A 3LM7A 3UY8A 1MSSA 1BTMA 2JKPA 4BF9A 1KV5A 1KV8A 1UJPA 4JTUA 4NNBA 2CLHA 3P5ZA 4RK8A 1O5XA 1XI3A 3WK2A 1JCMP 1C29A 2WSQA 2OJPA 3O8AA 4Y6GA 2BXVA 5LNRA 3LCIA 3MI2A 5AHMA 1TV8A 2YX0A 2I9EA 2JBMA 4FF7A 5DCBA 3QFEA 1W54A 1KLYA 2Z6IA 2EGZA 4WY0F 5CZ0A 1KTBA 4UR7A 1GVSA 3NYZA 3NAVA 4O1BA 1OX6A 2A7RA 2V8ZA 1FBAA 3O63A 3DXIA 1QCWA 3F4NA 3TJXA 1FXQA 1TJRA 2R91A 4JDBA 4I7WA 1X8FA 2ATSA 2NX1A 3LCGA 4JTLA 2CLIA 1JCJA 1FDYA 5I3JA 4K38A 1GVQA 2GVGA 2PCQA 3W7IA 4UTMA 1GTHA 3S42A 3TMLA 5CSRA 3VKJA 3H54A 1I8JA 4LW7A 3PBUA 1JUBA 3W7CA 2ZRWA 4WJEA 4LU0A 3TXVA 3WJXA 5D03A 3RLUA 3PVFA 3TMQA 5HUPA 1OFEA 3NQEA 1RZMA 3TCEA 3DI1A 1N55A 2ISWA 4I9AA 1YYAA 5HR6A 3NEVA 3W87A 1XCFA 2PRMA 1E51A 1SUXA 4JDYA 4A3UA 5CPLA 4JD4A 5F4XA 4CNOA 3W7QA 2V2CA 2H90A 3KX6A 4K6AA 4CQ8A 4E38A 4UTIA 3DGRA 3CM4A 1TTPA 1PHQA 3W7KA 4GXMA 1W3NA 2ZZ6A 1LRTA 1P0KA 3L68A 3UD6A 1UUMA 1IXQA 3QQ0A 4O0KA 3W1AA 5DBTA 2R94A 1H7RA 3NM1A 3O07A 2A7NA 2BLEA 1QAPA 1DVJA 3BW4A 4NNAA 3LCXA 4LUIA 1TTJA 1KBJA 2ZZ3A 3G1XA 4ONVA 4CQ9A 4UFHA 3LHTA 1SQ7A 2E1DA 4P2VA 1VLIA 4LY8A 3W2NA 4N9BA 3C2RA 3CU2A 4LC6A 3G1FA 3NL6A 1R2TA 3GR7A 2ZRUA 2X1TA 4KFNA 1LBMA 3P5YA 3DFQA 1WOBA 3QYQA 3QF0A 5FF3A 1WXJA 2R8WA 4IX0A 3ZS4A 4AF0A 1YDVA 1HFBA 3VI2A 2C1HA 1GG0A 4FB7A 4N9CA 1X6UA 5F4SA 1UUOA 4MY1A 4O4VA 2E6DA 4PFMA 4KFPA 2A1YA 1F2JA 1TCDA 2OZ0A 3B0UX 5LGZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1V0K A;  3FLU A;  2XGZ A;  5HMS A;  3CV1 A;  3BGG A;  1XS2 A;  2R1L A;  2E5C A;  2VX4 A;  5JIP A;  3JR2 A;  1GTE A;  2V30 A;  4A05 A;  4GQQ A;  1WB0 A;  1W9D M;  4HK7 A;  2QLY A;  3SUT A;  3UPW A;  3WNM A;  4A2R A;  5FSD C;  1SVD A;  4ZQC A;  4MB3 A;  3GNR A;  3HTW A;  3E49 A;  3BOL A;  4PMV A;  4EPE C;  5I03 A;  2A7P A;  1TPB 1;  2ADA A;  3PY2 A;  4WK9 A;  2QF7 A;  3AQU A;  4RXG A;  2ZRY A;  4HA1 A;  3MYO A;  3UES A;  4WDU A;  4LHM A;  2V3F A;  3EWB X;  4Z1D A;  5FIP A;  3T09 A;  2BS9 A;  3H26 A;  4USA A;  1XQK A;  4ZOC A;  2WM1 A;  4WXY A;  3UA4 A;  1B9B A;  1N62 B;  4JY8 A;  4PB3 A;  3UER A;  3BCJ A;  5EBU A;  5CJM A;  2VDI A;  3GHR A;  1E73 M;  3V4B A;  2OX1 A;  1Q6E A;  1O1Z A;  1S3T C;  2WKG A;  3STC A;  5D38 A;  3MUX A;  1HT6 A;  2BMB A;  3MYP A;  1UG6 A;  3KOW A;  1LJY A;  4E3V A;  3CQH A;  2GUB A;  3NPW A;  4K8E A;  2P3Z A;  1CGW A;  2OOD A;  1YTK A;  3DDM A;  4IUG A;  1ZP3 A;  2PC4 A;  3S1G A;  2V67 A;  2BXY A;  2BOD X;  1TIW A;  1TUX A;  2BZN A;  1R3W A;  2WZI A;  3G1Y A;  1B5T A; 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