3NL3A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
539
structure length
513
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGVTLVQIREDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGPDMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPDMVDYIGVGTLFPTLTKKNKKAPMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSTKNSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGYSATETRLLLNNKLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSKGTNGTSVEDIPCVAVEAGPGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Candida glabrata
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
total genus 164
structure length 513
sequence length 539
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nl3A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nl3A02
4CNPA 4S2CA 4PC8A 1OYAA 1Z48A 1I8JA 4N08A 5AFDA 2JGYA 1W5MA 2QAFA 5KZEA 3OVPA 1ZJIA 3G8EA 2QJHA 3BARA 1LOLA 1RFVA 4PL1A 3NZ1A 2JGQA 3O16A 1RK2A 4ZL1A 4JTFA 4MZ1A 1K3UA 1JVNA 3H54A 4LVAA 3W1AA 5CSRA 2KZHA 4BWLC 1GT8A 3QRHA 4JTGA 3NQ7A 3PWAA 2A2IA 1E51A 2CZFA 2NXGA 4LUIA 1WX0A 5F4SA 1KFKA 3BF5A 4JX5A 2NLIA 1H1ZA 3IE7A 1I4NA 1ZAHA 1QAPA 3CEPA 3L5AA 5CM5A 1OFAA 3PB0A 3Q94A 3TXZA 1ZAIA 4JNMA 3S5OA 4O52A 2YW4A 3ANYA 1OFEA 2OX1A 2QAPA 2FJKA 2CLOA 3KFTA 3G1VA 4DF1A 3LX9A 3N14A 3VASA 3EX4A 1YPFA 2HQQA 1IGSA 3MI3A 3L0KA 4WD0A 1VK4A 4AWSA 3L9CA 2NWRA 3DI0A 3W1RA 3C6CA 4M5PA 4WY0B 5D2TA 3C0JA 1O5KA 1W5OA 2B0MA 2J88A 2VC6A 3GXTA 3MP4A 1W31A 1R46A 2ZTKA 3G1XA 4JTEA 2HS8A 4UFLA 5G2IA 2QDGA 3SGUA 4M6PA 4UTMA 4IMEA 3MI6A 4O16A 3M44A 3W7QA 4O4VA 2ZRVA 4UTTA 3LI0A 5D33A 4DBDA 4RLIA 4WQ6A 3LTSA 1K7FA 1XM3A 3C52A 3C8FA 4MLRA 2AJRA 4R34A 3PM6A 5D30A 3RNDA 4N9CA 4K93A 2FIQA 1EUNA 4LC8A 3B1RA 4EN4A 3W72A 2A7RA 3GK0A 3ZR4A 2VFDA 1I2RA 1VJIA 4Q33A 5E1QA 5HWNA 2YYTA 1RPXA 4JKSA 2HS6A 1O5XA 2PURA 2ZRYA 4UMCA 2DZUA 3Q92A 3M5ZA 4HT3A 1RR2A 4KADA 5CPNA 1OFRA 1Z44A 3Q58A 3H55A 4XCKA 5L9FA 1FXQA 3EWYA 3G22A 1F7BA 5D04C 2ATSA 2LLEA 1TO3A 1KFLA 2VFFA 2JGVA 4JTJA 2A6NA 3GNDA 4CNNA 1D3HA 3MYPA 3F4NA 1LBMA 4MVAA 3O8AA 1WQ5A 5CGEA 4Y90A 3WFAA 1ML1A 5D05A 4E69A 5LGZA 4LV4A 3TX9A 3H53A 4UBEA 2B7QA 1TMHA 1XL9A 3T55A 3FOKA 5C55A 2WOQA 2TYSA 2J9ZA 1TB3A 1HFBA 3IH0A 2GJLA 2VEIA 2FV7A 3P61A 3TROA 1KTCA 2NXIA 2E5CA 3MHFA 4DO5A 4LV9A 2PE4A 2A4AA 4FHAA 1IXOA 2PKFA 4MOZA 3BG3A 4YWIA 3W7NA 3QYQA 2YGYA 1F74A 4A2RA 3C61A 4IX0A 1MEWA 2RKXA 3BGGA 3W7OA 1JULA 2GQ9A 2JKPA 3ABRA 1G7UA 3WK1A 4LBXA 3NPVA 4DU5A 2W6RA 3GR7A 4IMGA 2CW6A 4GWEA 2ZQ0A 4CNOA 3G1SA 3KRUA 2O7SA 3IIZA 3EXSA 4K6AA 3GX9A 4WZHA 3VKJA 4GUJA 4LRSA 2JBMA 1O95A 4QISA 3W2KA 3PB2A 1H5YA 1V1AA 3QAIA 4BK9A 3JS3A 1DJNA 4O15A 3CT7A 3RQHA 4A2SA 3RK8A 5K4XA 2VENA 3W83A 4LUJA 3TIMA 3W2UA 3HQ1A 1OF6A 2CLMA 1HL2A 3DGRA 3CIXA 1JCMP 3GO7A 4YL2A 2XTBA 4TMCA 1AL8A 3STEA 4N02A 2CLKA 4AAJA 5FEZA 2GVLA 2DP3A 2TSYA 3RRFA 3HJZA 3FEMA 1LBLA 5HUOA 5CSSA 3LCGA 1T96A 3RLUA 4AXKA 4GC4A 1KM6A 2NUYA 3PC0A 4DELA 4DPQA 2QCLA 2YR1A 5L6UA 5D38A 3W7GA 3W76A 3LRKA 3CM4A 1LORA 3GDLA 3QMSA 2H8ZA 2YCEA 4TR9A 3HYOA 2JK2A 1F6PA 2Y7FA 4CQAA 1TV7A 2A5HA 1Q45A 3EKLA 1X1OA 3O63A 3UWQA 1HO4A 1KFEA 3KXQA 5EYWA 2B7OA 1MO0A 3L66A 2WSQA 3U6WA 2ZYFA 2PC4A 2OT0A 3TA6A 3CWOX 2FFCA 3ZFHA 4EBUA 3N3MA 1FWNA 5DBTA 1JRCA 3VE7A 4E3AA 4OE7A 3MHUA 3EWBX 3QF0A 2WQPA 2R91A 2QUTA 2HTMA 1TV8A 1OFPA 4QJ1A 7TIMA 4IMCA 1LYXA 3M1ZA 3LHUA 3W7KA 3C2RA 3NQGA 3A5VA 5LNWA 2QCHA 4RXGA 1TTIA 3R12A 1K8XA 1ME9A 1XBXA 3H49A 4LCAA 5AHFA 4JX4A 4DC3A 1U2XA 3UWZA 3V75A 1A5CA 3THAA 2BX7A 1CI1A 4IXHA 1TQJA 4LOCA 1PV8A 5DY2A 2DU2A 3I7RA 1B57A 5E0KA 3WJYA 3NL5A 1D9EA 3EX2A 2QUVA 4MIMA 1SW7A 2X2GA 5TIMA 2IQTA 3DFSA 3NM3A 1VHCA 1JUEA 3S6DA 5H91A 2X1RA 4IJBA 3M6YA 5I3JA 5AHIA 3LJSA 2ZZ5A 4GNJA 1JQXA 1LOSA 4KAHA 3BW2A 4X2RA 1A5AA 4S1MA 3B4UA 2Y6ZA 1HTIA 5TBOA 3O1NA 2YFNA 4WXZA 3GXPA 3MO7A 2OT1A 1V1BA 2DDMA 1H60A 1SUXA 1C3QA 1K02A 1QWGA 3LB0A 2C0AA 3IV3A 1PHQA 4JIPA 1CW2A 5K4ZA 4UC5A 1RD5A 4OBTA 2FPYA 3NZRA 1VZWA 1A5BA 1Q3NA 4LU0A 3TR2A 2FLIA 3C3NA 3UQEA 5EA9A 1TREA 2QCDB 5KZDA 1PHWA 4HNTA 3HG5A 3PF3A 1TJPA 1ESJA 4LRTA 1G4TA 4HIBA 5IBXC 1VS1A 2H3DA 1LLZA 2YDAA 1KLZA 3LHWA 4JTLA 3NVTA 3RPZA 2AJPA 5FF2A 2RH9A 3OBKA 5KTLA 1GYNA 2QF7A 1EPXA 1WDWA 3MBDA 4AH7A 3L0NA 2DDOA 4AMAA 3B0VC 1FWTA 5C6MA 1EA0A 1VPXA 1EKKA 1H61A 2GUUA 1PCKA 4H6KA 1EB3A 1WAUA 5TQIA 3GAKA 3FS2A 4O1LA 3W7IA 1PS9A 4BR1A 1A53A 1YDOA 4GUIA 4O28A 1S3HA 1ZALA 4P61A 3UNDA 5TRWA 3ATYA 5J5RA 1RFUA 4GM6A 2C3ZA 4PTNA 1XBVA 3RT9A 1FCUA 1IIHA 3QMTA 2Q8ZA 3W84A 3B1OA 2ZZ3A 3RRBA 1LRQA 1SZEA 1N55A 1TZ6A 5F2GA 5AOUA 3GKFA 1TPC1 3UYCA 1VYRA 3W7JA 1JCLA 1L2LA 2NV2A 2Q5RA 3UXAA 4Y9AA 2H8XA 5BYFA 3TCEA 4UTJA 1SO6A 1BEUA 2F7KA 4DEFA 3G3DA 3TFCA 5G2HA 3IVUA 1YGJA 4E8WA 2V2CA 3IVSA 3P62A 3HIJA 3GO6A 4C5LA 3TUUA 4D2JA 3BLFA 3UXDA 5U4NA 2PKMA 1H7OA 1W1ZA 3LCLA 1JXIA 3S1UA 3P60A 4HSNA 5C3ZA 1FXPA 4RV8A 2JG5A 3W7LA 4EVZA 4JTSA 3WJXA 4B5NA 2GJNA 4N6EA 3B1PA 4NJKA 3GIYA 2Z2UA 1OK4A 3P5ZA 3W86A 2R8WA 3E49A 2V78A 2YFOA 3THQA 5HULA 3W1TA 3DFQA 4UMAA 5IM51 5B6AA 3MI2A 5EPDA 1EP3A 4W9TA 1S5VA 5LNUA 2CLEA 5CZ0A 1JCXA 2NV1A 4E0CA 1T99A 1VHNA 1G4SA 1L6WA 2ZBTA 3IIVA 2ZA3A 1NVMA 3P7YA 3W1QA 4Y8FA 3LCIA 3TC6A 3P8IA 3LKIA 3M43A 3W70A 5KMYA 3I7QA 5KSWA 3W4SA 4FX7A 5LNVA 1EUAA 4XDAA 2H6RA 4YMZA 3LGEA 1WYEA 3H74A 3G1FA 3SI9A 1H7WA 1C8VA 3Q37A 1AG1O 1SO5A 4NU7A 1OX4A 4MZ8A 4YCOA 1Q6OA 3DAQA 3QMRA 5DCDA 1FWSA 1TZ3A 2E5DA 1EEPA 3RTBA 5BOOA 2ZRXA 3WJSA 5HMSA 3G1YA 2BWGA 4FIRA 5K9CA 4XBKA 3KZHA 2C49A 4KBEA 1Z42A 5AYXA 4FNRA 4C5NA 2Y62A 2C18A 4KWVA 3OHIA 4GUGA 3GDRA 1W8SA 3K9EA 1EP1A 1KBJA 4XUGA 2C4EA 4LTSA 3E02A 1X7FA 3NO5A 2C1HA 3BO9A 1QCWA 3N1CA 1GEQA 3RU2A 3LV5A 3SR7A 3TNOA 3DHFA 4CCEA 3CTLA 1K7XA 3I6RA 4GUFA 4NNCA 3DU0A 4ZQRA 4FF7A 3M5XA 3I65A 3PAJA 1RKDA 3UWYA 2G5WA 4IPJA 3K30A 2H90A 1KM1A 3PVFA 1TTQA 1QFEA 1VCFA 2FPVA 3IIPA 4MLJA 1OYBA 1R30A 1LBFA 5E93A 5C3YA 4HNNA 1YTEA 3NL3A 4LVGA 5FF3A 3KRSA 4LC4A 3R13A 5LSMA 2DJXA 2I1OA 1EP2A 4M6QA 1N8FA 2A0NA 4O0KA 4I7UA 5CZTA 2WKJA 5CPOA 2FPTA 3LXCA 4WOQA 1TV5A 4JY8A 2FQIA 5D37A 1EKQA 2YXGA 1J2WA 2P10A 1RQEA 3LCHA 2DJLA 2I5BA 3KEUA 2QHPA 2W0UA 3L5LA 4GFSA 2TRSA 5LNRA 3T78A 2BXVA 4Q4KA 4H3DA 1K03A 3GVGA 1W54A 2XN0A 3W2LA 3S5ZA 3RTDA 3TAOA 4JR5A 3QZEA 3QQ0A 1YYAA 2UV8G 3PBVA 1FUYA 2CFFA 2DORA 3EX3A 5LZLA 5FF4A 4RZ5A 4N4QA 3EXTA 5FF0A 1PE1A 1TJRA 3DBPA 2Z6IA 4N9EA 1OVDA 4X22A 4C1LA 5A5WA 1OK6A 3W85A 4XWUA 4WJMA 2HLZA 5CZSA 4X9SA 2B7PA 3BW3A 3EEGA 4O1BA 2CZDA 4FNUA 4EWND 2J9YA 3W1LA 4UFHA 4UTWA 5FEXA 3PZSA 3MP3A 4O1AA 3FIGA 4IOTA 1R2RA 2X30A 5G1TA 5G2WA 1YDVA 4MYXA 2WPBA 1TPUA 1NSJA 1WYIA 3PG9A 2VEPA 3KD6A 3OEXA 2VFGA 3LHTA 4UFIA 4ICNA 3USBA 3IIXA 3W7PA 5AHLA 4JICA 2XN2A 4E84A 4BI5A 3IBQA 3NL2A 4IXXA 3OG3A 2Y7EA 4PH6A 5DXYA 2W79A 1L6SA 1EWDA 2JKEA 3B03A 2FDSA 3IGUA 4DQWA 1DVJA 3CQ0A 3LRMA 1LM1A 4QITA 1OG0A 1SW3A 4O19A 1SW0A 4L4MA 3NDOA 3TV8A 2FB2A 2WSYA 1J5TA 3TSMA 2ZDRA 2GVGA 4HPJA 2E1DA 3W7RA 2WSRA 3UZ5A 3T40A 3PBUA 1UJPA 1ME8A 4ML9A 3LCFA 1FDYA 3GLCA 3RQ5A 1RV8A 4FXSA 4UTLA 3W7MA 4NJGA 4LS2A 4UFMA 3RO4A 2Y70A 4PEKA 1FQ0A 4XQ6A 3RPHA 1SR9A 1M7OA 1XXXA 2J6XA 2V81A 1VR6A 5COJA 1W56A 1THFD 3LXBA 3GDTA 1ICPA 1KA9F 1ZAJA 2VFHA 3PY2A 4K8HA 1TTJA 4ZQMA 4EF8A 1GVSA 3G0UA 1H7XA 1DGMA 3G0SA 4JTTA 3S8HA 4CCCA 1LHPA 1H51A 1GOXA 2A6LA 4ALDA 3OVRA 4BFAA 2ZCGA 4K7YA 3QPYA 3W75A 2DDWA 4LVBA 3GZ3A 1U83A 3T4CA 4O11A 3LHVA 1VGAA 4NX0A 2H3BA 2ZZ1A 5FEPA 2XFWA 2E5BA 3A24A 4ONVA 1GQTA 3NBVA 1MZHA 1W5QA 1Q6LA 2VEMA 1FDJA 1TPEA 4YWRA 4TU1A 2YX0A 5I3HA 5CGQA 2WJZA 3W1MA 3GYEA 3HPZA 3LBMA 4FIQA 1W5PA 4C5MA 5AC6A 3G1AA 4E8YA 4C5KA 1KFBA 5CKSA 3NPWA 2XN1A 3PULA 5AB3A 1DQWA 3FHYA 1BWKA 3RT7A 5HWMA 3BLIA 2AQWA 1ICSA 2PKKA 2PCQA 4R7JA 5F1UA 1G67A 4NZJA 4IQLA 2WNZA 1H1YA 5CG7A 4FNTA 2C13A 1LIJA 1FY6A 5FF7A 4XBSA 2X1SA 1BKSA 2QCCA 5AHMA 3FFSA 4PA8A 3DI1A 2G97A 1C9DA 2VFIA 3TJXA 1W3IA 3CHVA 1B3OA 1F6KA 4WOZA 2VFEA 2B7NA 3GDKA 3UY7A 1JXHA 5HQEA 3S1WA 1SSDA 3FA5A 3NGJA 2P0OA 5DXXA 3LBCA 3ABOA 2YW3A 3L0GA 3N19B 1QDSA 3M0ZA 4Y96A 1KTBA 1LRNA 1OFOA 2GOUA 2NUXA 1QPNA 2P1FA 1AW5A 4FNSA 3MJYA 3HOJA 2QUUA 4ZQPA 3KRZA 1LP6A 3W1UA 3LERA 1OABA 3W87A 1SZGA 3K5WA 1PVNA 3W7CA 1O94A 3UWVA 1VH7A 1VYPX 2ZZ2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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