3NL5A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
539
structure length
512
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGLVQIREKDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGPDMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPDMVDYIGVGTLFPMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSTKNSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGYSATETRLLLNNKLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSKGTNGTSVEDIPCVAVEAGPIEIMGDITASGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Candida glabrata
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
total genus 158
structure length 512
sequence length 539
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nl5A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nl5A02
1B3OA 3W2JA 5LNWA 4JDBA 3RT7A 4O4WA 1ZHAA 1U5JA 2A5HA 3QEZA 3PR2A 1TQXA 2HTMA 3UQ9A 3HJZA 2FDSA 4C5KA 2WPBA 2I6BA 3IIXA 5D2YA 4MFEA 4JTTA 3NQ8A 1V5XA 3W7QA 4EOHA 2ABAA 3UWWA 2X1SA 1OABA 3L5MA 5D33A 4E69A 3OG3A 4O1AA 3GB6A 2J9XA 3N2MA 3O6YX 3OA3A 4JN6A 3IGUA 3NGJA 2VEMA 1VLWA 4QITA 1P1XA 2Y70A 4RJEA 1LRNA 2J88A 3W1RA 1VS1A 2A6NA 3NQAA 4GFSA 3L2IA 3W22A 3NNTA 1G7VA 2EGZA 1ESQA 3ABOA 3FHYA 1G7UA 3UY8A 4JTSA 2B4GA 2CWNA 3L9CA 4MY1A 4QIUA 5D04C 2TRSA 3L5LA 3NQCA 4N09A 2A9YA 3CQ0A 1I2RA 2JKPA 2RDUA 3QSTA 1TJRA 3THAA 5BYCA 2E77A 2JBMA 3G18A 3NQGA 2DZVA 1J5TA 1OHLA 2Y7GA 4JTHA 5HQEA 1SQ7A 1DJQA 1BWLA 3HIJA 3NAVA 3RU2A 2AAMA 1VM7A 6TIMA 2VEKA 2C19A 1WXJA 1B9BA 5AYXA 4DQWA 2CLEA 4FNTA 3R89A 5C3YA 4Z1AA 2OX1A 3B8DA 1LORA 1O60A 1D3HA 3C2VA 3NPXA 4FIQA 4LRSA 5FEXA 1H7PA 3BW4A 5HUPA 5KSWA 4LS0A 1OYAA 2NXIA 2A2IA 3NL2A 1YPIA 1F05A 1ME7A 4N9BA 3WK2A 5FF0A 2ZZ6A 5F4XA 3ZWTA 1XXXA 4DBDA 1YXDA 1TTQA 3LXAA 3RQ2A 4XDAA 4A21A 1TV5A 4MLRA 1RQEA 2NX1A 3PY2A 3BO9A 3PBWA 2NV2A 4FIRA 1AW2A 3ANYA 4DPPA 3P82A 3UWVA 5DXYA 2V9DA 4K7VA 2E5BA 1OFQA 3TAKA 3S9YA 3VASA 2JG1A 4JICA 1UB3A 3S1UA 2DDMA 4JR5A 3W7RA 4DXVA 4IXXA 5HINA 4IQLA 4E2DA 5DN1A 3CWNA 3L68A 2HLZA 1OK4A 3QA2A 3UQ6A 2V2CA 3GAYA 3FA5A 2QCHA 3KHJA 2QCVA 3RU6A 2V2DA 4IMDA 3LM7A 1LIKA 1XBYA 3P84A 4NQ1A 3LHYA 1H63A 4P61A 3W75A 2RH9A 3FYPA 3LBCA 1KFBA 2FLIA 1HFBA 1R2TA 3CPRA 4ZQMA 1UUOA 2TMDA 3LHWA 4AB4A 3EX6A 3RPHA 1O94A 1UJPA 2HS6A 2YXTA 3TXVA 4JDYA 4JTFA 5LNSA 1FBAA 1XBXA 5HULA 1XC4A 4U28A 5ABTA 2WSRA 5KZDA 5CZTA 4U7XA 4LBXA 2H3DA 4UCGA 4LC4A 2A4AA 3NO5A 4K6AA 4B5NA 1G4PA 1F73A 3W76A 1K8XA 4QSHA 1KYHA 3K30A 4U4MA 4O1CA 4ZQCA 3INPA 4OQVA 5LZLA 2GJNA 1O5KA 1TCDA 3GR8A 4MY9A 1JQXA 5AHEA 3W4SA 1M6JA 3LRKA 2FIQA 4M5PA 1T96A 4XKYB 2AX3A 1GC5A 3IIPA 4O1LA 3DGRA 3M0ZA 1S5TA 4GC4A 1ZCOA 1WDWA 3BVJA 5AFDA 2YW4A 5DBUA 1FX6A 5AC8A 5D09A 5K9XA 3SGZA 3SW6A 5I3JA 1A5CA 4TX9A 3AO0A 4E8ZA 1PVNA 1SPQA 3UQDA 4LS1A 3JS3A 4UNKA 1MO0A 4WX2A 1J2WA 1QR7A 5DCBA 5LHEA 4C5LA 3Q2DA 4RXGA 4PVVA 4DEFA 2F7KA 2FB2A 2VXNA 4FNSA 2Q8ZA 3LDVA 4M7SA 1CW2A 4JTLA 3CQDA 4NUWA 3IH0A 2PRHA 1DL3A 3EXSA 3RS9A 2AGKA 1JQVA 2XN0A 2C49A 4DO5A 3PVFA 4LC6A 3HQ1A 5FEWA 2ISVA 4GBUA 3LJSA 3TMQA 2QUUA 3L0GA 1YGJA 1HO4A 3P62A 1RK2A 4MIMA 2OCZA 3FLUA 3S1VA 2DU2A 1LHPA 3W7PA 2JGYA 5G2WA 1ZNNA 2V2HA 4UMAA 3C2RA 4GNJA 4NNCA 3C2FA 4LVBA 1G4EA 3HICA 5HNRA 1KFJA 3DFPA 3EKZA 5KZEA 4TMBA 2NLIA 3STCA 1VCGA 4HHPA 3W7HA 1TJPA 1R2SA 1SFLA 3M5VA 2X16A 3B05A 3GO7A 2ZDRA 4O1BA 3WJZA 1XDLA 3S0CA 4A2RA 3W7JA 2QKFA 2NWSA 3ATYA 3Q37A 4WXZA 1WA3A 3ATZA 3TIMA 3EWMA 1WQ5A 1K8YA 3NDOA 1X8FA 1DQXA 2VEIA 3PBUA 5FF2A 1LOLA 3IBQA 5BOOA 2QCDA 1WV2A 3MWAA 3OTXA 2WV8A 3BG5A 3W1UA 2ZRUA 2C4EA 5BYEA 4N6EA 4JEQA 2ABBA 1E51A 3B1NA 2CU0A 2WOQA 1XKYA 3V75A 3HO8A 1ZAJA 3R8RA 1UUMA 1F2JA 3FJ6A 4G1KA 4O11A 1YPFA 1EUNA 1F6PA 4WUIA 3W3OA 3EEGA 1TMHA 4JYFA 1YXYA 3W2KA 4PTNA 3HG4A 4H6KA 4LC8A 1PCKA 5G5IA 3RPZA 3VAQA 1I8JA 4K8EA 2ZA3A 2AWDA 1S5WA 2QEZA 2ZQ0A 1O95A 4AHQA 3M6YA 2YXGA 1LLZA 5E1QA 2C3ZA 2FTPA 4UR8A 2I6AA 5CZJA 1JUEA 2XN2A 5D2VA 1DGMA 5CZ0A 3STFA 3SECA 2XFWA 3V1PA 4AHOA 4C1KA 4O4VA 5BMWA 3TROA 4ORIA 1C8VA 1GTHA 4HT3A 3T78A 3KVLA 1VH7A 1H50A 3PUDA 3TQKA 2DZUA 4IMFA 5CGAA 4LV9A 5TBOA 4I9AA 1C3QA 4GUGA 3NM1A 5EY7A 4ONVA 3UQNA 1JCJA 2WO5A 3PSWA 2VFEA 5EA9A 1PE1A 1KTBA 4QNEA 1BWKA 2OJPA 3BF5A 4IMGA 1IXNA 3Q58A 4DF1A 2QR6A 3GNNA 3O07A 4XTDA 1FDYA 3HGJA 4NXSA 3B0UX 3WJWA 4N9CA 1F7BA 5G4WA 4ZMGA 3UYCA 1VZWA 1I2OA 3B0PA 3E9AA 4EF8A 4M6QA 3QC3A 3CIWA 4O8RA 5FI8A 4KBEA 2NUYA 1EP3A 4NU7A 3LLFA 4BWLA 1V1BA 3P61A 1FWRA 4FHAA 4MY8A 1OVDA 1UBSA 3NQEA 4NJIA 4BFAA 1FDZA 1NF0A 2DZXA 3L21A 4AXKA 5F1UA 3KRZA 3BW2A 4OV9A 2YPIA 4DF0A 4Q33A 1YTKA 4O0ZA 1JVNA 3PB2A 4CNOA 2PKMA 3RTEA 4IOTA 4WD0A 1TYGA 3RLVA 2J6XA 1G6CA 1VCFA 1ZALA 2BSLA 3G3DA 4FEZA 4K36A 1KFLA 3FJLA 2B0MA 3G8RA 1TREA 4KFPA 4NJKA 4Z08A 1U83A 3G24A 3QQ1A 2FPTA 1O5XA 1YDNA 3B03A 1Q6QA 4FB7A 4IGHA 3RQXA 2R3EA 5F2MA 1ZENA 3BW3A 1TD2A 1VHCA 1OX6A 3MJYA 4Z0SA 3DKLA 4AWSA 4O12A 2I5BA 4TO8A 4JX4A 3RO4A 5G2IA 2A0NA 3HOJA 3R5EA 3LCLA 3NBWA 1Q3NA 1PV8A 1M7OA 1KFEA 1QFEA 1KM2A 1OF8A 2QDHA 3SGUA 1XDMA 2ZFAA 2RDTA 2H3BA 4K37A 2ZZ5A 1EUAA 4RZ6A 3B1RA 1Z44A 3W87A 5LNRA 1PL9A 4JXCA 2F84A 4IPJA 5EYWA 3MHGA 1NEYA 3MUXA 1P0NA 5DLCA 3MBJA 2C14A 5I3KA 4KWWA 1MEIA 2V5LA 1IXOA 3CEPA 4BF9A 3DKJA 3DFTA 3P74A 1I2QA 1H5YA 3BLEA 4Z0JA 2AJRA 3O16A 3NQVA 2O7QA 4MPQA 3S5NA 3QRHA 4N2YA 3G0XA 3TJXA 2YYUA 1FQ0A 4S1HA 3QPZA 4S2CA 1QPNA 1V1AA 2Y61A 1KM6A 1HTIA 1VQTA 3CM4A 2ZRYA 4J9JA 1L2LA 3KD6A 2QUVA 4PL2A 5CPLA 1CX9A 1RZMA 2QCFA 4NNAA 4KANA 4DO4A 1XBVA 1ME9A 3LBMA 4JD4A 3PM6A 3SIZA 1XM3A 3UWZA 1AL8A 3M5XA 3UPWA 3QAIA 2DDWA 2R94A 2QCEA 4MOZA 3IVTA 3B04A 2RHGA 2NUWA 4IX2A 2C0AA 1OJXA 3LXCA 3MYPA 3HGSA 2CLKA 1GVFA 5K2ZA 1RKAA 2E6YA 1JCNA 5EBUA 2WJZA 3GKAA 2QCCA 4POCA 3PBVA 1LOQA 4UIOA 2NWHA 4C5NA 3B4UA 5EPDA 4BI7A 1TO3A 5HWJA 3NZRA 3GXTA 1SW7A 3F4WA 1F6KA 2AB8A 3B0VC 3BARA 3UQEA 5CPNA 3PBYA 4JTGA 1AG1O 4O50A 2Z2UA 4KFOA 4GUHA 4TU1A 2R91A 3T55A 2PRLA 2ZCGA 2CLHA 2NXHA 3PUOA 3QH2A 3TJLA 3L66A 4IX0A 3BGKA 3HB9A 2EPHA 3PZSA 3VI2A 4JTUA 5C40A 3P7YA 1ESJA 5EYNA 3RLUA 1LRQA 1GVQA 1SW0A 2ZZ2A 3LTYA 2ZZ7A 3CB8A 3MP4A 2W0UA 3W07A 1EX5A 2O7SA 2GOUA 3IVSA 4QAIA 3IE7A 4UC5A 1TRDA 1QPQA 5U4NA 1H60A 2BZNA 2CW6A 3RQHA 3GXPA 1TPH1 5FF7A 8TIMA 1XBZA 3GDRA 1ZAIA 1EKQA 4RZ4A 3NBVA 3OVQA 2CLLA 1VYRA 4HSOA 3PS7A 3A24A 4UMBA 1RVGA 1W54A 2PCQA 4GWEA 2ISSA 3R12A 5CM5A 2C16A 1ADOA 4HPXA 2CFFA 2JKEA 5D37A 3ZFHA 2C15A 4UTLA 2I14A 2NX9A 4DPQA 1H62A 4UFLA 1SR9A 4KALA 1VLIA 2GPTA 2V30A 2GJLA 4JJPA 5H2ZA 4DF2A 1JRCA 3A23A 4XTIA 3MW7A 2Y7EA 3PUEA 4ICNA 4GUFA 1S3HA 2QJIA 4N08A 5GVJA 1A5AA 2A9ZA 5D30A 4GUIA 3RS8A 2CLOA 4RZ5A 3LCXA 2LLEA 3VE7A 2Y89A 4OE7A 4GE8A 1N55A 3LERA 4CQAA 6ALDA 4ZQPA 4O53A 2V0TA 1IF2A 4AMAA 3O8AA 2VENA 2Z0IA 3E49A 3HBLA 1OFEA 3MI6A 4S1FA 3DENA 3GDMA 3DAQA 4AF0B 3TQ0A 1NSJA 3M44A 2Y85A 3MHUA 3UZJA 3QJAA 2IQTA 4UFKA 4O57A 3KVJA 3W7LA 3NQMA 3TFXA 3GZ3A 4OGZA 2V82A 3TV8A 2CLMA 3CHVA 4RV8A 4A22A 1GTEA 1LOSA 4E8YA 3CLMA 4NZJA 5K9CA 1W3IA 3WFAA 1AL7A 3QW4B 2D73A 3DBPA 2X2GA 5L9FA 5IBXA 1AK5A 1TIMA 1GYLA 1LCOA 5D32A 1TTJA 1YTDA 3W1NA 2GQ8A 4ADSA 4N02A 4K8TA 4WXYA 1OX5A 1OFDA 2ZZ3A 4FX8A 3S1XA 3S1WA 3RQQA 2Y6ZA 3HGOA 3RU3A 1GG0A 3G1XA 5G1YA 4DC3A 4M19A 1LIIA 3KFTA 4O52A 4YWIA 3RY7A 4MKNA 4X2RA 4EVZA 4GUJA 4Y6GA 2EF9A 4R34A 2PKFA 4JIPA 4NVTA 3RT9A 2CZ5A 3QPYA 1VHNA 3VKJA 2TPSA 1DHPA 2QCNA 3G8EA 3IIOA 4Z1CA 3TX9A 1KLYA 1EKKA 4LS2A 3FHXA 3RTDA 4BR1A 3IGXA 1GT8A 2ZYFA 3B3LA 3D0CA 2W79A 2XTBA 4AAJA 2FQIA 3BV4A 3RSFA 3WJSA 1YDOA 3LHUA 3PSVA 4LVGA 5C54A 3U2OA 2DZWA 3DZVA 5BYDA 4K8PA 4JKSA 3BGJA 1WYIA 3WJXA 3GDTA 2C18A 1QO2A 3HPSA 3VNDA 4MJZA 2QAPA 3EX3A 3W7DA 1K7XA 2CLIA 1TRIA 3BG3A 2G96A 3W7OA 4MLJA 4O28A 5AYZA 3M7WA 4E2BA 3W23A 3PWAA 1KV8A 1Q6RA 4WZHA 1KFKA 1JUBA 2YXUA 1TV8A 1F76A 1TPDA 1HL2A 3RMJA 4LVDA 2AJPA 1J4EA 4TIMA 5C55A 3HMJG 1QCWA 1LP6A 1UB0A 1PIIA 3RRFA 4O16A 3EWBX 1Z41A 5AHNA 3LHTA 4MVAA 2TSYA 2ZRWA 2WNZA 1C29A 2P10A 4JGDA 4AHPA 3A21A 3MI3A 1M7PA 4GJ1A 2QJGA 4WY0A 3MYOA 1YYAA 2YX0A 3MBDA 1RFUA 5AHMA 2NX3A 3G1HA 5G4EA 5EL1A 2E1DA 1KW1A 1DV7A 2H8ZA 4PL1A 5HJLA 1FWSA 1EWDA 4MUZA 1LHRA 3W2MA 3Q92A 3RTBA 1GPWA 4LW7A 4LU0A 3NC2A 4YL5A 1K3UA 3IRDA 3BLIA 3NL3A 4UTWC 5CSRA 3WK1A 5B6AA 4XWUA 4N6FA 4XF6A 1DBTA 3QMRA 2J24A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1B3O A;  3W2J A;  5LNW A;  4JDB A;  3RT7 A;  4O4W A;  1ZHA A;  1U5J A;  2A5H A;  3QEZ A;  3PR2 A;  1TQX A;  2HTM A;  3UQ9 A;  3HJZ A;  2FDS A;  4C5K A;  2WPB A;  2I6B A;  3IIX A;  5D2Y A;  4MFE A;  4JTT A;  3NQ8 A;  1V5X A;  3W7Q A;  4EOH A;  2ABA A;  3UWW A;  2X1S A;  1OAB A;  3L5M A;  5D33 A;  4E69 A;  3OG3 A;  4O1A A;  3GB6 A;  2J9X A;  3N2M A;  3O6Y X;  3OA3 A;  4JN6 A;  3IGU A;  3NGJ A;  2VEM A;  1VLW A;  4QIT A;  1P1X A;  2Y70 A;  4RJE A;  1LRN A;  2J88 A;  3W1R A;  1VS1 A;  2A6N A;  3NQA A;  4GFS A;  3L2I A;  3W22 A;  3NNT A;  1G7V A;  2EGZ A;  1ESQ A;  3ABO A;  3FHY A;  1G7U A;  3UY8 A;  4JTS A;  2B4G A;  2CWN A;  3L9C A;  4MY1 A;  4QIU A;  5D04 C;  2TRS A;  3L5L A;  3NQC A;  4N09 A;  2A9Y A;  3CQ0 A;  1I2R A;  2JKP A;  2RDU A;  3QST A;  1TJR A;  3THA A;  5BYC A;  2E77 A;  2JBM A;  3G18 A;  3NQG A;  2DZV A;  1J5T A;  1OHL A;  2Y7G A;  4JTH A;  5HQE A;  1SQ7 A;  1DJQ A;  1BWL A;  3HIJ A;  3NAV A;  3RU2 A;  2AAM A;  1VM7 A;  6TIM A;  2VEK A;  2C19 A;  1WXJ A;  1B9B A;  5AYX A;  4DQW A; 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