4AVAA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
332
structure length
327
Chain Sequence
DGIAELTGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 94
structure length 327
sequence length 332
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avaA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avaA02
3PP9A 1J3RA 3MPBA 5FQ0B 2PAEA 2IXKA 4X6QB 5I0UA 2JDCA 3FBUA 1O5LA 1Y9QA 4AVCA 3PZJA 4M3SA 1PUAA 5IB0A 3S6FA 2PR1A 3DKWA 3EJKA 1YX0A 4AQ2A 3L2HA 1ZVFA 3BPZA 4O9GA 1LR5A 3ACLA 4CAWA 3C3VA 1NE4A 3EXNA 5FLIA 4WVZA 3R9GA 4KOVA 4R3LA 3QAHA 3SCHA 3U10A 1RXTA 3R9EA 1QSNA 1B87A 4MX3A 3OTFA 1Q2YA 3CF6E 3LWCA 1XE7A 3CEWA 3WW4A 2Q44A 4KZTA 4JXRA 4KWKA 4NEXA 3SMHA 4E8OA 1S7KA 4R87A 2F5IA 2Q1ZB 4JLYA 3H1MA 2FSRA 4QGLA 4QM8A 4ZU4A 4Y49B 1CAUA 1FI2A 4HBNA 4MUVA 2BYVE 4KU8A 4Q0QA 4R52A 3EFAA 3MGDA 1UW8A 3TFYA 1J3PA 3WW1A 5KHGA 2OH1A 3MDPA 3NE7A 3TOAA 3JZVA 2ZW7A 3VWDA 1OMIA 4MY0A 5BY5A 2B4DA 3FYNA 3D0JA 1N71A 2BGCA 1YVKA 1BOBA 1Q2CA 1XMTA 4LLOA 4MGIE 3OD0A 1OFNA 2UY9A 1L0CA 3DN7A 4PK3A 5I0SA 5T3NA 4H89A 4QC6A 3TTHA 1ZRRA 2B9UA 1PU9A 4IUSA 2CGPA 3VWEA 2VBQA 3DSBA 3H4QA 3BJ7A 3MZHA 3LA3A 3CXSA 2XLFA 2ZCWA 2BNOA 3SCFA 2IL4A 2I45A 4Z07A 1KUYA 2UYBA 5C88A 4BH9A 4EROA 4OADA 3H1WA 5H84A 1Y7RA 3IBMA 2ZKLA 3IIAA 1EY2A 3H9AA 3WW3A 2P0WA 4CRYB 1S60A 2PQ8A 1RC6A 5DWMA 5ISVA 1VKCA 4LUKA 3E5UA 3KGLA 1ON0A 3G7DA 1MJ9A 1XIXA 5FQ0A 4I09A 4IEZA 2MNGA 1ZZCA 3PVBB 4TLFA 2Z69A 2FQPA 5CADA 2P6FA 4FD4A 5FCCA 5BUVA 2XLGA 3H3ZA 3S6KA 4KLVA 1CM0A 3CXQA 1K4JA 3FNCA 2I00A 1H1IA 2JLMA 4HMZA 1O3QA 4CAVA 3F5BA 1S5KA 2PA7A 4XPLA 2UY8A 4KL1A 1LB2A 5HMNA 3NKTA 4E2QA 4E2GA 2J8MA 4I3PA 5DWNA 4CAXA 3PLQA 2VQAA 5I93A 4HNXB 2R1IA 2AE6A 4XFAA 2D4OA 3TE4A 1I5ZA 3TCVA 3UKTA 4I49A 1UD1A 2CY2A 4OAEA 4Q0UA 5J48A 3FFQA 4AG7A 3TT2A 3BB6A 4ZBGA 3DNSA 2Y0MA 3SHRA 4IESA 4XFIA 3K9UA 1IPJA 1IIDA 5I0TA 4JTOA 2X7BA 3SXOA 2OZUA 4XPDB 3FE5A 5FPXA 2Q4VA 1O4TA 5F1RA 3D0SA 4BIFA 2R8VA 3GKRA 3KKWA 3UKNA 3RYOA 4L8AA 2XL7A 1RUNA 2XL9A 1M44A 2B3VA 2BUEA 3SHPA 4XFCA 3DL3A 1I1DA 2CNMA 2I79A 4L89A 4HNYB 3H50A 2Q0YA 1O7FA 2CNSA 1KZFA 2R98A 2OZHA 2XKPA 4NF1A 1PMIA 4FD7A 1KUXA 3QACA 2ZW6A 4DNCA 2VZZA 1DZTA 5JAXA 2JDDA 4RS2A 4R8HA 3LODA 1UFHA 3UKVA 1Z9UA 2H6CA 2PHLA 3KCCA 1GHEA 3CLPA 3E6DA 1XE8A 1OI6A 4AXOA 1QSMA 3TO7A 4YRHA 3F0AA 4FD6A 3NVCA 4FAGA 5I8SA 2V09A 1Z4EA 2BEIA 1ZRCA 2QECA 5D1IA 2Q30A 2ZPAA 5IX3A 1O3SA 2Z2SB 3S7EA 3CL1A 3F8KA 4XEZA 4R9MA 2Z10A 4P9GA 4OLLA 4NVPA 4M85A 2IXHA 4K30A 2Z0ZA 1YGHA 1VJ2A 1DZRA 3HQXA 3BLNA 2D5FA 1IICA 5IV0A 2FE7A 3ROUA 2H0VA 1YFUA 5I8YA 1I21A 1YLLA 2D93A 3ST7A 3NL1A 2O28A 4LTAA 4D7SA 4GULA 1NE9A 2PFWA 4IEYA 4LUAA 5KHIA 1CAXB 3EO6A 4QMAA 5LEKA 2PTMA 2EUIA 4HSJA 5KTCA 5E96A 1CAVB 4WZCA 4ZU7A 2WPWA 1CGPA 3V8IA 2OZGA 4MGZE 2G0BA 4U5YA 3ZJ0A 1GQGA 4R3KA 2P6GA 1KUVA 4MV2A 1YVOA 1QXRA 1ZZ7A 2ET1A 4R57A 2K0GA 4META 3GYDA 4F0YA 1S7LA 1FT9A 3P2FA 1XRUA 3ES4A 4N9HA 2H6BA 2K5TA 1J4JA 5KTAA 1H1MA 4XF3A 4HVQA 3MYXA 4JV4A 1FXZA 2OZ6A 1RO5A 4YRDA 3H7YA 3U0ZA 3S0MA 3O14A 1R57A 1UIJA 4OFGA 1YREA 2E9QA 2QVSB 1WLTA 3HT1A 3M3IA 2B5GA 2PAKA 4Q0SA 2GU9A 3EC4A 3R96A 2FS5A 2WPXA 2B8MA 1L3JA 3IWZA 3EY5A 2P6EA 4B5PB 3IGRA 2Q4SA 4YARA 4F8AA 5GCNA 4IEVA 2PQQA 5E16A 3DR6A 2ET7A 3CJXA 1IB1E 3RYRA 2D4PA 2Q04A 1J3QA 4KVOE 3TO9A 2CV6A 4EVYA 2Y0OA 3OCPA 4NXYA 3I59A 4PIYA 4A2UA 3C26A 2QCSB 4PV6A 3LA7A 1QWRA 2XLAA 3FWEA 4UBGA 4AVAA 1RUOA 1U6MA 2D5HA 4DINB 2BNNA 4Q29A 4XNHB 1EYBA 4KUAA 2HV2A 2VZYA 3FHIB 4QBJA 2BL1A 4KOYA 3GBFA 3HIFA 1XF8A 3LOIA 4WBBA 2ETEA 4I01A 1NZCA 4KVXA 1WA4A 4XETA 1QSRA 2XHKA 3R6SA 1BO4A 5FVJA 2ARHA 2NMTA 5KTDA 3LA2A 3DDDA 5JR7B 1S3ZA 4LA2A 2ZXVA 3BALA 4IF5A 5HI0A 2AJ6A 4CS0B 1YK3A 2BEOA 5H86A 2QNKA 4HN1A 4EWDA 4XF1A 1GQHA 4Q0VA 2FCKA 2PRBA 1CAXA 2REEA 2GZWA 5I8TA 1O5UA 3PNAA 4ORFA 5BPXA 5BXXA 4FBFA 1OD5A 3BU7A 4MGYE 1EP0A 3IDCB 1IYKA 2QJVA 3JVNA 4PK2A 2B4BA 4KORA 3FXTA 3TO6A 4F6AA 3RYKA 4EWEA 5KHKA 1IPKA 1YLEA 1QXJA 2FIWA 2VXKA 4UBRA 4XF0A 1ZREA 3R1KA 3B8GA 4PSWA 4Y49C 4IERA 2C0ZA 4E0AA 1VP6A 4FT8A 4QM9A 4UWIA 5F49A 4IEUA 2PHDA 2HQYA 4HN0A 4NCZA 4YYOA 2HUZA 3ELNA 5C8WA 2KXLA 2IXIA 4AVBA 4QB9A 3BCWA 3IWGA 4PIZA 2IXCA 1MK4A 3G3SA 3ZZIA 3LD2A 2B4DB 3ETQA 4HZFA 1X8EA 3LZZA 3QOPA 2J8RA 5I0CA 1VHSA 2Q7BA 4QUSA 1WGPA 4B5PA 4PSXA 2D40A 1Q2DA 3RDIA 1Y9WA 3S6GA 2WFPA 2IXJA 1ZRDA 3CXPA 1XEBA 2BSWA 1SFNA 3HT2A 1NSLA 2ATRA 2CNTA 4L11A 1WWZA 3I9SA 3G8WA 1QSOA 4JWPA 4K8FA 4YGOA 1ZZ9A 4PJYA 2OB0A 4IEWA 1UIKA 5JQ4A 4IEOA 3RYPA 1M4DA 4JJXA 5EBVA 1LRZA 1CAWB 1XE4A 3FIXA 2Q0AA 4LEJA 4E2SA 5CNPA 3KMHA 5KHHA 3NW4A 4JVAA 4II9A 2EA7A 2IC1A 2GC0A 3E97A 1Q3EA 1DGWA 1LRHA 4IEQA 1CX4A 2G3TA 2GAUA 4LULA 4RD7A 2HJIA 1I12A 5C82A 5KHJA 1Y9KA 3EHKA 3GYAA 2FL4A 3B02A 3EQEA 4N9IA 4U9YA 4IETA 4FD5A 5JPHA 5C6CA 2WC2A 4H6UA 3NSTA 4LX9A 3E6CC 1U12A 4HKFA 4KOWA 4LUMA 4AQ6A 4QX5A 2IXLA 2O8QA 4YSFA 2QMLA 1SQ4A 2PR8A 4MHDA 3WR7A 1RGSA 1RTVA 4KVME 1HW5A 5FDBA 1MJBA 4KWJA 1YFXA 4KU7A 2OYZA 1G6NA 1ZRFA 5FLHA 1FY7A 3FJSA 2KCWA 4QGMA 2EVNA 4H6ZA 3RPQA 4BMHA 2PAMA 4FAHA 1YFYA 4HNWB 3KGZA 1M4GA 5EZWA 1Z4RA 2VEZA 3T90A 3TNPB 3D2PA 4NSQA 3R95A 5J8CA 1NYWA 1X8MA 2PYTA 4ZU5A 1CJWA 3GY9A 4O9EA 1X82A 2GIVA 4MBUA 4CYDA 4KOTA 4Z82A 3D3SA 4XPDC 2XKOA 4MY3A 4EV0A 3EO4A 4MJ8A 2EVXA 4XF4A 5HH1A 1YUDA 2GANA 4PIXA 5J8FA 1Y3TA 3FB3A 1WK4A 5JCTA 4KOUA 4KWLA 2C27A 4F7ZA 2GC1A 4JTNA 4CRZB 3WW2A 3DV8A 2B3UA 2K9ZA 2HKXA 1B6BA 3IDBB 2PDOA 2ZW4A 1S7NA 3M70A 1NMTA 3DR8A 1O3TA 1TIQA 4AG9A 1VR3A 3OGJA 5BV6A 3TOBA 3EBRA 5EFUA 4I2OA 4J1XA 4QXKA 1QSTA 3D2MA 5FLJA 4E2AA 5AVPA 1M4IA 3FX3A 1CAWA 3ES1A 5J3UA 5JSPA 3H1YA 2CAUA 3UY5A 5CVRA 2VI7A 2GC3A 4I02A 3N7ZA 4J3GA 1SEFA 4UBHA 4KUBA 4RI1A 1YFWA 5JSRA 3H8UA 4XFFA 5F46A 2A4NA 1Q43A 4Q0PA 2DCTA 2H5MA 3I54A 4MZUA 3E6BA 2FIAA 4YNIA 2OPKA 2RC4A 2GC2A 1YHFA 3SCGA 5I91A 2Q4YA 4GS4A 3RNSA 1NE6A 1YR0A 1CAVA 4MI4A 5LRRA 4XFBA 3S7IA 4X6RB 4BYYA 3RZZA 2VPVA 3P2HA 5LEJA 1PM7A 1QY4A 3D82A 3KSCA 2GH2A 2JEVA 2QIRA 3W6SA 2ZW5A 3LAGA 1NXMA 1UCXA 5KBFA 1I6XA 3T9YA 1P0HA 1EPZA 3U11A 1J58A 2FMYA 2OA2A 2UYAA 2BNMA 4ONUA 4JXQA 4YFJA 2GE3A 4XF9A 2G3AA 5K8SA 2REFA 3E5QA 4U9ZA 3BJ8A 3R9FA 1ZZ8A 2ATFA 3W6XA 1CAUB 1ZX5A 2R7HA 2B5HA 1O3RA 3D8PA 4H7LA 4HLTA 1ZZ6A 2PSWA 3SXNA 1J1LA 3ZDSA 4KLWA 1UPIA 2N7GA 1IYLA 2VQYA 4QGNA 4XFGA 3W91A 2P17A 4KOXA 3H7JA 4IEPA 2VECA 5EC4A 2MHFA 5CU1A 3FRMA 1TQ5A 3I7DA 5E1RA 2F4PA 4B29A 3N4MA 1V0CA 1X7NA 4D7TA 2CAVA 3FZ3A 2MPFA 4HVOA 4BHPA 4L2NA 3E5XA 4XFHA 1YWKA 5J7MA 4UWJA 3OWCA 4UA3A 3E0KA 3SXWA 2PC1A 4XPKA 2DXQA 4QVTA 4IEXA 2XGXA 1J59A 4LA3A 1JUHA 4MGKE 1RL3A 4J1WA 3CO2A 3VHRA 5F47A 1ZNPA 2QDRA 4B5OA 5JSOA 1OZPA 1LKNA 5FPZA 2OU2A 4UXAA 2B5GB 3I3GA 3QB8A 3TNQA 4I0BA 5LRSA 4AB7A 4MH0E 5F48A 3NJZA 1V70A 4HSLA 1ZZBA 3USSA 1P4NA 2FT0A 3JUWA 2FXFA 2O1QA 1DGRA 2OZJA 4I0AA 1SQHA 5I0RA 3S6HA 2EAAA 1Q5OA 4JD6A 4KOSA 2Z11A 3OF1A 3H3UA 3I59B 4HVRA 3PGPA 4X5KA 1MJAA 2J8NA 4EWAA 2B58A 4XNHC 1M1DA 1S7FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BWCA 3POWA 3QAYA 1LR5A 4IL7A 5FXVA 4CAWA 3C3VA 4WM7B 3I3MA 3RMYA 3SCHA 1RXTA 2VY0A 2AR6A 3T2OA 2XJVA 1AR93 2BYVE 2D6PA 5LK7B 4IE0A 4KMQA 4WVMB 1EUTA 4FXKB 1SCSA 3I2HA 4RS5A 5JI9A 2B4DA 1AR81 1LOFC 5L9VA 1MQTC 1BJQA 4NHXA 4XDPA 4JGYA 1L0CA 5CYYA 3N9LA 2BZDA 1GYTA 2W1QA 3A23A 2ZCWA 3AX4A 5HXVA 2EIDA 3KQXA 2ZKLA 4H3WA 4D69A 4AGGA 4LHLA 5FKBA 4KG0A 4GXHA 2P6FA 2FQPA 2XLGA 4E4SA 5E88A 1RIRA 4A94A 1S5KA 5T5LA 5F5CA 5HMNA 3M7AA 1C57A 1IHMA 5DWNA 2ZGUA 5B4XA 5LYIA 3KVAA 3BB6A 3X29B 2VMIA 4BIFA 1GKBA 4LE3A 1TMF1 3B35A 4HNYB 2OZHA 2PCUA 2CTCA 4GWNA 3MIGA 2JDDA 4MHYA 1AL22 1H30A 4RHV1 1O8PA 2JDMA 4FUUA 1UOJA 4AXVA 3VBSC 4A7YA 3UGGA 1E5IA 4EWTA 1JU3A 3VBUC 5KXBA 2ZPAA 5FR3A 5LRJA 5LWBA 4XEZA 1PMJX 5GKAC 3OUIA 2LUWA 4OP4A 4Q4V3 5FKCA 2X8KA 2J9AA 2O28A 2O14A 4QMAA 4NUBA 4P9XA 3LEGA 4MGZE 2XQRA 4XE9A 1W6NB 4RA0A 4GMP3 2K0GA 1VAMA 4AI3A 1HXS2 4XYXA 2CXAA 4NAOA 5KTAA 4Z1VA 1BCXA 4C2ZA 1OQEA 4PBPA 1RTQA 2HWF2 3IU2A 2YBSA 3EY5A 4EFDA 3IGRA 1H9WA 4GJYA 1OA3A 2PQQA 4ET7A 3DR6A 1PK6C 3I59A 4PHZA 2QCSB 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chains in the Genus database with same CATH topology
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3KB5A
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3PP9 A;  1J3R A;  3MPB A;  5FQ0 B;  2PAE A;  2IXK A;  4X6Q B;  5I0U A;  2JDC A;  3FBU A;  1O5L A;  1Y9Q A;  4AVC A;  3PZJ A;  4M3S A;  1PUA A;  5IB0 A;  3S6F A;  2PR1 A;  3DKW A;  3EJK A;  1YX0 A;  4AQ2 A;  3L2H A;  1ZVF A;  3BPZ A;  4O9G A;  1LR5 A;  3ACL A;  4CAW A;  3C3V A;  1NE4 A;  3EXN A;  5FLI A;  4WVZ A;  3R9G A;  4KOV A;  4R3L A;  3QAH A;  3SCH A;  3U10 A;  1RXT A;  3R9E A;  1QSN A;  1B87 A;  4MX3 A;  3OTF A;  1Q2Y A;  3CF6 E;  3LWC A;  1XE7 A;  3CEW A;  3WW4 A;  2Q44 A;  4KZT A;  4JXR A;  4KWK A;  4NEX A;  3SMH A;  4E8O A;  1S7K A;  4R87 A;  2F5I A;  2Q1Z B;  4JLY A;  3H1M A;  2FSR A;  4QGL A;  4QM8 A;  4ZU4 A;  4Y49 B;  1CAU A;  1FI2 A;  4HBN A;  4MUV A;  2BYV E;  4KU8 A;  4Q0Q A;  4R52 A;  3EFA A;  3MGD A;  1UW8 A;  3TFY A;  1J3P A;  3WW1 A;  5KHG A;  2OH1 A;  3MDP A;  3NE7 A;  3TOA A;  3JZV A;  2ZW7 A;  3VWD A;  1OMI A;  4MY0 A;  5BY5 A;  2B4D A;  3FYN A;  3D0J A;  1N71 A;  2BGC A;  1YVK A;  1BOB A;  1Q2C A;  1XMT A;  4LLO A;  4MGI E;  3OD0 A;  1OFN A;  2UY9 A;  1L0C A;  3DN7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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