3NL2A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
539
structure length
505
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGVTLVQIREKDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGPDMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPDMVDYIGVGTLFPTMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSTKNSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGSATETRLLLNNKLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSKGTNGTSVEDIPCVAVEAGPIGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Candida glabrata
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
total genus 166
structure length 505
sequence length 539
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nl2A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nl2A02
1F05A 1LRNA 1TQJA 3SECA 3GZ3A 2TYSA 3OHIA 3Q58A 5AHMA 2Z6IA 4K7YA 4LC8A 3GDKA 3PUDA 3NL5A 4MZ1A 2FFCA 1EEPA 3CB8A 3ANYA 1OF8A 4DPQA 5G5IA 4UTLA 2GQ9A 2CU0A 1YTDA 4PFMA 1SPQA 3NDOA 1G7VA 3F4WA 3O07A 5EYNA 4ZQOA 3QMSA 5U7SA 1TZ3A 3W7RA 4RZ6A 1R2SA 4Y9AA 1YDOA 5KINA 2CZFA 1A50A 2ZRZA 4O1CA 3PSVA 4E0CA 1MEWA 2CZDA 4MZ8A 1SW3A 5KMYA 1W8SA 4LV4A 3IIZA 2V2CA 2ISWA 1I4NA 1JVNA 2CLFA 3C2RA 1EPXA 4IOTA 3P81A 3V1PA 1W5QA 3NQ6A 4UTHA 3BG9A 6TIMA 4ZL1A 4AH7A 5DN1A 4O10A 1D3GA 4DF0A 4H4IA 4LOCA 3L0GA 4C5KA 1TREA 1TTIA 4Y96A 3R2GA 3W7JA 5DBTA 4KWWA 1R2TA 1LP6A 3G0UA 3RTEA 2A6NA 2W79A 3P62A 5BOOA 3OIXA 1EP1A 4O50A 3W6YA 3W1AA 3RT9A 1IF2A 2QDGA 2NXIA 1VYPX 2FPVA 1UUOA 1IIGA 5CPLA 1WV2A 4GRSA 3UXDA 3NQAA 5AHEA 4JYDA 3TC7A 4UTKA 2V5BA 2ZYFA 4MJMA 3I3YA 2Y7GA 5L9FA 5D30A 4WJMA 5CZ0A 4XDAA 2WV8A 1QPRA 2YW3A 3C3NA 3UWZA 3IBQA 4E8ZA 3CPRA 3UWUA 4JTIA 5TBOA 2AA0A 3QA2A 4MKNA 1Q6QA 4X22A 3KTNA 3WK3A 5AYXA 3BG3A 3HGRA 3KRZA 1UASA 4JXCA 4LU0A 3UY8A 3QRHA 1G4PA 2CLHA 1O60A 1OFEA 4S1IB 1OYBA 2OCZA 1TCDA 3GLCA 2F02A 1OK6A 2YFOA 3ABRA 5MHBA 3N2XA 4EN4A 3M16A 2FB2A 2Y61A 1KBJA 3OTXA 1SW7A 4C1LA 3RT7A 3QEZA 4FNPA 3SGUA 1C8VA 1BWKA 1OVDA 3LHVA 3NR0A 1LIIA 4JTEA 3NQMA 3TKFA 3A5VA 1PHQA 1PCWA 1OFOA 3W7CA 3DHFA 3NQ2A 4YLWA 3QQ1A 1QPQA 3ZWSA 3MJYA 3NQCA 4AVFA 4WUIA 1I2NA 1J4EA 5LZLA 1SSGA 3A24A 3STEA 1GVOA 4IMGA 2Q8LA 2QJGA 2V5LA 3B4UA 5DLCA 2TSYA 2KZHA 2BTMA 5TIMA 3L66A 3PF3A 1C9DA 4N6EA 3C2EA 5A8GA 2ZRWA 5J5DA 4IPIA 3T55A 1TTPA 3C56A 4HHPA 2YCEA 1AL8A 3IQ0A 3S1XA 3O06A 3DKJA 1V5XA 2GUUA 5LNVA 3WK1A 3L5LA 4NXSA 3DFQA 1F5ZA 4YL2A 1A5AA 4ZVJA 4WJEA 3LGEA 4OQVA 2ZZ1A 1HUVA 1SFJA 2NX1A 5C3YA 2Q8ZA 5B6AA 5E93A 5H91A 2E5DA 4P2VA 4NJKA 1M5WA 3CEUA 2Q5RA 4O1DA 4TIMA 4TMBA 1YXYA 4N9DA 4GNJA 4HIBA 1TSIA 5CSRA 1SUXA 4LRTA 3RPZA 3RSSA 4CNPA 3HMJG 1I8JA 2R91A 5E1QA 2WSYA 1LBLA 2QCLA 5TQIA 2YXTA 5TRWA 3EX4A 3HG4A 2P0OA 3PVFA 3W7HA 1H5YA 4JKSA 3PR2A 4Q4KA 1DBTA 1DORA 3LTPA 4FX8A 1L2UA 3DBPA 4JTGA 4AF0A 2ISSA 1J5TA 2QEZA 4NZFA 4MJZA 2EHHA 2WNQA 3DENA 4XF7A 3O15A 2H3DA 4K39A 1T99A 1JCJA 3UQ9A 3CQ0A 1FX6A 3CLMA 3GDRA 4Y8FA 3UYCA 1LIKA 3B1PA 4A21A 4O15A 1C3QA 3MP5A 4HT3A 5CG7A 1A5BA 3TXVA 1UA4A 3HIJA 1LOSA 3PBYA 3TQKA 3E12A 2HS6A 4K38A 3DXIA 1TPFA 3H74A 1B57A 2HS8A 2CZ5A 1TD2A 4K6AA 4XUGA 4S1HA 3EX2A 1RKAA 5F2GA 5D02A 3W87A 3O63A 3BLIA 3WJSA 3W07A 2EKCA 2ZTKA 5LNSA 2NWRA 1TPB1 3S8HA 4NJJA 3EWMA 3QQ0A 1S5VA 4QJ1A 3G0SA 2CW6A 2ZDRA 3EXSA 1T8XA 4TR9A 1JRBA 3LBCA 3W74A 5HR6A 2E68A 4LBGA 3CWOX 4WQ6A 4OT7A 3I7QA 2QUVA 1HTIA 3NO5A 4WY0A 5LNRA 2A21A 1Q6OA 3A9IA 3TNOA 5F4WA 3LCGA 1U83A 3B1RA 3B3LA 3RO4A 1LYXA 1R30A 4Z0JA 2DU2A 1IXNA 4DO6A 1ADOA 1XBZA 4WD0A 2AJPA 5DBUA 2JKEA 3HGJA 4RZ4A 4AEOA 3PY2A 3BARA 3EKZA 3CM4A 4O53A 4C5MA 3MWAA 2ZQ0A 4OE7A 3RLVA 1ONRA 3RNDA 5LGXA 2DDOA 4L4MA 4YMZA 1GVFA 3LV6A 3TUUA 4NVTA 2OX1A 3W70A 2VFFA 3BLEA 2RBCA 2A6LA 1WX0A 4U7XA 4M19A 1BWLA 2E1DA 1GZGA 4FNSA 4WX2A 4UUIA 1H61A 4A3UA 1JCXA 4LVAA 4X8FA 1TO3A 4Q33A 2YDAA 3DFTA 4RK8A 4K8KA 1LOQA 2PKMA 3C52A 4JJPA 3W86A 3EXTA 4BR1A 5FF7A 4Q32A 4XWUA 3TC6A 1X1ZA 5C41A 1W5OA 5IBXC 4UFKA 1SW0A 2CFFA 1OYAA 1JXHA 4EBUA 4N9EA 1H1YA 3U8GA 4FXRA 5KZEA 2C6QA 1EP3A 4MY1A 1P0KA 3SI9A 3MP4A 5LKYA 2ZA3A 5AN7A 5G4EA 4FHAA 5G4WA 4UTUA 3W73A 5C5YA 3C4UA 5HWJA 3PL2A 4C5NA 4ADTA 5HQEA 4IJBA 5FEWA 1OJXA 2D73A 1DKWA 1IGSA 3C0JA 3E9AA 1SO6A 1S3HA 1UCWA 4JTUA 1AW1A 3LTYA 3TX9A 5AC8A 2VKZG 3BGKA 3RQ5A 4FNQA 3HGOA 1WQ5A 3FYOA 4FX7A 4CCEA 1WBJA 3R13A 3S9YA 3WK0A 4AWSA 1D9EA 5EKYA 4AAJA 3TW6A 2A1YA 5DCBA 1I2QA 5EL1A 4PL2A 2J24A 4QQ3A 3C2VA 4D2JA 5K7JA 5C2XA 3PB2A 3W7EA 3LDVA 2J9YA 4HNTA 1W0MA 1Z42A 5SWUA 3S5NA 3GXNA 4Z1CA 2X1UA 3PSWA 2EPHA 3KX6A 5D37A 3H49A 3BLFA 1WXJA 4UTIA 1EKKA 1TJRA 1FDYA 3O1NA 4JTLA 1Q45A 2ABAA 2ALDA 4HN4A 2C49A 1VGAA 3PS7A 1UB0A 4WY0F 4NQ1A 3OVRA 3M44A 3HF3A 4LVFA 1LTDA 3DI1A 3STGA 2NWHA 5D05A 1P4CA 3CEPA 6ALDA 2QJIA 4AHPA 3GX9A 4RCXA 3WJXA 4M7SA 4JD4A 2ZZ7A 4CLMA 4FNUA 3W1RA 5LSMA 3EWXA 1WBHA 3BO9A 1PS9A 3THQA 4YWIA 4Z1DA 3P8IA 1EB3A 4GUJA 4XTIA 5DY2A 5K9CA 3RQ6A 3TFCA 1OX6A 1ZJIA 1SZGA 2RDTA 3IVUA 5F2IA 2VARA 1UJPA 4IQLA 1SSDA 5FF0A 1VCVA 4ZZ9A 2F7KA 2PURA 2V2DA 4O52A 3V75A 4NX0A 1XM3A 4C5JA 3CIXA 4UTWA 1VC4A 1SO3A 3UMPA 1GPWA 3NZ1A 3W7LA 4PEKA 1KTCA 3W7KA 3E49A 3W7GA 3MO7A 1HO4A 2PE4A 1FWWA 2Z1BA 3BW3A 3B1OA 3FEMA 4NX5A 4ZQCA 3LCXA 3KVLA 5D04C 3I65A 1LRTA 5HUOA 1NF0A 4XBSA 4KADA 1VM7A 4RJEA 1LDCA 3W1LA 1YGJA 3RY7A 1H62A 3RQHA 4YCPA 1KM2A 1L6YA 5HUPA 3L0KA 2AQWA 4GFSA 1LROA 3NL2A 4LS1A 3E96A 3IRDA 2F84A 2HMCA 3TSMA 1L2LA 3TSDA 3TAKA 3FA5A 2C1HA 1RFTA 2I5BA 2C15A 3LBMA 2HTMA 3G8RA 4ADSA 3RS8A 3MBDA 1R2RA 2G96A 3W2NA 4R7JA 4QSHA 1IXPA 1KM5A 1W1ZA 3TCEA 1ZFJA 3P61A 4K8PA 3P7YA 4O57A 3IGSA 3TMLA 2A5HA 3GNDA 3KRSA 4M6VA 3GIYA 1F6PA 2QJHA 4OV9A 1PVNA 2CLEA 5CGQA 1NEYA 3FIGA 4DPPA 3TR2A 4ONVA 1FCQA 2Y63A 2YXGA 3RREA 5CZSA 3AO0A 1JCNA 4RR4A 5EY5A 3M5VA 1PL9A 5HINA 4JGDA 4MZYA 4YWRA 1G4TA 4ORIA 3R5EA 1E51A 2CLLA 3W7DA 4R33A 2EAWA 3MP3A 5FEZA 3EB2A 4O16A 2E6FA 3S5YA 4JYFA 2VOMA 5ABTA 2J9XA 3PZSA 4QNEA 5A5WA 3MYPA 4JNMA 4O11A 4O17A 3QH2A 1RFVA 2Y7DA 3RRJA 4X3ZA 3S6DA 5CGEA 3ZFHA 1H1ZA 1H7OA 4HNNA 3M47A 3CWNA 2NZLA 4PTNA 5FI8A 2ZA2A 1THFD 1JJKA 2QHPA 1CW2A 4HPXA 1EUAA 4BWLA 3VASA 3B03A 3LV5A 2Q3OA 2CLOA 2X1SA 1GVQA 4N4PA 4HPJA 4S2CA 3A5FA 4DF2A 3EWYA 4WZHA 1A5SA 3ZS7A 1DV7A 1SQ7A 3FKRA 1IIHA 1YDNA 2CLIA 3JR2A 2DZVA 1ZALA 2I14A 3W7PA 5AC7A 2TMDA 4OGZA 3LOTA 4R34A 2JG1A 4IX0A 5K4ZA 4DXVA 1XDLA 3C2OA 3MI2A 4UR8A 4XCKA 1F73A 1G6CA 2V9DA 4LTSA 3NQGA 4O0KA 1RKDA 3S0CA 3G8EA 5CZTA 1DJNA 4QAIA 1B4EA 2WNNA 4QITA 1LRQA 2V78A 4O0ZA 3IE7A 3N19B 1FUYA 3QC3A 1ZAHA 4KKXA 2PKFA 1XFBA 2BX7A 4XZ9A 4JDYA 4PA8A 3IIVA 1QOPA 2UV8G 1H63A 1ZAJA 2QAPA 3B04A 2RHGA 5F11A 4O4VA 3C6CA 2QCCA 4DF1A 3DRWA 3G1AA 1T96A 1KTNA 5F2MA 3W7IA 3U6WA 4B8RA 4Y6GA 4ZQPA 1MSSA 2EF9A 3ELFA 3F03K 1X1OA 2E09A 2H8XA 5TQLA 3ZR4A 1LIOA 5CKSA 1U5JA 1KV8A 5K4XA 2PCQA 1PHWA 3WJYA 3RQ2A 3JRKA 5HULA 2B0MA 3F4NA 4IGHA 1KW1A 3DH7A 2PKKA 3HPDA 5BMXA 5FEXA 4PCFA 1X7FA 3SSJA 2VEKA 3M7WA 3S5ZA 1KA9F 1QPNA 4GUHA 3NG3A 4N08A 4W9TA 2GOUA 3P74A 3FLUA 1RVGA 2Y70A 2DZSA 3IIXA 4XKYB 4LWWA 2EGZA 5CGAA 1FWNA 3NQEA 5LNUA 3L5MA 2RDWA 5FF4A 1XCFA 4UMBA 2YYTA 4Z1AA 4OU1A 5H2ZA 3H54A 3O6CA 3FJLA 3Q1YA 3KRUA 2YSWA 3B1QA 2R8WA 2CZEA 3TDFA 2A2IA 1W5PA 4GUIA 1VHCA 4JTTA 5BRBA 1TV7A 1K8YA 3B8DA 5BW6A 3NQVA 3T44A 4UC5A 3HPSA 4O12A 4UTTA 4AWUA 2E6AA 1TTQA 4OHQA 5G1YA 1OYCA 3LRKA 3EWBX 3S42A 1GTHA 1KFLA 1FXPA 5HWNA 3NYZA 3I7RA 1GVRA 3P82A 1JCYA 4M6PA 1QPOA 4KALA 3G1YA 3NM3A 1G69A 3W2MA 3TAOA 3G18A 3QSTA 2W6RA 4C1KA 1JCLA 1KBIA 2FTPA 3EX6A 1TYYA 3RU3A 4E84A 3W1UA 2B7OA 4JTHA 2BWGA 1ME7A 4GWEA 4K93A 2QCDB 4WXYA 4ALDA 1EWDA 3NQFA 3T4CA 2FJKA 1YXCA 3W7NA 1G7UA 1UUMA 3INPA 5J5RA 2H3BA 4I7UA 4A29A 3NC2A 1H7PA 4E2DA 2P10A 1SZNA 4O14A 3H55A 5C6MA 3QPZA 3QW3A 4JIQA 1VPXA 3LCIA 3W1MA 4CCCA 2DZPA 3LM7A 3W9ZA 3S1WA 3KEUA 4LW7A 3IGXA 3P67A 2VEPA 3LI0A 2I1OA 4EUMA 3SZ8A 3M6YA 4ML9A 3GO7A 1W3NA 3DU0A 4MVAA 3RSQA 5FF2A 4HSOA 5LNWA 2TRSA 3LHWA 1R46A 1WOAA 2OMAA 1BX4A 4EIVA 4AB4A 2PRLA 5D2TA 1V1SA 2G95A 2WSRA 4ZQRA 1V19A 1EIXA 1EX5A 2QAFA 3IVSA 4CQ9A 1D3HA 1GG1A 2H90A 3UBOA 3B0PA 4LVGA 1O5KA 1OX5A 4A2RA 2E5BA 4FEZA 3W72A 4POCA 1W5NA 2PRHA 4S1IA 4X2RA 2A9YA 1ALDA 4K36A 4HKPA 1MEHA 3W88A 3IGUA 1PCKA 1M6JA 4N9CA 3QAIA 3BVJA 3NZRA 2A4AA 1W5MA 3W23A 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