4AVAA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
332
structure length
327
Chain Sequence
DGIAELTGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
total genus 94
structure length 327
sequence length 332
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avaA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avaA02
1SFNA 4NVPA 2G3TA 2K5TA 1YR0A 4EV0A 3K9UA 5IV0A 2OZHA 4IETA 4D7TA 1GQGA 5FPXA 1XE8A 2N7GA 3ACLA 1I12A 4XPKA 4JWPA 4O9EA 4MJ8A 2ZCWA 1ZRCA 1KUXA 4XNHC 4WVZA 5FVJA 2Q44A 1J3QA 1DZRA 4E2QA 2BGCA 4QGMA 2J8NA 3BLNA 2PTMA 3ELNA 4HVQA 3GYAA 1ZZ6A 1Y7RA 1H1IA 3EC4A 2XLGA 3ZDSA 1EPZA 5CNPA 1VJ2A 3TOAA 3BALA 4ZU4A 4FBFA 2D5FA 5JSRA 3BB6A 3FFQA 3FIXA 1UIKA 4PIXA 4KOSA 2VZYA 4KOUA 3D0JA 2OZUA 2Q04A 3EY5A 1VR3A 4QUSA 3P2FA 4KL1A 2ZPAA 2VI7A 2Y0OA 3FB3A 1DGWA 4TLFA 2GC2A 1MJ9A 3IGRA 1CX4A 3S7IA 2J8MA 4Q0QA 2GH2A 3LAGA 3LD2A 1YLLA 2BNMA 5JSOA 3NSTA 4WZCA 4CS0B 4HMZA 2BSWA 3FNCA 2R8VA 5C6CA 2EVNA 3WW4A 3TT2A 4N9HA 2FE7A 4KLVA 3SCHA 1Y9WA 3F8KA 2A4NA 5KHHA 1SEFA 3VHRA 3PLQA 5HH1A 1NZCA 2I00A 5GCNA 2REFA 4XNHB 1J3PA 2CGPA 2WPWA 3IWZA 5K8SA 5EFUA 4L11A 2B4DA 4F8AA 3H9AA 1H1MA 4NF1A 1CAWB 2H6BA 4XF3A 2H5MA 2JDCA 4CRYB 3DV8A 5ISVA 1IIDA 3D2PA 3DL3A 3DR8A 2ET7A 4XF4A 1X7NA 4UWJA 1WWZA 5BUVA 2GC1A 1QSNA 1YVKA 1CGPA 5KHIA 1PMIA 2VQAA 3FRMA 1OI6A 3SXWA 4KVME 2Z10A 4KU8A 2FCKA 1IYKA 4HNWB 2Q1ZB 3QACA 4OLLA 4EWEA 3FE5A 4U9YA 3CLPA 3RYRA 2OZ6A 4YNIA 4EWDA 2XLFA 5I91A 3RYOA 3S6KA 3U11A 3H50A 4B29A 2R7HA 2PDOA 2EVXA 4A2UA 2H0VA 5D1IA 4F7ZA 1V0CA 2B58A 2QIRA 3CXSA 4XPDC 2QMLA 1UCXA 2GU9A 5I8YA 5KTAA 2GC0A 1Q43A 3MDPA 2OYZA 5J8CA 2CV6A 3DR6A 4YRDA 4II9A 4IERA 1O3SA 3KGLA 4IESA 4I49A 3USSA 2D40A 1NSLA 1EYBA 1IB1E 4H7LA 4LA2A 4QXKA 3GY9A 1YFXA 1O3RA 4IEQA 4XFIA 2CAVA 5E96A 2CNSA 1RO5A 3EJKA 2MNGA 2D93A 4K8FA 4B5OA 4J3GA 2Q0AA 4AXOA 3CEWA 2PRBA 3KMHA 1MJAA 4MHDA 2EUIA 5EZWA 1J3RA 2ZW5A 3EO4A 3KKWA 1PUAA 3E6CC 4HNXB 4M85A 4IEVA 3JZVA 1S60A 3C3VA 4IEUA 3SCFA 5JAXA 5J48A 1S5KA 3DKWA 4HVOA 1RTVA 4JXRA 4KZTA 2PQQA 3F0AA 3T90A 2O1QA 4I2OA 5FQ0B 4E0AA 4KU7A 2QNKA 1O3TA 4PJYA 2XLAA 5BY5A 4IEYA 2VXKA 3G3SA 5BXXA 3TNPB 2K0GA 4XPDB 3QB8A 1DGRA 4IEOA 3SHPA 1RUOA 5I0SA 3IDCB 2B5GB 1QWRA 1TIQA 1O5LA 1NE4A 4XF0A 4LUMA 1ZREA 3DSBA 1CAWA 1X8MA 4H6UA 1Y9QA 3R96A 2PAMA 1Z9UA 3H1MA 1I21A 4HNYB 4IEZA 4I01A 4XETA 2MPFA 4EWAA 4L2NA 2I45A 4YSFA 3OCPA 3EQEA 1ZRFA 3S7EA 4E2AA 3LOIA 1LR5A 3M70A 4CYDA 3W6SA 3U10A 3BU7A 3ZZIA 1ZZCA 4PIYA 2AE6A 4EROA 2B3VA 4PK2A 1RGSA 3NJZA 4MY3A 3R9FA 4R87A 2FIWA 2PAEA 3SCGA 4YFJA 2PA7A 3W6XA 1J1LA 3FYNA 3PNAA 5I93A 2FSRA 3B02A 5AVPA 4Q0PA 4H89A 2HQYA 4FD5A 4HSJA 4FT8A 3C26A 5J8FA 3CF6E 3TOBA 1YK3A 1FT9A 1ZX5A 4D7SA 2C27A 2WPXA 3RYPA 2I79A 3FWEA 1L0CA 1SQHA 3OWCA 1CJWA 2PHDA 2Z69A 4DNCA 3MZHA 4Y49C 2OB0A 3JUWA 1Y3TA 4QGLA 4LUKA 3ST7A 1U12A 2WC2A 4MGIE 3LWCA 2QDRA 3G8WA 1QSTA 2Q30A 1RUNA 5KTDA 4F0YA 2FMYA 4MZUA 5LEKA 1KUYA 2CY2A 3SHRA 5CADA 1NE9A 4RD7A 4R9MA 2ZW6A 2IXLA 4Z82A 3N7ZA 1YX0A 3CXPA 4QVTA 5JR7B 4AVBA 3KCCA 4HKFA 3PP9A 1NE6A 4UA3A 2B9UA 3LA2A 3LODA 5J3UA 5BPXA 1NMTA 5EBVA 1O7FA 4KOXA 4UBGA 5I8SA 3FXTA 2XGXA 1YFYA 4MX3A 2IXHA 1Y9KA 5CVRA 5E16A 2CAUA 5F49A 4QM8A 1Z4RA 3PVBB 4JXQA 1MJBA 1YFUA 3I7DA 4J1XA 1YVOA 4R8HA 3GKRA 3R1KA 2QECA 4MY0A 2DCTA 4NEXA 5FQ0A 1XMTA 2ET1A 4KWLA 1J4JA 4GS4A 1JUHA 1UPIA 3BJ7A 1I6XA 5KHGA 4E8OA 4AVCA 3WW1A 2B5GA 2PFWA 4PV6A 1YWKA 1BOBA 3M3IA 3FZ3A 1UFHA 4M3SA 3H1YA 2Q0YA 5T3NA 4Q0UA 3D0SA 5FCCA 1WGPA 2E9QA 3F5BA 1EP0A 4LA3A 4LTAA 1OMIA 2GC3A 3KGZA 1IYLA 4KOVA 5FLJA 4Y49B 2P6GA 1I1DA 4MUVA 1O3QA 4XFHA 3NKTA 3D2MA 4QC6A 1YFWA 4I02A 4QX5A 4FAGA 4JLYA 3TNQA 4AQ2A 1DZTA 1M4DA 5EC4A 3R6SA 3TO6A 4E2SA 1YGHA 2P17A 1OZPA 2P0WA 2PR8A 5JPHA 2J8RA 2IC1A 2GANA 3PGPA 3PZJA 1PM7A 1QXRA 2UYBA 2XL9A 1KUVA 1RC6A 4PSWA 4CAWA 4KUAA 3H4QA 2QJVA 1M4IA 1B6BA 5HMNA 1XRUA 3H1WA 1YUDA 5LRRA 2PHLA 2G3AA 3RPQA 4E2GA 3MGDA 3BPZA 1QY4A 4GULA 1ZRDA 4KOYA 2PAKA 5LEJA 3H7JA 4XPLA 1VP6A 1HW5A 3MYXA 4OAEA 1X82A 5J7MA 3RZZA 1XE4A 1RL3A 2OZGA 4JVAA 2D4OA 1WLTA 3VWEA 2JDDA 3BCWA 2ZXVA 4PK3A 4DINB 4UBHA 3IIAA 2WFPA 4MGZE 1ZZBA 2IXCA 1QSMA 3DNSA 2GE3A 2Z0ZA 3ES1A 4LEJA 3HQXA 4HN1A 3L2HA 4XF9A 4YRHA 5I0RA 3V8IA 1V70A 2P6FA 4QMAA 2EAAA 2PC1A 3NVCA 3S6FA 3UKNA 2RC4A 4LLOA 2R98A 1YREA 4XF1A 3OGJA 3JVNA 5IX3A 4KOTA 1Q5OA 1Q2DA 2O8QA 2CNTA 3RYKA 3EFAA 3FBUA 3ROUA 3SMHA 2KXLA 5CU1A 1GHEA 2VZZA 3IDBB 2BUEA 5C88A 2F5IA 1J59A 4U9ZA 1UIJA 1K4JA 3LA7A 4FD4A 1XE7A 2QCSB 2NMTA 4JJXA 4MV2A 4X6RB 2B4BA 2FIAA 3EBRA 1J58A 3P2HA 3H8UA 4MH0E 1BO4A 2Y0MA 4IUSA 3MPBA 2ZW7A 2Q4SA 2FT0A 4BYYA 3RDIA 2ZW4A 1SQ4A 4EVYA 4YARA 3S0MA 4I3PA 2ATRA 2REEA 3TE4A 1CAUB 1O4TA 1Q3EA 1UW8A 1GQHA 2OZJA 4KOWA 1FI2A 4RS2A 1S7KA 2UY8A 2BYVE 4X6QB 3O14A 4HLTA 4BMHA 2VECA 1Q2CA 2FS5A 3E5XA 4F6AA 4HZFA 1ZZ8A 4R3LA 4U5YA 5JCTA 3ZJ0A 3ETQA 3WW2A 4JTNA 4KVXA 3N4MA 3FJSA 3WW3A 1KZFA 3E0KA 2OPKA 5I0CA 2HJIA 3FX3A 5FLIA 5I0UA 5F1RA 2Q4VA 1XIXA 4QBJA 1P4NA 1ZNPA 3E97A 3NL1A 1FY7A 3TCVA 1N71A 4R52A 2ETEA 3KSCA 2Q7BA 3TO7A 2DXQA 1LKNA 5FDBA 4MGKE 3IWGA 4AG7A 3I3GA 2ZKLA 2XHKA 4XFFA 1VHSA 4NCZA 4B5PB 2Q4YA 1G6NA 4XEZA 4CRZB 1XEBA 2KCWA 5I0TA 3S6GA 3CJXA 2VEZA 2BNOA 1P0HA 1Z4EA 4XFBA 1YHFA 1CAXB 5FPZA 1CAVB 1TQ5A 3E6BA 3D3SA 4AQ6A 1WA4A 4BIFA 4FD7A 2EA7A 2D5HA 1M1DA 4AG9A 1IPJA 2MHFA 3WR7A 2BNNA 4PSXA 4WBBA 4I0BA 2JEVA 3UKVA 2B8MA 5KBFA 3TFYA 2FQPA 2G0BA 2HUZA 4HN0A 1QSOA 2OH1A 3CXQA 1ZVFA 1QSRA 2VQYA 3S6HA 1O5UA 3EXNA 5H86A 1B87A 4P9GA 4HSLA 4QGNA 3I9SA 2X7BA 5C82A 3H7YA 1XF8A 4NXYA 1IICA 4R3KA 5KTCA 3OTFA 2OA2A 1FXZA 4META 4AVAA 2V09A 1YLEA 3LA3A 1MK4A 4N9IA 4YGOA 1LRHA 1S3ZA 3H3UA 4HBNA 3I59B 3E5UA 1M44A 5HI0A 2B5HA 2FXFA 1Q2YA 2PSWA 3ES4A 4KLWA 4MI4A 3NW4A 1R57A 3R9EA 1OFNA 4BHPA 3DN7A 3SXOA 3T9YA 1CAUA 3H3ZA 4CAVA 3TTHA 1QXJA 3CO2A 4KUBA 4MBUA 4QB9A 3TO9A 5IB0A 4XFAA 3VWDA 2XKPA 3GBFA 1ZZ7A 4I0AA 4KVOE 2Z2SB 2BEIA 4BH9A 1X8EA 4KORA 4LX9A 1PU9A 4YYOA 4H6ZA 5DWNA 4KWKA 1U6MA 3B8GA 5KHJA 4JD6A 5H84A 3R9GA 1IPKA 5FLHA 2B3UA 2PQ8A 3HT1A 3W91A 4ZU5A 4HVRA 4KWJA 2GIVA 2IXKA 4NSQA 4CAXA 1VKCA 4J1WA 5BV6A 4MGYE 3NE7A 4IF5A 5JSPA 4ZU7A 4ONUA 3IBMA 4UXAA 3D8PA 1I5ZA 1UD1A 4IEPA 2ATFA 2BEOA 5F46A 3FHIB 5E1RA 3OF1A 4UBRA 4PIZA 2OU2A 2PR1A 2GAUA 3I54A 3D82A 1LB2A 1NYWA 2P6EA 4UWIA 4B5PA 2C0ZA 4RI1A 3U0ZA 2FL4A 4XFGA 2IXJA 2H6CA 4JV4A 2UYAA 5LRSA 2XL7A 1EY2A 2K9ZA 2D4PA 3HT2A 3QAHA 4Q29A 1CAXA 3E5QA 4Q0SA 1CAVA 4JTOA 3E6DA 4OFGA 3UKTA 1OD5A 4FAHA 4XFCA 3CL1A 5F48A 4K30A 4X5KA 3EO6A 2QVSB 5JQ4A 4IEXA 5F47A 3UY5A 3EHKA 3RNSA 1RXTA 2IXIA 4L89A 1L3JA 4O9GA 1WK4A 1ZZ9A 2AJ6A 2HV2A 4L8AA 4LUAA 1ON0A 2R1IA 4OADA 2CNMA 3BJ8A 1M4GA 3R95A 2GZWA 2PYTA 2XKOA 2IL4A 4I09A 4ZBGA 1S7NA 2BL1A 2HKXA 4FD6A 5I8TA 2VBQA 2VPVA 1S7LA 4LULA 2Z11A 2UY9A 2O28A 3LZZA 3HIFA 3OD0A 1LRZA 3SXNA 4Q0VA 4ORFA 4R57A 1S7FA 2B4DB 1CM0A 5DWMA 5KHKA 2ARHA 4IEWA 4Z07A 4AB7A 3I59A 3QOPA 1ZRRA 3DDDA 1NXMA 3G7DA 5C8WA 2JLMA 3GYDA 2F4PA 4QM9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YYOA 3AMMA 1YR0A 4EV0A 2OZHA 5ERLA 4RGGA 1ZRCA 3RZLA 3TX8A 3GALA 4OHVA 3FHQA 5A3NA 1S0BA 2IWGB 3ELNA 4UW4A 4P45A 4GMP0 3O5SA 2WSUA 1UIKA 2V8DA 1W8WA 3EY5A 1R1A1 2ZPAA 3GXUA 1XNBA 2HC9A 2BJSA 3VZOA 3AXEA 1WCQA 1OH3A 1Y9WA 4QQOA 2JD9A 5FZDA 1W6MA 2Q1MA 3F95A 5K8SA 3MO4A 4DQAA 2JDCA 3K51A 2OT7A 1AR71 5IK7A 1NCQC 3MF9A 4N43A 2VCCA 1SLAA 2V73A 5FPUA 3FE5A 5IFTA 3I3BA 2DWRA 1V9U1 2DFBA 1ZBE2 4P02B 2PDOA 2AEZA 1HB4A 2E7TA 3O1UA 3PFEA 4L8QA 1W6PB 1OLRA 4A33A 4QXKA 3GY9A 4XVHA 2XEIA 2R043 2XJUA 5KXEA 2DYCA 1W9TA 4LHNA 3OGVA 2Q8EA 2OU2A 4MXUA 4YW3A 1RMU1 3T1MA 1BPMA 2YBKA 2K0GA 4KBBA 1JU4A 1YC61 3VDDB 1GP5A 1NE4A 4NR1A 3DSBA 5JWPA 1OF4A 1I21A 3WINE 4GMP1 3D3AA 4E2AA 1H0BA 2B3VA 4GXHA 1MS1A 2VTXJ 5JVVA 5FY1A 3FYNA 3B02A 3CF6E 3AKRA 1W39A 5DUWA 2ZEGA 3IM0A 1QJEA 4JQRA 3JUWA 4NGNA 4Q1PA 1RUNA 1YYNA 2WAAA 3DGVA 4AVBA 3MIGA 5FZ3A 2VNGA 4OMCA 4K6BA 4TN7A 2XQXA 4FBEA 2VZ3A 4KWLA 1JUHA 3OPWA 4O23A 3W21A 2A73B 2TBVA 4Y26A 1YWKA 3FZ3A 3WC5A 4KOVA 2GC3A 1O3QA 4ISRA 2ARCA 4C91A 3CNAA 4M3CB 5IYYA 4A45A 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4RS5C
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1SFN A;  4NVP A;  2G3T A;  2K5T A;  1YR0 A;  4EV0 A;  3K9U A;  5IV0 A;  2OZH A;  4IET A;  4D7T A;  1GQG A;  5FPX A;  1XE8 A;  2N7G A;  3ACL A;  1I12 A;  4XPK A;  4JWP A;  4O9E A;  4MJ8 A;  2ZCW A;  1ZRC A;  1KUX A;  4XNH C;  4WVZ A;  5FVJ A;  2Q44 A;  1J3Q A;  1DZR A;  4E2Q A;  2BGC A;  4QGM A;  2J8N A;  3BLN A;  2PTM A;  3ELN A;  4HVQ A;  3GYA A;  1ZZ6 A;  1Y7R A;  1H1I A;  3EC4 A;  2XLG A;  3ZDS A;  1EPZ A;  5CNP A;  1VJ2 A;  3TOA A;  3BAL A;  4ZU4 A;  4FBF A;  2D5F A;  5JSR A;  3BB6 A;  3FFQ A;  3FIX A;  1UIK A;  4PIX A;  4KOS A;  2VZY A;  4KOU A;  3D0J A;  2OZU A;  2Q04 A;  3EY5 A;  1VR3 A;  4QUS A;  3P2F A;  4KL1 A;  2ZPA A;  2VI7 A;  2Y0O A;  3FB3 A;  1DGW A;  4TLF A;  2GC2 A;  1MJ9 A;  3IGR A;  1CX4 A;  3S7I A;  2J8M A;  4Q0Q A;  2GH2 A;  3LAG A;  3LD2 A;  1YLL A;  2BNM A;  5JSO A;  3NST A;  4WZC A;  4CS0 B;  4HMZ A;  2BSW A;  3FNC A;  2R8V A;  5C6C A;  2EVN A;  3WW4 A;  3TT2 A;  4N9H A;  2FE7 A;  4KLV A;  3SCH A;  1Y9W A;  3F8K A;  2A4N A;  5KHH A;  1SEF A;  3VHR A;  3PLQ A;  5HH1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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