3ABOA

Crystal structure of ethanolamine ammonia-lyase from escherichia coli complexed with cn-cbl and ethanolamine
Total Genus 191
50100150200250300350400450050100150200
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
453
structure length
453
Chain Sequence
MKLKTTLFGNVYQFKDVKEVLAKANELRSGDVLAGVAAASSQERVAAKQVLSEMTVADIRNNPVIAYEDDCVTRLIQDDVNETAYNQIKNWSISELREYVLSDETSVDDIAFTRKGLTSEVVAAVAKICSNADLIYGAKKMPVIKKANTTIGIPGTFSARLQPNDTRDDVQSIAAQIYEGLSFGVGDAVIGVNPVTDDVENLSRVLDTIYGVIDKFNIPTQGCVLAHVTTQIEAIRRGAPGGLIFQSICGSEKGLKEFGVELAMLDEARAVGAEFNRIAGENCLYFETGQGSALSAGANFGADQVTMEARNYGLARHYDPFIVNTVVGFIGPEYLYNDRQIIRAGLEDHFMGKLSGISMGCDCCYTNHADADQNLNENLMILLATAGCNYIMGMPLGDDIMLNYQTTAFHDTATVRQLLNLRPSPEFERWLESMGIMANGRLTKRAGDPSLFF
50100150200250300350400450400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structures of ethanolamine ammonia-lyase complexed with coenzyme B12 analogs and substrates.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain
total genus 191
structure length 453
sequence length 453
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.3.1.7: Ethanolamine ammonia-lyase.
pdb deposition date 2009-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06751 EutB Ethanolamine ammonia lyase large subunit (EutB)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.220.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Annexin V; domain 1 lyase 3aboA02
2.30.170.30 Mainly Beta Roll Ribosomal Protein L24e; Chain: T; ethanolamine ammonia-lyase heavy chain domain like 3aboA01
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3aboA03
4NQ1A 4QSHA 4ZVJA 3P62A 4MJZA 3FYOA 3GDLA 3KX6A 3RLVA 1SR9A 2G95A 3C6CA 4ZQNA 2PURA 5HQEA 4O4WA 3DGRA 5AFDA 2NX9A 3CU2A 2EGZA 2OT0A 3U6WA 4YL2A 4A2SA 5AB3A 4NU7A 1ZAIA 4RR4A 1W31A 1H1ZA 1ALDA 1IXQA 1O60A 5K3VA 1FX6A 1WAUA 3P84A 3LCWA 3W87A 3QF0A 3M43A 2QCGA 4O54A 5BMWA 5FF3A 1AL7A 2V2CA 3B0UX 3FKKA 4ZQMA 1LOQA 4TMBA 1W5NA 1XFBA 1S3HA 4FNUA 4HHPA 3P80A 3W7QA 5KMYA 1FDZA 1GJPA 1DJQA 1TPDA 2HMCA 3TQVA 1QNVA 1B4KA 1DBTA 3MHUA 5HWMA 1P0NA 3UWVA 1IXNA 4GXMA 3QYQA 1PV8A 5K9DA 5F4XA 2C18A 3EEGA 4OBTA 3KXQA 3TAKA 4QIUA 4DPQA 3TX9A 1SO4A 3DBPA 3E02A 5A5WA 3E96A 3GNDA 4J9JA 5CPOA 5CZJA 1GVQA 2XN2A 4HIBA 4Y90A 3T44A 3TFXA 3DI0A 4DBEA 1PE1A 2FPYA 5D2XA 4IXXA 1H7RA 4MY9A 4AWTA 4B5NA 1CX9A 3DU0A 2Y70A 4IMGA 3IVUA 2GVLA 4IMFA 2E6FA 3EXTA 3GYEA 2QEZA 3LERA 3NPVA 3QSRA 2QCHA 3M0ZA 3PUDA 3LHWA 2EPHA 4Y6GA 2ISSA 4ORMA 2VFEA 1TYGA 1GZGA 3S6DA 1VLWA 3NQGA 3VE9A 2HS6A 3GKAA 2YSWA 2VEKA 2QCNA 1FCVA 3CQ0A 3A24A 2G96A 1M7OA 1RQEA 2HS8A 5CSSA 3WJXA 3C2EA 2DORA 3LV5A 3A5FA 1M7PA 2YPIA 2YR1A 3NVTA 1N55A 3M5YA 1VPXA 8TIMA 5LZLA 5BMXA 3FFSA 4LVBA 5DXYA 3LHUA 2V82A 1MEHA 3G3DA 3EWXA 3GX9A 3W1UA 3KRUA 4JTKA 4NJKA 5IM51 3EXRA 4LNYA 4M5PA 3RFAA 2ZZ5A 1HO4A 2B7OA 1KA9F 4CNPA 1R2RA 3CHVA 1AMKA 2RHGA 3LTSA 1SFJA 2HSAA 1PCWA 1JQXA 2NXGA 3LI0A 4LOCA 1LOLA 2E5CA 3P5ZA 5D37A 2Y63A 5D09A 1LRTA 1WBHA 3DFSA 3OVRA 4UUIA 4UR8A 2QCDB 1TCDA 4ALDA 4MOZA 5EKYA 1EPXA 4MY1A 1RVGA 3QM3A 3G1VA 2V8ZA 5C55A 4JX4A 5FF2A 3W7CA 3G3MA 5TQLA 3TCEA 2TMDA 3IRDA 5G2IA 3UY8A 2NZLA 2Y7DA 5LNRA 1I2NA 2R94A 4LT9A 3DFTA 3UPWA 1Q6LA 2V5LA 2ZRVA 3Q94A 2Y7FA 1OFBA 3N3MA 2E68A 2VKZG 1EA0A 4U4MA 3O07A 3NM1A 4RLIA 2VC6A 4H4IA 2YYUA 2DZPA 2P10A 1VYPX 3WFAA 5J5RA 2FDSA 3L0GA 1BTMA 4NJJA 2A4AA 1LBMA 1PL9A 3NQAA 1FWTA 1QR7A 3OG3A 5L6UA 2R14A 1JRCA 3MBDA 3V1PA 3JS3A 3W1NA 5AC8A 1H51A 1W5OA 3NEVA 1N7KA 2Q8LA 1L6WA 1O5KA 3RF9A 1DKWA 3W1QA 4BI6A 1J2WA 1H7XA 3I7RA 3PUEA 3HGJA 3S1XA 3IIZA 4Q4KA 1YXYA 2E5DA 1YDVA 4LW7A 1KFCA 4Z1AA 3QMSA 1W5PA 1SW0A 2RDWA 3BLIA 4LWWA 4EVZA 1J5TA 1Q6QA 4M19A 5HULA 3KAOA 4CCCA 3CLMA 4NVTA 1SO5A 1GPWA 4UTWA 1W1ZA 1C8VA 2AGKA 3PWAA 3O6CA 5TBOA 4XTDA 3B4UA 3L0KA 4XTIA 1Q45A 4IX2A 4KKXA 3MP5A 1O5XA 3T78A 3U2OA 3STCA 3ABOA 4I7UA 3BO9A 4DBDA 1T99A 4TR9A 3LM7A 1F2JA 1QPOA 1GWJA 3LHVA 5CSRA 4O53A 2ZRUA 2ZZ4A 5K2ZA 1FBAA 3O15A 1YDOA 2PCQA 3M41A 1C9DA 5SWUA 4O12A 4JDYA 2WO5A 1YYAA 2ATMA 2C19A 2C13A 4DELA 4RV8A 1TJRA 5LNSA 2YZRA 3W86A 4O1AA 1SFLA 4R7JA 2CZEA 2FB3A 5AHFA 2ABBA 1RQHA 1SZFA 1I2RA 1PHQA 4UMBA 5G4WA 3TKFA 4N6EA 4GJ1A 2TPSA 3HQ1A 2X30A 5L9FA 4R33A 2J24A 3GAYA 3PUOA 4OV4A 3IGSA 1NAL1 4M7SA 1SUXA 1L2UA 4NX5A 1ICPA 2RFGA 2RH9A 1Y0EA 2V30A 3WJYA 5HUPA 2QUTA 4MZ8A 4WOQA 1D9EA 1IXOA 1H5YA 4Q33A 2RDTA 2R8WA 5K4ZA 3MBFA 4N02A 4I7WA 3W2UA 3PAJA 1OABA 2TSYA 2PE4A 1TO3A 3NDOA 2QCLA 4UC5A 2OMAA 3O16A 4KWVA 4ZL1A 2TRSA 3OVPA 3P60A 2R91A 1BEUA 3M47A 1GVRA 3TC6A 3N14A 1F7BA 3LB0A 3INPA 1OYBA 1O4UA 3TR2A 4O14A 5DN1A 4MLRA 3HMJG 4JD4A 5EL1A 1G7VA 3SFKA 1TRDA 5LNUA 1FDYA 4EIVA 3MHGA 3S8HA 4BK9A 4LY8A 3G24A 2B7PA 2DJLA 2QAFA 2ZTJA 5G4EA 1KM6A 3DXIA 3JRKA 3NO5A 3TE9A 4JGDA 1BKSA 4TX9A 1YTEA 3UQNA 2O7QA 1GT8A 5D30A 1W3TA 1X7FA 2BSLA 1TMHA 3HPZA 2H6RA 4ONVA 2YW4A 4UTKA 3TQ0A 4S2BA 4CQ9A 4YXGA 4K36A 4AHQA 3HB9A 4JR5A 4WUIA 3DI1A 1Z42A 5FEWA 2NXIA 3TC7A 2CZDA 2ZQ0A 1GYNA 3UWQA 1EP2A 4IUOA 1WQ5A 3W1XA 4WY0F 1WYIA 5KTLA 4R53A 3PB0A 3M6YA 4QAIA 4LV9A 1A5CA 2AQWA 1IF2A 3UZJA 3ZR4A 5I3GA 2XN1A 4BI5A 1XL9A 2CLEA 1SO6A 2A2IA 1A50A 3M5XA 2ZA2A 3UWYA 1DOSA 1H7NA 2JKAA 3NA8A 3GZ3A 3BK0A 1DQXA 1L6SA 3W3OA 1TV8A 1LLZA 3B03A 1YTKA 3W7HA 3P8IA 3EWWA 4DF1A 3TH6A 3W22A 1H62A 1PCKA 4FNRA 3Q37A 5BW6A 3LHZA 2ABAA 3QQ1A 3RU6A 3B0PA 4WJEA 1I8JA 3LCFA 4RZ6A 5FI8A 1B3OA 4E0CA 2ZA1A 3IGXA 5K9XA 3TXVA 3I68A 3HPXA 4N9EA 1K7XA 1OX4A 2J9ZA 1GG1A 1F74A 4G1KA 3WJWA 1TJPA 3DAQA 1IXPA 4PEKA 3GDMA 2YW3A 1LOSA 4O52A 3D0CA 4RXFA 4DF0A 4Z1CA 4HSNA 4NXSA 3M5VA 2Y7GA 1VCVA 3CM4A 2B4GA 3W73A 5LNVA 1EX5A 1OFDA 1GOXA 3ABSA 1EUNA 2GQAA 3CT7A 2HTMA 3FEMA 2ATSA 1U5JA 3PB2A 4O18A 1OFOA 4FNTA 5D04C 2CZFA 4UXDA 3UNDA 4JTJA 5K9CA 1F76A 3NQCA 4X2RA 3GK0A 4UFJA 3KVMA 1P0KA 1XDMA 1LLWA 3L5AA 2NWSA 1JRBA 3W7KA 3R13A 7TIMA 3PVFA 4JIPA 3HGRA 4GUHA 5KSWA 2TYSA 4DO5A 1KV8A 4MZYA 1TPH1 4MVAA 3PR2A 3W74A 4M6PA 3VKJA 2CLLA 1RD5A 4PA8A 1GG0A 3L0NA 4UFHA 3HG5A 3QZEA 3EWZA 1W54A 3RMJA 5FEXA 1TTQA 3BGGA 3MYOA 3NM3A 4PCFA 1FWSA 5F4WA 3GXPA 3TIMA 3EXSA 3IIOA 2GVGA 3I7SA 1F73A 4FX7A 2AAMA 3N19B 1K03A 3LTPA 4K8HA 1YTDA 1KFKA 4M7TA 5DELA 4O0ZA 4X22A 3UWZA 3TDFA 4Z1BA 2H8ZA 2PRLA 3TXZA 1X6UA 4O15A 2NUYA 1V5XA 3S0CA 5KINA 3IVSA 2WV8A 2ZRWA 1GVOA 5C5YA 2FPTA 1DL3A 2JKPA 3W83A 3VCRA 1I2PA 1HO1A 4DF2A 1EEPA 1OFAA 4GNJA 4LVGA 3BV4A 4O1DA 3W7OA 2C1HA 1PS9A 1JUKA 1SW7A 1W37A 3ZS4A 3GR8A 3A21A 3TSMA 2XFWA 2QJGA 2NUWA 4LRSA 3C2RA 2IQTA 1OG0A 1K8XA 2FIQA 4JTEA 1JUEA 3N9RA 2ISVA 2NXHA 4UTTC 4HNUA 1K7FA 5D03A 2B7QA 4LC8A 2UV8G 4RCXA 2A5HA 4WY0A 1IGSA 1K02A 2QUUA 4N6FA 3I6RA 1DJNA 1NSJA 3NZRA 1YPIA 3W7GA 6TIMA 3NQ7A 1OYAA 5EBUA 1JR1A 1KFEA 1U83A 2EF9A 4XZ9A 4K37A 2GOUA 1KM3A 2BLEA 1JQVA 2FFCA 3NPWA 1H7WA 3BW3A 3HGOA 1S5VA 3P61A 5AHEA 3W7RA 1JCMP 1OX4B 4JX5A 4RXGA 3SY5A 3W7PA 5HWJA 3CEPA 1KBJA 3R5EA 1X1OA 4AHPA 4CCEA 2G5WA 2A21A 1LBFA 1LBLA 4E38A 3W84A 3BG3A 5AC7A 4N9DA 1QCWA 3NQVA 1KM0A 2DZVA 4XBKA 3TAOA 4NNCA 4U28A 4O17A 3W7EA 1S5WA 2DJXA 5AHLA 4O8RA 4UR7A 1GEQA 4FNSA 4Y8FA 3O6YX 4MYAA 3MW7A 1WA3A 1MEIA 4AWSA 3DHFA 3TMLA 2F7FA 3DENA 1QPNA 2ZCGA 2VOMA 1HTIA 2VEIA 1RZMA 2J6XA 3MI3A 1Q3NA 4IX0A 4BWLC 2I1OA 4PTNA 3NQEA 3QFEA 1DVJA 1OF6A 2ZRXA 4ADSA 3QW4B 2QCFA 3B8DA 4WXYA 5I3JA 2WNZA 6ALDA 1ZAJA 3G22A 3NL3A 1QFEA 5G1TA 4Z0JA 3M44A 3NL5A 3UWWA 4HPXA 1MXSA 4JY9A 3W23A 4OT7A 4IXHA 4LVDA 1EWEA 4GC4A 3W1TA 5KZMA 1PIIA 4AEOA 4ZZ9A 3C61A 4NXKA 1VLIA 5CZ0A 4ZQPA 3LI1A 5T26A 1JCJA 2YDAA 4O4VA 2GPTA 3DFQA 4S2CA 1ZY9A 1O95A 5CKSA 3TMQA 4O50A 2ZZ2A 3TQKA 3KVJA 4WZHA 1W0MA 4PC8A 1XUUA 5BRBA 2DZSA 1HG3A 4OWGA 3M5ZA 3C8FA 3G8EA 5LSMA 1KBIA 4JX6A 4CNOA 3QQ0A 2VFDA 4UFIA 4ZMGA 1ME8A 2QDHA 3A22A 4H3DA 1R47A 1JJKA 1XBYA 3MP4A 3IV3A 2NWRA 2W0UA 3QRHA 4JYDA 5DY3A 2P1FA 3MO7A 3NQDA 3CTLA 3QMTA 4OE7A 4LUIA 3ATYA 4AWUA 1ICQA 2FLIA 4UTTA 3LCXA 4O1BA 3DFNA 4FIRA 5IBXC 3LBMA 3EKLA 3GVGA 1TPVA 4N4PA 3RLUA 4S1FA 5KZDA 3I7QA 2XN0A 3ZWTA 4HSOA 5HINA 1AG1O 3W7JA 4UFKA 3QJAA 4RZ5A 3HO8A 1KW1A 1TRIA 4LS0A 4O10A 5DY2A 4HNTA 3UWUA 3Q2DA 5HMSA 3GAKA 5AN7A 2E6DA 1J4EA 4WY0B 4FF7A 2CLKA 1FXQA 3UPBA 2WPBA 1VZWA 1IIGA 3C3NA 1G4EA 4YCOA 4JDBA 1KFBA 4A29A 3DKLA 1OYCA 5CPMA 1FCBA 4EOUA 3C2OA 3GDRA 1TPWA 1OJXA 4LS2A 3H53A 3IVTA 3F1QA 1THFD 2C16A 2GJNA 3PBUA 1LP6A 1FQ0A 3L5MA 5EMUA 4UFMA 1SPQA 4OV9A 3L67A 4TMCA 3GB6A 4POCA 2DZTA 5CZTA 3LCGA 1XI3A 3ZFHA 5I3KA 3LHYA 4JTSA 3FOKA 4MPQA 3E12A 5D05A 5DLCA 1A5SA 1YXDA 3WK0A 5AC6A 4FB7A 2YYTA 4Y96A 5F4SA 4AXKA 3MI2A 2YFNA 1UCWA 2FPVA 4FIQA 2ZYFA 3LCIA 3TU9A 1TB3A 3NZ1A 1BWKA 4YWIA 1JVNA 2CLOA 4JN6A 4WXZA 2Y62A 2B7NA 4ZQCA 2ISWA 4GFSA 1G4TA 2YGYA 3BW2A 2E6AA 2J88A 2V81A 1B57A 2JGYA 4MZ1A 3W2NA 1W8SA 2ZA3A 3LTYA 5H2ZA 4E2DA 5U7SA 4ICNA 1LROA 5AYZA 1AW2A 2ZRZA 4N9BA 1KM4A 4LC6A 1CI1A 3MWAA 3OVQA 1V7YA 2A7PA 2W79A 4JY8A 5C2XA 3S5YA 1ICSA 3N73A 2QJIA 3NQFA 3TNOA 3MP3A 5CGQA 3W85A 3S9YA 3VFLA 5F2GA 5A8GA 1ZCOA 1R2SA 5FF7A 4JTUA 3STEA 1JCYA 3FA5A 3G0SA 3LXAA 1VS1A 1FXPA 1LTDA 1NFBA 3UXAA 3EX1A 4BR1A 3T55A 1VRDA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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