4AVCA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 in complex with acetyl coa and camp
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
TGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSARVPSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 77
structure length 326
sequence length 326
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avcA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avcA02
1NYWA 4DINB 4NXYA 3IBMA 4QM9A 4HN1A 4L2NA 4JLYA 1YR0A 3EO6A 4MGKE 5FVJA 3H7JA 5AVPA 3OD0A 5E96A 4XFBA 3FWEA 3H1WA 3N7ZA 1J3QA 1J1LA 2BL1A 4XETA 5CVRA 5BY5A 2P6EA 2AJ6A 2XKPA 3JUWA 2ZW4A 4E2SA 2Q0YA 2GC2A 2PFWA 4IEQA 3CL1A 1ZZ6A 3S6FA 1NE6A 1KZFA 4JD6A 3KGZA 2CAUA 3MYXA 2PR1A 3HQXA 4IUSA 1O5UA 2B4DB 4CAVA 3HT2A 4ORFA 4Q0PA 4CAXA 2FT0A 1O7FA 1RC6A 4MHDA 1CM0A 4MX3A 1O3RA 2VXKA 1UD1A 4XNHC 4Z82A 2BYVE 1CJWA 2G3AA 3JZVA 2F5IA 5H86A 1S60A 4HLTA 1QXJA 4IEZA 1VR3A 2X7BA 2BNOA 4KORA 4HMZA 3S7EA 4KVME 1CAWB 5BPXA 5J8CA 1S7FA 3IDBB 3RYKA 4XPDC 5K8SA 4FD5A 1XF8A 3R6SA 4MY0A 1NZCA 1I12A 2FL4A 2P6FA 2AE6A 4DNCA 3D0JA 2Y0OA 2CV6A 2IC1A 1ON0A 1YK3A 4PK2A 4R57A 2HV2A 3V8IA 4PSWA 2ZW5A 4I02A 1I5ZA 3RNSA 1OI6A 2FE7A 2B4DA 5JSOA 2OZUA 4FAHA 2Q4YA 3BPZA 4JXRA 1IPJA 2GC3A 1YFWA 2ET7A 3FIXA 1Y7RA 1ZZCA 5JR7B 4NSQA 3D2MA 2Z11A 2PQQA 4HKFA 4XF0A 3IWZA 2DXQA 4YYOA 1X7NA 4R8HA 1QSNA 1CAWA 3KSCA 2PRBA 4MBUA 5C88A 5D1IA 4QMAA 3OGJA 1YVKA 3RPQA 1NXMA 1ZRCA 4NF1A 3E6BA 5F46A 4LUMA 4II9A 1UCXA 4AQ6A 1DZTA 4QGNA 3UY5A 2PR8A 1OMIA 4F8AA 2VZZA 4KZTA 5KHIA 4BMHA 3ETQA 3PNAA 5E16A 2MPFA 3FE5A 3FX3A 4WBBA 1SFNA 2GAUA 4UBGA 2FXFA 4LLOA 2QMLA 4BYYA 3RYRA 4HZFA 3PZJA 4LUAA 3L2HA 5KHJA 5KHGA 3GKRA 3H1MA 4XPKA 1CAUA 2IL4A 3I3GA 4PV6A 1M44A 2ZCWA 4ZU4A 2D40A 4WZCA 2CNSA 2XL7A 4ZU5A 3ES1A 1S3ZA 4NVPA 4K8FA 2CNMA 4X5KA 3FB3A 4B5OA 1QSRA 4MZUA 3E0KA 1ZZ8A 4QX5A 3QAHA 4XPLA 1LRHA 2V09A 3QACA 2J8NA 3NJZA 2XGXA 2ZKLA 3DN7A 1Y9QA 1VKCA 5EBVA 2PSWA 2B3VA 4MI4A 4QBJA 4META 4MGZE 5F48A 3SXNA 1Z4RA 4HNYB 5HH1A 5ISVA 3U11A 2VI7A 3KGLA 2GE3A 3LAGA 1YLEA 3VWEA 2QNKA 2HJIA 5FLHA 3BCWA 4IERA 4N9IA 5I0UA 3C3VA 1CX4A 1M4GA 2IXHA 1S5KA 5BUVA 1QWRA 4ZBGA 1J3RA 4B29A 2JEVA 2R1IA 4EROA 4RD7A 1TIQA 2VZYA 1Q43A 2PYTA 2DCTA 3M70A 1RGSA 4L11A 1IICA 1I1DA 2I79A 5LEJA 3EHKA 4HBNA 4HVRA 1B6BA 5F1RA 2E9QA 4FD6A 3TO7A 2QJVA 2UYBA 2XLGA 2H6CA 2IXLA 3H1YA 1L0CA 2WC2A 1O5LA 3H4QA 1KUXA 1DGRA 5KHHA 5DWMA 1MJAA 3PP9A 4AXOA 4CS0B 3CEWA 2GC0A 4L8AA 1OD5A 3IGRA 2G0BA 3SCFA 4KOVA 1O3TA 5T3NA 2H5MA 2RC4A 1NE9A 2A4NA 5FLIA 1UFHA 2WPWA 3S6GA 2EUIA 4YGOA 3FFQA 3N4MA 1J4JA 2O28A 3BLNA 5GCNA 1G6NA 1WWZA 4KOYA 5JSRA 3EO4A 4H89A 4R9MA 1ZRRA 3FYNA 4R87A 2BNNA 2P17A 4XFHA 2D5HA 3WW1A 2KCWA 3RZZA 4KWJA 4IEYA 3W6XA 2CY2A 1XEBA 5IV0A 3S6HA 3BJ8A 3B02A 1ZVFA 1I6XA 3BALA 4E2GA 1LB2A 3LODA 2R7HA 3TFYA 3FZ3A 1IB1E 1CGPA 2FMYA 3CXSA 4IEWA 4JTNA 3TO6A 3GY9A 2Z69A 4PIXA 3NSTA 3WW4A 2OU2A 3CLPA 2QDRA 2Q30A 3CO2A 4PSXA 3I7DA 4X6QB 1OZPA 4XFGA 3G3SA 4EWEA 2C27A 5EC4A 4Q0VA 3DDDA 5DWNA 1X82A 2UY9A 3GBFA 1GQGA 4PJYA 3ZDSA 3NW4A 4BIFA 2D4OA 3QOPA 1PU9A 3R1KA 4JWPA 4I01A 1MJBA 3T90A 2ATFA 1H1MA 3HIFA 4IEXA 2OH1A 5IB0A 3NL1A 2PHLA 5FPZA 4AVAA 2C0ZA 1GHEA 4BHPA 2BNMA 3DR8A 3OCPA 4FD7A 3MDPA 4KU7A 2FS5A 2Q0AA 4QXKA 3WW2A 1SQHA 1CAVB 3ES4A 3TNQA 5LRSA 3WW3A 2J8RA 2GU9A 4KL1A 2ZW6A 1M4DA 2ATRA 4YFJA 3R96A 1SQ4A 1GQHA 2VQAA 3E5QA 3U10A 4CAWA 3D8PA 5CNPA 3TTHA 1J59A 1QSMA 4UXAA 5J8FA 4QM8A 3H8UA 4Z07A 5LEKA 5C82A 3CXQA 4IESA 1QXRA 4XFFA 2CGPA 2BEIA 4IF5A 4I3PA 4KOWA 2HQYA 3P2HA 1BO4A 5F47A 2XKOA 4AVCA 3QB8A 4HN0A 1EP0A 2Q4VA 5I0RA 5HMNA 1RUNA 2REEA 1XE4A 3M3IA 3D3SA 3TT2A 3IDCB 5FPXA 1Q2YA 4AB7A 2PAMA 2D5FA 3NKTA 4OLLA 2B3UA 4MY3A 2GC1A 3CJXA 2GIVA 2Z10A 5KTDA 3SXOA 1UIJA 4NCZA 2EVNA 2Q1ZB 1CAVA 4LTAA 5I0TA 3FXTA 4CRYB 4EVYA 1EYBA 3H3ZA 1VHSA 4J3GA 4Y49C 3TOAA 3NVCA 5FCCA 4KUBA 2BUEA 4MUVA 1YFXA 4GULA 4XFCA 1QSTA 3H9AA 4PK3A 1NSLA 3E6CC 3R9EA 2N7GA 2VPVA 3BU7A 4D7TA 2Q4SA 3E6DA 2OB0A 1IYKA 1SEFA 4LEJA 5KHKA 1S7NA 2ZXVA 2UY8A 4BH9A 4XF4A 2F4PA 2K9ZA 1LKNA 2FSRA 3RDIA 4YSFA 4I0BA 1YREA 3TNPB 1TQ5A 1VJ2A 4MGIE 2Z0ZA 3SMHA 4MV2A 4XNHB 2B5GB 4YNIA 4KUAA 4GS4A 4YRHA 1RL3A 1P4NA 4R3LA 1YVOA 4Q0QA 2Q04A 4M85A 4U5YA 1EPZA 1U6MA 1ZNPA 5LRRA 2P6GA 4CYDA 5FQ0B 1O3SA 4XPDB 1U12A 1O4TA 2JLMA 4OAEA 2OZGA 4E2QA 2FIWA 3E5XA 2PC1A 4XF9A 1LRZA 5JQ4A 3LOIA 3IWGA 3NE7A 1VP6A 3USSA 3WR7A 5I8TA 4IEPA 2O8QA 2PAEA 2QIRA 4JVAA 2OA2A 4O9GA 2IXKA 3CF6E 4HSLA 1ZZ7A 3LZZA 2KXLA 4JV4A 1P0HA 1FY7A 2ZPAA 1N71A 4KLVA 4RI1A 3PLQA 3W91A 3OTFA 3VHRA 5JCTA 4FD4A 2PDOA 4FAGA 4AG7A 2B5GA 1BOBA 3LA3A 4HSJA 1L3JA 1FT9A 1WLTA 5J3UA 4QB9A 1X8MA 2PA7A 1YHFA 3R9FA 3BJ7A 3EC4A 5I0CA 2FQPA 3HT1A 5FQ0A 1Q5OA 3MPBA 2OZ6A 3DSBA 2O1QA 5KTCA 4IEVA 1X8EA 4IETA 1IPKA 2IXCA 1J3PA 3JVNA 3LA7A 1Y9KA 1M1DA 5CADA 5FDBA 1ZREA 5KBFA 5BV6A 4MGYE 4QVTA 5J7MA 5C6CA 1K4JA 2ARHA 3ZZIA 3TCVA 1HW5A 3SHPA 4L89A 1ZRDA 2MHFA 4UBRA 2CAVA 1V70A 2Y0MA 3VWDA 4H6UA 2I00A 3S7IA 4OADA 2GH2A 3OF1A 2ZW7A 2ETEA 5I0SA 3S6KA 2XL9A 4F7ZA 1MJ9A 1B87A 1RO5A 2H0VA 1QSOA 1YFUA 2D4PA 4XEZA 4E2AA 4LX9A 3KCCA 2P0WA 3O14A 2R98A 4QC6A 2G3TA 1XE8A 2B9UA 4ONUA 4WVZA 4F0YA 3DV8A 2EA7A 1MK4A 4K30A 4HVQA 2I45A 3EJKA 4J1XA 4D7SA 4U9YA 2PHDA 1Y3TA 2JDCA 3ZJ0A 2IXJA 4F6AA 1ZZBA 3P2FA 3R95A 2K5TA 2FCKA 3ACLA 4YRDA 3SCGA 3F8KA 3LA2A 1YX0A 1ZX5A 4TLFA 1LR5A 3H3UA 4KOUA 1YFYA 2OYZA 1Q2CA 4NEXA 3SCHA 3PVBB 1S7KA 2D93A 2WPXA 5EZWA 3LWCA 3FBUA 3CXPA 2QCSB 4IEUA 4JTOA 3W6SA 4XFAA 1NMTA 4A2UA 3C26A 3TO9A 1ZRFA 5CU1A 1M4IA 3EXNA 4I0AA 4H6ZA 2VECA 4N9HA 2BSWA 4P9GA 3BB6A 4AQ2A 1XRUA 1R57A 2OZJA 1DZRA 2Z2SB 3F5BA 5C8WA 1YWKA 1UW8A 1Z9UA 2Q44A 4KOSA 1WGPA 4LA2A 3GYAA 3ELNA 3KKWA 1H1IA 2GZWA 2B4BA 3K9UA 3GYDA 1KUYA 2BGCA 2Q7BA 4AG9A 2OPKA 2H6BA 2PQ8A 2VEZA 3DKWA 3TOBA 2R8VA 1CAUB 4H7LA 5FLJA 1EY2A 4QGMA 3U0ZA 2OZHA 2VBQA 3LD2A 1XIXA 1IYLA 2HUZA 4HNWB 4UA3A 3IIAA 4U9ZA 3D2PA 1NE4A 4UBHA 3SXWA 4CRZB 4MJ8A 4J1WA 3FJSA 4I49A 1OFNA 4FT8A 2GANA 4PIYA 1YLLA 4KOXA 3RYPA 4KU8A 1S7LA 3EQEA 1KUVA 1V0CA 2J8MA 5IX3A 1WK4A 2WFPA 1QY4A 1I21A 4R52A 3OWCA 3FNCA 5JPHA 3TE4A 1ZZ9A 1YGHA 1YUDA 5E1RA 4I2OA 4R3KA 2HKXA 3D0SA 1Y9WA 2B8MA 4EWAA 5JAXA 3R9GA 3KMHA 4QGLA 3SHRA 2CNTA 2REFA 3G7DA 1RTVA 4QUSA 2B5HA 4B5PB 4Q0UA 2PAKA 4PIZA 3ROUA 2NMTA 5F49A 3S0MA 2ET1A 1PMIA 4KWLA 4ZU7A 2FIAA 3MGDA 4KVXA 4RS2A 5BXXA 5I93A 5J48A 4AVBA 3DNSA 3F0AA 4LUKA 4YARA 3DR6A 1IIDA 4LA3A 4XF1A 3PGPA 4Q0SA 3EFAA 2QVSB 4X6RB 3UKTA 4MH0E 2XHKA 3EBRA 2XLFA 1WA4A 4EV0A 5H84A 5KTAA 4XFIA 4M3SA 4O9EA 1XE7A 1O3QA 3MZHA 4XF3A 3I59B 3UKVA 1CAXB 4LULA 4KOTA 2EAAA 1FI2A 2EVXA 4I09A 3I54A 5EFUA 4KLWA 2BEOA 4UWJA 1UPIA 1RXTA 1Z4EA 3H7YA 4B5PA 2PTMA 2UYAA 4Q29A 4FBFA 5I91A 1DGWA 3E97A 5I8YA 2JDDA 2QECA 4JXQA 1Q2DA 3I9SA 1J58A 2B58A 1PUAA 3EY5A 3D82A 4KVOE 3H50A 1UIKA 5HI0A 4UWIA 3T9YA 4Y49B 4E0AA 1Q3EA 1FXZA 1JUHA 1RUOA 4JJXA 5I8SA 1PM7A 4EWDA 2IXIA 3FHIB 3UKNA 4HVOA 3B8GA 1XMTA 4IEOA 3FRMA 3DL3A 3G8WA 3I59A 3ST7A 1CAXA 4KWKA 3RYOA 2XLAA 4E8OA 2MNGA 3E5UA 4HNXB 5JSPA 2K0GA 2VQYA 4OFGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4L2NA 2HWF2 3KHCA 5LBFA 5A1AA 4QX8A 1LODA 5CVRA 2O4HA 3VBSC 2AJ6A 2ZW4A 4BMEA 3LPGA 3AMHA 5A1FA 2JG8A 2VXKA 4IEZA 1VR3A 3ZYFA 1FPN1 2X7BA 4ARYA 1PK6A 4YW6A 2CSGA 4XPDC 1NZCA 2AE6A 1CPMA 2WT2A 2XR4A 3VZJA 4R57A 3NNGA 4PSWA 3KI9A 1K5MB 1W6NA 1Y7RA 4KQ7A 3SI2A 1IOFA 5LRGA 1GKBA 5A70A 5FAXA 1EE3P 2ZEYA 5K8OA 3PIJA 3RYRA 3V38A 4EZHA 4HL0A 2G19A 2RG4A 4W9YA 4NVPA 3FB3A 1R3NA 3GJBA 3QAHA 2BUKA 3BGAA 3INAA 5CFCC 3MBWA 3QBQA 1TXRA 2WYRA 4LLFA 4NR1A 2GNBA 2VVEA 4B29A 3HWJA 4RSUA 4ZS3A 2PYTA 5IVFA 4HVRA 4CEYA 2XLGA 3DXTA 3B69A 1GU3A 3U1XA 3KF5A 5AG5A 1LOGA 1SLIA 4AFAA 2A4NA 4E9KA 1Q8OA 4XCBA 3SI0A 4QB6A 3ISZA 2JDZA 2WO3A 5DG2A 2ORZA 3WHUA 4R9MA 2P17A 3ZO0B 3WW1A 5BNNB 2KCWA 5FPVA 4C91A 4E2GA 4UAPA 3DPRB 3KV9A 1HDUA 5DS0A 3UNPA 4Q0VA 1H2MA 4IV3B 1JZ2A 2WFF3 5FBJA 4ZY0A 1UMZA 4KBBA 2QQLA 1RUG3 1AX1A 3MN8A 2ADDA 2MEV2 3WCSA 3WEZA 3TTHA 2CDOA 1R092 2AH2A 1AZDA 1DQ2A 5LEKA 5AFBA 3VKLA 4GIQA 5LK7B 2X5IA 4UWDA 4GWJA 1OUSA 3NKTA 3VBRA 3HQUA 2GIVA 4WJBA 1OH3A 1DF0A 4NCZA 1H8VA 4GXLA 2XJRA 3H9AA 3A7QA 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1PO13
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1NYW A;  4DIN B;  4NXY A;  3IBM A;  4QM9 A;  4HN1 A;  4L2N A;  4JLY A;  1YR0 A;  3EO6 A;  4MGK E;  5FVJ A;  3H7J A;  5AVP A;  3OD0 A;  5E96 A;  4XFB A;  3FWE A;  3H1W A;  3N7Z A;  1J3Q A;  1J1L A;  2BL1 A;  4XET A;  5CVR A;  5BY5 A;  2P6E A;  2AJ6 A;  2XKP A;  3JUW A;  2ZW4 A;  4E2S A;  2Q0Y A;  2GC2 A;  2PFW A;  4IEQ A;  3CL1 A;  1ZZ6 A;  3S6F A;  1NE6 A;  1KZF A;  4JD6 A;  3KGZ A;  2CAU A;  3MYX A;  2PR1 A;  3HQX A;  4IUS A;  1O5U A;  2B4D B;  4CAV A;  3HT2 A;  4ORF A;  4Q0P A;  4CAX A;  2FT0 A;  1O7F A;  1RC6 A;  4MHD A;  1CM0 A;  4MX3 A;  1O3R A;  2VXK A;  1UD1 A;  4XNH C;  4Z82 A;  2BYV E;  1CJW A;  2G3A A;  3JZV A;  2F5I A;  5H86 A;  1S60 A;  4HLT A;  1QXJ A;  4IEZ A;  1VR3 A;  2X7B A;  2BNO A;  4KOR A;  4HMZ A;  3S7E A;  4KVM E;  1CAW B;  5BPX A;  5J8C A;  1S7F A;  3IDB B;  3RYK A;  4XPD C;  5K8S A;  4FD5 A;  1XF8 A;  3R6S A;  4MY0 A;  1NZC A;  1I12 A;  2FL4 A;  2P6F A;  2AE6 A;  4DNC A;  3D0J A;  2Y0O A;  2CV6 A;  2IC1 A;  1ON0 A;  1YK3 A;  4PK2 A;  4R57 A;  2HV2 A;  3V8I A;  4PSW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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