4AVBA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 in complex with acetyl coa and camp
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
GARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSARVPSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 90
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avbA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avbA02
4MZUA 4XFHA 5EFUA 5I0CA 4GS4A 5DWNA 3EBRA 1QSMA 2P6GA 3IGRA 1Y7RA 4LUMA 4YRHA 4JWPA 1RGSA 4U9YA 4IEWA 2Z69A 2OZJA 1Z4EA 1UFHA 2VZZA 3H7JA 4HNWB 3S6FA 4O9GA 2R1IA 1WLTA 1RXTA 3RPQA 3SHRA 3RDIA 3E97A 2HUZA 1WWZA 1WA4A 3L2HA 1NMTA 1XEBA 3H1MA 1P0HA 4IEOA 4Q0SA 4R52A 3UKTA 5LEKA 1QSNA 2QNKA 2Q0YA 2K9ZA 2PHDA 3BPZA 4IEYA 2JEVA 2G3AA 5I8YA 3LD2A 4QGMA 1GQGA 1MJBA 4E2SA 3ZJ0A 3HQXA 4LLOA 3G8WA 2OPKA 1Y9QA 4XNHB 4QM9A 4A2UA 2IL4A 4ORFA 4KOWA 2CY2A 4PIXA 4ZU4A 4PK3A 1CJWA 1NE6A 3H3UA 1TQ5A 4YSFA 4HZFA 2EAAA 2P6FA 4IF5A 4PSXA 4IEUA 5I93A 4JXRA 4QVTA 1SQ4A 2FQPA 3JVNA 1S7KA 4XPDC 4Y49B 3RYKA 1YHFA 4JXQA 5BXXA 3TNPB 2ATRA 2G3TA 3ETQA 4IEVA 5FPXA 1M1DA 1Z9UA 3HIFA 3UY5A 4I09A 1X7NA 4IETA 4KUBA 3ES1A 1ZX5A 4PIYA 4H6ZA 4XFAA 1YWKA 1VP6A 2XGXA 3R95A 2CGPA 4KORA 2BNMA 3I54A 4KZTA 3H1WA 2BNOA 2Z2SB 1NE4A 3H7YA 1FI2A 2BUEA 2B5HA 2ZW7A 3E0KA 3F0AA 4JVAA 2C27A 4AB7A 3UKVA 3BB6A 2B9UA 3DDDA 3ZDSA 3T9YA 2J8MA 2D5HA 1O3QA 4XPDB 2BGCA 4BMHA 1ZRRA 3GY9A 2OH1A 4EVYA 3BJ7A 1X82A 2FXFA 3S6GA 1ZRDA 2CNTA 2EA7A 3FXTA 5LEJA 3MPBA 2XL9A 4J1XA 1MJAA 3DR8A 3I7DA 4BIFA 4UWIA 4UA3A 3S6HA 2HJIA 3H4QA 3B02A 1ZVFA 3OWCA 3TE4A 3IWZA 1S5KA 3LWCA 1Y9KA 3MDPA 1EPZA 4F8AA 1RTVA 3BCWA 2DXQA 4PK2A 4MY3A 4DNCA 3KGZA 5JCTA 4FD5A 4FD7A 1L3JA 4E2GA 5GCNA 4Q0QA 4XF0A 1WK4A 3PZJA 1GQHA 2Q44A 5FCCA 5KHJA 4YNIA 4HSLA 3RYPA 3O14A 1J3PA 1LR5A 3CLPA 5FVJA 3VWDA 5KHKA 1IPKA 2B4BA 2GH2A 1RC6A 1CAVB 2ZW6A 4JTOA 3GBFA 4FD4A 2OA2A 4R3KA 4R87A 4MGKE 3D0JA 5CADA 2FT0A 4K8FA 1O5LA 4HKFA 4OLLA 3S6KA 3NJZA 3F8KA 3R6SA 5I8TA 4AXOA 5D1IA 1V70A 3FHIB 1CGPA 2F4PA 4HVRA 4L89A 1Q5OA 4LA2A 4II9A 3GYAA 5JSRA 2FIAA 3KGLA 1DZRA 1ZZ7A 3WW3A 1NE9A 5I0SA 1BO4A 2OU2A 2GZWA 4IERA 2I00A 3P2HA 1XE8A 4XFIA 1YK3A 2WPWA 3H1YA 3KKWA 4MY0A 5FDBA 4UXAA 3FIXA 5J7MA 1XMTA 2CV6A 3SHPA 1S7FA 4B5OA 4P9GA 5KBFA 3SXNA 2VEZA 1O3RA 5J48A 4UBRA 1S7LA 2FE7A 4LULA 4EWDA 3FRMA 4KOYA 2B58A 5KTCA 4PSWA 3G7DA 2PHLA 1M4DA 1O3TA 2WPXA 4M85A 4XF9A 1YVOA 3LZZA 2QMLA 2CAVA 1VHSA 2PAMA 3QB8A 3DN7A 4NVPA 5I0RA 2XKPA 3FYNA 2K0GA 3UKNA 4IEQA 2BYVE 4QB9A 1UPIA 3IWGA 2XLGA 3ELNA 2D5FA 3LA2A 2XHKA 1IICA 4WVZA 4F6AA 1ZRCA 4L2NA 4XETA 5IV0A 2UY8A 2CAUA 2FSRA 2PFWA 4AVAA 3IDBB 2R98A 1QSTA 3RNSA 3TCVA 2FL4A 4XF4A 4UWJA 2J8NA 3DR6A 2QJVA 3W91A 4QM8A 5C6CA 2EVXA 2MNGA 3HT1A 2BL1A 3EO4A 1PUAA 1YFXA 3OCPA 1CAWB 3SMHA 2OB0A 2N7GA 2B5GA 2P6EA 3LODA 1J3QA 1ZZ6A 4XFBA 4Q0UA 3H3ZA 4J1WA 5HH1A 3W6XA 4PJYA 3MZHA 4CRZB 3FE5A 3W6SA 3S7EA 1YLLA 3NSTA 1CM0A 3JZVA 4KVME 2FS5A 2UYBA 2Z10A 4KOTA 1I1DA 2HV2A 1DGRA 3TO6A 5KTDA 4FAGA 1O4TA 1R57A 2JDDA 5F1RA 2Z11A 3R9GA 5H86A 2RC4A 1WGPA 3H50A 2G0BA 4EWEA 2P17A 2XLAA 4FAHA 3SCHA 4Z07A 3U10A 4F7ZA 1O5UA 3BU7A 3CXPA 4M3SA 3R9FA 2IXHA 3OD0A 1YFYA 5BV6A 2HQYA 3TO9A 1LB2A 4R9MA 1YUDA 2IXIA 1QXRA 4KVXA 1ZZCA 4KVOE 3GYDA 4IUSA 3ACLA 5C8WA 4L11A 3GKRA 3NE7A 4QBJA 2P0WA 1CAWA 2O28A 4QUSA 4QGLA 2Q1ZB 1SQHA 1JUHA 2O8QA 2QVSB 3CJXA 4EWAA 5I0UA 2Q4VA 3E5XA 1MK4A 1FXZA 3T90A 3DL3A 2PQQA 2REEA 2MPFA 4MGIE 4KU7A 2QECA 2V09A 2PQ8A 1Q2DA 2ZXVA 4I0AA 3QACA 5JAXA 3VWEA 4OADA 1B87A 4ZU7A 1YR0A 1I5ZA 1UIJA 1P4NA 4AG9A 3EO6A 5BPXA 2ATFA 2PYTA 1G6NA 4XFGA 4PV6A 4HMZA 2Q7BA 3DKWA 2B4DB 1J58A 1S60A 2GC2A 4LUKA 1IPJA 2Q4YA 2WFPA 1QWRA 4AQ2A 1IIDA 3C26A 1Q2CA 4LTAA 2IXLA 1YX0A 5EZWA 3TNQA 2OZHA 1XE4A 4I01A 5F49A 1YREA 5J3UA 3RYRA 3EC4A 2H6CA 2BEOA 4MGYE 2AJ6A 2JLMA 2Q0AA 4B29A 5JPHA 4KOVA 1IYKA 3IDCB 1OMIA 2VQAA 3TTHA 3PVBB 2EUIA 2Q30A 4IEXA 4XPLA 4D7TA 1GHEA 1S3ZA 2H5MA 1J4JA 1EY2A 1RUOA 4J3GA 1MJ9A 4HNXB 2QIRA 2OYZA 3CF6E 4H7LA 3DNSA 1ON0A 2GE3A 4KWKA 4PIZA 4LX9A 3OF1A 1U6MA 3NVCA 2D93A 4HN0A 2ZW5A 3FWEA 1SEFA 4YRDA 1M4IA 2B4DA 2A4NA 4YYOA 5FQ0B 4U5YA 4X6RB 1RUNA 1CAUB 4IESA 3R96A 3ROUA 4QX5A 2ETEA 4UBHA 3SXWA 1CAXB 3FNCA 4QXKA 4XF3A 3N4MA 5CU1A 1Z4RA 2GC0A 2ZPAA 3LA3A 4RI1A 2OZUA 4NXYA 4CAWA 4AG7A 1DGWA 2DCTA 3MYXA 2FIWA 4E2QA 5E96A 2WC2A 5KHHA 2H0VA 4KWJA 2VBQA 1CAVA 1EP0A 4GULA 4N9IA 1QY4A 3M3IA 2D4OA 3NL1A 4LA3A 4L8AA 1ZZ9A 1NSLA 4FBFA 3USSA 4NSQA 2PA7A 3FB3A 1YFWA 5EC4A 5LRRA 3PLQA 1ZRFA 2Z0ZA 4KOXA 5J8CA 3D82A 4NEXA 1O3SA 5IX3A 3HT2A 2UY9A 4BHPA 1YGHA 2PTMA 4KU8A 1NXMA 5F47A 4KOUA 5FQ0A 4JLYA 4KLWA 4CAXA 5FLHA 3TO7A 1H1MA 2D40A 1CAUA 3SXOA 4D7SA 1ZNPA 1EYBA 4AQ6A 2O1QA 2KCWA 2VPVA 5HMNA 4U9ZA 5KHIA 2ZW4A 1QSRA 1CAXA 2GANA 1IB1E 4HLTA 4QMAA 4Z82A 5JR7B 1KUXA 1XF8A 4XNHC 4HBNA 4XFFA 4X5KA 3FZ3A 3U11A 5CVRA 2R8VA 5J8FA 3FBUA 1I6XA 3CEWA 4O9EA 2JDCA 2C0ZA 1K4JA 5I8SA 5HI0A 2UYAA 4B5PA 3C3VA 1PU9A 2Y0MA 3D2PA 3E6BA 1ZREA 4Y49C 1OI6A 5FLIA 1V0CA 2IC1A 5FPZA 4YGOA 3TOBA 4EROA 4QC6A 2I45A 1I21A 4XEZA 4FT8A 4MV2A 2PAEA 2AE6A 4ZU5A 1VJ2A 3CL1A 3FX3A 2ET7A 3LA7A 3SCGA 5JSOA 3H8UA 1CX4A 2F5IA 4FD6A 1PMIA 4H6UA 5CNPA 3WR7A 1U12A 3RYOA 2IXKA 4I2OA 4MHDA 4OFGA 1OFNA 3M70A 5F48A 1OZPA 3K9UA 1BOBA 2ET1A 4E0AA 3BJ8A 1NYWA 5JSPA 4HN1A 1J3RA 1OD5A 2XLFA 4NF1A 3PNAA 4YFJA 3EHKA 4N9HA 1PM7A 2PSWA 3ZZIA 5IB0A 2OZ6A 1S7NA 4KLVA 2VQYA 1HW5A 2BNNA 2GC3A 3DV8A 1I12A 5T3NA 4META 3I9SA 4ZBGA 3OTFA 2GU9A 2K5TA 1TIQA 4MJ8A 4I02A 2ARHA 1UW8A 1UIKA 4EV0A 2VXKA 3JUWA 3S0MA 4HVOA 4KWLA 4KL1A 1VR3A 3EY5A 3EFAA 2NMTA 4YARA 3SCFA 1M44A 3OGJA 2QDRA 3S7IA 4F0YA 4Q0PA 5I91A 3LAGA 4AVBA 2GAUA 2BSWA 4QGNA 3FJSA 4Q0VA 3MGDA 4BH9A 4HVQA 4I0BA 5KHGA 3D8PA 4NCZA 4LEJA 3BLNA 2ZKLA 3LOIA 3R9EA 2QCSB 2VECA 3F5BA 3VHRA 1B6BA 4I49A 1L0CA 3DSBA 1YLEA 3P2FA 2HKXA 2CNMA 4K30A 2E9QA 2Q4SA 2ZCWA 4JJXA 2B3UA 4MH0E 3IBMA 5E16A 3WW1A 2EVNA 4WZCA 2J8RA 3E5UA 5K8SA 1DZTA 4XF1A 3N7ZA 1XE7A 4X6QB 1KUVA 4H89A 1QSOA 5C88A 5JQ4A 5I0TA 5BUVA 3ST7A 3ES4A 3PP9A 1X8MA 2BEIA 3H9AA 1LKNA 4R3LA 1X8EA 1J59A 1YFUA 1NZCA 2IXCA 3WW4A 5FLJA 4JTNA 3G3SA 4E2AA 2CNSA 2I79A 1UCXA 4MX3A 2PDOA 3I59B 3TT2A 4E8OA 1XRUA 4OAEA 2PR1A 3E6CC 1O7FA 4CAVA 1M4GA 1ZZ8A 1YVKA 1VKCA 4XFCA 1N71A 4WBBA 3V8IA 4CRYB 4MGZE 1Y3TA 3PGPA 2H6BA 3EJKA 1LRZA 3BALA 4CYDA 3D0SA 3I3GA 2IXJA 4R57A 3KSCA 2VZYA 4R8HA 4TLFA 3RZZA 3QAHA 4HNYB 5EBVA 3TOAA 4B5PB 5DWMA 2OZGA 2PR8A 5F46A 2B8MA 4KOSA 5LRSA 1Q3EA 2XKOA 4BYYA 2D4PA 2PRBA 4AVCA 1Y9WA 4IEZA 4DINB 1FY7A 3D2MA 1KZFA 5H84A 1RL3A 4CS0B 4MUVA 1XIXA 1ZZBA 3CXSA 3WW2A 1IYLA 3KCCA 2PC1A 1FT9A 3B8GA 2GIVA 4UBGA 5AVPA 1Q43A 3QOPA 1KUYA 3E5QA 3KMHA 2R7HA 2REFA 3EQEA 5KTAA 3IIAA 4JV4A 2VI7A 5ISVA 1LRHA 1UD1A 3E6DA 3I59A 3U0ZA 3CXQA 1QXJA 2PAKA 4I3PA 2B3VA 3CO2A 2FMYA 1RO5A 2FCKA 3R1KA 4KUAA 4MI4A 1Q2YA 5BY5A 2Y0OA 3NW4A 2GC1A 2Q04A 4HSJA 4RS2A 2B5GB 4XPKA 1SFNA 2X7BA 2MHFA 2XL7A 5E1RA 3FFQA 4JD6A 1J1LA 3D3SA 4LUAA 5C82A 4ONUA 4IEPA 4Q29A 3TFYA 3NKTA 4RD7A 1H1IA 3EXNA 2KXLA 4MBUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TLGA 3KQRA 3B69A 2UWAA 4LUMA 5IK8A 3GXUA 2VZZA 4FPGA 1JTZX 4O9GA 1LNSA 2HUZA 1VBD3 4YVSB 1J83A 1SBDA 1RMU2 4UFMA 2RB7A 4LLOA 3VBOC 1HB2A 3OBZA 1W3XA 4A2UA 5FTTC 5FYMA 1W39A 3I3MA 2DV9A 1NG0A 4A32A 4NRQA 1IU8A 3M7AA 2HEYF 3LEGA 2G3TA 2X8KA 4CUCA 2JG8C 1K5MC 3K48A 4K3NA 5F7UA 4S2FA 2FDIA 2BNMA 3T1MA 3ZN5A 4TYSA 2BUEA 3E0KA 1CN1A 3PTRB 1UYZA 5A32A 4LIVA 4AI1A 2G9ZA 4J1XA 2BCOA 3MV01 1JYTA 3IWZA 1S5KA 2ABZA 2QZ2A 1EV11 2HWB1 1ND3B 5C33A 1SLTA 1E5RA 1ZA4A 5JLVA 4YM3A 4K1YA 5JMCA 4MGKE 1UY0A 2Z42A 5F5AA 3I49A 1POQA 4AXOA 1AYN1 4L89A 5JSRA 2RFHA 1IS6A 2Y38A 4CE8A 1QMUA 1ZO0A 2BERA 4Y33A 4P9GA 4ZX8A 3ZSLA 3O0XA 3K46A 1W04A 4M0NA 1UQXA 5FZ3A 1JU3A 1A8DA 1RUI1 2FSRA 2R073 4RQPB 2FDFA 2Z3KA 1ND2C 4QQHA 2YFUA 4MHPA 1R1A1 2N7GA 3C7OA 1W9YA 2R062 3VBSA 4NN0A 2ARBA 2PVVA 5FKCA 1I1DA 1CQ9A 3B3TA 3VL8A 2EIDA 3NNJA 4LLFA 1D0HA 2QZ3A 1TMF3 4EWEA 5C9AC 2Q7SA 1EAH2 4K20A 1LB2A 4R9MA 4M6GA 1ZZCA 1Q56A 2O28A 2P34A 3OPTA 2ZHKA 2GREA 5FZBA 4ZY0A 3T0DA 1UZZA 1C5IA 4WM8B 1VBE1 4LTAA 2IFWA 1QH7A 4FP2A 4W8JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4MZU A;  4XFH A;  5EFU A;  5I0C A;  4GS4 A;  5DWN A;  3EBR A;  1QSM A;  2P6G A;  3IGR A;  1Y7R A;  4LUM A;  4YRH A;  4JWP A;  1RGS A;  4U9Y A;  4IEW A;  2Z69 A;  2OZJ A;  1Z4E A;  1UFH A;  2VZZ A;  3H7J A;  4HNW B;  3S6F A;  4O9G A;  2R1I A;  1WLT A;  1RXT A;  3RPQ A;  3SHR A;  3RDI A;  3E97 A;  2HUZ A;  1WWZ A;  1WA4 A;  3L2H A;  1NMT A;  1XEB A;  3H1M A;  1P0H A;  4IEO A;  4Q0S A;  4R52 A;  3UKT A;  5LEK A;  1QSN A;  2QNK A;  2Q0Y A;  2K9Z A;  2PHD A;  3BPZ A;  4IEY A;  2JEV A;  2G3A A;  5I8Y A;  3LD2 A;  4QGM A;  1GQG A;  1MJB A;  4E2S A;  3ZJ0 A;  3HQX A;  4LLO A;  3G8W A;  2OPK A;  1Y9Q A;  4XNH B;  4QM9 A;  4A2U A;  2IL4 A;  4ORF A;  4KOW A;  2CY2 A;  4PIX A;  4ZU4 A;  4PK3 A;  1CJW A;  1NE6 A;  3H3U A;  1TQ5 A;  4YSF A;  4HZF A;  2EAA A;  2P6F A;  4IF5 A;  4PSX A;  4IEU A;  5I93 A;  4JXR A;  4QVT A;  1SQ4 A;  2FQP A;  3JVN A;  1S7K A;  4XPD C;  4Y49 B;  3RYK A;  1YHF A;  4JXQ A;  5BXX A;  3TNP B;  2ATR A;  2G3T A;  3ETQ A;  4IEV A;  5FPX A;  1M1D A;  1Z9U A;  3HIF A;  3UY5 A;  4I09 A; 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 3DV8 A;  1I12 A;  5T3N A;  4MET A;  3I9S A;  4ZBG A;  3OTF A;  2GU9 A;  2K5T A;  1TIQ A;  4MJ8 A;  4I02 A;  2ARH A;  1UW8 A;  1UIK A;  4EV0 A;  2VXK A;  3JUW A;  3S0M A;  4HVO A;  4KWL A;  4KL1 A;  1VR3 A;  3EY5 A;  3EFA A;  2NMT A;  4YAR A;  3SCF A;  1M44 A;  3OGJ A;  2QDR A;  3S7I A;  4F0Y A;  4Q0P A;  5I91 A;  3LAG A;  4AVB A;  2GAU A;  2BSW A;  4QGN A;  3FJS A;  4Q0V A;  3MGD A;  4BH9 A;  4HVQ A;  4I0B A;  5KHG A;  3D8P A;  4NCZ A;  4LEJ A;  3BLN A;  2ZKL A;  3LOI A;  3R9E A;  2QCS B;  2VEC A;  3F5B A;  3VHR A;  1B6B A;  4I49 A;  1L0C A;  3DSB A;  1YLE A;  3P2F A;  2HKX A;  2CNM A;  4K30 A;  2E9Q A;  2Q4S A;  2ZCW A;  4JJX A;  2B3U A;  4MH0 E;  3IBM A;  5E16 A;  3WW1 A;  2EVN A;  4WZC A;  2J8R A;  3E5U A;  5K8S A;  1DZT A;  4XF1 A;  3N7Z A;  1XE7 A;  4X6Q B;  1KUV A;  4H89 A;  1QSO A;  5C88 A;  5JQ4 A;  5I0T A;  5BUV A;  3ST7 A;  3ES4 A;  3PP9 A;  1X8M A;  2BEI A;  3H9A A;  1LKN A;  4R3L A;  1X8E A;  1J59 A;  1YFU A;  1NZC A;  2IXC A;  3WW4 A;  5FLJ A;  4JTN A;  3G3S A;  4E2A A;  2CNS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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