3ABS | Genus

Total Genus 188

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	188
sequence length	453
structure length	453
Chain Sequence	MKLKTTLFGNVYQFKDVKEVLAKANELRSGDVLAGVAAASSQERVAAKQVLSEMTVADIRNNPVIAYEDDCVTRLIQDDVNETAYNQIKNWSISELREYVLSDETSVDDIAFTRKGLTSEVVAAVAKICSNADLIYGAKKMPVIKKANTTIGIPGTFSARLQPNDTRDDVQSIAAQIYEGLSFGVGDAVIGVNPVTDDVENLSRVLDTIYGVIDKFNIPTQGCVLAHVTTQIEAIRRGAPGGLIFQSICGSEKGLKEFGVELAMLDEARAVGAEFNRIAGENCLYFETGQGSALSAGANFGADQVTMEARNYGLARHYDPFIVNTVVGFIGPEYLYNDRQIIRAGLEDHFMGKLSGISMGCDCCYTNHADADQNLNENLMILLATAGCNYIMGMPLGDDIMLNYQTTAFHDTATVRQLLNLRPSPEFERWLESMGIMANGRLTKRAGDPSLFF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystal structures of ethanolamine ammonia-lyase complexed with coenzyme B12 analogs and substrates. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain
molecule tags	Lyase
source organism	Escherichia coli
total genus	188
structure length	453
sequence length	453
chains with identical sequence	C
ec nomenclature	ec 4.3.1.7: Ethanolamine ammonia-lyase.
pdb deposition date	2009-12-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF06751	EutB	Ethanolamine ammonia lyase large subunit (EutB)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.220.70	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Annexin V; domain 1	lyase	3absA02
2.30.170.30	Mainly Beta	Roll	Ribosomal Protein L24e; Chain: T;	ethanolamine ammonia-lyase heavy chain domain like	3absA01
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3absA03

3RFAA 5CPLA 1GEQA 5KITA 3MWAA 2ZRUA 3NDOA 3UWZA 1N7KA 2CFFA 3UZ5A 3PY2A 1P0KA 3OVRA 3M47A 3MBDA 3SR7A 3NZRA 3ABSA 1EIXA 3PUEA 4IMGA 1FCBA 3LB0A 4CCDA 3NNTA 2H3BA 3DBPA 2NXIA 1XBXA 3P60A 4JTSA 3O6DA 3MHFA 4YCPA 1O95A 2JGYA 3ZWSA 1OFQA 2WPBA 4IMDA 3G1HA 4HIBA 2R14A 1OYCA 3S8HA 1OABA 1SFJA 3CU2A 5KZMA 3TX9A 4RXGA 4ZQOA 1KM5A 2Y63A 4TIMA 3E96A 4WX2A 1A5SA 4PH6A 2JBMA 1L2UA 2FFCA 1XCFA 3TQKA 5C5YA 3JR2A 3L0GA 3SFKA 4HKPA 1H1ZA 1VH7A 4NVTA 1NEYA 2HS6A 3C4UA 5FF3A 2ZRZA 3UY8A 1C29A 3BGJA 1YXCA 5IM51 3LDVA 3H54A 2ABBA 4O18A 2YDAA 1PHWA 3C6CA 3VI2A 1DKWA 5G5IA 3A22A 1ML1A 3SGZA 3QW4B 1DQWA 2ZZ7A 5C6MA 1VRDA 5I3FA 4A29A 2X1RA 2QUVA 3BGGA 4K7VA 1QOPA 3W1UA 5IBXC 2Z6IA 4H3DA 4E2BA 1GVFA 5K9CA 3W1LA 1O60A 3TFXA 1D9EA 1W5NA 3TK7A 4IMEA 4ONVA 2VC6A 1K7XA 5TIMA 4CLMA 2Z6JA 3GK0A 4JEQA 5FESA 3VE9A 1W56A 5DBUA 3C3NA 2ZQ0A 1T8XA 5HULA 3F4NA 4NQ1A 1I2RA 4LV4A 2E68A 2G96A 4MLRA 4U28A 1AW5A 3N9SA 5F2MA 3QMSA 4OT7A 3HJZA 1IXNA 3QQ0A 1M5WA 3EX4A 1KM4A 5FF4A 4DPPA 1FDJA 1LRQA 4DEFA 4NU7A 3GDRA 3QEZA 3CPRA 3GLCA 4FF7A 3STFA 1KM6A 1JQVA 1OHLA 2A4AA 1OX4A 3TSMA 3V75A 3PB0A 3USBA 3RLVA 3NL2A 3HPZA 4UTKA 3NM3A 1AMKA 2CLLA 2QDHA 4ZQCA 5I3JA 2OX1A 4NX5A 3TAOA 3NXFA 2CW6A 4WJEA 2VFFA 5C55A 4GJ1A 3W7IA 1U5JA 2YXGA 1EP1A 2R91A 3GKFA 3OHIA 4OU1A 3NPUA 2DP3A 1OF6A 1VC4A 1OJXA 3LV5A 4NJGA 2BX7A 1OG0A 3C2RA 4FNQA 2VFGA 1BEUA 4CQ9A 2GJLA 4UMBA 1DJQA 2YX0A 3TIMA 1G4TA 4RV8A 2G5WA 4GNJA 4BWLC 1TPVA 5G2HA 1H60A 1MEWA 3M5ZA 3MYPA 3SGUA 2ZZ2A 5DLCA 4PODA 5HWNA 1U83A 1OF8A 5LNRA 2RKXA 4A21A 5HR6A 4LRTA 2D73A 3Q94A 4Z0JA 2QR6A 3T78A 2EHHA 1CW2A 2CWNA 4FO4A 5DY3A 3LLDA 4MIMA 3W2UA 3NEVA 1W8SA 5BMWA 4QM1A 2NUXA 3CC1A 2ZZ3A 3B0PA 1R47A 3GB6A 2VFIA 5HUOA 2A6NA 3LX9A 3IGSA 3QFEA 4JR5A 3QYQA 3LCWA 4LWWA 5DN1A 3ABRA 1FWRA 1N8FA 1LBMA 1ZALA 3W71A 1GTHA 1R2TA 1FDZA 3W76A 4RZ5A 4Y96A 2KZHA 3SZ8A 4GFSA 3MUXA 3N9RA 1AK5A 3QMRA 2C13A 3P61A 5AYXA 1LORA 3NQFA 4LW7A 3QH2A 1I2PA 4UTJA 4O4WA 1QPOA 1X1ZA 3DAQA 3QM3A 3NQ7A 2YYUA 4DO6A 3DHFA 1DORA 1S5VA 3SW6A 4PA8A 4FXSA 5F2GA 4HT3A 4IXHA 2C16A 5KZDA 3LCIA 3LTYA 3M9YA 1ZNNA 2CZEA 4H6KA 4M19A 5HINA 1XKYA 4YXGA 3KRZA 5D09A 4RCXA 4JTJA 3W84A 3G18A 2NWSA 4ICNA 3KHJA 3R2GA 1FCVA 1B9BA 2VFHA 1VLWA 2CU0A 2FLIA 1ZCOA 3IIXA 4UMAA 3W1AA 2OT1A 2Y85A 3PBUA 3GKAA 3GR8A 1JUBA 1RPXA 1QPQA 3NQGA 2FB2A 4JD4A 3W7DA 4E0CA 1IXQA 3M41A 4QITA 2ATSA 5AHMA 3BLIA 5CSRA 1LLZA 2GQ9A 1L6YA 3M5YA 1GVSA 4R53A 3PBYA 2J88A 3QRHA 3PVFA 4IPJA 1LLWA 4UFHA 1G4SA 4NT0A 3ZFHA 5F4WA 2VEMA 4WY0A 2FTPA 4TMBA 3O63A 4GC4A 4GRSA 5D2YA 3S42A 3UWVA 4UFMA 2ZTJA 3UPWA 3W1QA 2J6XA 3T4CA 1OX4B 1L9WA 1BTMA 2NV1A 2NX3A 5CPOA 2QJHA 2A7RA 2DZWA 3P8JA 4OV4A 4IOTA 1GT8A 3DI1A 1QPNA 2HTMA 4LT9A 1XDMA 3W22A 2PE4A 1XI3A 3B04A 4L4LA 3W1RA 4PL1A 1B57A 3HIJA 4LNYA 3G8RA 4MUZA 4HNNA 3MO7A 3IVSA 4JIPA 4JNMA 1LOSA 2JGQA 1XFBA 3L9CA 5J5DA 1G4PA 3U2OA 1O5KA 2VENA 3WK1A 4IMFA 2ZZ1A 3GXNA 3SECA 3M0ZA 1VPXA 4LUIA 2B7OA 3G1DA 4UUIA 1F74A 2XN0A 4PEKA 3HGOA 3LHYA 3IV3A 1KFJA 1DJNA 1OFRA 4FEZA 5MHBA 3G1YA 4JICA 4O12A 3B8DA 4JYDA 1VYSX 1XXXA 1M6JA 4JTFA 1FUYA 1Q3NA 3NQ2A 2V2HA 3G3MA 3KVKA 3NG3A 2QDGA 4I7UA 3EX1A 2V8ZA 3FKKA 1ZAJA 2WSYA 2YW4A 1BKSA 1TPDA 1YTEA 3QPYA 3G8EA 1TQXA 3W7HA 1B3OA 3BARA 3P8IA 3PUOA 3MMTA 4M6QA 1R30A 1JCNA 3R89A 1FXQA 1YADA 1I2NA 2EGZA 2E5CA 3W7NA 1PV8A 1H50A 4QQ3A 3M5XA 2ZRXA 3B05A 4LTSA 1TB3A 5IBXA 3TC6A 1V5XA 4FNPA 1GG0A 5I3KA 1GJPA 3DGRA 4EIVA 3DENA 1EX5A 4UFKA 1E51A 3CHVA 2ZCGA 1S5WA 4JGDA 3WK0A 4RR4A 4AF0B 1TPC1 3W86A 2TYSA 3QW3A 4W9TA 4OV9A 3O6CA 4K39A 2BLEA 2QAFA 4LV9A 2ISWA 4RJEA 3FYPA 4DF1A 4UTHA 5EKYA 4B5NA 4QISA 3TJLA 3UWUA 1KBJA 3EWXA 1F6KA 3G22A 5BRBA 1LYXA 2B7NA 1YXDA 3TMQA 1C8VA 2V5BA 3C56A 3BW4A 4ML9A 4AHOA 1KLZA 3W7RA 1G7UA 4QNEA 3R12A 4HPXA 3F03K 2C19A 5L9FA 1FWNA 1BWLA 3KVMA 1X1OA 3JRKA 3NQ6A 3NQMA 4LS0A 5CG7A 1LTDA 2VEIA 3S5OA 4Q32A 1SW0A 1EUNA 4LUJA 4CCEA 4Z1DA 6TIMA 5U4NA 1G67A 4M6PA 4CNNA 4NZJA 1IIHA 1I2OA 3NZ1A 1T99A 3EX6A 4JS3A 4JX5A 1DHPA 1Q6RA 1YDOA 2ZA3A 4ZQNA 4Z1CA 3W1PA 3R5EA 4A2SA 2Y62A 3PULA 1LRTA 3IEBA 4ZVJA 4RZ4A 5EYWA 2XN2A 1WDWA 3GXPA 1WX0A 2DZXA 3I68A 3TFCA 3L66A 3N2XA 4XKYB 4O54A 3PBWA 1T96A 1VYRA 1PE1A 4EF9A 3B0UX 1RD5A 1RVGA 3GAYA 5SWUA 3PC0A 3FLUA 4RKAA 3THAA 5TQLA 4NNCA 4KFPA 3I7QA 5DXXA 1OX6A 5AYYA 4N2YA 3P5YA 4O17A 3PS7A 1YTDA 1SZFA 2TSYA 3W7GA 2QEZA 4CQAA 1K3UA 4NNBA 1QO5A 3FIGA 1TPUA 3QMTA 1G6CA 5EMUA 3AO0A 4PTNA 1TV5A 1WA3A 2B7QA 3GDTA 1EP2A 2Y7GA 4FIRA 4EVZA 4UTLA 1ZAIA 1RZMA 1FQ0A 4XBKA 1ZHAA 4E2DA 3LERA 1X7FA 5EL1A 4MLJA 5AYZA 1TRIA 3TMLA 1FWSA 4NNAA 1I4NA 4GXMA 3PM6A 3EXRA 3QSTA 1QFEA 1M7OA 3E12A 5DCBA 1J4EA 5FF7A 3HOJA 3U8GA 5KSWA 3CWNA 4HNTA 2ZYFA 3NQDA 5CPNA 2E6YA 3S1WA 3EB2A 1Z48A 2ZRYA 1ICQA 3L2IA 1GYLA 3W83A 3G0XA 1FBAA 1H63A 1QPRA 1J5TA 4R33A 3TQVA 3IIZA 3TE9A 3P81A 4UXDA 3W87A 1KTBA 3BG3A 2QCCA 2TRSA 1M7PA 5AHFA 3EWBX 4TO8A 3FYOA 3LLFA 1KA9F 1FWWA 4BK9A 4UTTC 2V9DA 1F76A 4NX0A 3FJ6A 4MOZA 1XL9A 3TUUA 3L68A 2G95A 4FNTA 3C2FA 5DCDA 1ADOA 3LHTA 2AAMA 4GUGA 1SO4A 2V0TA 1A5CA 2P1FA 3W72A 3TA6A 3GNNA 1HO1A 3STGA 2QUTA 1O5XA 1LDCA 3NVTA 5D38A 2JKEA 1P4CA 2V82A 5E93A 3G1XA 3GDKA 5KZEA 5D03A 2V81A 4N6FA 5HWJA 2A5HA 3BG5A 1UUOA 3WJZA 2C3ZA 2W6RA 5G2WA 5A8GA 2H3DA 3W85A 2R94A 3M44A 4AVFA 2P10A 3Q37A 4S2BA 4IPIA 4UTWC 3TH6A 1X8FA 2F7FA 2H90A 1W0MA 3TJXA 5FF2A 3PUDA 3LTSA 4N9EA 3LHWA 4GUHA 2A21A 4LS2A 1SQ7A 1LOLA 3MP5A 5KINA 3T40A 1WAUA 2RHGA 1VLIA 3DFOA 4WOZA 3YPIA 1JUEA 4NJJA 1SR9A 2X1TA 1VHNA 3NPXA 1B4EA 2FPVA 2O7QA 3DZ1A 2FIQA 5KMYA 4MVAA 1GYNA 2WKJA 2Y89A 4UCGA 3T44A 3W70A 2E5BA 1NFBA 3LBMA 3ZR4A 3G1FA 4FX7A 3VCRA 2Q8ZA 1V7YA 5TBOA 2QAPA 2ZFAA 2I9EA 3BLEA 5H2ZA 1MXSA 3L5AA 3DXIA 3LXBA 2QCFA 3WFAA 4Z1AA 4AEOA 4YL2A 3HPSA 1K8ZA 3S5NA 1EB3A 1SO6A 3MW7A 1R2SA 2NV2A 3A23A 3L65A 5I3HA 1XUZA 4OE7A 2WJZA 1H7XA 1K03A 3D0CA 3P62A 1OFBA 1YYAA 4I7VA 5AB3A 4N4PA 1O4UA 4BF9A 2VKZG 5E0KA 5G4WA 3U6WA 5D05A 5D2VA 3W07A 3N2MA 3NQ8A 1HL2A 1LBLA 4UFJA 1TSIA 1ZENA 2A7PA 2OCZA 5A5WA 2YW3A 5KTLA 4XTIA 1MO0A 1KBIA 4TMCA 3GNDA 3E02A 1TPWA 4X2RA 3A24A 4GBUA 3VNDA 2YZRA 1KFBA 2RDWA 1A53A 3A5VA 1FCQA 3S1VA 3O05A 2TPSA 3O15A 2WV8A 1G7VA 2AQWA 2NX1A 1GVOA 4ZZ9A 1H51A 5LSMA 1TYGA 3IGXA 2E1DA 3MHGA 4HNVA 3SSJA 4XWUA 4Q4KA 3TC7A 2Y70A 3IGUA 3ABQA 1HUVA 3DKJA 4IJBA 2E6AA 5GVJA 3LCXA 5CZSA 4LOCA 1TTQA 3ZS4A 2VOMA 1KFCA 3LCFA 5K7JA 5LNWA 4MY8A 4EWND 2A0NA 3LXAA 3P80A 4QIUA 1RQBA 5FF0A 1K8YA 7TIMA 1Q6OA 1XBZA 3FKRA 1Q45A 1WV2A 3UYCA 3N3MA 1HG3A 1KLYA 2C1HA 4AH7A 2H8ZA 3UZJA 4JTLA 1X6UA 1TPFA 2RDUA 3RF9A 1QR7A 2I14A 5LGZA 3S9YA 2EKCA 2GPTA 4HHPA 1PCKA 1JR1A 1AG1O 1TQJA 4PCFA 4ZQPA 4O10A 3W2MA 4PL2A 3MJYA 1YTKA 4Y6GA 4AWUA 4QSHA 3OBKA 3LGEA 4TX9A 1I2QA 5FI8A 2PC4A 3TQ0A 3RMJA 3O1NA 3SI9A 1A5BA 3GYEA 3BPWA 1J2WA 2GJNA 1DV7A 1MEIA 2G97A 4O1CA 1O94A 4HSNA 4AF0A 1TV7A 3ZWTA 4BI7A 1ICSA 1ZAHA 3UWQA 4Y90A 3TCEA 4AAJA 2Z2UA 4KWWA 4I9AA 2OJPA 3CWOX 3TSBA 4JTHA 3W1MA 5LNSA 1LM1A 3LRMA 2W79A 1K7EA 2WNQA 5HQEA 5AHNA 4FXRA 3N34A 3HMJG 4JTIA 1LOQA 1AL8A 4UTUA 3C8FA 1KW1A 4O13A 2P0OA 3GDMA 3QPZA 4UFLA 3S5ZA 4KFNA 4PFMA 1FXPA 3W7PA 3K30A 4ZQMA 1F73A 3AJXA 3HPXA 4UC5A 1SZGA 1ONRA 2H8XA 1H5YA 1YPIA 4S2CA 2QF7A 5CZ0A 1GWJA 4O1AA 3LXCA 4DO5A 1UCWA 2V30A 1DVJA 3QF0A 3NPVA 5EA9A 3W7EA 1OK6A 3GXTA 3DFPA 5G1YA 1UUMA 2XN1A 1TPH1 4O0KA 2OZ0A 3CEPA 3W7OA 1IF2A 4MPQA 4L4MA 3Q58A 1VCGA 1HFBA 4XKYA 2X16A 3STEA 3DHDA 1SSGA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3ABSA

Total Genus

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