3NL3A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
539
structure length
513
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGVTLVQIREDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGPDMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPDMVDYIGVGTLFPTLTKKNKKAPMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSTKNSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGYSATETRLLLNNKLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSKGTNGTSVEDIPCVAVEAGPGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Candida glabrata
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
total genus 164
structure length 513
sequence length 539
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nl3A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nl3A02
1KV8A 2V82A 1W5PA 4UFMA 3LOTA 5E93A 3PULA 4DO5A 1QO5A 3T4CA 3E96A 4S1HA 4LT9A 3SW6A 5BMXA 5D2TA 3OTXA 2XTBA 3A22A 1AL7A 4PH6A 3TQ0A 3P82A 4R34A 2PKFA 2FFCA 3PBYA 1NSJA 3S5OA 4S1MA 1OFEA 1TRIA 5HQEA 2A9YA 1L2UA 3FFSA 1IF2A 4M19A 3DFPA 3WJYA 5EL1A 4JTEA 1X7FA 3NBVA 3SI9A 2QDGA 1QDSA 1QNVA 1VLWA 3M44A 3C2EA 4OQVA 1M5WA 3ABRA 2G5WA 3W7NA 1H7WA 1J2WA 3UPBA 2OT1A 1TD2A 4EWND 1V19A 4EUMA 4CQ9A 1KBJA 3W76A 3W86A 3BLEA 3NVTA 2ZRVA 1RQEA 2QCCA 3B1PA 1O60A 3TAOA 1DHPA 5D33A 5CKSA 5F2MA 4DBEA 2FDSA 3K30A 3DU0A 1NF7A 3KHJA 2RFGA 1U2XA 3EXSA 3P74A 1TO3A 2YR1A 5CPOA 5TIMA 1S5VA 2C16A 2V2DA 2QCMA 1C3QA 3O6CA 2QUVA 3HMJG 1ZNNA 4K8CA 1YYAA 3BGGA 2X30A 2FLIA 1SZEA 4HN4A 1SR9A 1TMHA 3SIZA 5I3GA 1XDLA 3DENA 4K7VA 4EF8A 3S5ZA 3B3LA 3PVFA 1TQXA 5HWMA 2BXVA 4WUIA 2CWNA 1TSIA 3VE9A 4XWUA 1T8XA 4E0CA 8TIMA 3H55A 2QHPA 4PL1A 4UR8A 1H63A 1W1ZA 1JXIA 1LYXA 3QC3A 2F02A 1SZNA 3MP4A 4CLMA 2HS6A 1SUXA 3RSSA 5D05A 2ZZ6A 3NQ2A 3UWYA 4OE7A 4UFKA 3OIXA 3UWZA 3UQ6A 1HL2A 1SU5A 2VOMA 1RKSA 3NZRA 2J9YA 3KRZA 2WSYA 1GTHA 1SZGA 3FA5A 3LRLA 2J27A 3HG3A 1ZY9A 3MW7A 4AEOA 2VEPA 3G8EA 4LS0A 3TC7A 1TCDA 4UMCA 3DGRA 4LS1A 4IMEA 1YXDA 1VJIA 3CTLA 4JIPA 3RLVA 5EY7A 3NO5A 2VFFA 1G69A 5DXXA 1K8ZA 3W9ZA 3L2IA 1KFBA 3RSGA 2E68A 1BTMA 3B0PA 2QEZA 1MEHA 2NWRA 3JS3A 2AX3A 3KVJA 5D04C 3LHXA 1H62A 1KFKA 5CZSA 3W85A 4LW7A 3P8JA 3TQVA 2C0AA 2CLEA 4DELA 1DORA 3W2NA 2Z6IA 3FJLA 3O63A 4IUOA 1OF6A 3NA8A 1B9BA 3G1AA 4KADA 4DEFA 3NM1A 3UWUA 1WXJA 3FKKA 3RU3A 4PC8A 2VARA 5I3HA 5I3KA 5C54A 2BSLA 1C29A 3VAQA 3V75A 2VC6A 3LB0A 4LS2A 1EUNA 3QSRA 2EAWA 3EX2A 3SGZA 2ZRZA 5AC7A 5H2ZA 2Y85A 5G1YA 3TSDA 3G0XA 3TX9A 3DBPA 2DZWA 2QAPA 4JNMA 1AW1A 4XUGA 1F05A 4OHQA 4GUGA 2C49A 1WOBA 3GR8A 4KKXA 1VCGA 4Y9AA 4NJGA 4TMCA 3DI1A 5EA9A 3G8RA 4K37A 4ZQOA 4UMAA 1ZAIA 1LTDA 4HIBA 5HULA 4X3ZA 4GM6A 2E6FA 3B05A 3UQDA 2V81A 3IVUA 1IGSA 4GWEA 2QR6A 4K6AA 3TA6A 3W7IA 2GUUA 1GPWA 3GBUA 1PHQA 1ADOA 2VFDA 3B03A 4R33A 4MZYA 4Y90A 1EB3A 2A6LA 3I7QA 1O5KA 4HSOA 5FF2A 1EKQA 1WOAA 4WJMA 4C5JA 1H1ZA 4OBTA 4JTLA 4KBEA 4JX5A 4K8HA 3BK0A 4E8WA 3TH6A 4AH7A 1LBMA 4K8EA 4K93A 5D2VA 3VKJA 1TPUA 2VKZG 2IQTA 3FYOA 4JYEA 2NWHA 1BEUA 3LLDA 3EWZA 4WX2A 1B4EA 1J5TA 1PHWA 3UXDA 1KLZA 3DZ1A 1QPQA 2GQ8A 2XN0A 4JDYA 4QNEA 3PSWA 5G1TA 3L68A 1F5ZA 3GB6A 1JQXA 3IIOA 2ISWA 1TZ3A 1RV8A 3LTSA 4JN6A 1YHJA 5D32A 3W3OA 2PRHA 4X2RA 4KFNA 3I3YA 5DY3A 5C2XA 3UMOA 3FJ6A 1KTBA 1OK6A 4EIVA 3S1UA 2QUUA 3NPUA 1GOXA 4FNTA 2ABBA 3CEPA 2E09A 3YPIA 1KFCA 2JG1A 3GKFA 1TPC1 3O16A 5I3FA 3MBHA 4MZ1A 2R3BA 4QAIA 3L5MA 2W0UA 4IX0A 2WQPA 1VC4A 2EF9A 2Z6JA 4BI7A 5A5WA 2R94A 4X9SA 4O1CA 1V5XA 3L0GA 1U5JA 1TPB1 5EYWA 3RREA 1VZWA 3C4UA 1GVOA 5CPLA 1C9DA 2JG5A 3BO9A 4JTJA 1YTDA 5F4WA 2WOQA 3GR7A 3O15A 1OFAA 3TMQA 1ICPA 1OX4B 3UWWA 2QJHA 4GJ1A 2GVGA 4E8ZA 3LOOA 3RLUA 3LKIA 3EX1A 3I65A 4I9AA 1M7OA 1KM2A 3GKAA 5BYCA 4JX4A 4A22A 1SSGA 2VELA 4JKSA 4UR7A 1F74A 1ZJIA 2ATMA 3C6CA 5LZLA 2I6BA 3G22A 3M5ZA 1FCBA 3W83A 1T99A 3EWYA 3GAKA 3S1XA 4A2RA 2NWSA 3W1TA 5LGXA 2QCEA 4OGZA 3UWQA 3VNDA 4YCOA 4N6FA 3NNTA 3PAJA 2CW6A 1JCJA 1H7OA 3RTAA 5K4ZA 3B0UX 4WZHA 1QMLA 1RD5A 1R2TA 3G0UA 3OBKA 4XKYA 3FEMA 3W7KA 1OHLA 2ALDA 3NQCA 4K36A 3U8GA 2J88A 5CPMA 3PM6A 4ZL1A 3B1RA 3NL6A 1AK5A 5DY2A 2YXGA 3BARA 4CNNA 1TV7A 3DKLA 4Q33A 1HUVA 1JRCA 3CLMA 1VPXA 4BK9A 4N08A 5CGEA 3NQ8A 2HS8A 2CLIA 2B7NA 2PURA 2ABAA 3UZ5A 3KFTA 3KX6A 3M41A 4AVFA 2VXNA 4P2VA 1OX6A 2V30A 1Q45A 4O4WA 3MMTA 4O1LA 2GJNA 3W7JA 1OYAA 2NXGA 3E0IA 5ABTA 3DFNA 3GZ3A 4GXMA 2BWGA 4JYDA 1W56A 4K39A 2V5LA 2HQQA 3LCXA 1JUBA 3GAYA 4C5NA 5KINA 4C1LA 1SO3A 1RZMA 5D09A 1QR7A 5C40A 3G18A 3RPZA 4JTFA 1LRTA 1I8JA 4IMCA 1TPWA 3QMSA 3KVLA 3HPSA 4NJHA 1FXPA 4LUIA 4FNUA 4HNTA 3RTBA 4O54A 2C13A 1H7XA 3GYEA 1FBAA 2WSQA 2VFHA 1LIJA 2A7PA 1KTNA 3STGA 4GBUA 4DQWA 3V1PA 1UCWA 2NX3A 4UMBA 1L6YA 4ONVA 2JKEA 3PUDA 2FB2A 4CNPA 4NNBA 3NL3A 4O4VA 5AHIA 3DZVA 1SW3A 5HWJA 3LTYA 1RKAA 1I2RA 2DP3A 3Q58A 1FY6A 4JTTA 1SZFA 3PB2A 3EWBX 3NQ7A 3GO6A 2DZTA 1KYHA 1FWSA 3O05A 1XBZA 1H50A 5K9CA 4JY9A 3P84A 3M16A 4M7SA 4LOCA 3RT7A 3UQ9A 1LOLA 3GLCA 3RQ5A 2W6RA 3QAIA 2DZPA 2FPVA 2PKNA 1OX4A 3A23A 2OCZA 4R7JA 3P67A 5HNRA 2WNZA 1RFTA 3Q92A 1UB3A 4NX0A 4LU0A 1F76A 5D37A 4DF0A 3I7SA 3PUOA 4KFPA 3PBVA 3SJ3A 3W87A 4YL5A 2YGYA 3IIZA 4AXKA 4Z0SA 3SR7A 1TPEA 3BF5A 3W07A 4XDAA 1A5AA 5DCDA 4UTKA 3CB8A 2PKMA 2C14A 1MZHA 5KZDA 5TQLA 5B6AA 3KVKA 4ZQCA 3C3NA 1D3GA 3LCLA 3NQGA 1FDYA 4O17A 5F4XA 2ZZ7A 2QKFA 5LHEA 3W7QA 1QO2A 3CIXA 4BR1A 4L4LA 2D73A 3LCWA 5AYYA 1FCQA 1I2NA 5C3YA 3MP3A 2ZFAA 1H7NA 3WK0A 3L0NA 1KM5A 4LY8A 3HGOA 1WBHA 3S6DA 1JVNA 1TYYA 4N9EA 3UWVA 4DU5A 1EUAA 1GVSA 3W84A 4Q4KA 3NG3A 1DBTA 1RR2A 4WQ6A 1DGMA 4JTGA 5J5RA 3TJXA 3DHFA 1GC5A 3LJSA 3S5NA 3LHYA 1JJKA 4MFEA 1G4PA 2DU2A 2DDMA 4O1GA 2NUYA 1EKKA 2A4AA 3NPWA 4M6QA 4QJ1A 3W70A 3GDLA 4UXDA 3RU6A 4EVZA 4O10A 4YXGA 1N8FA 1GG0A 2Q5RA 3KXQA 3LM7A 1LRNA 4XTDA 3WJWA 5DXYA 4DO4A 1R2RA 3EB2A 5BYEA 3HIJA 2VENA 2V8ZA 4FNSA 3RFAA 4LV9A 2NLIA 2ABSA 3BGKA 3TFXA 3TK7A 3NL5A 1X1ZA 1SPQA 3HGJA 2WJZA 3IIPA 2NV1A 4LNYA 2AFBA 1GJPA 4UTHA 4MUZA 4MYXA 3TKFA 3FIGA 2HW1A 3CWNA 1G7UA 4KALA 3WK1A 3MHUA 2J9ZA 4IOTA 3VCRA 3ABOA 1GQTA 1W0MA 2G97A 4BFAA 4MYAA 2GVJA 2ZBTA 3M5VA 3SSJA 3S8HA 4XBKA 1Q6QA 1TTPA 2CU0A 3AJXA 5F1UA 5HMSA 2RKXA 4C1KA 4A2SA 2E5CA 3LXAA 3N19B 4CCEA 4B8SA 1DVJA 3M0ZA 2E5DA 2A2IA 2CLOA 2DDOA 1ESJA 3GVGA 2X1SA 3G1SA 3ZR4A 5LKYA 3RY7A 1SO6A 1W3TA 1F2JA 3THAA 4AHOA 2X2GA 2I5BA 4AWUA 4YWRA 3W1RA 3I6RA 3W7RA 3STCA 1WYIA 4MY1A 5BOOA 3TDFA 1VS1A 2RDUA 3SGUA 3C0JA 4NXKA 4HNUA 3W1XA 4ZQNA 3TQKA 3WFAA 5C55A 1B4KA 5FF7A 2Z0IA 5K2ZA 3CPRA 5HR6A 3LI1A 3NYZA 3DFQA 4IXHA 2XFWA 4LWWA 4MJZA 2YPIA 1LRQA 1SO4A 3RK8A 3HGRA 3EX6A 3QYQA 5KZMA 1ESQA 3O6YX 5DBUA 4O16A 1HO4A 4ZZ9A 1OFBA 2DZUA 3C2RA 1SSDA 1YTKA 2FJKA 3M7WA 3C61A 3BW4A 1NF0A 3E02A 3S1WA 1PL9A 3CU2A 4PA8A 2E6YA 1JULA 4CCDA 1F73A 2PC4A 4KWWA 4ADTA 4JEQA 1VRDA 4JTSA 3TNOA 1TQJA 1A5CA 1BWLA 1TTJA 4FXSA 4JTIA 3R12A 2DZVA 4K8PA 2F84A 4IJBA 1RFUA 2ZTKA 5IBXC 3PWAA 5D2WA 1R30A 4DO6A 4HNNA 3TE9A 1KTCA 3RQ2A 1B3OA 3C2VA 1W31A 2QCHA 4JY8A 4PCFA 1O94A 5MHBA 3SFKA 2NUXA 3ZFHA 1SFLA 3RQXA 4I7UA 3UMPA 1FXQA 3TXZA 1TYGA 1PCKA 1IIHA 3HPXA 4DPQA 3ZS4A 3N73A 3Q37A 2FB3A 3KOFA 1BX4A 1LIOA 4HPXA 3LCIA 5G2WA 2UV8G 3IIVA 4TO8A 4XKYB 1ZFJA 2Y62A 1I4NA 1UUOA 4NNCA 2Y7FA 1K7XA 3S9YA 3LDVA 4NUWA 2W79A 3P61A 2P10A 1OG0A 1ML1A 4UTLA 1PVNA 3RS8A 5DBTA 4XTIA 1VQTA 1YGJA 3W72A 1ZENA 3M47A 3LI0A 4B8RA 1JCLA 3N2XA 3DFTA 3LGEA 5U4NA 2A9ZA 1JCMP 2VFGA 1GWJA 3R8RA 2A5HA 4AWTA 5CM5A 3B0VC 3QMTA 4EN4A 3W23A 4O8RA 4O53A 3UNDA 4I7VA 3TSMA 1TV8A 3IGSA 1FCVA 1UJPA 1XCFA 3BW2A 5HR7A 4O12A 3QZEA 4P61A 1P1XA 1LLZA 3TMLA 1T96A 3RQ6A 4RZ4A 3ZS7A 3UXAA 1OX5A 3W1LA 4OU1A 3Q2DA 1I2OA 4PEKA 3LCFA 5LNWA 1JCNA 3GK0A 1Z48A 3TW6A 4UTMA 4ZMGA 4XCKA 3IGUA 3W6YA 3LTPA 1LBFA 1DL3A 3W7EA 2Y7EA 3RT9A 1BWKA 1TTIA 4Z1DA 2J24A 3GNNA 4E2DA 4FIRA 5U7SA 4ZVJA 3A5VA 5A8GA 1LZOA 5HJLA 3E49A 3N14A 3S1VA 3TUUA 4FF7A 3R89A 3DI0A 1FWNA 5AB3A 3PS7A 3RM5A 1H61A 3BLFA 1VR6A 1FCUA 3W7PA 4JR5A 2I9EA 2ZTJA 1P0KA 5FF3A 1YDNA 1VYPX 1QAPA 5CPNA 1L2LA 1XUZA 2X1TA 2V0TA 2WO5A 5D2XA 3HB9A 4JIQA 1XXXA 2JBMA 3MI6A 3EXRA 2AJPA 3RMJA 3OA3A 3LHTA 4MY9A 2ZDRA 4UTTA 3W22A 3HQ1A 3CM4A 4RZ6A 3UPWA 1HTIA 1MEIA 4MFDA 4UTIA 1KBIA 3RRJA 1XBVA 5D2YA 3UQNA 1G4SA 1SO5A 3HICA 3Q94A 5DELA 3LCGA 2AQWA 5BMWA 1UB0A 2G96A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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