5HUOA

Crystal structure of nadc deletion mutant in c2221 space group
Total Genus 90

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
283
structure length
283
Chain Sequence
TDLTPFQIDDTLKAALREDVHSEDYSTNAIFDHHGQAKVSLFAKEAGVLAGLTVFQRVFTLFDEVTFQNPHQFKDGDRLTSGDLVLEIIGSVRSLLTCERVALNFLQHLSGIASMTAAYVEALGDDRIKVFDTRKTTPNLRLFEKYAVRVGGGYNHRFNLSDAIMLKDNHIAAVGSVQKAIAQARAYAPFVKMVEVEVESLAAAEEAAAAGVDIIMLDNMSLEQIEQAITLIAGRSRIECSGNIDMTTISRFRGLAIDYVSSGSLTHSAKSLDFSMKGLTYLD

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
3H1 (10-12)EMPTYAH1 (13-24)AH4 (97-128)TIV1 (25-28)AH2 (30-35)S5 (88-96)S1 (41-48)TII1 (79-82)S2 (52-54)TI1 (74-77)AH3 (57-67)AH5 (145-156)S4 (82-84)AH10 (268-273)TII3 (142-145)TIV5 (250-253)3H2 (254-257)TI2 (130-133)TII5 (257-260)S6 (134-136)S11 (264-266)TI'1 (237-240)S7 (169-171)TI3 (164-167)AH6 (173-179)AH8 (206-215)AH7 (182-192)TII4 (193-196)S9 (219-223)TVIII2 (239-242)AH9 (227-237)S10 (242-246)S12 (279-286)TII2 (85-88)S3 (70-73)TIV2 (194-197)S8 (199-203)TIV3 (222-225)TIV4 (246-249)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Streptococcus pyogenes ga06023
publication title Streptococcus pyogenes quinolinate-salvage pathway-structural and functional studies of quinolinate phosphoribosyl transferase and NH3 -dependent NAD(+) synthetase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (Carboxylating)
total genus 90
structure length 283
sequence length 283
chains with identical sequence B, C, E, F, H
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2016-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5huoA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 5huoA01
1VYPX 4K6AA 3W86A 4XBKA 2X1RA 1U83A 4C1KA 1GVSA 4YMZA 2V0TA 3W2MA 5FF2A 3W88A 3LHZA 3PBYA 3TDFA 1XFBA 1EWEA 4JIPA 4ZQCA 3PB2A 4HHPA 4IWWA 3W1UA 3MP3A 1WBJA 3WK2A 2R14A 3W7IA 5FF3A 3G18A 4JDBA 1IXPA 4IMGA 4QIUA 1TV5A 4FX8A 4FXSA 2ABAA 4ZL1A 3PUEA 1WV2A 1VYRA 3C56A 1ZENA 1KFBA 4UTIA 3HJZA 2WOQA 1HUVA 3IVSA 3IGSA 2C13A 3M6YA 3DAQA 4UFLA 4LT9A 2YYUA 3KFTA 4ORIA 5HWNA 3FKRA 3WJZA 4UIOA 4ICNA 1GG0A 1FCVA 1HTIA 4Z1CA 4WUIA 3NL2A 3UNDA 5K2ZA 3OBKA 4CCEA 3S5ZA 1JCYA 3G1YA 1H5YA 1YYAA 4O18A 1ALDA 5I3HA 4RZ4A 4UMAA 2A6NA 3NL6A 3TW7A 1L2UA 1WOAA 2ZRYA 1QOPA 2OT0A 2ZA2A 3BLEA 4E2BA 4O12A 1L9WA 1UBSA 4JTTA 3S1VA 4LWWA 3BGJA 5CZJA 2DU2A 2ZQ0A 4YCPA 1VCGA 3I7RA 4Z08A 3NDOA 5TQLA 1GJPA 3MMTA 1BWLA 4BI7A 4GUGA 4JICA 5D2XA 1YXCA 3U2OA 1OFPA 1KFEA 3IEBA 2V81A 1IXOA 5DCDA 3KRZA 1LROA 1Z44A 1KM2A 1V7YA 4UTHA 4LVGA 1Z41A 3UQNA 2QDGA 1L6WA 2BWGA 2CLIA 3EX6A 3ZFHA 4GUHA 3GDMA 4IXHA 3W7JA 4GNJA 2F7FA 2OJPA 3O07A 4NJGA 1JCMP 4ZQPA 4AWUA 2VEMA 3I7QA 4R53A 1MO0A 1JCJA 4JD4A 3SJ3A 3VI2A 4DBEA 1RQBA 3QQ0A 2DZUA 1QDSA 4HIBA 3SR7A 2IQTA 4FNSA 3TMQA 4XWUA 2PRHA 3BLIA 3E0IA 4O28A 3MP4A 4K8EA 3EX1A 3W1MA 5I3JA 1KM4A 2V2DA 1DL3A 5IM51 3DI1A 2R94A 1TTJA 2QAFA 1KTBA 3BLFA 3G8EA 4AF0B 5DLCA 4CQ8A 3W7EA 2WNNA 1YLVA 4NU7A 4HSNA 4OT7A 3VKJA 4HKPA 4UFKA 4LVFA 3I7SA 4O16A 4FNTA 5EA9A 4EOUA 1K3UA 3GZ3A 4PL1A 5F1VA 3M44A 1Z42A 1R2SA 2B7NA 3W7KA 1ZCOA 3PR2A 4PL2A 1W31A 3LTYA 3NL5A 4ML9A 4EIVA 2FDSA 4XKYA 5D38A 3UWUA 5CGQA 3VCRA 3EWXA 1H7PA 4LV4A 1TPEA 3CWOX 2ZRVA 2YXGA 2YZRA 4O14A 1D3GA 5AHMA 4XUGA 1DVJA 3OVRA 3CC1A 4R33A 1AL7A 3BO9A 4PA8A 4ZVJA 1G4SA 2C18A 4TX9A 3LRLA 4JYEA 2I1OA 4M19A 3RLVA 3A23A 4CQAA 2YFOA 3GXPA 2JKAA 1OF8A 3G22A 1K7EA 3O8AA 4FXRA 4MZYA 3TROA 2YW3A 4LV9A 3DU0A 3C0JA 4HT3A 2RDTA 2JKPA 3WJSA 1W1ZA 2HTMA 3SW6A 5ABTA 3QW4B 3C2EA 3W2JA 4OV9A 5FEPA 5K7JA 1R2RA 2ZRZA 5EPDA 4NZJA 2WNQA 3GXNA 1TJRA 4DO5A 4N9BA 1SO6A 4WD0A 3A21A 4FIQA 3OA3A 1ICQA 1YDOA 1PVNA 5F2MA 3OVQA 3YPIA 4OU1A 3PY2A 1ZY9A 1OFAA 1OK4A 1NEYA 2A2IA 1B3OA 1F6KA 3A22A 4QSHA 3ZWTA 4FB7A 2VFIA 2YCEA 4Z1DA 1TTPA 2QF7A 2QCDA 1G7UA 1VCVA 3BGGA 4IOTA 4HPXA 4JTJA 1RQEA 3OHIA 3M41A 1SW7A 3P82A 3U6WA 1TCDA 3NPVA 4UTWC 3S5NA 1H7OA 2FIQA 2ABBA 1JRCA 3P80A 4UNKA 2V82A 4JX4A 3EXSA 2QR6A 2DZVA 3T7VA 3LCLA 4S2BA 4O10A 4DF2A 5DCEA 2NXHA 4TIMA 2NV1A 4ZMGA 2A4AA 3S1XA 4RCXA 3W7LA 2FLIA 1OFRA 1OX4B 2GJNA 2V2HA 4O1BA 3C2VA 1KLZA 1UASA 3ABRA 3W7GA 3EEGA 2ZDRA 1ZAHA 5AB3A 1V5XA 3G1FA 3W7RA 3L5MA 3QPYA 5IBXA 4WY0A 1VLWA 4MY8A 3DENA 5BNKA 1AW2A 2X2GA 3HPXA 3T4CA 3LLDA 5DBTA 5BW6A 2A0NA 2QJGA 4XZ9A 3ELFA 1BEUA 1GPWA 1FWRA 3E49A 3QF0A 1EP3A 3UWWA 4U28A 3GDTA 2WPBA 4LOCA 3MBDA 1PV8A 3BG5A 3FLUA 2YFNA 4IJBA 3RFAA 3HG3A 3TFCA 3JRKA 3B03A 3CU2A 4KKXA 4NQ1A 5G2HA 3NO5A 2H3DA 5FESA 2A7PA 3Q94A 5H91A 3TA6A 1SFJA 3NGJA 4IGHA 2NX3A 5HMSA 2E5DA 1OHLA 1FY6A 3GVGA 1SQ7A 2FFCA 5CZTA 2VFDA 3KVJA 3QYQA 1TJPA 1UUMA 2VFHA 1ADOA 1H7RA 5T26A 4MZ1A 4S2CA 4UR8A 5F4WA 3HOJA 4IX2A 1OABA 3LB0A 3PUDA 4TU1A 1XL9A 4DELA 3T40A 3LV6A 2E1DA 4RX0A 3DI0A 1F05A 3GDKA 1W3NA 3W7CA 5E93A 1MEHA 4O54A 2CZEA 4JTUA 2QCLA 2TYSA 3W23A 4Q33A 4NNBA 3LLFA 2GVJA 2H3BA 2J24A 2Y70A 1G67A 3NG3A 3DBPA 5CSSA 3ZS4A 1I4NA 4FIRA 1JJKA 1ZAIA 1G69A 1SFLA 1Q45A 5HJLA 1KV5A 3TKFA 4XQ6A 2NX9A 3M9YA 3TQKA 2E5CA 3LCXA 4FHAA 3LHVA 3G3DA 1W3TA 4HNNA 3NPWA 3QW3A 4I7UA 3M5XA 3G1SA 2G95A 1K03A 4K8HA 4O50A 5CPMA 5A5WA 3PS7A 1RZMA 3KX6A 1M5WA 3S1UA 2DJXA 4LC8A 1EPXA 1F73A 5CPOA 4M6QA 3K30A 1EB3A 2AQWA 4JY9A 3DZ1A 3IIZA 1XBYA 3L5AA 3B0UX 2ZYFA 3IIOA 1XBVA 3F1QA 2CLOA 1TRDA 4IPIA 1NVMA 1EX5A 4UC5A 1XC4A 1H62A 5D2VA 2YW4A 1TPB1 3TR2A 2CW6A 2PE4A 3NZRA 1KFLA 3N34A 1LDCA 1GVRA 1K8YA 4UMBA 4AVFA 3LRMA 2FPVA 1H63A 2OMAA 3HG2A 5DBUA 1LOSA 3G1XA 2X1TA 5HUOA 3TNOA 3I6RA 1Z48A 5J5DA 2VEPA 4AB4A 2NXIA 2JK2A 3MJYA 4JX6A 1XKYA 5C54A 3LXBA 1XUUA 4LVBA 4UCGA 3N3MA 3USBA 3W71A 3NQDA 5AC7A 3GNNA 3MHGA 3RMJA 3LRKA 1JULA 1BWKA 5C5YA 1GTEA 3O16A 1PS9A 4ZQOA 1C9DA 1W5NA 3W22A 2V2CA 3N9RA 2ZFAA 3QSRA 1LYXA 3EX3A 4POCA 1TTQA 1QNVA 3SI9A 1RR2A 3LOTA 1XDLA 4KFPA 2RFGA 3HPZA 1X1OA 1B4EA 4NJIA 2C16A 4YWIA 3M7WA 1R46A 3G1AA 3LCGA 2XN1A 3EXRA 2E6FA 1RV8A 4IXXA 5CZSA 3TCEA 4AAJA 4NNAA 2QDHA 3WJWA 3AO0A 1GWJA 1VS1A 3ZWSA 2A85A 3S8HA 2J6XA 3W9ZA 2W0UA 3PG8A 4QJ1A 2GVGA 3PULA 3UWVA 3NQVA 4UNLA 3FFSA 5DXXA 3EX2A 4O57A 5DELA 5DY3A 1KLYA 2GJLA 5KINA 2A1YA 3P61A 3STEA 4DBDA 5EL1A 3MBFA 2JGYA 3TUUA 4RXGA 4Z0JA 4A22A 2EF9A 2E6YA 2QEZA 1SO5A 4Z1BA 4MPQA 4Y8FA 5KTLA 3TX9A 4LS2A 4AHOA 4PCFA 2CZDA 1ICPA 3EB2A 1TPWA 1A5AA 3LHYA 5LGZA 1YXYA 1MXSA 5L6UA 2DJLA 3H54A 2ZCGA 5LSMA 3DGRA 1ZALA 4K7YA 4MFDA 4WX2A 2FB3A 3C61A 1H60A 1R47A 3C4UA 4Y6GA 3HPSA 2OT1A 4LNYA 2FQIA 1JR1A 2CLMA 4IMFA 5CPLA 5K9XA 3G0XA 3QMRA 1B4KA 1TPDA 1HO4A 2E68A 5K4XA 3W75A 4ALDA 1TPUA 3W72A 1W5MA 1LCOA 1I2OA 2YR1A 3C3NA 3ATYA 4UMCA 4JTKA 3LDVA 1G4PA 4UTLA 4AWSA 3R8RA 2Q3OA 3NVTA 1FX6A 1H7XA 1W56A 3TU9A 2DZSA 4O53A 4NXSA 3QC3A 4LUIA 5LNUA 3UPWA 1VQTA 4LUJA 3W6YA 1MSSA 3M47A 2G97A 3W83A 2R8WA 1DBTA 1M6JA 2DP3A 2ZZ6A 5F2IA 3LX9A 5FF4A 4OBTA 2RH9A 5EMUA 2CLHA 2OCZA 2RKXA 1KM3A 3W70A 2Y63A 3MW7A 3TQVA 2WNZA 4CNPA 3LHWA 1AW5A 3EWBX 3W2KA 5F1UA 3DFPA 5H2ZA 3QQ1A 3B0PA 2PC4A 4YCOA 2W6RA 4ZQNA 1C8VA 4WXZA 5KITA 1JQXA 4R7JA 2DZTA 2D73A 3PBVA 4Q4KA 2NWSA 4HN4A 3S5YA 2DZXA 4FX6M 1WDWA 4JR5A 4N02A 1FCUA 5CZ0A 1JUBA 1TO3A 1T96A 3TV8A 5LNVA 5AHFA 1SZNA 4KWVA 4XBSA 1ZNNA 3CPRA 4UXDA 3ABQA 2HS6A 2ZRXA 4FNRA 2AGKA 3N2MA 2NUYA 3VE9A 2ATMA 3GR8A 1LORA 2WSRA 1EWDA 4AF0A 1H61A 4JTIA 1G6CA 3G0UA 3BARA 1JRBA 3L0GA 1FBAA 5G4EA 4D2JA 5D2YA 1AW1A 2Q8ZA 1H1ZA 3WJXA 1HO1A 2ZZ3A 1TSIA 2O7SA 1I2NA 1XCFA 1I2PA 3D0CA 1QWGA 2ISWA 1LTDA 5K4ZA 2C14A 3UXAA 3LCWA 2YSWA 3W76A 1O4UA 4GUJA 3FJ6A 3NQCA 4ONVA 3NR0A 3EWWA 3I65A 1QPRA 4PFMA 2ALDA 4UFMA 3GNDA 2C0AA 2ZTJA 4HSOA 1GZGA 1O5KA 2A6LA 4QNWA 3GR7A 1K7XA 8TIMA 1VC4A 2BX7A 3FKKA 4IMEA 1TTIA 5CKSA 3BG9A 4KFOA 1LZOA 1FWTA 3ATZA 3NQGA 3SFKA 1FUYA 1FDZA 2ZA3A 1N7KA 2NWRA 5I3GA 1RD5A 4RR4A 4OHQA 3G0SA 3DKLA 1RPXA 3UXDA 1W8SA 1W3IA 1L6YA 3HB9A 4UR7A 3W3OA 2VENA 3DKJA 5TIMA 1KM5A 1Q6OA 4K36A 3QPZA 5F2GA 3DFQA 3LCIA 5AHLA 3UYCA 3IV3A 5KZMA 5LHEA 1VYSX 3LI1A 5HINA 1DJNA 5LZLA 2WO5A 4LTSA 4DEFA 3DXIA 3QM3A 4AMAA 3FYPA 3W2NA 5GVJA 4UFIA 3GDRA 3MYPA 5HQEA 2I14A 2JGQA 2G96A 1FXPA 1O94A 2ZZ2A 3SIZA 4K38A 4TO8A 3NOEA 1QPNA 1TB3A 1ICSA 5HWJA 3HGJA 2A7RA 3B05A 2JKEA 1DQXA 3DFTA 1EA0A 3C2FA 3U8GA 1HFBA 4BWLA 3P5ZA 1NFBA 3NNTA 2VFEA 2E5BA 3KXQA 2VOMA 1SSGA 3BK0A 3O6YX 3PVFA 1YDNA 4ZQMA 3HGOA 1QAPA 1MEIA 1QCWA 3CLMA 1KA9F 4WY0F 2WJZA 4XKYB 3Q2DA 1A5CA 3TIMA 4MY1A 4MZ8A 4UFHA 4IMCA 1YTDA 2OX1A 5LGXA 5AC6A 5HNRA 3L0NA 4GFSA 1JUKA 2FPTA 1FDYA 2HS8A 1QO2A 2Y89A 2YDAA 4JGDA 4Z1AA 1SPQA 4H4IA 1QR7A 5AYZA 5CSRA 3S1WA 4NT0A 1T0OA 3HO8A 3NM1A 3P60A 4E2DA 1IXQA 3VFLA 2CZ5A 5G2WA 3W2LA 4O15A 4CNNA 5D30A 2EAWA 1OG0A 1KM1A 4CNOA 1KTNA 1SO3A 5LHFA 2NUWA 3TK7A 3LXCA 4N9CA 2QJHA 5IBXC 3BW2A 4JTFA 4JTEA 3GYEA 3W07A 5C2XA 4QNEA 2QCEA 3HMJG 1F74A 3SGUA 1VRDA 2F84A 2QKFA 1F6PA 3OEXA 4FNPA 3WJYA 1GEQA 2P10A 3NPUA 3R13A 4AXKA 2HSAA 2WSYA 2J9ZA 1TPFA 1ZHAA 5KMYA 3W85A 4MYXA 3TFXA 3PSWA 4RXFA 3HF3A 5K3VA 5F4SA 3W7OA 3C6CA 3KHJA 1GYLA 1N55A 3UZ5A 4MVAA 3BPWA 1DV7A 1OVDA 1CX9A 3A5FA 5EBUA 1UCWA 1WBHA 1GTHA 1QPQA 3LBMA 3PBUA 3QZEA 2CLFA 1XUZA 3GK0A 1CW2A 2ZRUA 4QISA 3G3MA 2GQ9A 4GC4A 3PG9A 1XBZA 3MHUA 1JUEA 2QCMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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