3NL5A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
539
structure length
512
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGLVQIREKDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGPDMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPDMVDYIGVGTLFPMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSTKNSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGYSATETRLLLNNKLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSKGTNGTSVEDIPCVAVEAGPIEIMGDITASGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Candida glabrata
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
total genus 158
structure length 512
sequence length 539
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nl5A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nl5A02
3W88A 3EWWA 1TPB1 1VQTA 5H91A 1YPFA 4B8RA 2YW3A 2ZZ1A 1OF8A 4N6EA 1N8FA 4IOTA 2QR6A 4JTHA 1BTMA 1XL9A 4WXYA 3ZR4A 4OWGA 3I7QA 1JXIA 2AGKA 2ZRXA 1G69A 4WQ6A 3K30A 4MKNA 1JUKA 5TBOA 5EY7A 1AL7A 4WXZA 5CZTA 1TMHA 3PY2A 3S5YA 2ZZ3A 4LW7A 1FWRA 5K3VA 1GVRA 3NQDA 3LCWA 2YFOA 1K7XA 5HWJA 4S1FA 3UPWA 4DO6A 2O7QA 2PURA 1MZHA 2PC4A 4LWWA 4AMAA 1Z42A 4Z0JA 3RQ6A 3KRSA 2C1HA 3CT7A 4O1AA 2ZA3A 3BLFA 4HNVA 4IQLA 4UR7A 5FEZA 4LBXA 3O6DA 3ABRA 2CLLA 4JYDA 1G7UA 2VELA 3UXAA 2V2DA 4JTTA 1QCWA 2QCFA 3TW7A 3LXAA 1T99A 1YHJA 2C19A 1B4EA 2NWHA 3GZ3A 1H7OA 3BO9A 2AWDA 3KOFA 4YCOA 3NPUA 3UWUA 4GNJA 3P67A 3QH2A 5D05A 1JJKA 1T8XA 4Y90A 2YYUA 3FHYA 1YTDA 1QAPA 4JX6A 3F4WA 4CQAA 4XZ9A 2J6XA 4O0ZA 3LI0A 1O5XA 1ZHAA 3FEMA 3IRDA 3NQ2A 3UQNA 2P0OA 2DDOA 3P60A 3P84A 4IPIA 1OYCA 4BI5A 2WO5A 2Y62A 2YYTA 3TQKA 5LNVA 5EA9A 1EX5A 2ZA1A 3LBCA 3W83A 3W7GA 3RRBA 1ONRA 2QCHA 2Y70A 3GB6A 2QAPA 2CZFA 1SO4A 5D03A 5BNKA 5FEXA 3NM1A 3T44A 3T55A 4RV8A 4O52A 4XKYB 2C15A 1Q3NA 5L6UA 4E69A 5BOOA 5LGZA 3W7NA 1SR9A 1OYBA 1Z48A 4POCA 3LOOA 2NV1A 2E5CA 1LIIA 4Q4KA 4FNPA 3TA6A 4MIMA 3TJXA 5K2ZA 1DV7A 2E77A 1JQVA 3C3NA 3V1PA 5D2VA 3GYEA 3O06A 4UNKA 1LRTA 4BK9A 2TMDA 1WBJA 1ZAJA 1XFBA 1IIHA 2NXGA 3M6YA 3WK0A 2QCDB 3L68A 4Z0SA 2Y7FA 2H8XA 4MZ1A 3E9AA 5F0ZA 1ZAHA 3A21A 3TMQA 3RNDA 5LGXA 1PCWA 2ZFAA 4PEKA 4QAIA 3RSFA 5K4XA 3I68A 4K7VA 5K7JA 1VLWA 2EHHA 4K8EA 4MUZA 4UTTC 3NC2A 4N9DA 4IWWA 1OJXA 1XDMA 3PR2A 1N7KA 3LOTA 1OABA 3T78A 1G7VA 2J27A 4DBEA 3BW3A 3LBMA 2C3ZA 3PC0A 1WBHA 2DZPA 1GC5A 4UTHA 1XUUA 4ADSA 1VR6A 4AXKA 4N4PA 5CPOA 4HHPA 3QQ1A 1OFBA 3W7OA 1SZGA 4MZYA 2H3BA 3EXRA 4ZZ9A 4UFIA 3LV6A 1FBAA 3RSQA 4DF0A 5CZJA 4GUJA 3NPWA 4ZQMA 1TD2A 1SO5A 2ISSA 3HG3A 3P80A 1EPXA 4XQ6A 3DHDA 5E1QA 4O53A 1XDLA 3STEA 5DELA 1DQWA 3HPZA 2V82A 1RQHA 3NZ1A 4JDBA 1FCVA 1TPVA 4JICA 1A5BA 5KINA 3RQ2A 1BWLA 2X30A 3CWOX 4LOCA 1IXPA 3EEGA 1I2NA 2AQWA 1KV5A 2ISWA 3HOJA 4UMBA 3RQ5A 5G5IA 3QZEA 3W70A 4RJEA 3CC1A 5G4EA 1Y0EA 4LNYA 3DU0A 4R53A 3QW3A 2YGYA 4TMBA 3KRZA 5BMWA 3HIJA 1OK6A 2FDSA 2ZCGA 2I6AA 1JRBA 3VE7A 2VFDA 3TNOA 3W7MA 2FB2A 1DORA 1L6WA 3FHXA 4Y9AA 3PB2A 3LHYA 4LVFA 1TRIA 3LI1A 4WY0A 3LB0A 1NAL1 1GVOA 1GVSA 4O4VA 4LCAA 3UMOA 3PWAA 5AHFA 4UFJA 2RDUA 3DENA 5LNUA 3DFOA 4WZHA 3BK0A 4CLMA 5HUOA 4UIOA 2YXTA 1MO0A 3GIYA 1NVMA 5BYDA 5F2IA 5CG7A 4Z1AA 1TZ3A 1V19A 4I7VA 4S1MA 4N9EA 4FO4A 1IXQA 5D04C 1GYNA 2ISVA 3LCGA 1JCMP 5J5DA 3TX9A 4A2SA 1YYAA 3UXDA 2OJPA 2FPVA 1HO4A 2NXHA 1K8XA 2NX3A 5KMYA 3MHFA 2E6DA 3GO7A 2WV8A 1WOAA 5AN7A 3GLCA 1KM1A 3A23A 5AHMA 3QA2A 3WJSA 5F4SA 5CPLA 1AL8A 2QDGA 3NQ6A 3NQFA 2PRHA 5AB3A 2I5BA 1EWDA 3IQ0A 3TXVA 2BX7A 3W2KA 3W7LA 2CZDA 3CEUA 4EBUA 4OV9A 2V9DA 1FDZA 1B57A 1H50A 1OFDA 4HIBA 4L4MA 3NQ8A 3P8IA 1R2TA 1HG3A 1M5WA 4O1BA 1JCNA 3W1TA 3EX3A 1H5YA 1F05A 4O12A 2Z0IA 2LLEA 1VHCA 2NX1A 3THQA 1X1ZA 2JBMA 4TR9A 4N6FA 4JIPA 4XBKA 4UFMA 3FA5A 2E68A 3SSJA 4UTTA 1LZOA 4FB7A 3T7VA 2J9ZA 3MUXA 2ZDRA 2YXUA 4L4LA 2QCGA 4DPPA 1VYRA 3TCEA 1SUXA 4DF2A 2PKMA 4S1IA 2A7NA 3DKLA 4O15A 1LYXA 3P82A 5CGQA 1QFEA 3QMSA 3W85A 4EOHA 3LJSA 3P7YA 1KM4A 1KFCA 1XC4A 2B7PA 5TQLA 1X8FA 3NC9A 4MY8A 5T26A 4NJGA 1W5QA 2ZTJA 1UA4A 4XF6A 3IGSA 4PTNA 3FKKA 2QJGA 4AHOA 4IMDA 1YLVA 4S2BA 4R7JA 3WK2A 3GNDA 2VFEA 4EUMA 3ZS7A 3IV3A 1QPOA 4K8HA 4Y96A 1GWJA 3RU6A 5EBUA 1GYLA 4KFPA 4M6PA 4PA8A 2ZQ0A 4PL1A 1LRQA 3SJ3A 5HULA 4XF7A 3LCHA 3GDMA 3PUDA 4QSHA 4PC8A 3QSTA 3QF0A 1V1AA 4DPQA 3C2EA 1TTIA 3LHZA 5AYYA 3RSGA 1A5CA 1DGMA 1G4PA 3DI1A 3N19B 3DAQA 1EA0A 1R2RA 2H90A 2J24A 3RLUA 2P1FA 1PIIA 5FF0A 4RZ4A 3UQ6A 2Y6ZA 2ZRUA 1LHRA 1X6UA 3LRKA 2GQ9A 4AVFA 4DO4A 2EPHA 1S3HA 1R30A 5CSSA 5G2IA 3PBYA 1SZNA 2CU0A 2DJXA 1SPQA 3GDTA 1I2PA 1P1XA 4M5PA 5KZEA 2Y63A 2G96A 2FFCA 3W1MA 4KANA 1VS1A 1ZCOA 1KFJA 4O4WA 1KLZA 2XN2A 2CLMA 3EB2A 4JGDA 2VEKA 4J9JA 1Q6RA 1NEYA 1FUYA 8TIMA 1KTNA 2XN1A 1WDWA 3HPXA 4K38A 4LUJA 3B06A 2D73A 4FNSA 3GKAA 3TC7A 3VE9A 2IQTA 3UPBA 3QEZA 2G5WA 1PHWA 3EWUA 4O1LA 1UB0A 5IBXC 1X7FA 4DC3A 2I1OA 3KVLA 1RFVA 4AF0A 3RY7A 3JRKA 1SO3A 2BZNA 2JG5A 5G2WA 3IIZA 3R89A 1PL9A 4DELA 3PSVA 2HSAA 2QCVA 1SQ7A 4FHAA 1FXPA 5DBUA 1OHLA 1K8ZA 3RTAA 4QNWA 5C6MA 4N08A 4IX2A 3RTEA 2I9EA 5HJLA 1MEWA 1QPQA 2C13A 1VK4A 4JIQA 2E5BA 2NUYA 3W7QA 3MWAA 4JYFA 4LS2A 2PCQA 4ORIA 3NCAA 4ALDA 2RKXA 3PULA 4UC5A 1KYHA 4JNMA 3WJXA 3TSMA 4CNNA 4AH7A 3P74A 1YXDA 2DZWA 1ZJIA 3H53A 3LHXA 1ME7A 4FX7A 5I3HA 2ZZ5A 4ONVA 1OX6A 1FXQA 4LUIA 1RZMA 4BR1A 1SZEA 2Q3RA 4PH6A 4TIMA 3EXTA 4EVZA 2HQQA 4OE7A 3DRWA 3RF9A 4P2VA 4CQ8A 4YL2A 3IH0A 1L9WA 2AX3A 4NJKA 4RXGA 3KXQA 2QUTA 3HPSA 3AO0A 5LHFA 2FPTA 1LOLA 4KAHA 2VEIA 2OMAA 3OVQA 3S1UA 3S0CA 4Z08A 1TPDA 1FDYA 2A85A 3PUEA 3W07A 1FWNA 3ABSA 3M5ZA 5FEPA 3TR2A 4MFDA 3B1PA 4TO8A 3CQDA 4LY8A 4YL5A 4Z1BA 3FOKA 2CLFA 1RR2A 5KZMA 2GQ8A 3W9ZA 5FF4A 2GOUA 3TDFA 1PCKA 1YXYA 4ZQPA 1WOBA 1O4UA 1PVNA 4AHQA 2E09A 3O8AA 2JGVA 4UBEA 3LRMA 1QR7A 4AWTA 1WYIA 1ZFJA 2V78A 3IGUA 3HO8A 3W1PA 2YSWA 2B7OA 1BEUA 1TYGA 1ZENA 3P8JA 3M1ZA 4K93A 4NJIA 4ZQCA 1IXNA 2JGQA 2DZSA 3RTDA 2VENA 2VOMA 4O1CA 2YXGA 3FLUA 3KHJA 4U7XA 2E5DA 4NJJA 2DU2A 1O95A 4PODA 4G1KA 3TXZA 3R5EA 2FTPA 3LHTA 3NYZA 4MOZA 3C2OA 1EP3A 2NLIA 3FS2A 4ZVJA 1IIGA 1W31A 2V2CA 3LM7A 5TIMA 4BI6A 3LGEA 5DBTA 1P0NA 3EX6A 3NQEA 2HTMA 3HICA 3LCXA 3W2MA 4GC4A 1O60A 3A24A 5MHBA 4JR5A 3W2LA 3C2RA 4TX9A 3W1RA 3C4UA 4XTIA 5CZ0A 3PBUA 3W73A 3OTXA 1AK5A 1G4EA 1GTEA 1UCWA 1VC4A 3LTSA 3P81A 3W2JA 3O6YX 2JKAA 3ZWSA 3L5LA 4K39A 1LTDA 4O57A 3GO6A 3PL2A 2RFGA 2A5HA 3TKFA 1VH7A 4QNEA 4MY9A 1A53A 5IBXA 4ZQNA 1JQXA 3B1OA 3USBA 3KVJA 4XKYA 2C6QA 1PS9A 3TK7A 3O15A 3O07A 3IE7A 1TSIA 3GXTA 1F7BA 3NNTA 1V5XA 3GR7A 3NAVA 5BRBA 3HG5A 4O8RA 4B5NA 3BG3A 4NVTA 3MP5A 3W6YA 3SZ8A 3S1WA 5L9FA 1DOSA 1DJNA 1WQ5A 1UB3A 2VEPA 1FQ0A 3KZHA 1KFBA 2QCDA 3SGUA 2QAFA 4NU7A 5DY2A 1VCFA 1VCVA 1TQXA 3IVUA 1K7FA 3TAKA 4E3AA 3IBQA 3G0SA 3TW6A 1VZWA 5GVJA 4KKXA 1OFPA 3W7PA 4ZMGA 2Q5RA 2ZA2A 4M6VA 3W84A 1KTBA 4IXHA 2PE4A 5FF7A 2R3BA 5CGEA 3H54A 1M7PA 1Q6OA 4UUIA 4UFHA 4S1HA 3MI6A 4JD4A 4E2BA 3W7KA 2GJLA 2R14A 1HTIA 3G1YA 5CPMA 5AOUA 3W75A 5CZSA 2E6YA 5J5RA 4EN4A 4MYAA 4GWEA 5AFDA 1H63A 1MXSA 3RFAA 3S5ZA 2VFIA 2P10A 1P4CA 4S2CA 3NL5A 3M5VA 3RS8A 4MJZA 1XUZA 4QISA 1WV2A 1ICPA 1JR1A 3PS7A 1K03A 3FJLA 1G67A 5U4NA 4WOQA 5BYCA 4RXFA 3MBDA 3G1VA 4CQ9A 3BGJA 1WAUA 2F84A 1W1ZA 2CZ5A 5C2XA 4LBGA 1FWTA 2DORA 3RQQA 5SWUA 4JN6A 2QKFA 4WJMA 3NA8A 5HR7A 5DN1A 1BWKA 1J5TA 1Q6QA 2VKZG 4E84A 4AEOA 2HW1A 4NQ1A 1DBTA 3QYQA 3W2NA 1AG1O 1DVJA 4IGHA 4ZQOA 4A3UA 2Y88A 2FPYA 1I8JA 4QITA 4FX6M 1QDSA 3KVKA 2YDAA 3EWZA 4UFKA 1ZAIA 3IIXA 3W1NA 5FF2A 3W7IA 4PFMA 4YCPA 3PM6A 3TROA 2TRSA 3QC3A 3BG9A 3H49A 3IVSA 5HINA 4AB4A 3QPZA 2B4GA 3O63A 2ABQA 2VXNA 3HBLA 3S5OA 4XWUA 3UY8A 2CFFA 1I45A 4JTIA 1FX6A 3O16A 3NG3A 3IGXA 2OT1A 1KW1A 1OX4A 2ZRWA 4GE8A 3C56A 3ELFA 5FF3A 1F6KA 3CU2A 4WY0F 3TQ0A 1HUVA 1XCFA 4X2RA 3E49A 3MYPA 2BSLA 4FNQA 5E0KA 3TC6A 3BVJA 1YGJA 1H60A 1EIXA 3GAKA 1VCGA 3WK1A 2HLZA 2BWGA 3LLDA 4KALA 4Q33A 2JG1A 4H4IA 4IMGA 2ALDA 4FNUA 5BW6A 3Q94A 2Q3OA 1YGKA 1W37A 3M5YA 3M41A 3UZ5A 3B0PA 1F76A 1OG0A 4EF9A 3GAYA 1HO1A 4K6AA 4NUWA 3B04A 4R33A 3NO5A 1F73A 3NOEA 4C5KA 1W56A 1TPWA 2O7SA 2WQPA 2VFFA 3HJZA 3CIXA 4MPQA 3P5YA 3KD6A 4HT3A 4LRSA 1R46A 3PBVA 2ZZ4A 4EF8A 2TSYA 1RKDA 2NZLA 1WA3A 1TTPA 1SW3A 3B03A 1XXXA 4C1KA 3B1RA 2DDMA 1H1ZA 4WJEA 1XBXA 4UTWC 3UD6A 2ZZ2A 4UFLA 4JTLA 4YWRA 5LNSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3W88 A;  3EWW A;  1TPB 1;  1VQT A;  5H91 A;  1YPF A;  4B8R A;  2YW3 A;  2ZZ1 A;  1OF8 A;  4N6E A;  1N8F A;  4IOT A;  2QR6 A;  4JTH A;  1BTM A;  1XL9 A;  4WXY A;  3ZR4 A;  4OWG A;  3I7Q A;  1JXI A;  2AGK A;  2ZRX A;  1G69 A;  4WQ6 A;  3K30 A;  4MKN A;  1JUK A;  5TBO A;  5EY7 A;  1AL7 A;  4WXZ A;  5CZT A;  1TMH A;  3PY2 A;  3S5Y A;  2ZZ3 A;  4LW7 A;  1FWR A;  5K3V A;  1GVR A;  3NQD A;  3LCW A;  2YFO A;  1K7X A;  5HWJ A;  4S1F A;  3UPW A;  4DO6 A;  2O7Q A;  2PUR A;  1MZH A;  2PC4 A;  4LWW A;  4AMA A;  1Z42 A;  4Z0J A;  3RQ6 A;  3KRS A;  2C1H A;  3CT7 A;  4O1A A;  2ZA3 A;  3BLF A;  4HNV A;  4IQL A;  4UR7 A;  5FEZ A;  4LBX A;  3O6D A;  3ABR A;  2CLL A;  4JYD A;  1G7U A;  2VEL A;  3UXA A;  2V2D A;  4JTT A;  1QCW A;  2QCF A;  3TW7 A;  3LXA A;  1T99 A;  1YHJ A;  2C19 A;  1B4E A;  2NWH A;  3GZ3 A;  1H7O A;  3BO9 A;  2AWD A;  3KOF A;  4YCO A;  3NPU A;  3UWU A;  4GNJ A;  3P67 A;  3QH2 A;  5D05 A;  1JJK A;  1T8X A;  4Y90 A;  2YYU A;  3FHY A;  1YTD A;  1QAP A;  4JX6 A;  3F4W A;  4CQA A;  4XZ9 A;  2J6X A; 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