4AVAA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
332
structure length
327
Chain Sequence
DGIAELTGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 94
structure length 327
sequence length 332
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avaA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avaA02
4Q0QA 5J48A 4HSJA 1EY2A 2B5HA 4R9MA 5T3NA 1YLEA 1B6BA 5C88A 4H7LA 2VZYA 5E16A 1O4TA 1JUHA 4HNYB 3IDBB 4LA3A 4EWAA 3D3SA 1LKNA 2PAKA 2FL4A 2K9ZA 2MPFA 1K4JA 2VI7A 2PFWA 4IUSA 2PDOA 4KVXA 1J4JA 2ARHA 5FDBA 2D40A 3FE5A 2FIAA 5I0TA 1IPKA 3ZDSA 3M70A 3G7DA 4I0AA 1NE6A 4NVPA 1XE4A 2ZPAA 2PHDA 4KOWA 4XFGA 3D0JA 5FQ0A 3H7YA 1QSNA 1S7FA 3FNCA 5J8FA 4JVAA 1IB1E 3I3GA 4KOSA 3ZZIA 2D4OA 1YWKA 2K0GA 4LX9A 5F46A 2IL4A 1ZZ7A 4XF3A 4CRZB 1O7FA 1SQ4A 2VEZA 3F8KA 4I3PA 3N4MA 2IXCA 3GKRA 2CNSA 2REEA 1ZZ9A 3ES4A 5KTDA 4R52A 4Z07A 2OZGA 3B02A 3MGDA 3ROUA 5C82A 2XKOA 2G3TA 2B3UA 2Q4VA 1YUDA 4L11A 3FBUA 3V8IA 4XETA 2QNKA 4J1XA 2OYZA 4M3SA 2VECA 2WFPA 4KWKA 2GE3A 2IC1A 1OZPA 5H86A 3OGJA 1ZZ6A 4HVRA 1VJ2A 3BJ8A 4R8HA 5FLIA 5F1RA 3SXOA 1GQGA 1S60A 2BSWA 3SXWA 3R9GA 2PQ8A 1P0HA 3EQEA 4EWDA 5I0SA 3WW1A 3SHPA 4KUBA 1SEFA 1CAWB 1Q43A 4JWPA 4U5YA 3ETQA 3FYNA 4M85A 3IDCB 4CYDA 1IYKA 4R57A 1SFNA 3KMHA 1UD1A 4KVOE 3TTHA 5E1RA 1I12A 1RTVA 4E0AA 3EFAA 3USSA 1VHSA 4D7TA 2CY2A 4AG9A 1DZRA 3SHRA 2FCKA 2DCTA 1UCXA 3RYOA 1NE4A 4KWJA 2GH2A 2OB0A 4IERA 5I91A 4NF1A 3MDPA 2I79A 4NSQA 1S5KA 4KOYA 1IPJA 3CLPA 1FXZA 4EVYA 1OI6A 2O8QA 1EYBA 4E2SA 5LEKA 2PYTA 2B9UA 4JXQA 2VQAA 4KU8A 4QGLA 1RUNA 1NMTA 4UWIA 4LUMA 1Q2CA 3RNSA 2G0BA 2ZXVA 5J7MA 4META 3H3UA 4ZU4A 2FMYA 2ZKLA 4KL1A 1YR0A 3R95A 1ZZBA 4LLOA 5EC4A 1BO4A 1NE9A 2KCWA 2Z2SB 2Z0ZA 4P9GA 1HW5A 3LODA 2X7BA 3BB6A 4J1WA 4YNIA 1MJ9A 2H0VA 1Z9UA 2JDCA 4KWLA 1QXJA 2B58A 3S7IA 2B4DB 1EP0A 5CNPA 4EV0A 4WZCA 1N71A 1V0CA 1ZRCA 4WBBA 4K8FA 2IXKA 4MH0E 2QECA 3UY5A 2O28A 2H6CA 3D0SA 3IBMA 1RO5A 4F0YA 3DR6A 1Y7RA 2QMLA 4ZBGA 2OU2A 2GIVA 1O3QA 1XMTA 4XFAA 2BNNA 5I93A 3CEWA 4J3GA 3UKTA 4AB7A 3WW3A 4FD4A 3DKWA 2P0WA 1KUVA 3SCFA 3W91A 2IXIA 4IEXA 1YVKA 5F49A 2D93A 2GC2A 4HKFA 1CJWA 4UBHA 3NW4A 2CGPA 1Y3TA 4XPLA 4XFCA 3R96A 3S6KA 1YFUA 4F6AA 3S6HA 3R9EA 2GC3A 1M1DA 3LA2A 1S7LA 2ETEA 3CL1A 1SQHA 1QY4A 2Q4SA 5JSRA 2VXKA 2PSWA 2Z69A 3I7DA 5EZWA 1J3RA 1IIDA 4QM8A 1EPZA 3W6XA 4UA3A 2UY9A 3DSBA 2OA2A 2FQPA 1XRUA 5I0RA 3WW2A 3KGLA 4Q0PA 5I8SA 2A4NA 5KTAA 1YX0A 3E6CC 3D2PA 4ORFA 1PU9A 5JQ4A 1CAWA 3PZJA 3IWGA 2BGCA 5I8YA 2MNGA 3CXQA 3CO2A 3BCWA 4HVQA 3T9YA 1ZZCA 4HN0A 2G3AA 3N7ZA 3G8WA 5KHKA 1QSOA 4PK2A 4B5PB 4OADA 1FY7A 3DV8A 1V70A 3D8PA 3LA3A 3QOPA 3H3ZA 4LULA 5H84A 3QACA 3BJ7A 3QB8A 1PUAA 5K8SA 3U11A 4PIXA 4ONUA 5JSPA 4H6UA 3D82A 3FWEA 2QJVA 2DXQA 1G6NA 3GYAA 4HNXB 4XPDC 4I2OA 4O9GA 3GYDA 3H1YA 3WW4A 2FXFA 4OFGA 4PK3A 2UYBA 2ATRA 1L3JA 4F8AA 4FD5A 4IEVA 4QM9A 1UFHA 4L89A 4BIFA 2H5MA 2JLMA 2I00A 4MGKE 5KHIA 3TO6A 3NL1A 3F5BA 4YRHA 1OMIA 1KZFA 4GS4A 5FVJA 3TOAA 2GZWA 4FAGA 5CU1A 3FXTA 2QIRA 5BV6A 4MHDA 2XLGA 2ET7A 3H4QA 3WR7A 4BMHA 2CV6A 2CNTA 4DNCA 3H50A 4K30A 4MY0A 4PV6A 5KBFA 1YHFA 1RC6A 3IGRA 1Y9QA 2B4DA 2FSRA 2V09A 1QXRA 1RGSA 4Q0UA 4LUAA 5F47A 3RYKA 3KKWA 5I8TA 4QC6A 2HQYA 1Q2DA 4HSLA 3TO9A 4I49A 2ZCWA 4LEJA 3FX3A 1U6MA 1RL3A 5AVPA 5C6CA 1M44A 3TNQA 2Q04A 2D5FA 2UYAA 3E6BA 4IEZA 4Q0VA 5HI0A 3H9AA 2RC4A 4MI4A 4JJXA 4XPKA 3S6FA 2XLAA 4BHPA 4XF0A 4H6ZA 4CRYB 5FPZA 3FIXA 2CAUA 5KHHA 1KUXA 5DWNA 2XL7A 4E8OA 3RPQA 4EROA 1XE8A 3U0ZA 4RI1A 2Z11A 2F4PA 1O5LA 1LRZA 4IEOA 1I6XA 4IESA 3IIAA 1J58A 1PM7A 2XLFA 4KLVA 2PR1A 4MV2A 2NMTA 4L8AA 1YFXA 1Y9KA 2E9QA 1P4NA 1I5ZA 4MBUA 4YSFA 5BPXA 3TO7A 4CAXA 3BU7A 4Y49B 2MHFA 4NCZA 1O3TA 1YK3A 4KU7A 2IXHA 1QSTA 2JDDA 4X6QB 2P17A 3JVNA 3PGPA 5IX3A 1FI2A 3RZZA 4KZTA 4HN1A 4XPDB 4AQ2A 2H6BA 3C26A 2EAAA 1Z4RA 1J3PA 3U10A 4LTAA 3FHIB 3KSCA 1UIKA 3NVCA 2Q0AA 1CAXA 4AVAA 4E2QA 2VZZA 3F0AA 4KOUA 4II9A 5JAXA 1S7NA 3VHRA 4LUKA 2PRBA 4TLFA 4B5PA 4FD7A 1XEBA 1WWZA 4NXYA 3K9UA 2JEVA 4UWJA 1UPIA 4N9IA 3TE4A 4JD6A 4YYOA 4BYYA 3LOIA 3LZZA 1I21A 3VWDA 2BUEA 3MPBA 3SCHA 3O14A 1X7NA 1R57A 4KOTA 3LWCA 5E96A 3OD0A 3R1KA 4XFBA 4KOXA 3NKTA 3FJSA 3H1MA 2IXJA 5JR7B 2VPVA 1OFNA 1X8MA 5C8WA 1ZREA 1OD5A 2HUZA 3EY5A 2B4BA 4KUAA 4PIYA 4NEXA 2J8NA 3DN7A 3BLNA 2HV2A 3JUWA 2FE7A 4MY3A 2C0ZA 4I0BA 4MUVA 4MGIE 4MZUA 1O5UA 1LRHA 3FFQA 1TQ5A 1WLTA 3H7JA 3HT2A 2BYVE 4QXKA 2CAVA 4AQ6A 1GQHA 3CF6E 2R98A 2ZW5A 4PIZA 3M3IA 3MZHA 2XL9A 3IWZA 3HQXA 3RYRA 2PQQA 5IV0A 5I0UA 2AJ6A 2B5GB 2IXLA 2WC2A 4MGZE 4WVZA 2FT0A 1S7KA 2Q44A 3P2HA 4FT8A 2HJIA 1RUOA 1Q3EA 2EVNA 4HNWB 3I59A 3R9FA 3E5UA 4B5OA 1Y9WA 2P6GA 1YFWA 1YFYA 3OF1A 4QX5A 5EFUA 2BNMA 3TFYA 4F7ZA 1CAXB 2B8MA 4Q0SA 1Q2YA 2R8VA 1YGHA 2K5TA 2PAEA 3HT1A 1I1DA 3G3SA 3C3VA 4IEQA 1ZRRA 1XE7A 2OH1A 2OZUA 1DGWA 4QBJA 3E97A 2REFA 2KXLA 4Y49C 4X6RB 4YRDA 3UKVA 4IF5A 3OTFA 4O9EA 2B3VA 2ZW4A 2Q1ZB 3ELNA 1VP6A 4PJYA 1KUYA 4PSXA 5I0CA 4R87A 1YREA 1QWRA 3HIFA 1X8EA 2D5HA 4DINB 4H89A 4HMZA 2BEIA 1VR3A 1YLLA 3FZ3A 3TT2A 5KHGA 4QB9A 3JZVA 4R3LA 1ZNPA 4IEYA 4QMAA 1TIQA 2ATFA 1J1LA 3MYXA 5CVRA 4KLWA 3ZJ0A 5KTCA 3OWCA 4JLYA 1O3RA 4KOVA 4XFFA 5FCCA 1CAVB 3GBFA 3LAGA 1MJBA 4JV4A 2GANA 3KGZA 2ZW6A 4OAEA 2GAUA 2Q4YA 2EVXA 4Z82A 4QVTA 4XF4A 3ST7A 2ZW7A 1CX4A 3EO4A 5J3UA 3DNSA 3BALA 1MK4A 4ZU5A 1PMIA 2GU9A 4HBNA 4JTOA 4XFIA 1M4IA 2EUIA 3P2FA 4JXRA 4CAVA 2PC1A 5F48A 5LEJA 1B87A 2O1QA 4RD7A 3SMHA 1S3ZA 4YGOA 1L0CA 1ZZ8A 2C27A 5D1IA 1H1IA 2GC1A 3I59B 3LA7A 2P6EA 3EXNA 1QSMA 4L2NA 2J8MA 4X5KA 3EO6A 4XF1A 1ON0A 3TNPB 4I02A 5LRSA 2EA7A 1M4GA 5IB0A 2PAMA 4AVCA 3S0MA 2FS5A 2PTMA 3B8GA 1CAUB 4HZFA 2N7GA 2XKPA 1VKCA 3E5XA 3E6DA 3PLQA 1ZRFA 1UIJA 3EJKA 3FRMA 2R1IA 2QDRA 4XNHC 5FLHA 3I54A 1BOBA 4IETA 4I09A 4IEPA 4YARA 5LRRA 2FIWA 2B5GA 4MJ8A 4KORA 4QGNA 1XF8A 3FB3A 2BNOA 4MX3A 1Z4EA 1M4DA 1NYWA 1DZTA 3T90A 2GC0A 1J3QA 3DL3A 2BEOA 3ACLA 3SXNA 2Q30A 1Q5OA 3CJXA 3VWEA 1WA4A 3H1WA 4FD6A 5BUVA 2VQYA 1XIXA 4D7SA 3LD2A 4N9HA 4HLTA 3ES1A 4LA2A 3NE7A 1QSRA 2AE6A 3CXPA 2OZHA 2OZJA 3EHKA 1J59A 5DWMA 2PHLA 2UY8A 2WPWA 3QAHA 1ZX5A 3E0KA 4UBRA 3DR8A 5FQ0B 1LB2A 4BH9A 5KHJA 2D4PA 4QUSA 4U9ZA 5HH1A 2XHKA 4JTNA 1LR5A 2OPKA 4UBGA 1U12A 4FBFA 3DDDA 5BXXA 2QCSB 1IICA 2WPXA 5HMNA 1ZVFA 2PR8A 3TCVA 4U9YA 1DGRA 3PNAA 3W6SA 3GY9A 3EBRA 5FPXA 1X82A 2Q0YA 2Y0MA 2I45A 2Y0OA 3H8UA 4Q29A 4XFHA 3EC4A 5GCNA 2PA7A 2F5IA 4XF9A 4EWEA 5CADA 4PSWA 3NJZA 4CS0B 4QGMA 2VBQA 4XEZA 1CAVA 2HKXA 4CAWA 3UKNA 1WGPA 4E2GA 3TOBA 4MGYE 1O3SA 3L2HA 4HVOA 1RXTA 3S7EA 3BPZA 3PP9A 1NZCA 3RYPA 1YVOA 5EBVA 3OCPA 1CM0A 4KVME 5ISVA 1ZRDA 2J8RA 3SCGA 5FLJA 3R6SA 1GHEA 4A2UA 3D2MA 2Z10A 2ET1A 2BL1A 2CNMA 5J8CA 4I01A 4ZU7A 4IEWA 5JSOA 2OZ6A 4UXAA 3I9SA 1NXMA 2XGXA 4AXOA 4XNHB 4B29A 2P6FA 2R7HA 1CGPA 3CXSA 2QVSB 4RS2A 1NSLA 5BY5A 1MJAA 4E2AA 4OLLA 3NSTA 1FT9A 4GULA 4IEUA 1IYLA 5JPHA 4AVBA 3E5QA 5JCTA 3KCCA 4YFJA 1H1MA 1WK4A 1UW8A 4R3KA 2Q7BA 1CAUA 3S6GA 4AG7A 4FAHA 3RDIA 3PVBB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Q0QA 4NRMA 4HSJA 3I2KA 4GB31 2W87A 2WSAA 2ZEGA 5A7WA 4ZY2A 3EXUA 1OH3A 5LY1A 5A32B 5CIRA 4I0AA 4NVPA 2LRPA 5C4WA 2DVDA 5CPAA 2VD7A 5F46A 4FPFA 2OZGA 1QJX2 1IHMA 4UEEA 1UX7A 4XETA 3SJEA 2O8OA 4AVTA 2IC1A 5FY1A 1S60A 4P6YA 3LKJA 4P4DA 1LESA 3FYNA 1GR3A 4XXPA 1S2KA 4IV1C 2D3PA 4UWDA 4HG6B 1FYUA 3BHXA 3NRUA 4MCQA 2AFUA 2CYFA 4G4FA 4MXVA 2PJ9A 1AX2A 2OIIA 4UWIA 4ZZ5A 4IE7A 3VBUB 3KHXA 1HW5A 2RHPA 4LO7A 2RR11 4WZCA 1JYWA 1BPMA 1XOVA 1DGWX 5D29A 4X8IA 5FMOS 4ASMB 1O3QA 2E7TA 5DS0A 2WR9A 4J3GA 1W06A 2EALA 4LNVA 3FC0A 5GJ6A 3GB0A 1NLSA 1S0BA 1AYN2 4MFLA 2EIGA 4IE5A 1C5IA 3W6XA 3WINE 4ISQA 3CXQA 2CY6A 5JXHA 4CCJA 4H3WA 3T09A 2V8HA 5H84A 2VW1A 3DPRA 2DXQA 1F9KA 2NLRA 1UNBA 4ASKA 1UFHA 3L9JT 2P3JA 5CU1A 2QIRA 2YNDA 3NAPB 4IL7A 1XNBA 1VBB2 2QQMA 1JZ6A 2AFOA 5FJKA 3NO8A 1M44A 5HI0A 3VD7A 4HKWA 4MI4A 2ZEHA 1Q8SA 4XF0A 1JMUB 4IEOA 4R8FA 2PJ1A 2C1CA 1MVEA 5ABJC 2W52A 2ZGOA 2Q8CA 4PLNA 3ILRA 5IX3A 4ZI6A 5C7GA 3KSCA 4E4DX 1YQEA 4FD7A 1UU6A 2VNGA 2JEVA 4QQHA 1O59A 4TXWA 3U1XA 4UCMA 4Q4V3 4XUOA 3IWWA 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1NA1B
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4Q0Q A;  5J48 A;  4HSJ A;  1EY2 A;  2B5H A;  4R9M A;  5T3N A;  1YLE A;  1B6B A;  5C88 A;  4H7L A;  2VZY A;  5E16 A;  1O4T A;  1JUH A;  4HNY B;  3IDB B;  4LA3 A;  4EWA A;  3D3S A;  1LKN A;  2PAK A;  2FL4 A;  2K9Z A;  2MPF A;  1K4J A;  2VI7 A;  2PFW A;  4IUS A;  2PDO A;  4KVX A;  1J4J A;  2ARH A;  5FDB A;  2D40 A;  3FE5 A;  2FIA A;  5I0T A;  1IPK A;  3ZDS A;  3M70 A;  3G7D A;  4I0A A;  1NE6 A;  4NVP A;  1XE4 A;  2ZPA A;  2PHD A;  4KOW A;  4XFG A;  3D0J A;  5FQ0 A;  3H7Y A;  1QSN A;  1S7F A;  3FNC A;  5J8F A;  4JVA A;  1IB1 E;  3I3G A;  4KOS A;  3ZZI A;  2D4O A;  1YWK A;  2K0G A;  4LX9 A;  5F46 A;  2IL4 A;  1ZZ7 A;  4XF3 A;  4CRZ B;  1O7F A;  1SQ4 A;  2VEZ A;  3F8K A;  4I3P A;  3N4M A;  2IXC A;  3GKR A;  2CNS A;  2REE A;  1ZZ9 A;  3ES4 A;  5KTD A;  4R52 A;  4Z07 A;  2OZG A;  3B02 A;  3MGD A;  3ROU A;  5C82 A;  2XKO A;  2G3T A;  2B3U A;  2Q4V A;  1YUD A;  4L11 A;  3FBU A;  3V8I A;  4XET A;  2QNK A;  4J1X A;  2OYZ A;  4M3S A;  2VEC A;  2WFP A;  4KWK A;  2GE3 A;  2IC1 A;  1OZP A;  5H86 A;  3OGJ A; 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 1M4I A;  2EUI A;  3P2F A;  4JXR A;  4CAV A;  2PC1 A;  5F48 A;  5LEJ A;  1B87 A;  2O1Q A;  4RD7 A;  3SMH A;  1S3Z A;  4YGO A;  1L0C A;  1ZZ8 A;  2C27 A;  5D1I A;  1H1I A;  2GC1 A;  3I59 B;  3LA7 A;  2P6E A;  3EXN A;  1QSM A;  4L2N A;  2J8M A;  4X5K A;  3EO6 A;  4XF1 A;  1ON0 A;  3TNP B;  4I02 A;  5LRS A;  2EA7 A;  1M4G A;  5IB0 A;  2PAM A;  4AVC A;  3S0M A;  2FS5 A;  2PTM A;  3B8G A;  1CAU B;  4HZF A;  2N7G A;  2XKP A;  1VKC A;  3E5X A;  3E6D A;  3PLQ A;  1ZRF A;  1UIJ A;  3EJK A;  3FRM A;  2R1I A;  2QDR A;  4XNH C;  5FLH A;  3I54 A;  1BOB A;  4IET A;  4I09 A;  4IEP A;  4YAR A;  5LRR A;  2FIW A;  2B5G A;  4MJ8 A;  4KOR A;  4QGN A;  1XF8 A;  3FB3 A;  2BNO A;  4MX3 A;  1Z4E A;  1M4D A;  1NYW A;  1DZT A;  3T90 A;  2GC0 A;  1J3Q A;  3DL3 A;  2BEO A;  3ACL A;  3SXN A;  2Q30 A;  1Q5O A;  3CJX A;  3VWE A;  1WA4 A;  3H1W A;  4FD6 A;  5BUV A;  2VQY A;  1XIX A;  4D7S A;  3LD2 A;  4N9H A;  4HLT A;  3ES1 A;  4LA2 A;  3NE7 A;  1QSR A;  2AE6 A;  3CXP A;  2OZH A;  2OZJ A;  3EHK A;  1J59 A;  5DWM A;  2PHL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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