3NL5A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
539
structure length
512
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGLVQIREKDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGPDMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPDMVDYIGVGTLFPMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSTKNSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGYSATETRLLLNNKLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSKGTNGTSVEDIPCVAVEAGPIEIMGDITASGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Candida glabrata
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
total genus 158
structure length 512
sequence length 539
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nl5A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nl5A02
5BMXA 2PRHA 1QMLA 3O15A 4QNEA 5G2HA 4EIVA 3QAIA 3CQDA 1YLVA 4K8EA 2AGKA 4A2SA 3WJSA 2E68A 2WNNA 1G7VA 4WOQA 3DHFA 3LJSA 4A2RA 4M19A 4YMZA 2ATSA 1ADOA 3LM7A 1XBVA 3MI3A 4M7TA 3W7PA 3S6DA 4RZ6A 1ONRA 1GVQA 3PS7A 1S5WA 5FEXA 5HULA 2Y61A 2ZRWA 2X30A 3UWZA 1ME7A 3W2JA 5FF2A 3HGJA 4N02A 5DBUA 2YXTA 4Q33A 1LYXA 3T4CA 4MZ8A 3G1FA 1FWWA 4LUIA 3U2OA 4NNAA 1SZGA 1Q45A 4FNSA 1QPQA 3NBVA 3GDLA 5D2VA 4O52A 3KEUA 3JR2A 3R2GA 3UYCA 4FX8A 1TPWA 5CZJA 5AC7A 1SUXA 1JXIA 2BX7A 3TAKA 4FO4A 1SU5A 3HG5A 2GJLA 4A3UA 1HO1A 3UMPA 3LCXA 4AF0A 3LLFA 1IXOA 4PA8A 3LCGA 1KM0A 1M7PA 2RBCA 3I6RA 4JXCA 4DO4A 4CQ8A 1H51A 2VARA 5F4SA 2WO5A 1A5SA 1MZHA 1PS9A 1I2RA 2CZFA 3FJLA 3GAKA 4FX7A 1N8FA 3NZRA 4MOZA 3A23A 4K8HA 1L6YA 1JRBA 1QWGA 3PB2A 2QDGA 2YW4A 1VRDA 1KTNA 4X22A 3G1YA 2A0NA 3RT9A 2GVLA 3MP3A 4H6KA 4JTHA 2EF9A 2C1HA 1H7PA 3M44A 4OWGA 5C54A 3BW4A 3HJZA 1OG0A 1TMHA 3LRMA 1M5WA 3TW6A 3LGEA 4IMDA 4K7VA 4UMCA 3EB2A 5FI8A 2Y70A 1SW3A 3WJZA 3IGXA 4HT3A 1OX6A 3RO4A 2GVJA 2HTMA 4HPJA 3TW7A 3UQDA 3L0KA 4JX5A 4UTKA 1F7BA 3G0XA 1OK6A 1QDSA 1T96A 1BKSA 5F2IA 3B1RA 1VR6A 4JDYA 3I3YA 2ZZ1A 5A5WA 4E2DA 1LBLA 1K02A 1UUOA 1I8JA 2E6FA 3O8AA 3GNNA 4N6FA 3IVUA 5TRWA 4XBSA 5AC6A 5BOOA 4NX0A 4TR9A 3SECA 4NJIA 1LIKA 2B4GA 4R7JA 2JG1A 3TU9A 5HWJA 1P4CA 5D2XA 3UQNA 4N2YA 4C5LA 1ZAIA 2H3DA 3PR2A 1X7FA 2ZZ2A 5KZDA 3HO8A 2Q8LA 4WJEA 3HMJG 4N9DA 2Q3RA 4MFDA 3PBVA 1QAPA 2ABSA 3STEA 5KINA 1JCLA 1ME9A 4DF0A 5MHBA 3K9EA 3TAOA 4LW7A 3P80A 4GE8A 4S1IA 2ZBTA 3RTAA 3TSBA 5CPLA 3QF0A 4UTMA 1JULA 3MBFA 3QRHA 4O1AA 4DF2A 2FB2A 3JULA 4JYFA 3HGOA 3GK0A 1LHPA 2V2CA 1EUAA 3K30A 4ZL1A 2DZXA 1WV2A 1V1SA 4O50A 3KVJA 2JKPA 1HUVA 4I7WA 2JGYA 3IV3A 2QUVA 3TE9A 4OGZA 3EWUA 3PL2A 3KAOA 3VFLA 1THFD 5AFDA 3TJXA 5CGEA 3PB0A 2C13A 3IIOA 2D73A 5I3GA 1K7EA 3VASA 1IIGA 1KBIA 3PUDA 1GQTA 4M7SA 4AWUA 2ABBA 4MLRA 3DAQA 4TIMA 3NL2A 3S0CA 4E8ZA 1LRQA 2DZTA 3USBA 1KTBA 3W1XA 2CZDA 3G3MA 2FDSA 3T40A 3TV8A 3NQ7A 2J27A 4KADA 1KFKA 1KM6A 1H7NA 2C14A 1VYPX 1TCDA 4C1KA 4ALDA 1H7OA 3KHJA 3M7WA 2AWDA 3B0PA 3CIWA 4BFAA 3CC1A 2VFDA 3EX6A 4A21A 4Z1CA 4DPPA 2DORA 2BWGA 3PF3A 3SZ8A 4HNNA 5AHIA 1W1ZA 3QW4B 1DQXA 1W3TA 4RK8A 3OVPA 1CW2A 2V82A 2Y62A 5BMWA 3E96A 2YFNA 3W1LA 3R89A 1KM4A 2Y89A 4NVTA 2I14A 2DDOA 3OHIA 2ISVA 4OE7A 1FY6A 3W70A 2Z1BA 3NQVA 4LBGA 2WV8A 2ZTJA 7TIMA 2PKKA 1TIMA 2C6QA 4POCA 1ICPA 4UNLA 1TTQA 3NQ2A 2YDAA 3W2LA 2W6RA 3KRSA 2OMAA 1VHNA 3TIMA 3N9RA 2KZHA 2C3ZA 2GPTA 3M5YA 3E02A 1UCWA 2F7FA 3QMRA 2PC4A 1FXPA 1NAL1 1F6PA 3KRUA 3TFXA 3HPSA 2AJPA 4IX2A 2ZRVA 3KVMA 1XXXA 1MSSA 3LHZA 2DCNA 3UBOA 2V78A 1YGKA 3LHYA 4MY1A 2NX3A 3UY7A 3CT7A 3B04A 3DGRA 4LT9A 1RR2A 1Z44A 4Z0SA 5F4XA 3T78A 3THQA 3VCRA 1DGMA 1TTJA 3IKHA 1JQVA 3W7KA 1XBXA 4FIRA 2W0UA 3NPXA 3O16A 1S3HA 2E09A 3RRFA 1BWKA 3BARA 3PBUA 3UNDA 1TPC1 2ZQ0A 3WK1A 2C19A 1GG1A 2CU0A 4K9IA 4EF9A 3BLEA 4MJMA 1OFOA 2H6RA 3GBUA 3IVSA 3GIYA 3LTSA 3DHDA 5BYCA 3TR2A 4HHPA 3W76A 5C6MA 4O10A 1SQ7A 3PAJA 4Q32A 5G5IA 1GC5A 2VELA 2BXVA 5E0KA 1AMKA 1GYNA 3IQ0A 3Q92A 4MYAA 3MBHA 1A53A 2ATMA 1QPRA 3L0NA 5L6UA 3MYPA 3KRZA 1SPQA 3RS8A 3JRKA 3LX9A 2NUXA 3VAQA 1F5ZA 4ONVA 3THAA 4KBEA 2QJGA 1WBHA 3O6CA 3O6DA 3P62A 1EB3A 3GKFA 4HIBA 4UXDA 5F0ZA 3MHUA 3G0SA 1XCFA 2WPBA 2Y63A 4N4QA 3DU0A 4Y96A 5FEZA 3RU3A 2CLIA 2EAWA 4NJJA 3QPZA 1JUKA 3BLIA 4KWWA 1G67A 1P0KA 3LTYA 1OX4B 3TC7A 3EXSA 1GVOA 4O28A 3S1VA 3LLDA 3IEBA 5EPDA 5D30A 4JN6A 3KVKA 1SFLA 3GDRA 3TDFA 4LBXA 1TYGA 2DZSA 3N3MA 3N73A 4K8CA 1K3UA 4GWEA 4AWTA 3W1AA 4AH7A 3C2VA 2ZZ4A 3W23A 1MO0A 1UJPA 1PIIA 1EP2A 3DFTA 3N1CA 4S2CA 4H4IA 1OJXA 1FDZA 4ZQRA 2Y6ZA 5FF3A 1GYLA 1ESQA 4FNQA 5DCBA 3IIVA 3C8FA 3C0JA 4X8FA 4O0KA 4YLWA 1H60A 1KM3A 2E6DA 2E5BA 2CLOA 1LOSA 2J88A 4ZQMA 4DU5A 4JTIA 3G1AA 2J24A 3OA3A 4PTNA 3STGA 3UWWA 3H54A 3INPA 3GDTA 5TQIA 3RQ6A 4YCOA 3P7YA 1U83A 3VNDA 1L2LA 5TBOA 3MI6A 4ORMA 2FQIA 3TJLA 2YPIA 4E84A 4MLJA 1HG3A 1PV8A 3KXQA 4S1MA 5CZSA 3HQ1A 2NUYA 4MPQA 3M1ZA 3F4NA 4QAIA 4UR8A 3PSWA 2QCVA 5EKYA 2RDTA 3LXBA 1OFQA 4C5JA 4PCFA 3W7HA 1YDNA 2A7PA 3F03K 3HG3A 1FDJA 1UB0A 5LHEA 1DL3A 3LCWA 4E69A 1BTMA 2E5CA 3P82A 2CLFA 3A21A 4LS0A 3LCFA 4CQAA 4IMFA 3NL6A 4OT7A 3HG2A 5CKSA 5HWMA 5D02A 2TRSA 1KFLA 4JTLA 2FPVA 3SR7A 3QH2A 2ABAA 3W1QA 4ADTA 1K8YA 3KVLA 4ZQOA 2VENA 4PVVA 1JCXA 4C5KA 5C40A 1NFBA 4JR5A 5EY5A 2JK2A 3A22A 3DFPA 3N2MA 1LIOA 3LKIA 5HINA 2QAFA 1MXSA 2QUUA 4DO6A 3W7JA 4AXKA 4DXVA 3SY5A 4DBEA 1RFTA 3NG3A 4QJ1A 1I2QA 3C4UA 3FYOA 3NPVA 2O7QA 2VFIA 1Q6OA 1QPNA 1WBJA 3GDMA 3H74A 1X1OA 3ZR4A 5LGZA 4KFNA 1LDCA 3MMTA 4O54A 5I3IA 4RX0A 3RSFA 3LHUA 1T0OA 4EVZA 4HNVA 5FF0A 4WUIA 3IGUA 4AMAA 3L5MA 3VE9A 3TQ0A 1JUBA 4IXHA 1FWTA 3P74A 4LC4A 3LCLA 1V19A 4WXYA 3LHXA 1YTDA 2NLIA 3DZ1A 4K6AA 4GUHA 3LI0A 3CEUA 2CZEA 1ICQA 3L65A 3NQGA 1GJPA 1FQ0A 1IGSA 3LHTA 4M5PA 2A4AA 3TQVA 3D0CA 4WJMA 3RSQA 2V8ZA 4OU1A 3PSVA 4GXMA 2FIQA 1KW1A 3PULA 3LOTA 5J5DA 4CCEA 3NQCA 1G7UA 1PCWA 3LCIA 1KFEA 1BEUA 4H3DA 2CZ5A 4K36A 8TIMA 4RKAA 3KOFA 1VQTA 3GNDA 2C18A 3NL5A 4FNPA 2Z6IA 5HJLA 3W2KA 1KFCA 1L2UA 3C3NA 3MO7A 1GVFA 3QMTA 4N6EA 1TPEA 4BWLA 4KANA 2OT1A 3FYPA 1OHLA 2ZDRA 4DO5A 1FWSA 3DH7A 3IN1A 1LROA 5FESA 5DY3A 1J4EA 3P60A 1VGAA 2V2HA 2H3BA 1KBJA 3PZSA 2ZA2A 2Q8ZA 1Q6QA 1I2OA 1FCBA 3R8RA 2PRMA 4PEKA 2Q5RA 3A9IA 4UTJA 1G4SA 5LNWA 1MEWA 3NVTA 2DJXA 3Q2DA 2R3EA 1VPXA 3CB8A 3MI2A 4XQ6A 3QZEA 2E77A 3ABRA 1CI1A 1X8FA 3O63A 3L9CA 4LS1A 4AHOA 3LB0A 2PKFA 2QCDB 1AG1O 3SGZA 4QISA 3IIZA 3NR0A 3RT7A 4XUGA 4NNCA 1ML1A 3UWQA 2RH9A 1FBAA 1A5BA 1JCYA 5KSWA 3M6YA 3PWAA 5KZEA 3EWZA 5CPOA 3STCA 4EBUA 3I7RA 4BI5A 4Z0JA 1OFDA 2LLEA 4IMCA 1NEYA 3HICA 3TMQA 4JY8A 2YSWA 1R46A 1E51A 2NXHA 5G2IA 5I3JA 4E8WA 3MHFA 4CQ9A 3RTBA 1FDYA 3ATZA 3LV5A 3SGUA 3S5OA 4JTJA 1DJNA 5BYFA 1LORA 4OHQA 5K3VA 3EWMA 4NJHA 1XDLA 1VZWA 1W5MA 4JTSA 4YWRA 2E5DA 1OF8A 2H8XA 5I3KA 1XBZA 2Y7GA 2BTMA 1WOBA 3NBWA 2GQ8A 3W7IA 5IM51 3EX1A 4ICNA 3QPYA 3TX9A 1LIIA 3CIXA 4FEZA 1Z41A 2WNZA 4NXKA 1XL9A 4UC5A 2NV2A 4ZQCA 1EA0A 2A9YA 2B7NA 1DVJA 2Z2UA 3BW2A 3W75A 4K8TA 3TH6A 5FF7A 4W9TA 3UWUA 3W1PA 3WK0A 3UPWA 4Z1DA 1B3OA 3V75A 1HO4A 3L21A 4TU1A 5AHFA 3B3LA 5D04C 2FB3A 2RKXA 1MEIA 3NZ1A 1EKQA 4C5NA 2PCQA 4UTUA 1EEPA 3LXAA 3N34A 4O4VA 3CQ0A 3FS2A 1O95A 1H50A 3MYOA 3BPWA 5AHMA 4MZ1A 4JTFA 5BYDA 5LNUA 3FLUA 3ATYA 1EKKA 1OYBA 4E0CA 1U5JA 2ZRUA 3OIXA 1TTIA 1LM1A 1OFBA 4O1BA 3FOKA 3GYEA 1OX4A 4RZ4A 3A5FA 4MY9A 1TQXA 1OFEA 3W7QA 3Q1YA 3MP5A 2PRLA 2Q3OA 4R34A 1AW1A 1RKDA 2GJNA 1AW5A 1D3GA 3GR8A 4JGDA 3RQHA 3NQMA 1O60A 3W72A 1EWDA 2YYTA 3IRDA 2ZRYA 1QO2A 4I7VA 4XKYB 1SR9A 3EKZA 4N9BA 1LHRA 3L5AA 4JKSA 3B03A 3TUUA 1V1AA 3RFAA 5BYEA 3QEZA 3NXFA 3QC3A 4O4WA 4LVBA 1TPH1 2ZCGA 2R8WA 4UFKA 3FKKA 3N9SA 4LUJA 4QIUA 2GQAA 2DJLA 4FIQA 1DHPA 4O1LA 3GXNA 4NT0A 5C41A 5AYZA 3NQEA 5LNSA 4LC8A 2A6NA 3LHWA 1ZAJA 3HYOA 5BNKA 2QCGA 3LV6A 2I5BA 3VI2A 3E9AA 5AHEA 1YTEA 2ZZ3A 3DKLA 3RTEA 1B57A 2ISWA 3DI0A 2RDUA 1SW0A 2J6XA 3P5YA 4WY0B 1FWRA 2W79A 3EX4A 4GNJA 1WOAA 1UB3A 1F2JA 2A5HA 1ALDA 2V30A 5F1VA 3L66A 3EWXA 2BSLA 2DP3A 3W1MA 3A5VA 2C0AA 1XUUA 3KX6A 1NVMA 4K8PA 5IBXC 1TZ6A 4DF1A 4U4MA 1AK5A 3I68A 1VCFA 4CNPA 3BK0A 2NV1A 5D33A 1QFEA 5EY7A 3E49A 1TO3A 3MUXA 3RNDA 3IBQA 4KFOA 1HL2A 1I2PA 5TQLA 3OBKA 2QHPA 1GEQA 4DPQA 3QSRA 4Z1AA 4LRSA 4UTLA 5KITA 5G1YA 3QJAA 1TPUA 1LLZA 4AWSA 3QMSA 1JCMP 3DFSA 4FXRA 4X2RA 3PM6A 2X16A 3B1OA 4WY0F 3BG5A 3TMLA 1OX5A 2NUWA 1TPVA 4S1FA 3PUEA 2R3BA 2A2IA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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