3ABR | Genus

Total Genus 194

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	194
sequence length	453
structure length	453
Chain Sequence	MKLKTTLFGNVYQFKDVKEVLAKANELRSGDVLAGVAAASSQERVAAKQVLSEMTVADIRNNPVIAYEDDCVTRLIQDDVNETAYNQIKNWSISELREYVLSDETSVDDIAFTRKGLTSEVVAAVAKICSNADLIYGAKKMPVIKKANTTIGIPGTFSARLQPNDTRDDVQSIAAQIYEGLSFGVGDAVIGVNPVTDDVENLSRVLDTIYGVIDKFNIPTQGCVLAHVTTQIEAIRRGAPGGLIFQSICGSEKGLKEFGVELAMLDEARAVGAEFNRIAGENCLYFETGQGSALSAGANFGADQVTMEARNYGLARHYDPFIVNTVVGFIGPEYLYNDRQIIRAGLEDHFMGKLSGISMGCDCCYTNHADADQNLNENLMILLATAGCNYIMGMPLGDDIMLNYQTTAFHDTATVRQLLNLRPSPEFERWLESMGIMANGRLTKRAGDPSLFF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystal structures of ethanolamine ammonia-lyase complexed with coenzyme B12 analogs and substrates. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain
molecule tags	Lyase
source organism	Escherichia coli
total genus	194
structure length	453
sequence length	453
chains with identical sequence	C
ec nomenclature	ec 4.3.1.7: Ethanolamine ammonia-lyase.
pdb deposition date	2009-12-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF06751	EutB	Ethanolamine ammonia lyase large subunit (EutB)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.220.70	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Annexin V; domain 1	lyase	3abrA02
2.30.170.30	Mainly Beta	Roll	Ribosomal Protein L24e; Chain: T;	ethanolamine ammonia-lyase heavy chain domain like	3abrA01
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3abrA03

3NQFA 1RR2A 1PE1A 1FDJA 4JIPA 2DU2A 1GG1A 2TSYA 3C2RA 4JDBA 3B0PA 2CW6A 1XBYA 1CX9A 2ZCGA 1OYBA 5HUPA 4RV8A 5HR7A 2VFGA 5HWNA 1OFEA 1J5TA 3W7LA 1TJPA 3H55A 3NQAA 3HGOA 5DBTA 3C4UA 1JCJA 3WFAA 3FKRA 3ELFA 3LCWA 2WV8A 3S5NA 4NT0A 4JTLA 5DLCA 3PUEA 3TFCA 1IIHA 1OFDA 3NL3A 2A0NA 1MXSA 4TR9A 4NJJA 3I65A 1TYGA 4Z0SA 3LERA 2V5BA 5KMYA 2QCFA 3KVMA 4WX2A 2QCLA 1E51A 4O1DA 2VFDA 4JTTA 3LLDA 1SO6A 2TYSA 2E77A 3E9AA 4UFHA 3C61A 3NL2A 4PTNA 3O8AA 4QNWA 4K38A 2A2IA 1D9EA 2Y62A 5H91A 1ME9A 3LRLA 3KFTA 1FXPA 2E5BA 2FIQA 4LY8A 3TKFA 2Y7DA 2B4GA 1TSIA 3QMSA 2WNNA 1KFKA 3GKAA 1TPH1 1VPXA 4X2RA 1KM0A 3G8RA 5F2LA 2Q3RA 4NVTA 4O54A 3S5YA 4KWWA 1L9WA 2BSLA 1HO1A 2WOQA 3HB9A 4O10A 1G7UA 2X16A 4EOUA 1G4TA 4N9EA 1DV7A 3M41A 5CPLA 3T7VA 2A1YA 3N3MA 4YLWA 3P62A 3WK0A 4AH7A 4FIRA 4JY9A 5E1QA 5HQEA 1RVGA 5DCDA 3W1TA 1G4SA 2CLMA 1FCBA 2VFEA 2TPSA 4KFOA 3DFSA 2NLIA 4LOCA 3MP5A 1F73A 2X1UA 1UJPA 2V2CA 1YTKA 1XUZA 3IVSA 2H8ZA 1SFLA 4JTGA 3THAA 2C18A 5D05A 1X7FA 4O52A 3EWYA 2ATSA 4NNAA 3KVLA 5LSMA 3OIXA 4KFPA 2X1TA 4NUWA 2H90A 3B03A 4DPPA 1H7WA 2Y85A 4JTIA 1LYXA 1PHQA 3DFPA 1VS1A 5D2VA 4UTLA 3GX9A 3EWXA 1W56A 4O0KA 1Z42A 1KBIA 1U83A 3MW7A 4BR1A 1K02A 1LDCA 3QC3A 3RU6A 3W7CA 1QAPA 2ZRVA 1N55A 4M7TA 3GB6A 4K8EA 5F2IA 3STFA 3B0UX 3OHIA 4O0ZA 2YDAA 4UIOA 2VEKA 4FNUA 3FJ6A 2NX9A 4A21A 5G5IA 1ICQA 1EUAA 3W7GA 4N6FA 3TIMA 2ZTKA 1PCWA 2Y6ZA 4JNMA 2J27A 1YXDA 4MKNA 1KTBA 3RLUA 3L0NA 2CZDA 5AHFA 4IXXA 5K3VA 1G7VA 5LNVA 1R2RA 1YPIA 4TMCA 4FXRA 3L21A 4RCXA 2GQAA 4JD4A 4ALDA 1F5ZA 3DBPA 2WKJA 1W5PA 1FDZA 3G1VA 3WJXA 1WXJA 4A29A 4JS3A 4RX0A 1IXQA 1KV5A 3IVUA 3U6WA 3TW6A 4UFJA 3W1RA 4EF9A 2B7PA 2C14A 4A2RA 4BK9A 4DEFA 3HPZA 1N8FA 1F2JA 5K9XA 4Z1CA 3D0CA 4BI7A 1ZAJA 1SZEA 3W7HA 3LTPA 4GUJA 1M5WA 3PG9A 1NAL1 4HNTA 4L4LA 3G1SA 1TJRA 1F76A 1O5XA 5A5WA 3OBKA 4NU7A 2DP3A 2QR6A 1XDLA 1ZAHA 4IMDA 4LS1A 4YWIA 4GRSA 3VI2A 4JTHA 4K7VA 4TO8A 3QEZA 3W7NA 1KM5A 4O15A 5EL1A 3NYZA 3S1WA 4O16A 3GK0A 4MY1A 2ABAA 4M6QA 1XKYA 1SW0A 3QF0A 4ICNA 2H3DA 3G1DA 3N2XA 3N14A 3L65A 4UXDA 4TX9A 1TPVA 3NAVA 1QPQA 1AW1A 1VGAA 1K7EA 5LNWA 3KVJA 1KW1A 2ATMA 2HS8A 3A9IA 3TAOA 1JRBA 1O5KA 4LS0A 2FPTA 3L0GA 1XM3A 4UTWC 3MBDA 4HIBA 5D2WA 3EX3A 3MP4A 5HMSA 3VE9A 3WK3A 2E6AA 2ZZ6A 3L68A 5F4SA 1I4NA 2QCDB 3HG4A 1OYAA 5AOUA 3DHFA 2HS6A 1LZOA 3W84A 1QMLA 1XC4A 4RXGA 4O4WA 3QQ1A 1ZALA 1UASA 1QO2A 3GNDA 3JR2A 2VXNA 5I3IA 2WO5A 2YXGA 4IPIA 1KFBA 3ANYA 1H7OA 1OG0A 1YLVA 1VYRA 5K2ZA 2HSAA 4WXYA 2YFNA 3PBUA 3TQ0A 3NXFA 3MJYA 7TIMA 4CNNA 1D3HA 1JVNA 4I7WA 2GUUA 3B4UA 4JXCA 3PF3A 3UNDA 3W7PA 1W3TA 1HUVA 2KZHA 4X3ZA 2WSRA 1EWDA 3MHUA 1RV8A 3IVTA 3ABRA 1LBLA 2YPIA 2PC4A 5I3GA 3W87A 3GXNA 3LRKA 5D04C 3DU0A 4O1CA 3C2FA 2QEZA 1IIGA 3IIVA 1MSSA 1VR6A 4LV4A 3TSDA 1WX0A 3IRDA 3A24A 5I3JA 3I6RA 2Z1BA 4GNJA 4DO6A 2YX0A 1OABA 3UXAA 1DJNA 2YW4A 1MEHA 2DZPA 3HPXA 3PG8A 3M0ZA 2DJLA 4OE7A 4N9CA 1M6JA 3I7SA 3LTSA 1AL8A 5FEXA 1VLWA 2BLEA 1VH7A 3O6YX 2QAFA 3TE9A 2WNZA 3QFEA 5G2WA 3W07A 4CQAA 5CPOA 3S6DA 1BWKA 3BG9A 3NQGA 5BMXA 1VC4A 3W2MA 3M44A 3LI0A 1TPC1 4BWLA 4GUGA 3OVQA 1YDNA 4QAIA 2JGYA 2Q8LA 5ABTA 3FYOA 4JYFA 4RLIA 1SR9A 4EWND 4ORIA 3QM3A 3LGEA 4JYEA 4LVFA 2FQIA 4K7YA 1W37A 3LHVA 4NX0A 4ORMA 4FIQA 3IIXA 3EB2A 2RDUA 2PRLA 1W0MA 1K8XA 2XN2A 5FESA 3GR8A 1TPDA 3INPA 2YYUA 4I9AA 4AHPA 2RHGA 3SSJA 3BVJA 4RR4A 4FXSA 4OHQA 4MJMA 4NJGA 4WZHA 3TMQA 3TSBA 3PR2A 1OK4A 4AAJA 3EXTA 4GE8A 1TB3A 1X1ZA 1RQHA 3TQVA 3W74A 2J9XA 1UUMA 3ATYA 4UFIA 3W71A 1RQEA 4NZFA 3N73A 2A7RA 3W1PA 3W1MA 2B7NA 2A6LA 4OQVA 3DXIA 4PA8A 4C1LA 1SQ7A 3C0JA 3FJLA 3N9SA 2O7QA 5AN7A 3CIXA 1K03A 3P82A 4NXKA 5AB3A 1AG1O 3SGZA 2H8XA 1XCFA 3CWOX 3SI9A 1NSJA 5FF2A 1NF0A 4FNTA 1CW2A 3OA3A 3QQ0A 1ADOA 4H4IA 1P5BA 1EA0A 2NV1A 3P74A 5K9CA 3W7IA 3NL5A 3PSVA 6ALDA 2WSYA 3P81A 1Q6OA 2YFOA 4A2SA 2VC6A 4WOZA 3CU2A 4PL2A 4O57A 3W75A 3NM1A 1OFAA 3CEUA 3W22A 3DH7A 1H63A 3KVKA 5CZ0A 3S5OA 4R7JA 3DAQA 4NJIA 5EBUA 3C2VA 4PC8A 2H3BA 1JJKA 2E6FA 1B3OA 4U4MA 1I2NA 4O8RA 2DZTA 1WOBA 2B7QA 3NPWA 3W7QA 3NQ2A 3VFLA 2NXHA 3PVFA 3FFSA 1C8VA 5DXXA 2GVLA 3RMJA 5KITA 3R5EA 3W1LA 1K7FA 1WDWA 3BK0A 2YZRA 3MI3A 1SO4A 4IQLA 4R33A 3R8RA 3W7RA 3Q94A 5DCBA 3NVTA 4G1KA 4YXGA 1YADA 1FWWA 4K36A 3GAYA 1GTHA 5G2HA 4O19A 1QFEA 5TIMA 1X8FA 2QKFA 4AWSA 3EWZA 1X6UA 3OG3A 3UWZA 3VE7A 2D73A 1A5CA 1SZNA 1U5JA 3GR7A 3I68A 3LCIA 3P80A 3QW4B 5IBXC 1OYCA 5I3HA 2FJKA 2Y7GA 3F4NA 1FQ0A 4AHOA 4RZ4A 4KFNA 5CZTA 3B04A 3G0UA 2VFHA 3BLEA 1RD5A 3UPWA 1DKWA 4CQ9A 4JR5A 2ZZ1A 2QCHA 3SECA 5L9FA 3C3NA 3TR2A 3ABSA 3W88A 1SU5A 3GDLA 1TO3A 4TMBA 3P5YA 4I7UA 4MYAA 2ZFAA 4Z1DA 2RDWA 1F6KA 2C3ZA 3W83A 2ABBA 3KHJA 1Z48A 1TTJA 3G18A 1D3GA 1GTEA 3IIOA 1FCQA 3PBVA 1R2SA 2Z2UA 5K7JA 2CZEA 3W2KA 4ONVA 1TREA 4Q32A 3G1XA 4LVBA 1DJQA 3QSTA 3W85A 3L9CA 1R47A 1PHWA 3PBWA 4YCPA 3R13A 1JQXA 3THQA 2P1FA 8TIMA 5FF3A 4ZL1A 5CSRA 3HGSA 3SJ3A 4H3DA 4Y90A 2CLEA 4O13A 3M47A 4PH6A 1A5BA 4WY0F 4XTDA 4AHQA 2EKCA 2NUYA 1ZCOA 3CQ0A 3YPIA 4LVAA 1GQNA 5KZEA 1LRTA 5AC8A 1G4PA 2QJGA 4FNPA 3MI6A 4MY9A 4OT7A 1KFCA 3TCEA 4POCA 3QMTA 1KTCA 5AHIA 3A22A 2A6NA 1O94A 2GJNA 1B9BA 3G1AA 3P7YA 2R91A 4B5NA 1GVSA 3N19B 1I8JA 4IXHA 3M9YA 3RK8A 1PCKA 4Z1BA 1OJXA 1VHNA 4HSOA 4JYDA 3PWAA 4KWVA 3VCRA 5GVJA 4EF8A 4JTKA 3C8FA 3SY5A 3HG2A 2A7NA 3NG3A 1I2RA 1GVRA 5HJLA 3TAKA 4HNNA 4O1AA 1ZFJA 4MJZA 2PURA 1B4KA 1R2TA 2PRHA 2CFFA 3LOTA 1LTDA 3UPBA 4UTMA 2OX1A 5A8GA 4C1KA 5CG7A 1OFOA 1KA9F 2ZZ7A 3QPZA 1GVFA 1SZGA 4LU0A 4NX5A 3UWWA 3P8IA 3TK7A 4N9DA 4U28A 3R12A 1LRNA 5EKYA 1WBJA 2DZXA 4Y96A 2EHHA 4XKYB 4HT3A 3LRMA 4JDYA 3T4CA 2QCCA 3RNDA 3NZRA 3MWAA 1OK6A 4DO5A 3G0XA 1MEWA 3Q37A 3KX6A 3G3MA 4M5PA 5LZLA 2PRMA 4S1FA 4DELA 1JRCA 3BG5A 3S0CA 2CLHA 1GWJA 5BOOA 5F4XA 3M1ZA 3BLFA 5K9DA 4ZQMA 1M7OA 4FO4A 2ZRYA 2P0OA 4LRTA 1H7NA 1LBFA 3C56A 1PL9A 4XZ9A 3F4WA 1GJPA 3LXBA 3G24A 3QSRA 1VCVA 4QSHA 1FDYA 3BPWA 1KFEA 2H6RA 3NA8A 3W2LA 1CI1A 1W54A 3LXAA 2QCDA 3BGJA 1JULA 4UTWA 3PSWA 5BW6A 5BMWA 4CQ8A 2XFWA 2FB2A 4Q4KA 4M6VA 4NJHA 5C5YA 1JCMP 4LC8A 1P0NA 3M5ZA 1SZFA 5J5DA 3LM7A 1PIIA 4FX6M 3O6CA 1EIXA 2VELA 1AL7A 1W5NA 3JRKA 3CTLA 1FWTA 1MZHA 3NQDA 1H62A 3BG3A 4M7SA 4DPQA 3RF9A 1JCXA 4IUOA 4NNCA 2E5DA 3I7QA 3BW3A 3L66A 1IXPA 4OV9A 5CKSA 1UCWA 2JKAA 2CLIA 4GJ1A 2Z0IA 1BEUA 1HG3A 1TV7A 1XI3A 3KAOA 3PULA 5IM51 2A5HA 4MPQA 3TH6A 4WJEA 1QWGA 1LORA 2GQ9A 5I3FA 1A5SA 2QCMA 2R8WA 1QPRA 3P8JA 3SGUA 2DZWA 4ZMGA 2G96A 3STGA 1LCOA 3G8EA 1GZGA 3A23A 2WJZA 2ISVA 2VFFA 4UMBA 2CLFA 1G4EA 2P10A 4MFDA 1LLWA 2QUTA 1XFBA 4N4QA 1Q6RA 2ZZ3A 3CHVA 3CC1A 3EKLA 3M5YA 2VFIA 4MOZA 3PBYA 1XL9A 4O14A 2QAPA 4XUGA 4PL1A 1MEIA 4JY8A 1S5TA 2ALDA 1LP6A 3LCXA 2RKXA 4UTJA 1ALDA 4UTHA 4IX0A 5L6UA 3A5VA 3TX9A 3O6DA 3TNOA 4ZQNA 5CZSA 3SZ8A 1H50A 1TPWA 4TIMA 2FPVA 3HIJA 1H7PA 1EX5A 5F1UA 1THFD 3GAKA 1T0OA 3GZ3A 2Z6JA 4RZ6A 1YPFA 1Q3NA 4UFLA 4BF9A 4AWTA 1C9DA 2A21A 2NXGA 4LC6A 4ADTA 1NVMA 4PODA 3ABOA 3NQ6A 3BLIA 3CPRA 1SSDA 3O06A 3W86A 3QYQA 3MYOA 3GYEA 1GVQA 3LCFA 3NPUA 1F7BA 4FEZA 5D32A 4L4MA 1DL3A 1O95A 1FX6A 3W1UA 5KZMA 3HBLA 2C15A 4HPXA 3TQKA 3U8GA 5LNSA 1AW5A 3DHDA 3WK2A 3QZEA 2V8ZA 2WQPA 5DCEA 1SO5A 5EYWA 1I45A 1H61A 3N34A 3VKJA 3LB0A 1YTEA 4N02A 3SIZA 5FEWA 3LXCA 2IQTA 1T8XA 2QDGA 3M43A 1UB3A 2I1OA 4PFMA 3CB8A 3W7JA 3GVGA 3KRSA 3O1NA 2J24A 4FNRA 1LROA 1XDMA 3DI0A 1S5WA 2QUUA 3FOKA 1C29A 1NFBA 3E02A 1DBTA 1JUKA 1LOQA 3TC7A 2PE4A 4JGDA 1JCNA 4GWEA 3ZWTA 2W0UA 3UYCA 4HSNA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3ABRA

Total Genus

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Chain Sequence

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