4AVCA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 in complex with acetyl coa and camp
Total Genus 77
5010015020025030001020304050607080
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
TGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSARVPSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
TI1 (19-22)3H2 (26-29)S6 (101-106)AH1 (30-34)EMPTYS1 (36-38)TII2 (42-45)S3 (56-62)AH2 (89-94)S2 (45-48)S4 (64-70)AH4 (127-139)S5 (76-81)TIV2 (86-89)S7 (109-114)TIV3 (104-107)AH3 (115-119)3H3 (120-123)TII3 (124-127)S8 (148-149)3H5 (195-199)TI3 (150-153)S9 (155-156)AH5 (163-171)TI5 (230-233)S12 (218-226)S11 (207-213)TIV5 (203-206)TI4 (227-230)TIV7 (213-216)TVIII2 (228-231)S13 (233-240)TII4 (244-247)3H6 (242-244)AH7 (249-264)TI7 (285-288)3H7 (279-282)S14 (268-271)TI6 (274-277)TII6 (307-310)TIV10 (308-311)TIV11 (314-318)3H1 (12-15)TI2 (49-52)3H4 (140-142)S10 (159-160)TIV8 (214-217)TIV9 (282-286)S16 (298-304)TII1 (21-24)TIV1 (71-74)AH6 (178-185)TIV4 (192-195)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
total genus 77
structure length 326
sequence length 326
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avcA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avcA02
4HLTA 4UXAA 2IXKA 4HN0A 1Z9UA 2DXQA 3TO6A 2XGXA 2GZWA 4E2QA 3R1KA 2QMLA 3H1YA 1I6XA 3E5QA 4BHPA 3EO6A 1UCXA 3LD2A 1KZFA 3D82A 3GY9A 2Y0OA 3R6SA 2AE6A 4OAEA 3HT2A 4IEOA 3JUWA 2R8VA 4UBHA 3M70A 4QXKA 3G8WA 4M85A 3H7YA 3CF6E 2QCSB 1X8MA 4Y49C 2QVSB 1XIXA 4I02A 1I12A 3KGZA 1S60A 3FHIB 3R9GA 5KHIA 4II9A 3OD0A 3NL1A 1YVKA 4HKFA 4KOWA 4MV2A 4F6AA 3ACLA 4QGMA 1OZPA 4H89A 2PAEA 4AG7A 2P0WA 3F5BA 4JXQA 3H3ZA 4YARA 2Z2SB 3LWCA 4Q0VA 1L3JA 1RXTA 1Q43A 4IEYA 2QJVA 4XETA 1X7NA 2OZHA 3DKWA 4EROA 2PC1A 1O4TA 2O8QA 3RDIA 1Q2YA 3LAGA 1XE8A 5FQ0A 4XFHA 3L2HA 2OZ6A 1GQGA 3H1MA 4AQ2A 3KKWA 4LTAA 3USSA 3UKVA 2JDCA 4YSFA 2BNNA 2BYVE 2H0VA 2OPKA 2Q0AA 3CLPA 2VZZA 4HNXB 4MBUA 2GU9A 2WFPA 1K4JA 1H1IA 3SXNA 3DN7A 1FT9A 2QDRA 4META 3EY5A 5JQ4A 5FLIA 2PTMA 3PLQA 2H5MA 4LX9A 4DNCA 1KUVA 5J8CA 4JD6A 4TLFA 5FQ0B 4PV6A 2PQQA 2K9ZA 3OGJA 2OZGA 2GC1A 1J58A 2UYAA 1Q5OA 3BALA 2Q4VA 3TO7A 3VWEA 2BNMA 5JSPA 4QX5A 3PZJA 1J1LA 2Q44A 2RC4A 3HQXA 4J1XA 5JSOA 2EVNA 5HI0A 3ZDSA 4ZU5A 2ATRA 1VP6A 2I45A 3IDCB 1I1DA 4B5PA 5JAXA 1RGSA 4IEWA 1XEBA 1YX0A 2PR1A 2BSWA 1Y7RA 2XHKA 1M4IA 2XL9A 3C3VA 4R52A 3LA3A 4MI4A 2FL4A 3QAHA 3D2PA 5C8WA 5I0RA 4FAHA 1B6BA 2BNOA 4X6QB 2H6BA 4EVYA 3PNAA 1YFUA 2UY9A 2XLAA 4Q29A 3U11A 1IIDA 1QSMA 2FCKA 4U5YA 3PP9A 4B5PB 4MZUA 4O9EA 2E9QA 2EAAA 1FY7A 1LB2A 5C88A 2IL4A 1M4GA 1J3RA 3P2HA 5IV0A 4R57A 1ZVFA 4JTNA 1SEFA 3QB8A 3SMHA 3FXTA 4QUSA 1I5ZA 5GCNA 3IWZA 5H86A 4RI1A 4CAXA 4ONUA 3SCFA 5EBVA 4NF1A 1NZCA 1TQ5A 4I49A 4QGNA 2F4PA 4MGIE 3E5UA 3R95A 1KUXA 2Q30A 5CU1A 3ES4A 3RNSA 3EQEA 4AB7A 5D1IA 5E1RA 2OYZA 4AVAA 2J8MA 4AVCA 3EHKA 4KL1A 4N9IA 1ZRRA 4KWKA 2X7BA 4PSXA 1DGWA 4PIZA 3RPQA 4F7ZA 3BB6A 2XLGA 1CAUB 2Z69A 2ZCWA 1IYLA 3SXWA 2B5GA 4UWJA 3LA7A 1ZZ7A 2C0ZA 1LR5A 4L11A 4PK2A 3DSBA 3ES1A 1Z4EA 4BYYA 3E6CC 5KTCA 3GBFA 2D4OA 1FXZA 2D40A 2GANA 4FD5A 4I09A 3TCVA 1WLTA 3WR7A 4NSQA 5C82A 2BEIA 1ON0A 2PDOA 2GC3A 3R9EA 2PYTA 3D3SA 5IB0A 4B5OA 3LA2A 1VHSA 2K5TA 3D8PA 2B5GB 5FCCA 4LUMA 4PIYA 2FE7A 2PHDA 2JLMA 3G3SA 4GS4A 3FRMA 4FAGA 2B3UA 4EWAA 2CNTA 1UW8A 1YHFA 2WC2A 4XPKA 4IETA 1NE4A 5JPHA 2OB0A 3OCPA 2NMTA 4QMAA 1NYWA 1Z4RA 2I00A 3EFAA 1JUHA 4UBRA 3E0KA 3H4QA 3IWGA 5I8SA 1M4DA 4MY3A 1ZNPA 3HIFA 4MGZE 1Q2CA 2OH1A 2R1IA 4X5KA 5BXXA 4J3GA 4IEXA 2P17A 2XLFA 2B3VA 1QSRA 1M1DA 2VZYA 3JVNA 5F47A 5E16A 1J3QA 4E2GA 5KHGA 4I3PA 3U10A 1CJWA 1S3ZA 3S7IA 2ZW7A 1VKCA 2GIVA 1UD1A 5I0CA 2ETEA 4YNIA 3UKTA 2ET1A 2B9UA 2J8RA 1X8EA 4KLWA 4H7LA 4LLOA 2D4PA 5FPXA 5ISVA 1YFYA 4I2OA 4L2NA 2R7HA 4P9GA 1QSTA 1WK4A 1VR3A 4WVZA 3K9UA 2Q7BA 3KMHA 5FVJA 2V09A 3B02A 2IXCA 4XFIA 4XFCA 5BY5A 1XE4A 2JEVA 3SCHA 1O7FA 5BUVA 1J3PA 2FIWA 4LA3A 5FPZA 4FD4A 1DGRA 4A2UA 5C6CA 1P4NA 4AXOA 4Q0UA 1CGPA 2B4DB 1TIQA 2I79A 3SXOA 3FX3A 3GYDA 5BV6A 4R87A 4KU7A 4LEJA 3RYPA 1OFNA 5LEJA 4J1WA 5EC4A 2VXKA 1QXRA 2FT0A 5K8SA 4QC6A 3DL3A 3FZ3A 3IDBB 1N71A 5FLHA 4EV0A 2CAVA 5J48A 2VBQA 4LUAA 3EO4A 1QWRA 2KXLA 4HVOA 4WZCA 3RYRA 1SQ4A 4JJXA 3F8KA 2ZW5A 1RO5A 4LULA 4KOVA 3NKTA 1H1MA 3BJ7A 2OZUA 4KOUA 3O14A 5EFUA 1CAXA 2IXLA 4HSLA 4OADA 5I0TA 3W91A 4KUBA 4U9YA 2PQ8A 4JWPA 4IEZA 1J59A 1P0HA 3CL1A 4X6RB 3WW1A 1RC6A 2D93A 4BIFA 2FSRA 5DWNA 4Z07A 5BPXA 5CADA 1IB1E 1IPJA 3EXNA 4KVXA 5KBFA 5FDBA 3CXPA 4L89A 3EBRA 2HKXA 2EUIA 4H6ZA 1RTVA 4YGOA 4KUAA 1CAXB 4IEUA 3DV8A 4ZBGA 2BEOA 2G0BA 4E2AA 5IX3A 1QXJA 2Y0MA 2PAKA 2FXFA 4KORA 3TO9A 4Q0PA 2PFWA 2VEZA 4MHDA 3FJSA 1YFXA 3H50A 4I0AA 1OI6A 2ZW4A 1O3RA 4XFGA 5I8YA 5DWMA 1IICA 2KCWA 2P6GA 2FMYA 4MJ8A 1PMIA 1S7FA 1Y9QA 4FD6A 3SHPA 1IYKA 4QBJA 1MJAA 4FT8A 3FBUA 1O5LA 4JTOA 1KUYA 1ZRCA 1LRZA 4XF3A 2J8NA 2MNGA 4Z82A 5LEKA 4MGKE 3WW3A 1CAUA 5I8TA 3GKRA 4HNWB 2QNKA 5KTAA 2B4BA 2CV6A 3JZVA 3BLNA 4M3SA 5E96A 1ZREA 4BH9A 1NE6A 3S6KA 3TOAA 3MDPA 3RZZA 4XFBA 2EVXA 1DZTA 4O9GA 2FS5A 2ET7A 2PR8A 3S7EA 2Q1ZB 4XFAA 4MY0A 1J4JA 5KHHA 1XF8A 4F8AA 4H6UA 3QOPA 4OLLA 1QSNA 4RS2A 4K30A 2MPFA 3T9YA 3IBMA 2PA7A 1XE7A 5I0UA 2B58A 5LRRA 1DZRA 2H6CA 1MK4A 1O3TA 3WW4A 3P2FA 4YFJA 1YLLA 4GULA 2D5FA 4MUVA 1CAWA 2DCTA 4Q0QA 2GE3A 1O5UA 1MJBA 2Q0YA 4IUSA 1B87A 1WGPA 4IEQA 2REFA 4KOXA 3I9SA 2EA7A 3W6SA 4JV4A 4XPDC 2IXHA 4FBFA 5LRSA 3H1WA 3ELNA 2P6EA 4I0BA 1CAVA 3E6BA 2HJIA 2PAMA 3LODA 5JCTA 1YR0A 4MGYE 4PSWA 4KOYA 3ETQA 3WW2A 3MZHA 1CAWB 1UPIA 4MH0E 4WBBA 2QIRA 4OFGA 4N9HA 2GC2A 3ROUA 1PU9A 2PRBA 2PSWA 3CXSA 3T90A 4CYDA 3VWDA 4AQ6A 2CAUA 2XL7A 1V70A 2C27A 2CNSA 3ST7A 4EWDA 1CAVB 4E0AA 4CRZB 2G3TA 2Z11A 2VECA 4XF9A 1CM0A 4UBGA 4KWLA 2F5IA 5T3NA 1L0CA 3MGDA 1NXMA 1IPKA 1UFHA 4K8FA 1NMTA 1U6MA 3OF1A 3U0ZA 3M3IA 1SQHA 4HVQA 1LKNA 4KLVA 5KHJA 3LZZA 3KCCA 4JLYA 2B5HA 2OU2A 1EY2A 3EC4A 4YYOA 4CRYB 4QM8A 4XEZA 2Q04A 2WPWA 1YWKA 1S5KA 4XF4A 2ARHA 3OWCA 3OTFA 1RL3A 4HBNA 4U9ZA 2FIAA 3W6XA 3LOIA 4R3KA 2CY2A 3ZJ0A 4R8HA 2HUZA 3H9AA 2O1QA 1YVOA 2XKPA 3RYKA 1M44A 3GYAA 4XPDB 2ZKLA 3FE5A 5F1RA 3FYNA 1UIJA 4QM9A 4XNHC 3CEWA 4HZFA 2OA2A 3MYXA 2AJ6A 3KSCA 2A4NA 3N7ZA 4AVBA 1ZZCA 3HT1A 3H7JA 3V8IA 3TFYA 2IXJA 2Q4SA 3MPBA 1SFNA 3E6DA 3TNQA 4KU8A 1ZRDA 1FI2A 2IXIA 1OMIA 2GC0A 4BMHA 3R96A 1VJ2A 1XMTA 2GAUA 2CNMA 5F48A 2XKOA 1V0CA 3QACA 4ZU7A 1OD5A 4D7SA 3F0AA 4NCZA 2VI7A 3S6HA 5AVPA 5JSRA 4UA3A 2PHLA 3D2MA 3PGPA 2B8MA 2Z0ZA 2IC1A 4L8AA 1GQHA 3FIXA 1XRUA 3SHRA 1UIKA 2BUEA 1NSLA 5H84A 3N4MA 5F49A 3E97A 3NW4A 2UYBA 3D0SA 3FWEA 3NJZA 4YRDA 5HMNA 4F0YA 4UWIA 5F46A 5HH1A 3D0JA 4IF5A 4QB9A 1ZZ8A 4MX3A 3B8GA 3S6FA 5FLJA 5KHKA 1I21A 2VQYA 5CNPA 4KOSA 1O3QA 3R9FA 1HW5A 3S0MA 3FNCA 4B29A 4I01A 4KOTA 2ZXVA 1PUAA 4NVPA 4XNHB 2WPXA 2BL1A 4Q0SA 4EWEA 4R3LA 5J8FA 2R98A 4IESA 1R57A 4PIXA 1S7KA 2ZPAA 4XFFA 1MJ9A 4CAVA 3CJXA 1WWZA 4HN1A 3I59A 3S6GA 4ORFA 2Q4YA 1BOBA 4HNYB 2JDDA 4Y49B 5JR7B 1WA4A 2D5HA 4IEPA 4KVME 4ZU4A 2REEA 1S7LA 2MHFA 4KZTA 2FQPA 4JXRA 1YUDA 2GH2A 1RUNA 3ZZIA 1GHEA 4IEVA 4KWJA 4LA2A 3I7DA 1Y9WA 3KGLA 3TTHA 3BU7A 3I59B 3NVCA 3BCWA 3NSTA 2BGCA 4XF1A 3BJ8A 1BO4A 3TE4A 1YFWA 3H3UA 3IIAA 2ZW6A 5EZWA 1EPZA 3BPZA 3I3GA 3DR6A 4CS0B 4RD7A 3VHRA 1Y9KA 4D7TA 4JVAA 5I93A 5KTDA 1ZZ6A 4LUKA 3IGRA 2P6FA 1ZZ9A 1YK3A 1YREA 3DDDA 1LRHA 3CO2A 3UKNA 5I0SA 3PVBB 2O28A 4NEXA 2VQAA 3FFQA 3TOBA 1CX4A 2N7GA 3DR8A 4PJYA 4QGLA 5J7MA 1O3SA 4QVTA 4XPLA 4CAWA 1G6NA 2VPVA 4HSJA 1EP0A 2ATFA 4IERA 1QSOA 3FB3A 3H8UA 4AG9A 2UY8A 3SCGA 2CGPA 4FD7A 3DNSA 1PM7A 4PK3A 1U12A 3EJKA 2Z10A 5CVRA 1NE9A 5I91A 4XF0A 4R9MA 1RUOA 4HVRA 3NE7A 2OZJA 2K0GA 1EYBA 1ZX5A 4DINB 2B4DA 4E8OA 2HQYA 4NXYA 1Y3TA 1Q2DA 2HV2A 3CXQA 3TNPB 1QY4A 3E5XA 3I54A 4E2SA 1YGHA 1ZRFA 4KVOE 4YRHA 1ZZBA 1Q3EA 3G7DA 3RYOA 3C26A 4HMZA 1YLEA 3UY5A 2G3AA 2QECA 5J3UA 1S7NA 1X82A 3TT2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GHNA 4EN0A 2DXQA 5F3EA 3J7HA 1VHEA 1VBD3 5CKNA 1MQTC 3H3LA 3AVSA 1HB2A 4QKDA 4AEKA 1N3OA 4LMFA 3WR0A 2Z4FA 2Z5WA 1C57A 2JG8A 4Q1PA 5HVHA 2J22A 4Q0VA 1W8FA 4MFPA 5FYUA 1XE8A 2RS52 5HXMA 4LTAA 2PJ3A 2OPKA 1OOPA 4ASKA 3EY5A 4MFLA 3M8LA 1RVF2 4LX9A 2WQZC 4XIKA 3VL8A 1VBA3 1J1LA 2R043 2YBSA 1ZLHA 1ASJ3 3WC7A 2PR1A 1ZBE3 1U5IA 4AAXA 2A73B 4JQRA 1I3HA 2UY9A 2NM1A 5A7WB 4Q29A 1AL22 4IK2A 2VR4A 4O9EA 2IL4A 1J3RA 4LK6A 4COWA 1I5ZA 1ZRIA 1YQCA 1UAIA 4MGIE 3GF6A 5C3QA 2Z69A 2B5GA 4UWJA 5FPBA 4UFLA 3OBTA 1FV2A 5LATA 4FOQA 4NAMA 3WV6A 4OHZA 5JPHA 1JBCA 2E6VA 1OLMA 2OH1A 2BV4A 4X5KA 3LEGA 1QSRA 5F47A 3PB7X 3PBBA 1J3QA 4Y3OA 1BK1A 1VKCA 1O8SA 4FOWA 4AGRA 1Z2LA 3AYAA 5FPXA 2ENRA 5F37A 1RUE2 5ACA3 1W2OA 4P5YA 3WNMA 1FMD3 1VRH1 2ZGOA 4AW7A 1VBE2 2A75A 1VBC3 4GXHA 4P9LA 1QQP1 1REDA 2R0HA 3IDBB 1QIQA 4CCDA 5FZMA 4A32A 4AEDB 5K8NA 5CKQA 1MACA 3MFAA 4NPMA 1RMU3 4CA9A 2HWD1 4P10A 4S2GA 4K21A 5CADA 2WWUA 5HCAA 1UXZA 3K9TA 1RXGA 1BBT2 2G0BA 4XMIA 1ND3B 4MHDA 2HWE1 3J8F3 4CXWA 3AL6A 2GLFA 2JBKA 1R083 3WT3A 3IMMA 4QQOA 3WW3A 4HNWB 1JN2P 5F6LB 5JXJA 3DGTA 4KS9A 1NE6A 1DDLA 4XVHA 4XFAA 3PRTA 1M4LA 1J4JA 1KEXA 3K3NA 5A6YA 1YI9A 2Z3KA 4YFJA 3FMCA 2WAOA 5F8PA 3OJBA 1DQ0A 2JJ6A 1S0GA 3E6BA 1KXGA 3PU3A 4A38A 4MCRA 3T90A 5JIUA 3OOXA 4GWJA 2Z11A 2CL2A 4IQPA 4QDSA 4CP0A 1AR93 3M3IA 4GB31 4HVQA 3HR9A 2BOAA 2VVEA 3NAPA 3ZSMA 1RUC2 5A7PA 1RL3A 3LOIA 4R8HA 1CWPA 4Q26A 4JGYB 3I97A 4XACA 2GFQA 4CP1A 1Z0HA 4V1PA 2C6PA 1QKQA 5EJ3A 3H7JA 2D6MA 4KU8A 4NHXA 5ANNA 3LIHA 1GSLA 2JDKA 1QJEA 2CIJA 1MS1A 1B35B 4D7SA 1H9PA 2B8MA 3RZLA 4AFBA 4OYUA 4PLNA 1VALA 3IU1A 5H84A 1AXZA 3MIGA 4FPFA 4BA6A 1UMHA 1W2TA 2C6CA 4QDRA 2XVLA 3R4SA 5FP9A 4AXVA 3ON7A 4YW3A 5T5JA 5CFCB 2VZUA 1S7KA 2W1WA 4XFFA 3S6GA 4ZXKA 2B4KA 2TNFA 3CZJA 1DQ2A 3AZVA 4N7IA 2FBEA 4IEPA 1H4HA 4JXRA 2HWC2 1RUNA 4CYOA 1PX3A 4QB6A 3KR5A 4R6TA 3I59B 3V38A 1HRV2 1HKDA 1YFWA 1C8NA 2VZTA 3H3UA 2UURA 1GWLA 1FV3A 2QQOA 2P6FA 1W2UA 3KV4A 5C5TA 1VAVA 1G6NA 4HSJA 2OZJA 2OW4A 4E8OA 4UI9L 2B4DA 4EJRA 3BOWA 4M6HA 4MO3M 1QJX2 1NCQA 3BHXA 1WW6A 2VNVA 3OEAA 1W6QA 4QHBA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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