4AVCA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 in complex with acetyl coa and camp
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
TGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSARVPSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 77
structure length 326
sequence length 326
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avcA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avcA02
4XNHC 3H1MA 3NJZA 4CAWA 4EWDA 1M4DA 1YVKA 4MGIE 4N9IA 3F5BA 3S6KA 1O5UA 3JVNA 2IXKA 4I3PA 2ZPAA 3QAHA 1Z4EA 1ZRCA 3BPZA 4QM8A 2ZKLA 5EC4A 3H7JA 1ZZBA 2PAMA 1UPIA 3L2HA 3TT2A 2K5TA 3BJ8A 3VWDA 3DSBA 1QXJA 4IEUA 1O3QA 4KU8A 3WW3A 5J7MA 2BNMA 4D7TA 2HQYA 4QC6A 4DNCA 5BXXA 5CU1A 2J8RA 5JPHA 3CO2A 3LODA 4KORA 3UKNA 4IEOA 1NSLA 5FLIA 2J8NA 3RDIA 1QSMA 2Q7BA 4PIXA 1YGHA 3EY5A 4GULA 1FI2A 4HSJA 5J3UA 4HZFA 3DR8A 3SMHA 1H1MA 1CAVB 3N4MA 5BY5A 1YREA 3W6XA 4IEWA 2UY9A 2D4PA 2N7GA 3FB3A 4EWEA 1LB2A 2Q30A 2D4OA 2H6BA 4LLOA 3IDCB 1IIDA 3B02A 2VZZA 4MHDA 4XETA 1RUOA 1ZRDA 3PVBB 1XE8A 2H6CA 2GH2A 4QMAA 1FXZA 4BH9A 1Y9WA 4IEQA 1M1DA 4PIZA 4MUVA 2B8MA 2PAKA 3D3SA 1MK4A 4AVBA 3FZ3A 3EC4A 3S6GA 3QB8A 1UFHA 5FPZA 1Y7RA 1YR0A 4Q0UA 5FCCA 2IC1A 5ISVA 5FQ0A 1BO4A 3I59A 1V70A 2P6GA 3ETQA 2B4BA 2R7HA 4HNWB 4NF1A 4HVRA 4AQ2A 4FD5A 2D5FA 1Q3EA 5CADA 3S6FA 5FPXA 5IV0A 2PAEA 4JWPA 4KZTA 3WW4A 1EYBA 4MBUA 4CRZB 1ON0A 4KUBA 3D2PA 5I0RA 2OZGA 5DWMA 3FYNA 2A4NA 1IYLA 3BU7A 4IUSA 3TO7A 5KTAA 2BL1A 1S7FA 4L89A 2CNMA 4QB9A 3HIFA 3ES1A 3T9YA 3TE4A 1U12A 2O8QA 3KSCA 3WW1A 5J8CA 4NCZA 4L2NA 5JR7B 3ROUA 2FQPA 2Z69A 3P2FA 3WR7A 3DV8A 3UKVA 2GIVA 2QIRA 4UA3A 2PTMA 1UCXA 4XF3A 3H1YA 4YRDA 4CAXA 3EO4A 4YGOA 3R9EA 4KWKA 3E5QA 3S6HA 4XPDC 3MDPA 4QGLA 2XL7A 3PNAA 1VHSA 4Q0VA 3GKRA 1CGPA 3DDDA 3KMHA 4B29A 5BV6A 1UD1A 2PHLA 2Q1ZB 2B3UA 3FXTA 4YFJA 1O5LA 4IEPA 5FLHA 3EXNA 3D0JA 2Q4SA 4KUAA 3KGLA 1MJ9A 2J8MA 2WPWA 4KL1A 3BALA 3M70A 3R6SA 1ZX5A 3EO6A 1CJWA 4FBFA 2IXIA 2VEZA 2O1QA 3I7DA 4A2UA 3EHKA 4XFHA 1RO5A 3WW2A 3F0AA 5LRRA 1VKCA 3DN7A 3SHPA 1M4IA 2F5IA 1P0HA 3LD2A 1IYKA 3ZJ0A 2VQAA 4IEXA 3NKTA 2B3VA 2BUEA 2P6EA 3ES4A 3HT1A 1SFNA 2QCSB 1YVOA 3BJ7A 3DL3A 2BEIA 5JQ4A 1QXRA 4P9GA 1O4TA 2JDCA 4UWIA 2CGPA 1XF8A 2Q4YA 1QSTA 1EPZA 1L3JA 2UYBA 4OFGA 4XNHB 5F47A 2P6FA 4KWJA 4MJ8A 4R52A 1OZPA 1WA4A 3LA7A 4LUKA 2GC3A 2ZXVA 5IB0A 1IB1E 2GC1A 4LEJA 5C88A 4BMHA 4IEZA 1YX0A 5KHGA 2D93A 1WWZA 2F4PA 2OZUA 1ZRRA 2B5GA 5LEJA 2D5HA 1X82A 4E2GA 2BGCA 3FIXA 4O9GA 1SEFA 3NE7A 1S7NA 3M3IA 5DWNA 4YARA 4I0BA 3I3GA 3S7IA 1YWKA 4XEZA 5J48A 2FIAA 3FWEA 1MJAA 3H8UA 2DCTA 3ST7A 1ZRFA 2B5GB 4E2AA 4ZU7A 1Q5OA 4ZU4A 4LUMA 3ZZIA 4JXQA 5J8FA 3ZDSA 3I54A 1YFYA 2PR1A 1M44A 1ZREA 3TNPB 2AJ6A 3S7EA 3TOBA 1KUYA 1CAUB 5E16A 1CAVA 3RYKA 1EY2A 4I0AA 3PP9A 4JV4A 4F6AA 2GC2A 2MHFA 1J1LA 3GBFA 4GS4A 1WK4A 4R3KA 5E96A 2XLAA 4AG9A 3LA2A 4QGNA 1B87A 5FDBA 3E0KA 2CV6A 4XFIA 1I12A 4MZUA 3GY9A 4IEYA 3D2MA 3TFYA 3R1KA 2FCKA 4TLFA 1GQGA 3ELNA 1OI6A 1VP6A 2CAVA 5F46A 2BEOA 4QX5A 3H3UA 1BOBA 2HUZA 5I0TA 4YSFA 4H6UA 1Q2CA 1B6BA 4Z07A 1RGSA 2XKOA 3U0ZA 2FT0A 4MV2A 1FT9A 5I8TA 4L8AA 3SXOA 2WFPA 5JAXA 3D8PA 1NE9A 4AQ6A 4U9ZA 1NXMA 2PRBA 4Y49B 5I91A 2KCWA 1S5KA 3P2HA 1Y9QA 5EZWA 4M85A 3G8WA 1Z9UA 5JCTA 1OD5A 4LUAA 4XFFA 1YFWA 5I0CA 2OH1A 2OB0A 3LA3A 3OCPA 5KBFA 4JJXA 4B5OA 2WPXA 1RXTA 2Q0AA 2UY8A 3BB6A 3DR6A 1ZVFA 3IWZA 3ACLA 4F8AA 3I9SA 1J58A 3LWCA 3OD0A 4Q0QA 3R9FA 2PA7A 2H5MA 4KOYA 4PK2A 2EVNA 3EQEA 2OYZA 1U6MA 4AB7A 4AVAA 4Q0SA 4MY3A 3D82A 4ZU5A 3SCHA 3FJSA 1L0CA 3IWGA 4PJYA 4X5KA 2PQ8A 1X8MA 2QDRA 1TIQA 4HVQA 4RI1A 4XF0A 2IXLA 3H7YA 2G3TA 3MPBA 2OU2A 3TO6A 3E5XA 5KTCA 1NE4A 1K4JA 1XE4A 2ET1A 3SCFA 1ZZ8A 4HNXB 4EROA 5D1IA 4XFAA 5FLJA 4H89A 1YFUA 2H0VA 4BYYA 1RUNA 2AE6A 4Z82A 2Q44A 2I00A 1LKNA 3UKTA 2Q0YA 2E9QA 4CS0B 5KHIA 1Q43A 3NL1A 2Z10A 5AVPA 5HH1A 1R57A 5BUVA 4KOWA 1Z4RA 5FVJA 3DKWA 3KCCA 3UY5A 5KHHA 1I21A 1PUAA 2VI7A 3G7DA 2G0BA 1UIJA 2Y0MA 5EFUA 3SHRA 4MGZE 4AG7A 4XF1A 4XF9A 5BPXA 3DNSA 4JXRA 3QACA 4HN1A 4KVXA 4J1XA 3SXNA 4QM9A 2PQQA 1J3PA 5GCNA 2RC4A 4UBGA 1QSRA 4PK3A 1QY4A 1H1IA 2FIWA 4FD6A 5KHKA 4EV0A 2R1IA 2MPFA 5C82A 2GU9A 4KOTA 2B4DB 2IXHA 3E5UA 3PZJA 4F0YA 1KUVA 1XIXA 4AXOA 4LULA 3RYRA 1YLLA 2EA7A 1CAWB 2QJVA 5JSPA 1S60A 2X7BA 4KOXA 3H4QA 1MJBA 3IIAA 2REEA 2B58A 1X8EA 2VBQA 2FMYA 1I5ZA 3U11A 2WC2A 3F8KA 4BIFA 3NW4A 3FE5A 1S7LA 4HBNA 3GYAA 1CAXB 4NVPA 4I02A 3RYPA 4QUSA 3TOAA 2ATRA 4E0AA 1GQHA 1NMTA 4R8HA 2R98A 3C26A 3B8GA 4LTAA 5I8SA 3W91A 1ZZ6A 2FSRA 1CAUA 2ET7A 1OFNA 2Z0ZA 4YRHA 4H7LA 2P17A 1I6XA 2CAUA 3KGZA 4LA3A 4XFCA 2FXFA 2OZHA 2BNOA 2XLFA 3H9AA 3E6CC 1DGRA 3FHIB 3TNQA 2ZW4A 4IESA 4PV6A 2GC0A 3SXWA 3FNCA 4Q0PA 4I49A 4MGYE 4KWLA 4UXAA 4WZCA 1QSOA 3FX3A 1O3RA 2Q4VA 3OWCA 4X6QB 2CNSA 3G3SA 4XF4A 2IXJA 4WVZA 4MI4A 1J59A 2HKXA 2PYTA 3MYXA 4KLVA 4KOVA 4NEXA 4JD6A 1GHEA 1S7KA 4E2QA 4HNYB 2HJIA 4HVOA 2XLGA 4R57A 1HW5A 3D0SA 1XMTA 4WBBA 1X7NA 1IPKA 2ZCWA 3E6BA 2FE7A 5I0SA 1LR5A 2GAUA 2QMLA 5F1RA 3T90A 2HV2A 3BCWA 2VPVA 2OZ6A 1YFXA 2P0WA 4B5PA 2VQYA 4YNIA 1NZCA 1V0CA 2Y0OA 2Z11A 1LRHA 2FS5A 4F7ZA 2QECA 4FAGA 4M3SA 4I2OA 2XHKA 1I1DA 2KXLA 2G3AA 1O3SA 4FAHA 1J3RA 3USSA 4U9YA 5IX3A 3NSTA 5T3NA 1J4JA 2PFWA 4XFBA 5HI0A 1KUXA 2DXQA 5HMNA 1JUHA 3EFAA 4B5PB 2EAAA 3PLQA 3BLNA 3K9UA 4HN0A 4MGKE 3IDBB 4HLTA 5C6CA 2VZYA 2ZW7A 5EBVA 3TTHA 3CJXA 4E8OA 3IBMA 2OPKA 4UWJA 4JVAA 4UBHA 4R9MA 4FT8A 2K9ZA 5H84A 1PU9A 4EVYA 4QVTA 1RTVA 3RPQA 4CYDA 2CNTA 4QBJA 3CEWA 3R95A 4META 3TO9A 2OA2A 2XGXA 4IETA 2BNNA 2BYVE 1XE7A 2BSWA 3S0MA 2O28A 5I8YA 2UYAA 5LRSA 5I0UA 2PR8A 1IPJA 3CL1A 2ATFA 3MGDA 4KVOE 4IEVA 2QVSB 3HT2A 3V8IA 3JUWA 1CM0A 2OZJA 1YK3A 2PC1A 1ZZ9A 2B5HA 5LEKA 2R8VA 4K30A 4OADA 3OTFA 3HQXA 4RD7A 1Q2DA 2IL4A 4XPDB 2GZWA 4DINB 2I45A 4AVCA 1SQ4A 1OMIA 5JSRA 3MZHA 3IGRA 4JLYA 4II9A 1XRUA 1VJ2A 4Y49C 3H3ZA 3SCGA 5I93A 2ZW6A 1YHFA 3CXSA 1O7FA 4KOUA 4RS2A 2GANA 3E6DA 1NYWA 1G6NA 3O14A 3RZZA 2JDDA 3N7ZA 4J3GA 4CAVA 3OGJA 1WLTA 3RYOA 3LOIA 3NVCA 1LRZA 1M4GA 1VR3A 4UBRA 4FD4A 3LZZA 2V09A 4EWAA 2PDOA 4JTOA 5FQ0B 5C8WA 3C3VA 3E97A 3I59B 4Q29A 1UW8A 1QSNA 1P4NA 1TQ5A 2B9UA 2ARHA 4O9EA 3VWEA 4X6RB 5CNPA 4K8FA 3W6SA 5KTDA 2PHDA 2XL9A 4XPKA 4LA2A 1CX4A 3CXPA 4PSXA 4QXKA 2QNKA 4R3LA 2REFA 4D7SA 5CVRA 4PIYA 2PSWA 4IF5A 1WGPA 4KVME 2IXCA 4FD7A 4CRYB 1PMIA 4BHPA 1RL3A 2B4DA 3FFQA 1KZFA 1DZRA 1XEBA 4OAEA 5F49A 4QGMA 1DZTA 2D40A 2VECA 1RC6A 1CAWA 4ORFA 2FL4A 2I79A 2XKPA 4R87A 4LX9A 1YUDA 1N71A 4PSWA 4NSQA 3U10A 2K0GA 4ONUA 4E2SA 1FY7A 3CXQA 4NXYA 4MY0A 1ZZCA 4ZBGA 2Z2SB 5H86A 2MNGA 1Y9KA 1DGWA 1ZNPA 1Q2YA 4U5YA 4JTNA 1CAXA 1J3QA 3CF6E 3JZVA 3R9GA 3KKWA 4HKFA 3PGPA 2ETEA 4XPLA 1QWRA 2EVXA 4I01A 1SQHA 4XFGA 1PM7A 1NE6A 2Q04A 3CLPA 3GYDA 3TCVA 5E1RA 5JSOA 2EUIA 5KHJA 2VXKA 4N9HA 3EBRA 3EJKA 4HMZA 4L11A 1IICA 3QOPA 5F48A 3OF1A 1Y3TA 5K8SA 4HSLA 4IERA 4MH0E 4KOSA 3R96A 2JEVA 3LAGA 1S3ZA 3VHRA 1O3TA 4H6ZA 1UIKA 4YYOA 2C27A 4KLWA 1ZZ7A 3FBUA 2NMTA 2ZW5A 3RNSA 2GE3A 1EP0A 4I09A 4J1WA 2CY2A 3FRMA 3H1WA 1YLEA 3H50A 4MX3A 2C0ZA 4OLLA 4KU7A 2JLMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M3CB 3VBRB 1YMEA 1MS5A 4CYNA 2Y38A 3A21A 1HRV3 1CN1A 2EIDA 3ZYRA 2Y33A 1QXJA 4XW3A 5LYIA 2W94A 4D7TA 4Q4Y3 5JPHA 5FWEA 1FI2A 1H1MA 3K3NA 4IEWA 3GJBA 3USUA 2D4OA 1AR62 1NCRA 4COVA 5LCWL 3JB8A 1MK4A 4Q4W1 4C0BA 4DJLA 4MHUA 1UFHA 3GZUC 5FCCA 1W05A 5FQ0A 2P6GA 3ZSEA 4QAWA 4JWPA 1CVNA 4MBUA 5JI7A 2OZGA 4NIHA 1XSQA 5FUNA 3O0WA 3ROUA 2FQPA 4Q1RA 1AYM1 4LHSA 5EV7A 3UKVA 3NAPB 3S6HA 2RMU1 1VHSA 2ADEA 3CJIA 3FHQA 3EO6A 2UWAA 1VBE3 3EHKA 1HQNA 1LNSA 2YFUA 1V6MA 5LRRA 4EWTA 3HMYA 2F5IA 2R041 3NKTA 3ES4A 3HT1A 3IU1A 3FLTA 3THCA 5F3CA 3AKPA 1LOEA 2ES3A 1SG3A 5DAXA 4NGNA 5IB0A 1SLCA 5ACA2 4LEJA 2X53S 3O5SA 5DS0A 4LO8A 4ISQA 1X82A 3NKGA 1LGBA 3FIXA 4Q4W3 4RS5C 3S7IA 2HB6A 1HRV2 4YLZA 2IVIB 1HB4A 4F9UA 4LUMA 1V6KA 4JXQA 1S0BA 4FPEA 3S7EA 4Q4Y2 3TAYA 4AG9A 5IK4A 1WK4A 4R3KA 4QGNA 4FPOB 4AFMA 2ZENA 1AYM3 5F37A 4MVTA 4EZHA 3V0BA 1RUC2 2RDRA 1H1AA 4MV2A 2LUWA 3D8PA 2ARCA 3D67A 5JCTA 2PJ8A 2HBTA 4FTBA 3PJQA 5FY8A 4P4EA 4B5OA 3DR6A 2DFCA 2ZGMA 3R9FA 4PK2A 1Z5RA 4AVAA 4CDQC 3VGIA 1QJFA 2WYRA 5JZGC 1KRIA 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4IV1B
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4XNH C;  3H1M A;  3NJZ A;  4CAW A;  4EWD A;  1M4D A;  1YVK A;  4MGI E;  4N9I A;  3F5B A;  3S6K A;  1O5U A;  3JVN A;  2IXK A;  4I3P A;  2ZPA A;  3QAH A;  1Z4E A;  1ZRC A;  3BPZ A;  4QM8 A;  2ZKL A;  5EC4 A;  3H7J A;  1ZZB A;  2PAM A;  1UPI A;  3L2H A;  3TT2 A;  2K5T A;  3BJ8 A;  3VWD A;  3DSB A;  1QXJ A;  4IEU A;  1O3Q A;  4KU8 A;  3WW3 A;  5J7M A;  2BNM A;  4D7T A;  2HQY A;  4QC6 A;  4DNC A;  5BXX A;  5CU1 A;  2J8R A;  5JPH A;  3CO2 A;  3LOD A;  4KOR A;  3UKN A;  4IEO A;  1NSL A;  5FLI A;  2J8N A;  3RDI A;  1QSM A;  2Q7B A;  4PIX A;  1YGH A;  3EY5 A;  4GUL A;  1FI2 A;  4HSJ A;  5J3U A;  4HZF A;  3DR8 A;  3SMH A;  1H1M A;  1CAV B;  3N4M A;  5BY5 A;  1YRE A;  3W6X A;  4IEW A;  2UY9 A;  2D4P A;  2N7G A;  3FB3 A;  4EWE A;  1LB2 A;  2Q30 A;  2D4O A;  2H6B A;  4LLO A;  3IDC B;  1IID A;  3B02 A;  2VZZ A;  4MHD A;  4XET A;  1RUO A;  1ZRD A;  3PVB B;  1XE8 A;  2H6C A;  2GH2 A;  4QMA A;  1FXZ A;  4BH9 A;  1Y9W A;  4IEQ A;  1M1D A;  4PIZ A;  4MUV A;  2B8M A;  2PAK A;  3D3S A;  1MK4 A;  4AVB A;  3FZ3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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