3NL3A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
539
structure length
513
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGVTLVQIREDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGPDMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPDMVDYIGVGTLFPTLTKKNKKAPMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSTKNSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGYSATETRLLLNNKLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSKGTNGTSVEDIPCVAVEAGPGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Candida glabrata
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
total genus 164
structure length 513
sequence length 539
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nl3A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nl3A02
4GNJA 3MWAA 4IOTA 5I3JA 3R8RA 3N14A 5J5RA 3S8HA 1MXSA 3NL5A 1G4SA 1XXXA 1PHQA 3FEMA 4Y90A 4MZ1A 3P80A 1I8JA 1KTBA 3IGSA 3NQEA 1R30A 4IGHA 2QHPA 1TB3A 4TR9A 3CC1A 2FFCA 5D32A 3ELFA 1SUXA 4JS3A 3DFOA 1L6SA 5FF7A 1YTKA 2QDGA 3HPSA 3RU6A 3W1RA 4FNQA 1VS1A 3B1QA 5K4ZA 2Y89A 1W3NA 4UBEA 1FWNA 4RKAA 4MFDA 3GK0A 2QUTA 2FJKA 4MYXA 3FJLA 3W1NA 1NSJA 3P8JA 4OQVA 5U4NA 3EWMA 1LIOA 3CEPA 1YDNA 3ZS7A 3UZJA 4Q4KA 1EIXA 3NBVA 3TC7A 2VEIA 3CLMA 3UXDA 3RF9A 3GKAA 5IM51 2C4EA 4DO4A 1VHNA 3W2JA 3UWWA 3ZS4A 2WNQA 1X8FA 1JRBA 1TPB1 3DENA 3MW7A 3N2XA 2HLZA 5D2WA 5DELA 4DBDA 4GM6A 4AMAA 5DXYA 1A53A 3TMLA 2NWRA 1DVJA 3INPA 3TNOA 2TSYA 1GWJA 3NQ8A 2JKPA 4K7YA 4LBXA 1DBTA 4OHQA 4JKSA 2PKMA 1TREA 4JYEA 1A5SA 1WAUA 3B0PA 2GJNA 4H6KA 2ZTJA 1OFPA 4DF2A 5LGXA 3MHGA 3LHUA 4BI5A 1W1ZA 1C9DA 4HNNA 1GG1A 1OX5A 3TSMA 1EKQA 2PURA 3RK8A 3UNDA 4QM1A 1ME8A 1LOLA 3B06A 5I3FA 3RRJA 3W7OA 4LNYA 3QZEA 5EBUA 1LLWA 4N08A 3DRWA 4KFPA 1TTIA 4E2DA 3T4CA 2QCLA 1R46A 1AL8A 1T0OA 1R2RA 1H60A 3C2EA 2VKZG 3M0ZA 4ONVA 3PBUA 3N9RA 3UQ6A 3LDVA 1B3OA 3RY7A 2WOQA 4K8EA 4M6PA 4IXXA 1G7UA 4MJMA 5EMUA 3MO7A 3G0SA 5EA9A 2X1UA 2ZZ6A 1JUEA 1GEQA 3GAKA 4RXGA 3SJ3A 1LP6A 4NX5A 1P5BA 5EY7A 4U4MA 3HG2A 1SO6A 4NZJA 4GUJA 1L9WA 1NFBA 3DZ1A 3CIWA 3QW4B 1LYXA 1H61A 1GT8A 5AHFA 2H6RA 4I7VA 1SW0A 4WX2A 2BTMA 5K9XA 3SY5A 3NC9A 4BWLA 2V8ZA 4DPPA 4IWWA 2Y63A 1WV2A 2YSWA 5HULA 4NNCA 3P8IA 3TK7A 2B7QA 2NXIA 3P84A 4K39A 3PG9A 3BG3A 3SGUA 3G22A 1TPVA 3B05A 3GVGA 4LVDA 1DQXA 3ABSA 3OVQA 2ZZ2A 2WNNA 1Q6RA 3JRKA 1F74A 3L0NA 2VFGA 4UNLA 5CGQA 1OFDA 1GVOA 1AL7A 2G97A 3ANYA 1RFVA 4UXDA 3G3MA 3BGGA 2DZWA 1XL9A 4OBTA 2C19A 3BF5A 3EWZA 3LLFA 1IIHA 5AHEA 3HGOA 4MJZA 1KV8A 3E49A 4FXRA 1TZ6A 1W5NA 1XBZA 2E6FA 2NZLA 3W22A 1F2JA 1TSIA 3IIPA 2YYUA 3B4UA 3SECA 4E8ZA 2X1TA 3GKFA 3HOJA 4UUIA 1QDSA 3EX3A 3W1LA 1VC4A 4IX0A 2DDMA 3S5NA 2A4AA 4O28A 4O13A 2E09A 1UBSA 1VLIA 4CQ9A 5D38A 5G5IA 1XBVA 1Q6OA 1YTEA 3PBVA 1OX6A 4OV4A 4I7UA 1ZY9A 1XCFA 3HICA 1Z41A 3G24A 3M5VA 4D2JA 2C15A 3BGJA 2VARA 1CX9A 3MHUA 2ISVA 2A85A 5FF0A 4N9DA 4XTIA 4K38A 2YPIA 1S5TA 3C6CA 3SIZA 3W72A 5BNKA 3DXIA 4O15A 3E0IA 3S5ZA 2FQIA 3FKRA 4WXYA 4CCCA 1Q3NA 1TJPA 3G1DA 2CW6A 3L2IA 3FOKA 6ALDA 3RQXA 3NVTA 1MSSA 4MFEA 4TIMA 1VR6A 1FDJA 1TV5A 3T55A 4LVFA 5C2XA 1O5XA 4XBSA 1YGJA 1K7FA 3TH6A 2R3BA 4N6FA 2B4GA 4KKXA 5I3GA 3W2MA 1EPXA 4Y6GA 1OVDA 3OEXA 4IJBA 5LNRA 3W1UA 3W87A 1M5WA 3HPZA 5LHEA 4BWLC 3TR2A 1XDMA 3S9YA 1Q6QA 3RM5A 2YFOA 3LCHA 1L2LA 1JXIA 1SO4A 4JTIA 3MMTA 2IQTA 3EXTA 4UR7A 5HWNA 4LTSA 5FEPA 5D09A 4RK8A 2DDWA 1HFBA 4HT3A 1NF0A 3DFPA 2VFDA 3MYPA 1JCYA 1KFJA 2G5WA 1SO5A 2Y7FA 1GVQA 4AHOA 4MY8A 1LHPA 1KLYA 3SSJA 2DZSA 2E6YA 5AC6A 1FBAA 1KTCA 3B1NA 4H4IA 3E9AA 4O11A 1P1XA 1A5BA 1JRCA 4IMDA 5F1VA 2C0AA 4BI7A 5D30A 3IIOA 3TFXA 1W0MA 3SFKA 3TAKA 1CI1A 5A8GA 2R14A 4K6AA 3CQ0A 4JD4A 3B0VC 2VELA 4GUHA 1ICQA 2R94A 4XKYB 1GOXA 4NJJA 4DBEA 4JR5A 4IMEA 3M6YA 1JULA 1EB3A 2ZA1A 3O1NA 2OX1A 5EPDA 5K2ZA 3I3YA 4HSNA 1WBJA 1N8FA 3C52A 2Z1BA 4DC3A 5BYCA 2YX0A 5AYXA 3SZ8A 5F2LA 4JDBA 1ZAHA 4DO6A 2E6DA 3GDTA 4C5JA 3RTBA 4W9TA 3DZVA 2ZTKA 3PY2A 4C5MA 4N9CA 1OK6A 3NEVA 3RT7A 2V82A 1YPIA 2A1YA 4FIRA 5LGZA 1SZFA 2ATMA 4UTJA 4HNVA 3DFSA 1WQ5A 2E5BA 5LKYA 2NV1A 1LROA 2NWHA 3BLFA 3PWAA 3W84A 1JUBA 1VH7A 3LTYA 1FWRA 1QPNA 2QAFA 4HIBA 2QJHA 5AC8A 3B1OA 4POCA 4EOHA 4MOZA 5CZ0A 4BR1A 2ZCGA 3UQDA 3EWXA 3P82A 2C1HA 3OIXA 2R3EA 4O0KA 4DO5A 1TRDA 1YXCA 3TQKA 3QMSA 3EXSA 1IIGA 1RR2A 4LWWA 2ZA3A 3I7SA 3S5YA 3BG9A 4GE8A 3PS7A 3W75A 2A7RA 3NDOA 4WJMA 1F7BA 4HHPA 1EP3A 1FUYA 3GDRA 1YDOA 2I14A 5HUOA 3ABOA 3W7GA 2VFFA 3BLIA 1NEYA 3F4WA 4LC6A 2F84A 3USBA 3RPZA 3G1XA 1M7PA 2C6QA 5BYDA 1KM5A 1KM0A 1GYNA 3ABRA 4UCGA 3BW3A 2YXGA 2C16A 4JIPA 2YFNA 4HN4A 3UWQA 2RBCA 5A5WA 5DCDA 3MBJA 1B4EA 3NC2A 4LY8A 1ZENA 1PS9A 3I65A 1WA3A 5DN1A 3THAA 4GUFA 3PUDA 4MKNA 2DZXA 1VYRA 2Z6JA 1SQ7A 3NO5A 3NQDA 3TQVA 4NT0A 5TQLA 5F4XA 1SPQA 1C3QA 3EWWA 2AGKA 3NL2A 1H1YA 1LDCA 3M1ZA 3STGA 3RSFA 4LRSA 3NQ6A 3TSBA 4YL5A 2DZUA 5K9CA 1X6UA 1QOQA 5LNSA 4IQLA 3MI3A 1M7OA 3MBFA 3C0JA 3LHXA 2ZQ0A 3C61A 2E68A 5K9DA 4IMCA 2V30A 5TIMA 3IE7A 5D03A 4KWWA 3RO4A 3JR2A 4LT9A 2QAPA 3NQ2A 4A2RA 4LRTA 3TAOA 3UPBA 1GVRA 2X2GA 2FTPA 3L5AA 3OBKA 4O57A 4KALA 2DJLA 3QF0A 4NJIA 3TW7A 4XZ9A 3IV3A 1H1ZA 1TPH1 3NM3A 3NYZA 3E96A 3G0UA 4CCEA 1R2TA 4WUIA 5AB3A 4PA8A 4NNBA 4ALDA 5COJA 2GPTA 3GDMA 3N19B 3QMRA 4RZ4A 3NOEA 3E02A 1S5WA 1K03A 3RQHA 5I3HA 4I9AA 3VAQA 1W5OA 2AQWA 2OCZA 2RDWA 4DU5A 5CGAA 1OYCA 2RKXA 3RREA 5AHNA 4K8CA 2ZA2A 3HPDA 3HIJA 3LCIA 1KYHA 4EVZA 3TW6A 3IIVA 1JCLA 4LUIA 3KZHA 5TBOA 3R12A 1B57A 2H8XA 4XKYA 3RSGA 4KANA 1PE1A 4O1GA 2V2CA 4A3UA 1GC5A 2ZRXA 4LS0A 3UWUA 1ML1A 3I7RA 1KFEA 5HUPA 1W54A 2GQ8A 1GQNA 3STCA 3CIXA 2X30A 4IMGA 1PVNA 1NAL1 1EUNA 4GC4A 1RQBA 4NNAA 5C6MA 1RQHA 1RZMA 3O05A 1QAPA 4O19A 1XM3A 1RPXA 4O1BA 3GNNA 1XKYA 1KM4A 4NZFA 3UQ9A 1D3GA 3GDLA 1TQJA 4U7XA 3KXQA 4K8HA 1FX6A 2G95A 2RH9A 3UZ5A 5CSRA 4CCDA 1HUVA 3OVPA 4JTEA 1WYIA 3HB9A 2CU0A 1LBMA 2C13A 4UTWA 4MYAA 3QC3A 3DI0A 4FX6M 4K8PA 5LNVA 4UR8A 2CLHA 1BTMA 3G8RA 2JGYA 3MP4A 4LVGA 4BF9A 4K9CA 4FHAA 1XDLA 3UPWA 2HMCA 1JVNA 1SZEA 1LOSA 1W3IA 4RZ5A 3EX2A 1X1OA 4X3ZA 4MZYA 3LCFA 4JTKA 3RLUA 5FF2A 2QCFA 2HS8A 4NQ1A 1QOPA 1GQTA 3QSRA 4LU0A 1P4CA 1T96A 3W7RA 3L5MA 3GXNA 4RV8A 1GPWA 3RPHA 4K8KA 3O63A 1H7PA 1H63A 3OHIA 3RTGA 1LRQA 1ONRA 3UYCA 4AWUA 1OK4A 2B7PA 3IVTA 1UA4A 3IEBA 5HR6A 1F6KA 2GUUA 3O07A 1VRDA 2WPBA 4O53A 4LVAA 2ZZ7A 2Y85A 1OFAA 2BWGA 5EL1A 5KSWA 2QCDB 3O06A 4ZMGA 3TIMA 1SZNA 1DOSA 2Q8LA 5DLCA 2PE4A 1LM1A 4Z0SA 1LBFA 1LZOA 1SR9A 1W3TA 2QCEA 1Z44A 4JXCA 4LCAA 2Z0IA 3FYPA 1W8SA 2ZZ3A 3L67A 4K37A 1FY6A 3EXRA 4GJ1A 3QPYA 1EWEA 4EIVA 3KFTA 3LBCA 4QNEA 4AF0A 4S1IB 2ZRYA 3G1VA 1L6YA 1ZJIA 1PHWA 4BI6A 3VI2A 5F11A 5AHLA 1HG3A 2A6LA 4JY9A 4AXKA 4UFMA 2LLEA 4ADUA 4IMFA 1HO1A 5LHFA 4ADTA 5DBUA 3GAYA 5D33A 1W5MA 1RD5A 4MVAA 1EP2A 2PC4A 3NZ1A 2NWSA 4XF6A 1ZAJA 4UFKA 1VJIA 2FV7A 3GLCA 1GYLA 3W85A 3TU9A 3TMQA 2VEKA 4R34A 2F02A 1RVGA 2A0NA 4WOZA 3G3DA 2C14A 3QRHA 4Z1AA 1YADA 3PUEA 4R7JA 4K36A 1DJQA 3WJSA 3PZSA 3BGKA 2ZBTA 1DGMA 2DDOA 1ICSA 1V5XA 4PCFA 1IGSA 4Z0JA 4PFMA 5CGEA 1AW5A 3EX4A 1Z42A 4ORIA 4ZVJA 1OF8A 2RHGA 2F7KA 4ZQOA 4JIQA 3RQQA 2C3ZA 3IN1A 4M19A 3DKLA 4M6QA 1OABA 3IVUA 3LHTA 3VFLA 2UV8G 3UD6A 3WJYA 1KLZA 2FLIA 2ALDA 4DXVA 1UASA 3LCLA 4RXFA 3W7LA 2JKEA 1IXPA 1MEWA 4LC8A 4KBEA 3S1XA 1C8VA 1LTDA 5EYNA 2Q3OA 5D02A 4UTHA 5DY2A 1LRTA 4UTKA 2ABQA 4O1AA 2PRLA 2ZDRA 1IF2A 3LV6A 3U2OA 1PV8A 1W5PA 3HG5A 1Y0EA 4K7VA 1ME7A 1D3HA 3AJXA 1K8XA 5L6UA 3W7DA 3W2LA 1TCDA 1UB3A 4ICNA 3K5WA 1R47A 3VE9A 2DORA 3EWUA 5FI8A 2XN0A 2W6RA 2E77A 3LHZA 3NNTA 5K4XA 5L9FA 3KEUA 2X16A 2A2IA 5CPNA 4DPQA 4JX5A 4KFOA 4HPXA 2VEPA 1FWTA 1GVFA 4NJGA 3STEA 1KA9F 3KRZA 4ZQCA 1W5QA 2TPSA 1QR7A 1RK2A 2C49A 5CG7A 2VENA 3LHVA 3S1VA 3RRFA 1FCVA 2ABSA 3GNDA 3P5ZA 4RLIA 2NUXA 3N2MA 5HWJA 2B0MA 3W7JA 4TU1A 1TRIA 4ZQRA 1TMHA 2YW4A 1KBIA 1FWSA 1ESQA 2CLFA 3TUUA 1GTHA 3K30A 2AB8A 4PL2A 4E2BA 3DFTA 3DGRA 3IVSA 3HG3A 3TA6A 4S1MA 2OJPA 4TMBA 3CWOX 4LW7A 4YCPA 4QAIA 4ML9A 2DZTA 2YYTA 1TZ3A 5H91A 1J4EA 3W70A 1RKSA 5I3IA 2EGZA 2EPHA 2PRHA 3W86A 2W79A 4KAHA 2CLEA 3G1FA 3TJLA 4O1LA 2QCNA 3Q1YA 3P74A 2QCDA 1SFLA 2QCVA 4M5PA 3B03A 2QDHA 1SSDA 1R2SA 3EWBX 4C5KA 2AA0A 3W7NA 1I2OA 4IPIA 3UMOA 3PSWA 2VEMA 1H7NA 1IXNA 3EB2A 4MLRA 1AG1O 3FJ6A 3NL6A 1GZGA 1W37A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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