2ZQ0A

Crystal structure of susb complexed with acarbose
Total Genus 251
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
251
sequence length
718
structure length
704
Chain Sequence
MQQKLTSPDNNLVMTFQVDSKGAPTYELTYKNKVVIKPSTLGLELKKEDNKLDSKTNLYDGFEVKDTQTATFDETWQPVWGEEKEIRNHYNELAVTLYQPMNDRSIVIRFRLFNDGLGFRYEFPQQKSLNYFVIKEEHSQFGMNGDHIAFWIPGDYDTQEYDYTISRLSEIRGLMKEAITPNSSQTPFSQTGVQTALMMKTDDGLYINLHEAALVDYSCMHLNLDDKNMVFESWLTPDAKGDKGYMQTPCNTPWRTIIVSDDARNILASRITLNLNEPCKIADAASWVKPVKYIGVWWDMITGKGSWAYTDELTSVKLGETDYSKTKPNGKHSANTANVKRYIDFAAAHGFDAVLVEGWNEGWEDWFGNSKDYVFDFVTPYPDFDVKEIHRYAARKGIKMMMHHETSASVRNYERHMDKAYQFMADNGYNSVKSGYVGNIIPRGEHHYGQWMNNHYLYAVKKAADYKIMVNAHEATRPTGICRTYPNLIGNESARGTEYESFGGNKVYHTTILPFTRLVGGPMDYTPGIFETHCNKMNPANNSQVRSTIARQLALYVTMYSPLQMAADIPENYERFMDAFQFIKDVALDWDETNYLEAEPGEYITIARKAKDTDDWYVGCTAGENGHTSKLVFDFLTPGKQYIATVYADAKDADWKENPQAYTIKKGILTNKSKLNLHAANGGGYAISIKEVKDKSEAKGLKRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and functional analysis of a glycoside hydrolase family 97 enzyme from Bacteroides thetaiotaomicron.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron
molecule keywords Alpha-glucosidase (Alpha-glucosidase SusB)
total genus 251
structure length 704
sequence length 718
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.3: Glucan 1,4-alpha-glucosidase.
pdb deposition date 2008-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10566 Glyco_hydro_97 Glycoside hydrolase 97
A PF14508 GH97_N Glycosyl-hydrolase 97 N-terminal
A PF14509 GH97_C Glycosyl-hydrolase 97 C-terminal, oligomerisation
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.70.98.10 Mainly Beta Distorted Sandwich Beta-galactosidase; Chain A, domain 5 Beta-galactosidase; Chain A, domain 5 2zq0A01
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zq0A02
1FY6A 3PSVA 1UUMA 1VCFA 4A21A 2D73A 2C19A 3NQ2A 1KBIA 1IXOA 4PFMA 5CZTA 3OHIA 2ISVA 1RPXA 1I8JA 1VYPX 4HT3A 3W73A 4OV4A 2G5WA 2B0MA 1QO2A 3HOJA 4MY1A 1MMUA 2J9ZA 1ICPA 1T8XA 3EWXA 3B04A 3NPUA 5GVJA 4JX4A 3LBMA 5K9DA 3T44A 3T0BA 3TQKA 3P7YA 3FOKA 3I3DA 4K38A 4Y8FA 3M44A 4M6QA 2HMCA 2CLHA 2ZCGA 4O54A 3NL6A 2GOUA 3RU6A 1N7PA 5D30A 3PUDA 4ADUA 3I3EA 2QCGA 1NSJA 2R91A 3TU9A 1F4HA 2BWGA 1QPQA 4A2RA 1GG0A 4DF0A 3L0NA 1C9DA 1GT8A 3LXAA 3A22A 3FJLA 3HGOA 3PBUA 2DZSA 2W6RA 4JTIA 1GTEA 2QJIA 1XBVA 5D2WA 2R14A 2XFWA 2PC4A 3M7WA 1TJRA 4WOQA 2CFFA 2CIRA 1YXCA 4BWLA 1J5TA 1ZFJA 3PBYA 1HUVA 4FX6M 4JGDA 3IIVA 5D02A 1JUEA 5LGXA 5H2ZA 1FUYA 4RKAA 5A5WA 3S5ZA 3D0CA 3SECA 3DFSA 3WJSA 2G96A 3UYCA 4UTJA 5EYWA 1WXJA 1I2OA 4LW7A 3CT7A 5DCBA 2HS8A 1EX5A 1ZY9A 4O8RA 2P1FA 1GVRA 4K8EA 3S1XA 3HG5A 1F74A 3TDFA 1F76A 3RLUA 1TIMA 4JTUA 2ZZ3A 2QJGA 1LURA 5DLCA 3E9AA 2WNNA 2AGKA 3AO0A 3H54A 5CZ0A 1ZALA 3LRLA 1PX3A 1S3HA 4EF9A 3NJXA 4FIRA 3LXBA 3K25A 4MZ1A 2OT0A 5EMUA 3S0CA 1SZGA 1GOXA 1JULA 4Q32A 3E96A 3ZWTA 1NS0A 2X1UA 1MN0A 1RWCA 2JKAA 3CEUA 1Z42A 4UFHA 1PX4A 4M6PA 3DENA 5DCDA 4JD4A 3N9SA 1WX0A 4K7VA 3SEPA 1VJIA 1JZ6A 3IGXA 3QMRA 4UTKA 4D2JA 2Y62A 2C16A 4BK9A 4DO4A 3T2QA 4NNCA 4RXGA 1DORA 2GVLA 2V5LA 5AC8A 1SO4A 1TPFA 3ZWSA 2YCEA 2C1HA 4UFJA 1FCBA 1JUBA 1LROA 2G95A 1KM0A 3QSTA 4UIOA 2E6YA 3O1NA 3UXDA 2Y89A 1XBXA 1EUAA 3I7SA 3IV3A 3PWAA 4JN6A 4CQ9A 3FYPA 4I7WA 4K36A 2RH9A 4JYFA 1VHNA 1W5PA 4YLWA 1RZMA 2QCDA 3BK0A 4S1FA 1JUKA 4LC8A 1SZEA 4XWUA 5CPNA 5D05A 2CZFA 5SWUA 1VR6A 1A5BA 3VD9A 4UTHA 1HG3A 1X1OA 4O11A 3U2OA 1KM5A 3N73A 1WQ5A 3PB0A 2YXGA 3W1XA 1TMHA 4JTKA 4R34A 1GVSA 1S5VA 4RXFA 4FXRA 1VGAA 4DELA 4AWSA 3W76A 1X6UA 2ZZ5A 2ABAA 2YSWA 1XDLA 3NQ6A 3MWAA 3I6RA 1O95A 4XTDA 1XCFA 1VRDA 4RX0A 2EAWA 2TYSA 3IIXA 5LSMA 1NSZA 1TQJA 3GDRA 4LS1A 2PRMA 4E2BA 5BMWA 1R30A 3SFKA 1W8SA 1A50A 1Z45A 4NZJA 5G2WA 3EXTA 3GX9A 1LOQA 3FA5A 4HPJA 2BX7A 4AHQA 2OCZA 5F4SA 3W1UA 1MXSA 3NREA 4KFOA 1FCQA 3BV4A 4QISA 2PRHA 5HMSA 5CG7A 2NUWA 4TTGA 2IQTA 3F03K 1HL2A 4P2VA 4NX0A 3YPIA 1DOSA 3ECQA 5D2XA 2DZWA 1ZENA 1FQ0A 8TIMA 2ZFAA 4CNNA 3TKFA 3W75A 3HF3A 4GUGA 4E38A 2VEPA 1Q3NA 4UTUA 4Y90A 5F2GA 1N7NA 1TTIA 3W2MA 1IIGA 3N2XA 1BWKA 4K37A 1RR2A 4GFSA 2A7NA 4M7TA 3W1RA 3TA6A 1RD5A 2CLEA 4O15A 1EUNA 2VFGA 3A23A 3UWYA 1EWEA 1OK6A 4P61A 1LTDA 3W7IA 2G97A 4O1CA 2B7NA 3DCDA 4NNAA 3NQCA 1TPEA 4WY0A 4NQ1A 3TW7A 5BOOA 4JR5A 5D04C 1FDJA 3LERA 4IX2A 3GNNA 3NL5A 2YW3A 1C82A 1WDWA 3T2PA 1Y0EA 2UV8G 3NQFA 1LORA 4LVAA 4MZ8A 3IGUA 3OVPA 5D09A 4DBDA 4R53A 2ZRVA 5J5DA 3A9IA 3DFNA 4TMCA 2QCHA 3M9YA 3C2RA 2I14A 4I9AA 2GQAA 1KFCA 4N4PA 1LLZA 4Z0JA 3PB2A 1FDYA 4JDBA 1JCXA 4XKYA 4A29A 1JZ7A 4POCA 4CCCA 3W7QA 1A5CA 3INPA 3STEA 4ZQOA 1SQ7A 2WVZA 4MFDA 5K3VA 1W37A 1I45A 4JX5A 3G18A 1J0MA 1EIXA 2X1RA 2ZRZA 3LTPA 4IMDA 3OVRA 2EF9A 1KM3A 1D3GA 3TAKA 3DBPA 3AJXA 1EGUA 5AYZA 2YGYA 3C56A 5AFDA 3TMQA 5K4XA 4IJBA 2C18A 4YMZA 2GVJA 3SSJA 5KZMA 3EX1A 4IMGA 3B03A 5E0KA 2RDWA 1R2SA 1BKSA 2ZA3A 3L0KA 2ABBA 5IBXC 3GKFA 1HM3A 1H50A 3I7RA 2ZDRA 5AYYA 5CZJA 3BG5A 4GNJA 5G5IA 1OJXA 2QDHA 1N7RA 1NS7A 1XFBA 3PSWA 3S42A 2AAMA 3DFQA 1HMUA 1MZHA 3LHVA 3WK2A 3QJAA 4Z08A 1UCWA 3W7DA 1OFAA 1F5ZA 3TXZA 3LI0A 5BW6A 1YDVA 4AXKA 5U4NA 3P8IA 4DEFA 4QM1A 1TYGA 1M6JA 1ICSA 4MLRA 2ALDA 3LLDA 3OBAA 4ZMGA 4O13A 5FEZA 4DBEA 3DFPA 1NVMA 2NWSA 5EKYA 2GJLA 4HNUA 2CU0A 1G69A 4M19A 3CWNA 4QNEA 2CLIA 3IEBA 4ZQMA 3ABRA 4XZ9A 1KLYA 3S9YA 3TQVA 3CM4A 2YW4A 1TPDA 2DZXA 4NX5A 4ORMA 1AW1A 2V2DA 3HPSA 1ZAJA 4UTWC 1JZ3A 3EWBX 3TSBA 2ZYFA 5HR7A 4Z1DA 2RHGA 1F6KA 2WVXA 3TR2A 3NPVA 3W23A 1TPVA 3PUEA 3C2OA 3UWQA 5I3JA 4OBTA 3G3MA 4UR8A 2XHNA 2TPSA 3EX4A 3P5ZA 4MLJA 1XBZA 2Z0IA 5E1QA 2E09A 5C54A 1KM4A 1V7YA 2NUYA 4FNPA 4MPQA 4L4LA 3TSMA 1BTMA 4LVBA 2FPVA 1NKGA 1TRDA 3ZS4A 5C5YA 5G1TA 2H6RA 3CHVA 3SGZA 1GVQA 1X1IA 3TSDA 1EP3A 3IAQA 1DBTA 2Z6JA 4UFIA 1VCGA 4XTIA 4LOCA 5D33A 4BI7A 3Q1NA 4BZGA 2WSQA 4IXXA 3BLEA 1H7XA 3UWZA 1TQXA 3OA3A 1J0NA 3KOFA 2RFGA 4QNWA 1TPH1 3W1QA 3NQDA 4WXYA 3NPWA 1K8YA 2B7OA 3JRKA 1KTNA 1XBYA 4RK8A 3HB9A 4AWTA 3W7NA 3GXNA 2NZLA 5K7JA 1G6CA 1GYLA 3W1NA 3A21A 4FIQA 1PL9A 3W71A 1H1YA 2ZQ0A 2WSRA 4RZ5A 5BRBA 4N9CA 5G1YA 1LRNA 1GVFA 1G4PA 2VFDA 5F2IA 1WBJA 3MHGA 3GAYA 5HUOA 4AMAA 4GC4A 3DYPA 1WBHA 3SZ8A 3V1PA 1C8VA 3EXSA 2QEZA 4NUWA 1RQHA 2J9YA 3HPXA 3UPBA 2OJPA 5A8GA 2GQ9A 1NF7A 3DKLA 3NAVA 2HTAA 4AH7A 4WUIA 1G7VA 3DHDA 1YTKA 3LCIA 3NOEA 2QJHA 3M41A 1DJQA 4JYDA 1OK4A 1ME7A 4JTEA 3W1LA 1KV8A 3MI3A 4X3ZA 1NS2A 2ATMA 1JYNA 3EXRA 2VC6A 3DAQA 3T08A 3NQ8A 4JX6A 5DXXA 4UUIA 1VHCA 3IVUA 4EIVA 3PG8A 2A21A 3C0JA 3IIOA 1W5NA 4K6AA 1T96A 1GJPA 3N34A 2WKJA 4O14A 4JTTA 4FEZA 3CQ0A 4AQ0A 5CPLA 4LS0A 1PS9A 1XM3A 5BNKA 1L9WA 2WOQA 2Y61A 4DF1A 2A5HA 1H63A 3G1XA 1LOLA 2VFFA 4BWLC 1OFRA 3TH6A 4E2DA 3O63A 3W22A 4MY9A 3M1ZA 4DF2A 3GR7A 2JBMA 1HM2A 2CLFA 3BW4A 3BGAA 1K7XA 1G7UA 2QKFA 5HWMA 3C8FA 3O15A 3STGA 1P0KA 2V30A 1AG1O 4HKPA 4XBSA 4BZHA 1IGSA 5AB3A 3P62A 4LC6A 4MIMA 1CX9A 1P5BA 3LOTA 2Y7GA 2A0NA 3EX2A 2F7FA 3LB0A 5LNRA 1DQXA 1QWGA 2ZA2A 3KFTA 1P1XA 1H5YA 1OFOA 3G0UA 1HFBA 3PBWA 2H3BA 3LRMA 4U28A 1X7FA 2X30A 4TU1A 4X9SA 3NZRA 4XKYB 3H53A 1OJMA 2A2IA 4FNRA 1SZFA 5KSWA 1B9BA 1EEPA 1RQBA 4XQ6A 3T4CA 3IAPA 3EKLA 2XN0A 1TTPA 2WQPA 3QMTA 4JICA 3PULA 1U83A 2V0TA 2DZUA 4UMCA 2KZHA 1GWJA 4A22A 3W3OA 4RZ6A 1LF9A 2ZZ7A 1M7OA 1X1ZA 3TAOA 3VD5A 1PIIA 2ZRXA 2WNZA 4XBKA 3P84A 3NR0A 5H91A 3SIZA 2H90A 4PH6A 3OVQA 3TC6A 1H7RA 2ZZ4A 1G4EA 1U5JA 1QPNA 5F1VA 4S2BA 4C1LA 3RFAA 2ZZ6A 5I3IA 3W84A 2JKPA 4MVAA 1RWGA 4IQLA 5DY3A 3GNDA 2GVGA 2FPYA 3B4UA 2Z6IA 3WJXA 3VCRA 3TXVA 3VI2A 2ZTKA 1SW0A 1W3IA 4NJIA 4O17A 4IWWA 4UCGA 1LBFA 4ZQRA 3I7QA 3KVJA 3M5YA 3RNDA 3L9CA 4ZL1A 3W7EA 3NO5A 4GUIA 5FF0A 5TBOA 1QDSA 3UWWA 3OIXA 1H1ZA 1S5WA 3VD4A 1OYAA 3S5OA 5K9CA 3PBVA 2WCOA 3RLVA 5HWNA 4UFMA 2VEMA 2CWNA 2C13A 1N55A 4I7VA 3MYPA 1JR1A 3L5MA 3QW3A 5KZEA 3ANYA 3W83A 3WK3A 4CQAA 5EY5A 3W7CA 1YDNA 3MWXA 1TRIA 1RW9A 4PC8A 5LNSA 4UMBA 2CISA 4AHPA 4E0CA 4LRTA 4ZQNA 3W72A 2FJKA 3P81A 4Q4KA 1SNZA 2Y70A 4O0KA 3KRSA 2J24A 2WJZA 2BRVX 4DQWA 1IXNA 2X1TA 3GDTA 5FF3A 1YGAA 1I2RA 1KTCA 1TV5A 4IGHA 2VENA 3OS7A 2VFHA 2NWRA 4AVFA 2Q8ZA 5I3HA 3ATYA 3FFSA 2NV1A 2RDTA 5KITA 1UASA 4IOTA 3TV8A 3G8RA 4FNTA 1PHQA 3P82A 3E12A 4CNOA 2CW6A 3B06A 3C61A 3QM3A 3EEGA 4UTTA 3GDLA 3NQMA 2BRPA 4DPPA 5F1UA 5HWJA 4Z1BA 3NEVA 3LXCA 1LBMA 4ONVA 1VLWA 5CPOA 3T09A 3MJYA 3G1AA 3OEXA 3MP5A 2QCFA 2YPIA 3L0GA 4MJMA 4EWND 2A6LA 1QO5A 1MEHA 3WFAA 1TJPA 5T26A 3NQVA 1UJPA 3HGSA 5HINA 4IMEA 2VELA 4QIUA 3IVSA 5G4WA 3TFXA 2TRSA 3DFOA 4UMAA 4H4IA 3IMHA 2A7PA 3GYEA 4WOZA 3W1MA 2FFCA 1ZCOA 2J27A 1EP1A 1D3HA 2B7QA 3GDKA 1LP6A 2V8ZA 4LUJA 4C1KA 5HR6A 1PE1A 4TX9A 3C52A 4O19A 4MYAA 3UQNA 1K8XA 1I2NA 5C2XA 4KKXA 3KRZA 3V75A 3CC1A 1HO4A 3EX6A 4KFNA 3TIMA 3UY8A 2HTBA 1NEYA 1T0OA 2EPHA 5TIMA 5FF7A 3NPXA 3S6DA 4LVDA 3CTLA 1ZHAA 1XDMA 3GKAA 2NX3A 1KFEA 3W1AA 3VKJA 2E68A 3GVGA 1OFBA 1VLIA 1TCDA 4QJ1A 3FKKA 3S1WA 4K39A 1G4SA 5AHFA 1TPWA 1DP0A 2NX9A 4NT0A 1XKYA 1JYVA 2A1YA 1F4AA 3M43A 3TUUA 1CB8A 2FLIA 4YCPA 5G4EA 5KMYA 4PTNA 1YQ2A 1Q45A 1Q6RA 1SW3A 4OHQA 5DBTA 1KV5A 2I9EA 1W3NA 3TJXA 3TC7A 2HS6A 2XN1A 4JEQA 4LV4A 4AF0B 1OFDA 3CZJA 1XUZA 1K1XA 1F6PA 3TMLA 3KVMA 1B4KA 1K7EA 1RV8A 1GG1A 2R94A 3HGRA 4O4WA 3S8HA 4JDYA 3NJVA 4ADTA 2YYUA 2YYTA 3G1DA 3B05A 2NX1A 4WQ6A 1GVOA 3FS2A 5LZLA 2EKCA 1VH7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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