4AVBA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 in complex with acetyl coa and camp
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
GARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSARVPSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
total genus 90
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avbA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avbA02
3S6KA 2OYZA 3SXNA 1ZRCA 2CY2A 3L2HA 2Q30A 4HLTA 2PR1A 5AVPA 4U9YA 3N7ZA 4CAVA 4FD4A 3LODA 1MK4A 1TIQA 4I01A 3EC4A 5IV0A 4WVZA 1RL3A 5I0UA 3FXTA 1ZREA 1YHFA 2WPXA 4II9A 4KU7A 3BJ8A 1CAUB 1DGWA 4JJXA 4R87A 1DGRA 4PV6A 3D2MA 4OAEA 4YSFA 4R52A 1ZZ7A 1XE8A 2ETEA 3S0MA 4R57A 4L2NA 4FD7A 4RI1A 3ST7A 3UKTA 2CAVA 1GQHA 3PZJA 2I45A 1H1MA 1OMIA 5J3UA 1P0HA 3HT2A 3DSBA 3T90A 1YGHA 1YLEA 3GY9A 5I8YA 3SXWA 4O9EA 1QSOA 4NCZA 2BEIA 2MNGA 1RUNA 2B58A 1J1LA 1O7FA 4JLYA 3WW3A 1RTVA 2BSWA 3S7IA 5CU1A 4M3SA 2Z2SB 2P6EA 3RDIA 4K8FA 4H7LA 1QY4A 2PAEA 3ETQA 3LZZA 5FLJA 2PAMA 1X8MA 1GHEA 4KVOE 2XL7A 1VR3A 3TOAA 3JVNA 3OTFA 2I00A 2VECA 1QXJA 3GYDA 3P2FA 3S6HA 3WR7A 4KL1A 1R57A 4XNHB 3DKWA 3SCFA 2OZGA 1ZRFA 2QIRA 4QBJA 1O3RA 4K30A 4XFHA 3RYPA 4DINB 5BUVA 2AE6A 3BCWA 1FY7A 1PMIA 3B02A 1WK4A 1Q2CA 2OZHA 3QB8A 2K5TA 1ZVFA 4KU8A 5I8TA 3E6CC 4HNXB 1XRUA 4QM8A 4I3PA 4HVOA 4QC6A 4J1XA 5I0TA 4XF9A 1EPZA 2HUZA 3CXQA 3LA7A 3HIFA 3TT2A 4IEYA 3UKNA 5H84A 3MPBA 2FE7A 4CS0B 3F0AA 2PYTA 3HT1A 2QCSB 3LA2A 3D8PA 2BNOA 3FIXA 2Q44A 3R9GA 2EVNA 2GZWA 4UWJA 1S5KA 2OB0A 4EV0A 1G6NA 3C3VA 4B5PB 2QJVA 1VP6A 3SCHA 5JSRA 1I1DA 1SQHA 2B4DA 2PQ8A 5FCCA 3H7JA 2VZYA 3E5QA 1NZCA 1YREA 3FWEA 1S60A 1RUOA 4EWDA 4HKFA 4R3LA 1IPKA 5LEJA 4XF0A 1MJAA 4YNIA 4EWEA 3IWZA 1I5ZA 5KHGA 4Y49C 5HH1A 1EP0A 4PIZA 3CXSA 3CLPA 1LB2A 2FIAA 2CAUA 3IBMA 2Q1ZB 4BIFA 1NSLA 3E5XA 3EBRA 5F46A 1QSTA 3PNAA 3TNQA 2Q4VA 4MGIE 5HI0A 3LD2A 2VZZA 4IEQA 1NYWA 3OWCA 4FD6A 3I59B 3UY5A 2B4BA 3D2PA 1XIXA 4B5OA 2WC2A 1KUXA 2PR8A 2Q4SA 2GC3A 5ISVA 4XF4A 2O8QA 1CAUA 3TOBA 2B5GB 2D4OA 2IC1A 4JD6A 5JPHA 1YVKA 2Y0OA 4AG7A 5HMNA 1U12A 3MGDA 2GC0A 2IXJA 2H6BA 3FE5A 1O3TA 2FSRA 4IEZA 1YUDA 2ZCWA 2CNSA 1IIDA 3CF6E 4I49A 4HSJA 3EQEA 1NMTA 1YK3A 2ET7A 2XHKA 3QOPA 4ONUA 2ET1A 4XFIA 3TNPB 4NF1A 3MDPA 3CL1A 2PDOA 3CEWA 2PSWA 2ZKLA 1X8EA 4XFFA 4GS4A 3D0JA 5I93A 4XNHC 3ZJ0A 4UXAA 4KORA 3BU7A 4I02A 4LULA 3IDBB 4KOXA 4AG9A 3E6BA 1S7NA 1YX0A 3SCGA 3EJKA 4Z82A 2NMTA 3U10A 3D3SA 4MHDA 3O14A 2P17A 3BJ7A 2GAUA 1ZZCA 1M4DA 4PSXA 1ZZ6A 2ARHA 3I3GA 3TFYA 1B6BA 1I6XA 3H8UA 2G3TA 2PFWA 3FB3A 3MZHA 3ZDSA 4CAWA 3OGJA 4RD7A 1Q2DA 3R1KA 3NJZA 4JWPA 4UWIA 2OZJA 3R9EA 3KKWA 1V70A 1FT9A 2GU9A 1X82A 2O28A 4O9GA 3I9SA 4QVTA 2FMYA 2VXKA 4I09A 1GQGA 1PU9A 1S7LA 1RC6A 4CRZB 1LKNA 2Q4YA 4I2OA 4QGNA 3ROUA 1O3SA 2PQQA 2H6CA 3WW4A 4BH9A 3DR8A 5I8SA 4KOVA 2XGXA 5C8WA 1Z9UA 4Y49B 2Q7BA 2GH2A 5BXXA 4QMAA 4EROA 3R96A 4RS2A 4UBHA 4MV2A 2REEA 2IXKA 3WW2A 5KHIA 2Z69A 4IERA 4MY0A 1J59A 2QVSB 2BEOA 2Q0YA 2VPVA 3FJSA 5FLIA 4F7ZA 3NE7A 4B5PA 5KHKA 4OFGA 3G3SA 4NEXA 4YFJA 4AQ6A 2BNMA 3EXNA 3FFQA 3FZ3A 3KCCA 2REFA 3H1YA 1WGPA 2OU2A 2FQPA 3GKRA 2BL1A 2QDRA 1LR5A 4JV4A 1DZTA 4WZCA 3RNSA 1HW5A 2UYBA 1M4IA 4GULA 2A4NA 2R1IA 2BNNA 4HN1A 4H6ZA 4L8AA 4B29A 1Q3EA 4PIXA 3E97A 3EFAA 3JZVA 4CAXA 1XE4A 1Y9KA 2K0GA 4KOSA 3H50A 5I0RA 4KLVA 1ZZBA 3DNSA 1XEBA 4F6AA 4HBNA 1ZZ9A 2IXIA 2PHDA 4LA3A 2B5GA 1SEFA 4FD5A 3D0SA 1L0CA 1M1DA 4D7SA 1O3QA 2C27A 2EVXA 3PP9A 5EFUA 3CO2A 4I0BA 3VHRA 4HNYB 4MH0E 5F47A 4AXOA 4N9IA 4AQ2A 3IGRA 3SHPA 3TO6A 3S7EA 2I79A 1IYKA 3R9FA 1Q5OA 1FXZA 2ZPAA 4AVBA 2Q0AA 3ES1A 1M4GA 4F8AA 1I12A 1LRZA 3QAHA 2XKPA 4LUAA 3TE4A 1LRHA 2VEZA 5E16A 4E2AA 4MBUA 2O1QA 3EO6A 3I7DA 1YWKA 2OZ6A 1YR0A 2BUEA 3P2HA 4R3KA 3H3UA 1O4TA 5CVRA 1ZRRA 2XLGA 5J8FA 1FI2A 3W6XA 4IEOA 5EBVA 2JLMA 2KCWA 1DZRA 3H9AA 2JDDA 2GANA 4XEZA 2B9UA 5F49A 3NKTA 3I54A 1XMTA 3E5UA 2K9ZA 4QB9A 1CJWA 4KOUA 5IB0A 5KTDA 2CNMA 3CXPA 1XE7A 1EY2A 2GC1A 5BPXA 1NE9A 2QECA 2F5IA 1CAVB 4IEWA 3RPQA 2X7BA 4HVQA 5F1RA 2Z10A 2MPFA 2G3AA 1MJBA 3FNCA 4YYOA 3KSCA 4JTOA 5LEKA 3C26A 2HJIA 2D5HA 2Z11A 2GIVA 3SXOA 4X5KA 5FPZA 4KOYA 4ZU4A 3SMHA 2IXCA 3RYRA 2EAAA 3VWEA 1ZX5A 4YRDA 2FL4A 4QGLA 4XPDC 1OZPA 4M85A 2GC2A 3NVCA 2PHLA 3BB6A 2D5FA 1NE6A 2AJ6A 2UY9A 3H4QA 1OI6A 2J8MA 4UBRA 2N7GA 2QNKA 4YARA 1V0CA 2JEVA 1QSNA 3DR6A 4IF5A 4KVXA 4EVYA 3IWGA 4UBGA 1J58A 1ZNPA 1RO5A 4BYYA 3FYNA 1Z4RA 2G0BA 1YFWA 2H5MA 5FDBA 1YFXA 3H7YA 1IB1E 3WW1A 2VQYA 3R6SA 1CAWB 5E96A 5BY5A 1XF8A 1YVOA 2ATRA 4TLFA 1UCXA 2ATFA 4LX9A 1QSRA 1KUYA 4YRHA 4LUKA 4XFCA 1Q43A 1IPJA 4HSLA 5KBFA 3ZZIA 2OH1A 4XETA 3QACA 2C0ZA 3JUWA 1YLLA 1WA4A 5JQ4A 2PAKA 5C6CA 4OLLA 1Z4EA 5FLHA 3S6GA 1RXTA 2PA7A 4LTAA 2PC1A 4XFBA 5DWMA 4XF1A 1Y9QA 3U11A 5CADA 5KHJA 1S7FA 4U9ZA 2ZW5A 3H1WA 4ZU5A 3OD0A 5E1RA 2JDCA 1NXMA 4X6QB 2PTMA 3LA3A 2D93A 4IEPA 4ORFA 1Y7RA 4JXQA 4JTNA 5FQ0B 4KUBA 4JVAA 3TO9A 5J48A 3HQXA 1PM7A 2BYVE 2CNTA 1VKCA 2B5HA 2DXQA 4LUMA 4XPKA 1QXRA 4NVPA 4E8OA 2ZW7A 4LEJA 2RC4A 1SQ4A 3EHKA 1MJ9A 1Y3TA 2UY8A 3ELNA 3PLQA 4IETA 2D40A 4XF3A 4XFAA 5JR7B 1BOBA 4OADA 4MX3A 4UA3A 3N4MA 2P0WA 2WFPA 4IEUA 2FXFA 4FAGA 1QSMA 5H86A 4E2QA 4PSWA 1K4JA 5K8SA 4NSQA 4L11A 2VQAA 4XPDB 1J4JA 5EC4A 4R8HA 3IIAA 5GCNA 1ON0A 1CAVA 2HKXA 1ZZ8A 4KZTA 4NXYA 4DNCA 3U0ZA 2CGPA 1TQ5A 3I59A 3EO4A 4I0AA 2XKOA 2DCTA 1CX4A 3FX3A 4QX5A 3OCPA 1O5UA 4Q0PA 1UIJA 4KWJA 2EA7A 3FHIB 4MUVA 2KXLA 3RYKA 3DN7A 4FBFA 5JSOA 2MHFA 5I91A 1CM0A 3H1MA 4U5YA 4XFGA 3E0KA 3R95A 3M3IA 3UKVA 2J8NA 4QUSA 1UPIA 3K9UA 4QGMA 3W6SA 4AVCA 5BV6A 1CAXB 3KGLA 2FS5A 4IUSA 4AB7A 1B87A 4KVME 3G8WA 5EZWA 4EWAA 3IDCB 4LA2A 4A2UA 4MGYE 1UW8A 3S6FA 1H1IA 3KGZA 4N9HA 2R98A 3NL1A 2IL4A 2Y0MA 4J1WA 4PK3A 4F0YA 1CAWA 2B8MA 4QXKA 4CYDA 2F4PA 2OA2A 3NSTA 2P6FA 2XL9A 4MGKE 2OPKA 4HVRA 5CNPA 4META 3ES4A 1S3ZA 4MI4A 5FVJA 2WPWA 5I0SA 3GYAA 4E0AA 4H89A 4Q0UA 2QMLA 4HNWB 1YFUA 2UYAA 2R8VA 4XPLA 4Q0SA 4PJYA 3ACLA 4BHPA 3V8IA 4KOTA 4ZBGA 2FT0A 3W91A 4FAHA 3F8KA 3FBUA 2B3UA 1KUVA 5DWNA 3G7DA 5C82A 3LWCA 1O5LA 5IX3A 4PIYA 2OZUA 2BGCA 3BPZA 4KLWA 1S7KA 3BALA 3DL3A 2HV2A 5KTCA 3TO7A 2GE3A 4Q0VA 1UD1A 3LOIA 4HMZA 5KTAA 1IYLA 5FQ0A 1L3JA 3TCVA 5J7MA 5C88A 2H0VA 1YFYA 4D7TA 1UFHA 2IXLA 2XLFA 2CV6A 4KWLA 5T3NA 1SFNA 1UIKA 3RYOA 1QWRA 4LLOA 3TTHA 1BO4A 4FT8A 4Z07A 4ZU7A 2XLAA 2B3VA 5F48A 3PVBB 1OFNA 4KOWA 4HN0A 1VJ2A 2ZXVA 1CGPA 1P4NA 3T9YA 4E2SA 3D82A 2IXHA 1RGSA 2ZW4A 5J8CA 2P6GA 1U6MA 2EUIA 3E6DA 1OD5A 4KWKA 1PUAA 3OF1A 1N71A 2HQYA 1X7NA 2V09A 4IEXA 5KHHA 2J8RA 4YGOA 3M70A 2R7HA 4X6RB 4Q0QA 2E9QA 2D4PA 2FIWA 3B8GA 5I0CA 4HZFA 4IEVA 1Q2YA 4AVAA 3NW4A 4MZUA 3F5BA 4P9GA 4QM9A 3RZZA 4J3GA 1J3QA 1M44A 2PRBA 4PK2A 5JAXA 3SHRA 4Q29A 1KZFA 2VBQA 1J3RA 1J3PA 5JSPA 4KUAA 3USSA 4MY3A 1IICA 3BLNA 3DV8A 3VWDA 4MJ8A 5LRRA 1Y9WA 3KMHA 2ZW6A 1NE4A 4H6UA 4JXRA 3MYXA 1I21A 1WWZA 5LRSA 1CAXA 3LAGA 2Z0ZA 1JUHA 4L89A 3PGPA 3DDDA 2B4DB 4CRYB 3FRMA 2Q04A 2VI7A 5D1IA 3CJXA 1ZRDA 3GBFA 1EYBA 4E2GA 2FCKA 3EY5A 1VHSA 4R9MA 4MGZE 3H3ZA 4WBBA 4BMHA 5JCTA 1WLTA 5FPXA 4IESA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FUOA 4NIGA 4O61A 4BXSV 3AVSA 4AE2A 3UGFA 3BXMA 1RL3A 4OMDA 4EN6B 2XOMA 1C5HA 3ISZA 3HQUA 4XQDA 4QHOA 3GLJA 4RI1A 4FD7A 2VTXA 1P0HA 4X2TA 1W39A 2AYHA 3DSBA 2A3YA 5F3IA 5LA1A 5EJ1B 5DZEA 2VMHA 4K8FA 3LZZA 3SC7X 4YW1A 3KR5A 3GYDA 5F8PA 4UYBA 3RYPA 4LO8A 5A3LA 4XVHA 4HNXB 4QM8A 5FMOL 3UKNA 1DTDA 1UU6A 1TKJA 5JXIA 5A32B 2VZYA 2YNCC 4CDXC 1YJLA 2BBAA 3AL5A 3MUY1 3WQ1A 2W2IA 2WDBA 3ZYHA 2Q1ZB 4MGSA 3PB4X 4CCEA 2PJ1A 2WZNA 1WMDA 5JPMB 4OHXA 5IVVA 3CZXA 4HL0A 2IC1A 3FHAA 5DZGA 4S2FA 3IZOA 1YNAA 5C3PA 1VB2A 3AMNA 1NMTA 4Z65A 4EWTA 4UCMA 2NP0A 3C7EA 2VU9A 4AHWA 4C1WA 2RJLA 1MS9A 4E4DX 5J96B 1WCQA 4Q4Y1 2E63A 3JRUA 5JGFA 2LW8A 1QNYA 3FMCA 3ZSJA 5AFEA 4QVTA 4ISQA 1F2OA 4FUUA 4OADA 2PQQA 1ENSA 2WABA 1JS9A 1UO9A 4BM8A 4YVSA 4B5PA 1OHFA 2VTXJ 2I3CA 2F7VA 4HN1A 2VUCA 5CZKA 4M6IA 3PB6X 4LQRA 4FD5A 3IPVA 4LK7A 4RR3A 1HRI2 4CUBA 4DOUA 4HNYB 1UY3A 2O4HA 3EYPA 1U0AA 2VE1A 1SFYA 2VEZA 4B4PA 1G8WA 3KV5A 3N7KA 4ASKA 4FFGA 2KCWA 1BPNA 1RUF2 3I54A 3DPRB 4R9DA 3E5UA 4UCPA 4QB9A 2ARBA 4QWNA 2JG9B 3W5NA 1E57A 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3N7LA
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3S6K A;  2OYZ A;  3SXN A;  1ZRC A;  2CY2 A;  3L2H A;  2Q30 A;  4HLT A;  2PR1 A;  5AVP A;  4U9Y A;  3N7Z A;  4CAV A;  4FD4 A;  3LOD A;  1MK4 A;  1TIQ A;  4I01 A;  3EC4 A;  5IV0 A;  4WVZ A;  1RL3 A;  5I0U A;  3FXT A;  1ZRE A;  1YHF A;  2WPX A;  4II9 A;  4KU7 A;  3BJ8 A;  1CAU B;  1DGW A;  4JJX A;  4R87 A;  1DGR A;  4PV6 A;  3D2M A;  4OAE A;  4YSF A;  4R52 A;  1ZZ7 A;  1XE8 A;  2ETE A;  3S0M A;  4R57 A;  4L2N A;  4FD7 A;  4RI1 A;  3ST7 A;  3UKT A;  2CAV A;  1GQH A;  3PZJ A;  2I45 A;  1H1M A;  1OMI A;  5J3U A;  1P0H A;  3HT2 A;  3DSB A;  3T90 A;  1YGH A;  1YLE A;  3GY9 A;  5I8Y A;  3SXW A;  4O9E A;  1QSO A;  4NCZ A;  2BEI A;  2MNG A;  1RUN A;  2B58 A;  1J1L A;  1O7F A;  4JLY A;  3WW3 A;  1RTV A;  2BSW A;  3S7I A;  5CU1 A;  4M3S A;  2Z2S B;  2P6E A;  3RDI A;  4K8F A;  4H7L A;  1QY4 A;  2PAE A;  3ETQ A;  3LZZ A;  5FLJ A;  2PAM A;  1X8M A;  1GHE A;  4KVO E;  2XL7 A;  1VR3 A;  3TOA A;  3JVN A;  3OTF A;  2I00 A;  2VEC A;  1QXJ A;  3GYD A;  3P2F A;  3S6H A;  3WR7 A;  4KL1 A;  1R57 A;  4XNH B;  3DKW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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