3NL3A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
539
structure length
513
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGVTLVQIREDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGPDMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPDMVDYIGVGTLFPTLTKKNKKAPMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSTKNSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGYSATETRLLLNNKLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSKGTNGTSVEDIPCVAVEAGPGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Candida glabrata
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
total genus 164
structure length 513
sequence length 539
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nl3A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nl3A02
1SQ7A 2E6YA 3KXQA 1L6YA 2VENA 3M7WA 3HJZA 1W5QA 3G18A 4JKSA 3S6DA 4XBSA 2Q3RA 2Y70A 3LCXA 3LOTA 2VFFA 4HT3A 1Q6OA 3MYOA 2FFCA 4RKAA 1WBHA 4DQWA 3DKJA 5C55A 2Z6IA 5C2XA 1H51A 2BZNA 2B7QA 3LXAA 1KBJA 3LB0A 4DF1A 1LBLA 3O15A 3I3YA 3GXPA 3FYOA 2V82A 1LOSA 2JGVA 3B1PA 3ABQA 5AYZA 3RRBA 1PIIA 2A7NA 2X2GA 4ADUA 3UWUA 4S2BA 4KWWA 3TJXA 1QCWA 1SZGA 2Y63A 4CLMA 3GB6A 4FNTA 2GJNA 4O19A 3I6RA 3WK2A 4UTWA 2CZDA 4BR1A 1O95A 3S5YA 3C2FA 2NV2A 3EWXA 2X1RA 3O6DA 4LC8A 1PV8A 1BWLA 1I45A 1IIGA 5BMWA 4M7SA 1ME7A 4N9DA 2KZHA 3B03A 5FI8A 1XDLA 1GOXA 4OQVA 1TPWA 3W87A 3GR8A 1ZENA 3MI6A 1QOPA 1FBAA 2Y7EA 2QCFA 4FB7A 3G3DA 3ZR4A 4JN6A 3QF0A 5EY5A 2NLIA 4EIVA 1SO5A 2E5CA 1FY6A 3ATYA 2H3DA 4XF7A 5D38A 4K8HA 3HMJG 4K9CA 3BLFA 2XFWA 3L66A 3UPWA 5I3JA 4UUIA 1TO3A 5K9DA 1TCDA 4NU7A 3K30A 3HG4A 3NAVA 1VRDA 1DOSA 4AHQA 1D9EA 1N55A 3C2OA 4PH6A 5KZEA 4MFEA 3IV3A 1EKKA 1F7BA 4Z1BA 5K9XA 1VCGA 3LDVA 2ABAA 2Y6ZA 3BO9A 1LLZA 1IIHA 4QISA 1F76A 4JXCA 1G4SA 2ATSA 5G2IA 2A2IA 4MLRA 1DBTA 3Q1YA 1EWEA 1TJPA 4LVGA 3PUOA 2YXGA 3IE7A 3RRJA 3RRFA 3UY7A 3PY2A 3MWAA 5G1TA 4A2SA 1QNVA 1NF7A 1DKWA 2DZPA 2WNNA 5HMSA 3QPYA 3LHWA 1MEHA 1ALDA 4AXKA 4Y6GA 1PHQA 2DP3A 1K02A 4HNNA 4O4WA 3G1YA 4EVZA 3FOKA 2FPYA 4HPXA 1JQXA 1B4KA 2FB2A 1XUUA 5F11A 3CQ0A 4GE8A 2YW4A 5HQEA 5D30A 1S5TA 4M5PA 1XM3A 3KZHA 2HW1A 4A3UA 1W31A 4X9SA 4N02A 4NXSA 2DDWA 5IBXA 2Q8LA 4O0KA 3QW3A 3NBWA 2FQIA 2A9ZA 1MSSA 4FX6M 3IGXA 2WOQA 3PS7A 1JUBA 3KVJA 3W7JA 4ZQMA 3LXCA 1SSDA 4O50A 2PRLA 2PRHA 1GTEA 4K9IA 1OX6A 3C2VA 2ZFAA 1XUZA 3E0IA 3VFLA 1UJPA 4EUMA 4JTGA 1T0OA 3RY7A 2WSYA 1K7EA 5AC6A 1KM1A 2QCGA 5AFDA 1V5XA 2Y62A 5HWJA 3M0ZA 4FNSA 3MBHA 2AWDA 1TPH1 1G7UA 3S8HA 3B1QA 3TUUA 3N19B 2NXHA 3OIXA 1F6KA 2NX3A 4BF9A 5EY7A 1K7FA 2QAPA 1JULA 3TAKA 4BWLA 4LRTA 1M7PA 1LRQA 5BYFA 4NNBA 3GVGA 3MHFA 3KRZA 3T55A 2RDWA 1H62A 3C61A 3SI9A 3T78A 3SGUA 3LHYA 1A53A 1A5AA 3W7NA 1VZWA 2HMCA 1GZGA 4HSNA 4QQ3A 3M5VA 5AHMA 1OG0A 4MZ1A 1THFD 4O0ZA 4YWRA 3DH7A 4AF0A 1YGJA 1NEYA 4GUGA 5LNUA 4XTDA 3P84A 1OF8A 3NQAA 3W7CA 2C0AA 2E6AA 5J5DA 3W2UA 2ABSA 4LVDA 4ZVJA 1G4TA 3JR2A 2DORA 1KFBA 1W5OA 2E1DA 3NL6A 5FF0A 3Q92A 2C15A 1GG1A 2B0MA 1EIXA 1GTHA 2ABBA 4POCA 2YXTA 2CLMA 2C18A 1Z41A 4K37A 3WJYA 3DAQA 3EXSA 3NQGA 1V1BA 2DCNA 3IKHA 4FF7A 1EP2A 4XQ6A 2AQWA 5CPLA 4Q33A 1T8XA 2DZWA 2RH9A 3FHYA 1FDZA 1FUYA 4BWLC 1OK4A 2Y7FA 5D09A 2CLHA 3M41A 5F0ZA 4AF0B 1UB0A 2OX1A 3F03K 4Z0SA 2NWHA 3G1AA 2Q5RA 3KTNA 4Y9AA 3CT7A 5SWUA 5D02A 1Q45A 2ZRVA 3P8JA 4WXYA 3SW6A 4JTIA 3S0CA 3NEVA 1WOAA 1DORA 2E6FA 3LHUA 5AHIA 4N6EA 2BWGA 4C5JA 2Y89A 3GXNA 3MO7A 2F02A 4UTTA 1C9DA 3GDKA 1PCWA 1VHCA 3N3MA 5CM5A 4RX0A 4E3AA 4MFDA 3PG9A 1KM5A 4HNUA 3NNTA 2VARA 5EPDA 2CLFA 3QM3A 3TMLA 3GX9A 4JTHA 3LI0A 1O60A 3O8AA 3INPA 1V19A 1UA4A 1I8JA 3CC1A 3EWUA 4JIQA 1QO2A 2ZZ7A 1P5BA 1KA9F 3ABSA 1F5ZA 1JCMP 4LV4A 1LCOA 1H5YA 2JGYA 4CQAA 1OX5A 3LX9A 2DJLA 2NUWA 1ZAHA 3M16A 5DCDA 3RTAA 1OF6A 2CLIA 3BGJA 3ZWSA 1ZALA 4WJMA 5FF7A 4LTSA 5E1QA 4U7XA 3W73A 2ZDRA 3R89A 1GPWA 5L9FA 1GQNA 4U28A 1EB3A 1OYBA 1ZAIA 5U7SA 3RQ2A 2VFGA 3W2JA 3B05A 4DXVA 1Q3NA 3L2IA 2CLKA 3DFTA 5AYXA 4K8CA 5DCEA 5FEWA 1R2RA 2CU0A 1KFLA 4JTEA 3H54A 4C1KA 5F4XA 2JKPA 3HGSA 2YYTA 3NO5A 4MZ8A 1J4EA 4FX8A 5CPMA 2YGYA 3RFAA 4JYEA 2JBMA 3UQ9A 2JKAA 1FCVA 3MHGA 4JTUA 4KWVA 3UWZA 3OVPA 2CFFA 3G8RA 3I68A 4UTJA 1B4EA 1WAUA 1YLVA 3A21A 5AOUA 2DU2A 2QJGA 1SR9A 4PODA 1I2RA 1ZNNA 2W79A 2F7KA 4LRSA 3TJLA 1PL9A 1O94A 3NQCA 2CWNA 3LHVA 4XBKA 1TTIA 2R3EA 1W37A 2E5BA 3MP3A 4LU0A 1PVNA 3W2KA 1HG3A 1N7KA 3G1FA 3W76A 1UASA 4E84A 2YXUA 1R47A 2GVGA 4KALA 4MY8A 4JYFA 4YCPA 3LCIA 3LTSA 2CLLA 1OFQA 3DENA 2GUUA 3STEA 5G1YA 3NA8A 3BW3A 1QWGA 1VHNA 5CZSA 3M1ZA 5FEPA 3W9ZA 1QAPA 3RM5A 1KTCA 3S1WA 5HUOA 4O52A 1TPUA 5F1UA 3WK1A 2NV1A 4XTIA 3TE9A 3NZRA 5AC7A 3IIZA 4S1FA 1FCUA 3BG3A 4E8WA 1T96A 4UC5A 3FHXA 3FEMA 3M5ZA 3UD6A 4CCCA 2PKNA 4IQLA 3RTEA 3CEPA 4O17A 7TIMA 2YW3A 4HN4A 2A4AA 1FCQA 4UFIA 1DVJA 3LOOA 2I14A 3CWNA 4QIUA 3RLUA 3PULA 3HPZA 3SR7A 3EXRA 5AHNA 5G2WA 3WFAA 1T99A 2VKZG 1F2JA 4NQ1A 1W54A 3S1VA 1OFAA 4NNCA 3EWWA 1DQXA 3A9IA 1SO4A 4BK9A 3B0UX 3HGOA 2JG5A 3EX2A 1H50A 5DY2A 1P1XA 2A0NA 4B5NA 1NFBA 3N9SA 3ZS7A 4NZFA 2AGKA 1ICPA 5C3YA 1LIJA 2X16A 1AL8A 1UB3A 3UWVA 2AA0A 1BEUA 4IX2A 2W6RA 4GM6A 1OFDA 4JTKA 1XBZA 1H61A 4N2YA 6TIMA 1RR2A 1VLWA 2JK2A 2TMDA 5G4EA 4TR9A 1Q6LA 3GYEA 3NPXA 3MYPA 3T40A 1K3UA 1EP1A 3F4NA 3UYCA 4YMZA 1ZHAA 5DXXA 1SZEA 2YX0A 3W86A 3Q2DA 5LNWA 2E5DA 1GYLA 3UQDA 1ICSA 4O1DA 1GVFA 1KLYA 4ML9A 2GQ8A 3TC7A 3GDLA 5D04C 6ALDA 3LV6A 4GJ1A 4DBDA 1V1SA 2YZRA 3TW7A 5DBUA 2YCEA 1UCWA 1S5WA 1QMLA 4O13A 4NNAA 1OJXA 4NJGA 3MW7A 1C8VA 4LUJA 2ISWA 5D03A 5C3ZA 2V9DA 4QITA 2VFDA 4OV9A 1CI1A 4G1KA 1D3GA 4JJPA 4H3DA 1XXXA 3R8RA 4O12A 3R2GA 2P10A 4R53A 3RSSA 1XFBA 1YADA 2EKCA 3CTLA 5C6MA 3S5NA 1SW0A 1AMKA 5HUPA 3HO8A 3LI1A 3BARA 3EXTA 3RLVA 3W7IA 4NT0A 1FWSA 3GLCA 1LRNA 3M43A 1HO1A 2ABQA 4GXMA 1U83A 1I4NA 1JVNA 1JCLA 4ONVA 4DEFA 3QMRA 4IMFA 5CPNA 4K93A 3LRMA 1J2WA 2PE4A 3C6CA 5LHFA 3LBMA 2HLZA 4KBEA 3KD6A 4ZQCA 3RMJA 4DO5A 4LS0A 4IXXA 1NSJA 3LCWA 4XF6A 2J9XA 3CLMA 1TD2A 4RXGA 3NL3A 5LKYA 5BOOA 5HNRA 3F4WA 2O7QA 3B06A 1JRCA 2QCEA 3MJYA 1FDJA 4KAHA 1G69A 1LOQA 4RLIA 5KITA 1LBFA 4KANA 4O54A 4OGZA 1WOBA 3A5VA 3V75A 3TW6A 3I7QA 1FWNA 3PM6A 2VEPA 5K4ZA 2HQQA 3KRSA 3TMQA 2ZRYA 5BRBA 1YDNA 1VCVA 2A6NA 4M6PA 3STFA 3W7EA 4FNPA 4R7JA 3QW4B 5DLCA 1YPFA 4EF8A 1FXQA 3ANYA 2G5WA 4YLWA 3OVRA 4NXKA 1TJRA 4NX5A 4MY9A 3B1NA 3TC6A 2C1HA 3M5XA 3IBQA 2GPTA 2R8WA 4A2RA 1K8XA 4GUHA 1XL9A 4ORIA 3HPDA 2V81A 1TRIA 3NGJA 3W1PA 2AJRA 4O53A 3W7HA 5HR6A 1IXQA 4X2RA 1EPXA 4Y96A 1VM7A 2AJPA 3UWQA 1KM3A 3DFSA 4OBTA 5F2GA 1OK6A 3W88A 1GVOA 4MPQA 3LRKA 3OEXA 3O06A 4UTLA 5DXYA 3SJ3A 2CZFA 3QSRA 3LRLA 4GC4A 2G96A 3OBKA 3MHUA 3NQ7A 1LHPA 2EHHA 2ISSA 3DHDA 2DZVA 1KV8A 3BK0A 1AW2A 3NQVA 3LM7A 3PBVA 1FCBA 3N1CA 1SU5A 1OVDA 2ZRWA 3BVJA 3U6WA 3W71A 4HIBA 3TSMA 2VXNA 4LBGA 1VYSX 4UR8A 3W1RA 3NQDA 2ISVA 1TMHA 1I2OA 3P5YA 2DDMA 3C2EA 3LTPA 1PHWA 3FKKA 4UNLA 1ESQA 2BLEA 3AO0A 1GG0A 3R12A 2YSWA 1RQBA 1X8FA 3TSDA 4UTWC 1RZMA 4UNKA 4UR7A 5D32A 4N4PA 3DHFA 4ZQOA 3NQ8A 4ZL1A 5LNVA 3H74A 1QFEA 4A29A 1TYGA 4CQ8A 3NG3A 1M7OA 1U2XA 3QQ1A 2C3ZA 4OE7A 3G8EA 4I9AA 1SW7A 3LCLA 4ZQRA 4TX9A 3RQXA 4JYDA 4LNYA 1EUAA 3CIXA 3VKJA 1E51A 3G0SA 1L2UA 2I9EA 4RR4A 3PVFA 1ME8A 3N2XA 3EKZA 1IGSA 1RFUA 3W7PA 3RPHA 1FQ0A 2X1TA 2QUTA 1WYIA 4H6KA 5CGQA 1M5WA 3SSJA 1R2SA 4IWWA 1SZNA 3LCHA 1JQVA 3C56A 3SIZA 5KMYA 4IGHA 3HG2A 3TV8A 4JTTA 3PB2A 3IIOA 4LWWA 3L0KA 4X3ZA 1KFKA 4O14A 2WQPA 1RFVA 4X22A 2YFOA 1R30A 4WOZA 3GO6A 1HL2A 3FJLA 1K8YA 4UBEA 1JJKA 4E2BA 5KZDA 5LHEA 3JRKA 4CQ9A 4DELA 1C3QA 1AW1A 3QYQA 2DZXA 3GAKA 5CKSA 4WX2A 3L68A 1DJNA 4EOUA 1X1ZA 4I7VA 2A9YA 1Z44A 3FS2A 2AX3A 4IMDA 2QCNA 4LC6A 3LJSA 2ZA2A 2CW6A 1RFTA 1OABA 3UQEA 4EOHA 1UUOA 3UXDA 3ZS4A 3DGRA 1OFEA 1H7XA 3P67A 5EYWA 3L9CA 3PZSA 3CB8A 4LT9A 4AVFA 1VC4A 4MJMA 1SO3A 1CW2A 3G1XA 4EN4A 1RKAA 3KOFA 4Y90A 1TPDA 2VC6A 2I5BA 4LCAA 3EX6A 2NXGA 4IMCA 1TTPA 3NVTA 2H6RA 2ZZ6A 4NJHA 3TKFA 3LTYA 5DY3A 4YL5A 1MO0A 4JDYA 3W1QA 3TK7A 4GWEA 4HPJA 8TIMA 5F4WA 3NL2A 1QPNA 5IBXC 4O28A 4O15A 3NPVA 2QR6A 3P60A 4JD4A 4NJIA 4OWGA 3USBA 2OMAA 1LRTA 4PFMA 2QEZA 4E8YA 1PE1A 2FIQA 1BKSA 4AH7A 2QHPA 3QAIA 5I3FA 1IXPA 2BTMA 2TYSA 4M7TA 3G22A 2ATMA 3W23A 1NF0A 5AHEA 3EWMA 5TIMA 4R34A 1GJPA 2I1OA 4B8RA 5HINA 3W2NA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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