3ABOA

Crystal structure of ethanolamine ammonia-lyase from escherichia coli complexed with cn-cbl and ethanolamine
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
453
structure length
453
Chain Sequence
MKLKTTLFGNVYQFKDVKEVLAKANELRSGDVLAGVAAASSQERVAAKQVLSEMTVADIRNNPVIAYEDDCVTRLIQDDVNETAYNQIKNWSISELREYVLSDETSVDDIAFTRKGLTSEVVAAVAKICSNADLIYGAKKMPVIKKANTTIGIPGTFSARLQPNDTRDDVQSIAAQIYEGLSFGVGDAVIGVNPVTDDVENLSRVLDTIYGVIDKFNIPTQGCVLAHVTTQIEAIRRGAPGGLIFQSICGSEKGLKEFGVELAMLDEARAVGAEFNRIAGENCLYFETGQGSALSAGANFGADQVTMEARNYGLARHYDPFIVNTVVGFIGPEYLYNDRQIIRAGLEDHFMGKLSGISMGCDCCYTNHADADQNLNENLMILLATAGCNYIMGMPLGDDIMLNYQTTAFHDTATVRQLLNLRPSPEFERWLESMGIMANGRLTKRAGDPSLFF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structures of ethanolamine ammonia-lyase complexed with coenzyme B12 analogs and substrates.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
total genus 191
structure length 453
sequence length 453
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.3.1.7: Ethanolamine ammonia-lyase.
pdb deposition date 2009-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06751 EutB Ethanolamine ammonia lyase large subunit (EutB)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.220.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Annexin V; domain 1 lyase 3aboA02
2.30.170.30 Mainly Beta Roll Ribosomal Protein L24e; Chain: T; ethanolamine ammonia-lyase heavy chain domain like 3aboA01
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3aboA03
1ZALA 2VXNA 3TAKA 1F6KA 4UUIA 1DORA 1AW1A 3PUDA 1SW0A 3MBDA 3R5EA 4O12A 1DV7A 7TIMA 4WX2A 3G8RA 1ME8A 2WSRA 1Q3NA 4Y96A 5LGXA 4YCPA 3L21A 3TCEA 1WBJA 3B4UA 3STCA 2PE4A 3T78A 3ABQA 4PH6A 5E93A 2EF9A 2R91A 2QCNA 5CZJA 3W2JA 2B7OA 4Z0SA 3PG9A 2OX1A 3GLCA 3THAA 3W1MA 3A21A 1G4TA 1QOQA 2WSQA 4ADUA 5F1VA 4HT3A 1PCWA 1TPDA 4GRSA 1JRCA 5F2IA 3EWBX 1TMHA 1BWLA 2BX7A 3I6RA 3G0UA 3PF3A 3W1XA 4LS1A 1SR9A 1SSDA 1FX6A 4FEZA 3RLVA 2A2IA 3KX6A 4EIVA 2OT1A 1TB3A 4GJ1A 5HR6A 1OX4A 3W7RA 4FX7A 2PC4A 4RZ6A 4RCXA 1JVNA 4UFLA 3DENA 4NNAA 3INPA 3TE9A 2ZZ6A 2B7NA 1LRTA 4O14A 1FY6A 1JCLA 5CPLA 2ZCGA 3DKJA 1UASA 4XUGA 1IIGA 2JKPA 3FLUA 4BR1A 4HHPA 5AHMA 3EWUA 5D33A 3S5ZA 1XBYA 3NL2A 4GUJA 1THFD 1P0KA 4DF0A 4PEKA 4O15A 1ICSA 3GDMA 3DAQA 5G5IA 5F4SA 4P2VA 3GYEA 3L66A 3NPUA 4OWGA 3NYZA 4FIQA 5D09A 1L9WA 3MP4A 3G1YA 5AYZA 3HG2A 5KSWA 4RZ4A 5KZEA 3G1SA 5FF0A 4WY0B 4AHOA 5I3IA 4LY8A 1SZFA 3IV3A 1H61A 2C1HA 3KRUA 5D2TA 3H54A 2ZA3A 3N34A 3TXZA 4LT9A 4BFAA 2B7QA 2R94A 5D37A 3HJZA 5G1YA 1YTDA 3G8EA 4TU1A 4ZMGA 2QJGA 2YZRA 3OEXA 4IUOA 4GUHA 3G22A 1J5TA 5SWUA 3LRKA 1K03A 1H51A 2C13A 4JTGA 4MYAA 2TRSA 3HF3A 1OFAA 3QPZA 4AVFA 3TUUA 2WV8A 3W7HA 3MW7A 2PRLA 3QSRA 5K2ZA 1LDCA 4AWUA 1XUUA 8TIMA 1J4EA 3QM3A 3LRMA 4UTWC 4MKNA 1TPC1 1LM1A 3EX6A 4O10A 5LNRA 3B03A 5HUPA 4CCEA 4JYEA 1Z42A 2RHGA 1TPWA 1WXJA 3L65A 2JKAA 1KFKA 1DHPA 3OVPA 3DFTA 1LBFA 4AB4A 1XKYA 4O1AA 4HIBA 4L4LA 5CZTA 5DLCA 1CX9A 4U28A 3LHVA 3EX4A 3SGZA 4N2YA 4IXXA 2Y89A 3LCGA 3OIXA 3QPYA 3DU0A 4FHAA 5J5RA 3NQVA 1P1XA 1FCBA 2QF7A 3BVJA 1W3IA 1KM2A 4M6QA 1VCGA 3JRKA 4UTKA 3UWUA 1EIXA 3G1AA 3W76A 2RH9A 1JRBA 2VFDA 4O1DA 3QC3A 3CWNA 2ISSA 4XKYA 2ZRUA 4YL2A 1JUBA 5AC6A 2QCGA 5EMUA 4NU7A 1EWDA 1LRQA 3S1XA 2GPTA 1OK6A 2FPYA 2HMCA 3TJLA 3TNOA 2CZEA 4L4MA 2P1FA 2VEPA 5D2WA 3BPWA 1H7XA 4JYDA 4IMGA 3MYPA 2OMAA 5BW6A 1ZFJA 3GVGA 4M6PA 3GZ3A 2DZUA 3F4WA 1VYPX 1DKWA 4OHQA 4UIOA 3PG8A 4O4VA 3G1HA 2E5BA 4HN4A 1R2RA 3WJYA 2DZPA 1KFLA 1LORA 4DF1A 2AAMA 2V2CA 2WO5A 1OJXA 1VYSX 2YYTA 3IRDA 4ADTA 4R34A 2B7PA 4CCDA 2ZZ7A 3QQ1A 6ALDA 1KM6A 3FS2A 3DHDA 3Q2DA 4PCFA 3V1PA 1W5OA 5E0KA 3UZ5A 4AF0A 4WY0F 1KBJA 3M0ZA 4N9DA 3S5OA 1QCWA 3EXRA 5DN1A 1VLWA 3TR2A 1H62A 1VPXA 3CB8A 2A7RA 4O4WA 3QQ0A 2WNNA 1EP3A 3FYPA 1AL8A 3G1FA 4UTJA 3C8FA 3R89A 3W1LA 1OHLA 3HPZA 1YYAA 2CWNA 3PB2A 3KVKA 3IIOA 2X1UA 1AG1O 4RLIA 4JTUA 3GDRA 3GNNA 3GDTA 1LOSA 3L0KA 1FWTA 1BWKA 4MIMA 4IGHA 2V9DA 1QFEA 2FJKA 2TMDA 4XZ9A 5FEPA 5C6MA 3GKFA 3LTSA 3BGJA 1I4NA 4RKAA 1GTHA 3LXAA 3ABOA 1IXNA 4POCA 1I2NA 1TRIA 3IIVA 4O19A 1FXPA 3MHUA 3FOKA 4X22A 1JULA 4JX4A 4GXMA 4O16A 4XKYB 3NNTA 3BLIA 1TIMA 4UFIA 4LC8A 3IGSA 3TDFA 5TQLA 1MEIA 1T0OA 5EL1A 1OFBA 2BZNA 4O17A 5K9CA 1A5SA 3QFEA 3H55A 3HPSA 5K4ZA 1A50A 4EWND 3HG4A 3V75A 6TIMA 1F7BA 3W6YA 1AK5A 4DXVA 3GR7A 3PBVA 1SZEA 3WK2A 5IBXA 2CLFA 4M7SA 5L9FA 4MZYA 3GDKA 4XWUA 3QW3A 4ZZ9A 1VCVA 4FO4A 4ONVA 1SUXA 3LX9A 4M7TA 4JN6A 5D2XA 3PR2A 4IOTA 4ZQOA 2DJLA 4FNRA 3AO0A 3ZR4A 3W7NA 5DCBA 4LU0A 1ZJIA 4K37A 2I9EA 1Z48A 4H6KA 1IF2A 3NZ1A 3GNDA 3W3OA 3FIGA 2QKFA 2CZFA 3BGGA 1ML1A 5KTLA 4YCOA 5AYYA 4O53A 3UD6A 2FDSA 4MYXA 2BTMA 2Y7GA 3KRSA 3E49A 3G3MA 1P4CA 1RZMA 3DFNA 2CW6A 3NPVA 4JTJA 4MY8A 4FF7A 1XM3A 3B06A 1MO0A 4KWVA 1W3TA 3S1VA 4CNNA 1W3NA 2Y7DA 4K7YA 1TQXA 4OV9A 1GWJA 3UWYA 4FNPA 3WK3A 3P5YA 2ZTKA 4GFSA 3W1RA 1SFJA 4M19A 4K8HA 3QH2A 1GVRA 1MEWA 3Q58A 4UMCA 5EY5A 2HS6A 2ZZ1A 5E1QA 1W37A 4WOQA 5C55A 1EEPA 5HQEA 2GUUA 1ME9A 4MZ8A 4I7VA 1K8ZA 3NG3A 3O6DA 4JDYA 3O15A 1M7PA 3W2LA 3HOJA 1KTNA 1YDOA 1PCKA 3EWXA 2EKCA 4RX0A 4LW7A 2ISVA 1FCUA 3G0SA 2J24A 2CLLA 3DGRA 4RR4A 2QCEA 5H2ZA 4E2DA 3CU2A 3L2IA 1XUZA 2QJIA 3ZFHA 2V81A 3C2OA 1LROA 3P5ZA 1P0NA 3UPBA 4MOZA 3CPRA 3TU9A 1SZGA 3BG3A 3LBCA 4D2JA 1EWEA 3G18A 2FLIA 2QAFA 4BF9A 4DBEA 1HL2A 4DQWA 1LBLA 3U6WA 4QNWA 1SO6A 2A5HA 1D9EA 2YDAA 3NL6A 2XFWA 1YDVA 2CLOA 1NF0A 5L6UA 2E6AA 4WQ6A 3PVFA 5U4NA 3R13A 4HSOA 4LV9A 3ZS4A 2R14A 4A29A 4O57A 1R2TA 3CIXA 3UXAA 5KZDA 4IX2A 4JY9A 1M7OA 1O4UA 4HPJA 3WJXA 2YW3A 5F2LA 1DOSA 4KKXA 1AL7A 2FB2A 2ZZ5A 3HGJA 3GXTA 4Q32A 4IXHA 3BW3A 1FDJA 3L67A 2J9XA 4FNUA 2XN0A 1KM4A 4N4QA 1XI3A 4W9TA 3EXSA 4Y90A 1L6WA 2AGKA 3W86A 4ZQMA 1XC4A 3RNDA 1TJRA 2I1OA 1GJPA 3LGEA 3TSBA 4JTSA 1ZY9A 3WJWA 3S5YA 5KMYA 3L5LA 1DVJA 3A24A 1VRDA 3NQFA 1PS9A 3PUOA 3S42A 2FIQA 4AXKA 4OT7A 1UJPA 4Z1CA 3LB0A 4Y6GA 4WY0A 3ANYA 1K8XA 5AFDA 2YPIA 4K7VA 1UUMA 3M7WA 2ZFAA 4O0KA 5LHEA 3TXVA 2YFOA 5LZLA 3TMQA 1RQBA 1LTDA 4IJBA 4A21A 3EWWA 2DP3A 4O1BA 4BI6A 3SGUA 4E0CA 3B04A 3NQAA 1OF6A 1C8VA 1TQJA 3B05A 3MHGA 4GBUA 4TX9A 4I7UA 4JTFA 4NT0A 3NQEA 3N2XA 5AN7A 2VEMA 1OFEA 1T8XA 4XBKA 2ABAA 5KITA 4JIPA 1TTQA 1H63A 3NQDA 3L5AA 4J9JA 5TBOA 2NV2A 5MHBA 3KHJA 3I65A 1WOBA 5D05A 3TW6A 2NWSA 1W56A 3BW4A 1O94A 1P5BA 1RVGA 3M44A 1CW2A 1Q6RA 1ZAHA 3QZEA 1VHNA 2QCCA 5HWNA 2Z6JA 4NVTA 4DEFA 1ADOA 1OFOA 3DFQA 1GQNA 1HO1A 1OG0A 3M5YA 4LUIA 1GVQA 5A5WA 1QO2A 4UFHA 3WJZA 3MHFA 3N9SA 4LNYA 3ELFA 1EUAA 4JXCA 3LCIA 3Q37A 3QW4B 3TKFA 3A23A 3SJ3A 4QSHA 3M9YA 2A85A 3C4UA 1ME7A 3P8IA 3FKRA 4MLJA 5DY3A 3OBKA 1F5ZA 3ATYA 4GE8A 4HNUA 1I2RA 4R7JA 1O95A 3FA5A 4WOZA 1VHCA 2YXGA 1QO5A 1H7RA 4RXFA 1PVNA 1GEQA 3UQNA 1VZWA 2Y70A 3LCFA 4MLRA 4N6FA 4UTIA 3W75A 4UFKA 5BMXA 3W7KA 3MP5A 4OQVA 5J5DA 1PL9A 3MMTA 4O28A 5HJLA 1TPH1 1NEYA 1W54A 4CCCA 4CQ8A 1JQXA 5LNVA 3P67A 5FEWA 1JUEA 2V82A 1YLVA 3KVLA 1TPB1 4JGDA 3W85A 4E38A 2VELA 5LSMA 5KINA 3TV8A 3WK1A 1ZCOA 3LRLA 5D32A 3U8GA 3P60A 1TV5A 2DZVA 1I8JA 1NVMA 2GQ9A 4OBTA 4FX8A 3BG9A 3W7IA 5D02A 2VEKA 4ZQCA 2ZTJA 3NO5A 4XBSA 2FFCA 1F73A 1OYAA 2EGZA 4C1LA 4C1KA 1VS1A 2JKEA 1ICPA 4AEOA 2C19A 1DJNA 2ISWA 2YGYA 1HUVA 3QEZA 4MZ1A 4GC4A 2JBMA 1ONRA 3GXPA 4IQLA 1GT8A 3NA8A 3W84A 3LTPA 5CPNA 3PSWA 1EP2A 1PIIA 5CZSA 1KA9F 2RDTA 3TA6A 1OFPA 1O5XA 1WAUA 3IVSA 3W7CA 1GYLA 1GVOA 2OT0A 5U7SA 3LV6A 3MI2A 1H7WA 2NX9A 4QISA 3EWZA 1YADA 2VENA 3OHIA 2VKZG 4I9AA 2AQWA 4TR9A 2Z0IA 3M1ZA 3EXTA 2DU2A 2C15A 3LLDA 1M5WA 5AHLA 5DELA 5KZMA 3MJYA 1JCXA 1G67A 3UWQA 3PBUA 1L6SA 4IMEA 1G69A 3UWVA 5BRBA 4HSNA 1I2QA 1WDWA 4JNMA 4M6VA 4QIUA 4FIRA 1HO4A 3CHVA 3BLEA 1U83A 2QJHA 3C61A 3EEGA 3PUEA 3LHWA 3W7QA 4ADSA 2E6FA 3K30A 2O7SA 1EP1A 3QRHA 3W73A 4HNVA 3W2MA 2GJNA 4K39A 1L6YA 5LNUA 4IPJA 5EPDA 3LCHA 2F84A 5DBTA 1S5WA 3W7LA 4FNQA 2RFGA 3P8JA 1RQHA 3GX9A 4WUIA 2TPSA 4AHPA 4P61A 1KTBA 4FXSA 3TX9A 3MO7A 1T99A 3P82A 1TCDA 5HR7A 2PURA 1KV8A 3MI6A 2V8ZA 4LRTA 1TTPA 4GWEA 2CLMA 1UB3A 3UWZA 2ZRXA 1B3OA 1C29A 2FTPA 3L0GA 3LM7A 4Q33A 3SW6A 4UTMA 1TPVA 3W7MA 3UNDA 4Z0JA 2CLHA 1Q45A 3DH7A 3SZ8A 3BK0A 3DBPA 4LS2A 3NL5A 5LGZA 2F7FA 3F4NA 2J9ZA 4UCGA 5EKYA 3GAKA 1W5MA 1LCOA 3IVUA 5C5YA 3E9AA 4LV4A 2WPBA 3UYCA 2WNZA 1IXOA 3M47A 2RKXA 1KM3A 1YXYA 3VCRA 2EPHA 2DORA 5EBUA 1Q6QA 1DJQA 1EB3A 2C16A 3G1XA 1ZAIA 1N8FA 3SFKA 3C2VA 5HMSA 3OA3A 2QUUA 4R33A 2P0OA 2Y61A 1TRDA 3W2NA 3LI1A 2WJZA 3ZWTA 5LNWA 1YXDA 2Y7EA 3IVTA 2DZWA 4S2CA 2A6LA 4DO5A 3PY2A 1I2PA 3W72A 2TYSA 4AMAA 1A5CA 1ICQA 4UFJA 4BK9A 2IQTA 1TREA 4PODA 1ZNNA 4LVFA 3TFXA 2V30A 4CNOA 2ZRYA 4GUGA 1G7UA 3O07A 3KVMA 4EF8A 2FPVA 3DI0A 3GXNA 1Z44A 1TSIA 3ATZA 5DCEA 1H1YA 1TV8A 1BEUA 4MY9A 4O54A 2Z1BA 4X2RA 4AAJA 2A7PA 2KZHA 4QITA 4YXGA 1OYCA 2PCQA 4DPPA 4NNBA 3S6DA 2FB3A 5FEXA 3P62A 3E0IA 2ZZ2A 4AWTA 2Y88A 3GK0A 1X8FA 3KFTA 1AMKA 1VQTA 1QPNA 2HTMA 4QJ1A 3EWYA 4K8EA 5H91A 4A2RA 2G5WA 3DI1A 1VC4A 1YPIA 2DZXA 1S3HA 3T4CA 1SSGA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4GUI A;  3IIX A;  3ZWS A;  1A53 A;  1LP6 A;  1JJK A;  1UUO A;  1F2J A;  2GOU A;  3TC7 A;  5BOO A;  1XDM A;  4DF2 A;  4PFM A;  1W5P A;  5F1U A;  3CEU A;  2JGY A;  1CI1 A;  2NUY A;  3FFS A;  1GOX A;  1KFE A;  1FCQ A;  4CQA A;  3M6Y A;  4N9B A;  1FUY A;  1FWW A;  3AJX A;  1ALD A;  5F4X A;  3L9C A;  2BXV A;  1RD5 A;  3C2E A;  2Q3R A;  3CC1 A;  3E12 A;  4UC5 A;  3RK8 A;  1G4E A;  4FNT A;  2NV1 A;  4JIQ A;  5DY2 A;  4Z08 A;  4XTI A;  1SU5 A;  3VE7 A;  2NXG A;  1L2U A;  3W7O A;  1F74 A;  1G7V A;  1SPQ A;  1H50 A;  3W1U A;  2V5L A;  3C2R A;  3R12 A;  3NQC A;  4BI5 A;  4O13 A;  4ORM A;  2Z2U A;  1JUK A;  5T26 A;  4JR5 A;  1UCW A;  3HBL A;  4LS0 A;  3UPW A;  5CKS A;  5AYX A;  3EKL A;  3G1V A;  1R30 A;  2E1D A;  2CFF A;  2YFN A;  2QCF A;  3R8R A;  3W74 A;  1S5V A;  1GPW A;  1YXC A;  2C3Z A;  2QCL A;  1OFD A;  2Q8L A;  3VND A;  3TQK A;  3P74 A;  2DZT A;  3CM4 A;  2OCZ A;  4NXK A;  3I68 A;  2DZS A;  4G1K A;  1HG3 A;  5CPO A;  4AWS A;  3HO8 A;  4UNK A;  1S5T A;  3M5X A;  4UMA A;  3SI9 A;  4DPQ A;  3OG3 A;  4PL2 A;  3W7P A;  3ABS A;  3TML A;  2BWG A;  2C14 A;  2YR1 A;  3G1D A;  1M6J A;  4YMZ A;  1V5X A;  1KV5 A;  3SR7 A;  1J2W A;  1K7X A;  2J88 A;  5FI8 A;  3LDV A;  4ORI A;  2Y85 A;  3LV5 A;  2ABB A;  4UTH A;  1B4E A;  3DFO A;  2BSL A;  4MVA A;  1FQ0 A;  3N14 A;  3S5N A;  3LHZ A;  1F6P A;  3DHF A;  3KOF A;  2BLE A;  2CU0 A;  2NXI A;  1Q6O A;  2QUT A;  4JTH A;  4OV4 A;  3TSD A;  4O1C A;  3LLF A;  2RDW A;  4JTK A;  5HWJ A;  3A22 A;  1WV2 A;  4UTW A;  1H7P A;  4DBD A;  4JEQ A;  4O0Z A;  1FDZ A;  3N2M A;  3S1W A;  4H3D A;  3NM1 A;  2NUW A;  1OYB A;  4JDB A;  2ATS A;  1FWS A;  2NUX A;  3FJ6 A;  3NEV A;  3PUL A;  3L0N A;  5G2W A;  1W5N A;  3W1Q A;  3C2F A;  4JX5 A;  4OU1 A;  1FCV A;  5FF2 A;  5AHN A;  4N6E A;  3WJS A;  1LBM A;  5HIN A;  3PS7 A;  3G24 A;  3VI2 A;  4CLM A;  5IBX C;  5AHE A;  3PB0 A;  1FXQ A;  4UTU A;  3W07 A;  3W71 A;  4PC8 A;  2H3B A;  3HMJ G;  3B0U X;  3NQ7 A;  5G2I A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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