4AVCA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 in complex with acetyl coa and camp
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
TGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSARVPSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
total genus 77
structure length 326
sequence length 326
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avcA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avcA02
5FPXA 4HNXB 5BXXA 4XPDB 4B29A 4PIZA 5K8SA 3E6DA 4JXRA 5J8FA 3D82A 3MDPA 2K5TA 4WBBA 1LKNA 1LRZA 2JEVA 2DXQA 2PA7A 1NXMA 1UW8A 3EQEA 4HNWB 4D7SA 5F46A 4LA3A 2V09A 2KXLA 1NE9A 2PQQA 3S6HA 3BJ8A 4QC6A 3W6XA 1XE8A 5FDBA 5IX3A 3WW1A 2ZW6A 2BL1A 2BGCA 4MZUA 2XGXA 1Z4EA 2BSWA 2EUIA 3PNAA 1S60A 2VEZA 3VHRA 4KWJA 2IXHA 1Z4RA 3SHPA 1Q5OA 3CEWA 5J48A 5E96A 3TFYA 4LUAA 1GQGA 2O8QA 5I91A 2ZW7A 4J3GA 1JUHA 3HQXA 1J3RA 3DN7A 1EP0A 4AG9A 2ET7A 1M44A 2OZUA 4X5KA 4MX3A 2GC3A 2EVXA 3U11A 1I1DA 1TQ5A 3DR6A 1QXJA 4XNHC 3TO6A 5JSRA 1CAVA 2F4PA 5KHJA 3L2HA 2P6GA 2VQYA 2CNTA 1ZX5A 4O9EA 4AVAA 1KUVA 2REFA 2ATFA 3F5BA 3FIXA 5I8YA 5EC4A 1G6NA 2CAVA 3GY9A 2VZYA 3TO9A 1ZZ7A 2IC1A 4CAWA 1H1MA 2F5IA 3H3UA 4KU7A 4U5YA 5FLHA 1MJAA 4KWLA 3E6BA 2P6EA 4R3LA 2RC4A 3TO7A 3E5UA 4L8AA 4ORFA 4R52A 2XHKA 4OADA 2GC2A 4ZU5A 3RDIA 2P0WA 3CLPA 1ZZ9A 2ETEA 4KU8A 4EVYA 2ZW4A 4IEUA 4PK2A 2GH2A 5FLJA 3U0ZA 2Z2SB 1Q2DA 2OB0A 3G8WA 4QVTA 1GQHA 2HQYA 1XEBA 4IEXA 4IUSA 1CAVB 2Q0AA 1L3JA 4XF3A 2Q30A 4R87A 4EWAA 1WK4A 3SXOA 2IXIA 3EJKA 3I3GA 2IXCA 5T3NA 1YFUA 4IERA 5I8TA 1IPJA 3OCPA 3SCHA 3MGDA 3IDCB 4UBHA 4QX5A 5KHGA 5J8CA 4AQ2A 2B4DB 2ZXVA 1Y9QA 3R96A 3PP9A 1SEFA 3FNCA 1UPIA 4ONUA 2FXFA 4UA3A 4YGOA 1YR0A 4IEQA 5KBFA 4MJ8A 3DV8A 4AG7A 2XLAA 2Q44A 4H89A 2G3AA 1Z9UA 2OZ6A 1S7LA 2OH1A 1YHFA 4JTOA 1O3SA 2PTMA 2FMYA 3QOPA 3N4MA 4XFGA 2PSWA 3S6KA 1N71A 4MGYE 1UIJA 4MGKE 1VHSA 1YWKA 3R6SA 3BPZA 3E6CC 3M70A 1QXRA 4Y49B 3VWEA 3V8IA 4XF4A 1XF8A 1O3TA 5JQ4A 2BYVE 5E16A 3SXWA 2OPKA 2CGPA 4IEYA 4YNIA 1BOBA 4FAHA 2PRBA 3S7EA 3CXQA 5HI0A 4QMAA 3EC4A 3LOIA 4MV2A 1NZCA 2E9QA 4NVPA 4L2NA 5LEKA 3CXPA 4E0AA 4CS0B 5DWNA 5I0RA 1YX0A 1IPKA 1V0CA 2D5FA 5EFUA 1ON0A 1Y3TA 4BYYA 1O3RA 2XKPA 2B5GB 2P17A 3FE5A 4ZBGA 4J1WA 1M4GA 4KLWA 3T9YA 4FBFA 2Q4SA 4KVOE 1OMIA 4IEZA 4JVAA 4YYOA 3E5QA 2FE7A 4QXKA 3JVNA 4H6ZA 4PSWA 1I6XA 3TOBA 2GAUA 4LTAA 2QDRA 4O9GA 4Q0VA 1MJ9A 4KUAA 5JPHA 1V70A 4FT8A 4AXOA 3NVCA 4I09A 4MGZE 5KTAA 4KOYA 4AB7A 5I8SA 1RXTA 4KOVA 3FX3A 5I0UA 2MPFA 2A4NA 1CAXA 1O5UA 3RNSA 1S7FA 3GYAA 3FRMA 3KSCA 1Y9WA 3EY5A 4IETA 3FBUA 3LA3A 1YFWA 4PV6A 4UBGA 3F8KA 3RYKA 5FQ0A 2QECA 2Z0ZA 3P2HA 1SFNA 2PAMA 1XE7A 4ZU7A 2FS5A 4FD5A 3GKRA 3R9FA 4MUVA 4QGLA 4AVBA 1M4IA 4QBJA 4L11A 4IF5A 4OAEA 2IXLA 4RD7A 4HKFA 3PLQA 3D3SA 1H1IA 2H5MA 2H6CA 5BUVA 4K30A 4IESA 4I3PA 4EROA 1M1DA 4CRZB 1YVOA 5ISVA 3ACLA 4Q29A 5J3UA 3CF6E 4HZFA 5JAXA 3RYRA 1YREA 4XFCA 2R1IA 3E0KA 2FL4A 4XPLA 2R7HA 4MGIE 1MK4A 1J3PA 5I93A 1PU9A 1QSTA 4XFFA 3ZZIA 4BMHA 5F48A 4WZCA 2QNKA 3SHRA 2AJ6A 1IYLA 1B6BA 5GCNA 3HT1A 1IB1E 2BEOA 4HVOA 4XPDC 3CXSA 1ZNPA 2WPXA 5LRSA 4KLVA 1O7FA 4KUBA 4YARA 3WW3A 2G0BA 3LZZA 4R8HA 1S3ZA 2VBQA 2Z10A 1J3QA 2VECA 1UFHA 2PHDA 3EFAA 1J4JA 4ZU4A 5KTCA 1S7NA 3W91A 1ZRFA 5C88A 4YRDA 4XF0A 1CGPA 3LD2A 4LUKA 1HW5A 4UXAA 4QM9A 4LX9A 3I7DA 2H0VA 2B5HA 1ZVFA 1QY4A 3SXNA 1PMIA 1WLTA 3S7IA 2PAEA 2PYTA 3OD0A 4I01A 2Q4VA 1VKCA 5FVJA 3DL3A 2BNNA 4QM8A 4UBRA 3F0AA 1X7NA 2VPVA 4KL1A 2HUZA 4U9YA 3S6GA 2UYBA 4XETA 1KZFA 3I59A 2WFPA 4I0BA 1DZRA 4WVZA 2UYAA 1OI6A 1ZRRA 3DNSA 1YUDA 2QJVA 3FJSA 2BNOA 3ELNA 3ES1A 3NKTA 5CU1A 5C8WA 3MZHA 3KMHA 1PUAA 2QMLA 2R98A 4MBUA 4B5OA 2ZKLA 4NF1A 4YFJA 3JUWA 1O5LA 2CAUA 5E1RA 4PSXA 2EA7A 3GYDA 3N7ZA 4GS4A 3KGLA 2OA2A 4FAGA 1QSMA 1XMTA 1VR3A 3GBFA 4KOWA 2D5HA 3WW2A 1U12A 4I02A 4XFHA 3CJXA 3H1MA 4JLYA 1ZRCA 1SQHA 1OD5A 3H9AA 4MH0E 4XEZA 4U9ZA 2UY9A 2PHLA 1QWRA 3D0SA 1RUOA 2EVNA 3WR7A 2VI7A 2VZZA 3K9UA 5JSOA 3I59B 2Z11A 2MHFA 3OWCA 1X82A 4AVCA 4HVQA 3BLNA 3U10A 4PIYA 3P2FA 1NSLA 3EO4A 3S6FA 2VXKA 4LLOA 3H7JA 1YVKA 3G3SA 3I54A 1FI2A 4MHDA 1RC6A 1CJWA 1Q2CA 5CADA 2HKXA 3LA2A 3RYOA 1U6MA 4II9A 4N9HA 4KWKA 4R9MA 1LR5A 1CAUA 3QACA 4IEOA 2BUEA 1NE6A 4XF9A 2BEIA 1OZPA 2FQPA 4E2QA 2PQ8A 3TOAA 1WA4A 2GE3A 2EAAA 3USSA 5JCTA 2I45A 5EZWA 2C27A 3IGRA 4H6UA 2HV2A 5KHIA 1UCXA 1ZZBA 3RPQA 2OZHA 1CAWA 1O4TA 1Q3EA 3RYPA 2Q1ZB 2ZCWA 1DGRA 3R9EA 2UY8A 3NL1A 2XLGA 1QSRA 3IIAA 2XL7A 1ZREA 2IL4A 3OGJA 2OZGA 1O3QA 1RGSA 2P6FA 3R95A 2QCSB 4LULA 1XE4A 2Y0OA 3PGPA 1K4JA 4KVXA 3ES4A 5FLIA 4XF1A 4M3SA 2Q4YA 1FT9A 2J8RA 1L0CA 1LB2A 3DDDA 3TNQA 4F7ZA 3H3ZA 4QGNA 4X6RB 4LUMA 1J1LA 4KOSA 3BJ7A 4R57A 4RI1A 5HMNA 3FFQA 4Q0PA 4PK3A 3TCVA 1I5ZA 3DR8A 2G3TA 4BHPA 4AQ6A 4YRHA 4Y49C 3NSTA 4HLTA 3FHIB 1KUXA 1CAWB 3B02A 1TIQA 2O28A 4XFAA 5FPZA 4HSJA 3HIFA 4CYDA 5LEJA 2CNMA 4L89A 1X8EA 3O14A 3SCFA 1VP6A 4UWJA 3S0MA 3BU7A 4KORA 4NEXA 2ATRA 3VWDA 1FY7A 5H84A 4JV4A 5CVRA 3R1KA 5F47A 1UD1A 4GULA 3UKVA 2B9UA 4PIXA 4XFIA 1QSNA 3IWGA 4QUSA 2CV6A 2Q7BA 1RL3A 3UKNA 2VQAA 2D4PA 2ARHA 3PZJA 3TT2A 1XIXA 3NE7A 1PM7A 5I0SA 2Q04A 4MI4A 3SCGA 1IYKA 2NMTA 3OF1A 2B3VA 1CAXB 3BALA 4Q0QA 1B87A 3DSBA 1NMTA 4YSFA 4MY0A 2I00A 2O1QA 1ZZ8A 1BO4A 3LAGA 2K9ZA 3KKWA 3BCWA 4KVME 5FQ0B 2J8MA 1P0HA 1R57A 4E2GA 1IIDA 4E2AA 2B3UA 3TTHA 4J1XA 3BB6A 4HN0A 2J8NA 5BPXA 2GC0A 2HJIA 5LRRA 1J59A 1VJ2A 5H86A 1ZZCA 2XLFA 3H8UA 4R3KA 4RS2A 2GU9A 4BIFA 3IDBB 5C6CA 4JJXA 4PJYA 5BY5A 2FIAA 3ROUA 4XPKA 3ST7A 1P4NA 2OZJA 4I0AA 4F0YA 3D8PA 3T90A 2R8VA 1FXZA 2PR8A 4NCZA 4FD4A 2XKOA 4A2UA 1M4DA 3EHKA 4LA2A 4DINB 4KOXA 3EXNA 2D93A 3E97A 4HSLA 1S5KA 4K8FA 2JDCA 3TNPB 2REEA 1SQ4A 2K0GA 3D2PA 3FYNA 4Z82A 2JLMA 4EWEA 3NJZA 2ZW5A 4MY3A 3CL1A 4HMZA 4IEWA 1RTVA 1XRUA 2ZPAA 2N7GA 3OTFA 1RO5A 4E8OA 1GHEA 4JD6A 2B4DA 1Q43A 4CAVA 3TE4A 1X8MA 3ZDSA 3ZJ0A 2PDOA 3ETQA 3H1WA 5KTDA 3MPBA 2PR1A 1DZTA 3QB8A 4CAXA 1I12A 3R9GA 3IBMA 1NE4A 1Y7RA 2CNSA 3FXTA 3I9SA 3KCCA 4JXQA 5JR7B 2B58A 2QVSB 4KZTA 2Q0YA 1Y9KA 3JZVA 2Y0MA 1WWZA 2FCKA 4HNYB 3LWCA 4NSQA 4B5PA 3CO2A 2DCTA 3FWEA 4E2SA 5JSPA 1KUYA 5CNPA 4OLLA 1Q2YA 2AE6A 2IXJA 5FCCA 5F1RA 5J7MA 3RZZA 4P9GA 3PVBB 4QGMA 5I0TA 5I0CA 3D0JA 4FD7A 1CX4A 1ZZ6A 5D1IA 3M3IA 4XFBA 2FT0A 2KCWA 1WGPA 5F49A 3G7DA 3IWZA 1YLEA 4HN1A 1DGWA 5KHKA 4EWDA 2GANA 5IV0A 3W6SA 2QIRA 1YK3A 4CRYB 3UY5A 3EBRA 2H6BA 5DWMA 2B5GA 3C26A 1ZRDA 4B5PB 3C3VA 3B8GA 3FB3A 1J58A 4M85A 4X6QB 2MNGA 2FIWA 4I2OA 2OYZA 4IEPA 4DNCA 2BNMA 2XL9A 1CAUB 3HT2A 2B4BA 5IB0A 4META 5EBVA 2PFWA 2X7BA 3MYXA 4TLFA 4Z07A 2IXKA 4BH9A 4Q0UA 5BV6A 1EYBA 5KHHA 1MJBA 3QAHA 4JWPA 2PC1A 4KOUA 4KOTA 1NYWA 4F6AA 2WC2A 4HBNA 4UWIA 2D4OA 1YLLA 3NW4A 4FD6A 4EV0A 1S7KA 2GIVA 2WPWA 3LODA 2JDDA 3LA7A 1YGHA 2CY2A 4I49A 3H1YA 2I79A 2Z69A 1YFXA 2OU2A 1LRHA 3KGZA 2GC1A 3SMHA 4QB9A 3FZ3A 1RUNA 2D40A 1OFNA 2ET1A 1IICA 3D2MA 2PAKA 4N9IA 1UIKA 2FSRA 3UKTA 5HH1A 4F8AA 3H7YA 2C0ZA 3DKWA 4LEJA 1EPZA 1CM0A 4IEVA 4Q0SA 1YFYA 3H50A 5C82A 4JTNA 4D7TA 4OFGA 3WW4A 4NXYA 3EO6A 5AVPA 3H4QA 2B8MA 1EY2A 4H7LA 1I21A 4HVRA 3E5XA 1QSOA 2GZWA 4XNHB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5A80A 2IFWA 4XPDB 3I2JA 5BYNA 2L9LA 4WVVA 2WIIB 2DXQA 2EXJA 2RS31 1CZVA 1DHKB 1OKQA 1FMD1 4XCAA 1S0BA 1QQP3 2B46X 4MZUA 2WNVB 4CYPA 2EUIA 4L9BA 1AR81 2J42A 4KG0A 1F57A 4DEVA 2O8OA 5A3LA 4Q4V3 2Y6HA 1SLAA 1QXJA 2WZR2 5EPAA 1H2KA 4P02B 2PJ8A 4AQTA 1SLBA 2EF6A 4D6QA 1IU8A 4L8AA 2RS52 4OADA 4AFBA 1C3HA 2ZW4A 3TTHA 3D67A 2Q0AA 2HC9A 3I3BA 5T3NA 1ASJ2 2Q1MA 5ACA2 5JXHA 1C8M1 4RR3A 4CGLA 2OPWA 4ZI6A 1O3SA 4JDMA 5SV8A 5JUVA 4XFGA 2R073 4XF4A 1O3TA 3WQ1A 3FC0A 2PRBA 5IAXA 5JWPA 2HWE1 2XEJA 1RUF2 4LIVA 1LU1A 1M4GA 4UW3A 2C6CA 1XOVA 3VD4A 4AI0A 1V6KA 4ZXKA 1JU4A 4MGZE 5A1FA 1N1TA 4A95A 1FOD2 1GR3A 2OT7A 1W3VA 3VHPA 3QAYA 5C33A 2DUQA 1RUJ2 1UZZA 2DPTA 3NV2A 4WM8A 2Y60A 1L7RA 1XB9A 4CGOA 3GLJA 3ILRA 4BMHA 1DQ4A 2DURA 5FMOL 5AFEA 1OURA 5C88A 1UZYA 4XHXA 4JGZC 2B5HA 3DECA 5F9TA 4GAZA 2PIZA 4LHKA 5I4MA 3OD0A 1S2BA 4MYEA 2Q4VA 3BXMA 4ZY2A 1SPPA 4XQ4A 4NE9A 4COYA 2D7FA 1QJFA 2QUOA 1PUAA 1YIPA 4TZDA 2OXBA 1RTQA 4XZPA 4NRPA 3GF6A 1OD5A 2PHLA 2VZZA 4BQWA 3TWIA 4QWNA 5FUPA 1KITA 2ZS6B 1LR5A 1CAUA 3LMSA 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4N43A
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5FPX A;  4HNX B;  5BXX A;  4XPD B;  4B29 A;  4PIZ A;  5K8S A;  3E6D A;  4JXR A;  5J8F A;  3D82 A;  3MDP A;  2K5T A;  4WBB A;  1LKN A;  1LRZ A;  2JEV A;  2DXQ A;  2PA7 A;  1NXM A;  1UW8 A;  3EQE A;  4HNW B;  4D7S A;  5F46 A;  4LA3 A;  2V09 A;  2KXL A;  1NE9 A;  2PQQ A;  3S6H A;  3BJ8 A;  4QC6 A;  3W6X A;  1XE8 A;  5FDB A;  5IX3 A;  3WW1 A;  2ZW6 A;  2BL1 A;  2BGC A;  4MZU A;  2XGX A;  1Z4E A;  2BSW A;  2EUI A;  3PNA A;  1S60 A;  2VEZ A;  3VHR A;  4KWJ A;  2IXH A;  1Z4R A;  3SHP A;  1Q5O A;  3CEW A;  5J48 A;  5E96 A;  3TFY A;  4LUA A;  1GQG A;  2O8Q A;  5I91 A;  2ZW7 A;  4J3G A;  1JUH A;  3HQX A;  1J3R A;  3DN7 A;  1EP0 A;  4AG9 A;  2ET7 A;  1M44 A;  2OZU A;  4X5K A;  4MX3 A;  2GC3 A;  2EVX A;  3U11 A;  1I1D A;  1TQ5 A;  3DR6 A;  1QXJ A;  4XNH C;  3TO6 A;  5JSR A;  1CAV A;  2F4P A;  5KHJ A;  3L2H A;  2P6G A;  2VQY A;  2CNT A;  1ZX5 A;  4O9E A;  4AVA A;  1KUV A;  2REF A;  2ATF A;  3F5B A;  3FIX A;  5I8Y A;  5EC4 A;  1G6N A;  2CAV A;  3GY9 A;  2VZY A;  3TO9 A;  1ZZ7 A;  2IC1 A;  4CAW A;  1H1M A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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