4OLLA

Camp-binding acyltransferase from mycobacterium smegmatis
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
333
structure length
316
Chain Sequence
VAELTEVRAADLAALEFFTGCRPSALEPLATQLRPLKAEPGQVLIRQGDPALTFMLIESGRVQVSHAVADGPPIVLDIELIIGEIALLRDAPRTATVVAAEPVIGWVGDRDAFDTILHLPGMFDRLVRIARQRLAAFITPIPVQVRTGEWFYLRPVLPGDVERTYRRFQSVRKPTRALLEYLFEVDYADHFVWVMTEGALGPVIADARFVREGHNATMAEVAFTVGDDYQGRGIGSFLMGALIVSANYVGVQRFNARVLTDNMAMRKIMDRLGAVWVREVVMTEVDVPPVDTVPFEPELIDQIRDATRKVIRAVSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Allostery and Conformational Dynamics in cAMP-binding Acyltransferases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetyltransferase Pat
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium smegmatis
total genus 86
structure length 316
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.3.1.-:
pdb deposition date 2014-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4ollA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4ollA02
1S5KA 3S6HA 1Y3TA 3D2PA 1S7LA 2FQPA 1U12A 2XHKA 2I45A 1ZRRA 4Q0VA 4KZTA 1CM0A 5JQ4A 1OFNA 1M44A 3FFQA 4Q0QA 1MJ9A 4UBRA 4LTAA 5BPXA 1J58A 4K30A 4H6ZA 3PNAA 2PR1A 1CX4A 3TE4A 1VHSA 1P4NA 4U9YA 4XFGA 5F46A 1UIJA 4AXOA 3NSTA 2B5GA 1DZRA 2D5HA 5EZWA 1I1DA 5C82A 1O3TA 3GYDA 1RTVA 4MI4A 1CAUA 2P6EA 4JD6A 1J3PA 3G7DA 1I12A 3C3VA 1S7NA 5CADA 1RUNA 4UWJA 5BUVA 3RYKA 5I0SA 2EAAA 2P6GA 4JWPA 1ZX5A 4MJ8A 3TO6A 3E5UA 1JUHA 2O8QA 2CV6A 4CAWA 3LA2A 3K9UA 4LA2A 4MY3A 1YFXA 4I3PA 5CVRA 3GBFA 1KUYA 1CAVA 4ZU7A 3D82A 3OD0A 1PU9A 5KHJA 2FIAA 2OU2A 4J3GA 1Q5OA 3RYPA 1V0CA 4L11A 4M3SA 2B4BA 5H84A 4NVPA 1OMIA 1ON0A 2REEA 3SHPA 2IC1A 2H6BA 3IBMA 4PSXA 3U11A 3SXNA 3I59B 1X82A 1YFUA 4NEXA 1WGPA 3HIFA 1X8MA 4H6UA 5FPZA 3EO6A 2FIWA 2XLGA 2GANA 3GKRA 4PV6A 1LKNA 5I0TA 4MGIE 4UWIA 1MJAA 5KBFA 5F49A 4HN0A 2H0VA 2GC1A 4XF9A 3PP9A 4R87A 3EBRA 1NYWA 2Q4VA 3UY5A 4KOVA 4N9HA 5CU1A 3ES1A 4TLFA 4R52A 3RDIA 3ZDSA 4BHPA 3FRMA 3CF6E 4QB9A 4FAHA 5I8TA 4QBJA 1RL3A 4PIXA 2D93A 4F0YA 4NXYA 5I8YA 3DR8A 3G3SA 3PGPA 3TOAA 1S7FA 1SQHA 4QGMA 4F7ZA 3VWDA 3LZZA 2K0GA 5C8WA 3KSCA 4XFCA 5BV6A 5KHGA 5EFUA 4LA3A 2PAEA 2GE3A 4U5YA 5FVJA 3R1KA 4Y49B 2OZ6A 4YSFA 3IDBB 4DNCA 2JDDA 4XFFA 3T90A 2K5TA 4O9EA 2HJIA 4JJXA 2PFWA 4XFIA 3LODA 4FBFA 4RS2A 4FD6A 4E2SA 1Q2CA 3IDCB 1O3SA 5I8SA 4OFGA 4I0AA 1KUXA 3CO2A 4XFAA 3S7EA 2PTMA 3KMHA 1L0CA 1XE4A 4KVME 3FWEA 4EROA 4E0AA 1NMTA 1Y9KA 4PK3A 1YR0A 1IYKA 2PQ8A 1VP6A 1LRHA 2Q1ZB 5E96A 4QM9A 1ZZ9A 2OB0A 2B3UA 1I21A 3N4MA 3F8KA 4HN1A 4PSWA 3ETQA 1XF8A 2D5FA 3QAHA 3NJZA 1CAUB 2OPKA 5JSPA 5EBVA 4UBGA 1Y7RA 1Z9UA 5I0UA 3BU7A 2BNMA 2B8MA 4I0BA 4RD7A 2XLFA 5JCTA 1M4GA 1Q3EA 2F5IA 2R1IA 4MGZE 2EVNA 3ROUA 4JTOA 4KORA 1UFHA 3H50A 1NE6A 3QB8A 1NXMA 1CAVB 1QXRA 1ZRDA 1ZNPA 3FB3A 3SHRA 3USSA 2XL7A 3M70A 1ZVFA 3U0ZA 1FXZA 3CLPA 3QACA 4JVAA 3RNSA 3FIXA 3R95A 1YK3A 2QVSB 4ORFA 3RPQA 5BY5A 1RUOA 5LRRA 2BNOA 3ELNA 2Q44A 4QGNA 2ZPAA 3WR7A 2VPVA 3CXQA 4Y49C 4MGKE 2I00A 1ZRFA 4HNYB 1YVKA 4QVTA 5KTAA 2BUEA 2NMTA 2VI7A 4PIZA 4ZU5A 4KOSA 4YRHA 2XKOA 2XL9A 4HSLA 1EY2A 2J8NA 3SXOA 4FT8A 5HH1A 1FT9A 2IXCA 4KVOE 4LEJA 2WFPA 4I09A 5I91A 1P0HA 3KGZA 2FS5A 1H1MA 2OZGA 4XNHB 5EC4A 1R57A 4I02A 4J1WA 3H4QA 5I0RA 3IWZA 2QMLA 4CRZB 1DGWA 1GQHA 3FHIB 4GULA 4L2NA 5CNPA 4II9A 3KCCA 2OZUA 1SFNA 4QGLA 1XRUA 3QOPA 4J1XA 3N7ZA 4IEZA 2FXFA 4YNIA 2AE6A 2FE7A 5F47A 2GZWA 1QWRA 4HSJA 1O7FA 3OF1A 4ZU4A 5BXXA 2O28A 1OD5A 3LOIA 3FJSA 4Q0PA 4P9GA 2OZHA 3KKWA 3P2HA 5AVPA 5D1IA 1J59A 2KCWA 2BSWA 5HMNA 4CRYB 3CJXA 1YHFA 1KUVA 2BEIA 4MUVA 1RO5A 2DXQA 3FBUA 3E0KA 3GY9A 4MHDA 1NSLA 1U6MA 2ZW4A 2BNNA 4BIFA 4CAVA 2K9ZA 2Y0OA 3EO4A 3I3GA 1TIQA 5JSOA 1EPZA 5HI0A 1QSNA 4R3KA 1DZTA 4META 3S0MA 5LEJA 2KXLA 1V70A 1G6NA 1Q43A 4H7LA 1VKCA 2CY2A 3UKTA 2QECA 2D40A 2JDCA 4UBHA 5IX3A 3E97A 3SCFA 3F0AA 4CS0B 2GU9A 4WBBA 2IL4A 3KGLA 4LUKA 3H7YA 4EWDA 1M4DA 1I5ZA 3B02A 2R7HA 3TO7A 1X7NA 1YLEA 1S7KA 4HMZA 2WPWA 4WZCA 2HQYA 1VR3A 2ATFA 2BYVE 4IEYA 4XF0A 4XPDB 3I7DA 4IERA 5FQ0B 3DV8A 3OGJA 4LUMA 1QSTA 3TT2A 4Q0SA 2EA7A 3RZZA 1QY4A 3FE5A 4KL1A 2C0ZA 3DNSA 3H3ZA 3ZJ0A 5FLIA 4Z07A 1O5UA 4XF4A 2BL1A 4MGYE 3H1WA 3MPBA 1UPIA 3BLNA 2QJVA 1Z4EA 5E1RA 3BCWA 5JR7B 3E6DA 5LRSA 2WC2A 2GAUA 4HNXB 4LUAA 1RXTA 4LULA 2PAKA 1CGPA 3CXPA 4XEZA 3D8PA 4F6AA 3EXNA 4OLLA 3L2HA 2EUIA 4FD7A 2UY9A 1PMIA 3UKNA 2BGCA 3CEWA 1EP0A 4I01A 2ATRA 2ZXVA 4QUSA 4XETA 3CXSA 4O9GA 3HT2A 4HVQA 3TNQA 3WW1A 2UYBA 4JXRA 1MJBA 1K4JA 4OADA 1PUAA 1YREA 3EY5A 4AVBA 3TO9A 4JV4A 3BJ8A 1YFWA 3OCPA 4YGOA 3H7JA 3H8UA 4B5PB 2V09A 4CYDA 1X8EA 3H9AA 5FCCA 4N9IA 5KHKA 2WPXA 3V8IA 4UXAA 1SQ4A 4KVXA 4E8OA 2PHLA 5J3UA 5JPHA 4DINB 2JLMA 4HKFA 3LA3A 4IF5A 1QSRA 4R8HA 5FQ0A 2IXKA 2VQYA 3NE7A 1BO4A 2OH1A 4QXKA 1DGRA 1J4JA 1FI2A 4U9ZA 1M4IA 4IEOA 5KTDA 5I93A 3JZVA 1YUDA 4XPDC 4WVZA 2FT0A 4AB7A 5JSRA 2ZW5A 4E2AA 4BH9A 2O1QA 4MZUA 1LR5A 3LWCA 2Z11A 2VZYA 1ZZ6A 4KWLA 3EQEA 4KU7A 4HVRA 2P17A 4X6QB 4ZBGA 4R9MA 1RC6A 3JVNA 4YYOA 3CL1A 4AQ2A 2GC3A 4QC6A 1IPJA 1O5LA 2ET7A 5FLHA 5FLJA 4EWEA 2PSWA 4AVAA 3MGDA 3IIAA 4PJYA 3R9GA 3S6GA 4PIYA 4L8AA 3PVBB 2QIRA 3DR6A 5DWNA 1QXJA 3FZ3A 4IESA 4IEVA 3WW3A 3IWGA 2IXHA 2G3TA 3H1MA 2Q4SA 3LD2A 4IEWA 1LRZA 2HKXA 3DDDA 2Q0YA 3E6CC 3S7IA 4HZFA 3WW2A 1OZPA 3IGRA 4XPLA 4HLTA 4KWKA 4B5PA 3HQXA 4MY0A 3OTFA 3D0JA 5FDBA 5IB0A 1UW8A 4PK2A 2PA7A 4KU8A 3SCHA 2OA2A 4AQ6A 4B29A 4I49A 1GQGA 4FD5A 4LX9A 3DL3A 2HUZA 4K8FA 2VQAA 3O14A 1KZFA 1N71A 1CAWB 4XPKA 3P2FA 2XGXA 2H5MA 1CAXB 4MV2A 4IEPA 3TTHA 3VHRA 2MNGA 4NF1A 4R57A 2J8MA 1I6XA 2G0BA 1Z4RA 3NL1A 1NE4A 4KOWA 2D4OA 2ZCWA 3ZZIA 2CNMA 5E16A 3ES4A 1IYLA 2Z2SB 4AG9A 5C88A 3SMHA 1YWKA 4QX5A 3LA7A 3SCGA 1XEBA 1ZZ7A 2F4PA 2N7GA 2DCTA 4JXQA 1YLLA 3M3IA 2E9QA 4QM8A 4FAGA 3E5QA 4XF1A 3FXTA 4MX3A 3F5BA 5GCNA 1Y9QA 1PM7A 3U10A 1WWZA 5DWMA 1ZRCA 3R9FA 2GC2A 1J1LA 3I54A 5J8CA 3EHKA 4QMAA 1UCXA 2PRBA 3OWCA 3MDPA 4IETA 3R6SA 2ETEA 4JTNA 3RYRA 1VJ2A 3W91A 2UY8A 2CAVA 2RC4A 4M85A 1H1IA 1WLTA 4RI1A 3FX3A 5K8SA 1HW5A 2R8VA 2MPFA 3C26A 4KLWA 3S6FA 5J7MA 2PC1A 3EC4A 4IUSA 3EJKA 4XFBA 1M1DA 3GYAA 4KOYA 1YX0A 3R9EA 1ZZCA 2Q4YA 5KHHA 2Z10A 1IIDA 4KOXA 4FD4A 3I9SA 1ZZ8A 4XNHC 4KOTA 3RYOA 2B4DA 1WA4A 3NKTA 2PYTA 1B87A 1B6BA 1CAWA 2VZZA 2QDRA 1CAXA 3NVCA 3PLQA 1ZZBA 1BOBA 5ISVA 2ZW7A 3TCVA 2B3VA 2Q7BA 3MZHA 1S3ZA 5FPXA 2HV2A 2Y0MA 1O4TA 1ZREA 5I0CA 2OZJA 3ACLA 1IPKA 4HBNA 3H3UA 3BB6A 1YGHA 2PR8A 3WW4A 3PZJA 1O3QA 2J8RA 4BYYA 2FL4A 2PHDA 4X5KA 5J8FA 2ET1A 1WK4A 3W6SA 3NW4A 5J48A 4I2OA 2D4PA 3W6XA 2FMYA 4E2QA 3BALA 1O3RA 2G3AA 4F8AA 2IXLA 5F48A 4A2UA 2FSRA 1YFYA 2B5HA 2Q30A 3LAGA 4E2GA 2CGPA 4NCZA 4EVYA 1IB1E 2IXJA 5T3NA 3ST7A 2PDOA 4H89A 1UIKA 3TFYA 2MHFA 3SXWA 1J3QA 2B58A 2B9UA 2C27A 4BMHA 5IV0A 2UYAA 3H1YA 2ZW6A 4XFHA 2Q0AA 1XE8A 3JUWA 2Q04A 2VEZA 2ZKLA 3E6BA 3D3SA 3DSBA 3EFAA 4EV0A 4MBUA 1CJWA 4IEQA 2AJ6A 2CAUA 4HNWB 1Q2DA 3I59A 1Y9WA 4MH0E 4GS4A 4Q0UA 4OAEA 2GIVA 1GHEA 2XLAA 4LLOA 1XIXA 2GH2A 1L3JA 4Q29A 2R98A 3BJ7A 2FCKA 2P0WA 4KUBA 1YVOA 3FNCA 3HT1A 1UD1A 2GC0A 3E5XA 3TNPB 2REFA 4KOUA 1XE7A 2ARHA 3T9YA 2B5GB 4YARA 4NSQA 1RGSA 3D0SA 1IICA 2VECA 3B8GA 3BPZA 4JLYA 1XMTA 1QSOA 4ONUA 1SEFA 4IEXA 4KWJA 5F1RA 2VXKA 5C6CA 4AVCA 4CAXA 2CNSA 4R3LA 1MK4A 2A4NA 3MYXA 4HVOA 4KUAA 3G8WA 2Z69A 1EYBA 4AG7A 2JEVA 5JAXA 4UA3A 1Q2YA 2X7BA 3S6KA 1J3RA 4D7TA 3R96A 3UKVA 3VWEA 4XF3A 2BEOA 2QCSB 2XKPA 4X6RB 2P6FA 2CNTA 2PAMA 1NE9A 1S60A 1OI6A 2EVXA 2QNKA 3D2MA 5KTCA 1NZCA 2IXIA 4IEUA 2Z0ZA 5H86A 3TOBA 5LEKA 4KLVA 1FY7A 4Z82A 4EWAA 1LB2A 4D7SA 2VBQA 2H6CA 2I79A 2B4DB 3FYNA 4B5OA 3DKWA 4YRDA 2OYZA 1TQ5A 3DN7A 5KHIA 1QSMA 4L89A 4YFJA 2PQQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HNBM 4QPGA 4UBRA 4N90A 1FOD2 2R041 1CX4A 3WEZA 1P4NA 5GLUA 2D5HA 4CEWC 4FQ4A 1K5MA 3HNMA 4GMP3 1ND3C 5FP9A 3D6EA 3SI0A 4MJ8A 4Z8BA 3GF6A 1JUHA 2BUKA 3D68A 1SCRA 4AGVA 1B35A 2OU2A 5KHJA 3M1HA 2REEA 2Y6LA 1RMU3 2W1WA 2VY0A 3I2DA 3VKMA 2GANA 2ZGSA 2RM23 1S0EA 3HPNA 4B7KA 4KG0A 4CXXA 3N9OA 3P3NA 4YU9A 3PHMA 3DEMA 2D93A 1REFA 2P6CA 1QMUA 3LSEA 1KITA 4F7ZA 5DDJ2 4LA3A 4MHRA 5CISA 5KR7A 5FZAA 4XFFA 5CBLA 3DUIA 2JDHA 4YW5A 3LODA 1KFXL 4PDWB 4FD6A 2DVBA 2OPWA 2C1CA 2RDNA 3S7EA 1XE4A 4MCPA 4KVME 4C91A 3NJYA 5AFBA 4FTBA 3F8KA 1W9FA 3BU7A 4ZS2A 1HXS1 2CSGA 2ZEGA 3ZSEA 4BQXA 3VKOA 3H50A 4N43A 4UEFA 2ZEOA 4E27A 1QJU3 3WY6A 4JVAA 3R95A 1YK3A 2DURA 1NSAA 5FPBA 4INDA 1PHMA 3CXQA 3ZSJA 4ZU5A 3UT0A 1W6OA 5I91A 2XBO2 3KGZA 3IC1A 1R57A 1DGLA 2VTXA 1SBDA 5FYHA 5LB6A 1GANA 3O1VA 1O8SA 5L7OC 3VBOC 5HVFA 1GNHA 3HNYM 1J59A 2BSWA 1VAMA 1YHFA 2BOIA 2VVFA 2VU9A 4F9UA 4BIFA 2JDAA 4QQHA 2B42B 4KI5M 3GGLA 3LOBA 1HDKA 1N1VA 1ASJ2 3B02A 1A78A 1CJPA 4YWYA 1RVF3 5FXVA 2HQYA 1VR3A 2R1BA 1IS5A 1US2A 1K45A 4C7HA 4HKWA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1S5K A;  3S6H A;  1Y3T A;  3D2P A;  1S7L A;  2FQP A;  1U12 A;  2XHK A;  2I45 A;  1ZRR A;  4Q0V A;  4KZT A;  1CM0 A;  5JQ4 A;  1OFN A;  1M44 A;  3FFQ A;  4Q0Q A;  1MJ9 A;  4UBR A;  4LTA A;  5BPX A;  1J58 A;  4K30 A;  4H6Z A;  3PNA A;  2PR1 A;  1CX4 A;  3TE4 A;  1VHS A;  1P4N A;  4U9Y A;  4XFG A;  5F46 A;  1UIJ A;  4AXO A;  3NST A;  2B5G A;  1DZR A;  2D5H A;  5EZW A;  1I1D A;  5C82 A;  1O3T A;  3GYD A;  1RTV A;  4MI4 A;  1CAU A;  2P6E A;  4JD6 A;  1J3P A;  3G7D A;  1I12 A;  3C3V A;  1S7N A;  5CAD A;  1RUN A;  4UWJ A;  5BUV A;  3RYK A;  5I0S A;  2EAA A;  2P6G A;  4JWP A;  1ZX5 A;  4MJ8 A;  3TO6 A;  3E5U A;  1JUH A;  2O8Q A;  2CV6 A;  4CAW A;  3LA2 A;  3K9U A;  4LA2 A;  4MY3 A;  1YFX A;  4I3P A;  5CVR A;  3GBF A;  1KUY A;  1CAV A;  4ZU7 A;  3D82 A;  3OD0 A;  1PU9 A;  5KHJ A;  2FIA A;  2OU2 A;  4J3G A;  1Q5O A;  3RYP A;  1V0C A;  4L11 A;  4M3S A;  2B4B A;  5H84 A;  4NVP A;  1OMI A;  1ON0 A;  2REE A;  3SHP A;  2IC1 A;  2H6B A;  3IBM A;  4PSX A;  3U11 A;  3SXN A;  3I59 B;  1X82 A;  1YFU A;  4NEX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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