3NL2A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
539
structure length
505
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGVTLVQIREKDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGPDMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPDMVDYIGVGTLFPTMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSTKNSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGSATETRLLLNNKLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSKGTNGTSVEDIPCVAVEAGPIGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
molecule tags Transferase
source organism Candida glabrata
total genus 166
structure length 505
sequence length 539
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nl2A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nl2A02
1KV8A 2YDAA 4LV4A 5K3VA 4C5LA 5F0ZA 1HFBA 3G0SA 2QJGA 4UTTC 4JX6A 1JCXA 2A5HA 5HWNA 1KTCA 1WV2A 4UTTA 2GJLA 6ALDA 4K7VA 2ZBTA 3GYEA 4BR1A 3OHIA 4Y96A 4IPIA 2ZRZA 4O15A 3NZRA 3C8FA 2C18A 4KFOA 4AF0B 2X1RA 3DENA 1GG0A 4AH7A 3QSRA 1W1ZA 1DBTA 4Q4KA 4O8RA 1BWKA 3EWZA 4XTIA 3L5LA 4AWSA 2PC4A 4Y9AA 4TMBA 3A24A 1SW7A 5E0KA 1Q6RA 4Z08A 1FCBA 1W56A 1T99A 3H53A 4N6EA 4LTSA 5FEZA 5AHEA 3O6YX 1UA4A 2QUUA 3M5YA 1EUAA 4MY1A 3UY7A 2B7PA 3M16A 4XKYB 2ALDA 4DPPA 4I7WA 4UFIA 1GOXA 1I2RA 3Q37A 4UTIA 1PCKA 5G2WA 5DCEA 2VC6A 2JBMA 4AWUA 4ZQOA 2P0OA 2FLIA 3GDMA 3IEBA 4MIMA 1LHPA 4B8SA 1KA9F 2BWGA 1NEYA 2PRLA 4O1GA 3EKLA 1OFPA 2CLOA 3IIVA 5CZSA 1O60A 4RCXA 3WK0A 1KM4A 4LVFA 1IXNA 3RSGA 1QO2A 3HGOA 2JGQA 2C13A 4LS0A 3W71A 1FX6A 2FPTA 4UUIA 3ANYA 4LY8A 4ZMGA 4LC8A 1LRNA 3ZFHA 1ML1A 3W2UA 3WK1A 3EX4A 4TO8A 1A5CA 5LGXA 1SSGA 2HQQA 1LP6A 1F2JA 1EX5A 4DO5A 1G6CA 3DHDA 1PL9A 3LBMA 3KAOA 4JR5A 3G1DA 5BYFA 3BG5A 3HB9A 2J6XA 1FWTA 1WA3A 1R2TA 3IIXA 5DCBA 4YWRA 4B8RA 5FF7A 4CQ9A 4GE8A 5DELA 1JQXA 4UXDA 4AMAA 3S8HA 3W88A 4C1KA 2CZDA 5C2XA 2I6BA 3IQ0A 3F03K 4ZZ9A 3HMJG 4OGZA 4NJJA 1W3TA 1TSIA 4R7JA 1HL2A 1VPXA 3EWWA 5EY5A 3MW7A 1Q6QA 1L2UA 2ZRVA 2A0NA 4O16A 1SR9A 4PTNA 1RK2A 4EBUA 1RQEA 4YXGA 2XN0A 3F4NA 4PVVA 1YXYA 2CW6A 3V75A 3UD6A 3S9YA 4I7VA 1R2RA 1VCVA 4DU5A 4K9IA 4DF0A 2YFNA 4Z1BA 1HO1A 4NU7A 2HS6A 3MI3A 2OX1A 4UTLA 1SSDA 4GBUA 2DZXA 3B1OA 3VCRA 5F4SA 2WV8A 3GIYA 3KOFA 3L9CA 3MBJA 5U4NA 2CZEA 3W4SA 5DLCA 3FKRA 4MY9A 2QCEA 1FQ0A 1H61A 4JTHA 3R8RA 3O05A 3W23A 4A2SA 3TC6A 3L21A 1TQJA 3EWMA 3R2GA 4LS2A 5CPLA 3RO4A 5TIMA 3TA6A 2RHGA 3KX6A 1SQ7A 1EP1A 3H54A 3NBWA 1XL9A 1TB3A 3QMTA 1GVFA 3B3LA 2FDSA 2RKXA 3TROA 4LC4A 4A21A 1K02A 3HPDA 1KYHA 4O4VA 3W9ZA 1QPOA 4S1HA 3NZ1A 2NZLA 1W31A 1VRDA 1KW1A 3ABRA 1SW3A 3TJLA 2DCNA 1LIJA 1EUNA 1TV8A 1Z44A 4K37A 1ICSA 2F7FA 3LTYA 3UQ9A 1LORA 1LDCA 4LRTA 1VHCA 4NNBA 3MHUA 3A23A 2VOMA 3MMTA 3NAVA 4MZYA 3O6CA 4Y6GA 4AHOA 3W74A 2ZA2A 2WSRA 5HINA 3LDVA 5DY3A 3CEUA 1D3HA 3RQQA 5BOOA 3RU3A 4YCPA 3AO0A 4IXXA 2YGYA 2QKFA 2A6NA 2NV2A 5AN7A 2Y88A 3P84A 3PUDA 4BI5A 4JTIA 1FXPA 4D2JA 2FPVA 3L0KA 2AX3A 3I65A 1OF8A 2NUXA 3L2IA 4JXCA 4FNPA 1JRCA 2ABAA 2AB8A 3KRZA 1PV8A 1TJRA 5BYCA 5F11A 5BRBA 1TTQA 3TSMA 3PSVA 4RXGA 4K8EA 1Z48A 3P7YA 3S6DA 2YSWA 5D2WA 2B7NA 3MYPA 3RREA 2PE4A 4XBSA 5D03A 5D2VA 2HLZA 3QAIA 1SO3A 3DFNA 1SUXA 1V7YA 7TIMA 3N73A 3LRKA 4UIOA 4IGHA 4WOQA 1O5KA 3W7IA 4MY8A 1VJIA 3G8RA 2CZ5A 1GWJA 2RDUA 2B4GA 3EXSA 3PUEA 3IV3A 4E8ZA 4BF9A 4O0KA 4UTUA 1J2WA 3LI0A 3NL6A 1YTEA 4RV8A 4XQ6A 1FWNA 3P82A 4OHQA 3BLEA 4JTSA 4N9CA 1KTBA 4H3DA 3G8EA 1HTIA 4MYAA 1H1YA 4NJGA 3WJYA 1OG0A 3N2MA 5D2XA 2I6AA 4DC3A 2PRHA 2VXNA 4JIQA 1KFEA 1OX5A 1IF2A 3CM4A 3BVJA 3T40A 5FF0A 4K36A 2ZFAA 3LTSA 3L65A 1JUBA 3L0GA 3NNTA 4Z0JA 1TO3A 3W7PA 3ZR4A 1SZGA 3TNOA 4W9TA 1W0MA 5AHFA 1NF7A 3RK8A 4JNMA 4NXSA 1TZ6A 1EIXA 1WQ5A 3MYOA 3LOOA 1G69A 1QOPA 3UZ5A 4N6FA 1PCWA 1X1OA 3TE9A 2VEPA 3C6CA 5C40A 4JIPA 1YGJA 4O53A 1FWWA 2B7OA 2NWRA 5DCDA 3W87A 1TREA 3W7HA 4O1LA 3W1PA 2E1DA 3G1HA 1KLYA 3M5XA 4UNKA 3ZWSA 4RK8A 4GWEA 4N9BA 1TTIA 3CIWA 3I7SA 4IUOA 2DZPA 4DELA 1T0OA 2WO5A 3PY2A 5K4XA 1FXQA 4GUGA 1YPFA 3PG8A 1WXJA 2F02A 1TQXA 4UFHA 4GC4A 3RM5A 3FYPA 1WOAA 2H3DA 3RQ2A 3RRBA 3UBOA 4MOZA 2XN1A 4ICNA 1U2XA 4K8TA 4FX7A 4KADA 3UNDA 5K9CA 1KBIA 1L6YA 4O11A 3UQEA 3IVUA 3EWYA 3TFXA 1OYCA 5KITA 1N7KA 2E09A 1EKKA 1RR2A 4I7UA 1RKSA 3W73A 1K8XA 2JKAA 2Y7EA 2NLIA 5BNKA 1TPB1 3M47A 3PG9A 1RQBA 3DFQA 3RSSA 3W2KA 4JTKA 4UTMA 3RT7A 3LBCA 1VM7A 1YDOA 4O52A 3R89A 3GZ3A 3MJYA 4TR9A 1GQNA 3G18A 1TJPA 5D09A 2A9ZA 3GXTA 3DBPA 2EHHA 3C52A 5SWUA 5FEPA 2Q3RA 1OX4B 3I68A 2OMAA 2WNQA 3RTBA 1ZY9A 3NGJA 1DQWA 2VEKA 4E8YA 3QF0A 1SW0A 4E3AA 1LYXA 3G1XA 3S5NA 4C5JA 4JKSA 5AC6A 3OEXA 5LHFA 3IIPA 2WSQA 2YZRA 5C41A 4GJ1A 1Z42A 3CQDA 4LUJA 5CSSA 1EEPA 3TQVA 3RTGA 1F7BA 3NG3A 2I1OA 2QDHA 4K8HA 2AAMA 3MP4A 4KANA 1F6KA 4JYEA 3FA5A 4M7TA 4R53A 4ADUA 1ESJA 3W84A 4A29A 1SPQA 1TPVA 3QRHA 3B0VC 3RTAA 1CW2A 1FDZA 4IX0A 5D38A 3T4CA 3I7RA 4XBKA 3KZHA 3RQHA 1W5NA 2Y7DA 4QISA 1JVNA 1VQTA 2QAFA 2GQ9A 3TSDA 3LHVA 2AJRA 2A4AA 4ZQPA 5HR6A 1XBYA 3VE9A 4AHQA 1U5JA 1W37A 4NX5A 4XF7A 2QCDA 1QOQA 2V2DA 1V1SA 4LC6A 3M5ZA 4CQ8A 3VE7A 2DZTA 2FTPA 5FF2A 3B0UX 2NV1A 3LXAA 4JDYA 4GUHA 4PA8A 3GO6A 3BGKA 3TMQA 3KXQA 3CHVA 1GVRA 4NNAA 2TYSA 1KM3A 5FEXA 4O50A 5F4XA 1EWEA 1QAPA 1TV7A 3M43A 2DDMA 3LCLA 1LRQA 3E49A 2CU0A 3BPWA 3HGJA 1H1ZA 5LNWA 1K7FA 3FIGA 5LNUA 4KFPA 1ZENA 3NQEA 1ZCOA 1F74A 4NT0A 5LSMA 2C3ZA 4N2YA 1ESQA 3IE7A 2JG5A 1A5SA 4CCDA 4JTEA 1LBLA 4M6QA 5T26A 3VASA 3LXBA 4U28A 4OU1A 3NQAA 4BI6A 1PIIA 5C55A 3B03A 1WBHA 2EGZA 1X1ZA 4DQWA 3O1NA 1ZHAA 3K5WA 2H8ZA 3VKJA 1IXQA 1HO4A 4LVGA 3LCXA 4N9EA 2VARA 3Q2DA 5D2TA 1S5TA 3SW6A 3SSJA 3PB2A 4O28A 1VCGA 3RRFA 4P61A 3KVMA 1J4EA 1I2PA 1TIMA 3CPRA 3GKFA 3INPA 5E93A 3NYZA 4CCCA 1OFRA 3TDFA 3DFOA 3KVJA 1HUVA 2DZSA 3BG3A 5AHLA 4C1LA 4HN4A 2ZZ6A 3KHJA 3LX9A 1X7FA 3EKZA 3IGXA 1NSJA 2O7SA 5E1QA 3K30A 4CQAA 1ME8A 3P8IA 5CPMA 1M6JA 1AL7A 2A2IA 4IPJA 3PBYA 3R13A 4WXYA 2ZCGA 4Q33A 3GO7A 5F2GA 1A50A 1VC4A 4EUMA 2DJXA 1QCWA 4OQVA 3A9IA 1K8ZA 4RX0A 1N55A 3LCIA 1LM1A 4H6KA 1VK4A 2DP3A 3RQXA 1ZJIA 2VEIA 4QITA 5G1YA 2V9DA 1SFLA 4DXVA 4LBGA 4QJ1A 2OT1A 4J9JA 3B06A 4JTGA 2AGKA 2RFGA 1UBSA 3FJ6A 3JULA 3RPZA 3NQ6A 3DHFA 3CIXA 1WAUA 3NQDA 1B3OA 4ZQMA 3HF3A 1W8SA 3NQ2A 4WD0A 3NPVA 2X30A 4WX2A 2C4EA 1L9WA 1B4KA 1FCVA 2HMCA 1JJKA 1GZGA 4O18A 5BMXA 2DORA 3RS8A 4UR8A 2GQAA 2J9XA 5FI8A 4NZJA 2YXGA 3W83A 1M5WA 2J24A 2A21A 5AYXA 1QPRA 1RD5A 1L6WA 1RPXA 1ME7A 1J5TA 1YYAA 2J9ZA 1XDLA 3SFKA 3C2VA 5KINA 3TW6A 2QHPA 1DHPA 3HBLA 4QAIA 4FXSA 3BGJA 4TX9A 2RBCA 5FESA 1I8JA 4LNYA 1VH7A 2ZRXA 3E0IA 3WJZA 3PZSA 3DKLA 2I9EA 5K9DA 3N19B 4GNJA 1NFBA 4S1IB 1TTPA 1H7OA 1XCFA 2G5WA 4LVBA 1KLZA 3RLUA 3UYCA 4QIUA 5G1TA 4PH6A 4PL2A 3MI2A 3EWUA 3SIZA 2R8WA 2B0MA 3PB0A 3C2RA 3S1VA 1GEQA 2WJZA 4JTFA 2J9YA 2VFDA 1KV5A 1LIOA 3NQ7A 2TMDA 5EA9A 2F7KA 3RTEA 1AL8A 5TQLA 3NO5A 4MYXA 2EAWA 3STFA 4JKUA 3S1XA 3IRDA 1ALDA 2EKCA 5I3FA 3NQFA 2BTMA 2B7QA 1FDJA 1TRDA 4UNLA 4IX2A 1L2LA 1QO5A 2CLLA 2QDGA 4X22A 4WOZA 3KFTA 3QQ1A 3U8GA 5AC7A 4M19A 5AB3A 3G1YA 4EF8A 4E0CA 1AMKA 1MEHA 2DJLA 1JCYA 3TV8A 4E2BA 4WZHA 2W6RA 3W7KA 2NXGA 4NVTA 1G7UA 4YMZA 1EA0A 1YADA 3SJ3A 2ZTJA 2CLHA 1LHRA 3DAQA 3P5ZA 3HPSA 1XDMA 5LNSA 1DVJA 3G0XA 3MUXA 2X1UA 3RT9A 2NXHA 5EBUA 3QH2A 1TPDA 4ZQCA 5D30A 4RKAA 1OF6A 3CB8A 2RH9A 2FIQA 3RPHA 3NBVA 1GTHA 2NX9A 4RZ6A 3W1UA 4EIVA 3UXAA 3JS3A 1DV7A 3LCWA 4Z1DA 3DI1A 3CQ0A 3I7QA 4MKNA 4QQ3A 5L6UA 5G2IA 5F2IA 3B1NA 2YW4A 1OYAA 4WY0A 3A5VA 2A6LA 3IIOA 2ABBA 3GLCA 1YLVA 3HG4A 3W7RA 3STEA 4R33A 2QUTA 4UBEA 1KM1A 4FXRA 1OK4A 4FNTA 3BW2A 4K39A 2A9YA 3BLIA 4WJEA 4HNUA 1P4CA 4GUJA 3THQA 3R5EA 3LHUA 5C3YA 1ICQA 1ZNNA 3W85A 1MXSA 1C3QA 1WX0A 2GOUA 2W0UA 2BLEA 3GNDA 5BMWA 1RVGA 4KKXA 2QCLA 3NQVA 4AAJA 1L6SA 5HNRA 3KVKA 3WJXA 3B8DA 2Y7FA 1TTJA 3GXNA 3GBUA 1UASA 1OFBA 2YXUA 3EWBX 3PL2A 1THFD 2ZRYA 2KZHA 4LVAA 4YL2A 3TX9A 5DXXA 4JD4A 3LOTA 4CCEA 1EP3A 5D32A 4LBXA 3NQGA 4BI7A 1TPEA 2J88A 5CZ0A 4GUFA 2Z1BA 3QZEA 3O07A 3U2OA 3T44A 4IWWA 4IJBA 3L67A 3E02A 2QJHA 3PBVA 2JKEA 3FOKA 5CGEA 2G95A 1Q3NA 3RQ6A 4HNNA 1LROA 3TR2A 1ZALA 3W7OA 1WYIA 1IGSA 1H7PA 1XI3A 2X16A 4MPQA 4UMBA 3GAYA 4S1FA 3G22A 3O63A 3BV4A 2Q8ZA 2FPYA 1TZ3A 3NOEA 3LTPA 3TC7A 3GR7A 2CZFA 4HPXA 4NQ1A 1F76A 5J5DA 4FX8A 1H5YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5K3V A;  1KCL A;  3ABX A;  4Q4O A;  2QJG A;  4B2D D;  5FSE C;  1TA3 A;  4UTT C;  4JX6 A;  5I2U A;  4DWS D;  4L6H A;  4UTT A;  2ZIC A;  5D8Z A;  4IMA A;  3CQJ A;  4GFI A;  2YL5 A;  4IPI A;  4EX4 A;  4AUB A;  2P5N A;  4AF0 B;  1UIO A;  2X1R A;  3QSR A;  4EPE C;  4IIE A;  4QTG A;  1DBT A;  4XTI A;  3KL3 A;  3L5L A;  4IFK A;  3A24 A;  4Z08 A;  1Q6R A;  4PB4 A;  1FCB A;  4LCS A;  4HTB A;  1W56 A;  1F3X A;  5I77 A;  2QUU A;  4F40 A;  1EUA A;  4E3V A;  1LQ0 A;  3M16 A;  3SCN A;  2ALD A;  1RBA A;  1NWT A;  4ZST A;  4UTI A;  5G2W A;  5DCE A;  2JBM A;  2A3H A;  1HJV A;  2P0O A;  1ECQ A;  2FLI A;  3GDM A;  3WSU A;  2PI6 A;  1KA9 F;  1A0D A;  2BWG A;  2PWV A;  1S3T C;  1UP3 A;  1XSI A;  2IKI A;  3KBN A;  3UES A;  1KM4 A;  4GQB A;  3EWD A;  1UZH A;  3CWH A;  3BZG A;  3U3H A;  2FPT A;  4UUI A;  2PWU A;  3CJP A;  4ZMG A;  3QQW A;  6A3H A;  4LC8 A;  3AMG A;  3MUZ 1;  3EX4 A;  1A5C A;  3R6I A;  4PMX A;  4F8X A;  5DRI A;  1F4A A;  3N12 A;  4NZ3 A;  2QXW A;  2FZB A;  4AWE A;  4GNK B;  5BRO A;  3KAO A;  3WLR A; 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