4ORFA

Camp-binding acyltransferase from mycobacterium smegmatis, mutant r95k
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
332
structure length
319
Chain Sequence
AELTEVRAADLAALEFFTGCRPSALEPLATQLRPLKAEPGQVLIRQGDPALTFMLIESGRVQVSHAVADGPPIVLDIEPGLIIGEIALLRDAPKTATVVAAEPVIGWVGDRDAFDTILHLPGMFDRLVRIARQRLAAFITPIPVQVRTGEWFYLRPVLPGDVERTSETLYRRFQSVRKPTRALLEYLFEVDYADHFVWVMTEGALGPVIADARFVREGHNATMAEVAFTVGDDYQGRGIGSFLMGALIVSANYVGVQRFNARVLTDNMAMRKIMDRLGAVWVVVMTEVDVPPVDTVPFEPELIDQIRDATRKVIRAVSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Allostery and Conformational Dynamics in cAMP-binding Acyltransferases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium smegmatis
molecule keywords Acetyltransferase Pat
total genus 96
structure length 319
sequence length 332
ec nomenclature ec 2.3.1.-:
pdb deposition date 2014-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4orfA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4orfA02
2JDCA 1B87A 2P6FA 1VKCA 3LAGA 2IXJA 4PIZA 4IETA 2VZZA 4KOTA 3FX3A 3PNAA 3D3SA 4KVOE 2XGXA 4F7ZA 4I01A 1ZRFA 1YFXA 1M4DA 2XL7A 2MHFA 2Z2SB 1Z4EA 5KHGA 5J8FA 1J59A 3FIXA 3VHRA 4MGYE 1UPIA 4Z82A 3OGJA 4WVZA 2ET7A 2GC3A 1RUOA 2B58A 2J8MA 2PTMA 5LEKA 1OMIA 3MPBA 1CAUA 2V09A 3E0KA 4ONUA 2EVNA 4FBFA 1GQGA 3RYRA 3IWZA 3E6CC 1V70A 4N9HA 2A4NA 3TTHA 1S3ZA 4U9YA 5F47A 4OLLA 4JVAA 4JTNA 4XFCA 1OZPA 1VHSA 2QVSB 3ST7A 4RD7A 4FD5A 1LB2A 4LUAA 4QVTA 1IYLA 3TE4A 1KUXA 5JSPA 2N7GA 4XFHA 1Y9KA 4X6QB 3WW4A 2ATFA 4NEXA 2BNNA 1OD5A 2C0ZA 4JV4A 3ES4A 4L8AA 2QCSB 3D0JA 3LD2A 3C26A 2PAMA 4KWJA 3EXNA 4K30A 4ZBGA 1ON0A 2FL4A 4ZU5A 3BALA 3HIFA 4I02A 4FD4A 3W6XA 3H1MA 4QGMA 5F48A 1O4TA 3H7JA 5E96A 3TNQA 3H3UA 5T3NA 4KLVA 1LR5A 5FDBA 1DZTA 2R1IA 3CXQA 2D5FA 5I8SA 1X8EA 1YVOA 2KCWA 4RI1A 3H1WA 4MBUA 1J1LA 3IBMA 1ZRCA 1QSTA 4I49A 3QOPA 3TNPB 4KUBA 4NF1A 2G3AA 4QB9A 4HMZA 2H5MA 3G7DA 2D4OA 2PRBA 4XFGA 2I00A 5C6CA 1CGPA 1YK3A 2ATRA 1ZZ9A 2RC4A 3K9UA 1WA4A 3U10A 4NSQA 1M4GA 3N7ZA 1I6XA 3W6SA 4IUSA 4IESA 3H50A 1ZVFA 2GIVA 4E2GA 3SCFA 1O5LA 2R8VA 4B5PA 2GC0A 4JJXA 4YYOA 5KTCA 1Q43A 2NMTA 3R9GA 2CAVA 4H89A 4YNIA 2GANA 4QGNA 3ZDSA 3G8WA 3SHPA 3CEWA 3GYAA 5FVJA 3TT2A 3WW1A 4H6ZA 3KKWA 2OB0A 3FJSA 4HN1A 5KTAA 3BJ7A 3S6KA 2GU9A 4O9EA 1UFHA 5LRSA 5BY5A 5F49A 1YFWA 2Q4YA 3CLPA 4EROA 4NCZA 1J58A 3UKVA 1M4IA 2VBQA 1DZRA 4R3LA 3FRMA 3FFQA 2B5HA 3CO2A 5BV6A 2CGPA 2GAUA 1ZZ7A 3D82A 1YFYA 2CAUA 3NW4A 4AVBA 2BNMA 4FAGA 3L2HA 4X6RB 2XL9A 1O3QA 4PIYA 1X8MA 2JLMA 1CAVA 2QIRA 2D40A 1Q2YA 4HNXB 5HMNA 2HJIA 3FBUA 5K8SA 4H7LA 4I2OA 3FXTA 5FQ0A 1RC6A 2XLFA 4XFFA 3OWCA 1LRZA 4U9ZA 3TO6A 1ZRRA 4BH9A 3TOAA 4KLWA 1Q3EA 4HSJA 2EAAA 4Q0UA 3SXNA 4AG9A 2ZXVA 3DV8A 4HZFA 5AVPA 1QSNA 1CJWA 4XFAA 1XE7A 4Q0VA 2FIWA 1H1IA 1IB1E 4WBBA 1EYBA 1SEFA 4PV6A 3QB8A 1UD1A 4KVME 3RYOA 2E9QA 4XF3A 2O28A 3T9YA 2OZGA 1Q2CA 2CY2A 2HV2A 1YX0A 3ES1A 3MZHA 3LA3A 3ZZIA 3UY5A 3WR7A 4KORA 1SFNA 2CNSA 4YRDA 1YREA 2OZJA 4JXQA 1EP0A 3EBRA 4PK2A 2H6CA 5EFUA 1MJAA 4LEJA 4XNHB 1SQHA 1NYWA 3E6DA 3LOIA 4D7TA 1QSMA 4MZUA 2PA7A 1Z9UA 2PR1A 3CJXA 1IIDA 1NXMA 1CAUB 1SQ4A 3CL1A 3KCCA 3KSCA 2R7HA 2ZW4A 3P2HA 1VR3A 5C88A 5JQ4A 5FPZA 1GQHA 2IL4A 1QWRA 3R1KA 4FD6A 2BL1A 3F8KA 2WPWA 5CU1A 5I0SA 2B4DA 2IXHA 2FS5A 2Z10A 1M1DA 4UBHA 5H84A 4L2NA 4IEQA 2HQYA 5EBVA 2HKXA 3SCHA 3SMHA 4YARA 3H4QA 3W91A 3OF1A 5E16A 3R95A 4JWPA 1Y9WA 2PHDA 2Y0OA 2FIAA 3RNSA 1P4NA 2Q4SA 2PQ8A 2R98A 4PJYA 5FPXA 3U11A 2P6GA 3RYPA 3B02A 2H0VA 2JDDA 4MH0E 2BYVE 4HVRA 3LA7A 3M70A 5I0CA 3H1YA 1I12A 3GY9A 3D0SA 4E2AA 4CRZB 2OZUA 3MDPA 2P0WA 3E5QA 2UY8A 1NSLA 4KZTA 5LRRA 3RDIA 1FY7A 2UYBA 4PIXA 2AJ6A 3EFAA 3R9FA 4NXYA 3BPZA 2GE3A 3S6GA 1OFNA 3FE5A 4ZU4A 5BPXA 3OCPA 4QM9A 5F1RA 3DSBA 2MNGA 2EUIA 5HH1A 4DNCA 2QNKA 1EPZA 4XPLA 2K5TA 4GULA 3OTFA 3NJZA 2Q1ZB 2QJVA 4LA3A 4XETA 2FCKA 2IC1A 1NE4A 4LLOA 3WW2A 4KOXA 4CAWA 5CADA 1JUHA 3JZVA 1VP6A 4XEZA 3P2FA 3OD0A 2VXKA 1S60A 5LEJA 1WWZA 5F46A 4KU7A 3KGLA 4K8FA 4B5PB 2XKOA 4MX3A 4CS0B 3NVCA 4EVYA 2Q0YA 5KTDA 2BSWA 4F8AA 2VZYA 5EZWA 4GS4A 2Z69A 3DL3A 3UKTA 4CYDA 4LA2A 2G0BA 4FD7A 5E1RA 3M3IA 2IXLA 4E2SA 5IX3A 3U0ZA 2BNOA 2B9UA 3GKRA 3PZJA 1J4JA 5ISVA 1G6NA 1UCXA 1DGWA 1RUNA 3ZJ0A 2XHKA 2Y0MA 4I09A 4XPKA 3DN7A 5C82A 1ZREA 4AXOA 2CNTA 3E5UA 2B3UA 4QMAA 3GYDA 1KZFA 3IGRA 2OA2A 2WFPA 4HBNA 5IB0A 4KOUA 4XNHC 2D93A 1H1MA 4IEVA 3CXSA 1CAVB 1S7LA 3WW3A 4ORFA 1XIXA 1EY2A 2WC2A 4E0AA 2MPFA 5FQ0B 4Q0QA 3HQXA 1QXRA 4ZU7A 4MY0A 3FWEA 4OFGA 1KUYA 1VJ2A 1FI2A 4UWJA 4CAVA 1QY4A 4QX5A 2D4PA 2VEZA 2XLGA 4KVXA 4AVCA 1U12A 2O1QA 4MGIE 2HUZA 2PDOA 1XF8A 1WGPA 1XMTA 1PU9A 3DNSA 4Y49C 3PVBB 4QBJA 4META 2JEVA 1FXZA 3QAHA 4CAXA 1J3PA 1S5KA 2VI7A 4F0YA 2B8MA 5GCNA 1WLTA 4UA3A 1S7NA 3RYKA 4R3KA 4R52A 5CVRA 1PUAA 5JAXA 4QM8A 4HSLA 2ETEA 3FNCA 4DINB 3BCWA 3ETQA 2ZW5A 4HNWB 1IPJA 3UKNA 4KL1A 4B29A 1YLLA 4L11A 1ZZ6A 3NSTA 2PC1A 4L89A 4FAHA 2REEA 2Q30A 4UXAA 2OZ6A 1CAXB 5FLJA 1KUVA 1QSRA 4MI4A 1IYKA 3I3GA 1NE6A 2KXLA 2G3TA 1YLEA 4LULA 3TOBA 1LKNA 4Z07A 3LODA 4PK3A 5FCCA 3IWGA 2ZPAA 3KGZA 2F5IA 3DR6A 3LA2A 4KOYA 4YRHA 4IEZA 1BOBA 5I0UA 5JPHA 2VECA 2XLAA 1IPKA 2B4DB 1Q5OA 5I8YA 1PMIA 2FE7A 3B8GA 4A2UA 1YFUA 4IEOA 1ZZBA 1ZRDA 1O7FA 1YUDA 4KU8A 1WK4A 2B3VA 3EO4A 3TO7A 1YHFA 3VWDA 2FXFA 1XE8A 4I3PA 2D5HA 4IERA 3S6FA 3SXWA 1CAXA 2IXCA 3ELNA 2EVXA 5I93A 4OAEA 1R57A 4IEUA 2P6EA 1OI6A 2UYAA 4I0BA 4QXKA 1TIQA 2PR8A 3I9SA 3I59B 2F4PA 1NZCA 1O3TA 4HNYB 1X7NA 4LX9A 4YGOA 4R9MA 1DGRA 3FHIB 1YR0A 2GZWA 2PFWA 5KHIA 4EWDA 2PAKA 4UWIA 4YFJA 2BGCA 4XF9A 4X5KA 4II9A 3DR8A 4MJ8A 1UW8A 5IV0A 3RZZA 4Y49B 1X82A 4PSWA 1ZZCA 3N4MA 3EHKA 2OZHA 3TO9A 1MK4A 1YGHA 2GH2A 2Z11A 3EY5A 5DWMA 2Q0AA 1L0CA 3PGPA 1ZNPA 4JTOA 4LUKA 4KOSA 4M3SA 1TQ5A 3I59A 3E5XA 1I1DA 3IIAA 5KHJA 1NMTA 1CAWA 4XPDB 3PLQA 1K4JA 2WPXA 1L3JA 5EC4A 4FT8A 4O9GA 4J3GA 4I0AA 2FT0A 4CRYB 1IICA 2ZW7A 3NE7A 4R8HA 2ZKLA 2VPVA 2ZW6A 1QSOA 5J3UA 1ZX5A 4HVQA 2BEIA 3R9EA 1GHEA 3D2MA 1BO4A 3DDDA 3H9AA 2GC2A 1RO5A 4F6AA 3D8PA 2XKPA 3I7DA 2PSWA 3S6HA 1V0CA 4MY3A 3C3VA 5CNPA 3T90A 3SHRA 2FSRA 3USSA 2J8NA 4M85A 2H6BA 1RXTA 2IXIA 4YSFA 5I0RA 4IEPA 2J8RA 3LZZA 4TLFA 5HI0A 2BUEA 1RTVA 3PP9A 5JSRA 1J3RA 2PQQA 3EQEA 4HVOA 2Q4VA 3F5BA 1N71A 3IDBB 3O14A 3QACA 3TFYA 4HN0A 1CM0A 3FB3A 5C8WA 3H7YA 4PSXA 1QXJA 3H8UA 1M44A 1Y3TA 4NVPA 1LRHA 4U5YA 1O3RA 2ZCWA 4AG7A 4E8OA 3MYXA 2IXKA 5BUVA 4LUMA 1ZZ8A 3LWCA 4LTAA 5J48A 3HT2A 4QUSA 1PM7A 4XF4A 1MJ9A 2Q7BA 4OADA 2CNMA 3EC4A 3GBFA 2K9ZA 5I91A 3TCVA 4MGZE 3E6BA 5FLHA 1YVKA 4JD6A 5KHHA 2BEOA 2GC1A 1FT9A 1YWKA 5JSOA 3ROUA 1MJBA 2PHLA 5H86A 1Q2DA 3SCGA 4KOWA 5J7MA 3G3SA 4AB7A 4R87A 1XE4A 4HKFA 2AE6A 1I21A 3V8IA 1Y9QA 2CV6A 3FZ3A 4IEWA 4XPDC 4XF1A 3BJ8A 4IEYA 4HLTA 5I0TA 3NL1A 4AVAA 4MHDA 4QC6A 3CF6E 5KHKA 3JVNA 3D2PA 3JUWA 3MGDA 2DCTA 4BIFA 2EA7A 2ET1A 4BHPA 2I79A 4WZCA 3F0AA 2ARHA 2OPKA 2FMYA 3EJKA 3I54A 1XEBA 4D7SA 4EWAA 4KUAA 2Q04A 2OYZA 1B6BA 2VQAA 1U6MA 3ACLA 3NKTA 4JLYA 1RGSA 3S7IA 4BMHA 4IEXA 4QGLA 5D1IA 1NE9A 2REFA 4KOVA 3S0MA 2P17A 3DKWA 1Y7RA 4KWKA 2Q44A 3E97A 1UIJA 2FQPA 4J1WA 3FYNA 2Z0ZA 5JCTA 5JR7B 4P9GA 3EO6A 3S7EA 4XFIA 5BXXA 2O8QA 4UBGA 3R6SA 4KWLA 4AQ6A 4BYYA 3IDCB 2B5GB 4RS2A 3VWEA 4H6UA 1O3SA 1O5UA 4MV2A 4XF0A 2DXQA 4N9IA 3CXPA 1CX4A 1CAWB 1RL3A 4JXRA 2OU2A 4IF5A 1UIKA 4Q0SA 5J8CA 2PAEA 4J1XA 3RPQA 2QECA 2C27A 4Q29A 1S7FA 1I5ZA 4R57A 3KMHA 4XFBA 2K0GA 2OH1A 2X7BA 5FLIA 2B4BA 4B5OA 1J3QA 2UY9A 5I8TA 3R96A 2QMLA 5DWNA 3BB6A 3BU7A 2I45A 1XRUA 4EV0A 3HT1A 1HW5A 4E2QA 4AQ2A 1P0HA 2B5GA 1S7KA 3BLNA 3H3ZA 3SXOA 2VQYA 2PYTA 4EWEA 4UBRA 4Q0PA 2QDRA 5KBFA 1Z4RA 4MGKE 4MUVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4S2GA 4KOTA 4XAAA 1E5IA 1UYYA 2AENA 3VDBA 1JQGA 3E0KA 3B3WA 2JDKA 4UEEA 4M4PA 4NEXA 4NMIA 4JGZB 5K8PA 1D7PM 3N9NA 2VOKA 5FZOA 2P34A 1M4LA 3CXQA 2BGPA 4PF1A 1RTQA 2YGLA 4DO0A 4NIAA 1IHMA 3POYA 1UOJA 2RDSA 4XJ8A 1U5XA 3U10A 1RJ7A 4WV8A 2I2SA 3RZJA 2RM22 4YYOA 4H89A 4WVVA 2ADEA 2DFCA 4N90A 3FN9A 5T5LA 4R8FA 4CDWC 3WD5A 4NCZA 4EN6B 5BV6A 2V5YA 2CGPA 1RUG3 1ZZ7A 1RUJ3 3NKGA 4MFKA 4NGRA 5FWJA 2WR9A 3W21A 3MUZ1 1F4AA 3TOAA 5D8AB 4LBNA 3ZFEC 2ZX0A 4Q0VA 2YBPA 3IAQA 2C6GA 5FP4A 3BUCA 1W9FA 4YVWA 3RYOA 3B94A 3ZSKA 4JYWA 1RMU2 3URFA 1LGBA 2CTVA 5IVVA 5DAXA 2WZPP 1SQ4A 2R7HA 1R083 5FV3A 5A6QA 4XILA 5FOBB 1IY7A 4P4DA 3F8KA 1LOEA 2Y38A 2GNTA 4ARYA 4QPIC 5FYVA 5E88A 2PHDA 4IV1C 4HKLA 1LGNA 2Z3MA 3SNMA 1NCQC 2Q7SA 4CPBA 3M70A 2CWMA 4Y1XA 5EXOA 2OZUA 2P0WA 1QQP3 4KZTA 3R9FA 4LORA 4CP9B 4NXYA 1ND3A 4FOQA 2K5TA 5JLVA 2VOXA 3K75B 2QYVA 1A6CA 2WQ4A 2ZACA 1WCKA 5HBAA 2PIZA 5AG5A 4MCPA 2YY1A 2EIGA 2VZYA 3BIWE 1W2OA 1NA1C 1AR93 3U37A 4DJLA 3T2OA 3PUAA 2PXJA 3E5UA 5JOYA 1JBCA 2XOMA 1RUI1 2OQ7A 3ON7A 2EF6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2JDC A;  1B87 A;  2P6F A;  1VKC A;  3LAG A;  2IXJ A;  4PIZ A;  4IET A;  2VZZ A;  4KOT A;  3FX3 A;  3PNA A;  3D3S A;  4KVO E;  2XGX A;  4F7Z A;  4I01 A;  1ZRF A;  1YFX A;  1M4D A;  2XL7 A;  2MHF A;  2Z2S B;  1Z4E A;  5KHG A;  5J8F A;  1J59 A;  3FIX A;  3VHR A;  4MGY E;  1UPI A;  4Z82 A;  3OGJ A;  4WVZ A;  2ET7 A;  2GC3 A;  1RUO A;  2B58 A;  2J8M A;  2PTM A;  5LEK A;  1OMI A;  3MPB A;  1CAU A;  2V09 A;  3E0K A;  4ONU A;  2EVN A;  4FBF A;  1GQG A;  3RYR A;  3IWZ A;  3E6C C;  1V70 A;  4N9H A;  2A4N A;  3TTH A;  1S3Z A;  4U9Y A;  5F47 A;  4OLL A;  4JVA A;  4JTN A;  4XFC A;  1OZP A;  1VHS A;  2QVS B;  3ST7 A;  4RD7 A;  4FD5 A;  1LB2 A;  4LUA A;  4QVT A;  1IYL A;  3TE4 A;  1KUX A;  5JSP A;  2N7G A;  4XFH A;  1Y9K A;  4X6Q B;  3WW4 A;  2ATF A;  4NEX A;  2BNN A;  1OD5 A;  2C0Z A;  4JV4 A;  3ES4 A;  4L8A A;  2QCS B;  3D0J A;  3LD2 A;  3C26 A;  2PAM A;  4KWJ A;  3EXN A;  4K30 A;  4ZBG A;  1ON0 A;  2FL4 A;  4ZU5 A;  3BAL A;  3HIF A;  4I02 A;  4FD4 A;  3W6X A;  3H1M A;  4QGM A;  5F48 A;  1O4T A;  3H7J A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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