3TQVA

Structure of the nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from francisella tularensis.
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
280
structure length
276
Chain Sequence
NTDQINKVPNDIVTRLVRESLAEDIATGDITAQLAEDIDTTAFCITREEMILCGQDFANEVINQLDKNIQITWLYSDAQKVPANARIFELKGNVRSILTAERTILNFIQMLSGTATVTNKLVKLISQYKTKLLDTRKTIPGFRLAQKYAVRCGGGFNHRIGLFDAYLIKENHIGIAKAVTKAKKLDSNKVVEVEVTNLDELNQAIAAKADIVMLDNFSGEDIDIAVSIARGKVALEVSGNIDRNSIVAIAKTGVDFISVGAITKHIKAIDLSLQVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Rapid countermeasure discovery against Francisella tularensis based on a metabolic network reconstruction.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
total genus 86
structure length 276
sequence length 280
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2011-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tqvA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3tqvA01
2VOMA 3RFAA 2CZFA 2JGQA 3DI1A 5HR7A 1X1OA 3KRSA 4GBUA 4BWLA 3W9ZA 2Q3RA 3STGA 2CW6A 4Y90A 4WOZA 1YDOA 1H7XA 5CPMA 3N3MA 3FJLA 2NUXA 1VHNA 4A21A 1F6KA 3B05A 1T0OA 2DJXA 3VFLA 5LNUA 1EUNA 2ZZ2A 4JDYA 4IXHA 3FIGA 5AOUA 5DXYA 1C29A 3EXSA 3QW4B 1FCUA 3NXFA 4AHOA 5KTLA 3HB9A 3BARA 4BI5A 1H7NA 1WX0A 5F1VA 3HGOA 1BWLA 3TKFA 3HG5A 2VELA 4LTSA 2E5DA 2I14A 4Z1AA 8TIMA 1CX9A 3P84A 3TV8A 1ZCOA 3TE9A 3TC6A 1LORA 2HSAA 1LP6A 3QQ0A 3EX4A 4IUOA 4N9DA 3S5OA 3M16A 4CCDA 2O7SA 4AHQA 2R91A 4L4MA 2J9YA 4O28A 2OT1A 1G7VA 4S2CA 1VR6A 2AAMA 1MSSA 2FQIA 2CLLA 5C2XA 3PB2A 1THFD 3T40A 1TPWA 3B8DA 4MY9A 1OG0A 4JIPA 4AHPA 4NJGA 1HO4A 4UTKA 4FXSA 4ORMA 4E38A 5G2IA 3W75A 4O53A 1I2QA 4ORIA 3PBUA 4RJEA 4YXGA 5LGZA 1WBJA 3BG5A 3LCXA 3LXAA 4UNLA 1JCJA 1KW1A 5EY5A 3W87A 3PSWA 2Y85A 3HF3A 3W7JA 4FX8A 3EX6A 2TYSA 2ZRVA 1VJIA 3TK7A 5FF4A 3IVSA 1HFBA 4X9SA 2AQWA 1K02A 1AW1A 1PHWA 3AJXA 1A5AA 4O57A 1K7EA 3LI0A 5C54A 3IIOA 1XFBA 3GX9A 3LXCA 3LRMA 5BRBA 4PL1A 5G1TA 3P80A 4S1FA 3PG9A 1HO1A 1XC4A 5U4NA 3QSTA 1KBJA 1JCLA 1Q6QA 5G2HA 1PV8A 2A2IA 2E77A 1GTHA 2C0AA 3G18A 3MHUA 1ICSA 3NEVA 2RHGA 2PRLA 4M19A 5T26A 3HGJA 1IF2A 5AHIA 2WNNA 3QC3A 3TU9A 1OVDA 1TQXA 1OF6A 1LRNA 2C13A 3BLIA 3FOKA 1KM3A 3DHFA 5LNSA 3F4WA 3KX6A 2W0UA 1VCFA 4HT3A 4RXFA 3KRUA 3L0GA 3UPBA 4XBKA 2NX1A 4O17A 2YR1A 2F7FA 4OU1A 1JQXA 1SW0A 2WV8A 2A1YA 2ZA1A 4M6PA 1QMLA 3QMTA 1TIMA 4DQWA 3SGZA 1D9EA 2J27A 2CZ5A 4LUIA 2JK2A 4UTMA 1W3TA 3GKFA 1W0MA 3TXVA 4FF7A 3SIZA 3BVJA 4LRTA 3ELFA 5DCEA 1KM5A 4DF0A 4ADSA 3LLFA 3WK0A 3LOTA 3ABSA 1TO3A 2E1DA 4JTIA 2YZRA 2HMCA 3TJXA 1F76A 3NQ2A 1W56A 3HQ1A 3NM1A 5F4SA 3W1AA 1I2PA 3G24A 2X1SA 4YWIA 3QPYA 4NZFA 4ZQRA 1DV7A 1KTCA 3EWYA 3NPVA 3ABRA 1WQ5A 2Y7FA 1KM2A 4QISA 3W1QA 4LS2A 4RR4A 4YMZA 3GDTA 1H61A 2YXGA 1YTEA 3L9CA 1XKYA 4MYAA 3S42A 3FEMA 2RFGA 1YDVA 2X1TA 1TV7A 3INPA 2A0NA 4AH7A 3NL3A 4O0ZA 5KZMA 3TMLA 4UFIA 2A4AA 2W79A 3LLDA 4JS3A 3OBKA 1V5XA 1TPDA 2YCEA 3VE7A 4POCA 3OVRA 1O94A 3RMJA 3RNDA 4HNVA 5AYYA 1XI3A 2QAFA 1FWNA 4UR7A 3W22A 1FBAA 1SZFA 3LB0A 2HTMA 4AVFA 3QZEA 1DL3A 3RK8A 4N9EA 3CB8A 1TPVA 1H50A 1H62A 2V9DA 2QUTA 1J4EA 4K7YA 5IM51 5G4WA 4M5PA 4XTDA 1N8FA 4K6AA 4JTTA 3TH6A 3CT7A 3M41A 1KLYA 4LY8A 3W1RA 3LV6A 1XDLA 5CPNA 5EYWA 1KFBA 3UWQA 1VLIA 5CZ0A 2CZDA 3TQKA 3F4NA 3W7CA 2ZRXA 5C5YA 2Y7DA 4KWVA 4Q32A 4OV9A 1B57A 3NQEA 1SO4A 3CWNA 3W74A 1TMHA 4Z08A 2BX7A 3NO5A 4NT0A 1VYRA 3NL6A 1RZMA 4JY8A 1WAUA 1GVFA 4B5NA 3SW6A 4ADTA 3W07A 1C9DA 1EUAA 3PUEA 1NVMA 2Y7GA 4ZQCA 2NWSA 3P62A 2BSLA 5G5IA 1QOQA 1S3HA 1XXXA 3P5ZA 2PCQA 2DZXA 3UZ5A 1WOAA 4O50A 3NYZA 3N14A 1NF7A 4NXSA 3NQ7A 2NXIA 3L0KA 3WJWA 3IGSA 5F2IA 4JYEA 2FFCA 2WOQA 1X6UA 3B0UX 3UY7A 2ISSA 4PCFA 5EPDA 2A5HA 4UMBA 4WXYA 3W23A 1L2UA 5D33A 5SWUA 3TC7A 1Q6RA 3LGEA 2A21A 2Q8LA 3W7RA 2Y7EA 1VYSX 5KITA 3WJSA 2CZEA 3A5FA 3QF0A 1OYBA 2EKCA 4IGHA 4UFLA 3W7MA 3Q37A 3W7DA 3E96A 2B4GA 3MP4A 3PSVA 4ALDA 3LTPA 1I2RA 4IPJA 1O60A 5HINA 4GXMA 4QM1A 2TMDA 2DORA 2D73A 2GVGA 3C52A 3W7HA 1TPC1 2QDHA 1ADOA 3NNTA 1JUEA 4JX4A 3MJYA 1LOSA 3PUOA 1OK4A 1FDYA 5G4EA 4K8HA 5HNRA 1P4CA 4OHQA 1QR7A 4M7SA 2VXNA 4IMGA 2FIQA 3KVJA 2RH9A 3MI2A 3PWAA 3EB2A 4MKNA 3SZ8A 4EOUA 1MEIA 4DBEA 4LT9A 4MZ1A 5L6UA 4XWUA 2WSQA 1VCVA 2Y62A 4O10A 3S0CA 3DU0A 5F4WA 5HUPA 3UZJA 1Q6OA 4E2DA 4IMEA 2ZQ0A 4CQ8A 2PE4A 4L4LA 3HOJA 1VC4A 4DF2A 3I7QA 3TQVA 2C6QA 2GVJA 1WDWA 5F2LA 4X2RA 2X16A 3W7OA 1RR2A 2R94A 2X30A 1C8VA 2QR6A 3CLMA 4MFEA 3TQ0A 5CPOA 4K38A 2CLOA 1LRTA 3ZWTA 3G1HA 3QRHA 4H4IA 4UXDA 3S9YA 3B06A 3MHFA 2P10A 2V5LA 3GKAA 1H1ZA 4NNCA 5TQLA 4LVBA 2ZA2A 4O4VA 2V2DA 1NF0A 1KFEA 5FEPA 3PY2A 1PVNA 3C61A 2YPIA 1GYLA 3LCFA 2FPYA 2FB3A 1HUVA 6TIMA 4AEOA 5AFDA 2J88A 1GOXA 3E9AA 4NXKA 3PUDA 3W1PA 1RVGA 4Z1BA 4XUGA 3IIPA 3CQ0A 1LROA 2QCNA 3SGUA 3MW7A 2I9EA 5HWJA 2XN0A 4PFMA 3OHIA 4TIMA 4R7JA 1H63A 1GEQA 3QMSA 1K03A 3WJYA 4UTWA 3RLVA 1SZGA 5AHNA 3DKJA 5C6MA 4U4MA 1LM1A 3UXDA 1TPFA 4HNUA 4WD0A 4YLWA 3TW6A 1W5NA 3FYOA 2E6AA 3LM7A 4GUJA 4LW7A 2C14A 4EVZA 4KFOA 3BK0A 3TCEA 1KM4A 2E5CA 1OX5A 1VQTA 1LTDA 3M44A 5K9XA 3L5MA 5D2YA 2A85A 3B4UA 3IGXA 3PS7A 5I3GA 2ZRYA 4JY9A 3UWWA 2FPVA 1QPQA 1JRCA 1ZAIA 4N6FA 2YDAA 2V82A 1W8SA 1SSGA 3EX3A 3C56A 2CWNA 1FWSA 1ONRA 1S5TA 4OGZA 1FY6A 2ALDA 5IBXA 4JIQA 4EF9A 3THQA 4UUIA 3QJAA 1TJPA 4FXRA 4MZ8A 4CCCA 5J5RA 3DHDA 2ABBA 1G67A 1KA9F 4O16A 4RZ4A 2JKPA 1KM0A 3G8RA 5DLCA 1VH7A 5I3FA 2Y89A 3F03K 5CPLA 3GVGA 4NX0A 1LCOA 1L9WA 3M0ZA 1VYPX 1R30A 2I1OA 3YPIA 3C4UA 3C2FA 4O8RA 3TW7A 1T8XA 1TRDA 3HBLA 4HPXA 3W7LA 3KHJA 1YADA 4LS1A 1FQ0A 4MJMA 4NNBA 3VCRA 1WYIA 4IX0A 3MI6A 4KFPA 1MXSA 1LDCA 1AG1O 5D05A 1JCXA 2C19A 2ZRWA 5FI8A 4RK8A 1OFAA 1IIGA 3BGGA 3TNOA 4UIOA 1LLWA 5E0KA 5U7SA 5FF0A 2GVLA 3IRDA 4N02A 3MP3A 4FEZA 4MIMA 2XFWA 1ZHAA 5HULA 1WXJA 2Q3OA 2UV8G 2F84A 2XN2A 4DPQA 2QCCA 4JD4A 1O4UA 2TSYA 3UWUA 1QAPA 5EKYA 2ZZ7A 2ZZ4A 2H8XA 3G1AA 1LOQA 1G4PA 1OFPA 4TX9A 3NG3A 2R8WA 3WJXA 3L65A 3ZWSA 3UPWA 1NEYA 2ISVA 2QCDA 4OWGA 2OX1A 3DFPA 4QITA 1LRQA 3O16A 3Q2DA 1D3GA 3NA8A 1KLZA 3FYPA 3W6YA 4PODA 2AGKA 4K37A 1JCYA 3B0PA 1OK6A 1W31A 3S1XA 4ZL1A 4HKPA 2VFHA 3R8RA 3T7VA 3UYCA 1F7BA 3P8IA 4K39A 2Z0IA 1IXOA 1TTPA 3E49A 3ANYA 3G22A 3QM3A 1QOPA 1GG0A 2DJLA 3GDKA 1ZNNA 3PAJA 3O6YX 2VFFA 4FX7A 5CZSA 4IMCA 3BGJA 3FKKA 1O5XA 4JGDA 2C1HA 4RZ6A 3UD6A 2DZSA 1SFJA 3FLUA 3R2GA 1KFKA 3NPWA 1JRBA 4OV4A 1R47A 3ZFHA 4XBSA 4HN4A 3Q94A 5HR6A 1SUXA 4RLIA 1ZAHA 4GUFA 2ABAA 4WUIA 3RF9A 1YTKA 1XUUA 4ZQPA 2NX9A 1F05A 4JR5A 3GAYA 5I3HA 1YLVA 3C8FA 3VE9A 3CC1A 3G1SA 3H54A 3LHYA 3P61A 5E93A 3O05A 4TO8A 1N7KA 3MP5A 3KVMA 3OG3A 1U83A 1OYAA 4I7VA 1FWTA 3LCLA 3C2OA 3TXZA 3E02A 2BTMA 3NGJA 2VKZG 5KMYA 3R5EA 3I65A 4O0KA 2PRHA 5I3IA 1ZFJA 4WY0A 4CNOA 1IGSA 2DZUA 3LBCA 2BLEA 4GUHA 2G97A 4FNPA 3NQGA 5I3KA 2CLMA 3C2EA 2KZHA 4X3ZA 1F5ZA 1A50A 2GUUA 3G0SA 4JTEA 4WJEA 2QCDB 2J24A 3N9RA 3DGRA 3PBVA 1K3UA 4XZ9A 3E0IA 3CM4A 3FKRA 2WNQA 4BFAA 1VCGA 2E5BA 4LVAA 1QCWA 2GQAA 2V30A 3N2XA 4FHAA 1FDZA 1H5YA 1Q6LA 3GNDA 4NJHA 3GDMA 2VFGA 1I8JA 4BF9A 3B04A 2DP3A 4MLRA 3T78A 1LLZA 1X1ZA 2TPSA 3S6DA 1X8FA 3L2IA 5CSRA 2H6RA 1EEPA 4HHPA 3W73A 1SFLA 3TSDA 2E68A 2EHHA 3HPXA 1UB3A 1PL9A 4BWLC 4A2RA 2NUWA 4Q4KA 4AWTA 4OQVA 3TA6A 3NDOA 3STEA 5C55A 5H2ZA 3TROA 3PULA 2YYUA 4OBTA 5AHLA 5AN7A 3W71A 1KFJA 3NPUA 5GVJA 3STFA 3NQDA 4O11A 3FS2A 1W54A 3EXTA 4YL2A 3TSBA 1Z44A 1TB3A 3TX9A 1I4NA 3W2NA 3GK0A 1F74A 3P60A 3T44A 4K7VA 4MPQA 1F6PA 1T99A 2EAWA 3S5NA 3L21A 4FNQA 1LZOA 3B0VC 2FPTA 1HL2A 3M5YA 4MY8A 2NV2A 5HMSA 4NUWA 4NJIA 3W7QA 1S5WA 1WV2A 1SSDA 4ZQOA 2QUVA 3U2OA 1GPWA 4ZVJA 2P1FA 4R34A 4WY0B 1WBHA 2WNZA 1QO5A 1GT8A 4JICA 1SZNA 1SO6A 2ZRZA 3U8GA 4ZQMA 1ZAJA 3LCIA 5DELA 4WY0F 4O14A 4JTGA 1JQVA 3TDFA 3RLUA 3V1PA 2C15A 4CLMA 3QW3A 4M6VA 4A3UA 3NPXA 5KZDA 3H53A 3NAVA 4JEQA 3W85A 5EL1A 4QIUA 2ZYFA 5AC6A 4O15A 3I6RA 2RDWA 1W3IA 2GQ8A 4AWSA 4IMDA 4IX2A 1R46A 3NQAA 2FB2A 1W5OA 4UTTA 4UFKA 2QF7A 4FX6M 5ABTA 3GXNA 4PEKA 3DAQA 4JTLA 1OFEA 2NX3A 4LV9A 4UCGA 2JKEA 2DZPA 1LBMA 1HG3A 5TIMA 6ALDA 5D30A 1H60A 1WOBA 4GRSA 4KFNA 3W2JA 3DFOA 2X1UA 3KFTA 2GPTA 2GOUA 1B4KA 1IXQA 2ISWA 4J9JA 5HQEA 4TMBA 4GUIA 4LOCA 2QCGA 1NFBA 1SW7A 3O1NA 1UUMA 2Y88A 3W3OA 3PG8A 4LU0A 1YXYA 4BR1A 3I7SA 3W2UA 3OA3A 2YW3A 3NL5A 4O1AA 3UWVA 5HWNA 3NQFA 1XUZA 4JNMA 5AYZA 2TRSA 3TUUA 4E2BA 4MY1A 3M6YA 2V2CA 3PC0A 4K8EA 3NQMA 1VRDA 3UNDA 3P5YA 3M5VA 2OT0A 1TV8A 3M9YA 4N6EA 3LHVA 1TPH1 3LHWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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