4I9AA

Crystal structure of sus scrofa quinolinate phosphoribosyltransferase in complex with nicotinate mononucleotide
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
MDPEGLALLLPPATLATLADSWLREDCPGLNPVALVTGAAPSQAVLWAKSPGILAGRPFFDAIFAQVNCQVSWFLPEGSKLVPVAKVAEVRGPAHCLLLGERVALNMLARCSGVASAAATAVETARGTGWAGHVAGTRKTTPGFRLVEKYGLLVGGATSHRYDLGGLVMVKDNHVVAAGGVKQAVQGARRAANFALKVEVECSSLQEALEAAEAGADLVLLDNFRPEELHPTAAALKAQFPTVGVEASGGVTLDNLPQFCGPHIDVISLGMLTQAAPALDFSLKLFAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Sus scrofa quinolinate phosphoribosyltransferase in complex with nicotinate mononucleotide
pubmed doi rcsb
molecule keywords quinolinate phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase
source organism Sus scrofa
total genus 90
structure length 288
sequence length 288
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2012-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4i9aA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 4i9aA01
3EWZA 3NL5A 1KA9F 5LZLA 5D2XA 3PF3A 4IMEA 1YPIA 2PRLA 3SW6A 4PH6A 1W5QA 3NQAA 1EX5A 3O6CA 4XUGA 5AHFA 3PS7A 2GJLA 4LV9A 5AOUA 3SECA 1JVNA 4MVAA 1XM3A 3W1PA 2R94A 3W88A 3WJYA 4JXCA 1FDYA 4UTMA 2XN2A 1OFPA 4ZVJA 1W31A 2QCLA 3CQ0A 2YR1A 3DAQA 5G5IA 3N2XA 3P80A 4IMFA 3QPZA 1GT8A 1KFKA 3N3MA 8TIMA 3W76A 1GYNA 2WSRA 4DXVA 4OWGA 1KFEA 1A5SA 2DP3A 4AVFA 2C3ZA 2R8WA 5AB3A 1GG0A 3LCGA 2UV8G 1V7YA 3LV5A 2WSQA 4U28A 1OF6A 4AWTA 1LZOA 4NNCA 4JICA 4N6EA 4O12A 1H63A 2B7PA 2KZHA 3CHVA 1XBZA 3GDTA 1S3HA 4GC4A 1OX4B 1YDVA 3N9SA 4TO8A 1C9DA 1TV5A 1EB3A 1W8SA 4GWEA 3TAOA 4AH7A 2B4GA 4MPQA 2RH9A 3KRUA 5HMSA 5CZSA 1ZY9A 3S1XA 1OX4A 4TU1A 3QMSA 5AN7A 2DZVA 4O53A 3B0UX 2H3DA 5CG7A 3C0JA 1G7VA 1TPC1 2JBMA 5HJLA 1K7FA 2VEMA 3MP4A 4M7SA 2DORA 4CCCA 4AHPA 4Q4KA 2H8ZA 2I1OA 1GTEA 2YX0A 1EWDA 2RKXA 1Q45A 1YDNA 1ICPA 3MYPA 2Q3RA 5LNRA 4P61A 2DU2A 2X16A 1I2RA 3BW3A 3B0VC 1EIXA 3W74A 3UXAA 3EXSA 4JN6A 4EF8A 3W1LA 1W5PA 1Z44A 2C18A 3QPYA 4AHQA 5CZTA 1W5MA 3B0PA 3PY2A 2CLHA 3L5AA 4O4VA 4GUIA 2JKEA 1H1YA 1KM2A 1G67A 2P10A 3W7RA 3UY7A 3ATYA 1QO2A 2E1DA 5L6UA 2ZYFA 2A7NA 3BO9A 3BV4A 3T55A 4A2RA 5L9FA 5I3IA 1ICSA 4DO5A 3EWBX 4H3DA 1PIIA 2ZZ4A 1Z48A 1ZAHA 2E6AA 4FX7A 5T26A 4R53A 1OF8A 4FB7A 3HG4A 1TTIA 3T78A 3HIJA 2XN1A 2YCEA 4Z0JA 3MWAA 4YWIA 1ZJIA 1SZEA 3A24A 2RFGA 4UFLA 1OFEA 2C14A 3Q2DA 3M41A 1JCNA 3WK2A 3W1AA 1D3GA 1AMKA 2NXGA 1TSIA 3LTPA 2EHHA 3RF9A 4MZ1A 1XI3A 4NVTA 3BPWA 1FXPA 5G4WA 3KVJA 3PB2A 3GDKA 3P5ZA 4FNRA 1N55A 4XQ6A 1SO4A 2CW6A 1J5TA 3E49A 5E93A 4PFMA 4BI7A 5IBXA 3ATZA 1HTIA 1TV8A 3M6YA 2QAFA 4LS0A 1I2OA 2ZRYA 2ZQ0A 3G1HA 3LHUA 4O17A 3QZEA 4LS2A 4K38A 3DFOA 3JR2A 2G5WA 1SW3A 5KZEA 4O0ZA 2CLEA 2W6RA 1XCFA 5DLCA 3THAA 2G96A 5KSWA 1FY6A 3STCA 3HOJA 4LW7A 3MP3A 1QR7A 1W5OA 4O57A 1HUVA 3MW7A 4UCGA 1FCUA 1RR2A 2YSWA 2PE4A 3L0KA 3NOEA 4OU1A 3O05A 1UJPA 1JULA 4RR4A 3OIXA 1XBVA 4NZJA 3FOKA 2ISVA 1O5XA 1VYRA 2ZZ2A 1L6WA 4JGDA 3QH2A 1FCBA 1LRQA 3TV8A 2NV2A 2A85A 1Z42A 3C56A 2C15A 3U2OA 1RZMA 1QAPA 3KRZA 4LRSA 2X1UA 4M19A 1JCYA 4S2CA 3NZRA 1WXJA 1Z41A 4CQ8A 1JRCA 3O6YX 4MIMA 3E0IA 1Q6OA 5HINA 2WNZA 4JX4A 1G4EA 4Y9AA 2QJGA 4UC5A 4PL2A 3YPIA 3LCLA 4L4MA 2O7QA 3VI2A 2CLIA 1SFLA 1X1ZA 5AHLA 5KZMA 4JTLA 3P81A 4XZ9A 1WYIA 2VXNA 3SR7A 5K3VA 1VH7A 4BI5A 1W56A 2ZTJA 4K8HA 5CSRA 3QSTA 1VLWA 3W7QA 2HMCA 1QOPA 3CWOX 4UFKA 5D37A 1QDSA 3W2LA 1AW2A 2J88A 2Q3OA 3SGZA 5FF3A 1H1ZA 3LHYA 3B03A 1TQXA 3ABQA 3NR0A 4A3UA 3M43A 3I68A 5BW6A 1TREA 4LU0A 1TYGA 4JTSA 1JQXA 3W86A 2E6FA 4DPPA 3CEPA 2HS8A 3S8HA 3TSMA 1VCVA 1WA3A 3TCEA 4MFDA 4ADUA 4RX0A 3W7DA 2ZZ5A 2PURA 1W0MA 2V0TA 1GEQA 3SSJA 4HPXA 4ALDA 2DZUA 3M7WA 4XTIA 3N19B 4ORMA 3A22A 4XKYB 3SZ8A 1SU5A 1TO3A 1VCGA 1FWRA 5EKYA 3ZS4A 1U83A 2FIQA 3BG3A 4JTUA 1TQJA 1YPFA 3V1PA 1JCMP 4JR5A 1OYCA 1B4KA 3MMTA 4HNUA 1I2PA 5LHEA 2QCDA 2OCZA 3M47A 4O50A 4UTIA 3W07A 3KHJA 1F6PA 4JTGA 1FBAA 3W1RA 1H7WA 3G22A 3TSDA 2NWRA 4DBEA 3GX9A 4UUIA 1FXQA 2DZSA 5AC7A 1VHCA 1RV8A 2EPHA 1H51A 3RLUA 3KRSA 4E2DA 2CFFA 4AB4A 1X7FA 2WOQA 1LOQA 3NQMA 4WXYA 3TFCA 2YPIA 3LLDA 2Y89A 5DCBA 3EX1A 1LTDA 1CW2A 2RDTA 3F4NA 1PCWA 1T99A 4UFMA 3UZJA 3SI9A 3SIZA 2J24A 1MZHA 1TMHA 3TJXA 4UR8A 5DY2A 1JR1A 3P82A 3P61A 1LP6A 2NWSA 3F4WA 4O1AA 2WQPA 2VELA 1KW1A 2QUUA 2VFDA 1KM3A 1FUYA 3W6YA 1X8FA 1DQWA 4ZMGA 4GRSA 2ATSA 3S6DA 4K7YA 4LVBA 2FLIA 3FIGA 4JD4A 1S5TA 5D04C 2Z6JA 2Y85A 3TDFA 3S1WA 1FCVA 2OJPA 3TW6A 1B4EA 3NPWA 4QJ1A 4IPIA 3PAJA 1LLZA 3L65A 1TPFA 2Y63A 3W2MA 1B57A 5F1VA 2X1SA 1IIHA 1O95A 2ZFAA 3EKLA 1TRDA 3M5ZA 4K39A 1D3HA 1NAL1 1WOAA 1LM1A 1ZHAA 1RVGA 2A5HA 1LORA 1PV8A 3TKFA 3W2NA 4WOQA 3R12A 4CCEA 1SO6A 1TTPA 2LLEA 2NXHA 4IMCA 5AYZA 4AXKA 2BXVA 2OX1A 4LVDA 3QJAA 3W85A 3L0NA 1J4EA 1PHQA 3P5YA 4HKPA 2QKFA 3MHUA 1SO5A 4GUGA 1GPWA 3IGSA 1AW1A 2QR6A 4OV9A 1DL3A 3G0SA 3UZ5A 1I2QA 2EGZA 3DFQA 2CLOA 3PWAA 3M1ZA 1GWJA 3VE7A 7TIMA 4ORIA 4YCOA 2NZLA 2J27A 4WXZA 2G95A 1O5KA 3DZ1A 3FEMA 4WY0B 1SW0A 3MYOA 4UXDA 2ZRZA 2A6LA 3B06A 1ICQA 3C2EA 4JYDA 1HO1A 3IIXA 3O15A 4N9DA 1BWLA 4JIQA 1OFAA 4WY0A 3W7OA 5BOOA 1KV8A 3EWXA 4GNJA 2A2IA 3CTLA 5I3FA 3TH6A 3GKFA 3C52A 3DU0A 4FNQA 3EWYA 1DQXA 3A5VA 5HUPA 5D03A 1K7EA 3GYEA 2ISWA 3C2FA 1EPXA 3KVLA 5F2LA 5C6MA 3NQ2A 2QCGA 3S5ZA 3IVUA 3ABOA 1VYPX 3P8JA 3N9RA 3LHWA 2AAMA 5F1UA 2X2GA 3NYZA 5BNKA 3BVJA 1NF0A 4UNLA 3G3MA 3UWZA 3M5VA 4O0KA 2GUUA 3PULA 4P2VA 2QJHA 1ML1A 4IWWA 4BK9A 2V5LA 4EF9A 1XBXA 4UTTA 3LHTA 4J9JA 5I3HA 1WQ5A 2NUYA 5CPOA 4NJKA 1I45A 1A53A 1GVSA 3IIPA 2Z2UA 3GK0A 4TMCA 5D2YA 4L4LA 4UMBA 4UMCA 2WSYA 3OA3A 1R47A 3UWVA 2Z0IA 2C19A 4FEZA 3W72A 3NL3A 3WK3A 4NUWA 1VZWA 3NVTA 1M6JA 2Z1BA 3TXVA 3A5FA 3P67A 5D05A 4WX2A 3M5XA 1B3OA 4JX6A 3LRKA 4LRTA 5DBTA 5D09A 1F76A 1O94A 4QM1A 5D02A 5K4XA 4NXKA 2ZRWA 3NO5A 3NPVA 2BWGA 3PSVA 1OFQA 3VKJA 4NNAA 4Y96A 3HO8A 2VFEA 2QCMA 2V82A 1YTEA 4IMDA 3FJ6A 4NJJA 1Q6QA 3L67A 2P1FA 3UWWA 4DF0A 2C6QA 2Y7FA 4FHAA 2QJIA 3W7HA 3R5EA 4MYAA 3GKAA 1IGSA 4GUJA 5H91A 4CCDA 1QPRA 1K7XA 5K7JA 2DJXA 4MY8A 3BG5A 4X3ZA 1SZGA 1XUUA 1K8YA 1H7RA 1QCWA 3TIMA 2D73A 3T7VA 3LCHA 4HNTA 4UFIA 2Y6ZA 3QMRA 3PB0A 3HGOA 2X1TA 4HT3A 2VKZG 1Q3NA 2ZZ6A 4UR7A 1I2NA 4N9CA 3MI3A 1XC4A 1QPQA 1WBJA 5DXYA 1LBLA 1JCLA 4I7UA 3LGEA 1XUZA 4H4IA 4AHOA 4BI6A 4QNEA 3L5LA 2VFIA 1LOLA 4N4PA 3U6WA 5HWNA 2JKPA 3I6RA 5I3KA 3HBLA 4IGHA 4M7TA 3D0CA 1V5XA 1SW7A 1YYAA 3NQVA 2X1RA 2VFFA 3W84A 2FJKA 3TX9A 1MXSA 2VEPA 2AQWA 2QAPA 4MKNA 3HMJG 4MZYA 3W2UA 4UTWC 2QCCA 4UTKA 1I8JA 1UCWA 1VQTA 1SSDA 5KZDA 3CIWA 1BKSA 4QISA 3M9YA 5SWUA 4U4MA 3NPUA 3O63A 4CNPA 4JDBA 2TRSA 3LRMA 2GQ8A 3OVRA 3NQCA 4K8EA 1K02A 2TYSA 5E1QA 2BTMA 1DOSA 3C61A 1QOQA 4UTJA 2ZTKA 3NQGA 3W83A 3RMJA 2RHGA 3TAKA 1SPQA 4OQVA 4JNMA 1XFBA 3OG3A 4YXGA 1JRBA 5LSMA 1MEIA 1D9EA 3R8RA 3GVGA 4AAJA 4NXSA 4BWLC 3W7GA 4GFSA 1K03A 1RQHA 3UYCA 1R2SA 4Z1AA 1XKYA 1LLWA 4DELA 2Y7EA 3INPA 1G7UA 3W2KA 1JCJA 4ML9A 4MJMA 4JTTA 4JTIA 3W75A 3P84A 4CQAA 3LDVA 3BARA 3N14A 4PTNA 3DXIA 4LOCA 3HPXA 3MHFA 1YADA 2QDGA 1VR6A 2YFOA 3I7RA 5IM51 4ADTA 4NNBA 4GUHA 3IVTA 3OHIA 3NXFA 5FESA 1NFBA 2ZA1A 5CPNA 5IBXC 1F74A 1TPDA 1VPXA 5F2MA 4N02A 1F7BA 1VRDA 1TPB1 5I3JA 3QQ1A 3LV6A 1PL9A 2FB3A 3PBVA 1L2UA 4NU7A 1UB3A 1OFRA 1VCFA 2ZZ3A 4PCFA 1VC4A 1U5JA 3FYOA 5EYWA 4KWWA 3ABRA 1CX9A 2ZCGA 4LUIA 2YYUA 3AO0A 1UBSA 2ZRXA 4H6KA 4FNPA 3TW7A 3HF3A 1LYXA 1K3UA 3L0GA 3W73A 1DORA 4XBSA 2GVJA 2VOMA 3TK7A 3P74A 3QSRA 2Y7DA 3C8FA 3I65A 3BGGA 3O06A 4POCA 4YL2A 5HNRA 1JUEA 2NLIA 2OZ0A 1TTQA 1R46A 2WO5A 3S0CA 3DH7A 4AMAA 4N4QA 1GTHA 1WDWA 4RV8A 1Q6LA 3HG3A 3W3OA 4LVGA 1ADOA 1EUNA 3LXBA 1MSSA 4IPJA 4JY9A 3BG9A 3K30A 3NQFA 4ZQMA 5A5WA 2V81A 3L2IA 3W1XA 3UPBA 2GVLA 4LNYA 2NX9A 3SJ3A 3QW4B 3E12A 1LDCA 5KTLA 4Q32A 4EOUA 2CLMA 2I9EA 3GR8A 3NM1A 3M5YA 3JRKA 4IQLA 5F4XA 5J5DA 4RKAA 3LBCA 5U4NA 3W7IA 4JDYA 1L6SA 4Z0SA 4LV4A 2WKJA 4QQ3A 1OK6A 3GZ3A 3NPXA 5CPLA 4OT7A 1EP3A 3G8RA 1M7OA 5D33A 1UASA 3CU2A 1CI1A 3LBMA 2QUTA 1OX6A 1ZALA 2NV1A 2FPYA 4DPQA 3A9IA 1OFOA 4NX5A 4N6FA 2TMDA 4HSOA 2QF7A 3DI0A 5CSSA 4GBUA 2YXGA 3HG5A 1KM0A 2EF9A 3QYQA 3NAVA 3TA6A 3MHGA 2QCDB 5FF4A 3R13A 4WUIA 1P5BA 4UTUA 3KXQA 2W0UA 2QCEA 4Y90A 3G1AA 4UTHA 3BW4A 1OJXA 5EBUA 4Z1BA 4CQ9A 3UQNA 1NEYA 2QEZA 4QNWA 3N34A 3NL6A 5AHEA 4AWUA 1IXPA 4JTJA 4AWSA 4HHPA 3W2JA 2OT0A 2A7PA 2OT1A 1GZGA 2DZXA 3V75A 1X1OA 3N2MA 2H3BA 4OV4A 2W79A 1H50A 1S5WA 3KVMA 5CZ0A 5G1YA 4MY9A 3IGUA 3G18A 1ZENA 1J2WA 4RZ6A 4DBDA 2A0NA 1ALDA 3TC7A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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 2E68 A;  4MFE A;  5TBO A;  1W3T A;  3GAY A;  1K8Z A;  1PE1 A;  4LC6 A;  2FTP A;  1KFB A;  4TR9 A;  4HIB A;  1ME9 A;  4BR1 A;  2GQ9 A;  3QC3 A;  4NT0 A;  4Y8F A;  1NSJ A;  5LNS A;  3PBY A;  2E09 A;  2YW3 A;  5EA9 A;  2WJZ A;  3CLM A;  3I7Q A;  4UNK A;  4JS3 A;  2ATM A;  3EB2 A;  5KMY A;  4B5N A;  3C2R A;  2PCQ A;  5HWJ A;  3NEV A;  2YGY A;  3CC1 A;  4WZH A;  3VFL A;  2GQA A;  2Y62 A;  1DJN A;  3G3D A;  4E0C A;  3W7N A;  4NZF A;  1IXO A;  4UFH A;  4N9B A;  2FFC A;  1FWS A;  3STG A;  1QNV A;  3DBP A;  3EX2 A;  3FKR A;  4UIO A;  3F1Q A;  3G1V A;  1EA0 A;  4O15 A;  3TFX A;  2YDA A;  1G6C A;  3W9Z A;  1BTM A;  3FKK A;  3C6C A;  1WV2 A;  2ZRU A;  1F6K A;  4OE7 A;  3QEZ A;  1FWN A;  1SQ7 A;  5DCE A;  1AK5 A;  4A21 A;  1O4U A;  4HN4 A;  2ZZ7 A;  2HTM A;  4LVA A;  4O8R A;  3WJS A;  3FYP A;  3GIY A;  1XDM A;  3IIZ A;  4R33 A;  3TXZ A;  2CWN A;  2YW4 A;  2WNN A;  3IIO A;  3ZR4 A;  1KBI A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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