4AVAA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
332
structure length
327
Chain Sequence
DGIAELTGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 94
structure length 327
sequence length 332
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avaA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avaA02
4R87A 2CAUA 1CAWA 2XHKA 1ZRFA 2BEOA 3ES4A 3IBMA 1UD1A 2Z10A 1GQGA 1PMIA 1O5UA 4HVQA 1V70A 3F5BA 4MGIE 3EQEA 4NVPA 4WBBA 1TQ5A 3QAHA 4IERA 3JZVA 3FWEA 1Z4EA 1RTVA 2GIVA 4XFIA 4I02A 5EFUA 2MHFA 4ZU4A 4BHPA 1N71A 2JDDA 4ZBGA 5H86A 4J1WA 4XF1A 3SCGA 2Q7BA 4NEXA 3PNAA 2VQYA 3IDCB 3L2HA 4UXAA 1CAXB 1S5KA 5H84A 2QNKA 3MDPA 3IIAA 2OZHA 3VWDA 3D82A 4Q0SA 2AJ6A 2REFA 4M85A 4LUMA 3DR8A 1VHSA 2PC1A 4B5PB 4BYYA 4BH9A 3H9AA 3LZZA 4JXRA 4R3LA 4MH0E 1B6BA 5C8WA 4KLWA 5KHKA 4UA3A 1KUVA 3LAGA 2FCKA 2VBQA 2BYVE 1VJ2A 3OGJA 5KHHA 3F0AA 3TFYA 3H50A 4I3PA 2IXHA 3FRMA 3E6DA 1FI2A 3WW1A 4JJXA 2ATRA 4AXOA 2IXKA 4UWIA 4PSWA 3TT2A 1OMIA 2H0VA 3FZ3A 3HT1A 5DWNA 1X7NA 3BJ7A 3E6BA 4F6AA 1YFUA 4MY3A 1DGWA 2C27A 4PIZA 1I21A 1QSMA 4J1XA 4XNHB 1ZZBA 2P6FA 1O3SA 2D4OA 4NF1A 4HNYB 3TTHA 4PK2A 1VR3A 2ET1A 3KMHA 2K9ZA 4K30A 2O1QA 1XIXA 1XE4A 4IEXA 3NE7A 4LUKA 2DCTA 2PFWA 2BL1A 3CXQA 3S0MA 2HKXA 3MPBA 4E2SA 2Q04A 3LODA 5KHIA 4LLOA 4XNHC 4RS2A 1FT9A 2H6BA 3S6GA 3WW2A 1ZRCA 2KCWA 4Q0QA 5JCTA 3IWGA 4R57A 1YVOA 1CAVA 3GKRA 3FFQA 3JUWA 5F49A 3UKTA 3H7YA 1OI6A 2CAVA 3IGRA 4KVXA 3G8WA 1DGRA 3CF6E 4GULA 1CX4A 3E5XA 4XEZA 5CVRA 4IEOA 4KZTA 3ELNA 4KOYA 4XFBA 4PSXA 4U9YA 1SQHA 3W91A 5C82A 1O3RA 3D2PA 2MPFA 4Y49B 3KGZA 1YVKA 1Y9QA 4QGMA 5BPXA 1IB1E 3EXNA 1TIQA 4YFJA 2OZUA 4Q0VA 5FLJA 1I12A 3HT2A 4RD7A 2Q30A 4Q0PA 2ZW4A 1NE9A 3PZJA 2B5GB 4IEZA 4IEWA 4FD4A 2BGCA 4E8OA 1M4DA 4Y49C 4WZCA 1WGPA 2B5HA 5E16A 5I91A 1EPZA 4L8AA 3RYRA 3KCCA 3M70A 4L89A 3DL3A 3PVBB 2X7BA 2BNNA 4I09A 3ZDSA 2G3TA 4CYDA 1S7LA 3H7JA 2PRBA 4H89A 4LA2A 4FAHA 3DN7A 5KTAA 3W6SA 4AVBA 3EHKA 1UCXA 5I8TA 5F47A 2IL4A 2Z0ZA 2O8QA 4MJ8A 2Q4SA 4XPDC 4E2GA 4N9HA 1IPJA 2FS5A 1Q5OA 2PYTA 2Q4YA 4XF0A 2QMLA 4QM9A 1PU9A 3EO4A 2HJIA 4X6RB 2PSWA 4KORA 4R3KA 4KUAA 3RNSA 2FL4A 2J8MA 1Q2DA 3PGPA 3RPQA 2ZW5A 3SHPA 4CS0B 3S6KA 1H1MA 4IEUA 1XEBA 4MX3A 4F7ZA 5KHJA 3B8GA 4L11A 1CAXA 1S60A 5I0CA 3PLQA 3R9GA 1Z9UA 3CLPA 4IEYA 4H6UA 4MZUA 1UIKA 3G7DA 4LA3A 2ETEA 5JSPA 4CRYB 2GC0A 4KUBA 4AG7A 4BMHA 3HQXA 3TOBA 2VI7A 1LRZA 4QGLA 1QSNA 4B5PA 2OZ6A 3D8PA 4HLTA 1MJAA 2B8MA 3LOIA 3RYOA 3DSBA 4AG9A 3T90A 4HVRA 4KOTA 3O14A 4DINB 4MY0A 3BLNA 4KOUA 5EC4A 4I0BA 5HI0A 5FQ0B 3E0KA 4WVZA 3TNPB 3N4MA 2FSRA 3BJ8A 3H4QA 1J59A 3WW4A 2R8VA 3GYAA 1QSOA 3UKVA 4U9ZA 4AB7A 5FLHA 1O7FA 4CAVA 2P17A 1MJBA 4O9GA 1I1DA 3OTFA 3CO2A 1Q2YA 2JLMA 5J7MA 3DNSA 5F1RA 4R9MA 2VXKA 2PAEA 3H8UA 5JAXA 4AVAA 2V09A 2HUZA 3R9FA 2GH2A 1XE7A 4HMZA 2VZZA 3D0JA 4NXYA 4JTNA 4TLFA 2MNGA 3R1KA 2PR8A 3S6HA 3RYKA 4AQ2A 5JSRA 2OA2A 1YR0A 2EVXA 2VPVA 3I7DA 2OPKA 3GBFA 4QGNA 1UW8A 3BPZA 4ZU7A 1RUOA 3I9SA 1L3JA 3BCWA 3NL1A 5E1RA 2EUIA 4FD7A 4NCZA 5BUVA 3FB3A 3W6XA 1S7NA 1CJWA 1U6MA 1IYLA 5HH1A 4L2NA 1I6XA 1YLEA 3D3SA 4PJYA 2ZW7A 2IXCA 2PR1A 2GANA 4JXQA 3KGLA 4MV2A 2OYZA 4IF5A 2H5MA 1JUHA 3NW4A 2XLGA 4HSJA 4I0AA 4XFHA 4CRZB 2QIRA 1MK4A 3OD0A 4E2AA 2FMYA 1RUNA 4LX9A 2EAAA 4LEJA 3TOAA 3TNQA 2G3AA 5C88A 3I3GA 1O3QA 3LWCA 3P2FA 1ZZ9A 4HSLA 2XLAA 2R98A 2D93A 3EC4A 5AVPA 1IIDA 3KKWA 3OWCA 2GC3A 1M4GA 1LR5A 2B5GA 3GY9A 2D40A 2Z2SB 1IPKA 4EV0A 1ZVFA 5D1IA 1J1LA 2WFPA 1NMTA 3FBUA 1CGPA 1ZZ6A 4XF4A 3C3VA 4EWEA 5J48A 2A4NA 5HMNA 2GZWA 4D7TA 3EBRA 2VEZA 3TO7A 4F0YA 2WPWA 1CM0A 3RZZA 1YFYA 3SXOA 5BY5A 4QXKA 4PK3A 2I45A 5J8FA 3U10A 2EVNA 2CGPA 3PP9A 3D2MA 3DDDA 3K9UA 2CY2A 2BUEA 2C0ZA 1SFNA 4M3SA 4R8HA 3BU7A 3H1MA 5FDBA 3FYNA 4IUSA 3EO6A 4ONUA 2GC2A 3LA2A 1J3RA 4FBFA 2CNSA 4MI4A 4XPKA 1FXZA 2Q0AA 4YYOA 4KWLA 2VZYA 4EVYA 2KXLA 1S7KA 2JEVA 1OZPA 3LA7A 2PDOA 2XKOA 1NE4A 4UBRA 2QJVA 3EFAA 5IV0A 3OF1A 5I0TA 4D7SA 3GYDA 5LRSA 4PIXA 4XPDB 3V8IA 4IETA 4QBJA 1DZRA 4MBUA 4OADA 3TCVA 5F46A 1UIJA 4B29A 3MGDA 4MHDA 2I00A 2XL7A 3FXTA 1P0HA 4XFFA 2B4DA 1KUYA 3QB8A 2VQAA 4JVAA 4PIYA 1P4NA 2WPXA 1WWZA 4U5YA 1EYBA 3NKTA 3RDIA 1RC6A 4QX5A 5CADA 3ES1A 4CAXA 4CAWA 4ZU5A 5I0SA 1ZZ8A 3WR7A 1QXJA 4XF3A 3FHIB 5FQ0A 1LKNA 2PAKA 1ON0A 1U12A 1XE8A 1R57A 2B58A 2I79A 3OCPA 2ZW6A 4HNXB 4P9GA 3F8KA 3I59B 1ZX5A 4X6QB 1YWKA 3DV8A 3FJSA 3H3ZA 3SCFA 4QM8A 2B3VA 1IICA 1UPIA 2D4PA 2Q4VA 4LULA 4Q0UA 3D0SA 3R6SA 1LB2A 1LRHA 4RI1A 1S7FA 2P0WA 4J3GA 1Q3EA 4JV4A 2UY8A 4JLYA 3CEWA 5IB0A 1M1DA 2B4DB 3IDBB 1YUDA 4N9IA 4UBGA 1OD5A 1Y9KA 3E97A 1Y3TA 1ZRRA 3S7EA 5FPXA 3CXSA 1M44A 2B4BA 5T3NA 3KSCA 1J3PA 5FLIA 2BNOA 4QUSA 2F4PA 1WA4A 3NVCA 4K8FA 4Z07A 3EY5A 2RC4A 1I5ZA 4IEQA 1WK4A 4HZFA 1ZNPA 3QOPA 4JWPA 5DWMA 4JTOA 3SMHA 1WLTA 1PUAA 2GE3A 4IEVA 3S6FA 1XF8A 2ZXVA 5F48A 1J3QA 4EWAA 2J8NA 2K5TA 2R1IA 1BO4A 1Q2CA 4KOXA 2BEIA 2F5IA 2B9UA 2ZPAA 1J4JA 2QVSB 1M4IA 3BB6A 5I8SA 1Y7RA 3BALA 1CAUB 3USSA 4JD6A 3TO9A 5FPZA 3R96A 1O4TA 2Q1ZB 2VECA 1H1IA 3HIFA 4HBNA 4FAGA 3FX3A 1GHEA 2FE7A 2PAMA 3FNCA 1X82A 4PV6A 4X5KA 3ACLA 4YARA 3E5UA 4E0AA 2UYBA 3ZZIA 3EJKA 2H6CA 2CNMA 5I8YA 4KWJA 2PHDA 3SCHA 1QWRA 3WW3A 1VKCA 4HN0A 2OZGA 1RXTA 2QDRA 4EWDA 4KOSA 4FD6A 1XRUA 1S3ZA 2PHLA 2PQQA 5FCCA 5KHGA 1Y9WA 1RO5A 2FT0A 3DR6A 5FVJA 2IXIA 3CXPA 1GQHA 4B5OA 1FY7A 1CAWB 2J8RA 3I54A 4MUVA 3U11A 4HN1A 4QC6A 2XLFA 1Z4RA 1DZTA 2PTMA 4EROA 4I2OA 1K4JA 1YREA 2ARHA 5K8SA 2Y0MA 1YFWA 3JVNA 5I0UA 2IXLA 3IWZA 2WC2A 1OFNA 3SHRA 1V0CA 4YSFA 1O5LA 4KL1A 3H3UA 4KU8A 3MZHA 4HVOA 3H1YA 2D5HA 1NE6A 1YLLA 2IXJA 3VHRA 5KBFA 3FIXA 3TE4A 1VP6A 2UYAA 4FT8A 5J3UA 2Z69A 4ORFA 2GU9A 5EZWA 2FXFA 2QECA 4A2UA 4QMAA 4AVCA 4KLVA 2P6GA 2NMTA 1YHFA 3S7IA 4I49A 3T9YA 2UY9A 4H7LA 2O28A 4KVME 3UKNA 3ROUA 3NSTA 3U0ZA 3QACA 4I01A 1ZRDA 2OB0A 3ZJ0A 2CV6A 5LEKA 1KUXA 1YX0A 3VWEA 2HQYA 4LUAA 2Y0OA 4YNIA 4YRDA 3FE5A 4OLLA 1NYWA 1J58A 2PA7A 4XPLA 3I59A 2Q44A 5ISVA 3SXNA 4NSQA 4QVTA 2OZJA 4F8AA 4KVOE 2XKPA 4UBHA 2FIAA 4AQ6A 1X8MA 3MYXA 3R95A 1QXRA 2BSWA 2B3UA 5KTDA 1SQ4A 1YK3A 2FQPA 1BOBA 5J8CA 5KTCA 4XFCA 3M3IA 2D5FA 5EBVA 5E96A 2OH1A 4Z82A 4KOVA 2OU2A 4KOWA 4QB9A 1NXMA 2ZCWA 5BV6A 1NZCA 4H6ZA 5LRRA 1QSTA 2ATFA 5I0RA 2GAUA 3C26A 4HNWB 5JPHA 4HKFA 2P6EA 1YFXA 5CNPA 3G3SA 1Q43A 3TO6A 4GS4A 3ST7A 4IEPA 4R52A 1KZFA 4KU7A 5JR7B 2N7GA 1XMTA 2FIWA 1RL3A 2BNMA 3CJXA 3LA3A 5GCNA 1CAVB 4LTAA 4XF9A 3CL1A 5LEJA 4YGOA 1HW5A 4II9A 4MGYE 2ET7A 3E5QA 5BXXA 1O3TA 1L0CA 1UFHA 1PM7A 2R7HA 2EA7A 4OFGA 1YGHA 3UY5A 5I93A 1MJ9A 3R9EA 1ZREA 4BIFA 2G0BA 4E2QA 4MGKE 3DKWA 5JQ4A 3H1WA 1QSRA 1ZZ7A 4UWJA 4FD5A 3NJZA 1SEFA 1CAUA 1IYKA 4IESA 4YRHA 2XGXA 3B02A 3E6CC 2IC1A 2AE6A 2JDCA 5JSOA 2HV2A 1EP0A 3RYPA 4DNCA 1ZZCA 2REEA 3SXWA 2PQ8A 1NSLA 5C6CA 4OAEA 3N7ZA 3P2HA 2XL9A 4XFAA 2E9QA 1RGSA 4XETA 2K0GA 3ETQA 2DXQA 4XFGA 2CNTA 1G6NA 4KWKA 2Z11A 4MGZE 4META 1B87A 2QCSB 1EY2A 2GC1A 3LD2A 2Q0YA 4Q29A 4O9EA 1QY4A 1X8EA 5IX3A 2ZKLA 5CU1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GQGA 3IAPA 2MHFA 1N71A 1ND2B 5ABJA 3IDCB 2A73B 5H84A 2QNKA 3KCYA 3VD7A 1PVC3 1VHSA 4JXRA 5C8WA 1BAVA 1GWLA 1OVPA 1WW6A 3SEPA 3NMBA 5E8AA 1RUG2 2ZMLA 4A95A 2P3IA 5T50A 4E9KA 4AHXA 4OCTA 3N9LA 2GSYA 4MVTA 2H6BA 3D7HA 1LGNA 1DYKA 5A1LA 4NGSA 4DXRA 2XB6C 6CPAA 1DGRA 2DEAA 1PIV2 1YVKA 5FIXA 1Y9QA 1LU1A 1AHSA 2VO5A 1HJGA 3OBRA 2XVKA 1XYPA 4LOSA 1VAKA 4FTSA 4L92A 4LQGA 4V1PA 2B5GB 4NWWA 4Z92B 1FMD2 1RXGA 2B5HA 2O14A 4EJRA 3KCCA 4L89A 1PVC1 4CYDA 2JEMA 1PGL1 1IPJA 3CZJA 1PU9A 3RMYA 2ZGPA 1JXNA 1W0PA 2FZ2A 1CAXA 3PLQA 2VOTA 1ND3C 4LMFA 4AG9A 4QPIA 2ABZA 3VBFC 3K2OA 5HI0A 4OC1A 3DPRA 1GWMA 2Q8CA 1W39A 2OT7A 5CFDA 3DXTA 3I3MA 2GH2A 4HMZA 4YVSB 4FUUA 4CAVA 4AQ2A 5JSRA 3FBYA 5FYCA 3GBFA 3SH5A 3NNMA 4DYOA 1WW4A 4L2NA 2DF5A 4PJYA 4YPJA 1OBRA 4XC9A 1UF2C 2RJLA 3EC4A 4ES8A 2D40A 3WHTA 1QQP3 5J48A 4HKWA 4CEYC 3NWKA 3C7EA 3OB8A 2C0ZA 1SFNA 4B13A 3ZSJA 1LAPA 4CDUB 3FYNA 4OIWA 4KWLA 4EVYA 4UBRA 2QJVA 1N47A 5I0TA 4XPDB 3UJOA 5H9SA 1HX6A 4B29A 4MHDA 2VNVA 2XL7A 4GWIA 2R073 3QB8A 2VQAA 2XVGA 3V0AA 4ZU5A 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1SBFA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4R87 A;  2CAU A;  1CAW A;  2XHK A;  1ZRF A;  2BEO A;  3ES4 A;  3IBM A;  1UD1 A;  2Z10 A;  1GQG A;  1PMI A;  1O5U A;  4HVQ A;  1V70 A;  3F5B A;  4MGI E;  3EQE A;  4NVP A;  4WBB A;  1TQ5 A;  3QAH A;  4IER A;  3JZV A;  3FWE A;  1Z4E A;  1RTV A;  2GIV A;  4XFI A;  4I02 A;  5EFU A;  2MHF A;  4ZU4 A;  4BHP A;  1N71 A;  2JDD A;  4ZBG A;  5H86 A;  4J1W A;  4XF1 A;  3SCG A;  2Q7B A;  4NEX A;  3PNA A;  2VQY A;  3IDC B;  3L2H A;  4UXA A;  1CAX B;  1S5K A;  5H84 A;  2QNK A;  3MDP A;  3IIA A;  2OZH A;  3VWD A;  3D82 A;  4Q0S A;  2AJ6 A;  2REF A;  4M85 A;  4LUM A;  3DR8 A;  1VHS A;  2PC1 A;  4B5P B;  4BYY A;  4BH9 A;  3H9A A;  3LZZ A;  4JXR A;  4R3L A;  4MH0 E;  1B6B A;  5C8W A;  4KLW A;  5KHK A;  4UA3 A;  1KUV A;  3LAG A;  2FCK A;  2VBQ A;  2BYV E;  1VJ2 A;  3OGJ A;  5KHH A;  3F0A A;  3TFY A;  3H50 A;  4I3P A;  2IXH A;  3FRM A;  3E6D A;  1FI2 A;  3WW1 A;  4JJX A;  2ATR A;  4AXO A;  2IXK A;  4UWI A;  4PSW A;  3TT2 A;  1OMI A;  2H0V A;  3FZ3 A;  3HT1 A;  5DWN A;  1X7N A;  3BJ7 A;  3E6B A;  4F6A A;  1YFU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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