4OLLA

Camp-binding acyltransferase from mycobacterium smegmatis
Total Genus 86

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
333
structure length
316
Chain Sequence
VAELTEVRAADLAALEFFTGCRPSALEPLATQLRPLKAEPGQVLIRQGDPALTFMLIESGRVQVSHAVADGPPIVLDIELIIGEIALLRDAPRTATVVAAEPVIGWVGDRDAFDTILHLPGMFDRLVRIARQRLAAFITPIPVQVRTGEWFYLRPVLPGDVERTYRRFQSVRKPTRALLEYLFEVDYADHFVWVMTEGALGPVIADARFVREGHNATMAEVAFTVGDDYQGRGIGSFLMGALIVSANYVGVQRFNARVLTDNMAMRKIMDRLGAVWVREVVMTEVDVPPVDTVPFEPELIDQIRDATRKVIRAVSQ

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH1 (3-14)S1 (33-38)EMPTYTII1 (18-21)3H2 (23-26)AH2 (27-31)S7 (105-110)S2 (42-45)TII2 (39-42)S6 (98-101)TII3 (46-49)TVIII1 (43-46)S4 (62-66)S3 (54-59)S5 (74-75)AH3 (86-91)TI8 (306-309)AH5 (125-138)S9 (152-157)TI1 (147-150)S8 (143-146)TIV7 (225-228)AH6 (190-198)TI2 (182-185)TIV3 (179-182)TII4 (159-162)TIV4 (185-188)3H3 (163-165)S10 (204-208)TI5 (240-243)TIV5 (200-203)TIV6 (210-213)TI6 (241-244)TI4 (212-215)S12 (234-239)TII5 (227-230)S14 (298-303)TIV8 (278-282)AH7 (248-263)S13 (267-272)TI7 (273-276)TIV9 (280-284)TVIII3 (284-287)3H1 (16-18)TIV2 (101-104)S11 (219-224)AH4 (112-120)TII6 (243-246)TIV11 (292-298)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium smegmatis
publication title Allostery and Conformational Dynamics in cAMP-binding Acyltransferases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetyltransferase Pat
total genus 86
structure length 316
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.3.1.-:
pdb deposition date 2014-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4ollA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4ollA02
2IXIA 5C82A 1ZZ7A 5C88A 3D8PA 3TCVA 1YFUA 4XFCA 3C26A 1YK3A 2HUZA 3DNSA 4MI4A 3LA7A 1NSLA 2NMTA 4F7ZA 2P6EA 4CRYB 4UBRA 5JCTA 5EC4A 4KOWA 1NE4A 2Q04A 2PQ8A 1ZX5A 1QSTA 3TO6A 1CAXA 2OZUA 1J58A 1Q43A 4I02A 1Z9UA 1L0CA 2VZYA 3NKTA 2Z0ZA 4OADA 1MJAA 5CNPA 1Q2DA 2XL9A 2FIWA 2Q7BA 1PU9A 4HZFA 3E5XA 3ES4A 3D0JA 3OCPA 4I3PA 5FLHA 3F5BA 4MZUA 4IERA 4KWLA 2ATFA 3SCHA 5J48A 2I79A 4NXYA 2OZ6A 2OZHA 4M3SA 1CAVB 3JZVA 1QXJA 1B6BA 4QMAA 4R8HA 1RXTA 3FWEA 2GIVA 4FD7A 4JV4A 3OWCA 3MYXA 5F1RA 2ZW6A 5IB0A 1YLEA 4R57A 4F8AA 4R9MA 1GQHA 4I09A 1GQGA 3TE4A 2ZKLA 3NE7A 3SHPA 4U9ZA 2MPFA 2VPVA 1Q2YA 1XIXA 2DCTA 2I45A 2WFPA 1RUNA 4HVOA 2QMLA 3D3SA 3P2HA 4U9YA 2D4PA 1CM0A 4CYDA 1OZPA 2REFA 4LULA 2JDDA 2Q44A 4LA2A 4ZBGA 2PHDA 4KWJA 2PRBA 2Y0MA 4U5YA 2VECA 4PSWA 3U0ZA 4H7LA 1YGHA 5KTCA 1JUHA 3ROUA 4IEYA 4L2NA 3CXQA 2B9UA 1OMIA 4IUSA 2IXCA 1NXMA 1NE6A 4XF0A 4DINB 2VQAA 3MGDA 4QBJA 4HSLA 1YHFA 2VQYA 2J8RA 4XFFA 1LB2A 1ZZ8A 4YFJA 4LEJA 2K9ZA 2Q4YA 1CGPA 4KOXA 3QB8A 2PAKA 2D5HA 3G3SA 4NCZA 3UY5A 3IDCB 1O3SA 4X5KA 4YRHA 2CNTA 5I93A 1KUXA 3BCWA 4PIXA 4D7SA 4E2QA 4FAGA 3O14A 3CEWA 1S60A 4N9HA 2WPXA 4PK2A 1UD1A 3CF6E 4MY3A 4HNWB 3WR7A 1ZREA 2CY2A 4HBNA 4QXKA 4L8AA 1CX4A 4HSJA 2JEVA 3N7ZA 5E16A 4XPDB 4JLYA 4CAXA 2CNSA 5E96A 3R9FA 2FS5A 2WPWA 2O28A 3MPBA 5LRRA 3S0MA 4IEQA 2B5HA 4BMHA 3LZZA 2HJIA 4I49A 1O3RA 3NJZA 5FPXA 5BY5A 5F48A 1H1MA 4XFAA 3DL3A 4QM8A 3VHRA 1H1IA 4EV0A 1RUOA 2B4DB 4KU8A 4FD6A 1UPIA 2XLGA 4Y49B 1I21A 4UWJA 1FI2A 2OYZA 2FQPA 4Z07A 1XE4A 1R57A 4MHDA 1CAUA 1CAWB 4IESA 2B4BA 2J8MA 4L89A 4ORFA 4KOVA 1NYWA 2GAUA 2HKXA 2XLFA 4AVCA 1X82A 1IYKA 5FQ0B 1XEBA 4LA3A 3PVBB 3SXNA 3TT2A 4FAHA 2UY9A 3VWEA 4UWIA 4ZU4A 4XFIA 4II9A 1PM7A 1NMTA 3DSBA 4NEXA 4QB9A 3MZHA 1YFWA 1DZRA 2BNNA 2H6CA 3E5UA 2R98A 1O4TA 1ZZBA 2QVSB 1Y9KA 5BUVA 3EXNA 3CL1A 3RYKA 1YX0A 4JWPA 4KOYA 4ZU5A 5FPZA 4EWAA 1TQ5A 3CXPA 1X7NA 3CXSA 1FT9A 1CAXB 3I59A 2X7BA 2AJ6A 1UCXA 2Z69A 3MDPA 3S6GA 3RYPA 4FD5A 5I0SA 4FD4A 3H1YA 1WWZA 2I00A 2F4PA 2GZWA 4D7TA 5HI0A 1S7FA 2FXFA 1V70A 4OAEA 3V8IA 1YR0A 2ZW5A 5HMNA 2F5IA 3T90A 2ETEA 4Q0SA 5I0TA 5I8YA 3H8UA 4EWDA 1DGWA 1RGSA 5I0UA 5KHJA 2VXKA 3GKRA 2PFWA 1KUVA 4KLWA 4FT8A 5J7MA 2KCWA 2QDRA 3H7YA 2EVXA 4KZTA 3QAHA 3NSTA 3DN7A 2KXLA 3UKNA 3PGPA 3FFQA 4LTAA 1YFYA 2Q30A 3KCCA 3SCGA 1BO4A 3HT1A 4MX3A 1QY4A 3EQEA 4JD6A 3FX3A 2PDOA 5FDBA 1VJ2A 4XF3A 3HIFA 2ZPAA 3IDBB 4KU7A 1MK4A 4RI1A 5F46A 3LAGA 2EUIA 3BJ7A 4YSFA 4PV6A 3SXOA 5I0RA 2FMYA 3CJXA 3SCFA 4A2UA 4DNCA 3S7EA 5KHIA 2PQQA 4JTNA 2FSRA 3TOAA 1IICA 1I5ZA 1P4NA 2OB0A 1WGPA 4QGLA 1UFHA 4FBFA 2R8VA 3TFYA 4XEZA 2PTMA 2Z2SB 5J8FA 3H1MA 4B5PA 3NVCA 4Q0PA 3ZDSA 4UBHA 1O3QA 1WLTA 1M44A 4MGKE 5EZWA 3SHRA 2IXHA 2OZGA 3EFAA 2GC0A 1VHSA 3QACA 5K8SA 3DDDA 4LX9A 3E6DA 2P6FA 2K0GA 3D2MA 4E2AA 5BPXA 3I3GA 1N71A 3R96A 4EROA 2A4NA 5IV0A 3HT2A 4WZCA 4PSXA 3BLNA 1M4IA 1X8MA 1ZRDA 4XF9A 5J3UA 4RD7A 4Q0UA 2EA7A 4O9GA 5GCNA 4Q0VA 5I91A 3R9EA 2J8NA 1J1LA 1Q2CA 5H86A 4IEPA 4GS4A 3RZZA 2PYTA 3W6XA 5JSPA 1IPKA 1LRHA 2P17A 4HVQA 1I6XA 1RC6A 2MNGA 2ARHA 2D5FA 3E0KA 1EY2A 4LUAA 5JR7B 2R7HA 1ZZ6A 5KTDA 4IEZA 2FIAA 5I8TA 4KOTA 1Z4EA 2OZJA 4CS0B 4IEOA 3L2HA 5KHGA 1GHEA 1IIDA 4B5OA 4IETA 5DWNA 5J8CA 3RDIA 2HV2A 4B29A 3D2PA 3FRMA 3W91A 2B5GA 4XPLA 1Z4RA 3ST7A 1J4JA 4IEVA 2PC1A 3E6CC 4GULA 4LLOA 5KHHA 4XPDC 1FXZA 2PSWA 4UBGA 1CAUB 1S7LA 1B87A 3KKWA 4JJXA 4XNHB 3NL1A 4NSQA 3LWCA 4AB7A 4ONUA 4XF4A 5FVJA 4CAWA 3FHIB 4KLVA 2QCSB 4XF1A 1ZRRA 2CV6A 1PUAA 2B8MA 1QSRA 2Z10A 4J1XA 4AXOA 3RYOA 1ZRCA 4MV2A 3G8WA 2R1IA 3LD2A 5BV6A 1YFXA 4F6AA 1QSNA 3LA3A 3PZJA 2Q0AA 1QWRA 4Y49C 5JSRA 1ZRFA 2IXLA 3ACLA 3H3UA 4PJYA 5LEJA 3IGRA 1O5UA 4LUMA 4HN0A 1UIKA 1YUDA 3GBFA 4UA3A 3DR8A 1OD5A 2QIRA 3WW1A 2FL4A 2XKOA 3F8KA 3EY5A 5KHKA 3I59B 2XL7A 1SQHA 3ETQA 2FT0A 3FYNA 3PP9A 1QSMA 1SEFA 3E5QA 4CRZB 1S7NA 5JQ4A 1XF8A 5CVRA 4EVYA 1S3ZA 2JDCA 5C6CA 3E97A 2BEIA 4MGZE 4YNIA 3IWGA 5C8WA 2D40A 2Y0OA 4PIYA 4X6QB 2G3TA 1BOBA 2GE3A 3GY9A 1IB1E 4MGIE 4KWKA 3TO9A 4I2OA 3UKVA 1M4DA 1L3JA 3OGJA 4H89A 4F0YA 2CGPA 1NE9A 2BNMA 2VBQA 4KVOE 2UYAA 2XGXA 4KL1A 3EO4A 3H4QA 5FLIA 4OFGA 2ZW7A 4H6ZA 5JSOA 4K30A 4QC6A 4AQ2A 5AVPA 3H50A 2PAMA 4KVME 1IYLA 2C0ZA 2BNOA 3OTFA 3BPZA 4JVAA 4QVTA 3OD0A 1RTVA 5JPHA 3R95A 2CAUA 1I12A 1TIQA 4IEWA 4HKFA 4QX5A 3ZJ0A 1YLLA 2FCKA 2ZXVA 4YRDA 2P0WA 3ES1A 3W6SA 3I9SA 2H5MA 2D93A 3EC4A 3FBUA 2Z11A 4R52A 3C3VA 3EJKA 4H6UA 2Q1ZB 3U10A 5FQ0A 2QECA 3I54A 4UXAA 3S6HA 2VEZA 3TNPB 5JAXA 4L11A 1OI6A 4Z82A 2UYBA 4I0BA 2VZZA 1VR3A 1Y3TA 3JUWA 2BEOA 3EBRA 4B5PB 3EHKA 4PIZA 1Y9WA 2O8QA 4BH9A 2BYVE 2Q4VA 1RO5A 3JVNA 4N9IA 4J1WA 4HN1A 1KZFA 4KOSA 3I7DA 3UKTA 3ELNA 4BHPA 1DZTA 1EP0A 2O1QA 2G3AA 3LOIA 2EVNA 3D0SA 4RS2A 3S6FA 4IEXA 2XKPA 1CJWA 1UIJA 4M85A 2GH2A 4OLLA 3BU7A 4HLTA 4QGNA 3BJ8A 1V0CA 3RYRA 3H7JA 3T9YA 4R3LA 2N7GA 2V09A 2Q4SA 1DGRA 2OU2A 2IXJA 2JLMA 2PAEA 4NVPA 3G7DA 2P6GA 2PR8A 2IL4A 3OF1A 4KOUA 4HNXB 4MBUA 4Q0QA 4YARA 3WW2A 1I1DA 1EPZA 2ET7A 4XFBA 3SXWA 5EBVA 2GANA 4MY0A 3H3ZA 1Y7RA 5LEKA 1J3RA 1ZNPA 4BYYA 4PK3A 2B5GB 4CAVA 4HMZA 1O3TA 2D4OA 1Q5OA 2VI7A 2H0VA 3NW4A 3R9GA 4XFHA 1S7KA 4MJ8A 3S7IA 3BB6A 1MJBA 2FE7A 1CAVA 3N4MA 3TO7A 2B3UA 5DWMA 3F0AA 4MH0E 3SMHA 3WW3A 4R87A 3VWDA 3P2FA 3KSCA 1PMIA 4JXRA 3D82A 1KUYA 2K5TA 1P0HA 5F49A 2EAAA 4BIFA 2XLAA 1K4JA 1SQ4A 3TNQA 4X6RB 1Y9QA 5I0CA 4I01A 2GC1A 2OH1A 1U12A 2G0BA 3B8GA 5ISVA 1NZCA 1HW5A 4YYOA 2QNKA 2UY8A 3PNAA 2B58A 1QXRA 3DV8A 4HNYB 2BL1A 4WBBA 1J59A 1J3PA 4AVBA 1FY7A 4J3GA 4R3KA 5D1IA 3BALA 4KUBA 1WK4A 5EFUA 4K8FA 3FNCA 4E2SA 3U11A 3QOPA 3M70A 2AE6A 1QSOA 1EYBA 4XNHC 4XPKA 4YGOA 1YREA 3GYAA 4EWEA 4ZU7A 5HH1A 1YVKA 1ZZCA 2HQYA 2ET1A 3DKWA 5IX3A 3KGZA 4MGYE 3H1WA 4E2GA 1XE8A 5KBFA 2ATRA 2PR1A 3IBMA 3FB3A 3TOBA 4IF5A 4QUSA 1OFNA 4AQ6A 4KUAA 4TLFA 3ZZIA 2PA7A 1LKNA 1SFNA 1O7FA 2WC2A 2DXQA 2REEA 2OPKA 3R6SA 4KORA 4IEUA 3K9UA 1ZVFA 4HVRA 1X8EA 1U6MA 1VP6A 1ZZ9A 3GYDA 4AG7A 2B3VA 1LRZA 3RNSA 1YWKA 2IC1A 1O5LA 3FXTA 5LRSA 3KGLA 5CADA 3R1KA 3S6KA 1G6NA 5E1RA 3E6BA 1MJ9A 2BGCA 2QJVA 1LR5A 4JTOA 1J3QA 2GC2A 4O9EA 1ON0A 1WA4A 2ZCWA 4AG9A 3FIXA 4JXQA 4XFGA 3FZ3A 3FE5A 5H84A 4WVZA 4MUVA 2PHLA 1Q3EA 2CNMA 3M3IA 2BUEA 5KTAA 2CAVA 3USSA 4AVAA 5I8SA 5BXXA 3H9AA 2H6BA 1XRUA 4P9GA 3WW4A 5CU1A 1UW8A 1XMTA 3IIAA 1S5KA 2RC4A 2B4DA 3DR6A 3HQXA 1M4GA 2GU9A 2XHKA 4KVXA 4NF1A 3LODA 2BSWA 3TTHA 4LUKA 4Q29A 2ZW4A 1IPJA 3CO2A 1VKCA 3KMHA 5FCCA 2Q0YA 1YVOA 1CAWA 3LA2A 3CLPA 2GC3A 1RL3A 4META 4E8OA 3EO6A 1M1DA 2E9QA 2MHFA 4I0AA 3RPQA 1XE7A 3IWZA 5F47A 2C27A 3PLQA 2OA2A 3B02A 4QGMA 4XETA 5FLJA 4E0AA 4QM9A 2IXKA 5T3NA 3FJSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3SKJE 2JDCA 3GBWA 3D3AA 1W99A 3I2IA 4FQ4A 1PMJX 5FY0A 1W2OA 2PMWB 2UYAA 4QC6A 2I3CA 1OQ1A 1PX3A 1HEEA 1IYLA 4RYDA 4Y1VA 5BNNB 4QX0A 4IK2A 3MLKA 4LO8A 5F5CA 1PVC2 4CPBD 4QX7A 1QJFA 1Y3TA 4PQ9A 4OHXA 3WT4A 3EHKA 2VTXJ 1QHDA 3BTXA 3I7DA 1HX6A 2R0FA 3UKTA 2KD7A 5K7PA 3U4SA 5ANQA 1PMHX 3GM8A 2VMCA 2GH2A 3NNMA 4GWNA 1CPMA 2R0HA 3T2PA 4AAPA 1RUG1 1IOFA 2ZGSA 2HEYF 3SXWA 4QX3A 4XOGA 4LKSA 4NHMA 2BUKA 4MJ8A 2B3UA 3T4VA 4R87A 4FPFA 1MEC2 4P9JA 4TNUA 1RUD1 3W5MA 4YZ3A 3WG2A 2GC1A 4CGOA 2WZPP 3BOWA 1SPPA 1RUC1 1F2PA 2WA3A 4PDWC 1JZ6A 3A4UA 4EWEA 2ZGRA 1YQ6A 2TBVA 5JZGA 3VD3A 4UF4A 5A6QA 3CQOA 4BK4A 1ASJ2 2WQ4A 4KORA 4TXWA 4AG7A 1OLME 3RNSA 3TWIA 1OF3A 3CPXA 1XYOA 3M7AA 4IV3C 5AG4A 5A33B 1R081 3RWNA 3SITA 4YU9A 1W8HA 5LATA 4LOTA 5FXWA 3FHQA 4JKMA 3WF1A 3TTHA 5CFDB 4CCDA 1F15A 1VHOA 2Q0YA 3ZVXA 1DQ2A 2MEV3 3IWZA 5D21A 2XR4A 4ZYQA 1MEC3 1APNA 2R063 5FAXA 5FP4A 2RDNA 2OW4A 4LBOA 2ZEPA 1Q43A 4OULA 1O8PA 2XL9A 4DPNA 4M3SA 5F3CA 3D7DA 3H8GA 2HWD2 3FUOA 1YLEA 5GZEA 1UL9A 3WT3A 1CWPA 1H8LA 2VPVA 2D6PA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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