4OLLA

Camp-binding acyltransferase from mycobacterium smegmatis
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
333
structure length
316
Chain Sequence
VAELTEVRAADLAALEFFTGCRPSALEPLATQLRPLKAEPGQVLIRQGDPALTFMLIESGRVQVSHAVADGPPIVLDIELIIGEIALLRDAPRTATVVAAEPVIGWVGDRDAFDTILHLPGMFDRLVRIARQRLAAFITPIPVQVRTGEWFYLRPVLPGDVERTYRRFQSVRKPTRALLEYLFEVDYADHFVWVMTEGALGPVIADARFVREGHNATMAEVAFTVGDDYQGRGIGSFLMGALIVSANYVGVQRFNARVLTDNMAMRKIMDRLGAVWVREVVMTEVDVPPVDTVPFEPELIDQIRDATRKVIRAVSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Allostery and Conformational Dynamics in cAMP-binding Acyltransferases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetyltransferase Pat
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium smegmatis
total genus 86
structure length 316
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.3.1.-:
pdb deposition date 2014-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4ollA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4ollA02
1XE7A 4XFFA 4BHPA 2PAMA 1IIDA 5J8CA 5FPXA 2B5GA 4UA3A 2MPFA 4HBNA 4KOYA 3FE5A 4MGIE 4KOXA 3W6XA 3HQXA 3MZHA 1IICA 4NSQA 3CF6E 5F49A 1UW8A 1CAUA 2PYTA 4F8AA 3H1WA 1ZREA 1I21A 3OF1A 1ZX5A 3CJXA 3EBRA 4EWEA 3CXSA 2ZCWA 1CGPA 4IEOA 3B02A 4HNYB 3TO6A 4IEYA 3E97A 2ARHA 2VXKA 4LX9A 4XNHC 4Z82A 1XEBA 4MBUA 1VJ2A 3H8UA 2BGCA 3EHKA 5KHHA 3L2HA 3LZZA 1PUAA 4QC6A 4QX5A 4B5PB 1GHEA 2OZGA 4I0AA 1LRZA 5LEJA 4I3PA 2GC1A 1N71A 1NMTA 1Z4EA 2CY2A 3RPQA 4FD6A 4KOSA 2CNTA 3BU7A 3IBMA 4JTOA 1YLLA 4JXRA 2PFWA 4FD4A 4B5PA 1Y9QA 4WBBA 2WPWA 5BV6A 2Q44A 2IXLA 1LB2A 3FXTA 3JVNA 2Q7BA 1YUDA 2CAVA 3DL3A 4GS4A 1XE4A 1WA4A 3GY9A 4HVRA 1ZZCA 4YRHA 1O3SA 1CJWA 3CO2A 2GC2A 1NXMA 1O7FA 1UCXA 2H0VA 4Q0UA 2OH1A 4KLWA 3SCFA 4YARA 1X8MA 3TO7A 4UWJA 4XPLA 5LRRA 2HV2A 1YHFA 5D1IA 1NE6A 2CGPA 2OYZA 3HT2A 4AVCA 1YVKA 5C88A 2GC3A 3BCWA 3CL1A 4HMZA 5KBFA 3BJ7A 5H84A 1XMTA 4KOVA 3LD2A 1NZCA 4QM9A 2EUIA 5CNPA 3G7DA 3U10A 4PK3A 4XF3A 3CXQA 5I0RA 1TIQA 4U9ZA 2OPKA 3OGJA 1XE8A 1ZNPA 5I0SA 2ZW4A 4LUMA 4HVOA 4ZU5A 4I49A 4MV2A 1VR3A 3WW2A 4ZBGA 1P4NA 5J8FA 3EO4A 4JVAA 1DGRA 2HKXA 4QMAA 4N9HA 2HQYA 4M3SA 1EP0A 2OU2A 3EO6A 4D7SA 5EZWA 4FBFA 1QSOA 1NE4A 1M44A 1S60A 1Y3TA 3D2PA 2Z2SB 4N9IA 5FLHA 3R9FA 4X6QB 3GYDA 2N7GA 4IF5A 4Q0SA 2JEVA 5EBVA 3ZZIA 1M4IA 1CAWA 2PR8A 3OWCA 5I8SA 3MYXA 5FCCA 3ELNA 5JSOA 4QGMA 3I54A 5E16A 2REFA 3OD0A 2UYAA 3RYKA 1Q5OA 3IGRA 4XF0A 3UY5A 4KL1A 5JQ4A 4X6RB 3TOAA 4DINB 5HI0A 2G0BA 3FJSA 4Q0PA 3E6BA 4KWLA 5BY5A 1FI2A 4UBHA 1RUNA 2KCWA 3LAGA 2QDRA 5KHGA 5C82A 5K8SA 2B3UA 2FQPA 1I6XA 4QGNA 2XHKA 2XL7A 2Z10A 4YGOA 2O8QA 4IEPA 4R3KA 4XPKA 5LEKA 2GU9A 2FT0A 4YRDA 2P6GA 3EJKA 1MK4A 4PK2A 3RNSA 4AG9A 4IUSA 2X7BA 2BNMA 4JJXA 3MPBA 4E2AA 1M4GA 2D4PA 3ACLA 1FT9A 2A4NA 3I59B 2G3AA 3ST7A 4Y49B 2O1QA 4KOUA 4DNCA 4XEZA 2BEIA 1SEFA 2P0WA 4KOWA 4MY0A 4KORA 3QB8A 3W91A 5H86A 3CEWA 3DV8A 2QJVA 1QY4A 5I0UA 3UKTA 2GE3A 2NMTA 5JSRA 2G3TA 3BLNA 4CAWA 1Q2CA 4PSWA 5KHKA 4H6ZA 2FCKA 3ZDSA 2QMLA 2PHDA 1S7LA 2XLFA 3I59A 3I9SA 5AVPA 2JDCA 4R87A 2PA7A 4CRYB 1RO5A 1KUYA 4F7ZA 1WK4A 1UD1A 2PHLA 3H1MA 2FIWA 3FRMA 1SQHA 1QSNA 4H89A 3IDBB 5EC4A 2AE6A 4HNWB 2E9QA 4KWKA 2CAUA 1X8EA 4LA3A 4OADA 5CVRA 3CXPA 3S7EA 3TT2A 2GANA 1O5UA 1S7FA 2D93A 1R57A 3M70A 2CNMA 2ET1A 3BB6A 3I3GA 2EVXA 4BMHA 4HSJA 3FYNA 3QACA 3IIAA 5E96A 2REEA 4Q0VA 3V8IA 4J3GA 3EC4A 2D4OA 3FBUA 3FIXA 3F8KA 2HJIA 4PJYA 4HZFA 2GZWA 2XGXA 1J4JA 3S0MA 3IWGA 3P2HA 4AB7A 4LLOA 1O3TA 2PTMA 5HMNA 3MGDA 2GC0A 5F47A 5J7MA 5JSPA 2J8NA 4XNHB 2B5HA 2BEOA 4QB9A 2Z11A 3JUWA 2F4PA 5JR7B 4FAHA 1O5LA 2WFPA 1ZRRA 2D40A 4PIXA 5I8TA 2QNKA 1L0CA 1KUXA 3PZJA 4EROA 4XFAA 2IL4A 4PIYA 2ZW5A 3D0SA 3KGLA 3SMHA 1Q2DA 2PDOA 1Q2YA 2IC1A 2PR1A 4HN1A 3ETQA 5J48A 3IDCB 2K0GA 5HH1A 2UY9A 4J1XA 2ATRA 3R9GA 4E8OA 4FD5A 3PNAA 1LKNA 3VWDA 5KTAA 2PSWA 2VEZA 2Q0AA 3F5BA 1LR5A 1CAVB 1KUVA 2WPXA 3S6HA 1ZZ9A 4OLLA 1YFUA 2I79A 4QVTA 2Q4YA 2MHFA 1RC6A 2D5HA 4JV4A 5CU1A 1DZTA 2AJ6A 5JCTA 4IEWA 2BSWA 3KKWA 4K30A 4MGYE 3PLQA 4UBGA 4PIZA 3R6SA 1CX4A 4H7LA 1YX0A 3R1KA 2P6EA 2MNGA 4OFGA 4MI4A 3T90A 3C26A 5I93A 4CAVA 4O9EA 4IESA 3BJ8A 2B8MA 3D82A 1B87A 3LA3A 1CAVA 1CAXB 4KWJA 1BO4A 4CRZB 4YYOA 4KVOE 4XF9A 2PRBA 1OI6A 3I7DA 4EWAA 4D7TA 4UXAA 1RXTA 1XRUA 4IERA 3MDPA 2B3VA 4EVYA 5JPHA 4LUAA 5IV0A 2ZKLA 4XFIA 1XF8A 5I0CA 3NL1A 4E2SA 4XFCA 1U6MA 1IYLA 5LRSA 4FD7A 2QVSB 1M4DA 5GCNA 3EQEA 1ZRFA 1CAXA 3TE4A 4I2OA 1J59A 4AXOA 2ZW7A 3NKTA 1IB1E 2FIAA 1UIJA 2B9UA 3SCHA 3TNQA 4II9A 2ATFA 2VPVA 1SQ4A 3LA2A 4NF1A 4JXQA 3RYRA 4XPDB 3WW3A 2FE7A 3QOPA 3H3UA 4YSFA 1QXRA 3OTFA 2R1IA 2ZXVA 1TQ5A 1FY7A 4R57A 4MHDA 3SHPA 2I00A 3U11A 1UPIA 2Q4SA 1BOBA 1FXZA 4E2GA 4O9GA 4RS2A 5CADA 3WR7A 2H5MA 4WVZA 3DN7A 4QXKA 1H1IA 4ZU4A 4KUAA 4U5YA 2PAKA 3SCGA 3VWEA 1O3QA 2QECA 1YWKA 2VBQA 2VI7A 1M1DA 4AG7A 4I02A 1ZVFA 4E2QA 2J8MA 4L2NA 5J3UA 3W6SA 2EA7A 2PAEA 5I91A 4J1WA 4LEJA 2RC4A 4JD6A 1EPZA 4HKFA 4KVXA 4F6AA 1S5KA 4NXYA 1PM7A 4MGKE 3H3ZA 4L89A 1G6NA 1DZRA 2GAUA 3R9EA 3U0ZA 1MJ9A 2H6BA 3UKNA 3TFYA 3E6CC 4LUKA 4BIFA 1MJBA 2XKPA 3RDIA 1QSRA 3GKRA 3S6FA 5FQ0B 4CYDA 4P9GA 4YFJA 5IB0A 3HIFA 2CNSA 2B4BA 3R96A 4PSXA 3D0JA 1WWZA 2PQ8A 1V0CA 4RD7A 3S7IA 4JLYA 1YFYA 3RYPA 2FXFA 4KLVA 2C27A 4MZUA 4HVQA 4I09A 2FMYA 2FL4A 2BUEA 3RYOA 3E5XA 3SXOA 5C6CA 3G3SA 3NJZA 5FQ0A 4KZTA 4RI1A 3LA7A 5E1RA 2GH2A 4META 3HT1A 4GULA 2R98A 3C3VA 2GIVA 3NVCA 3JZVA 3M3IA 1X82A 3O14A 2UYBA 4BYYA 1UIKA 4Z07A 2ZPAA 1DGWA 3H1YA 5KHJA 2PQQA 1ZZ8A 1L3JA 2PC1A 2JDDA 1X7NA 4AVAA 5BXXA 1Q3EA 3RZZA 4A2UA 1Q43A 1I1DA 1MJAA 1S3ZA 2Q4VA 1QWRA 4FT8A 3P2FA 4XF4A 1XIXA 1NYWA 1LRHA 4B29A 3TOBA 1WGPA 2Y0OA 1YFWA 5DWMA 3E5QA 2Y0MA 4HSLA 4AQ2A 4X5KA 3TCVA 2Q04A 3S6KA 3PGPA 4B5OA 4QBJA 5FPZA 3H4QA 4XFGA 1NE9A 1Z9UA 4EWDA 4ZU7A 3EY5A 2KXLA 1K4JA 2EVNA 3OCPA 1VHSA 1ZZ7A 3DKWA 3KCCA 1JUHA 1ON0A 1UFHA 3SXNA 3UKVA 1VP6A 3ZJ0A 1J58A 4MGZE 3DDDA 2P17A 3NSTA 3GBFA 2Q1ZB 3S6GA 5KTCA 1J1LA 1YGHA 4L8AA 2ET7A 5I0TA 3KMHA 4KOTA 3R95A 1YREA 2IXJA 2IXIA 2ZW6A 5T3NA 2FSRA 1O4TA 3WW1A 4IEVA 1OZPA 1GQHA 3K9UA 1GQGA 4KUBA 3TTHA 1OFNA 1KZFA 2P6FA 4IEZA 2Q30A 1ZZ6A 4Q0QA 2BL1A 3QAHA 4R8HA 3USSA 1ZZBA 2OZUA 3FFQA 4R52A 1HW5A 3E6DA 3KGZA 1ZRCA 1VKCA 1WLTA 2I45A 1NSLA 1YLEA 3N4MA 3BALA 4TLFA 3N7ZA 1PMIA 1EY2A 4IEQA 1I12A 5JAXA 1Z4RA 1YK3A 2OZ6A 1I5ZA 3D3SA 2XLGA 3BPZA 2HUZA 2UY8A 3PVBB 1EYBA 4QUSA 4BH9A 2ETEA 1J3QA 3ES1A 3D8PA 2VECA 3GYAA 3H7YA 2EAAA 4NCZA 4ORFA 4Q29A 5F46A 2BNNA 4CS0B 4XFHA 1Y9KA 1OMIA 1CAWB 5FLJA 5KHIA 5F48A 2Z0ZA 3FX3A 3DR6A 3TO9A 1P0HA 4UWIA 2DCTA 5EFUA 3B8GA 4NEXA 2FS5A 4QM8A 3DSBA 2OZHA 2Z69A 4WZCA 3H50A 1QSTA 1RGSA 4KU7A 3EFAA 3H7JA 3NW4A 4HLTA 3FB3A 2VQAA 4UBRA 3F0AA 2OB0A 1O3RA 4H6UA 4XPDC 3T9YA 2BNOA 2J8RA 2XKOA 2VQYA 3FWEA 5BPXA 1J3PA 2JLMA 1IPKA 2D5FA 1IPJA 4MX3A 3FNCA 2WC2A 3LOIA 4I01A 2B58A 1J3RA 4IEXA 4EV0A 4KU8A 4F0YA 2IXHA 5BUVA 2QCSB 3ES4A 4NVPA 2V09A 3TNPB 2CV6A 3EXNA 4I0BA 4L11A 3E5UA 3E0KA 4CAXA 2K9ZA 4Y49C 3SHRA 2R7HA 4MJ8A 1IYKA 3FHIB 5C8WA 4OAEA 1QSMA 4KVME 4E0AA 2XL9A 5FLIA 3ROUA 2B4DB 3DNSA 5DWNA 1RTVA 2DXQA 1S7NA 3H9AA 4YNIA 5FDBA 2VZYA 4LA2A 3KSCA 4HNXB 2OZJA 2XLAA 3IWZA 3LWCA 4K8FA 4AQ6A 2Q0YA 2R8VA 3VHRA 4ONUA 4XETA 5I8YA 3CLPA 4FAGA 2OA2A 4IETA 1PU9A 4HN0A 1OD5A 2F5IA 5IX3A 2O28A 1Y7RA 4QGLA 2IXCA 4LTAA 3G8WA 4PV6A 2C0ZA 3NE7A 5FVJA 1YVOA 2VZZA 2BYVE 5KTDA 4M85A 1QXJA 2B4DA 2B5GB 1RL3A 3SXWA 1S7KA 4R9MA 1SFNA 4XFBA 3FZ3A 4MUVA 1YR0A 3D2MA 1CAUB 3WW4A 1CM0A 4JTNA 4IEUA 4AVBA 1RUOA 2H6CA 1H1MA 2IXKA 1U12A 1ZRDA 1Y9WA 4XF1A 4MY3A 3LODA 4R3LA 1YFXA 5ISVA 2K5TA 3DR8A 1B6BA 3PP9A 4U9YA 1V70A 5F1RA 4MH0E 2QIRA 4JWPA 4LULA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GKBA 3W6XA 3B3QE 1UPSA 4LBQA 4EWEA 1O8SA 2XVGA 2ZCWA 2B39A 2ARXA 2Q1MA 2V4AA 2ZOGA 4Q1RA 3VDAA 2GNBA 4BQ3A 5KHHA 4QC6A 4B5PB 4IXLA 3E1F1 2OS2A 4OUSA 3FLPA 3PB6X 5FZAA 3B93A 4C1XA 3BIEA 1ZA4A 3V38A 1ND3A 2PJ7A 1Q7LA 3JVNA 4AGVA 2WS91 2GC2A 2OH1A 4Q0UA 3POBA 2HWB2 1LTEA 3MGUA 4QPWA 1AX2A 1AL23 4CDUB 3CXQA 2DU0A 2LROA 4OQ9A 2RDNA 2X5IB 2NZ9A 4KSIA 1R093 1XBFA 3KT4A 3VZMA 1S0FA 1S60A 1JI6A 4M0NA 4ET7A 1IQDC 3ZN6A 3ZSKA 3LSDA 3VDBA 1GZWA 1LAPA 5I8SA 3VHOA 2RG4A 5JSOA 4LKEA 1KWMA 1Q5OA 4MHRA 2RS53 4KL1A 1W8FA 3BJ7A 1QGLA 2LM3A 1RUNA 2JG8C 2ZS6B 2FQPA 4YG6A 4YGOA 2ILMA 1OH4A 2WQ4A 2ORZA 2FVGA 1QMUA 4FP3A 1V6KA 5F8PA 3D7FA 3EJKA 1MK4A 1EE3P 2V8GA 2BEIA 1SEFA 2D3RA 3V0AA 2VOWA 2QYVA 3M3EA 3GBWA 1TXRA 1UOGA 4J25A 3ZFEC 4R6TA 2NYYA 2DUPA 2JX9A 3PURA 3NWKA 3IPVA 3GLJA 5EC4A 4I3GA 4NO4A 1VBA3 2LRPA 5BNNB 4E9KA 2ET1A 3RZJA 4E27A 3NJYA 5G05L 4LK7A 5LA9A 1S0DA 4A31A 4GQ7A 5DUWA 2GZWA 3AX4A 4Y1XA 4YWYA 2H0BA 2WZR3 2F4PA 1QJY3 2WT2A 3IZOA 4MSVA 1AR92 1Q2DA 2IC1A 3J9SA 2ZELA 4M0HA 2BW8A 1XYPA 4QHBA 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4LULA
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1XE7 A;  4XFF A;  4BHP A;  2PAM A;  1IID A;  5J8C A;  5FPX A;  2B5G A;  4UA3 A;  2MPF A;  4HBN A;  4KOY A;  3FE5 A;  4MGI E;  4KOX A;  3W6X A;  3HQX A;  3MZH A;  1IIC A;  4NSQ A;  3CF6 E;  5F49 A;  1UW8 A;  1CAU A;  2PYT A;  4F8A A;  3H1W A;  1ZRE A;  1I21 A;  3OF1 A;  1ZX5 A;  3CJX A;  3EBR A;  4EWE A;  3CXS A;  2ZCW A;  1CGP A;  4IEO A;  3B02 A;  4HNY B;  3TO6 A;  4IEY A;  3E97 A;  2ARH A;  2VXK A;  4LX9 A;  4XNH C;  4Z82 A;  1XEB A;  4MBU A;  1VJ2 A;  3H8U A;  2BGC A;  3EHK A;  5KHH A;  3L2H A;  3LZZ A;  1PUA A;  4QC6 A;  4QX5 A;  4B5P B;  1GHE A;  2OZG A;  4I0A A;  1LRZ A;  5LEJ A;  4I3P A;  2GC1 A;  1N71 A;  1NMT A;  1Z4E A;  2CY2 A;  3RPQ A;  4FD6 A;  4KOS A;  2CNT A;  3BU7 A;  3IBM A;  4JTO A;  1YLL A;  4JXR A;  2PFW A;  4FD4 A;  4B5P A;  1Y9Q A;  4WBB A;  2WPW A;  5BV6 A;  2Q44 A;  2IXL A;  1LB2 A;  3FXT A;  3JVN A;  2Q7B A;  1YUD A;  2CAV A;  3DL3 A;  4GS4 A;  1XE4 A;  1WA4 A;  3GY9 A;  4HVR A;  1ZZC A;  4YRH A;  1O3S A;  1CJW A;  3CO2 A;  2GC2 A;  1NXM A;  1O7F A;  1UCX A;  2H0V A; 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 2VQY A;  3FWE A;  5BPX A;  1J3P A;  2JLM A;  1IPK A;  2D5F A;  1IPJ A;  4MX3 A;  3FNC A;  2WC2 A;  3LOI A;  4I01 A;  2B58 A;  1J3R A;  4IEX A;  4EV0 A;  4KU8 A;  4F0Y A;  2IXH A;  5BUV A;  2QCS B;  3ES4 A;  4NVP A;  2V09 A;  3TNP B;  2CV6 A;  3EXN A;  4I0B A;  4L11 A;  3E5U A;  3E0K A;  4CAX A;  2K9Z A;  4Y49 C;  3SHR A;  2R7H A;  4MJ8 A;  1IYK A;  3FHI B;  5C8W A;  4OAE A;  1QSM A;  4KVM E;  4E0A A;  2XL9 A;  5FLI A;  3ROU A;  2B4D B;  3DNS A;  5DWN A;  1RTV A;  2DXQ A;  1S7N A;  3H9A A;  4YNI A;  5FDB A;  2VZY A;  4LA2 A;  3KSC A;  4HNX B;  2OZJ A;  2XLA A;  3IWZ A;  3LWC A;  4K8F A;  4AQ6 A;  2Q0Y A;  2R8V A;  3VHR A;  4ONU A;  4XET A;  5I8Y A;  3CLP A;  4FAG A;  2OA2 A;  4IET A;  1PU9 A;  4HN0 A;  1OD5 A;  2F5I A;  5IX3 A;  2O28 A;  1Y7R A;  4QGL A;  2IXC A;  4LTA A;  3G8W A;  4PV6 A;  2C0Z A;  3NE7 A;  5FVJ A;  1YVO A;  2VZZ A;  2BYV E;  5KTD A;  4M85 A;  1QXJ A;  2B4D A;  2B5G B;  1RL3 A;  3SXW A;  1S7K A;  4R9M A;  1SFN A;  4XFB A;  3FZ3 A;  4MUV A;  1YR0 A;  3D2M A;  1CAU B;  3WW4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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