2ZQ0A

Crystal structure of susb complexed with acarbose
Total Genus 251
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
251
sequence length
718
structure length
704
Chain Sequence
MQQKLTSPDNNLVMTFQVDSKGAPTYELTYKNKVVIKPSTLGLELKKEDNKLDSKTNLYDGFEVKDTQTATFDETWQPVWGEEKEIRNHYNELAVTLYQPMNDRSIVIRFRLFNDGLGFRYEFPQQKSLNYFVIKEEHSQFGMNGDHIAFWIPGDYDTQEYDYTISRLSEIRGLMKEAITPNSSQTPFSQTGVQTALMMKTDDGLYINLHEAALVDYSCMHLNLDDKNMVFESWLTPDAKGDKGYMQTPCNTPWRTIIVSDDARNILASRITLNLNEPCKIADAASWVKPVKYIGVWWDMITGKGSWAYTDELTSVKLGETDYSKTKPNGKHSANTANVKRYIDFAAAHGFDAVLVEGWNEGWEDWFGNSKDYVFDFVTPYPDFDVKEIHRYAARKGIKMMMHHETSASVRNYERHMDKAYQFMADNGYNSVKSGYVGNIIPRGEHHYGQWMNNHYLYAVKKAADYKIMVNAHEATRPTGICRTYPNLIGNESARGTEYESFGGNKVYHTTILPFTRLVGGPMDYTPGIFETHCNKMNPANNSQVRSTIARQLALYVTMYSPLQMAADIPENYERFMDAFQFIKDVALDWDETNYLEAEPGEYITIARKAKDTDDWYVGCTAGENGHTSKLVFDFLTPGKQYIATVYADAKDADWKENPQAYTIKKGILTNKSKLNLHAANGGGYAISIKEVKDKSEAKGLKRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and functional analysis of a glycoside hydrolase family 97 enzyme from Bacteroides thetaiotaomicron.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron
molecule keywords Alpha-glucosidase (Alpha-glucosidase SusB)
total genus 251
structure length 704
sequence length 718
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.3: Glucan 1,4-alpha-glucosidase.
pdb deposition date 2008-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10566 Glyco_hydro_97 Glycoside hydrolase 97
A PF14508 GH97_N Glycosyl-hydrolase 97 N-terminal
A PF14509 GH97_C Glycosyl-hydrolase 97 C-terminal, oligomerisation
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.70.98.10 Mainly Beta Distorted Sandwich Beta-galactosidase; Chain A, domain 5 Beta-galactosidase; Chain A, domain 5 2zq0A01
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zq0A02
3LTPA 4ADUA 1NSMA 1FCBA 1QAPA 4RCXA 3S1UA 3BW4A 1YDNA 1YTDA 3E02A 4MVAA 3EX1A 4IPIA 1IF2A 3PUDA 5AHNA 4YWIA 1R2TA 1TPWA 2QDGA 3B03A 1TTIA 4H3DA 4FXSA 3LBCA 4GBUA 4XKYB 1QPNA 3NREA 2OZ0A 2ZQ0A 4MYAA 4BZEA 3S9YA 3E12A 4O54A 2VFHA 4NJJA 4MY1A 3LBMA 3W2UA 3PG8A 2DP3A 1J5TA 3IAPA 4UXDA 5TIMA 3HG3A 4QAIA 4KWVA 4FNUA 4OGZA 4IQLA 2WZSA 3FFSA 4C1LA 5FF7A 5KITA 4GFSA 1DVJA 1X1ZA 4O17A 3CU2A 3H54A 3STCA 1EUNA 3L66A 3P82A 1L2UA 5SWUA 1TJRA 3MUZ1 1OFQA 4K36A 2NXHA 4UFIA 1E51A 1A5BA 4FHAA 3EX6A 3UWVA 4N9CA 4BFAA 3QYQA 5D30A 2TRSA 3N2MA 2HTAA 3NQGA 5E93A 1LBFA 3INPA 1TCDA 3C0JA 1SU5A 3JS3A 3DKLA 3WJZA 2YGYA 1J2WA 2V2HA 1VLWA 5DELA 1VS1A 3L0GA 3STEA 3CLMA 4BI7A 2ZDRA 3HG5A 3OVQA 5J5RA 1K1YA 4UTTC 2DZSA 1RQHA 1AW5A 4MLRA 3L5AA 3W1PA 3MUY1 3ABSA 1R47A 2ATMA 3N2XA 5K9DA 3LDVA 4YCOA 1FCVA 1F9GA 4GRSA 2C18A 1XBXA 3VDBA 3NJXA 1W54A 2QKFA 3BG3A 1PE1A 3NQDA 3HGSA 4FNTA 1WV2A 4XBKA 2A2IA 2GVLA 3EWXA 3P74A 4NZFA 4RZ4A 4AWSA 3ABQA 1QR7A 3E0IA 4JTGA 3HPSA 2FTPA 3IMHA 4PCFA 1L6YA 3LXCA 1CB8A 3RMJA 1XDMA 2PRLA 4AF0A 1FBAA 4CNNA 3S42A 1G6CA 4LVDA 3VNDA 1OFOA 5EL1A 3IVUA 2YW4A 5D04C 3I3EA 2NZLA 4O0ZA 1EB3A 1JCXA 1W1ZA 1ZY9A 1X7FA 3ABOA 2JKAA 3QQ1A 4NX5A 3LCWA 3LCLA 3C2VA 3DHDA 2BTMA 1JCYA 1W0MA 1WOBA 3I68A 4ICNA 1MO0A 3FS2A 4O28A 3PULA 2FIQA 1RQEA 4JYDA 4YMZA 3JRKA 1NS0A 4E38A 5HNRA 3TCEA 4FIQA 4ML9A 4NJKA 5I3KA 2V0TA 2C15A 4CCDA 3UXDA 4OE7A 3MBFA 3BLEA 4P61A 3HBLA 1KV5A 1N7KA 3SIZA 3M5VA 5EPDA 1RWHA 1OK6A 5FF0A 1NS8A 3GDKA 1LDCA 5D32A 1DHPA 1KBIA 4NVTA 3THQA 2A5HA 3TR2A 3LHYA 2ZZ2A 4JEQA 2TMDA 3I7QA 2B7NA 2VKZG 4FIRA 1H5YA 4UR8A 1S5WA 5KINA 1GG0A 5CZJA 2CLHA 3JR2A 3NAVA 3KHJA 3NJVA 3M5XA 3W7RA 1QO2A 3T44A 1KW1A 4UR7A 3GLCA 1H7NA 3F4WA 2GJNA 5FF4A 1A5SA 3OVRA 2Y88A 1XM3A 5C55A 2EAWA 3GYEA 3LB0A 3QZEA 3LHVA 4Z08A 1ZHAA 5J5DA 1GJPA 2WW3A 1ZENA 3TMLA 1H62A 4JXCA 1LRQA 4NX0A 2RKXA 2EPHA 3OA3A 2H3BA 4S2BA 4MFDA 4B5NA 3TKFA 3TH6A 2GOUA 3A22A 4FX7A 5I3FA 5FI8A 1D3GA 2Z6IA 1EP2A 5MHBA 1RW9A 4HPJA 3GXTA 1NEYA 1SW7A 5C6MA 2ZCGA 2QAFA 1PIIA 4I7VA 1H7WA 1R30A 5AHLA 2YFNA 4IGHA 1G7VA 3LM7A 2YPIA 1B3OA 4RX0A 3P84A 1O94A 3P8JA 3CHVA 1GVOA 3ZS4A 3MI6A 3W7EA 4L4MA 2P0OA 3IIZA 4ZQRA 3DI0A 5CGQA 4ADSA 3GZ3A 1RVGA 3VI2A 2VC6A 3LTSA 5D2XA 3MHGA 4OV9A 4PA8A 3KX6A 2R91A 3TC6A 1RWGA 3O07A 3WK3A 2NUXA 4RR4A 3NQ6A 4GE8A 3QEZA 3T0BA 4GUIA 4GXMA 5KTLA 2BRWA 4MLJA 1X1IA 1SW3A 3UZ5A 3G18A 3KVLA 3W22A 1OJXA 3TJLA 3IVSA 1AMKA 5D2YA 3NQ8A 4IUOA 5HR7A 1R2SA 3TE9A 2VXNA 1N7QA 2QJHA 1O5KA 4MZ1A 4QNWA 4AEOA 4H4IA 4NJHA 3MW7A 3FIGA 1N7OA 1TRDA 1X6UA 5D37A 2EF9A 1GVSA 5DY2A 5FESA 1QCWA 4Z1AA 3KOFA 1GEQA 3W7LA 1AG1O 1YXCA 5D2WA 2H90A 4NJIA 1HM3A 3CQ0A 3TK7A 3G3MA 3NGJA 1UB3A 2ZZ4A 1VC4A 1ZNNA 1SZNA 3S5YA 4O10A 1IXPA 3ABRA 4PH6A 4HPXA 3PBUA 3E96A 4UCGA 3FA5A 5CKSA 5K2ZA 1JYXA 2ISVA 1CI1A 4PC8A 1JUKA 3W1RA 3KAOA 2Z2UA 1NFBA 1PS9A 4DO6A 3HMJG 1TTPA 2QUUA 4A22A 1L9WA 3ECQA 1OX4B 2YXGA 3HIJA 3N3MA 1A5CA 3W7QA 1BWLA 3SFKA 1SO0A 4FEZA 5FEXA 3DENA 3J7HA 4OWGA 3W07A 1ICPA 1M5WA 2W6RA 2DJLA 4N9EA 4FX6M 3SJ3A 4AB4A 2E6DA 1VLIA 2EHHA 5CSSA 2E5CA 3EXSA 3F03K 4NUWA 2J27A 1TTQA 4IJBA 4XTIA 4IMEA 5BW6A 2NUWA 3QPZA 4A29A 1V5XA 4EOUA 2Y7FA 2QCLA 3HPXA 2P10A 3MP3A 1RR2A 4Q4KA 4O4VA 2I1OA 1MEWA 3M1ZA 4ZQOA 3W7NA 4LT9A 1JR1A 2FFCA 3H53A 3T78A 3M16A 1F74A 3FYPA 1HUVA 2YX0A 1SO5A 2AGKA 2B4GA 3TJXA 3R8RA 3NM1A 4R7JA 4YL2A 4E2DA 2BX7A 2KZHA 3EEGA 3IIXA 3M47A 4UMAA 3W1XA 1RQBA 2C6QA 5LNRA 2XN1A 1I45A 3IIPA 3C3NA 2OX1A 5AHIA 5LHEA 1GG1A 2QCEA 4KKXA 4EF9A 3R5EA 3DXIA 4Z1BA 3QMRA 1GZGA 5CPNA 4U4MA 5C5YA 2BLEA 1JCMP 3LHWA 3N14A 4O1DA 4IX2A 3W7DA 3VFLA 1GPWA 3EKLA 8TIMA 4MPQA 4L4LA 3ZWTA 3BVJA 4Z0SA 5D02A 1VCFA 3S1XA 2BXVA 4HNVA 5ABTA 1ADOA 2HS6A 1AW2A 4Q33A 3GR8A 2WSYA 3GNNA 3FJ6A 4BR1A 1K7FA 4JY8A 1G4PA 1EP1A 1ZAIA 2CWNA 5H91A 1I2QA 3NOEA 3UPWA 5U4NA 2JGYA 4O1BA 5BOOA 1DKWA 4GWEA 1RPXA 1WDWA 1TTJA 3I3DA 3W1TA 3W1LA 4RXGA 2F7FA 1F76A 1FDZA 2CLFA 2NX3A 1QOPA 3DU0A 2ZZ7A 3KVMA 2J9XA 1DQXA 4HN4A 2V9DA 2WSRA 4UTJA 5EKYA 2PRMA 3HGOA 5F2MA 1VYRA 3FJLA 1HM2A 3CPRA 2E1DA 1I2OA 3W73A 4XQ6A 4K6AA 2XSGA 1EA0A 2HMCA 3UXAA 5CSRA 3UY7A 1WYIA 1K1WA 2WW2A 3CT7A 1IXQA 1GWJA 3KFTA 5HUOA 1F5ZA 4N6EA 3MWAA 4N4PA 3EWBX 3GK0A 1TMHA 3ATZA 2H8ZA 3OVPA 1MXSA 2CLEA 1OJMA 3A9IA 3NL2A 3R13A 4UFJA 1XUUA 1XXXA 1SFLA 3G0XA 4UNLA 3B8DA 4KWWA 1JYWA 5G2WA 3TQ0A 3O16A 5CPMA 4XZ9A 3SZ8A 1HL2A 4D2JA 5DBTA 3NZ1A 1CW2A 1Z41A 3UYCA 3BLFA 4K8HA 4MY9A 1H50A 4LOCA 1QOQA 1EIXA 4K39A 4JX6A 3RK8A 3LI0A 2PCQA 3WFAA 1JZ3A 4DF0A 1LBLA 1I2NA 2FPVA 1T96A 3LOTA 2GJLA 3GDLA 1F05A 2QF7A 3DFNA 4FNSA 1KM4A 5HWJA 2NLIA 1T99A 4AQ0A 1WBHA 3FKKA 2X2GA 4O19A 1OFRA 2DU2A 4BZHA 3S5OA 3C2EA 3NZRA 4NNAA 2ZZ6A 1Z45A 3T0DA 5G1TA 2Y63A 1TXKA 4K37A 1N7PA 1YXYA 3GR7A 3L5MA 3VD4A 1HTIA 5H2ZA 3T2QA 2Q3RA 3BW3A 1WX0A 2R14A 1YPFA 5HUPA 1YDVA 3C2FA 4K8EA 1Z44A 1K8XA 1KM2A 1FDYA 1D9EA 1JZ7A 5FEZA 2QCNA 1H61A 1W5OA 3USBA 1HN0A 4WXYA 5C54A 5FEPA 1YPIA 2UV8G 3M7WA 1B9BA 1V7YA 2WPBA 1F6KA 4MKNA 3B4UA 4ORMA 1HG3A 2V2CA 4JS3A 4CCCA 4ZZ9A 1W3IA 4JTFA 1XFBA 3GB6A 4O1CA 3LI1A 4IMFA 3NQCA 4GUHA 5LNUA 5L6UA 4N9DA 3O06A 3OG3A 4LRTA 3W7OA 1DJQA 3DH7A 3LCHA 1FQ0A 5F2IA 4XKYA 1KFCA 3EKZA 4WY0B 4O57A 3T2PA 4LU0A 3NG3A 4H6KA 3H55A 3W1MA 3W2KA 2C13A 2NUYA 3LRLA 4QM1A 4CNOA 3W1QA 3PBWA 4Z1DA 5HQEA 3DYOA 3PSVA 3C2OA 2RH9A 3IGXA 2A85A 1H7RA 4I9AA 1KLYA 5A1AA 4LNYA 4MZYA 3NQFA 2JKPA 1ICQA 3M5ZA 3S8HA 3G1DA 4O0KA 2DJXA 3T09A 1JZ2A 4EF8A 1H7XA 3HQ1A 3LHTA 1TV8A 4WOQA 4DQWA 2VFFA 4WQ6A 4CQAA 3U2OA 3ANYA 2ZZ5A 1SFJA 1VHCA 3GDRA 4ZVJA 3K25A 2DZVA 1VR6A 1MSSA 1X1JA 3NA8A 3A5VA 3N34A 1RV8A 2HSAA 3VCRA 3KVJA 3GDMA 3NQAA 1BEUA 1XKYA 2EGZA 3IRDA 4DELA 3S5NA 3QF0A 2GVGA 1W8SA 4HNTA 5I3JA 3R2GA 5DXXA 5G2IA 2GVJA 2XN0A 3PM6A 1X1HA 1H60A 3DI1A 3WJYA 1W56A 1IXNA 1LRNA 4HT3A 4ZMGA 1JYVA 3GIYA 1ZAJA 4UFKA 1YQ2A 1TO3A 3G1VA 3NNTA 5BRBA 5E0KA 3WJXA 5EA9A 3GX9A 3P81A 3NPVA 5DCEA 2B0MA 2X1TA 3FKRA 4OHQA 4PODA 2V30A 3MP4A 1VCVA 2ABAA 2WW1A 3BGAA 2PE4A 1JJKA 1OG0A 4HHPA 1K7XA 1SW0A 3B0VC 3TXZA 3CTLA 3PWAA 5HWNA 2Z6JA 2NXGA 3A23A 3W74A 1THFD 4MJMA 1NKGA 3OBKA 3QMSA 1SUXA 3M41A 4MIMA 2HS8A 4AWUA 1TPDA 4AAJA 3R12A 5BMWA 4UIOA 1KFKA 3PSWA 5C2XA 5K4ZA 1LXKA 3N19B 3IIVA 5D33A 1NSSA 2Y62A 3GDTA 1XBZA 3L2IA 3LERA 4LW7A 1LXMA 4M19A 4UC5A 3W1NA 4JTJA 3MP5A 3S0CA 1TRIA 1LF6A 2YCEA 1SZFA 1HMWA 5G2HA 4DO5A 4XTDA 3MUXA 1SPQA 4UFHA 3MV11 1GOXA 4UTWC 3E9AA 3SECA 1G4EA 3VD3A 2YW3A 3GXPA 3K30A 4MZ8A 3RFAA 4OT7A 3EX4A 4UNKA 3HJZA 3TSMA 4IXXA 1G67A 1Y0EA 1KTBA 2TSYA 4MY8A 3W84A 2VEKA 3QRHA 1J0MA 4NNCA 5F2GA 1WQ5A 3Q37A 4JTKA 5F4SA 5AC7A 1X1OA 4JYEA 4KFPA 3TROA 2E22A 3TUUA 2DZUA 2YYTA 2CZEA 1TPFA 4M7SA 3MO7A 4Y90A 3P67A 4JX4A 1GVFA 5K3VA 3M6YA 4J9JA 3LCFA 2NV1A 4LVGA 3M5YA 2WNNA 3NR0A 3W1UA 1GT8A 3CEUA 4CCEA 1TIMA 4Y9AA 1NF7A 1S5VA 3PBYA 4RLIA 1EPXA 2HTMA 5K4XA 3TIMA 1FCUA 3BLIA 4X2RA 4DF2A 2B7OA 4N02A 1DORA 4UMCA 3IAQA 3SGZA 2ISWA 4M6VA 2NWSA 3LTYA 3U6WA 4JTSA 5AHFA 1I2RA 3N73A 1EUAA 2CZFA 2PURA 4FO4A 3NQMA 1TYGA 3MYPA 1TSIA 3GVGA 2Q3OA 3I65A 3NPXA 3VDCA 3TDFA 5CZ0A 2VFGA 3IGUA 2JK2A 4UMBA 4AVFA 2J9ZA 4UTWA 2A6LA 2BRVX 3LCXA 1JZ8A 1VQTA 3QQ0A 1KV8A 1ALDA 4EWND 3O6YX 1CX9A 3S1VA 4UTUA 3P8IA 4UFMA 1L6SA 5EY5A 2XHNA 4LRSA 2Q8ZA 4UTKA 1W3YA 1MMZA 1OHLA 5I3GA 1NSJA 1W37A 4Z0JA 1JQXA 3STFA 5FF3A 4QJ1A 4M5PA 3TSDA 2CLIA 4LTSA 3BW2A 4RJEA 4KFNA 1F4HA 5AOUA 1M7OA 5LGXA 1A5AA 5G1YA 2H8XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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