3C2EA

Crystal structure at 1.9a of the apo quinolinate phosphoribosyl transferase (bna6) from saccharomyces cerevisiae
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
294
structure length
267
Chain Sequence
PVYEHLLPVNGAWRQDVTNWLSEDVPSFDFGGYVVGSDLKEANLYCKQDGMLCGVPFAQEVFNQCELQVEWLFKEGSFLEPSKNDSGKIVVAKITGPAKNILLAERTALNILSRSSGIATASHKIISLARSTGYKGTIAGTRKTTPGLRRLEKYSMLVGGCDTHRYDLSSMVMLKDNHIWATGSITNAVKNARAVCGFAVKIEVECLSEDEATEAIEAGADVIMLDNHFLLECSGGLNLLCDDIDIYSTSSIHQGTPVIDFSLKLAH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
publication title Comprehensive X-ray Structural Studies of the Quinolinate Phosphoribosyl Transferase (BNA6) from Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 84
structure length 267
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2008-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3c2eA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3c2eA01
2QCDA 4DF2A 1EP2A 5H2ZA 4ICNA 2XN2A 4DBEA 1GQNA 2X1TA 2H8XA 2PRLA 4XQ6A 2C1HA 4K38A 4TR9A 4B5NA 4O57A 1LRTA 4LC6A 1GVSA 2NLIA 2Q3OA 1FCBA 1V7YA 1KLZA 1G67A 2J9YA 3MP4A 3PUOA 3EWYA 1S5VA 3FKKA 2NXIA 3NQDA 2G96A 1OYCA 3DI0A 1VCFA 3CT7A 3KOFA 4LU0A 3MBFA 1JCNA 2F7FA 4JD4A 3OEXA 5TIMA 3NPXA 6ALDA 3KVMA 4JDYA 4MYXA 4XTDA 3W1XA 4JTEA 3E0IA 4I9AA 2GJLA 2DZTA 4LRTA 1GG0A 3UXAA 4OT7A 5G1TA 3TSBA 2QJHA 3EXRA 1L2UA 4ZQNA 3FLUA 3W76A 5K9CA 1JQXA 3STGA 3R5EA 3MP5A 3T78A 4KWVA 4DO5A 1FWTA 1L6YA 3WK2A 5FF3A 3H55A 1JUEA 3HPSA 4AWSA 5K9XA 5EKYA 4OWGA 4RXFA 4WY0A 1DORA 4ORIA 1JCLA 3RK8A 3C3NA 3BGJA 1OFEA 3BGGA 4FNPA 3LRKA 3W73A 3I65A 3QYQA 3NQCA 4OQVA 1T96A 4N4PA 2EAWA 1ZY9A 3GVGA 3IIVA 6TIMA 4XUGA 2XFWA 1G7VA 1KBIA 1V5XA 4UR7A 1MSSA 4FF7A 3M5XA 2YXGA 4LUIA 2GQ8A 2DORA 4H3DA 3LCFA 1Q6LA 2Z2UA 2Y62A 3ABOA 3O07A 2AGKA 1SU5A 4PTNA 4CNOA 5AYZA 2B7NA 4AHOA 3LOTA 1G4EA 1FQ0A 3M41A 4NT0A 1WOBA 3LCGA 3MP3A 1GTHA 2YFOA 5LZLA 2R91A 2EGZA 4N6FA 5AHFA 3S9YA 3OIXA 2WSYA 2VEPA 1H7NA 1EWEA 5D04C 4Z1CA 4UFIA 5G2IA 3M5VA 3L5LA 5D2TA 4ZMGA 1W5PA 2GUUA 4IPIA 3L2IA 5F2MA 4EF8A 5HWJA 3TMQA 4DF0A 3WK3A 2CLHA 4C1KA 4MYAA 3MW7A 1VH7A 3BARA 4UTJA 3Q37A 2BX7A 1TV7A 3SW6A 3M44A 3HG2A 3NPVA 3A5FA 4YL2A 4YCPA 3BPWA 3W2LA 4AWUA 4Q33A 2B7OA 5DY3A 3PC0A 3A5VA 2WNZA 3P82A 3GDKA 1XKYA 3S8HA 1H7PA 1NEYA 1X7FA 5F1UA 4IPJA 1B4EA 4JTGA 4JTLA 1OK4A 4LT9A 3EWUA 2DJLA 5BW6A 2RKXA 3BLEA 4HT3A 2PCQA 2BSLA 2RDTA 1X6UA 3A23A 3DENA 3STEA 4MFEA 2YSWA 5LNSA 2YGYA 3N2MA 1YADA 2CFFA 3N19B 3DI1A 1DKWA 1PCWA 1FCQA 3W2JA 3I7SA 4N2YA 5G5IA 4AMAA 5IM51 4OHQA 4X2RA 3KAOA 3PS7A 3P62A 3BW2A 3CM4A 2Q8LA 1OFQA 1WXJA 3P67A 4CQ9A 1KV5A 3BG9A 4R7JA 1OX4B 3VCRA 2XN0A 2Y88A 1WA3A 2A7RA 1NF0A 4JY9A 3W1RA 5D2VA 3W7HA 4IXXA 2GPTA 1LBLA 3PUDA 2JKEA 3ATYA 3W1AA 1UJPA 4XKYB 2J9ZA 2BWGA 3HO8A 2V2HA 4R33A 3DFPA 2Y70A 3R8RA 3EKZA 1K8XA 3O16A 3LXBA 4UNLA 5FEWA 1U5JA 3M9YA 4UTTC 5KZMA 1LDCA 1QAPA 2ZQ0A 5E93A 5D37A 3LI1A 2QUUA 3NQFA 3PWAA 3F1QA 5FF7A 1YPFA 2TMDA 1KTBA 1GTEA 3NZ1A 4O17A 3F03K 5G4WA 1ME7A 2ZRWA 5IBXC 2H3BA 2CLMA 3HGOA 2VKZG 3PF3A 3ZWSA 1HUVA 2NV2A 4ZQRA 4ADSA 3BW3A 4MY9A 4MOZA 4ZQCA 2QAFA 2ZZ7A 3PBUA 4MUZA 1TTJA 3LCIA 3QC3A 4MZ1A 5LHFA 3QQ1A 4JY8A 1LBFA 4LVGA 1SO4A 1KM2A 2ZRYA 1N7KA 3EX6A 3MYOA 3TQVA 2VFHA 3KVJA 2QCCA 3PSWA 3RF9A 2DZPA 2Z6JA 1N8FA 3ANYA 3DHDA 3C8FA 3IGXA 3O6CA 1E51A 2F84A 1VC4A 2A0NA 3G0XA 4Q32A 1K8YA 5BNKA 3EKLA 4X22A 2QKFA 5HWMA 5KZDA 3BVJA 3N14A 4JYDA 3KVLA 2FIQA 1FDYA 5KITA 1JRCA 3BG5A 4KFOA 4ZQPA 1Q6OA 3DGRA 4CQ8A 3TJXA 1ME8A 4RLIA 1UUMA 3LHZA 4GUHA 3G0UA 2RFGA 4IJBA 3UPBA 8TIMA 1H62A 4JN6A 2YX0A 3PSVA 3VFLA 3W7QA 1Q45A 2R94A 1EUNA 1M5WA 1I4NA 4WXYA 5HUOA 1G7UA 3NQ6A 5AHEA 1W1ZA 2I1OA 2NUYA 1J2WA 4IUOA 3W9ZA 5F1VA 4IMDA 3F4WA 4O1AA 1XL9A 1PL9A 3MJYA 3W70A 2V9DA 1H7RA 4LS0A 1K3UA 4U4MA 4GUJA 3WJSA 2P0OA 2HTMA 2IQTA 2ZA3A 1Q6QA 4KFNA 3R89A 1HL2A 1YXDA 2Y7FA 3RFAA 1UBSA 3QEZA 1HG3A 1UASA 3NQMA 2A1YA 4TMBA 2ZZ3A 1DVJA 2OT1A 5D32A 4FXSA 4LWWA 2C6QA 3NO5A 3W07A 4ADUA 5D30A 1ZJIA 2EHHA 2EKCA 4UTKA 4S2BA 4OV9A 2PURA 3TDFA 3PY2A 5DN1A 4GXMA 2ZCGA 3KRUA 3TC6A 4IMEA 3DZ1A 3QZEA 5GVJA 5TQLA 2CLKA 4FNRA 4ONVA 2G97A 2V82A 1PHQA 1K02A 3PR2A 3LHWA 2O7SA 1JRBA 4YLWA 5CGQA 4PCFA 1G4PA 5K4ZA 2QCDB 4UMCA 5AC6A 1EA0A 2R14A 2Z6IA 5KSWA 3IRDA 5CPLA 5KTLA 2JKAA 1OFRA 2QCMA 1YTDA 1BEUA 1QFEA 2ISVA 4UXDA 3NR0A 1VYSX 4K7VA 1VQTA 1SZEA 3DBPA 1VLWA 3GX9A 3TX9A 2A7PA 1JVNA 4O53A 3PUEA 1QPNA 4S1FA 3W7RA 1Q6RA 1UB3A 2Z1BA 3GAKA 1F7BA 4MPQA 2FPTA 2YW4A 3LXCA 1D3HA 4UFLA 4LVBA 3C6CA 5CZSA 1W3IA 2ZZ4A 1FXQA 3WK1A 4BK9A 3I68A 1GYNA 2X1RA 3BW4A 2KZHA 1KFLA 2QJIA 3M7WA 1SUXA 1SFJA 1L6WA 5C55A 4AVFA 5CPOA 3HG5A 4NJGA 3ABQA 2QEZA 3G1HA 2QUTA 4M5PA 3C2OA 3GR7A 1FY6A 3LTYA 4XBSA 1SSGA 5D2WA 1UCWA 2GOUA 1Y0EA 2EF9A 3C61A 4A2RA 3S6DA 4K36A 3W2NA 1FWSA 3TUUA 1P1XA 3UQNA 3VKJA 1SO5A 1W54A 4MZYA 4WY0B 1AW5A 5BRBA 4IGHA 3LHYA 3W2UA 3HPXA 4M6PA 3TH6A 3CC1A 4NX0A 3UY8A 1EP1A 3P8IA 2C3ZA 3FA5A 1SZFA 4HSOA 4Z0SA 1A5AA 3HPZA 2Y85A 4GUIA 4HSNA 4RZ4A 3KRZA 3HGJA 2P1FA 3L66A 2FLIA 4POCA 1TYGA 4DEFA 1Z48A 1W3NA 4DXVA 3P84A 4DPPA 3G8RA 1KFKA 1T99A 1YLVA 3PB2A 5D03A 1FCVA 1YYAA 1K7FA 4ZQMA 2AAMA 1BWLA 3G22A 2E6FA 4ZZ9A 3C0JA 1XDLA 2BTMA 4JIQA 2GQ9A 2ZBTA 1H7XA 2Y7EA 1WBJA 2Y89A 5LNVA 2YYUA 1AW1A 2Y7GA 4AXKA 3OBKA 1C8VA 4MJZA 5F4XA 2FB3A 1DHPA 1FX6A 2E6DA 3QPZA 1R2TA 4Q4KA 3UWVA 4GNJA 1LZOA 3N34A 4JX6A 1FBAA 1YDNA 3F4NA 2BLEA 2I14A 3QPYA 3DFQA 3WK0A 1G69A 1PIIA 1EP3A 3LRLA 4BWLC 5J5RA 1R2RA 5D02A 3NQGA 3LCWA 3TU9A 3LERA 3RNDA 4N9EA 2QCNA 3TSDA 3W87A 4WXZA 4UFKA 4M7SA 4CQAA 2OMAA 1FWNA 3NL6A 3B03A 1TREA 4NNAA 3L9CA 4UFHA 5AHIA 2DZUA 3S1XA 4AB4A 4MFDA 5CPMA 4O0ZA 2PRMA 5A8GA 5I3JA 5ABTA 3TXVA 1H7WA 2A2IA 4FHAA 4A2SA 3W7EA 3CEPA 4UMBA 4UNKA 3CLMA 4RX0A 3W22A 3W3OA 1R2SA 2NXGA 3E49A 3LHUA 3G18A 2ZTJA 3TFCA 2ZRZA 1KFCA 1VHCA 3EX2A 3NA8A 4IMGA 1VJIA 4P61A 3G1FA 2Q3RA 2AQWA 2A5HA 1TPDA 3GDRA 4RZ6A 1RD5A 1A53A 1X1ZA 1T0OA 4GWEA 4OV4A 3TAKA 1P0KA 3GK0A 4IX0A 3A24A 1SQ7A 3FJ6A 2V2CA 4S2CA 3HJZA 4RXGA 3SI9A 1VCVA 5AC7A 2JK2A 2WV8A 3DFNA 2ZA1A 3MHGA 5LHEA 3W1QA 3W1NA 4GBUA 1KV8A 4DPQA 1LOSA 2VENA 2ZRXA 4HIBA 1QDSA 3TIMA 1YDOA 1EEPA 3M47A 3W83A 1F5ZA 2J24A 3WJYA 1GVOA 3GXPA 4NJKA 4JTKA 3LHVA 1L9WA 1WBHA 3CPRA 3GDLA 3ZR4A 1OVDA 4LVAA 1MEIA 4A29A 3PBYA 1CI1A 1F6PA 3W72A 3BG3A 3B0PA 4WY0F 3DFOA 5AYXA 2YCEA 1G6CA 3IVUA 4O15A 2P10A 4AWTA 3IGUA 2NX9A 4I7WA 2NUWA 3QMSA 2WOQA 1JR1A 5CG7A 4FNQA 4Y96A 1SW3A 3FS2A 2ISSA 2FTPA 2V81A 4LS1A 3NM3A 3AO0A 4CCDA 3G8EA 3DFSA 2VEIA 3HB9A 3B0VC 4RV8A 2WSQA 4IQLA 4WOZA 5F4SA 5CZTA 1MEWA 1SW0A 4O4VA 3PBWA 3S1WA 1KM4A 1K7EA 1FUYA 1J4EA 1WYIA 3VI2A 1JQVA 4QSHA 2WO5A 4PFMA 5DBUA 5FF0A 1H61A 1H63A 3NZRA 4X9SA 5F4WA 3CWOX 2OZ0A 2JKPA 1NFBA 3M16A 2ZDRA 3SY5A 3N9SA 1PCKA 4OGZA 4JIPA 4M6VA 3NL2A 4O28A 4QQ3A 2VEKA 5FF4A 2QF7A 2YYTA 3UWWA 3NOEA 2ISWA 1TJPA 2E5CA 2TPSA 4HNTA 2DZSA 4Z1BA 5F2LA 4QITA 2VFEA 1DV7A 2UV8G 3USBA 1ME9A 1WV2A 3S5YA 1GWJA 1K8ZA 5FI8A 3UWQA 2VFDA 5HULA 3NL5A 3VNDA 3L21A 1AMKA 4UTWA 5AOUA 1AW2A 3O6DA 4O18A 3DAQA 4FX8A 4GUGA 4HPXA 4QISA 4TMCA 3DHFA 3FEMA 3L67A 1JCXA 1I2PA 1OJXA 2J9XA 2WKJA 5DXYA 1VYRA 2ZZ6A 1LROA 1M7OA 1TCDA 4N9DA 5CZJA 4DBDA 1TPFA 3S5ZA 3CHVA 1VRDA 2QUVA 4JICA 3BV4A 2DZVA 1KM6A 4GUFA 3GAYA 4I7UA 1HTIA 4O13A 2H6RA 1BKSA 3NGJA 4OU1A 2BZNA 1QOPA 3STFA 3O06A 4TX9A 1XBZA 1TV5A 5HWNA 4AEOA 3NDOA 3PBVA 1OFBA 4WUIA 3T7VA 4O19A 1DBTA 4IMCA 2CZFA 4O1BA 1H7OA 2Z0IA 4LOCA 3W75A 1IXQA 2WNQA 1DQWA 3V75A 3HF3A 3P7YA 1SPQA 1T8XA 3TJLA 3W1MA 2VOMA 5EBUA 1GG1A 3T40A 1EWDA 2B0MA 4TO8A 1GYLA 4O11A 3G3DA 4R53A 4LUJA 3U8GA 3GDTA 2A6NA 1ICQA 2C19A 3MI6A 4UC5A 3RMJA 2WPBA 1YTKA 4K6AA 2ABAA 2J88A 1LRQA 1O4UA 2Y6ZA 2H8ZA 3C52A 4NVTA 5C5YA 1ZAJA 4GE8A 2ZTKA 1TPC1 2C16A 4HPJA 4O1DA 2A21A 2CLEA 2X2GA 3W88A 1QOQA 1LTDA 3S1UA 3UXDA 4UTHA 5CPNA 3N2XA 3NQVA 4UR8A 3S5OA 1TPUA 2YZRA 3N3MA 1OHLA 5KMYA 3NXFA 5CSSA 4Z0JA 1JJKA 1K03A 1A5BA 1GPWA 1H5YA 2Y7DA 1GVFA 2GVGA 3E96A 4YXGA 1JULA 4H4IA 4UUIA 3W6YA 4QIUA 4FB7A 4O14A 1FWRA 3NM1A 4G1KA 5K4XA 1Q3NA 4RCXA 5D2YA 4DQWA 2E6AA 3P60A 1VZWA 2FJKA 3S1VA 3KRSA 4BR1A 3NQEA 3IIOA 2A85A 2FPYA 1HO4A 3L65A 5HUPA 2VC6A 3GNNA 2NUXA 4BFAA 3TC7A 3RLVA 1HFBA 3W7NA 4JXCA 1JCMP 1XFBA 4PEKA 4PA8A 5AHNA 1PVNA 1IIHA 1NSJA 1W0MA 3ZFHA 1TPEA 4M6QA 4WZHA 1OFOA 2WQPA 4WJEA 1KFBA 4QNEA 1KM0A 1ML1A 3GDMA 5AFDA 2FQIA 3M0ZA 2B7QA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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