4AVAA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
332
structure length
327
Chain Sequence
DGIAELTGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 94
structure length 327
sequence length 332
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avaA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avaA02
3FYNA 2ZW5A 3TO7A 3KGZA 4XFBA 4IF5A 2KXLA 1RGSA 1UIKA 4X6RB 1QXJA 3TE4A 4CAWA 3PP9A 4UWJA 4XFFA 2VZZA 4MZUA 2XKOA 4XETA 1J3PA 3H1MA 4Z07A 1B87A 1S60A 3VHRA 2HQYA 2VXKA 1PUAA 1YK3A 4OFGA 2XKPA 3TTHA 2ATRA 1XEBA 5FLIA 3TOAA 1YLLA 1YGHA 2IC1A 2ZW7A 4MV2A 3SHRA 1P0HA 3PGPA 5F49A 2R8VA 5FLHA 2ZPAA 3D3SA 1S5KA 4DNCA 1SQ4A 3LODA 5BY5A 2IXLA 4XFCA 2I79A 4ZU5A 3D0JA 2BNNA 1DGRA 4Q29A 2PHLA 4F6AA 1I6XA 4MX3A 2UY9A 3UY5A 3H1YA 1M4IA 5AVPA 2RC4A 2K5TA 3E97A 2HUZA 4KLVA 3ZDSA 3PZJA 4UWIA 5C8WA 3SXWA 4IEZA 3GY9A 3CJXA 4HMZA 1J1LA 5I93A 2R98A 2FIAA 1RXTA 4U5YA 4XPDB 2H6BA 5I8YA 4KVME 3H7JA 2GZWA 4KWJA 2B4BA 5EBVA 2Q7BA 3S6GA 5CADA 4RI1A 5E16A 2PQ8A 3IDBB 2GANA 5JAXA 4XF9A 2QIRA 3R9FA 1ZZ6A 4Q0QA 3S6FA 1NXMA 4FD4A 2D5HA 4RS2A 3HT1A 5HH1A 5KHIA 3G8WA 3KKWA 2D4PA 3ZZIA 3CL1A 3TNPB 1QSMA 2ET7A 4YARA 2QCSB 1N71A 1S7FA 3EJKA 4GULA 1O3QA 3DNSA 4IEWA 2B5GB 4UBGA 1LRHA 3FNCA 1VKCA 4QGLA 1ZRDA 2BEOA 3K9UA 4H89A 2B3VA 1GHEA 3R9EA 1CAVA 5F48A 1NE6A 4AB7A 2WPXA 2BNMA 3WR7A 1YHFA 3IWZA 4N9HA 3CXSA 5KBFA 2VQAA 3S7IA 1NE9A 3BPZA 4MUVA 4UBHA 2QNKA 1VR3A 1ZZBA 4YYOA 1XRUA 5FQ0A 2Q1ZB 2D4OA 2IXJA 3HQXA 3LWCA 2IXIA 4META 2B4DA 4I2OA 1L3JA 3OF1A 3TFYA 3OCPA 1X8MA 1YWKA 2X7BA 4JV4A 1SEFA 3DSBA 4F0YA 3HT2A 5LRSA 1Q3EA 4K30A 3EQEA 2FIWA 1VJ2A 3H3UA 4E2GA 2OPKA 4OLLA 2Z11A 5GCNA 4CAXA 4HVRA 3LOIA 4AVAA 3EC4A 4H6ZA 4PIZA 3SHPA 4HVOA 4R3LA 4QX5A 1IYLA 3FJSA 1IICA 2Q44A 5JPHA 4QGMA 4FT8A 1ZVFA 3KMHA 1QSTA 3ROUA 3P2HA 4I0BA 5BXXA 1M1DA 4E8OA 3FX3A 5EFUA 4XFGA 5F46A 5JR7B 3RZZA 3S0MA 2JDDA 4OADA 4FAGA 2XLGA 5LEKA 4H7LA 5H84A 4HVQA 1U6MA 3EO4A 2ZKLA 3LZZA 2B5HA 4B29A 3IBMA 5JSRA 2HV2A 2Q4YA 3I3GA 1XE4A 2O28A 1M4GA 2B8MA 4MGZE 5FVJA 2B4DB 1IPKA 4LUKA 1YLEA 4NXYA 2I45A 2PAKA 2VECA 2B9UA 5KTCA 4CS0B 3EHKA 3D0SA 2BGCA 3RPQA 3USSA 5J7MA 2FXFA 4KUAA 4FD6A 4UBRA 1QSOA 4XFAA 3T9YA 4PV6A 2PYTA 2KCWA 1ZZ7A 4B5PB 4E2SA 3E6CC 3OWCA 3OTFA 4BH9A 3RNSA 3GKRA 5KTDA 3G7DA 2WFPA 3UKVA 4AVBA 1MJBA 3LA7A 2J8MA 4M85A 3FWEA 4CRYB 2D93A 3NVCA 3MZHA 2HJIA 4XFIA 4AQ6A 4CYDA 1Q2YA 1SQHA 1WK4A 3W6XA 4D7TA 3GYAA 4R9MA 4J1WA 2JLMA 3BU7A 5C82A 1IIDA 4JTOA 1Q2DA 4JXQA 3S6HA 1J3RA 1QXRA 2FS5A 4FAHA 2OB0A 2MNGA 4KZTA 3R95A 5FLJA 5C6CA 4JWPA 2IXKA 2XHKA 5F1RA 4KOWA 2OZHA 4OAEA 4HNXB 4KUBA 1BO4A 1OI6A 1UD1A 4YSFA 4YNIA 4KOUA 3UKTA 2BYVE 4UA3A 1Q5OA 2K0GA 3WW4A 2Q30A 3SCHA 4J3GA 2EVNA 2P6GA 4LX9A 1NYWA 1S3ZA 1UW8A 3JVNA 2PAMA 3EY5A 5EZWA 2B58A 3LA2A 4L2NA 1UPIA 1V70A 2PAEA 3RYKA 4QM9A 1ZRFA 2B5GA 1Y3TA 4E0AA 1CAWB 2UYAA 2D5FA 3FRMA 2MHFA 1CAXA 1ZRRA 2Z0ZA 4XPKA 4LA2A 2GH2A 4EWDA 1MJAA 3MDPA 3ETQA 5KHKA 4JXRA 2C0ZA 4WVZA 4EV0A 4JVAA 3D82A 2GU9A 3R6SA 3TOBA 3CXPA 5I0CA 2ZW6A 4PSXA 1YVKA 1O5UA 5I0TA 1X82A 1YFYA 3IWGA 4AG9A 1KZFA 4O9EA 1Y7RA 3DKWA 3NJZA 2BNOA 2J8RA 2HKXA 4HN0A 2PR8A 2PR1A 3F0AA 2IXCA 1KUYA 1G6NA 1PM7A 5I0SA 4NF1A 3JUWA 4HNWB 2XL9A 2I00A 1O3TA 5C88A 4LUMA 5F47A 2PFWA 1GQGA 3O14A 3MGDA 3FZ3A 5KHJA 2JDCA 1EP0A 2BSWA 1IPJA 1WWZA 2FQPA 3HIFA 3FBUA 1EY2A 1NSLA 3R96A 1CAXB 4EVYA 3MYXA 1XE8A 4PK3A 2ET1A 1YX0A 4MHDA 3C26A 5J3UA 1DGWA 3FFQA 3ACLA 4WBBA 3NKTA 4IEYA 2PA7A 4IEVA 2P6FA 2CAUA 4IEXA 3WW3A 2GAUA 1R57A 1UCXA 2DXQA 2QMLA 1NMTA 2B3UA 3H9AA 4CRZB 1IYKA 3CEWA 3TCVA 3FHIB 3T90A 1X8EA 4AVCA 2CY2A 3SCGA 5IV0A 4KLWA 4IEUA 3FIXA 4FD5A 5E1RA 1RO5A 2F4PA 1ZRCA 3E0KA 4KOVA 2CNSA 2XLFA 4KVXA 2QECA 2ATFA 3ES4A 2ETEA 4HSJA 4IETA 2EA7A 1Q2CA 5HMNA 4DINB 2K9ZA 2Z69A 4Y49C 5D1IA 5I0RA 2Q4VA 4B5OA 4I3PA 1QSNA 4B5PA 3EXNA 4PK2A 5EC4A 1XIXA 4XFHA 5FDBA 2Q0AA 4R87A 2ZXVA 5I91A 1MK4A 4PSWA 4XNHB 3UKNA 3DR6A 1DZTA 3OD0A 1H1MA 1I5ZA 4QC6A 4EWAA 4Q0VA 1S7NA 1CJWA 5E96A 2FT0A 4CAVA 4X6QB 3PLQA 4M3SA 2Y0OA 3IDCB 2PQQA 4L8AA 2ZCWA 1FY7A 3H3ZA 5IB0A 3GYDA 1I21A 4U9ZA 4XF4A 1S7LA 1BOBA 3U11A 2J8NA 4NSQA 1LB2A 3BJ7A 4WZCA 3S6KA 3E6DA 4A2UA 2D40A 5J8CA 4FD7A 4QUSA 3VWDA 4QGNA 4II9A 1RL3A 2GC3A 5LEJA 3H4QA 3CO2A 4HZFA 4YRHA 3DV8A 3KGLA 4R52A 4QB9A 1ZZ9A 1U12A 4IEOA 3U10A 1XMTA 1OD5A 1YVOA 1CAWA 4QVTA 3CF6E 2UY8A 1VP6A 1PU9A 4PIXA 1OFNA 1SFNA 2BL1A 5H86A 4F7ZA 5CVRA 4HLTA 3SMHA 2OZ6A 2XLAA 4BHPA 2OA2A 4KOSA 2CNTA 4R3KA 4LLOA 4AXOA 3BALA 2VBQA 1CX4A 3FXTA 3FE5A 4KVOE 4NVPA 2UYBA 2GIVA 4FBFA 1ZZ8A 3N4MA 3CXQA 2NMTA 5KHHA 3S7EA 3SCFA 1RUNA 2FCKA 5CNPA 3QB8A 3BCWA 2VZYA 3BJ8A 3F8KA 3P2FA 5I0UA 2BUEA 4JD6A 2QJVA 4E2QA 2FSRA 3D2MA 3BB6A 3TNQA 3LA3A 3RDIA 1J58A 1Y9WA 3KCCA 2OH1A 3WW1A 3LAGA 2GE3A 3MPBA 1Y9KA 4KWLA 2P6EA 2A4NA 3SXOA 5I8TA 4IERA 1WA4A 1I12A 1S7KA 3BLNA 3I54A 1M44A 1ZREA 1XF8A 3H1WA 1Y9QA 3EBRA 2VEZA 4LA3A 1JUHA 4MY3A 3TO6A 3EFAA 3QACA 3DR8A 4BMHA 1HW5A 3E6BA 5HI0A 4KOYA 2GC1A 2JEVA 4LUAA 2G0BA 3V8IA 4ZU7A 5DWNA 3U0ZA 4GS4A 4KOTA 2EVXA 4U9YA 2PC1A 2AE6A 2Q0YA 4HBNA 2G3TA 3VWEA 1EPZA 1J59A 4X5KA 4KU7A 4MY0A 3F5BA 4L11A 4HKFA 3WW2A 4JJXA 5JQ4A 1XE7A 4IUSA 2V09A 4O9GA 3I59A 4NEXA 1RC6A 4QM8A 4KOXA 2Y0MA 2FE7A 2OYZA 3QAHA 3ELNA 3PVBB 3PNAA 5CU1A 2WPWA 1FXZA 4MGYE 2ZW4A 2OZJA 1Q43A 1P4NA 5ISVA 2FMYA 4RD7A 1TQ5A 4KORA 3H8UA 2C27A 1ZZCA 2R7HA 4XPDC 3IIAA 4F8AA 5FCCA 1RUOA 1CAUB 5BPXA 4L89A 4XF3A 2MPFA 2CNMA 2CAVA 3E5QA 2H6CA 3CLPA 1OMIA 1DZRA 4ONUA 3NE7A 1YFUA 3KSCA 4XPLA 4KL1A 2F5IA 4AG7A 3E5XA 4MBUA 2IL4A 1O7FA 2PDOA 1ZNPA 4HSLA 1B6BA 2FL4A 2XL7A 3D2PA 4AQ2A 4LULA 3H50A 2N7GA 1LRZA 3N7ZA 4P9GA 5KTAA 2P0WA 3ZJ0A 4KU8A 4QMAA 4LTAA 4QXKA 5BV6A 3M70A 2VQYA 3I59B 4TLFA 4Z82A 4I09A 4PIYA 3I9SA 3IGRA 5DWMA 4BIFA 3ST7A 1YFXA 4J1XA 1YFWA 3NL1A 2EUIA 2XGXA 1YUDA 4H6UA 3ES1A 1H1IA 1VHSA 2Z2SB 1NE4A 5JCTA 2GC0A 4I0AA 5JSPA 1O3RA 3RYOA 2BEIA 1WGPA 4QBJA 1QWRA 2H0VA 2IXHA 4R8HA 5FPZA 3RYRA 2CGPA 1O4TA 1UFHA 2ARHA 2OZGA 2REEA 5IX3A 4Y49B 1ZX5A 1V0CA 2QDRA 4MGIE 3OGJA 3M3IA 4ZU4A 1WLTA 4UXAA 4Q0UA 1GQHA 2GC2A 1QSRA 3G3SA 4KWKA 4XF0A 2P17A 2PTMA 4I01A 4K8FA 4N9IA 2Z10A 4YGOA 4YFJA 1I1DA 1L0CA 1KUXA 1J4JA 1KUVA 2CV6A 2E9QA 2PSWA 1M4DA 3R9GA 3B8GA 4XNHC 2VPVA 3DDDA 2Q4SA 3JZVA 4I49A 3EO6A 3H7YA 4BYYA 1ON0A 3E5UA 3NW4A 2H5MA 2O8QA 2PRBA 1FI2A 3W6SA 5LRRA 2REFA 1NZCA 5BUVA 3R1KA 4MJ8A 4JTNA 2OU2A 3C3VA 4XF1A 1FT9A 3NSTA 4PJYA 4HNYB 4XEZA 1CAVB 3FB3A 1CM0A 1UIJA 3DN7A 1O3SA 1Z4RA 5T3NA 1QY4A 1Z4EA 4MI4A 4E2AA 1LR5A 2AJ6A 3D8PA 3W91A 4MH0E 2WC2A 3QOPA 3B02A 5I8SA 2QVSB 2OZUA 4EWEA 5FQ0B 5KHGA 5JSOA 4Q0SA 3DL3A 3TO9A 2EAAA 3RYPA 1MJ9A 1X7NA 5J48A 1TIQA 1IB1E 4ZBGA 4YRDA 1PMIA 1CGPA 5J8FA 5K8SA 4MGKE 4IEQA 1LKNA 4Q0PA 1EYBA 4IESA 4IEPA 4EROA 2O1QA 1YR0A 4JLYA 3LD2A 1YREA 4ORFA 1O5LA 2VI7A 4NCZA 3GBFA 4HN1A 2G3AA 3SXNA 1OZPA 4R57A 3L2HA 1RTVA 1J3QA 4I02A 5FPXA 2DCTA 1K4JA 2R1IA 1Z9UA 3TT2A 3I7DA 4LEJA 1CAUA 4D7SA 2Q04A 2PHDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1O91A 4XFBA 2WINB 1R081 4CUAA 2JG8A 1A8DA 6CPAA 3HQRA 4WM7B 4Z07A 5EJ1B 3B3QE 2ATRA 4PDWA 1YGHA 1S5KA 3D0JA 1X36A 4H3WA 1XOYA 3AP7A 3TEZA 2XUMA 2EXIA 4YW4A 4GXHA 3PJQA 4QD2A 3IDBB 1NA1B 2GANA 4XF9A 3B35A 2JDHA 4OC3A 2FDHA 4OHXA 1CZVA 3NV4A 2RM21 3KKWA 5KXCA 5F2SA 5DMYA 5APAA 3HOBA 4FBEA 2XEJA 5G05L 2R073 4X8IA 3KL9A 4QGLA 3AVRA 2J1UA 2AUYA 5KBFA 4LHKA 3S7IA 1PM4A 4RR3C 3ABZA 4Y5TA 2A7AA 5JDBA 4AFDA 1W8FA 1X8MA 4JV4A 1SEFA 2PLV3 3ZFGC 5CG8A 4CXYA 4WV8A 3H3UA 4OLLA 5LBFA 4QQLA 3WF4A 3D4UA 2Q8OA 1QF3A 2C24A 3EO4A 3KT1A 1MS8A 4L0PA 2O28A 2Q1FA 4ZYQA 4WM7A 2XMLA 4Y4YA 1TME1 3OBTA 4NXYA 2VMGA 2WQ4A 2PAKA 2B9UA 2GU2A 4WJBA 4OZXA 2GNTA 2KCWA 3OWCA 2Q4ZA 2Z42A 3G7DA 5DZEA 2WL1A 1SFYA 5C82A 4YGBA 3EYPA 4GQ7A 2WA3A 3NMBA 3S6HA 1IKQA 4BCUA 1Z7S2 2XHKA 1NA1A 5K8PA 4HANA 3O1TA 5ERLA 3B00A 4BB3A 5F6KA 3NH8A 3D68A 2HH9A 3RQ0A 4L2NA 2PAEA 2P1BA 1XJAA 1ZRFA 4R76A 3IIIA 3SJXA 4O23A 2ZW6A 3VBUB 2RMU2 2C6CA 3IWGA 5IB9A 3KV6A 4HN0A 2BW8A 2PR1A 2QJ8A 5C3QA 2VBDA 3BKZA 2J1AA 4JDNA 2WZ8A 1IKPA 1XE8A 3W91A 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2QZ2A
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3FYN A;  2ZW5 A;  3TO7 A;  3KGZ A;  4XFB A;  4IF5 A;  2KXL A;  1RGS A;  1UIK A;  4X6R B;  1QXJ A;  3TE4 A;  4CAW A;  3PP9 A;  4UWJ A;  4XFF A;  2VZZ A;  4MZU A;  2XKO A;  4XET A;  1J3P A;  3H1M A;  4Z07 A;  1B87 A;  1S60 A;  3VHR A;  2HQY A;  2VXK A;  1PUA A;  1YK3 A;  4OFG A;  2XKP A;  3TTH A;  2ATR A;  1XEB A;  5FLI A;  3TOA A;  1YLL A;  1YGH A;  2IC1 A;  2ZW7 A;  4MV2 A;  3SHR A;  1P0H A;  3PGP A;  5F49 A;  2R8V A;  5FLH A;  2ZPA A;  3D3S A;  1S5K A;  4DNC A;  1SQ4 A;  3LOD A;  5BY5 A;  2IXL A;  4XFC A;  2I79 A;  4ZU5 A;  3D0J A;  2BNN A;  1DGR A;  4Q29 A;  2PHL A;  4F6A A;  1I6X A;  4MX3 A;  2UY9 A;  3UY5 A;  3H1Y A;  1M4I A;  5AVP A;  2RC4 A;  2K5T A;  3E97 A;  2HUZ A;  4KLV A;  3ZDS A;  3PZJ A;  4UWI A;  5C8W A;  3SXW A;  4IEZ A;  3GY9 A;  3CJX A;  4HMZ A;  1J1L A;  5I93 A;  2R98 A;  2FIA A;  1RXT A;  4U5Y A;  4XPD B;  2H6B A;  5I8Y A;  4KVM E;  3H7J A;  2GZW A;  4KWJ A;  2B4B A;  5EBV A;  2Q7B A;  3S6G A;  5CAD A;  4RI1 A;  5E16 A;  2PQ8 A;  3IDB B;  2GAN A;  5JAX A;  4XF9 A;  2QIR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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