4ORFA

Camp-binding acyltransferase from mycobacterium smegmatis, mutant r95k
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
332
structure length
319
Chain Sequence
AELTEVRAADLAALEFFTGCRPSALEPLATQLRPLKAEPGQVLIRQGDPALTFMLIESGRVQVSHAVADGPPIVLDIEPGLIIGEIALLRDAPKTATVVAAEPVIGWVGDRDAFDTILHLPGMFDRLVRIARQRLAAFITPIPVQVRTGEWFYLRPVLPGDVERTSETLYRRFQSVRKPTRALLEYLFEVDYADHFVWVMTEGALGPVIADARFVREGHNATMAEVAFTVGDDYQGRGIGSFLMGALIVSANYVGVQRFNARVLTDNMAMRKIMDRLGAVWVVVMTEVDVPPVDTVPFEPELIDQIRDATRKVIRAVSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Allostery and Conformational Dynamics in cAMP-binding Acyltransferases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetyltransferase Pat
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium smegmatis
total genus 96
structure length 319
sequence length 332
ec nomenclature ec 2.3.1.-:
pdb deposition date 2014-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4orfA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4orfA02
1S60A 4HNYB 1SFNA 1YK3A 3W6SA 2PAMA 3WW2A 2Q30A 3QOPA 2ZCWA 2G0BA 4OAEA 5I0UA 1YLLA 1X7NA 2BGCA 4GS4A 3N7ZA 4MGKE 3IBMA 1XEBA 3PVBB 3RPQA 1QXRA 4IEUA 3NE7A 2OH1A 3I7DA 4NSQA 2P6EA 5JSPA 2VZZA 2VQYA 2ZW6A 2WFPA 4Q0VA 5KTAA 2GZWA 1CAWB 4XF1A 3NSTA 1YHFA 2RC4A 4META 1OFNA 3H7JA 2GIVA 2FSRA 3SCHA 3QACA 3LWCA 3QB8A 4NF1A 3S6GA 3HT1A 3SHRA 2XL7A 4MGIE 2BNOA 2P6GA 3EJKA 1I6XA 3M70A 3NKTA 4EWEA 2H6BA 4HSLA 1KUXA 4AVCA 3DKWA 3BJ7A 1Q43A 5CNPA 2IL4A 1ZZCA 1DGRA 5C88A 1UD1A 1YVKA 3E0KA 2MNGA 3RYPA 3OD0A 1M1DA 2UY9A 3F8KA 3F5BA 5C8WA 3DV8A 4RD7A 3TO9A 1VJ2A 1XE7A 1RXTA 1WK4A 2QIRA 1LRHA 4UA3A 4QB9A 2IC1A 2PTMA 2XHKA 5JSRA 4YYOA 5JQ4A 3CJXA 1IYKA 4AG9A 4Q0PA 1Q2YA 5IV0A 4IEQA 3R1KA 3LOIA 2B8MA 3VHRA 4HVRA 2KCWA 4RI1A 1K4JA 3NW4A 3I3GA 5C6CA 4MH0E 1CAVA 4N9HA 1LR5A 3I9SA 4HZFA 4PK3A 1P0HA 1RC6A 3GYDA 4AXOA 4KOUA 4K30A 2UYBA 4M85A 1OI6A 4F7ZA 5JAXA 3UKVA 4X6QB 1WLTA 4Q29A 4D7SA 4FD6A 2GU9A 5KHIA 2B3UA 2PR8A 2MPFA 2GC3A 5CU1A 3S6FA 2ET1A 2BNNA 3DDDA 3CXSA 4EV0A 4CYDA 1Q5OA 1O7FA 2D40A 2XGXA 3G7DA 5KHGA 4NVPA 2P17A 5CVRA 4B5PB 5F47A 3KSCA 1L0CA 4JTOA 4LUKA 4QGNA 2B4DB 4DNCA 1YVOA 5I0SA 3V8IA 2Z11A 4X6RB 1YR0A 4J1XA 3ES1A 3R6SA 1QXJA 2WPWA 4NXYA 1NZCA 5C82A 2HV2A 2BSWA 1X8MA 1CAXA 1GHEA 2BUEA 2CNTA 4OFGA 3BLNA 1YGHA 3USSA 2F5IA 2FCKA 4H6ZA 4JJXA 1ZVFA 3WR7A 3H50A 2B4BA 5K8SA 2C27A 4HNXB 1XE8A 1ZZ9A 3E6DA 1S7LA 4PIYA 2XKOA 3H1YA 5BXXA 2EVNA 1J1LA 3I54A 3B02A 1M44A 4E2AA 2JLMA 4XF3A 4YRHA 4F8AA 2Z69A 1KZFA 4N9IA 2OB0A 3FXTA 4HKFA 3WW3A 2BL1A 4LA2A 4XETA 1Y7RA 3KKWA 1FI2A 3FX3A 1I5ZA 2CV6A 3E97A 2GAUA 5DWNA 5EBVA 5HH1A 2PQQA 2HKXA 1X8EA 3S6HA 1EY2A 4EROA 4KWLA 2OPKA 1IPKA 5FCCA 4AB7A 5T3NA 2GANA 4BMHA 2ZW4A 4LUMA 4UXAA 4JV4A 3SHPA 2QJVA 4BH9A 2IXHA 3D82A 1L3JA 3PLQA 2OZ6A 2R8VA 3OCPA 4KUBA 5AVPA 1ZZ6A 2CY2A 2VZYA 2BYVE 3H9AA 4XFIA 4I02A 3EXNA 4BHPA 2QMLA 4PJYA 3ZJ0A 2BEOA 4U5YA 4QX5A 2IXIA 4R57A 2Y0MA 4H6UA 3I59A 3UKNA 1WGPA 2IXJA 4ORFA 5BV6A 4HBNA 1Z9UA 3FBUA 2B5GB 3R9EA 3BPZA 4QGMA 4HNWB 1V70A 3WW1A 2OZHA 3D2PA 5BY5A 4MV2A 4UBGA 4XF4A 1N71A 1YLEA 1QSMA 2G3AA 2Q4VA 5FDBA 2N7GA 2PSWA 2FT0A 2P6FA 2Z2SB 1Z4EA 4UBRA 2ATFA 4MI4A 1ZZ7A 3MGDA 4U9YA 2VBQA 1UPIA 5I0CA 1OMIA 1U6MA 3RZZA 4R87A 2D93A 4XFHA 3ZDSA 5LRSA 3EFAA 2H6CA 1VKCA 4QVTA 2GH2A 1PM7A 4O9GA 1O3SA 5I91A 4IEZA 3S7EA 5E96A 4ZU5A 4JD6A 2J8MA 4PIZA 4HVQA 2O1QA 3FFQA 2HQYA 3HQXA 1S7NA 1O3TA 1IIDA 3BALA 3LA2A 4FD4A 2E9QA 2O8QA 2PDOA 2Z0ZA 4EWDA 3MZHA 4KOWA 1M4IA 4RS2A 1IYLA 2EVXA 1Q2CA 3NL1A 1QSOA 1X82A 4I49A 4EWAA 1VR3A 3IWZA 4LUAA 3T9YA 3IGRA 1I12A 2VQAA 2PHLA 3TCVA 2UYAA 2WPXA 5KHJA 1GQGA 3S0MA 1CJWA 3E6BA 3JZVA 3H3UA 2ARHA 4D7TA 3DNSA 4PSXA 5JR7B 3FHIB 5JSOA 3SCFA 4CRYB 4KVME 2H5MA 1FXZA 4II9A 3IWGA 3H7YA 2DCTA 2KXLA 4IEPA 2XLAA 4FD7A 4Y49C 4JXQA 2QCSB 5J3UA 2EA7A 1NE4A 2OZJA 1NYWA 3DN7A 4OLLA 1B6BA 1Z4RA 2IXKA 4IEOA 1FT9A 1O3RA 4UBHA 2AE6A 4Y49B 3GBFA 2Q04A 4O9EA 1ZRDA 3FRMA 4L8AA 4JWPA 4XPKA 3TT2A 4CAWA 2P0WA 4TLFA 4KOTA 1CAUA 1ZRFA 1J4JA 1YUDA 5E16A 3ETQA 3S6KA 4AQ6A 1MJBA 2PAEA 3D8PA 5D1IA 1I21A 1WA4A 5I0RA 2FIWA 4XF9A 4QMAA 2B9UA 3H4QA 1O4TA 3H8UA 4JXRA 3DR8A 4E8OA 5HMNA 1XRUA 2BEIA 4B5PA 3TNPB 1RO5A 4E2QA 5FQ0A 2FE7A 2J8NA 2QNKA 1NE9A 2B4DA 3HT2A 1MJAA 2EAAA 3ES4A 2FIAA 4IUSA 3DSBA 3UY5A 1CX4A 3CO2A 2ET7A 1XIXA 2OZUA 5I8TA 2FS5A 2PR1A 2ZW5A 4IEVA 2K9ZA 2GC0A 5LRRA 4LTAA 3RNSA 1B87A 4XFFA 1FY7A 2JDDA 3JVNA 2UY8A 5F48A 3H1WA 2PFWA 1PU9A 1CM0A 2GC1A 2X7BA 2FL4A 3N4MA 2AJ6A 3R96A 4IEXA 4MBUA 3C3VA 1EPZA 2B5HA 4KUAA 5J8FA 3RYKA 1R57A 1UIJA 1UW8A 4FT8A 2Q1ZB 1MJ9A 4LA3A 2R1IA 1M4DA 4K8FA 2OYZA 4KWJA 4XFGA 2R98A 2FQPA 1VP6A 3IIAA 4XNHC 3RDIA 1PMIA 3P2FA 1ZRCA 1TIQA 1NSLA 1J58A 4B29A 1MK4A 4YFJA 2CAVA 1BOBA 4XNHB 3SXOA 2H0VA 3EHKA 4HMZA 4Z82A 2ETEA 4A2UA 3SXNA 4HN0A 3E6CC 4UWIA 4XPDB 4YGOA 4R3KA 4IEYA 4CS0B 3D2MA 3PZJA 3C26A 3FZ3A 2BNMA 2R7HA 5J48A 4MX3A 5E1RA 1CAXB 2FXFA 4QXKA 3VWDA 5I8YA 2QVSB 3MDPA 1HW5A 5EC4A 2GC2A 4MGYE 2JEVA 4XPLA 4R52A 1OD5A 4Z07A 5FVJA 4IERA 4ZU4A 5FLIA 1S7KA 2ZW7A 1EP0A 3CXQA 3CL1A 5DWMA 2PAKA 2ATRA 2Q4YA 3E5QA 2JDCA 2IXLA 3U11A 4KLWA 4FAHA 3H1MA 2HUZA 4MHDA 4E0AA 4Q0UA 1BO4A 1CAWA 4DINB 1S5KA 4R9MA 2Y0OA 3R9GA 4WVZA 3OTFA 2K0GA 3DR6A 2PC1A 4XF0A 2PRBA 4H89A 1M4GA 3R95A 1O5LA 4LLOA 2MHFA 4I3PA 1O3QA 1LKNA 1NXMA 2V09A 5LEKA 3NVCA 1IPJA 4IEWA 3LA7A 4ONUA 3WW4A 3ELNA 2OU2A 3FYNA 3MPBA 3ST7A 1TQ5A 3CXPA 4Q0QA 3LODA 1YFWA 1WWZA 4KZTA 4JTNA 3LA3A 1NE6A 3MYXA 3SCGA 5CADA 4MJ8A 5F1RA 1ZZ8A 4XFBA 3NJZA 4J3GA 3I59B 4CAVA 1LRZA 2EUIA 2PHDA 3E5XA 2C0ZA 4FD5A 3CF6E 3L2HA 3FNCA 4PSWA 3TE4A 2Q0AA 3M3IA 3FJSA 4KOXA 1U12A 3PP9A 1Q2DA 2Q0YA 1Y9WA 5EZWA 4QM9A 4BIFA 3G3SA 3P2HA 2XLFA 4E2GA 2VI7A 4AVBA 4AG7A 2CNSA 2REEA 1Y9QA 2FMYA 5I0TA 3R9FA 2VECA 2D5HA 4WZCA 1UIKA 4XEZA 4AQ2A 4I0AA 3DL3A 3D0JA 1UFHA 1RL3A 1PUAA 5HI0A 3LD2A 5J8CA 5IX3A 3EC4A 1G6NA 5FPXA 3GY9A 1EYBA 1YFUA 2QDRA 4H7LA 2NMTA 3ZZIA 3RYRA 4HLTA 2GE3A 3BB6A 2XL9A 4LEJA 4WBBA 2XKPA 2Z10A 2Q7BA 5FPZA 1ZX5A 1YREA 4MY0A 5JPHA 4QC6A 5FLJA 1SQ4A 2PA7A 4HSJA 4NCZA 1NMTA 2HJIA 2B58A 1RGSA 1DZTA 4QUSA 4KL1A 4ZBGA 3LAGA 4IESA 1OZPA 4QM8A 2D5FA 2G3TA 4LULA 2WC2A 4MZUA 4FAGA 2OZGA 3TOAA 4YRDA 4LX9A 1DZRA 1VHSA 3BU7A 4AVAA 4MY3A 1O5UA 2DXQA 3E5UA 3OF1A 2Q4SA 4HVOA 4IF5A 3TO6A 4L89A 3HIFA 2PQ8A 3FIXA 4QGLA 1KUVA 1Y9KA 4U9ZA 4F0YA 3FE5A 1RUNA 1Q3EA 5LEJA 3TTHA 3TO7A 4UWJA 5KTCA 4XFAA 3ROUA 2ZPAA 3EO6A 4KWKA 1SEFA 3B8GA 1YFXA 3GKRA 1ON0A 4KVOE 3W91A 2ZKLA 2PYTA 2VPVA 4E2SA 1ZZBA 1RUOA 3VWEA 3OGJA 5H86A 3LZZA 4F6AA 1CAUB 4KOSA 4MUVA 2K5TA 2CAUA 1CAVB 3ACLA 4JLYA 4IETA 2I45A 3U0ZA 1Y3TA 3CEWA 4MGZE 3UKTA 1LB2A 2IXCA 5KHKA 2Q44A 1YWKA 5GCNA 1I1DA 3EQEA 5FQ0B 1H1IA 2A4NA 3FB3A 4YNIA 1ZREA 2B3VA 5KHHA 4KLVA 2CNMA 4XPDC 1J3RA 1CGPA 5H84A 4EVYA 4KU8A 4R8HA 5JCTA 1J3PA 4M3SA 1UCXA 3KGLA 4GULA 4I09A 3H3ZA 3JUWA 4QBJA 1QSTA 4B5OA 3GYAA 3F0AA 3D0SA 4P9GA 3BJ8A 4OADA 1V0CA 2B5GA 2D4OA 3D3SA 3W6XA 1KUYA 2XLGA 4PK2A 3KMHA 1YX0A 3K9UA 2OA2A 1YFYA 5BPXA 2QECA 4HN1A 4Q0SA 2O28A 3SXWA 4XFCA 5KBFA 4I2OA 1QSRA 3TNQA 2VXKA 1P4NA 5I93A 5J7MA 3IDBB 4KOYA 3KCCA 3FWEA 3T90A 4I01A 1ZNPA 2F4PA 4YARA 4CAXA 4KORA 4L2NA 3EY5A 3EBRA 2REFA 4J1WA 3U10A 3PGPA 5IB0A 1QWRA 5EFUA 4YSFA 1XF8A 4CRZB 1XMTA 4KOVA 3PNAA 1QY4A 1IB1E 1QSNA 5F49A 4FBFA 5I8SA 4KU7A 2CGPA 1J59A 3TOBA 1GQHA 2J8RA 3CLPA 3KGZA 1XE4A 2VEZA 4JVAA 1H1MA 3OWCA 3RYOA 5F46A 3TFYA 1RTVA 1ZRRA 3BCWA 1S7FA 5FLHA 2I79A 4X5KA 3O14A 3QAHA 4L11A 1S3ZA 4KVXA 1J3QA 1SQHA 4ZU7A 5KTDA 4BYYA 3SMHA 1JUHA 4PV6A 4I0BA 3G8WA 4PIXA 1IICA 5BUVA 3EO4A 5ISVA 2ZXVA 4NEXA 3IDCB 1DGWA 4R3LA 2D4PA 2I00A 3S7IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RUC2 1XU1A 5I0UA 4HFSA 3SI1A 3RAMA 4ZXKA 2D6MA 3IBMA 3PVBB 4N90A 1QOSA 1S0GA 3AMNA 4IV3B 4CEYA 4FPEA 5DAPA 5CNPA 1C8M3 1OH4A 3B3QE 3CBNA 2YZ4A 5AFEA 4XUTA 3P6BA 5FBJA 4Y1VA 4OHVA 2B8MA 3I3GA 5A33B 1RC6A 4QHOA 5JAXA 5T5PA 5K0UB 5FP4A 5KHIA 1W6MA 4BBHA 3ZYIB 3CXSA 4CYDA 4C7IA 3AP6A 3R6SA 5C82A 2HV2A 4CYPA 1X8MA 1YI7A 4CUGA 3BLNA 3USSA 3WR7A 5IK5A 1C1LA 3H5ZA 2C27A 1ND3B 4H14A 4KSFA 3I54A 3U14A 4HKFA 3KKWA 2IVIB 3E97A 2C24A 1CZSA 2R7EB 3WXPA 5C5TA 2ZGRA 2RDRA 3SH3A 4A32A 1XBUA 2Q51A 3VHOA 2FHRA 2QMLA 4IE4A 3OUJA 2B5GB 3B93A 3WEZA 5FPUA 1ENRA 4CDUC 4EE2A 4UT5A 3FN9A 1JUIA 4S2FA 5I91A 4UW6A 4P10A 4GWMA 1NUKA 1W6OB 2AFZA 5A1AA 2NYQA 4TWTA 3ORJA 1Z8XA 3DYPA 4YVWA 4PSXA 4GB32 5LYDA 1DQ0A 2DCTA 2QCSB 4CAWA 1K5MC 4BQ3A 4XIKA 2IQ6A 1LOFA 2XJPA 3RMYA 5HXDA 3O7OA 2F8HA 3J4UH 4GXLA 2BP6A 3FFZA 3J7NA 4HXCA 4GM5A 4BQ1A 3THPA 3PUIA 5FYZA 1GOFA 1D2SA 1PO22 5DG2A 1SZBA 2GC1A 4M3CB 2IMOA 5C7GA 5EP9A 4PDWC 4H2AA 2RS53 4KWJA 3FJUA 2IFWA 1NCQC 1RYYA 4MG2A 2ORZA 4OYUA 3ZXAC 3GCWA 1SCSA 1PIV1 4F83A 5EYXA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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4EN7B
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1S60 A;  4HNY B;  1SFN A;  1YK3 A;  3W6S A;  2PAM A;  3WW2 A;  2Q30 A;  3QOP A;  2ZCW A;  2G0B A;  4OAE A;  5I0U A;  1YLL A;  1X7N A;  2BGC A;  4GS4 A;  3N7Z A;  4MGK E;  3IBM A;  1XEB A;  3PVB B;  3RPQ A;  1QXR A;  4IEU A;  3NE7 A;  2OH1 A;  3I7D A;  4NSQ A;  2P6E A;  5JSP A;  2VZZ A;  2VQY A;  2ZW6 A;  2WFP A;  4Q0V A;  5KTA A;  2GZW A;  1CAW B;  4XF1 A;  3NST A;  1YHF A;  2RC4 A;  4MET A;  1OFN A;  3H7J A;  2GIV A;  2FSR A;  3SCH A;  3QAC A;  3LWC A;  3QB8 A;  4NF1 A;  3S6G A;  3HT1 A;  3SHR A;  2XL7 A;  4MGI E;  2BNO A;  2P6G A;  3EJK A;  1I6X A;  3M70 A;  3NKT A;  4EWE A;  2H6B A;  4HSL A;  1KUX A;  4AVC A;  3DKW A;  3BJ7 A;  1Q43 A;  5CNP A;  2IL4 A;  1ZZC A;  1DGR A;  5C88 A;  1UD1 A;  1YVK A;  3E0K A;  2MNG A;  3RYP A;  3OD0 A;  1M1D A;  2UY9 A;  3F8K A;  3F5B A;  5C8W A;  3DV8 A;  4RD7 A;  3TO9 A;  1VJ2 A;  1XE7 A;  1RXT A;  1WK4 A;  2QIR A;  1LRH A;  4UA3 A;  4QB9 A;  2IC1 A;  2PTM A;  2XHK A;  5JSR A;  4YYO A;  5JQ4 A;  3CJX A;  1IYK A;  4AG9 A;  4Q0P A;  1Q2Y A;  5IV0 A;  4IEQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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