3ABR | Genus

Total Genus 194

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	194
sequence length	453
structure length	453
Chain Sequence	MKLKTTLFGNVYQFKDVKEVLAKANELRSGDVLAGVAAASSQERVAAKQVLSEMTVADIRNNPVIAYEDDCVTRLIQDDVNETAYNQIKNWSISELREYVLSDETSVDDIAFTRKGLTSEVVAAVAKICSNADLIYGAKKMPVIKKANTTIGIPGTFSARLQPNDTRDDVQSIAAQIYEGLSFGVGDAVIGVNPVTDDVENLSRVLDTIYGVIDKFNIPTQGCVLAHVTTQIEAIRRGAPGGLIFQSICGSEKGLKEFGVELAMLDEARAVGAEFNRIAGENCLYFETGQGSALSAGANFGADQVTMEARNYGLARHYDPFIVNTVVGFIGPEYLYNDRQIIRAGLEDHFMGKLSGISMGCDCCYTNHADADQNLNENLMILLATAGCNYIMGMPLGDDIMLNYQTTAFHDTATVRQLLNLRPSPEFERWLESMGIMANGRLTKRAGDPSLFF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystal structures of ethanolamine ammonia-lyase complexed with coenzyme B12 analogs and substrates. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain
molecule tags	Lyase
source organism	Escherichia coli
total genus	194
structure length	453
sequence length	453
chains with identical sequence	C
ec nomenclature	ec 4.3.1.7: Ethanolamine ammonia-lyase.
pdb deposition date	2009-12-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF06751	EutB	Ethanolamine ammonia lyase large subunit (EutB)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.220.70	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Annexin V; domain 1	lyase	3abrA02
2.30.170.30	Mainly Beta	Roll	Ribosomal Protein L24e; Chain: T;	ethanolamine ammonia-lyase heavy chain domain like	3abrA01
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3abrA03

4OV9A 4O53A 2PRLA 5F4WA 4XUGA 3NQGA 3HJZA 1ZY9A 1BEUA 1OABA 4IXHA 4TR9A 1MEWA 1LRTA 1VR6A 4WQ6A 1OFEA 3F4WA 1RQBA 5C5YA 1L2UA 3QJAA 3FKKA 1I2QA 3S1UA 3UY7A 2QCDA 3O1NA 3TAOA 4QISA 5G4EA 1IF2A 3PBWA 1D9EA 4Z0JA 3HGRA 4UTWA 4UUIA 4KFOA 1IXNA 1UASA 5A5WA 4FB7A 1I4NA 1G67A 1FY6A 3I65A 4ZZ9A 4IPIA 3W1RA 4GJ1A 3IIOA 3NPWA 2CLOA 4QNWA 4HIBA 4X2RA 1H62A 3DFQA 3WK0A 3U6WA 3L5LA 3VKJA 1F73A 2ATMA 5LNWA 4UR7A 3B0VC 5K2ZA 1DJQA 1X1ZA 3W75A 4CCCA 3IIZA 1IGSA 4QAIA 1W3TA 4EIVA 4UFJA 1RPXA 3W1MA 1IXOA 2Q3RA 4DBEA 4JTSA 2B4GA 1XXXA 5D38A 3N9SA 5CG7A 2WO5A 1W5NA 3RMJA 3KVLA 1CI1A 3DKJA 5LNUA 4B5NA 1B3OA 4GXMA 3STFA 3QFEA 3QH2A 1ME8A 1N7KA 5F2GA 3G0UA 3N2MA 3FIGA 5I3FA 4LT9A 1UJPA 3STGA 2QR6A 2V2DA 1W3NA 3NQ2A 4M6PA 3LHUA 1FBAA 1RQHA 1W1ZA 4RV8A 5C54A 4NX0A 5CPOA 3EEGA 1GOXA 4M6VA 3C4UA 4UFHA 3BLIA 1LBMA 5D2XA 3LXCA 2TSYA 1FCVA 4HT3A 3NOEA 4KKXA 1TB3A 1TJPA 4O1CA 4GE8A 3LGEA 4UTTC 3W84A 5HMSA 3CIWA 2CLEA 3MJYA 3DHFA 3L66A 2Z6JA 3MMTA 1Z44A 5AC8A 2GVLA 4K39A 3THQA 5K9DA 4JR5A 4O8RA 3M44A 1H7PA 3RF9A 4ZVJA 1EUAA 1TSIA 5LNSA 1Q3NA 4JD4A 1PCKA 3EWXA 2F84A 1XBZA 2A4AA 1VLWA 1VCFA 1FDYA 3GKFA 4A2SA 1J2WA 3GKAA 3GNDA 1T96A 2NXGA 5AHLA 3LTSA 1TV5A 1W8SA 4I7WA 3LI0A 3NPXA 1VH7A 2NX9A 3G0SA 1VCGA 1JQXA 2GQAA 3QQ0A 2G96A 2PURA 2ZZ4A 2B7OA 3FYPA 3G1DA 3UZJA 3LLFA 3FEMA 5FEZA 4WZHA 4WY0B 4K38A 1W54A 4YL2A 1QPRA 4AEOA 2BZNA 2GUUA 3NQDA 1VLIA 3NO5A 3N34A 5FF0A 4Y9AA 4UMCA 5HJLA 3SGZA 4UTLA 2ISSA 3G1SA 4DF2A 2DZUA 2ZDRA 3EX6A 4XTIA 4UTUA 3M5VA 1F76A 1F74A 1J4EA 3NQAA 2ABAA 2NV2A 1WBHA 1QPOA 3B4UA 4O54A 4K36A 5IM51 3KX6A 5U4NA 1GPWA 3NZ1A 3W1LA 3GX9A 4JN6A 2QDHA 4O16A 3W7CA 4IMCA 2QCEA 2V0TA 2LLEA 2FPYA 3L65A 4FX8A 1C8VA 2O7QA 3P60A 4IMFA 1YDNA 3MO7A 1TPH1 1GVSA 3IVTA 3LOTA 1KLZA 3LCFA 1GYLA 4FXSA 4O12A 2ISWA 3OVQA 4XKYB 1EIXA 1H1YA 1OFRA 1LRNA 1XBXA 1YDOA 3TE9A 3H55A 3GAKA 3OEXA 4GUJA 3R13A 1X1OA 4RJEA 3M5XA 3W83A 3P61A 4WY0A 4PTNA 4IXXA 2ZA3A 4MY1A 3L5MA 3NM3A 4LS1A 4Z1DA 3HG3A 2JKPA 1ADOA 4XZ9A 3QRHA 2E1DA 5DCDA 3PB0A 1FQ0A 1KBIA 3KRSA 4QITA 3C2EA 5HINA 4WOZA 5E1QA 5C6MA 2E6AA 1FCBA 3EX3A 3TK7A 1KLYA 3CEUA 1R47A 3OVRA 3ANYA 1OFPA 3N19B 1SW7A 1G6CA 1QAPA 3NQ8A 4LV4A 3INPA 4DBDA 4O11A 2R94A 4FX6M 5KTLA 3B06A 1YTDA 2HTMA 4XKYA 1KTNA 2A1YA 1K7EA 5D33A 1K8XA 2ALDA 3BARA 3RLUA 5LGXA 5AC7A 2CLKA 3BG5A 2ZBTA 1FDJA 3DKLA 3NNTA 3GVGA 3NM1A 3CTLA 5TIMA 3O06A 4S1FA 1I2RA 3NEVA 3MP5A 1DQXA 1L9WA 4OGZA 1UUMA 1YLVA 1GWJA 3QYQA 4O10A 2X1TA 1TTPA 4Y90A 5U7SA 2JKEA 2Y70A 4L4MA 3MYPA 3EKLA 4LOCA 2P1FA 3UYCA 3GR8A 1F7BA 1GTEA 1SUXA 2ZZ3A 5A8GA 4UMBA 1PL9A 3PUDA 4HPJA 2CLHA 5AYXA 1JRCA 1LOSA 2C15A 1LCOA 1LORA 3FFSA 3GDMA 4ALDA 1K03A 3TAKA 3UWYA 3G1FA 3NL2A 3UWVA 4M7TA 2Z2UA 1XBVA 4NXKA 7TIMA 4UTKA 1X7FA 2B0MA 3PUOA 2X1UA 3FKRA 4AHQA 2Y85A 1JCYA 2V8ZA 3DBPA 3IV3A 5SWUA 1KBJA 3W87A 2Z6IA 4ZMGA 1G4EA 4LWWA 3VFLA 5MHBA 4O57A 4A29A 5FF2A 3NVTA 4HN4A 3RLVA 4DO4A 3H54A 3LTPA 3P7YA 1QOQA 2VEKA 5CPNA 1ONRA 5KZEA 1KFLA 5KZMA 3LI1A 2J27A 3ABRA 1EUNA 5DY3A 2GOUA 3IIVA 4NX5A 1U5JA 3QC3A 2W6RA 1OJXA 2BX7A 3QQ1A 3W1AA 1OFBA 2H3BA 3L67A 1NSJA 2FJKA 3M1ZA 4O0ZA 3VCRA 3W7IA 3DFPA 1E51A 3IGUA 3NA8A 3PSWA 2WJZA 5LNRA 1WX0A 1YDVA 2GJLA 2WNNA 2O7SA 3PC0A 1TPC1 4GUGA 3B05A 5LSMA 4MJZA 1GJPA 4QQ3A 4PEKA 1YADA 4CNOA 3R89A 1LYXA 3O8AA 5CZJA 3EX2A 1GVQA 5K4XA 4Q33A 3LDVA 4MVAA 3V75A 1N8FA 2YW4A 1TRDA 4MKNA 3QW3A 1SSDA 1EPXA 4WUIA 1ML1A 1MO0A 4CQ8A 3GXPA 1VYPX 4Z0SA 2V2CA 2FPTA 4I9AA 3CU2A 1YYAA 1XUZA 4LS2A 4GUHA 1L6WA 3ZWSA 1VC4A 3UD6A 3B0UX 4CCDA 2TMDA 2VEIA 4UFLA 5D37A 5HUPA 2NZLA 2G5WA 5EY5A 4MPQA 4NZFA 4UR8A 3SGUA 3TC7A 3VE9A 3U8GA 3GYEA 2Y61A 3D0CA 1H7RA 1ZNNA 4UNKA 3TXVA 3QMSA 1SO5A 2ZRVA 3C56A 1AK5A 4K6AA 4C1LA 4UTWC 1DL3A 3BVJA 3B03A 1H63A 1UCWA 2E5CA 2WPBA 2C18A 1VS1A 2ZRZA 3M5YA 5LKYA 3MHGA 4KFPA 1NEYA 4K7YA 3PR2A 4O0KA 1ICPA 1FDZA 4JY8A 3C2OA 3UZ5A 2E6DA 3NL6A 1PIIA 3NAVA 3GB6A 3ABOA 1JCMP 3E12A 4Y96A 3BLEA 1QNVA 4IPJA 4HKPA 3M7WA 1TIMA 3MBDA 3W74A 2YPIA 5K4ZA 5TQLA 2OCZA 3CLMA 4YXGA 3I7SA 3QSTA 1H7WA 4BI7A 4IQLA 1MZHA 3IIXA 3E9AA 1FX6A 5C55A 1VGAA 3W7HA 4GWEA 1EB3A 2DP3A 4O17A 1JJKA 5DBUA 3W7QA 1QFEA 3EKZA 1DOSA 1Q6RA 3L9CA 3TFCA 1VQTA 4HHPA 3K30A 5HWNA 2EGZA 1RVGA 3TW7A 4LTSA 3PM6A 1F05A 4LVGA 4UCGA 3NQ6A 4LVFA 4GFSA 2C13A 4O50A 3FOKA 1XKYA 4H4IA 1A5BA 4BK9A 2OZ0A 1R2SA 3SFKA 1KV5A 4IX0A 3R8RA 1KTBA 1RQEA 2Y89A 4JIQA 1TQXA 4LNYA 3O05A 2C3ZA 4DF1A 4O1AA 5D09A 1W5MA 4LVAA 4NJIA 3LV5A 5LHFA 3ZFHA 5AYYA 2DU2A 2QCHA 3S6DA 5F1VA 2CZFA 2GPTA 3BG3A 4RK8A 4CNPA 3L0KA 1AW1A 1WOAA 2A85A 5E0KA 4KWVA 4C1KA 4DELA 2OJPA 1TPEA 3SR7A 1AL7A 4Q32A 3S42A 2CWNA 1VHCA 1F6PA 2PRMA 2ZZ6A 3W23A 1SSGA 2Z1BA 2C0AA 4O13A 3EB2A 4LUIA 1XFBA 4IGHA 3WK3A 1I2NA 3PSVA 4JYDA 3C2FA 1LBFA 3M16A 3M5ZA 4HNVA 4LRTA 2WSRA 2WSYA 1OX4A 3EX4A 4XWUA 4XBKA 2H8ZA 3S0CA 2QJHA 5D2WA 1V7YA 3MHFA 2FTPA 3L0NA 4NJGA 3DAQA 4NZJA 1OYAA 4NU7A 2BLEA 3S9YA 3W9ZA 2TRSA 3WJZA 3NPUA 1TYGA 2TPSA 3W70A 1WV2A 4UTHA 2FPVA 2VFEA 1FXPA 3TKFA 4MLJA 3W85A 3W3OA 4RLIA 2CW6A 3P8JA 3G24A 2E77A 2D73A 5AHIA 4CQAA 4K8HA 3HOJA 3R12A 3ZWTA 4JNMA 2PRHA 3W76A 1W31A 4AF0B 2V5BA 4LRSA 3P5YA 3LBMA 4POCA 4JTHA 1O94A 4MZYA 2A6LA 4GUIA 1LM1A 4U28A 2RDUA 2A7PA 4A22A 4LS0A 2C14A 5I3GA 3DH7A 5DXXA 1TREA 1EWEA 1H51A 4N9BA 1LROA 5DLCA 4N6FA 5BMXA 3W7GA 1T0OA 5DCEA 2J88A 5D2VA 1JQVA 4PC8A 3UPWA 1SO6A 2W0UA 4ONVA 5KZDA 3STCA 1NAL1 1JUBA 3QMTA 5AB3A 3IGXA 4OV4A 3Q2DA 3M9YA 3MI2A 4DEFA 1W5OA 3QM3A 4YCOA 2WOQA 1SU5A 1GVOA 3TQVA 4EWND 4ICNA 5F4XA 1HO4A 1R46A 2PC4A 3TROA 1TTJA 3TSMA 3GLCA 1MSSA 3IRDA 4O52A 5HR7A 1SR9A 4AF0A 1J5TA 1SPQA 3UXDA 4E2BA 3W2KA 5G1TA 4BWLA 1LLWA 1SO3A 3GIYA 2WSQA 2ZZ5A 2X30A 1AW5A 1DV7A 3M47A 3A22A 3F03K 4PA8A 4PL2A 4Z1BA 4N2YA 4AHOA 3TC6A 5J5DA 1QR7A 2Y7FA 3G1YA 1RR2A 2QKFA 1EP3A 1OK6A 3SW6A 1MXSA 5DY2A 3BO9A 4WX2A 2ZTJA 4CCEA 1DHPA 1IXPA 3ZR4A 4LY8A 3EWBX 3A5VA 2AQWA 3LX9A 4FF7A 4N9CA 2DJLA 4DPPA 3PWAA 5D30A 3W88A 2V30A 5BNKA 4S2CA 3W7MA 1ME9A 1BTMA 2QCFA 2P0OA 1KM4A 2A5HA 3LCIA 2NV1A 3LHZA 2GQ8A 1DVJA 2E68A 5BRBA 3I6RA 1QPNA 2ZQ0A 3HG4A 2DJXA 3O6DA 3G3MA 2JGYA 5G4WA 5AN7A 1FWRA 4ZQMA 2OMAA 2QDGA 1NF0A 3GDKA 1D3GA 3LV6A 3UY8A 3TIMA 3IIPA 1NF7A 3W2LA 1FCQA 4PH6A 2ZFAA 1WAUA 2ATSA 5K9XA 3A21A 3JRKA 4MIMA 1SZGA 1KTCA 5CPLA 3S5ZA 1H7OA 3WK1A 1P0KA 2PE4A 4IOTA 4ORMA 2HS6A 3GDRA 3LXBA 2XN2A 2Y7EA 4JIPA 3L0GA 5H91A 1OYCA 2C6QA 1PVNA 1ZJIA 3P84A 1UBSA 2X2GA 2QEZA 5CZ0A 2ZA2A 4MOZA 2QCMA 5AFDA 1PHWA 1O60A 1SFJA 1UB3A 3SSJA 4J9JA 5AOUA 2ZZ2A 5CGQA 1HL2A 1TTQA 1W56A 2A0NA 2A2IA 3HGSA 1WYIA 3N2XA 2J6XA 3KVKA 4JTJA 4R7JA 3SJ3A 4JTLA 4RXGA 4UMAA 3P67A 4AXKA 1I8JA 1ALDA 4OE7A 2VC6A 2WNZA 3MHUA 3M41A 3W1NA 2YR1A 2HSAA 3CM4A 3T4CA 3FA5A 2OX1A 3R2GA 4OWGA 3TJXA 3W7NA 1OHLA 1GG0A 2HMCA 4Z1AA 1GEQA 5K7JA 4NT0A 1OF6A 2X1RA 3C61A 4O14A 3BLFA 5BOOA 4MUZA 1THFD 2BSLA 2FFCA 4LU0A 1V5XA 4RZ5A 5HUOA 1MEIA 1ZAHA 4X9SA 1OG0A 3NR0A 1G4PA 3EWWA 1BWKA 5CKSA 1O5KA 1XDLA 1TV7A 1WDWA 3CWNA 3L5AA 4MYXA 1FUYA 1VPXA 3UWQA 3CEPA 1KM2A 2V2HA 3TJLA 1L6SA 4HSNA 3C0JA 5K3VA 5EPDA 1ZCOA 3DI0A 2VEMA 4QSHA 4RR4A 3B8DA 4E0CA 3W7RA 1UUOA 3BW3A 3G3DA 3SECA 3RFAA 2Y7GA 3OBKA 4N9EA 1GG1A 5FEPA 5D2YA 2E09A 4UNLA 3A9IA 1A5SA 3SY5A 2VKZG 4OQVA 5G2HA 3O6CA 1QCWA 1KM6A 2QJGA 4JXCA 4JTGA 2VFFA 1F5ZA 3DENA 4MJMA 3NQMA 2H90A 5AC6A 3PBVA 3TFXA 4NQ1A 3KFTA 3TX9A 1WOBA 3Q58A 2RDWA 3MW7A 3A24A 2ZRWA 1GQNA 3E0IA 4O4VA 3S1WA 2CLLA 5FI8A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3ABRA

Total Genus

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Chain Sequence

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