4AVBA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 in complex with acetyl coa and camp
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
GARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSARVPSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
total genus 90
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avbA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avbA02
4XFIA 1Q3EA 2GZWA 1ZRFA 5IX3A 3BPZA 1CAWB 2R8VA 1XF8A 4I02A 3E5UA 4KOXA 2C0ZA 1M1DA 1X82A 3CXSA 4I09A 3OF1A 2P6FA 4OFGA 3MPBA 4HLTA 1S7FA 3S7IA 3SCFA 2HKXA 3KMHA 4QX5A 5KHKA 2VI7A 3E5QA 2FXFA 4Q0VA 2I79A 3U10A 2PAEA 4KOYA 1S60A 4QVTA 4H6ZA 2MPFA 1YHFA 4UBHA 4AVCA 1M4DA 4MY0A 1Z4EA 1ZZ8A 2Z2SB 3DN7A 2GC2A 3QACA 2UYAA 4IEZA 2FQPA 3G8WA 4X5KA 4II9A 2Q4VA 4IETA 4IEXA 1MJAA 2OYZA 5I8TA 5DWNA 5D1IA 2ZXVA 2IXKA 4OADA 2PTMA 5LRSA 3ZJ0A 1XE8A 4E2GA 1YVOA 1TQ5A 3I7DA 2EUIA 3EO6A 1TIQA 3FXTA 4KLVA 3TO6A 2Z69A 4UXAA 1OMIA 5KTAA 4E0AA 2REEA 4YSFA 2B58A 3K9UA 5FPZA 4XNHC 4Q0UA 3E6BA 4CYDA 1RUNA 2Q30A 1WLTA 2V09A 3NKTA 4Q0QA 5J48A 2CNTA 3T9YA 4H89A 4Z07A 2OH1A 3WW1A 2HQYA 3NW4A 5CNPA 1O5UA 3ST7A 3OCPA 1ZZ9A 4XF3A 3IWZA 1S3ZA 1Z9UA 2HV2A 4XFCA 4QMAA 3RYRA 3JZVA 3RYPA 3JVNA 3QAHA 1S7NA 3I3GA 4NVPA 1FI2A 2EA7A 4Z82A 4F0YA 4U9ZA 3WW3A 3T90A 4PSWA 3IDBB 4ZU7A 2ARHA 3F0AA 5BXXA 1Q2DA 2H0VA 3HT1A 1BOBA 2XKPA 2P17A 1HW5A 2Q0YA 4HNXB 1ZX5A 2FE7A 4MBUA 2B3VA 4CAWA 2OPKA 2QNKA 4IEPA 4KOWA 1QSOA 3TFYA 3FFQA 3H3ZA 2VQYA 1GQGA 5LEKA 5IB0A 2N7GA 4R3LA 2VZZA 3S6HA 4DNCA 3ELNA 1Y9KA 1IYKA 4NSQA 1YVKA 1M4GA 2OZHA 1ZRCA 1DZRA 3WW2A 3HIFA 1IICA 3OTFA 2IL4A 4HSLA 3EQEA 5CU1A 5BPXA 2B5GA 5BV6A 2P6EA 2Q4YA 1ZZ7A 4J1XA 2VZYA 2JLMA 2B9UA 5DWMA 2WPXA 3ZZIA 4JTOA 4FAHA 5EFUA 3BLNA 4NCZA 3NSTA 4MX3A 3MZHA 1ZZBA 3GYAA 3S6FA 3TOAA 4R87A 3H1MA 3D2PA 4XPDC 4P9GA 4QB9A 1NSLA 2VXKA 2UY9A 2B5GB 2D4OA 3HT2A 3D0JA 3DV8A 2EVNA 5JCTA 2QECA 3UY5A 2OZ6A 2KCWA 4R8HA 5JR7B 2JDCA 1ZREA 1QSMA 4QM8A 5KHJA 2O1QA 3KSCA 1XEBA 4AG9A 1RL3A 2BNNA 2PDOA 3ES4A 4KOUA 2ET1A 1M44A 2B8MA 1L0CA 4XETA 5C6CA 3BJ7A 1NXMA 5KHGA 2FCKA 3M70A 4I01A 3L2HA 2BNOA 3EBRA 4JTNA 4LEJA 3U0ZA 5HMNA 4LLOA 4XF9A 2G0BA 4RI1A 1YGHA 4QM9A 3R9EA 2UYBA 4FAGA 2BYVE 1I1DA 4QGLA 4ZU5A 5E1RA 5BY5A 3DSBA 3FJSA 3R6SA 3LODA 4HNWB 1Q2CA 4NF1A 4Y49C 4I2OA 2R98A 5H84A 1O3TA 2PAMA 2Z0ZA 4O9GA 2IC1A 1CAVA 3PVBB 5JAXA 3VHRA 3E6DA 1IYLA 1KUYA 2ZW7A 4E2AA 5EZWA 2JEVA 3CL1A 1PUAA 1H1MA 2VPVA 4YNIA 2DXQA 2Q7BA 3R96A 2R7HA 5T3NA 5FLIA 5JSRA 2IXCA 4KWJA 1J59A 5FPXA 4MI4A 2OA2A 4XNHB 1O3RA 5KHHA 5CADA 1CAVB 4PSXA 4WVZA 4KLWA 3FHIB 1QY4A 4F8AA 1YUDA 4LA2A 3ACLA 4J1WA 2EVXA 1YFXA 1QXJA 1DGRA 3UKTA 1MJBA 4QC6A 3V8IA 2F4PA 1ZZCA 2ATFA 3SCHA 1SEFA 5C8WA 2WC2A 2B3UA 4KOVA 2MNGA 2JDDA 1KUVA 2Q4SA 2QIRA 4L2NA 2VBQA 4H6UA 2D40A 4YRHA 4UBRA 4E2QA 5J7MA 2Z11A 1OI6A 3LOIA 4HVRA 2R1IA 3B8GA 2XL7A 4Q0PA 2XLAA 1WK4A 2VEZA 3FRMA 3CXQA 2ATRA 1I5ZA 5E16A 4XFGA 4ZBGA 4MGYE 3P2HA 5I8SA 1Y9WA 3DDDA 1RXTA 2Q0AA 4KU8A 4PV6A 2BEIA 2FS5A 3DNSA 4I49A 1EP0A 2PHDA 3H9AA 4HNYB 3SCGA 1J3PA 4UWJA 3EO4A 2XL9A 2E9QA 5LEJA 2GE3A 2H6CA 4FT8A 2A4NA 4X6RB 3RZZA 4HBNA 3PZJA 2WPWA 4KORA 3ETQA 2XLGA 3IGRA 3LD2A 4AVAA 3GBFA 2OZUA 3TO9A 3PLQA 3PP9A 3FYNA 4JLYA 2Q1ZB 1O3SA 3P2FA 4MHDA 2BL1A 4XPDB 3LA3A 4KUBA 2PR8A 3F5BA 1S7KA 4YYOA 3NE7A 4AVBA 4KOSA 3VWDA 4PIZA 3EY5A 2CAUA 1L3JA 2ZW6A 4U9YA 3SMHA 1X8EA 1RO5A 4R52A 5I8YA 4IEYA 2K5TA 1ZVFA 5FQ0A 3DR8A 1U6MA 2X7BA 4IEWA 1CJWA 2QJVA 2Q04A 4JD6A 4CRZB 4CS0B 3CXPA 4YFJA 1YREA 2J8MA 2OB0A 2D5HA 3BJ8A 1X8MA 5FQ0B 4BH9A 4Y49B 4GS4A 4XFAA 1ZRDA 1N71A 1RC6A 4KZTA 2QMLA 2C27A 3D2MA 4MGZE 3S7EA 2ZCWA 1CAUB 4N9HA 3EFAA 4MV2A 1O5LA 3IWGA 5CVRA 2BGCA 3LWCA 2NMTA 2CNSA 3R1KA 3B02A 4F7ZA 3E5XA 4MJ8A 2EAAA 5FLHA 1UPIA 2D4PA 2XHKA 1CM0A 3D82A 1FXZA 2I45A 3R95A 2PYTA 2WFPA 3E6CC 1U12A 5LRRA 1O7FA 2CNMA 4MY3A 1Y9QA 1B87A 1J3RA 4KWKA 2GC0A 2GIVA 4LULA 3TNQA 1UD1A 2QVSB 2CY2A 4MH0E 3BU7A 4NXYA 1VR3A 3N4MA 4KUAA 2XLFA 1YLLA 4AQ2A 1OZPA 1XE4A 1PM7A 3H1YA 4CAXA 3BALA 3ZDSA 4A2UA 3H8UA 3KGLA 2PC1A 4U5YA 4PIYA 2PHLA 3NL1A 4HVQA 3SXOA 2AE6A 4KL1A 3NVCA 3OWCA 1YX0A 4IUSA 2B5HA 3VWEA 4BMHA 4KVXA 4XPKA 1CGPA 4QBJA 2VECA 3D0SA 2PFWA 1Y3TA 4IEVA 1J58A 1XRUA 3LAGA 3RDIA 4FD4A 1VJ2A 1CX4A 5HI0A 3S6GA 4L11A 2G3TA 2AJ6A 4BIFA 4RS2A 1LRHA 3KGZA 5I0RA 2PR1A 5H86A 2QCSB 1ZRRA 4HN1A 4KOTA 5I0TA 4PK2A 3ES1A 3QB8A 1MK4A 4KWLA 5FDBA 3H50A 2PA7A 4UBGA 1RGSA 1UFHA 4NEXA 1EYBA 4LUKA 5C88A 4B5PA 4JJXA 5F49A 1QWRA 3I54A 1QSTA 1SFNA 4XF4A 4M85A 2QDRA 3FX3A 4JV4A 2Q44A 1V0CA 2OU2A 4LUAA 2CV6A 4B5PB 4JWPA 1QXRA 1OD5A 1X7NA 2BSWA 4X6QB 4PK3A 1S7LA 1R57A 5JQ4A 4Q0SA 4I0BA 1NYWA 3LA2A 3I59B 3MDPA 2GAUA 3ROUA 2G3AA 3D8PA 4MUVA 4MGKE 4XF1A 1G6NA 1IIDA 1SQHA 4MGIE 1LRZA 3RYOA 3CF6E 2P6GA 5JSOA 3FE5A 1YFWA 1Q2YA 2FMYA 4IESA 5KHIA 1I12A 1VHSA 4QUSA 1S5KA 4I0AA 1NMTA 1Q5OA 4AB7A 1ZNPA 2FSRA 2O28A 3W6XA 1CAXB 1YFUA 1PU9A 4H7LA 4HZFA 1BO4A 1WWZA 3IIAA 4CAVA 5C82A 4K8FA 4EWDA 2FT0A 4KVME 1Q43A 4LX9A 4AQ6A 5F46A 3LZZA 5E96A 4IF5A 3E97A 4RD7A 2H6BA 2FL4A 4XFFA 4D7TA 4IEUA 4HSJA 2GH2A 3USSA 4CRYB 3FBUA 1IPJA 3JUWA 3KKWA 4QXKA 1UCXA 1YWKA 3DR6A 1NZCA 1DZTA 4YRDA 1JUHA 2PQQA 1O4TA 4N9IA 2BNMA 2FIWA 2B4BA 1XE7A 3CLPA 2PQ8A 3O14A 2MHFA 5JPHA 4XPLA 5J8CA 2K0GA 4FD6A 5F47A 1YLEA 3CEWA 5FLJA 4B29A 3EC4A 4R57A 4WZCA 2CAVA 2IXIA 5I0UA 1DGWA 4EVYA 1NE6A 5FVJA 3OGJA 3I9SA 4META 2O8QA 1FY7A 1MJ9A 3W91A 4XEZA 3IDCB 1ON0A 3LA7A 2XKOA 4OAEA 2Y0MA 5GCNA 1QSNA 4D7SA 2ZPAA 3TOBA 5EBVA 4L89A 5AVPA 3EXNA 1CAUA 4IEQA 4HVOA 2ZW4A 4XF0A 5J3UA 1IB1E 4B5OA 3H3UA 4IEOA 1Y7RA 4HMZA 5ISVA 2PAKA 3MYXA 4LA3A 1ZZ6A 1PMIA 2HJIA 4DINB 1GHEA 3WW4A 1H1IA 2J8RA 2KXLA 4R3KA 3TCVA 3TTHA 4E8OA 4JVAA 2ZW5A 4MZUA 2H5MA 4HKFA 3R9GA 1VP6A 1WGPA 3RPQA 4E2SA 5JSPA 3GKRA 3RYKA 5EC4A 2ETEA 5K8SA 2B4DA 1V70A 4XFHA 4J3GA 3PNAA 1P0HA 5I0CA 3HQXA 2REFA 1LKNA 3FWEA 2F5IA 2XGXA 1FT9A 1UW8A 3H1WA 3FB3A 3DKWA 3E0KA 3DL3A 1NE4A 2D93A 5KTCA 1SQ4A 4YGOA 3PGPA 5I0SA 1EY2A 2RC4A 1J4JA 2B4DB 4JXRA 3C26A 3WR7A 5IV0A 3FNCA 4AG7A 3CJXA 2ET7A 3BCWA 1EPZA 1VKCA 1XIXA 5I93A 4EWAA 1YK3A 3EHKA 2PRBA 2DCTA 5BUVA 1I21A 3H4QA 3BB6A 3TO7A 1XMTA 3C3VA 3SHRA 3TE4A 2Z10A 4KU7A 1KUXA 4JXQA 1WA4A 2ZKLA 3U11A 3G3SA 1YFYA 4FD7A 4R9MA 1M4IA 2OZJA 1J3QA 1KZFA 4EWEA 2J8NA 3R9FA 1LB2A 4FBFA 1K4JA 4M3SA 4IERA 2GC3A 5HH1A 2P0WA 1I6XA 1YR0A 3GYDA 4ZU4A 5J8FA 1OFNA 2FIAA 2K9ZA 4QGNA 4EROA 2I00A 3GY9A 4F6AA 5FCCA 1J1LA 2IXHA 1NE9A 2BEOA 4Q29A 4XFBA 3TNPB 4LTAA 3SXWA 4PJYA 4YARA 4FD5A 3KCCA 3S0MA 4I3PA 3I59A 1P4NA 4K30A 4HN0A 4EV0A 2HUZA 2GU9A 4ORFA 3G7DA 3FIXA 3F8KA 1UIJA 3EJKA 4QGMA 2UY8A 1IPKA 3FZ3A 3IBMA 4L8AA 1UIKA 3RNSA 3SXNA 3UKNA 3CO2A 1LR5A 3M3IA 4PIXA 4WBBA 2GC1A 1RUOA 5F48A 3OD0A 3QOPA 4GULA 1GQHA 2GANA 2Y0OA 3D3SA 3MGDA 3TT2A 3H7YA 1CAXA 2IXJA 4AXOA 4BYYA 5I91A 2BUEA 3SHPA 5KTDA 4OLLA 4UWIA 5KBFA 3S6KA 4UA3A 3NJZA 5F1RA 1O3QA 1CAWA 3UKVA 1B6BA 1RTVA 2D5FA 2IXLA 1QSRA 2CGPA 3W6SA 3H7JA 2PSWA 3N7ZA 4KVOE 4TLFA 4BHPA 2VQAA 4LUMA 1Z4RA 4O9EA 2OZGA 4ONUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Q8LA 4XTPA 4XC9A 1LESA 1XF8A 2DU0A 4YW2A 2DTYA 3WNMA 4EZHA 2FHRA 5A80A 4UFLA 2OYZA 4OADA 5FZ3A 5LCWL 3ZJ0A 5IAXA 3I7DA 3NRUA 3R4UA 3QCWA 1OMIA 1GUIA 5A33A 2HEYF 1U5IA 5FZ7A 1AR72 2BFUS 5FYVA 5GJ6A 2WNVB 3CHXA 2V09A 3MFCA 1GSLA 2OH1A 2GP3A 3QAHA 2W95A 3JVNA 4ARYA 1DQ0A 5DUXA 1NAEA 3C7EA 5B4NA 1BEV1 4QKDA 1EUUA 2GSYA 3QH7A 1REFA 2CDOA 4X3RA 4WJBA 1AR73 2VZYA 3AL5A 1R3NA 3VB9A 2ZX0A 3DV8A 4GB32 2YU1A 1QOTA 4ZYQA 1RL3A 1RVF2 5FBJA 2EICA 4RI1A 1P8JA 3FJSA 4Y49C 2R98A 3BGAA 4CCOA 4Q4X2 2MEV1 4B13A 4E2AA 4A3XA 3AMHA 1OOPA 4YZ2A 2TNFA 5EJ3A 2ZAAA 4AFAA 5C8CA 1F4HA 1LOFC 1QXJA 1ZZCA 2VMEA 4F3JA 2B3UA 4OC2A 5A7WA 4UW4A 3LOIA 3LSDA 2R1IA 1RVF3 1GYKA 3CXQA 2C6CA 5EYYA 4MGYE 5I8SA 3WDVA 4I49A 1EP0A 4NRQA 1QXPA 2Y6HA 4UWJA 4QX8A 1S0BA 2WO7A 3CZUA 4JLYA 2VU9A 3NAPA 3GHMA 3ZN6B 1KFXL 3VKFC 1PNGA 3OG2A 1VB2A 4H14A 5DABA 3D7HA 3WABA 3CNAA 1EV11 1WW5A 2ZCWA 5DXDA 3LWCA 3NV2A 1S0IA 2IMOA 4NJRA 4PI0A 4XDOA 1OZPA 1YLLA 4H2AA 1XE4A 1RUG3 4OHZA 4AHZA 1ZG7A 4P6YA 4LO7A 1VBA3 3LPFA 4NGSA 3VDCA 4FD4A 3KGZA 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4CDWC
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4XFI A;  1Q3E A;  2GZW A;  1ZRF A;  5IX3 A;  3BPZ A;  1CAW B;  2R8V A;  1XF8 A;  4I02 A;  3E5U A;  4KOX A;  2C0Z A;  1M1D A;  1X82 A;  3CXS A;  4I09 A;  3OF1 A;  2P6F A;  4OFG A;  3MPB A;  4HLT A;  1S7F A;  3S7I A;  3SCF A;  2HKX A;  3KMH A;  4QX5 A;  5KHK A;  2VI7 A;  3E5Q A;  2FXF A;  4Q0V A;  2I79 A;  3U10 A;  2PAE A;  4KOY A;  1S60 A;  4QVT A;  4H6Z A;  2MPF A;  1YHF A;  4UBH A;  4AVC A;  1M4D A;  4MY0 A;  1Z4E A;  1ZZ8 A;  2Z2S B;  3DN7 A;  2GC2 A;  3QAC A;  2UYA A;  4IEZ A;  2FQP A;  3G8W A;  4X5K A;  4II9 A;  2Q4V A;  4IET A;  4IEX A;  1MJA A;  2OYZ A;  5I8T A;  5DWN A;  5D1I A;  2ZXV A;  2IXK A;  4OAD A;  2PTM A;  5LRS A;  3ZJ0 A;  1XE8 A;  4E2G A;  1YVO A;  1TQ5 A;  3I7D A;  2EUI A;  3EO6 A;  1TIQ A;  3FXT A;  4KLV A;  3TO6 A;  2Z69 A;  4UXA A;  1OMI A;  5KTA A;  4E0A A;  2REE A;  4YSF A;  2B58 A;  3K9U A;  5FPZ A;  4XNH C;  4Q0U A;  3E6B A;  4CYD A;  1RUN A;  2Q30 A;  1WLT A;  2V09 A;  3NKT A;  4Q0Q A;  5J48 A;  2CNT A;  3T9Y A;  4H89 A;  4Z07 A;  2OH1 A;  3WW1 A;  2HQY A;  3NW4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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