2ZQ0A

Crystal structure of susb complexed with acarbose
Total Genus 251
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
251
sequence length
718
structure length
704
Chain Sequence
MQQKLTSPDNNLVMTFQVDSKGAPTYELTYKNKVVIKPSTLGLELKKEDNKLDSKTNLYDGFEVKDTQTATFDETWQPVWGEEKEIRNHYNELAVTLYQPMNDRSIVIRFRLFNDGLGFRYEFPQQKSLNYFVIKEEHSQFGMNGDHIAFWIPGDYDTQEYDYTISRLSEIRGLMKEAITPNSSQTPFSQTGVQTALMMKTDDGLYINLHEAALVDYSCMHLNLDDKNMVFESWLTPDAKGDKGYMQTPCNTPWRTIIVSDDARNILASRITLNLNEPCKIADAASWVKPVKYIGVWWDMITGKGSWAYTDELTSVKLGETDYSKTKPNGKHSANTANVKRYIDFAAAHGFDAVLVEGWNEGWEDWFGNSKDYVFDFVTPYPDFDVKEIHRYAARKGIKMMMHHETSASVRNYERHMDKAYQFMADNGYNSVKSGYVGNIIPRGEHHYGQWMNNHYLYAVKKAADYKIMVNAHEATRPTGICRTYPNLIGNESARGTEYESFGGNKVYHTTILPFTRLVGGPMDYTPGIFETHCNKMNPANNSQVRSTIARQLALYVTMYSPLQMAADIPENYERFMDAFQFIKDVALDWDETNYLEAEPGEYITIARKAKDTDDWYVGCTAGENGHTSKLVFDFLTPGKQYIATVYADAKDADWKENPQAYTIKKGILTNKSKLNLHAANGGGYAISIKEVKDKSEAKGLKRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and functional analysis of a glycoside hydrolase family 97 enzyme from Bacteroides thetaiotaomicron.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Alpha-glucosidase (Alpha-glucosidase SusB)
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron
total genus 251
structure length 704
sequence length 718
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.3: Glucan 1,4-alpha-glucosidase.
pdb deposition date 2008-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10566 Glyco_hydro_97 Glycoside hydrolase 97
A PF14508 GH97_N Glycosyl-hydrolase 97 N-terminal
A PF14509 GH97_C Glycosyl-hydrolase 97 C-terminal, oligomerisation
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.70.98.10 Mainly Beta Distorted Sandwich Beta-galactosidase; Chain A, domain 5 Beta-galactosidase; Chain A, domain 5 2zq0A01
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zq0A02
2EPHA 3TX9A 4YXGA 4YCPA 4JYEA 3W70A 3MMTA 2FPYA 2J24A 1OK6A 3I6RA 3A21A 1EP2A 4IMFA 5D2TA 2PRHA 3W7OA 3G3DA 1QPRA 1OABA 1TQXA 3HIJA 1FQ0A 2A6LA 3IGXA 4O17A 5G2WA 3QYQA 4E2DA 3T2QA 2A2IA 2H3DA 3CQ0A 4Z0SA 3PBUA 3P82A 1DP0A 1HM3A 1AW1A 3NVTA 3SFKA 2FPTA 3NL2A 4JY8A 4Z1BA 2C6QA 5F2MA 5AYXA 3MW7A 1A5CA 1NSJA 3KRUA 1YADA 1OFEA 4K6AA 2J27A 1LLZA 1W3YA 1WDWA 3GK0A 4BZHA 1ZNNA 3PB2A 4Y96A 4DELA 1TV7A 4MFEA 3W7DA 2ZA1A 1YTDA 4FNRA 3MHUA 2YX0A 1XXXA 1KFEA 5CPMA 3W88A 5F4SA 5G2HA 4UTUA 1NSUA 3TU9A 5KSWA 5CKSA 4BK9A 1SO4A 1EX5A 2VENA 1H51A 3BO9A 3MI3A 2BSLA 2WJZA 5DXYA 2Q8ZA 4DF1A 4WX2A 1H7XA 2WVZA 1AMKA 4BI7A 1W8SA 2A4AA 3BG9A 5LGXA 4WZHA 2R8WA 3G1DA 3GAYA 4NXSA 3A24A 3S5OA 3ZR4A 2OX1A 3JRKA 1ZAHA 1F1SA 1YPIA 4BWLC 2ZRYA 3FJLA 1CB8A 3KVKA 3V1PA 3FKKA 3STEA 3NNTA 1F73A 4IX2A 4AVFA 4LVDA 4M5PA 4LNYA 1H7PA 3KRSA 1W54A 2V82A 1OJMA 2WNNA 3VKJA 1KM2A 2FB3A 3OVPA 3HG5A 4O10A 1SO0A 2OJPA 5MHBA 1LRNA 1SFLA 2UV8G 2ZTJA 4IMGA 3DFPA 4GFSA 1LF6A 4ZQRA 4NX0A 4ALDA 3GKAA 4N02A 1VRDA 1H62A 2PRMA 4UFIA 3C2OA 1IXOA 2Y7EA 4XQ6A 1D9EA 5EKYA 4XTDA 4AWSA 2X1UA 4AAJA 2A85A 5CSSA 3GXNA 3CHVA 3THQA 3MWXA 3O07A 2YYTA 4OU1A 4PL2A 1K1XA 4N9EA 3G0UA 2QUUA 2H3BA 3T55A 3RNDA 4RLIA 1KTCA 3O1NA 1UB3A 3KOFA 1AL8A 2I14A 2CU0A 3OBKA 2RDTA 2C19A 3PSWA 4U4MA 1RWGA 1PCWA 4IX0A 4NUWA 5AHMA 2VOMA 3UPBA 3MUY1 5LNRA 4LW7A 1B4EA 1LRQA 1I8QA 1YLVA 3MI6A 3TSMA 1ZHAA 4FXSA 4BFAA 4GJ1A 1JUEA 1JCYA 5DN1A 1N7KA 3MV11 3QQ1A 4WJEA 5DBTA 5IM51 4K36A 3P5YA 4RJEA 3P81A 3IVTA 1O94A 3M1ZA 3DKJA 5LSMA 1SR9A 1TXKA 2H8XA 3N19B 3G24A 2Y61A 3NYZA 1D3GA 4UTKA 3OB8A 3W1PA 3HMJG 1QR7A 3T09A 3RLUA 1QDSA 2C16A 2RFGA 4PL1A 3L5LA 4Y6GA 3LCWA 3EWXA 1GYLA 3EB2A 4BI6A 4O12A 4KFNA 4LRSA 5CGQA 1KW1A 4LU0A 3CIXA 4QM1A 5LGZA 3DI0A 1VYSX 1C82A 3NL6A 4YMZA 2A7NA 2ZZ2A 4JTLA 2Y7FA 2ZZ1A 4HNNA 4OWGA 3LRKA 3RF9A 4UFLA 3W87A 3GNDA 2O7SA 4ONVA 2BRPA 3LCXA 4UFKA 4I7VA 1FDYA 2Z6JA 3STCA 3W1UA 1AW2A 1P1XA 3NQ6A 3PBVA 4RNLA 2RDWA 1O95A 4JTHA 4FEZA 4DPQA 3BGJA 2CIRA 4IMCA 3T7VA 2WO5A 2QCHA 1HN1A 4MOZA 4H3DA 1KV5A 3CZJA 4N6FA 1YDOA 1N55A 3GDMA 2C0AA 3HJZA 2ZFAA 4FNSA 2WZSA 4HPJA 3BLFA 4N9DA 2I9EA 3L65A 1K3UA 1YTEA 3W23A 1LYXA 1ALDA 1DL3A 2BTMA 4AQ0A 5HWJA 5K4XA 3OBAA 4LVAA 3VD7A 2GOUA 3E12A 3M5YA 1JZ8A 1Q45A 2JKEA 3C2FA 1TRDA 4H6KA 1IXPA 5HMSA 4GXMA 1OK4A 4E2BA 1NS7A 3IIVA 3O15A 2VFGA 3IMHA 4O16A 4FB7A 1W3TA 3E02A 1ZFJA 1UG9A 1RWAA 5HR6A 4NJGA 3S0CA 1JRBA 1OJPA 3C3NA 2ZDRA 3G8EA 1FWNA 4LWWA 3W86A 4AF0A 4PC8A 3UZJA 4QSHA 3MBDA 3LCGA 1WBJA 3O8AA 1CI1A 3JR2A 3MP5A 3S5NA 2XSGA 1I4NA 2FIQA 3ABQA 4CCEA 3N9RA 2V2DA 4GUIA 1OFPA 1MMXA 4P61A 2VC6A 4FNPA 2WVXA 5EPDA 1LF9A 4JTGA 5K7JA 4X2RA 5DY2A 3HB9A 3U2OA 2HTBA 2OZ0A 4O8RA 1H63A 5A8GA 3V75A 3KHJA 1H5YA 1SU5A 3IAPA 3TROA 4A22A 5K2ZA 4JIQA 4PODA 4AMAA 3N3MA 3PBWA 1YDNA 3W72A 1F74A 1GZGA 3W1LA 4AEOA 1EPXA 5BNKA 1WX0A 1NS0A 2QR6A 4WOZA 4C1KA 5C5YA 2RH9A 1H1ZA 4MZYA 3DHFA 5L6UA 2WSQA 3R5EA 1XUZA 5TBOA 3E96A 3HPSA 1H7WA 4H4IA 1DOSA 4MZ1A 3B0UX 1EGUA 1VHNA 3FA5A 2NWSA 8TIMA 4R33A 3EXTA 3QZEA 4JX5A 3W1NA 1LOQA 1JYWA 1X7FA 3P74A 3GXPA 3P8IA 1SO6A 1H61A 3VNDA 2B7QA 3BLEA 1N7OA 4NT0A 4NVTA 4JYFA 3ECQA 5LNWA 1LDCA 4M6PA 3SIZA 1VZWA 2TRSA 2QJHA 3TH6A 1SW7A 3UY7A 1FDZA 4UC5A 2ATSA 1ZJIA 1LXMA 1JCXA 4IQLA 3S5YA 5T26A 3PB0A 1L6SA 5FEZA 4UTIA 3MHGA 3M41A 3TNOA 4FNQA 3E1F1 1SO5A 2ZA2A 3NPXA 1TPWA 2E5BA 2NWRA 4O19A 5DCEA 4A2RA 4O52A 3NQCA 2QCFA 3G1AA 4N2YA 1H7OA 2NLIA 3IIPA 4UTMA 2QCNA 4IXXA 1ULVA 1P5BA 4LVGA 1VC4A 1W1ZA 2A21A 4NU7A 4N6EA 1Q6RA 3B0VC 3TMLA 3B06A 4RKAA 4J9JA 3IAQA 4PFMA 1UJPA 4JICA 5I3HA 4QJ1A 4ORMA 1SZGA 5G4EA 2WCOA 2NZLA 3QRHA 3RK8A 1W56A 1KFJA 3GIYA 3VDAA 2WW3A 1UUMA 4FIRA 1Q6OA 4NJIA 4UNKA 2Q3OA 3A5FA 3OS7A 1QNVA 2B7NA 4CLMA 2JGYA 4O57A 1GOXA 1OX4B 3TXVA 2NXHA 4LVBA 5HJLA 3WJYA 1T0OA 2WW2A 3HGJA 1G4SA 1K8XA 5D37A 1TPVA 4BZFA 4GBUA 5AC8A 2Y70A 2QCCA 3LLDA 1G6CA 1GVFA 4RZ4A 3NL3A 2DZWA 1GJPA 1YYAA 1XBVA 4EF8A 4TX9A 5E93A 3PVFA 1F7BA 3VDCA 3KFTA 2ZRVA 3NJVA 4RZ5A 2PC4A 3N2XA 2YGYA 1W5QA 3HF3A 4O14A 4JTKA 3OA3A 1BWKA 2CZDA 1NSRA 3CIWA 5F1VA 1PE1A 1W5OA 5HQEA 1SSDA 3VE9A 3I3BA 1L2UA 4WY0B 4AHPA 5EMUA 3NPWA 3LHUA 2VFHA 2EKCA 2Y6ZA 1JZ6A 1BTMA 4QNWA 1FY6A 3DAQA 2GVGA 1LBFA 1TMHA 1TJPA 4DXVA 3RLVA 1XL9A 2Z2UA 1G67A 1XM3A 3R8RA 4UTLA 3PR2A 5IBXC 1KLYA 1VLIA 2YFOA 3FFSA 4MYXA 2HMCA 2VFEA 2YYUA 3W2NA 4ZMGA 2J9ZA 1R47A 5KZEA 3I7SA 4WUIA 4ZQPA 1FWTA 4GRSA 1KA9F 3LLFA 1C8VA 2DU2A 4MJMA 2VFIA 1YGAA 2CZFA 3W07A 2WSRA 2VEKA 4Z1AA 2F7FA 4MPQA 3RU6A 1NS8A 1W31A 3S5ZA 3NM1A 2ABAA 2ZQ0A 3I7QA 1OYAA 3L0KA 4Z1DA 2B7OA 5IBXA 5FF0A 1TRIA 4UNLA 3IVUA 2AGKA 1PCKA 3ANYA 3W9ZA 1TIMA 4OV9A 4K7YA 1TREA 3E9AA 4JTSA 1F6PA 4EF9A 4GNJA 1VLWA 2QCDA 1QPQA 3FLUA 4MYAA 2OT1A 3NO5A 3NZ1A 4QQ3A 3UWUA 1U83A 3GKFA 1VYPX 3F4WA 2AAMA 1G7VA 1MZHA 1E51A 1RQHA 2H8ZA 1QO5A 3HG2A 3BG3A 4TIMA 2DORA 5EL1A 4PTNA 1KFBA 3VI2A 1SZEA 1FX6A 2NX1A 2ISVA 3C4UA 3Q37A 1OX5A 4HNTA 5BMXA 3Q1NA 3NL5A 4S2CA 1W5NA 4PA8A 2WDAA 3QM3A 1H60A 3QFEA 1TTIA 2X2GA 1WXJA 2V81A 4DUWA 2ZCGA 3MV01 2CIQA 3A5VA 4LS2A 2EF9A 2WVYA 3W2MA 1I2OA 1PVNA 4KFPA 4NJKA 5K3VA 1DJQA 4KWWA 5F2IA 1JCLA 3C2EA 3HGOA 4LUJA 3BG5A 5DCBA 4LTSA 1F05A 2E68A 4OGZA 4NNCA 1VPXA 3THAA 4GWEA 4CQ9A 3MUXA 4IOTA 3RFAA 3W7EA 4I9AA 4R53A 2Y62A 4KFOA 5AC6A 5D38A 3LBCA 5DY3A 3WJZA 4I7WA 3P80A 4FX6M 1B3OA 3LHZA 1ADOA 4IPIA 2CLIA 2PE4A 4OQVA 1K7XA 1FCQA 3TIMA 5A5WA 1EB3A 3O63A 1LM1A 5D2XA 3SSJA 3F4NA 3VD9A 1LTDA 1JR1A 4UFMA 3K25A 5LKYA 1G4PA 5AFDA 5LHFA 3ATZA 4KKXA 4EOUA 1W0MA 3W7NA 2NXGA 4M7TA 4HNUA 4IMEA 4HKPA 1L7JA 3W7PA 3W7RA 3GYEA 2WW1A 1QPOA 2DZXA 2QEZA 3PWAA 1OFQA 5AN7A 3TAKA 4XKYB 5BW6A 1LBMA 3LHYA 3NPUA 4JYDA 3TW6A 2CZEA 2O7QA 2QCMA 1WAUA 2V8ZA 1DQXA 1VCVA 3FEMA 1JRCA 1EP3A 2E22A 3B4UA 3L66A 2CLKA 1A5AA 1HO4A 3L21A 3P84A 1HMUA 2WPBA 4CNOA 2YXGA 2V30A 5G4WA 4AWUA 4IMDA 3TC6A 4ADTA 2V9DA 4O1BA 1R2TA 5FEPA 4LV4A 1UCWA 2OT0A 3I68A 1XC4A 1L9WA 1J4EA 4DO6A 3ELFA 1LCOA 3W7LA 4O4WA 1RWFA 2VEMA 5BOOA 5KTLA 1OX6A 4Q33A 3TJXA 2GQAA 3S1WA 3LRLA 3GNNA 1JYNA 1H7NA 1TB3A 1OVDA 4JGDA 4NZJA 5KZDA 5F2GA 1NVMA 1NSVA 2FFCA 3GX9A 4JTJA 4TR9A 4MY8A 1IIHA 1Z42A 2E1DA 3KVJA 2CISA 3UXAA 3ZFHA 3SGZA 1OF8A 4FHAA 1HO1A 3QSRA 1N7PA 4MLRA 1MN0A 3CWNA 3PUEA 1U5JA 2YW3A 1OFAA 3W7HA 3VE7A 3W84A 3B04A 1WQ5A 3VFLA 1VGAA 4YWIA 3G1SA 3NGJA 2EAWA 3DBPA 3EWYA 5U4NA 3TAOA 1RD5A 2G96A 4MUZA 4WY0F 3OVRA 1K02A 1GQNA 3HG4A 3D0CA 1GVSA 4Y8FA 3OVQA 3MYOA 2CLOA 2DJXA 1FWRA 3LXCA 2ZA3A 1O5KA 2G95A 4PEKA 1LXKA 1TPFA 3NQAA 2RKXA 4O1AA 4X3ZA 4JD4A 3PSVA 1T8XA 5E1QA 4A21A 3IRDA 1GG1A 1K1YA 3I3EA 3VD5A 2CFFA 4DBDA 3TDFA 4U28A 4ADUA 4MIMA 4UMAA 1MMUA 1RWCA 1VJIA 1XI3A 3DENA 3EWUA 4UUIA 1X1IA 3NXFA 1NSSA 1OG0A 2C3ZA 3TV8A 4Q4KA 1WYIA 1G7UA 4DPPA 1DBTA 4LV9A 4JTFA 3C2VA 5FF4A 1JCNA 1HG3A 1XDLA 1P0NA 3ZS4A 3S1UA 3W3OA 4TTGA 1X1JA 4GUHA 3QH2A 2PRLA 3QMSA 4W9TA 5CZJA 3R13A 4JTTA 2CLMA 3ABOA 4M6QA 2PURA 3DECA 4I7UA 1JCMP 4E38A 4Q32A 4TO8A 3R2GA 2QCGA 4NQ1A 2NUYA 4XBKA 5LNUA 1PIIA 3NDOA 3DYMA 2NXIA 1NF7A 5BMWA 3ATYA 3NQ8A 3G1HA 4MY9A 3G18A 2YCEA 3SI9A 1K8ZA 2BXVA 2Y89A 2V5BA 3BLIA 1T96A 2FJKA 5D33A 2NV1A 1FDJA 4POCA 4S2BA 2XHNA 4GUFA 2P1FA 2B0MA 1FWSA 1V7YA 1W3IA 3LI0A 4FO4A 5K4ZA 3LERA 3P62A 1JZ7A 1J5TA 3T44A 2Y88A 3B8DA 1XUUA 2A0NA 1Z41A 2X1RA 4WD0A 1F5ZA 4JDBA 3UNDA 1ZAJA 4RXGA 3EWBX 3W7QA 2BWGA 4ADSA 4UTHA 2ZRUA 3DZ1A 1Z48A 1OHLA 1Q3NA 4NNBA 2ZZ6A 3F03K 1NS4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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