4AVBA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 in complex with acetyl coa and camp
Total Genus 90

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
GARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSARVPSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAV

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS5 (76-81)AH1 (12-17)3H1 (19-21)TII1 (21-24)3H2 (26-29)S7 (101-106)AH2 (30-35)S1 (37-41)TII2 (42-45)S3 (57-62)S2 (45-48)TIV2 (104-107)AH3 (89-94)S4 (64-70)TI1 (71-74)AH5 (127-141)S6 (85-87)TII4 (82-85)TIV1 (86-89)S8 (108-113)AH4 (115-123)TI2 (150-153)S9 (146-149)TIV3 (203-206)S10 (155-160)AH8 (193-200)AH6 (163-171)S13 (233-240)TVIII2 (228-231)AH7 (178-185)S11 (207-213)TI3 (227-230)TIV5 (213-216)TIV6 (214-217)AH9 (249-264)TI4 (230-233)3H3 (242-244)TII6 (244-247)S16 (298-304)TII7 (295-298)AH10 (278-286)S14 (268-274)TII8 (307-310)TIV7 (308-311)AH11 (315-331)TII3 (49-52)S12 (218-226)S15 (290-295)TII5 (124-127)TI5 (274-277)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
total genus 90
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avbA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avbA02
2G0BA 4R3KA 3H1WA 3EC4A 2Q4SA 4EWAA 4YGOA 1UIKA 3HQXA 1WA4A 4U9YA 2EA7A 2B5HA 2O8QA 3LOIA 1Y7RA 4MH0E 2Z11A 3F8KA 1O4TA 2ZW5A 1ZZ6A 2FL4A 4OADA 4CAVA 3PP9A 3CJXA 2O28A 2PQQA 1UIJA 3EBRA 2XLGA 4MZUA 2OZGA 3IBMA 4R52A 4R8HA 4QVTA 5C88A 1WLTA 2VPVA 3TE4A 3EO4A 1LKNA 3CXQA 3R1KA 3I3GA 4KOWA 4LUMA 2Z10A 3FXTA 1YK3A 1Q3EA 5KTCA 2ET7A 2FXFA 4MI4A 4N9IA 4KORA 4NCZA 2H0VA 5GCNA 1J4JA 4META 3BB6A 1V70A 1FY7A 2C27A 4MGYE 3S6HA 1B87A 2G3AA 1YWKA 2D40A 3CLPA 3FJSA 3NL1A 4D7SA 4XFCA 1MK4A 1VJ2A 3DR6A 3I9SA 3JUWA 3SXWA 4I0AA 4QUSA 3TOAA 3SCGA 4E2GA 2OPKA 3FYNA 1I5ZA 1YGHA 4Q0PA 2JLMA 2CGPA 4NEXA 3SXNA 1ZREA 2OYZA 3TO7A 2F5IA 4JWPA 4MV2A 4XF1A 4I49A 1MJ9A 2B5GA 4U5YA 1K4JA 2REFA 2WPWA 1YFWA 1NE4A 4WBBA 2FIAA 2PC1A 1SQHA 2HUZA 1IYKA 2JEVA 4R9MA 4BIFA 4RD7A 2X7BA 1VR3A 1U12A 4UA3A 3KSCA 4KU8A 3FX3A 3ZDSA 4KLVA 4X5KA 3IWGA 4B5OA 2FMYA 1ON0A 4AVBA 4HKFA 2P6EA 5HH1A 5BY5A 2EUIA 3SMHA 1IPJA 1V0CA 1LB2A 3VWDA 4XF9A 5J7MA 4PSXA 2ZW7A 2IXLA 3E5XA 3LA2A 4PV6A 2Z0ZA 2I45A 3G7DA 4MGKE 5JSPA 3FZ3A 2FT0A 5CVRA 2QJVA 2B5GB 2ZW4A 4B5PA 3FB3A 1Q2YA 2R1IA 1CGPA 3CXSA 2F4PA 4XETA 2GAUA 4GULA 4XFHA 2PR1A 2B4DA 1KZFA 2FE7A 4CS0B 2A4NA 4Z82A 2GZWA 3UKTA 4QGLA 3V8IA 3D0SA 2OZHA 3W91A 4LUKA 2Q0YA 4KOUA 1I6XA 1VP6A 5KTAA 2IC1A 4UXAA 3PZJA 4TLFA 3H3ZA 4I0BA 1DZTA 2GC0A 4H6ZA 4XPDB 5D1IA 4AQ2A 3D2MA 3GY9A 1YUDA 2Q0AA 3FFQA 3M3IA 1ZX5A 4KLWA 3TO6A 2GC1A 2CNMA 2WFPA 2CAVA 1UPIA 3DL3A 3RPQA 1QSMA 5LEJA 4UWIA 4B5PB 2VEZA 2J8MA 2QNKA 1I21A 1H1MA 1Q2CA 5E96A 4ORFA 5FLJA 2R98A 2OZJA 3E6DA 2BNOA 1O3RA 4HVQA 1DGRA 1RUOA 2B4DB 2VBQA 4KVME 3ZJ0A 2GIVA 1XE7A 1UD1A 2PR8A 3H7YA 3NE7A 2BYVE 3PNAA 1NE9A 1S3ZA 3N7ZA 4IEQA 4NSQA 3MGDA 5FVJA 3UKNA 1YVOA 3VHRA 1J58A 3QACA 4J1XA 3TNPB 2QCSB 3IDCB 3SCFA 4AVAA 3MZHA 2P0WA 2FIWA 4KWKA 4LULA 2D4OA 4KUBA 1L3JA 1CAVA 1TQ5A 2BNMA 3SHRA 2Q4YA 1FT9A 4I01A 3H8UA 3TNQA 3GYDA 4I02A 4PIXA 1CX4A 1QSOA 2PFWA 3N4MA 2ZCWA 2PA7A 2BEOA 4H6UA 5EBVA 4XEZA 1PM7A 5J48A 4YRHA 4MHDA 4BHPA 3S6FA 4KUAA 4AG7A 4XFFA 3EO6A 3WW4A 4UWJA 2XL9A 4Q29A 1O3QA 3FRMA 4HNXB 4XF3A 4ZU7A 4IEVA 1H1IA 3DSBA 3LWCA 3SXOA 1EPZA 3EFAA 4F0YA 1M1DA 1S5KA 3EY5A 4IESA 4WVZA 1I1DA 4XF4A 3KMHA 2CNTA 1CAVB 4XFIA 1QSNA 2VXKA 4JXQA 3D8PA 1YFXA 1J1LA 3ES1A 2IL4A 4I09A 1M44A 4MGZE 4N9HA 3LA3A 3FHIB 4XNHB 3E6CC 2IXIA 4IEPA 3E97A 4KL1A 1CAXA 2ZKLA 3NVCA 3NW4A 4ONUA 3H3UA 5LRSA 3D2PA 3TOBA 3W6XA 3WR7A 4FD6A 5EZWA 3IGRA 4Q0UA 1ZZ7A 1ZRFA 2GC3A 2BUEA 3S7EA 2ATRA 1XRUA 3ELNA 4BH9A 2K0GA 3PGPA 4RS2A 3FE5A 2GE3A 5J3UA 1J3RA 1IB1E 4O9GA 4AB7A 1Z4EA 3DV8A 1ZVFA 1CAUA 1P4NA 1NE6A 4EVYA 3ACLA 4E2QA 1YHFA 2QMLA 3DR8A 2B4BA 3S7IA 2B58A 3T9YA 2CAUA 4FD5A 4M3SA 5DWMA 1JUHA 4HN0A 1QSRA 1HW5A 4FAGA 2REEA 2D5FA 3JZVA 4EWDA 3CO2A 4XFGA 3CL1A 1CAXB 2XLFA 1FXZA 4XFBA 5LRRA 1WK4A 1OFNA 3S6GA 5C6CA 5IV0A 3I7DA 4KOVA 1Y3TA 4PJYA 4XPDC 1M4IA 4HVRA 1NYWA 4HZFA 1Y9KA 2B9UA 3MDPA 4JVAA 2KCWA 4BMHA 3M70A 4KOSA 1CAUB 4YNIA 2IXHA 3H4QA 2PHLA 4EWEA 3QB8A 4Q0VA 2B3VA 4ZU4A 2I00A 3U0ZA 1Q2DA 4IEXA 4CAXA 3R6SA 4MY0A 4PIZA 1OMIA 2XGXA 3QOPA 2Z69A 1Y9WA 4JTOA 4LA2A 1WWZA 4DINB 4X6QB 1J3QA 3T90A 3O14A 4NF1A 3TFYA 1YLEA 2HKXA 2RC4A 1L0CA 2JDDA 3PVBB 2HV2A 5I0CA 5E16A 4CRZB 3U11A 1O5UA 1RXTA 1ZZCA 2ZXVA 2R7HA 1CJWA 4KOXA 1QY4A 2EVXA 3R96A 3MPBA 1O3TA 3DNSA 1NZCA 2Q4VA 3LD2A 1YREA 2BL1A 2PQ8A 4YFJA 1FI2A 1OI6A 4YRDA 5I8YA 3OTFA 3RYOA 4QB9A 1QXJA 4FT8A 3D3SA 4RI1A 3B02A 2J8RA 5DWNA 2IXKA 2Q1ZB 4XPKA 1CAWA 4MX3A 3GBFA 4QGNA 3BJ8A 4IF5A 5IX3A 4K30A 1X8EA 2CV6A 3W6SA 4Q0SA 4H89A 3FWEA 3L2HA 5JPHA 4PK3A 1UFHA 1IICA 1O5LA 4UBHA 4R57A 3I54A 4PIYA 1Q5OA 1SFNA 3H1YA 5J8CA 4IEWA 1XF8A 4BYYA 2Y0OA 2GC2A 3EQEA 1XEBA 4K8FA 3VWEA 4QBJA 2B8MA 4UBRA 5BV6A 2B3UA 3BCWA 2VZYA 4QM8A 4XF0A 4D7TA 1M4GA 4L8AA 4LUAA 4NXYA 5JQ4A 4O9EA 4YYOA 1PMIA 5F1RA 3ROUA 4XNHC 5KHGA 1J3PA 2P6FA 3D82A 5KHKA 1XE8A 3LAGA 2QDRA 4MJ8A 3HIFA 4MUVA 2Q30A 2QECA 5EC4A 2P6GA 2R8VA 4M85A 5CU1A 3EJKA 1S7KA 1O7FA 4PK2A 2FQPA 2ZPAA 3E0KA 1I12A 1RO5A 3KGLA 3SCHA 4B29A 2G3TA 1OD5A 1IPKA 3OD0A 2H5MA 4XPLA 3RYKA 4IEUA 3IWZA 4IEYA 4PSWA 3BALA 1Z9UA 4DNCA 1KUXA 4AG9A 1DZRA 1X8MA 4EROA 1UW8A 1RTVA 5I91A 3BJ7A 1YVKA 5F49A 1NXMA 1XIXA 2ATFA 3FBUA 5JR7B 4UBGA 4Y49B 5I8TA 5BXXA 3D0JA 5E1RA 1S60A 3RDIA 4ZBGA 5KHHA 5JSOA 2IXCA 3G3SA 4U9ZA 4FD7A 1X7NA 3UY5A 5ISVA 1J59A 5BPXA 5T3NA 1SEFA 2OZUA 4F6AA 1ZZ8A 1IIDA 4GS4A 1RC6A 3WW3A 3RNSA 1PUAA 2OU2A 3P2HA 1KUYA 1GQHA 1YX0A 3CF6E 4FD4A 1ZNPA 2MNGA 2PDOA 1VHSA 3H7JA 3R9GA 2VI7A 5BUVA 1ZZ9A 2GU9A 3FIXA 4P9GA 5AVPA 5F48A 1GQGA 5F47A 3F0AA 4HMZA 2P17A 4JD6A 5JAXA 2Y0MA 1IYLA 4QC6A 4E2AA 4OLLA 1EP0A 3E5QA 3IIAA 4LA3A 4XFAA 1EYBA 2PAMA 3KCCA 3WW1A 1OZPA 3RYRA 3TTHA 2PTMA 5KHIA 4WZCA 3USSA 1LRHA 2WPXA 4IEZA 3NSTA 5JCTA 4HVOA 4QX5A 1XE4A 2EAAA 2I79A 2HQYA 1UCXA 3C26A 4ZU5A 5FCCA 2DCTA 4L11A 3EHKA 3R95A 4KOYA 4KU7A 1G6NA 2FCKA 4KOTA 4MY3A 2BEIA 1MJBA 2N7GA 2K9ZA 4KVOE 5JSRA 2O1QA 4IETA 4YARA 3JVNA 4IUSA 1GHEA 4Z07A 3H50A 4JLYA 3DN7A 1S7FA 1YFUA 4F8AA 5I8SA 3H9AA 1KUVA 4II9A 4AXOA 4YSFA 4IEOA 3KKWA 3QAHA 3I59A 4X6RB 2ETEA 2V09A 5HI0A 4FBFA 1YFYA 5HMNA 4KWJA 2MHFA 4KVXA 2XKPA 4HNWB 5I0UA 1ZRRA 2D5HA 3NKTA 4QXKA 2AJ6A 3R9FA 5C82A 3P2FA 4MGIE 1RGSA 5FPXA 1NSLA 2UYBA 1U6MA 4J3GA 1BO4A 2PAKA 3IDBB 3BLNA 4QM9A 1O3SA 5CNPA 4CYDA 5C8WA 2UY9A 1PU9A 3LODA 1S7LA 4CRYB 1R57A 2GH2A 3RZZA 4F7ZA 2OB0A 4MBUA 2NMTA 4R3LA 4KWLA 2XHKA 2IXJA 4AVCA 3KGZA 1ZRCA 4L89A 3TT2A 2XLAA 2VECA 4JV4A 4LTAA 1Y9QA 4IERA 5FDBA 5IB0A 2XKOA 3MYXA 4A2UA 2Q04A 3I59B 4HSLA 2Q44A 4HN1A 5FLIA 3OWCA 4L2NA 3BU7A 2KXLA 1YLLA 2HJIA 3E5UA 3H1MA 2MPFA 1QSTA 4HNYB 2VQAA 4LX9A 3NJZA 2XL7A 1XMTA 2CY2A 3HT1A 2OH1A 4HLTA 1M4DA 3TO9A 2UYAA 1Q43A 2PSWA 5EFUA 1X82A 2PAEA 2BSWA 2AE6A 2H6BA 2CNSA 3B8GA 5CADA 4OAEA 4HSJA 1WGPA 2OZ6A 4I3PA 1P0HA 1DGWA 4H7LA 4NVPA 3ES4A 3PLQA 2DXQA 4CAWA 4Y49C 5J8FA 5KTDA 1RL3A 1LR5A 1YR0A 1Z4RA 2PYTA 1VKCA 3OGJA 3S6KA 3GKRA 2FS5A 4I2OA 4E8OA 4JTNA 3G8WA 1ZZBA 2WC2A 3S0MA 4EV0A 2PHDA 4JJXA 4Q0QA 5KBFA 2Q7BA 4AQ6A 2E9QA 1CAWB 1B6BA 3DKWA 2BNNA 2ZW6A 2K5TA 4E0AA 2VQYA 5I93A 3LZZA 1ZRDA 2VZZA 1SQ4A 5FPZA 1NMTA 2PRBA 2OA2A 3LA7A 3OF1A 2EVNA 3EXNA 5FQ0A 3TCVA 1LRZA 3UKVA 4KZTA 3R9EA 2BGCA 3ZZIA 1S7NA 3C3VA 5K8SA 4QMAA 2ARHA 4E2SA 2FSRA 3GYAA 3SHPA 3K9UA 3OCPA 2Z2SB 4J1WA 2QVSB 1TIQA 1QXRA 4LEJA 5KHJA 5H84A 3ETQA 3WW2A 1QWRA 5H86A 3CXPA 5LEKA 2ET1A 3BPZA 2H6CA 5I0SA 4OFGA 2UY8A 4HBNA 1MJAA 1RUNA 4LLOA 5I0TA 1EY2A 2C0ZA 3U10A 3E6BA 3CEWA 3RYPA 3HT2A 2D4PA 1CM0A 4R87A 3ST7A 3F5BA 4FAHA 4QGMA 5I0RA 4JXRA 3DDDA 2JDCA 5F46A 2D93A 2GANA 1N71A 2J8NA 3FNCA 5FQ0B 2QIRA 5FLHA 1BOBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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