4AVAA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
332
structure length
327
Chain Sequence
DGIAELTGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
total genus 94
structure length 327
sequence length 332
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avaA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avaA02
3D0JA 3H9AA 4R3LA 3PGPA 3CJXA 2PC1A 3BB6A 1J1LA 1IPKA 4ZU7A 5T3NA 2PSWA 1RUOA 2UYAA 4JWPA 1Y9QA 4YARA 5GCNA 4HMZA 3CLPA 4QGLA 4QM8A 4ZBGA 4ZU5A 4YFJA 5I91A 2E9QA 4NEXA 4KUBA 4CAWA 5I0SA 4MZUA 4MV2A 2IXIA 2PA7A 3EQEA 2FXFA 3FE5A 1Q2CA 1NE9A 5C88A 2F4PA 4XF4A 4R57A 3FWEA 1WLTA 2FCKA 1ZVFA 1B87A 1S3ZA 3H4QA 1JUHA 3IWZA 2XLAA 1X7NA 3LOIA 1O3TA 4CRYB 2PYTA 2D93A 4JXRA 4FT8A 3PNAA 2XHKA 4I02A 5FQ0A 2HV2A 4U9ZA 5CNPA 1WGPA 3R9EA 5I8YA 3SXNA 2Q04A 3I9SA 1UIJA 3E97A 3TO7A 2N7GA 3RPQA 1XF8A 2HUZA 1X8MA 2FMYA 3KGLA 4HVRA 4LUMA 1FY7A 4NF1A 5FPZA 1S7FA 2OU2A 1V70A 3FNCA 4EV0A 4I0BA 1J58A 4HBNA 1YVOA 5E1RA 2ET1A 3SHRA 3N4MA 2O8QA 1M44A 3TOAA 5ISVA 1Y3TA 3S0MA 4KWJA 1IIDA 4ORFA 2H6BA 2QJVA 1O5UA 1QSRA 2VI7A 4U5YA 2XLGA 4QGMA 4B5PA 2QVSB 2UY9A 3GY9A 2FT0A 5JSPA 3CXSA 1ZZ6A 4OLLA 1QSTA 4N9IA 4HNXB 3SCGA 4FD4A 4LUAA 3UKVA 4XFIA 1R57A 1CGPA 3BU7A 3N7ZA 2PAMA 4LTAA 2DXQA 2HKXA 4DNCA 3EBRA 1XE4A 1DZTA 4B5OA 3I59B 2ET7A 2CNTA 3PP9A 4EVYA 2QECA 3GYAA 4MY0A 3DR6A 2H0VA 2R1IA 3PLQA 2KXLA 5C82A 2IXJA 3LWCA 2JDCA 4JD6A 2BNNA 4PK2A 5C8WA 5EBVA 5E16A 2K9ZA 1HW5A 3ZDSA 1Q5OA 4J1WA 1BO4A 3EC4A 4MX3A 4AQ2A 2F5IA 4XPDB 5HMNA 1XE8A 2P6EA 2C27A 1UD1A 3DKWA 4P9GA 4QXKA 2BUEA 3SMHA 4R9MA 2HJIA 1RUNA 4IUSA 3IDBB 3BLNA 5CVRA 1ZZ9A 3F8KA 3D8PA 1CAUB 4JTOA 3VHRA 2FL4A 1J59A 4KL1A 1NE6A 4KOSA 1O3QA 2IL4A 2VBQA 4QVTA 2G3TA 4HVOA 3E5QA 1CAXB 3ELNA 5I0TA 3DDDA 4KOYA 3BJ8A 2FIWA 3R1KA 2FQPA 5FDBA 1YWKA 5JR7B 1FT9A 4PSWA 2D5FA 3U0ZA 1VJ2A 3ROUA 2FS5A 4XPDC 4J1XA 3DR8A 4AVBA 5FPXA 3DN7A 5K8SA 1S7KA 3R95A 4LEJA 3I59A 2R98A 4LA3A 2J8MA 2PHLA 4HLTA 2QCSB 2GAUA 2OZJA 4IEZA 2WPWA 1DZRA 2VEZA 3H7JA 1O7FA 1DGRA 3S6HA 3EY5A 1M4GA 2CAVA 1PM7A 4BMHA 5IB0A 4H89A 5F1RA 4H7LA 4M85A 2QNKA 5LRRA 1UW8A 4R8HA 4XFAA 2CGPA 4I09A 4XEZA 3B8GA 4X6QB 3H1MA 3WW1A 4CAXA 3QOPA 4IEXA 1N71A 2GE3A 4QM9A 3FIXA 1CAVB 3IIAA 1UFHA 4KOUA 5LEJA 4JXQA 1ZRDA 1QXJA 1YR0A 1Z4RA 1OD5A 1YHFA 2EVXA 4XFFA 1SQHA 1CAUA 4YYOA 2VECA 3R96A 4META 1OZPA 1Z4EA 4O9GA 2IXCA 3SXWA 4MBUA 5BY5A 3KCCA 4L8AA 5JPHA 1CAXA 3FB3A 4GS4A 4Q0QA 1VR3A 1RGSA 1O4TA 4HVQA 3H50A 3TE4A 5E96A 5J8FA 3LA7A 3FJSA 4FD6A 3TO6A 1KUVA 3R9GA 4BYYA 1M1DA 5KHJA 1H1MA 4E2GA 3ACLA 2P6FA 4E2QA 2KCWA 3JUWA 4B29A 2EA7A 1IB1E 1OFNA 4I3PA 2Q0AA 4QB9A 1KUYA 4KOVA 2IXHA 1I5ZA 2WFPA 5I93A 1IYKA 3JZVA 4CYDA 2QIRA 4L2NA 5F48A 1PMIA 4UA3A 1M4DA 2MNGA 2H5MA 1J3RA 4HNYB 4F6AA 1J3QA 3U11A 1ZZBA 3MDPA 5EZWA 2FIAA 2CV6A 4RS2A 4Z82A 3W91A 3HT1A 1J3PA 4MJ8A 1PUAA 1CAWB 5D1IA 4PV6A 3F5BA 2GC1A 4IEQA 1YGHA 4IF5A 2B9UA 1CAVA 4YRHA 2Z2SB 2BSWA 4KZTA 3TCVA 3EFAA 3MYXA 4MI4A 3GBFA 3I54A 3CL1A 2OZUA 2PDOA 1ZRCA 1CM0A 1XMTA 2AE6A 3P2HA 2REEA 4XPKA 2B58A 2B5HA 4LA2A 2XGXA 3EJKA 2XKOA 2WPXA 1SEFA 2P17A 1LRZA 3OGJA 2B8MA 3I7DA 4QX5A 3NKTA 2Q4VA 4PSXA 1Q43A 3T90A 5CADA 2GC2A 3TNPB 2Z11A 3MZHA 5HH1A 4LUKA 2BYVE 4E2AA 1NMTA 1VP6A 2BNOA 1MJBA 3SCHA 1LKNA 2OPKA 5I8TA 5F47A 4XF1A 4H6UA 2ETEA 3RZZA 2OA2A 1U12A 3QAHA 4AQ6A 2ZKLA 3D2MA 4UBGA 4U9YA 3ETQA 2XLFA 4KWKA 4AG7A 2DCTA 2OYZA 1I12A 3VWDA 3DSBA 1ZZCA 1RTVA 1WA4A 4IEUA 1J4JA 3S7IA 3MGDA 1P4NA 3HQXA 4R87A 4HN1A 2Q7BA 2MPFA 2EVNA 4GULA 3SHPA 3R6SA 4AVAA 2I79A 2Z0ZA 3SXOA 3BALA 3BCWA 2CY2A 1GQHA 3W6SA 4L11A 5JQ4A 5FLHA 1Z9UA 1S60A 4M3SA 1EP0A 4IEOA 3E0KA 4KOTA 3B02A 4PIYA 2PAKA 4AG9A 5KTCA 4UXAA 2XL7A 5C6CA 2V09A 4BH9A 4CRZB 1EPZA 5J48A 3C26A 3ZZIA 1O3SA 2PAEA 5KBFA 3G8WA 5J8CA 2P0WA 3LAGA 1MJ9A 1ZREA 2QMLA 2ZW6A 2O1QA 1OMIA 2ATFA 4IEWA 1WK4A 1S5KA 1QXRA 3JVNA 4QGNA 4FBFA 2GH2A 4XFCA 5KTDA 1YK3A 2FE7A 5JSOA 2WC2A 4E2SA 3TT2A 2B3VA 3FX3A 4JJXA 2MHFA 4LLOA 1S7LA 4ZU4A 1FXZA 4NSQA 1RL3A 4UWJA 3R9FA 2O28A 2XKPA 3QB8A 2ZPAA 2D4PA 3H3ZA 3F0AA 4HSJA 4UWIA 3E5UA 4N9HA 4Q0UA 1QWRA 2R7HA 4OAEA 2BEIA 5BV6A 2ZW4A 1H1IA 3OWCA 3WR7A 3TOBA 3S6FA 2PQ8A 1ZRRA 4MGIE 3FXTA 3O14A 3ES4A 4KUAA 2ATRA 5KHIA 1NE4A 1G6NA 2GIVA 2C0ZA 2OZHA 3FYNA 1RC6A 2QDRA 1IICA 4MGZE 5FLIA 4BIFA 1YUDA 4AB7A 2Q30A 3NW4A 2GU9A 4WVZA 4CAVA 3RYRA 3KMHA 1ZZ8A 1ZX5A 4I0AA 3CF6E 5JCTA 3D82A 3GYDA 1O5LA 5LRSA 3BPZA 3OTFA 4NVPA 4XFHA 4R52A 4XF9A 1ZZ7A 1M4IA 2B4BA 2NMTA 4KOWA 3CXQA 4KVOE 5HI0A 4PIXA 1Q2YA 2K5TA 1I6XA 4EWAA 4I01A 1QSNA 2PFWA 5H86A 5I8SA 1Y9KA 1EYBA 2OB0A 2VXKA 1X8EA 3T9YA 2ZXVA 4R3KA 5KTAA 4XETA 1QY4A 4JVAA 3RDIA 2IC1A 2JLMA 3VWEA 3FBUA 4Y49C 1V0CA 1CX4A 4KOXA 4YRDA 5EC4A 3OD0A 4F8AA 5BUVA 1BOBA 3LA3A 4K30A 2H6CA 1ZNPA 3H7YA 3RYPA 2B4DB 1YFUA 1SFNA 4NCZA 4JV4A 2X7BA 2K0GA 5FLJA 3L2HA 3NVCA 2Q44A 4F7ZA 2OH1A 2REFA 4KVME 1OI6A 1XEBA 3MPBA 4XFBA 2RC4A 4PIZA 3FHIB 1Y9WA 4IESA 4PJYA 3PVBB 4XNHB 4FD5A 4O9EA 4X5KA 1PU9A 2JDDA 1GQGA 3K9UA 2B3UA 1IYLA 3IBMA 4Q0VA 1B6BA 3EHKA 3USSA 1UCXA 2Z69A 2VZZA 2GC0A 3CO2A 3NL1A 5JSRA 1ZRFA 2G3AA 4KWLA 5CU1A 1Y7RA 2D40A 4LX9A 2J8NA 4IEVA 3BJ7A 4XPLA 4FD7A 3QACA 3G3SA 5BXXA 1YX0A 4KLVA 2Q1ZB 2PTMA 5FCCA 3HT2A 2JEVA 3OCPA 4E8OA 3W6XA 3TFYA 3WW4A 4UBHA 1WWZA 3FRMA 4XF3A 2PHDA 3LA2A 4Z07A 1RXTA 3FZ3A 4UBRA 3D3SA 3ZJ0A 2ARHA 1L3JA 2I00A 4QMAA 4XNHC 4H6ZA 4X6RB 5J3UA 2PQQA 4K8FA 4I2OA 1TIQA 3D2PA 3UKTA 3GKRA 3LZZA 5F46A 3DV8A 4NXYA 3H3UA 2B4DA 3EO4A 5DWNA 1NSLA 4YSFA 1X82A 2CNSA 3H8UA 5KHGA 4KORA 4EROA 2IXKA 2OZ6A 1KUXA 1YFYA 2UY8A 4HN0A 4IERA 2VQYA 1SQ4A 1TQ5A 2B5GB 1CAWA 4MUVA 3E6DA 3NJZA 3UKNA 5JAXA 4I49A 4KU7A 1UIKA 4D7TA 2I45A 4HNWB 2ZCWA 4A2UA 4WBBA 2FSRA 1S7NA 2PRBA 4MHDA 4QC6A 2GZWA 3NE7A 4KLWA 3LODA 5IV0A 2D4OA 3H1YA 4LULA 5I0UA 2AJ6A 1O3RA 3UY5A 3E6CC 4DINB 5KHKA 4YGOA 1QSMA 3S6KA 2XL9A 1LR5A 4MH0E 4OFGA 4D7SA 2Q4YA 4QBJA 3WW3A 5EFUA 4PK3A 3PZJA 5H84A 1I21A 4FAHA 1YLEA 3TTHA 1KZFA 3H1WA 3M3IA 2BNMA 1GHEA 2Y0OA 3G7DA 4KU8A 1UPIA 1YREA 1YVKA 1NYWA 2EAAA 3DNSA 3P2FA 3RYOA 1XIXA 1RO5A 2PR1A 2GANA 4HSLA 4EWDA 1Q3EA 3M70A 4WZCA 2BGCA 3CEWA 3TO9A 2D5HA 3E5XA 3TNQA 4HZFA 4MGYE 5BPXA 4II9A 3IDCB 1ON0A 4MY3A 1EY2A 1P0HA 2ZW5A 3E6BA 5FVJA 3IGRA 3WW2A 4Q0PA 2CNMA 2R8VA 2J8RA 4Q0SA 2VQAA 5LEKA 1YFWA 2Y0MA 4AVCA 3S6GA 3D0SA 1VHSA 2B5GA 3HIFA 3DL3A 1XE7A 3KSCA 1MK4A 2EUIA 1YLLA 2OZGA 2PR8A 4IEPA 3S7EA 4L89A 4AXOA 4RI1A 4OADA 4F0YA 1CJWA 2BEOA 3IWGA 1FI2A 2A4NA 3CXPA 4Y49B 1U6MA 1L0CA 3ST7A 2CAUA 3C3VA 4CS0B 2Q0YA 2UYBA 1I1DA 2P6GA 2ZW7A 5J7MA 3RYKA 4KVXA 4E0AA 2VZYA 3NSTA 1XRUA 4FAGA 1QSOA 2G0BA 4QUSA 4YNIA 4BHPA 1NZCA 4RD7A 1DGWA 5FQ0B 5I0RA 5KHHA 3KGZA 1MJAA 1VKCA 2HQYA 4JTNA 1LB2A 3OF1A 3KKWA 4J3GA 3U10A 5I0CA 3EXNA 2GC3A 5F49A 1Q2DA 3V8IA 2Q4SA 5IX3A 4HKFA 3ES1A 2Z10A 1LRHA 4XFGA 4IETA 4JLYA 4TLFA 5DWMA 5AVPA 4IEYA 1K4JA 1YFXA 1IPJA 3EO6A 3LD2A 4EWEA 3SCFA 2BL1A 2IXLA 2VPVA 4ONUA 3I3GA 4Q29A 4B5PB 1NXMA 4MGKE 4XF0A 3RNSA 3FFQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BQPA 1JYCA 3CJXA 1CZTA 3AL5A 3NH5A 3AKRA 5APAA 3W5MA 4A6SA 4A42A 2F4PA 4NPLA 1EV13 2X10A 4N53C 2G1MA 2WZR2 1VBC1 1FX5A 3JXSA 4JDOA 2FMYA 3C2UA 2YNCA 4LUMA 1FY7A 3B3WA 4HBNA 1YVOA 5E1RA 2XXZA 3WQ1A 2AFUA 3PUAA 4ZXEA 4H14A 3RMXA 2XLGA 2AFWA 2FT0A 3KS7A 5FZMA 3DEMA 2K2SA 5FMBA 1NSAA 3I59B 1QJU1 1R091 1XNBA 2EIBA 1VPHA 3AJYA 1PM4A 2WO7A 5THWA 4K1YA 4Y5TA 1CAUB 4OVEA 2XQRA 3MFCA 2CSGA 4HXCA 1JYVA 1RUI1 1DYOA 4Y5Z0 3VBRB 2RFHA 2DFCA 2VZPA 1BXHA 4IEZA 2OZJA 2WPWA 3GIUA 4YW1A 3FL7A 2ZEYA 1T6BX 2WSVA 5LYLA 2YY1A 4CPBD 4UAPA 5KR7A 3B8GA 5CB7A 1RJ8A 4IEXA 3ACHA 4QM9A 1UFHA 4CYNA 2EVXA 4XFFA 4CP2A 2F17A 5G1ZA 4NRMA 5JPHA 2WNOA 4Y4RA 4WM8B 3T4VA 3R9GA 5KHJA 2GLFA 5FYHA 2J1UA 1PZ8A 3BODA 3B94A 1OFNA 4NGSA 1PVC3 2ZMKA 3X29B 4S2HA 2DVBA 3FBYA 4ZY1A 2VNRA 4RS2A 5AFBA 3HBZA 4QHBA 4NN0A 2WZR1 5F3GA 3CBNA 1T2XA 4DUKA 1QJZA 3NAPB 2ZAAA 4Y22A 4R9DA 4QXHA 5A7QA 2XGXA 1ODNA 1N3PA 4LXLA 4NGPA 2D6OX 3T90A 5CADA 1JS9A 3WEZA 4CXYA 4IE7A 1ZO0A 1HB2A 2BNOA 3OYWB 5FKBA 3CKHA 1AJOA 2I3CA 3PBBA 4TLGA 5L9RA 4FTSA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3D0J A;  3H9A A;  4R3L A;  3PGP A;  3CJX A;  2PC1 A;  3BB6 A;  1J1L A;  1IPK A;  4ZU7 A;  5T3N A;  2PSW A;  1RUO A;  2UYA A;  4JWP A;  1Y9Q A;  4YAR A;  5GCN A;  4HMZ A;  3CLP A;  4QGL A;  4QM8 A;  4ZBG A;  4ZU5 A;  4YFJ A;  5I91 A;  2E9Q A;  4NEX A;  4KUB A;  4CAW A;  5I0S A;  4MZU A;  4MV2 A;  2IXI A;  2PA7 A;  3EQE A;  2FXF A;  3FE5 A;  1Q2C A;  1NE9 A;  5C88 A;  2F4P A;  4XF4 A;  4R57 A;  3FWE A;  1WLT A;  2FCK A;  1ZVF A;  1B87 A;  1S3Z A;  3H4Q A;  1JUH A;  3IWZ A;  2XLA A;  1X7N A;  3LOI A;  1O3T A;  4CRY B;  2PYT A;  2D93 A;  4JXR A;  4FT8 A;  3PNA A;  2XHK A;  4I02 A;  5FQ0 A;  2HV2 A;  4U9Z A;  5CNP A;  1WGP A;  3R9E A;  5I8Y A;  3SXN A;  2Q04 A;  3I9S A;  1UIJ A;  3E97 A;  3TO7 A;  2N7G A;  3RPQ A;  1XF8 A;  2HUZ A;  1X8M A;  2FMY A;  3KGL A;  4HVR A;  4LUM A;  1FY7 A;  4NF1 A;  5FPZ A;  1S7F A;  2OU2 A;  1V70 A;  3FNC A;  4EV0 A;  4I0B A;  1J58 A;  4HBN A;  1YVO A;  5E1R A;  2ET1 A;  3SHR A;  3N4M A;  2O8Q A;  1M44 A;  3TOA A;  5ISV A;  1Y3T A;  3S0M A;  4KWJ A;  1IID A;  4ORF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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