3PAJA

2.00 angstrom resolution crystal structure of a quinolinate phosphoribosyltransferase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. n16961
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
YFQSNAMKETHNSQDRLAYLKQQLPADITRSVIDTLKEDLGGTLDPAADITASLIPADRISTATIITREAGVFCGQLWADEVFKQLGGQVSIEWHVQDGDTLTPNQTLCTLTGPARILLTGERNAMNFIQTLSGCATATARYVQELKGTQCRLLDTRKTIPGLRSALKYAVACGGGYNHRIGVFDAYLIKENHIIACGGIRQAISTAKQLNPGKPVEVETETLAELEEAISAGADIIMLDNFSLEMMREAVKINAGRAALENSGNITLDNLKECAETGVDYISVGALTKHLKALDLSMRFKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase, carboxylating
publication title 2.00 Angstrom resolution crystal structure of a quinolinate phosphoribosyltransferase from Vibrio cholerae O1 biovar eltor str. N16961
rcsb
source organism Vibrio cholerae o1 biovar el tor
total genus 103
structure length 302
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2010-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3pajA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3pajA01
1JUKA 3NQ2A 1SO3A 2ZZ6A 3UWWA 2JK2A 2RDTA 3LTYA 2ZRWA 2BZNA 4UR8A 4Q32A 4HT3A 1LBMA 1QPQA 1U83A 1R30A 2NXGA 3EWYA 2VKZG 2C13A 2ZRYA 1SZNA 5AHLA 4FNTA 3UY7A 4ADTA 3PM6A 3QM3A 4WOQA 3STGA 2HSAA 2ATSA 2W6RA 3KXQA 4DELA 3S1WA 1U5JA 1K8XA 3CM4A 3MP5A 3W7DA 3T78A 2FFCA 4AMAA 3C6CA 1JQVA 3NR0A 4Q33A 3DH7A 5D2YA 2FQIA 4AHQA 4YCOA 3O16A 3QPYA 1I45A 6TIMA 3TV8A 2C16A 2YYTA 5DCBA 5I3GA 3LXCA 4QJ1A 4WXZA 3TW6A 1OABA 3JRKA 4EIVA 1YTKA 2QUVA 2FIQA 4NZFA 5G4EA 1TQXA 4LUJA 1KFJA 5EBUA 1FXPA 1F05A 3B05A 3GNNA 1BWLA 3C0JA 5CPMA 2W79A 2CLKA 1LORA 4RK8A 4K6AA 3RMJA 5D38A 5U7SA 1K7XA 3LHTA 4LVBA 2FDSA 3OVPA 2R94A 1FCVA 3CPRA 3W1LA 4AF0A 5HUPA 2NWSA 3W83A 4TX9A 3KHJA 3EWUA 2QCMA 1F74A 4UNKA 2WQPA 5F2IA 3DFOA 4PTNA 2CZEA 1PHQA 5EYWA 3TCEA 4CNNA 3BW4A 5AYXA 3W3OA 1YTDA 1YXDA 1B9BA 1FDZA 1Q6RA 3NNTA 3I68A 3LCFA 1EWEA 4EWND 3NM1A 3RNDA 3LCIA 3GB6A 3TQ0A 4O1DA 3WJZA 3VFLA 4BWLA 2A0NA 2YFOA 4E2DA 2WJZA 1TRIA 3B0PA 3MP4A 3OIXA 4O4VA 3W7JA 3BLEA 4LY8A 5J5RA 1XCFA 1KM5A 1WA3A 1I4NA 5CPNA 3W85A 3PVFA 2QCLA 4P61A 2AAMA 1H7XA 4BR1A 1PCWA 3N14A 3IV3A 3ATZA 1L2UA 1LM1A 2NLIA 1KM1A 3W22A 1GOXA 3EWWA 3FLUA 4JNMA 3B04A 3RLVA 1TCDA 1UB3A 1TV8A 3SSJA 3GDMA 4A21A 5D03A 5K3VA 2C0AA 4XZ9A 3VNDA 5FF0A 3IVSA 4XQ6A 2J24A 1F6KA 2TRSA 3VKJA 3NZRA 3THQA 4XBSA 3CEUA 5E1QA 4W9TA 1IXQA 3PBWA 2BXVA 1P4CA 3TX9A 3W6YA 1M7OA 5BW6A 1A5AA 4M7TA 1H51A 3M5YA 3M1ZA 4HKPA 4N6FA 1H62A 4PH6A 4R53A 3UPWA 4BF9A 1H7PA 3DKJA 4LV9A 1JR1A 1YPFA 4X3ZA 5CGQA 4XTDA 4GJ1A 1QR7A 4HNTA 5I3FA 2VEPA 1OYBA 1I2RA 3M44A 1GPWA 1XUUA 2QAPA 2B0MA 5AHNA 3EB2A 3UY8A 2E09A 3LCGA 3PY2A 4I7VA 2BTMA 3NQEA 2VFHA 2NV1A 3W71A 5AHMA 1RPXA 1PCKA 3C2VA 1P1XA 3O6YX 4JY9A 4LVFA 2DJXA 3SJ3A 2Z2UA 3P7YA 3W2LA 3W76A 1EA0A 1XC4A 2Y7FA 1H7OA 2QAFA 3L5LA 2Q8ZA 1OFRA 2VFDA 4UMCA 2GVGA 2J27A 2GPTA 2WNNA 2HS8A 4UNLA 1I2PA 2QF7A 4O1AA 5FESA 3W1QA 4JX5A 3NQFA 3UXAA 2CWNA 3P5YA 4MY1A 1H7RA 4U28A 1SZFA 1T99A 1OFBA 1A50A 4KWWA 5DCEA 1SW0A 2QUTA 2R91A 4JTJA 4NX0A 1VYPX 4HSOA 5EPDA 3WJXA 3HPXA 4UMBA 1LBFA 4HNVA 3C52A 4IXHA 4MFDA 3S1XA 5KZDA 1ZNNA 1LLZA 4XKYB 5CKSA 1W5OA 5G4WA 3DI0A 1KTBA 2WV8A 3M43A 4AWUA 1EEPA 3G22A 3JS3A 4IMEA 4FNUA 4AWTA 1EP2A 3S1UA 3Q94A 5LNVA 2RDWA 3P84A 5CSRA 3TNOA 1GZGA 4CCDA 3IRDA 2EHHA 5FEZA 4HNNA 5SWUA 4IX2A 1R2RA 4Z0SA 4POCA 5LKYA 1T96A 1AW2A 4JDYA 3KVKA 3S5YA 2CFFA 2GQAA 3GDRA 3LM7A 3C2OA 3LB0A 4NT0A 3TQVA 4JICA 2CZFA 3W86A 3NQVA 3G1HA 4RZ4A 3LERA 3W74A 1WBJA 2A6LA 1JJKA 5FF2A 3O07A 5D05A 3LRMA 1KFCA 3C4UA 1I2OA 4DO4A 4AXKA 4G1KA 1SFJA 3NPVA 3PC0A 1TREA 4FX6M 2P10A 2F7FA 1PE1A 3MW7A 3T4CA 1A5SA 1DJQA 2Y61A 3EXRA 1KLZA 4DF0A 3NG3A 2Y7EA 2ZTKA 3TIMA 3DFQA 2A21A 4M5PA 2PRLA 5AFDA 1KFEA 3L5MA 2V8ZA 4Y6GA 1ZAJA 2YFNA 5BMXA 1M7PA 4ZZ9A 3SIZA 5F2GA 2GQ8A 3Q2DA 2ISWA 3TJXA 3UZJA 4ZQPA 1EPXA 3R12A 1IIHA 3MI2A 1B4EA 4M6PA 3DHDA 3CHVA 5F2LA 3O1NA 1DOSA 4IUOA 4ONVA 4M19A 4H4IA 4JYFA 1UBSA 1DKWA 4LS1A 2ABBA 1R47A 1T8XA 3N2MA 1OFOA 1VLIA 1JCNA 4RCXA 3C56A 2E6FA 3A5FA 2ZA2A 1VHNA 4MY8A 4TO8A 3MI3A 2ZFAA 3BPWA 1KLYA 3BLFA 3PUOA 1TPDA 5DBTA 4MKNA 4BI6A 3DI1A 2DZPA 4ZVJA 1EIXA 4AVFA 5DY2A 1D3HA 4JEQA 1N55A 4MZ1A 1OK4A 2QCEA 4MVAA 3MBDA 3UWQA 1Z42A 2H3DA 5AC7A 3MO7A 3EX3A 2A7NA 4KFOA 5EL1A 3TJLA 1FY6A 5FF4A 4ZQRA 4NXSA 3DXIA 1QAPA 4GNJA 1KW1A 3B03A 3NQAA 3BO9A 3TQKA 1TRDA 4LVDA 2C19A 3P5ZA 4BI5A 3HGRA 4GUJA 3ANYA 2E1DA 5HWNA 2J9XA 2OX1A 4CLMA 1FWRA 3I6RA 4PC8A 1A5BA 2H6RA 3FKKA 2UV8G 1W56A 4RV8A 3W70A 4CNOA 1LZOA 5KZEA 3B0VC 1XM3A 4R7JA 3EEGA 4IXXA 3G0UA 1B57A 2AQWA 1ML1A 1K8YA 4PFMA 4YCPA 2A1YA 4TIMA 4JN6A 4DEFA 1NVMA 1THFD 4OT7A 3L2IA 3NVTA 4JTHA 1YXYA 1QFEA 1TPB1 3HG4A 4E2BA 1S5WA 3TW7A 3W75A 3TH6A 2QCDA 3I7RA 2CLLA 3KX6A 3W7EA 4DBDA 1SO4A 2NX1A 3M47A 4HSNA 2O7SA 1RQHA 1WYIA 4O4WA 3N19B 3HGSA 4A2RA 3QH2A 4MIMA 1MSSA 2YSWA 4JDBA 1W8SA 4H3DA 4JTUA 3I7QA 4DO5A 4UR7A 2RH9A 5LHFA 4LC8A 3CTLA 4ADUA 3PF3A 4RXFA 3U6WA 2TMDA 1XDLA 5H2ZA 3GNDA 2GJLA 4FB7A 1J5TA 4HPJA 1KM4A 3QPZA 5HR6A 3W7HA 4XBKA 2E6YA 3KVJA 3WK3A 3UWYA 3DHFA 3O05A 4AEOA 2X1UA 5HUOA 3MHGA 3LCLA 4MPQA 1EUNA 4CNPA 3CU2A 3PUEA 1DORA 3WJSA 3F03K 1VLWA 3QSRA 3IGXA 2QCDB 3BW3A 3BW2A 4BI7A 4LW7A 1RZMA 2JGYA 3EXTA 3VE7A 2OZ0A 4JTGA 4MFEA 3F4WA 1H7WA 3LRKA 5D2TA 1YXCA 4O17A 1IGSA 4NNCA 4TR9A 1AG1O 3P80A 4LVGA 3S42A 3UPBA 2VEIA 1HO4A 1G4TA 2DZTA 5DXXA 1F76A 1CX9A 1W1ZA 1FWSA 3NM3A 3DU0A 4OGZA 3FFSA 1O60A 3P8JA 3I7SA 1KA9F 1ZHAA 2WSYA 1VH7A 1IXOA 3C2RA 4ZL1A 2QJIA 3NL5A 4MLRA 5HNRA 2B4GA 3NQ6A 1H7NA 1KTNA 3MWAA 2OT0A 1XFBA 4Z1CA 1OX4A 3W7RA 1V7YA 2V81A 5F2MA 2NX9A 4FIRA 1W5QA 1JULA 2A2IA 3HPZA 2WPBA 4OQVA 5G5IA 3ZFHA 2PE4A 5CPOA 2WNZA 3V1PA 4N6EA 3NPUA 4JTIA 4CQAA 2A7RA 4QISA 3GKAA 2VXNA 3W2UA 3NQCA 3GAYA 5L6UA 1OFQA 4QM1A 5HR7A 5FF7A 1ICSA 4UXDA 4QAIA 3EX4A 1KBIA 2EPHA 3P8IA 4RZ5A 1UUOA 4UTWA 3LTPA 1H61A 1SW7A 2WKJA 3E49A 4R34A 3L0KA 1W0MA 3U8GA 5F4WA 3NA8A 3QQ1A 4ORMA 4CCEA 3TSDA 1NAL1 1XUZA 4ORIA 1N7KA 2VFFA 2ZBTA 5AYYA 5L9FA 3VI2A 3GVGA 4M7SA 5GVJA 4DQWA 4MYAA 3PUDA 3UD6A 4IPJA 2P1FA 3ABRA 3KRZA 3P62A 3GXTA 2EKCA 3G8RA 1XBZA 2ZTJA 1DBTA 4UTKA 3ABSA 1G67A 3C8FA 5LNSA 5D09A 3G0XA 4UFHA 1KM3A 1KFKA 3DKLA 2ISSA 3LLDA 2EGZA 4I7WA 4PL1A 5HMSA 5G1TA 3HPSA 4EF8A 5E0KA 4MZYA 1LCOA 1IF2A 1NFBA 1TPVA 4YLWA 1FDJA 2J6XA 1RR2A 3HGOA 4R33A 3NOEA 1G7UA 1I2NA 3CEPA 4FO4A 3NL6A 2YR1A 4FIQA 3T44A 4UTUA 2B7OA 4GBUA 3CT7A 3ZR4A 2HTMA 4JS3A 5EY5A 4ALDA 4LU0A 5AHEA 3GR7A 2WNQA 3ABOA 3PB0A 4ML9A 5C55A 1LLWA 3LHWA 1X1ZA 4KWVA 4XUGA 5K4XA 2Y63A 5LGZA 1SR9A 3WK1A 2FJKA 1PIIA 3GK0A 1HO1A 2FLIA 3NGJA 3PBYA 1IIGA 2X2GA 4WXYA 3W84A 4IX0A 4JGDA 1JQXA 3OBKA 4K8EA 1XI3A 2R8WA 3CWOX 4JIQA 3W7NA 4AF0B 3G1FA 4K38A 2ZZ5A 2OMAA 5D32A 3THAA 3P81A 1PS9A 3W73A 5D04C 4NJHA 2QCHA 3MYPA 3TE9A 3NQ7A 1B3OA 1IXNA 1HG3A 1X1OA 5K9CA 3W7GA 4AB4A 1C9DA 3NQDA 2VEKA 1FCBA 3P60A 2Q3OA 1G7VA 2J9YA 3BGGA 3EX2A 3L66A 3LGEA 2NUYA 3HOJA 4O19A 3OEXA 4NX5A 3ELFA 1YTEA 3DGRA 4JIPA 5D2VA 4O1CA 1EP3A 3TROA 3LXAA 3G1SA 5KINA 1G6CA 4AAJA 5TBOA 2A5HA 1YADA 3S5OA 3WK2A 2QJHA 2YZRA 3KRSA 3OA3A 5FEPA 4O53A 1TJPA 4GUHA 3P74A 4OHQA 4ICNA 3VE9A 3QMRA 1Z41A 3W07A 1JCMP 4JX4A 4O57A 4NZJA 3NQ8A 1GT8A 2RHGA 4MOZA 2JGQA 3GKFA 1T0OA 4OWGA 3QMSA 1B4KA 3L0GA 3IIXA 4QITA 2V9DA 5BNKA 2QCCA 1JRCA 3HO8A 3BG5A 2YW4A 1W3NA 3UWZA 2DZSA 3BGJA 3TR2A 1KFBA 2RDUA 3OVRA 4A29A 1SZGA 1KM6A 1JCXA 4N4PA 3LHUA 2B7NA 1C29A 2FB2A 2TSYA 2Y70A 1L6SA 2XN1A 4JTKA 4LTSA 2QCNA 1O4UA 2QDGA 3LOTA 1TPC1 4DBEA 1W31A 4IPIA 1H5YA 3R8RA 5D33A 3W1TA 1LBLA 3IGUA 3KOFA 3P61A 1OX5A 1ZENA 1GQNA 1MO0A 1WOAA 4JTTA 1TB3A 3OG3A 2FPVA 3G1DA 3TAOA 3EXSA 4GXMA 3TMLA 5E93A 2JKAA 4IMDA 1KTCA 1HFBA 1X6UA 3DENA 2A6NA 4LRTA 2XFWA 3LI1A 3FYPA 1QMLA 1ZY9A 2Y7GA 2WO5A 3EWZA 3LRLA 1BWKA 1AL8A 1X7FA 1GVRA 1NEYA 3NL2A 4WY0A 4A22A 4TMBA 1W5MA 3O6DA 4QNWA 3AJXA 1GJPA 1LTDA 5J5DA 1TPWA 5AOUA 1OX6A 1FWNA 2C3ZA 4ZQCA 3G1VA 3NPXA 1TTPA 3TKFA 4FNQA 2FPYA 4ZQNA 3W9ZA 4JTSA 1SU5A 3TA6A 1SPQA 5LSMA 3E02A 3EX1A 4K7VA 2V5BA 3NL3A 1Q6OA 3AO0A 3QJAA 2E5DA 2E6AA 3CB8A 4FF7A 2A7PA 1JVNA 3MP3A 1GYLA 2YCEA 3A23A 1JCYA 1WDWA 4NJJA 4NJIA 4XWUA 7TIMA 3G0SA 3GX9A 4N02A 5DBUA 4MYXA 1UUMA 2TYSA 4Z1BA 4ADSA 1N8FA 4JYDA 1SUXA 2PRHA 2ZRVA 5T26A 1H63A 1TV5A 4Z08A 3W1UA 2VFEA 3C2EA 2G5WA 3EX6A 3M5ZA 2VOMA 1KM0A 1WOBA 2ZYFA 4JY8A 2J88A 3KAOA 1W5PA 5FEWA 3W2KA 2WOQA 5G1YA 4O54A 3HQ1A 3B4UA 3M5VA 3LLFA 3ZWTA 3WFAA 1RD5A 4GE8A 2YDAA 5F4XA 3PSWA 5DXYA 4PODA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1BKS A;  1D3G A;  4WQ6 A;  4KKX A;  2Y85 A;  2Z6J A;  4LWW A;  4NJK A;  1VCG A;  2DZV A;  1VCV A;  3W1M A;  1MEI A;  4QNE A;  5K9X A;  1Y0E A;  2XN0 A;  3R5E A;  3O6C A;  3BAR A;  3QZE A;  4UTH A;  4ZMG A;  1WBH A;  3CIX A;  3QFE A;  1JUE A;  3KFT A;  3SW6 A;  3B8D A;  2GUU A;  3G1Y A;  4IOT A;  3LHV A;  3TC7 A;  4O18 A;  3W2J A;  3LCH A;  2Y88 A;  3W7L A;  3U2O A;  3N34 A;  1DQX A;  1Q3N A;  3W87 A;  5K9D A;  3TFC A;  3C3N A;  4BWL C;  1HUV A;  1PV8 A;  1ME7 A;  3TMQ A;  4UTJ A;  1OFA A;  3LTS A;  1WX0 A;  4I9A A;  3QEZ A;  4UTT A;  2E77 A;  2Q8L A;  4RXG A;  5G2H A;  2BX7 A;  4O11 A;  1O94 A;  3FJL A;  3LI0 A;  1FQ0 A;  1YDN A;  3A22 A;  3F1Q A;  2GVL A;  4UFJ A;  3CIW A;  3G1X A;  3O06 A;  3UWV A;  2Z6I A;  2KZH A;  4A2S A;  5I3I A;  5DEL A;  4N4Q A;  3KVL A;  1ICP A;  4MLJ A;  4WX2 A;  2YPI A;  2H90 A;  4UTL A;  5FI8 A;  1S5T A;  3GXN A;  5D2X A;  3NPW A;  1DVJ A;  3IEB A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1KRM A;  2D3L A;  4EAN A;  3LCI A;  3CHD A;  4X9Y A;  3VFL A;  1BVW A;  2WJZ A;  3E2Q A;  4PCN A;  3I3D A;  3W7J A;  1QPK A;  1VFM A;  3TWB A;  4MDP A;  1WA3 A;  1DWJ M;  1QI0 A;  4IP5 A;  2QCL A;  4DBS A;  4C7G A;  2PTD A;  1YIJ H;  3IV3 A;  1H4P A;  5FAJ A;  5CG0 A;  4WJX A;  4G5D A;  1LM1 A;  1GOX A;  1BPL B;  2IKH A;  1BTC A;  2PDK A;  1N63 B;  3V16 A;  2ZX9 A;  5J8L A;  2WK5 A;  1XD1 A;  3E5P A;  4A21 A;  1A5O C;  4C6N A;  1YIT H;  3H70 A;  1B9Z A;  3A3H A;  2J24 A;  3VKJ A;  3NZR A;  4BEQ A;  4BCE A;  5E1Q A;  4W9T A;  1IXQ A;  2BXV A;  1P4C A;  4IFK B;  3FA4 A;  1M7O A;  3ABZ A;  3C86 A;  4LAN A;  5BW6 A;  4DVO A;  2X42 A;  3G77 A;  4QE4 A;  3OLE A;  3RPM A;  4HMD A;  3VX1 A;  3WL1 A;  2XYL A;  1JR1 A;  1J9Y A;  4Q4M A;  1BVN P;  1GK8 A;  2ZUM A;  4HNT A;  1QR7 A;  5I3F A;  4PUJ A;  5FAC A;  1OYB A;  3D46 A;  3GC5 A;  1GPW A;  3CTT A;  3L4U A;  3M44 A;  2I57 A;  3SQL A;  4Q3M A;  2QAP A;  2HE8 A;  2B0M A;  5AHN A;  3UY8 A;  2GFT A;  3SCO A;  3NQE A;  5HJX A;  1S3T C;  2NV1 A;  3C2V A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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