3L0GA

Crystal structure of nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from ehrlichia chaffeensis at 2.05a resolution
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
ISFSEIIHNALKEDLGDKGDITTNSILINEKVNFAINTRENLVVCGIPILEEVFNMNKEHVKYEIHKKDGDITGKNSTLVSGEALAIYLLPIERVILNFIQHASGIASITRQFVDEVSGTKVKIRSTRKTTPGLRMLDKYSVCIGGGESYRDNLCDGVLIKDNHIASCGSITLAIQRLRKNLKNEYIAIECDNISQVEESLSNNVDMILLDNMSISEIKKAVDIVNGKSVLEVSGCVNIRNVRNIALTGVDYISIGCITNSFQNKDIGLDIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
publication title Crystal structure of Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from Ehrlichia chaffeensis at 2.05A resolution
rcsb
source organism Ehrlichia chaffeensis
total genus 97
structure length 272
sequence length 272
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2009-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l0gA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3l0gA01
3B8DA 3LBCA 2RFGA 2AAMA 1W3IA 4LNYA 3O16A 4S2CA 4E0CA 1H7NA 1XBYA 4ORMA 5CPOA 5LKYA 3QYQA 1OABA 5T26A 5AYYA 4GFSA 3PSWA 4O15A 5F1UA 3TMQA 1K7XA 1SO4A 1K8XA 4Z08A 3GLCA 4NX0A 3W83A 1A53A 5LZLA 1LOLA 2YCEA 1G7VA 3TDFA 1J5TA 1FXQA 5KZDA 4N02A 3DU0A 4NNBA 3P5YA 4MUZA 2QKFA 1F05A 3ZR4A 4HNTA 2GOUA 4CNPA 3GNDA 3O8AA 1A5AA 2WOQA 5E93A 5KZMA 4O17A 1F6KA 2CLOA 4NU7A 5FF0A 1K3UA 3C3NA 2D73A 3W7EA 1B9BA 2G5WA 4ZMGA 4QISA 5G4WA 3PUOA 2NV2A 4JTLA 4MOZA 1JCNA 3NQFA 3ABQA 3A9IA 4E2BA 3NGJA 4LRTA 2X16A 3MHUA 1W5QA 3IVSA 1XBVA 3HJZA 4XKYA 4N9DA 2C18A 3KRZA 3QSRA 4UMAA 2NX3A 4ICNA 1VYPX 1FY6A 3NL6A 1WBJA 3CIWA 3Q94A 3GZ3A 3W22A 5HULA 4K37A 4IPJA 1XI3A 1F7BA 2RDWA 1TV7A 1RZMA 2V5LA 1LBFA 3CWNA 3JR2A 3W7DA 4LC8A 5CPMA 1TPDA 4IMGA 4M6VA 5D02A 3VE9A 4H6KA 1UUOA 3FOKA 4RZ4A 1SSDA 1WYIA 4HT3A 1JQXA 2I1OA 3GKAA 3MUXA 3W7HA 5CSRA 3I68A 3NPXA 3JS3A 2I14A 3EWZA 3DKLA 1LRNA 4KKXA 2ZRXA 1VCFA 2CLFA 4M5PA 3TU9A 4FX8A 4I9AA 4AAJA 1HFBA 1SFJA 1KM0A 1K8YA 2Y6ZA 2DJXA 2YW4A 4WXYA 1GG0A 5DXYA 2VFHA 4DPPA 1XCFA 2J9YA 4PL1A 5CKSA 1KLZA 1H7WA 2H6RA 4CQAA 4ZVJA 3W2KA 4O54A 3M16A 1YTDA 1LOSA 2A0NA 1E51A 4FB7A 4AF0B 2WNNA 1A50A 1WV2A 4UNKA 5HINA 1YDVA 3DAQA 3IVUA 3HBLA 2AQWA 5E0KA 5DBTA 1EUNA 4TO8A 2VFGA 3DI0A 4ML9A 4R53A 1GVSA 2GQAA 4K7YA 2NV1A 2Z1BA 1T99A 4JDBA 1HTIA 3PB2A 3DFNA 3LCLA 3L21A 1SO3A 3LI1A 5EMUA 4Y9AA 3NQ8A 3G1VA 4YCPA 1P1XA 4WX2A 3MP4A 3KRSA 2AGKA 1T8XA 3VI2A 1D9EA 5DY2A 5HWMA 3EX4A 5C55A 3QSTA 3TQ0A 1U5JA 5LNUA 3NPVA 3MYOA 1OG0A 4RLIA 5HUOA 3O07A 3T44A 4UMCA 3NPUA 4GNJA 4BK9A 3WJWA 3T78A 2B7PA 4ZQOA 3NR0A 2YYUA 3LB0A 5HNRA 4MFEA 2G95A 1UB3A 2V2HA 1YDNA 1YTKA 3GDKA 4UTTA 1W37A 5DCEA 2Y61A 1Y0EA 3BGJA 5AB3A 4TIMA 1FXPA 5HMSA 4PA8A 4NT0A 4UFLA 4K8EA 3TA6A 2YX0A 1BWLA 5AC8A 5D38A 1Q6OA 1SSGA 4IMEA 5CZSA 4UXDA 2VEPA 4C1LA 4MFDA 3W1PA 5FEWA 1V5XA 3I7SA 3S5YA 4MZ8A 1Z44A 3QMSA 4N9BA 1VJIA 4RZ6A 1M7PA 4N4PA 1R47A 1H60A 1JCJA 1C8VA 1QO2A 2QDHA 1KFLA 2QJHA 2ZBTA 3F4NA 3W7GA 3CB8A 1XM3A 4KWWA 4O18A 4MVAA 5HUPA 3TAKA 3DHDA 3KOFA 3BVJA 1TPEA 2Y7EA 2GUUA 3LCWA 4JGDA 3RNDA 1TPVA 5LNSA 1I2QA 1KM3A 5D32A 4M6PA 4DQWA 2JK2A 2CZ5A 3EX1A 3PY2A 3A21A 5GVJA 1G6CA 4UFJA 4NNAA 1TV8A 3TX9A 3EEGA 2ZRVA 3IGXA 3IIXA 4NXSA 5H91A 4BI7A 2DJLA 5LHFA 1I2PA 1RV8A 3LTPA 4RXFA 5HWNA 1F6PA 1DOSA 3LCFA 4BI6A 3TQKA 2TRSA 3TROA 3PBWA 1HO1A 2Y85A 3L0GA 2E6YA 2KZHA 3G1HA 3MW7A 1PCKA 3ATZA 4PODA 3C2FA 3H55A 4U4MA 2O7QA 3M41A 3L66A 1NVMA 2FPVA 5HR7A 3NAVA 5K7JA 2ZDRA 5BRBA 4JTGA 2PURA 3EB2A 5KSWA 1PCWA 3VFLA 5I3GA 5CZTA 1F73A 1TRIA 4XZ9A 5D04C 1XDMA 5G1YA 3EXSA 5G2IA 4CNNA 1J2WA 1MEIA 1F76A 4UTLA 3E9AA 4ORIA 3YPIA 2WO5A 3HGSA 3TW6A 4RK8A 2J6XA 4EF9A 4Z1BA 3IVTA 3ATYA 2DZXA 1J4EA 3LRLA 3N2MA 4GUFA 1N8FA 1LYXA 2H8ZA 3N2XA 3GAYA 2YGYA 3STFA 2CLEA 1O5KA 4LS1A 5D2YA 4D2JA 4WZHA 4NJJA 2FDSA 2YR1A 2QEZA 2ZYFA 3O06A 2VFFA 2OT0A 3OHIA 1VH7A 1TO3A 2A7NA 3CHVA 2VFDA 3NPWA 2C1HA 5LNRA 4XKYB 5AN7A 4Y8FA 1LRTA 2HSAA 1W56A 2FPYA 1LBLA 3DGRA 1SU5A 2X2GA 2RHGA 3LGEA 2NUYA 3HGJA 4RZ5A 1EA0A 3EKZA 1SO5A 2FIQA 3DH7A 3GB6A 1VZWA 4O14A 3BGGA 3W1LA 5D05A 4AH7A 2Y7GA 3OEXA 1YTEA 3FFSA 4E38A 4YLWA 1OYAA 1VLIA 1KTCA 2BLEA 1DKWA 2EAWA 4X2RA 3P84A 1PIIA 2ISWA 1DL3A 3G22A 4MY9A 2V81A 1FX6A 4YMZA 3B04A 2ZA3A 3C6CA 3CC1A 2QUUA 4N4QA 3LCGA 5EYWA 3ZS4A 3PBUA 2J24A 2QCEA 3WK1A 4QAIA 3LCIA 2Y62A 3LTSA 1S5VA 5DELA 2E5CA 4QITA 3C2VA 2QCMA 1N55A 1I2NA 2CLIA 2DZWA 1VCGA 4PCFA 4WY0A 4XBKA 5FEXA 3GXTA 1N7KA 2NWRA 2OCZA 4XBSA 5CZ0A 2WSRA 1G69A 3WJYA 4BI5A 2YW3A 3L0NA 4POCA 1VYRA 3IV3A 1X6UA 3QW4B 2YFNA 3GDMA 4JTKA 5F2IA 1KM4A 3ZWTA 1GTHA 1JJKA 3W7PA 4HPJA 1HL2A 2FLIA 2G96A 4JTEA 5AHMA 4C1KA 1WQ5A 2ZTJA 1F74A 3DBPA 1AK5A 2ABBA 1M5WA 4JTJA 5LHEA 1P0KA 5CGQA 5BW6A 4IMCA 4RKAA 3TJLA 4MY8A 1GVRA 3M5XA 5SWUA 3EWWA 4NJIA 1DVJA 3W7LA 4OV4A 3RF9A 4ADTA 2C19A 3VKJA 3QMTA 1AG1O 2J9ZA 3NOEA 4S1FA 3B03A 4JX5A 1OFRA 3PVFA 4EF8A 3W1TA 4UTIA 4CNOA 3NQ7A 3VCRA 1DJNA 4FX6M 4O1AA 2QR6A 1VYSX 1NF7A 3CLMA 1KFKA 4GE8A 2C6QA 2OX1A 5G2HA 5L6UA 4Y96A 3NVTA 3ABRA 4JTUA 2BWGA 2FPTA 3M43A 3CT7A 4DF2A 1OX5A 4IXHA 4JICA 2FB3A 2R94A 2NZLA 4FIRA 1KFJA 3W7MA 2QAPA 2RDTA 3M44A 4R33A 3SGUA 2O7SA 3G1DA 4UFIA 3GKFA 1JUBA 1T96A 1KV8A 2NXHA 3W7JA 1VC4A 2X1RA 3QMRA 2EPHA 3ABSA 4O53A 1YXYA 3H53A 1K02A 4ZQPA 5TBOA 3PS7A 1KA9F 2JBMA 4R34A 4DELA 1UBSA 1ZAIA 3E96A 3TV8A 2E68A 1XC4A 4RV8A 4RXGA 3W73A 4OE7A 4PEKA 2JGQA 1O94A 4MYAA 1ZAJA 5C54A 4XWUA 5FF2A 5ABTA 3I65A 3NO5A 3PULA 4JX4A 1THFD 2HS8A 3G0UA 1KM2A 3PF3A 2ZA1A 3I7RA 3LERA 1ZAHA 3RLUA 4M7SA 2H3DA 2HTMA 3W2JA 5LGXA 4IXXA 1UJPA 1H1ZA 1RD5A 1L2UA 1YPIA 3B4UA 3KX6A 3IRDA 3BLEA 1LOQA 1P0NA 3BLFA 1IIHA 1UCWA 1W8SA 4GUIA 5D2XA 1GOXA 3BW2A 3C8FA 3R13A 2F84A 4J9JA 4DF0A 1DBTA 3S1WA 2CLHA 2ZRWA 3TAOA 5EBUA 3HPZA 1OFEA 3EX3A 3NM3A 4HKPA 3QH2A 2QCDB 4P2VA 4AWTA 5LNVA 4LTSA 1TV5A 5DLCA 5BNKA 1BWKA 2XN1A 3GIYA 5KITA 3PBVA 5I3HA 2WV8A 2XN0A 2V30A 3T4CA 1QNVA 5AHEA 3TQVA 2QCNA 4I7UA 4U28A 1OFDA 1BTMA 2WJZA 1KFCA 1KW1A 2BX7A 4NJKA 3PUDA 4MLRA 3FEMA 3O6DA 3P62A 4OBTA 3BW3A 3A23A 3V1PA 5MHBA 3HG3A 1G4TA 3UWWA 5C5YA 3LHUA 3TKFA 1I8JA 4FXRA 1HG3A 3HIJA 4IUOA 3QF0A 3MO7A 3P7YA 3P81A 2DZSA 3SY5A 3MBDA 4MY1A 4K38A 3PG9A 3BG9A 2B7NA 4XUGA 3M7WA 4UFKA 1JCMP 2ZCGA 1LLZA 1AW5A 2X1TA 4YXGA 3NYZA 3SSJA 3HB9A 5A8GA 4AHPA 4IMDA 3W3OA 5EY5A 2Q8LA 4DPQA 2BTMA 1H7PA 3OBKA 1YLVA 1UASA 2Z6IA 3DENA 3FJLA 3HMJG 2E5BA 1AMKA 3EWUA 1G7UA 2B4GA 1L6WA 4MPQA 4UFMA 3NXFA 2FB2A 4UTUA 1AL8A 1FWRA 1SZGA 3W70A 4XTDA 4ZQNA 4IWWA 3B06A 1S5TA 1FDJA 2H3BA 5FF3A 2B0MA 4UTWA 1GZGA 3LTYA 1OF6A 2OJPA 5AYXA 3GR7A 4MYXA 2GQ9A 1C29A 1S5WA 1QMLA 4A22A 1GTEA 1TPUA 1QAPA 3VNDA 4O57A 1H7XA 2VXNA 5D30A 1JVNA 5CSSA 3R2GA 3DHFA 2WSQA 2QUVA 3BPWA 1I2OA 3FYPA 1R46A 4ZQCA 3KVKA 3C56A 5HWJA 3GXPA 3KVMA 3MWAA 1Z48A 4N9EA 3N34A 1K7EA 3B0UX 2B7QA 5FI8A 4JXCA 2C14A 2NXGA 2ZA2A 5LGZA 2QF7A 1JRBA 3IGSA 1OFPA 3QRHA 5AOUA 4ZZ9A 2XFWA 4EIVA 3BW4A 1VQTA 1WAUA 1SZFA 3M47A 3PSVA 2ZZ2A 1OYBA 3G8RA 3TCEA 2X1UA 4IGHA 4MZYA 2DORA 4X9SA 4CCEA 3C52A 3CIXA 4O8RA 5D2WA 3MMTA 5F2MA 1L6SA 3W1XA 3W87A 1DHPA 4W9TA 3W76A 1ICQA 1OFOA 1OHLA 4WXZA 1FWSA 4AVFA 1JUEA 1ZALA 3G18A 4UIOA 5F4WA 2E09A 3W1AA 3W1NA 1WDWA 4QSHA 3EWYA 4JTFA 1EX5A 2WKJA 1K8ZA 2R14A 2EKCA 3UZJA 4JTIA 3S0CA 4O11A 3S8HA 5D2VA 4IX0A 2GVJA 4ADSA 4QQ3A 1KFEA 3BV4A 2A21A 3BG5A 1W5PA 5DXXA 3AO0A 3F4WA 3W7IA 3GDTA 4Q4KA 3TH6A 4GJ1A 5I3FA 1KM1A 3V75A 2A7RA 4OHQA 3IGUA 1LCOA 3HG2A 1OFAA 3R5EA 3W75A 1YYAA 4LVGA 1UUMA 4H4IA 2JKAA 1A5CA 4PH6A 3UPWA 3K30A 4ZL1A 4PFMA 3NQCA 1WA3A 4JTTA 3BK0A 1QO5A 2A7PA 3LHTA 2JKPA 2Y7FA 3CEUA 1C9DA 2C16A 3M5YA 4L4LA 3S9YA 3G8EA 3W72A 1O5XA 3W1UA 3LLDA 1ZFJA 2CZDA 1FDYA 1X8FA 2OT1A 4IQLA 3M5ZA 5C6MA 2NX9A 1X1OA 4Y90A 3O05A 4CQ9A 4AWSA 2E1DA 1EWDA 3NL3A 1AL7A 1DJQA 4FNRA 1VRDA 3E02A 4JYFA 3TC6A 3PC0A 5AFDA 5AC6A 2JKEA 2A2IA 3W2NA 3LOTA 2ZRZA 2I9EA 4K8HA 2TYSA 3GDRA 2TMDA 1FBAA 3GR8A 2X30A 1FCQA 1JULA 3HG5A 1FUYA 1QPQA 3U2OA 3FLUA 2E6FA 1TQXA 4PL2A 5BMXA 2BXVA 2CLLA 5H2ZA 4UTTC 4O4WA 3N14A 2DZPA 5K2ZA 4Z1CA 2R8WA 4K6AA 1JCYA 1A5SA 3LI0A 1KV5A 3QZEA 2ZRYA 4LV9A 4WOQA 4M7TA 3WK3A 4B5NA 4LS2A 1H61A 3UD6A 3LCXA 4AMAA 3NG3A 2Y89A 3KHJA 1GYNA 4BWLA 3NQAA 1SW3A 1TTPA 3NQ6A 4UTKA 3SGZA 3A24A 4DXVA 1XDLA 1TTJA 1XKYA 1DORA 1P5BA 2PE4A 3CU2A 3P82A 1QCWA 3NDOA 2FFCA 2HMCA 2W0UA 1JUKA 3NQMA 2YPIA 4XQ6A 3CEPA 3DFOA 4KFPA 4Q32A 2YSWA 4DBEA 1QOQA 3HPSA 3LM7A 1GEQA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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