3NL6A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 175
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
175
sequence length
539
structure length
518
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGVTLVQIREKDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGPDMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPVDYIGVGTLFPTLTKKAPMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSTKNSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGYSATETRLLLNNKLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSKGTNGTSVEDIPCVAVEAGPIEIMGDITASGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Candida glabrata
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
total genus 175
structure length 518
sequence length 539
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nl6A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nl6A02
4B8SA 1XDMA 3HGJA 3W7JA 4PL2A 1YPFA 4GRSA 4JDBA 2NV2A 2HSAA 4AHQA 3L0KA 3BLEA 2V30A 5FEZA 4UFMA 3ZWSA 5D02A 5KSWA 4Q32A 3EWBX 1KFEA 2X2GA 1UASA 3UQEA 3N9SA 2O7QA 3IIPA 3D0CA 4AAJA 3B8DA 4ADTA 3DFSA 2I6BA 3QPZA 3TK7A 4HNNA 1QO5A 4XBSA 1YHJA 4EN4A 1JUKA 1OYCA 1TTPA 1DV7A 1K7FA 3L5MA 1AL7A 2P0OA 2ZRVA 5DCEA 2QDGA 4GUFA 4WY0F 3EWMA 4BI7A 3PBWA 1UJPA 3VE7A 3TNOA 1W5PA 4E69A 3CWNA 3C2OA 5DCDA 3A5FA 2VFIA 3RS8A 1YXCA 2Y61A 2Y70A 4RX0A 1RZMA 2ZRUA 3O8AA 3ABQA 2X1RA 1I2QA 4XF7A 2ZCGA 3QQ0A 1O94A 1KBJA 1KBIA 2ISWA 3PBUA 5LSMA 3IVTA 3BG3A 1LM1A 2XFWA 3GYEA 2V2HA 1FWWA 4ZZ9A 3WK0A 1G7VA 1KTBA 5AYZA 3NQCA 3RTCA 1LROA 1KLYA 2DZWA 5K9XA 4IGHA 3W1MA 3LGEA 5LNUA 4JTLA 4CQAA 1T96A 1TO3A 1VK4A 3ABRA 2E6FA 3L0NA 4OGZA 5D2WA 3RS9A 5K4XA 2OT1A 3GB6A 3BW3A 3PY2A 3TAKA 3BGKA 5C5YA 1LIIA 3OBKA 2V78A 2A4AA 2O7SA 2RDUA 5I3HA 1UUMA 3WJWA 4GUHA 5HJLA 3UMOA 5DBUA 1HL2A 1JCNA 3P5YA 1YXDA 1C3QA 3I3YA 1LOLA 4QQ3A 3EX4A 3GX9A 2FB2A 1SW7A 3UWYA 3W7CA 4C1LA 1WYIA 3W75A 4WZHA 3G0SA 3OG3A 2HMCA 4LUIA 4A2RA 1JXIA 3RM5A 3S1VA 1F6KA 1A5BA 4PFMA 4WJEA 2DJLA 2HS8A 4MY9A 1MXSA 1W54A 1G4PA 3RK8A 2C15A 4ONVA 3CWOX 1WOAA 2A7PA 4A3UA 5U7SA 2B0MA 3CIWA 3ABOA 3W1RA 3IN1A 1X8FA 4QITA 3CLMA 5HQEA 3S42A 1TV8A 3P80A 2NLIA 5CSRA 4DU5A 1LIKA 1IF2A 1VYPX 1YGJA 2H3DA 3LB0A 2E6DA 2FPYA 5HULA 3W3OA 3IV3A 4JEQA 3RQQA 4ADSA 4E0CA 1AW1A 4HSOA 2ABAA 1GYNA 3FOKA 1O5KA 1JCMP 3UWUA 3DZVA 1FDYA 3NL2A 1YGKA 2FPVA 4K7YA 3U2OA 2VARA 3DXIA 4UIOA 5BMXA 2CLOA 4ADUA 2WSYA 2CLEA 1K7XA 3L68A 4TO8A 1G4SA 5BYDA 4MJMA 4OQVA 3UQ6A 2ZYFA 3DU0A 5G1YA 4Z1AA 3W2LA 5AOUA 1LTDA 3G18A 1Y0EA 3E02A 3F4WA 4FXSA 3BVJA 4GWEA 4O1DA 3N2XA 4OE7A 2VENA 1K7EA 4AWUA 4O10A 1GOXA 3NQDA 1M5WA 5LGXA 1FXQA 4JNMA 4MLJA 4PL1A 3LRMA 3L66A 4TMBA 3S1UA 1VYRA 1DHPA 3C4UA 1JCYA 2ZTJA 4MY8A 5DY3A 3HB9A 1OX6A 1OFEA 2QCMA 3OVRA 2TMDA 4FNPA 4WOQA 3L5LA 1J5TA 3ZR4A 4QISA 3NC2A 1AMKA 3SIZA 4FNQA 3GBUA 1B4EA 4FIQA 1WX0A 3KD6A 3NC9A 2B7QA 1O5XA 1YXYA 3CEPA 1G69A 3RF9A 2YPIA 3QF0A 4Z1CA 4DF0A 1N7KA 4UTHA 3DFTA 5SWUA 4AMAA 1F6PA 1RFTA 2ZRXA 5FEWA 1KM4A 1AK5A 1OYAA 1PCWA 4FEZA 2CLIA 1EKKA 5F4XA 3DBPA 4AXKA 2R94A 2NWHA 3HGSA 2W0UA 1B3OA 4YWRA 2ZZ7A 2I5BA 3LXCA 1WOBA 4BI6A 3ZWTA 4C1KA 3ATYA 1H7RA 2QCGA 4BK9A 4GC4A 2R8WA 3G24A 4JKUA 1S5TA 3GIYA 3QEZA 2PRHA 1YDNA 1O95A 3DI0A 3CTLA 3RSQA 1FCQA 3BG5A 3QSRA 1JQVA 4O8RA 3UZ5A 3P60A 3H49A 3STFA 4GUIA 3NEVA 1YYAA 2P10A 4BF9A 1RV8A 2WOQA 4JS3A 3KAOA 4ML9A 3TW6A 2X16A 2VFEA 3V75A 3PUOA 2QCCA 4K8TA 2CLHA 2RDWA 4XTDA 6ALDA 1PCKA 1OFBA 2JKPA 3W7NA 3SW6A 4A21A 3NM1A 1SPQA 3RTBA 3FJLA 1I2PA 4IPIA 1DOSA 1KM6A 2Q3OA 3STEA 3SGZA 3VCRA 4YCPA 1BTMA 1L6YA 2JGQA 3FLUA 3KFTA 1DQWA 4LUJA 4HNUA 1JQXA 5BNKA 4DC3A 4N2YA 1HG3A 4CNOA 3PZSA 3TAOA 4P61A 3C52A 2DDOA 1W8SA 2TPSA 1XKYA 3SECA 4N9CA 1QOPA 4IMEA 3C2FA 4RR4A 4P2VA 1Q6OA 4LBXA 3OEXA 4C5NA 3NQ2A 1AG1O 2E5CA 3I7QA 4DF1A 1WQ5A 3DFQA 2JG1A 1LRTA 3TQ0A 3VE9A 4IX2A 3QRHA 1OF8A 2ZZ2A 3KOFA 2E5DA 3TU9A 1A50A 5E0KA 4LC4A 4O19A 3NOEA 5HWJA 5D09A 3AJXA 4JIQA 1R46A 3QZEA 2YXTA 1VCVA 3WJSA 1QPQA 5DXXA 1G4TA 3GDRA 3NL5A 4JTSA 4FO4A 1SU5A 5F2IA 2H6RA 4LC6A 3M1ZA 2ZZ3A 5AC6A 4YL5A 3TMLA 1D3GA 4JTTA 4LCAA 3MW7A 3M5XA 3CPRA 1ME7A 3UPBA 1YDOA 2QF7A 2C6QA 5G1TA 3JS3A 1VPXA 1THFD 4DF2A 3TMQA 1PL9A 1L6WA 2WNNA 5F1VA 5F1UA 4EVZA 3W76A 4QIUA 1W31A 5G2WA 1C8VA 4KFNA 4DEFA 4FNUA 1LLZA 3N1CA 2AJRA 4S1IB 5K7JA 5IM51 4R34A 4GUGA 1FX6A 4UUIA 4S1IA 3EWUA 1SW3A 4O28A 2B7PA 5TQLA 2B7NA 3DRWA 4QM1A 3UQNA 4O1AA 2AGKA 4JXCA 1KM1A 1TQXA 1KFBA 5K9DA 3O63A 4M5PA 1Q45A 4FNTA 5TRWA 3IVUA 5CZTA 4O1CA 1OJXA 3EEGA 2DCNA 5I3IA 4NVTA 5G4WA 1F76A 1VZWA 3TQVA 3NPWA 5EPDA 4I9AA 3W7KA 3NBWA 2CZ5A 4N4QA 3LCLA 2EF9A 2YXUA 2Y7EA 3QMTA 4K38A 4GM6A 3LRKA 1ZFJA 4PEKA 4QSHA 3T40A 2WSQA 5CZ0A 1DVJA 3RTEA 3GDLA 1TRDA 3TH6A 4O1LA 1F74A 4DPPA 5D2XA 2W79A 1GVOA 2ATMA 4AHOA 2ZA3A 1IGSA 4IMDA 3TUUA 2VXNA 1H60A 1IXQA 3TSMA 3VFLA 2V5LA 3IBQA 1BWLA 2WQPA 1LHRA 3KZHA 4R33A 1P1XA 5AYYA 3UQDA 5AFDA 1JUBA 1FWSA 3B4UA 3UXDA 2OX1A 1XXXA 2DORA 3W2NA 1RKSA 4LC8A 3W83A 5BW6A 4NJKA 4UR8A 3O6YX 4JYFA 2NV1A 3RQ6A 4UTIA 4LVFA 4RKAA 2FPTA 2VEPA 1P4CA 3LTPA 4RJEA 3W85A 2Q8LA 4ZVJA 4O57A 2A7RA 3RTAA 5I3GA 2C49A 2A0NA 1NVMA 4BR1A 3UXAA 4HNVA 3GXNA 1RR2A 2LLEA 4IMCA 4OWGA 3SR7A 2A85A 1X1OA 1P5BA 3A5VA 3T4CA 1GVSA 4IXHA 3MUXA 4UCGA 3L9CA 2QCDB 3TC7A 3CC1A 3INPA 2ZZ4A 2QCDA 2QJGA 4GE8A 3LCFA 2NX9A 1M7PA 4GUJA 3PF3A 5LNSA 3CU2A 1C29A 3NQGA 4C5LA 1JCJA 2DZXA 4ZQCA 4WQ6A 2W6RA 2A6NA 5AHEA 2ABQA 3LHWA 1B9BA 1QNVA 2X1TA 3KVJA 4B8RA 3TA6A 2Q3RA 4LVDA 3UWVA 3UY8A 4JX5A 1QDSA 2C13A 3LCIA 3LKIA 4LS2A 3SZ8A 3O16A 3MJYA 3W72A 2Y7DA 3A24A 3NQMA 4H3DA 4KFPA 5HR6A 1R30A 3EX1A 1SZGA 3R2GA 1EPXA 3CIXA 1VH7A 1XBVA 2F84A 4HN4A 3ZFHA 2CZEA 3PM6A 4E8ZA 3UBOA 3NA8A 2WJZA 3RMJA 5D2TA 1RQHA 3A22A 1F5ZA 4OT7A 2D73A 3R89A 3KVKA 2B7OA 3EXSA 5EA9A 2E6AA 3FA5A 3H54A 2AWDA 5F2LA 3TKFA 1OFQA 2R3BA 4XDAA 3S0CA 3QMRA 1DJQA 4FB7A 4MJZA 2J6XA 5BRBA 3GLCA 3NG3A 1LLWA 3P62A 3EXTA 1IXPA 3TQKA 4CNNA 3MHFA 4WJMA 3G1VA 2XN2A 4JYEA 3HPSA 4X8FA 3TSDA 1K03A 1A5SA 4UTKA 4TX9A 3FHYA 1VC4A 3IH0A 1QMLA 4K37A 3G3MA 1OG0A 3G0UA 2AAMA 2QEZA 3LX9A 5G2HA 3G3DA 3LCXA 1TPDA 1B4KA 1W5NA 1ZAIA 2QDHA 1S5VA 3HG3A 2I14A 2PRMA 1Q6LA 4JN6A 3S1WA 4NQ1A 5E93A 1I45A 5FF7A 3W70A 2DDMA 1J4EA 4AWSA 3RPHA 3W6YA 4N6EA 2AFBA 2V81A 3W07A 4HSNA 3M16A 1W3NA 2YYTA 4FNSA 3RLVA 3O07A 5AHFA 4NT0A 4FX7A 3DKLA 4K39A 1PS9A 3GDMA 1SSDA 1VM7A 3ELFA 3HJZA 3P81A 3PUDA 3B06A 1EA0A 1LDCA 1OK6A 3HG4A 1SZFA 3BLIA 1GT8A 3LBMA 3NDOA 4FX8A 1F2JA 1VQTA 1XCFA 4E8WA 3CQDA 3TC6A 1TRIA 3W23A 3W1LA 4UFLA 1X6UA 3NL3A 5CZSA 3FIGA 3MP5A 3EB2A 4CLMA 2XTBA 2Z1BA 3LCWA 4JIPA 2PC4A 2EAWA 3S8HA 1SW0A 3NQ6A 1L2LA 3W7HA 3NYZA 1VLWA 3F1QA 4EUMA 3VAQA 1FUYA 1FBAA 3LLFA 4AF0B 1NF0A 3V1PA 1TTQA 2CLKA 4DXVA 3QSTA 1TJPA 4AF0A 2GJLA 1DGMA 4AHPA 3RLUA 3HOJA 2CLMA 3HPXA 3SGUA 1H7XA 5HUPA 2E5BA 3O1NA 4ORMA 3MHUA 4K8KA 4BFAA 3W1PA 2Y7GA 1RD5A 1OX4B 3LOOA 5CPNA 3OA3A 2J9XA 3NO5A 2C14A 1OX4A 3IGSA 1RQEA 4EF9A 4M6VA 1XBYA 4E2BA 4RXGA 4U4MA 3ZS4A 5FF2A 2Y7FA 3LI0A 3IIZA 3LV5A 1V19A 2H8XA 3UWQA 3B0PA 4FXRA 1GWJA 3W7OA 2NZLA 1DL3A 2ALDA 5D33A 1DORA 1JR1A 2HTMA 3E49A 2YYUA 4O18A 4UTMA 1D9EA 5CKSA 1LOQA 5FF0A 1H63A 3OVQA 2ZZ5A 1XDLA 2BWGA 3HPDA 3M43A 3L65A 1ICPA 3PULA 4X22A 4TIMA 3K9EA 3TJLA 2BSLA 3B1QA 4EF8A 1HTIA 1ML1A 1IXNA 3NPUA 2QAPA 2EGZA 2WSRA 1GG0A 6TIMA 3W7QA 1HUVA 5DBTA 2VC6A 4BWLA 5KINA 4HHPA 3OHIA 3P8IA 3QYQA 3W74A 4ORIA 2AB8A 1N8FA 3YPIA 3IGUA 3FS2A 3O06A 3RTDA 4GFSA 1TZ3A 3RNDA 1VS1A 3C56A 4XCKA 4UNLA 5TBOA 2C19A 4AB4A 4IQLA 5LZLA 1X1ZA 3E12A 1TJRA 4XUGA 4O15A 2Y88A 3NQEA 1EB3A 3NQAA 4UMCA 1W1ZA 3P5ZA 3VKJA 5D04C 3A23A 3HBLA 5J5RA 2ABSA 1MO0A 1DKWA 1H61A 1JULA 2J27A 3G8RA 1G67A 1MEIA 3GR8A 3M9YA 4QNEA 5FESA 5AYXA 5H91A 1PHWA 1H51A 4DO4A 5HUOA 3FKKA 3RSGA 4EOUA 2V0TA 2AX3A 3LERA 3B05A 2FLIA 2F02A 4DO5A 5AB3A 5D2YA 2NWRA 3M7WA 3GAYA 2GJNA 4Y9AA 2PKKA 4OBTA 3NQVA 3B3LA 2C3ZA 4H4IA 3KVMA 4RCXA 1ZAJA 4BI5A 5HWNA 3TR2A 2I1OA 4UFHA 3O15A 2ISVA 1ME9A 2ZZ6A 3LM7A 2YZRA 3LV6A 2VFFA 2V2DA 1EP2A 1ALDA 2G5WA 5LKYA 4LBGA 4OU1A 3DAQA 5G5IA 2V5BA 5CSSA 4YLWA 1EWDA 3FYOA 3MBFA 3TFCA 1MEWA 3BG9A 2GVLA 1KFJA 3NGJA 1M7OA 1K3UA 2ZRYA 1ICSA 4ZMGA 1BX4A 3HICA 4O0ZA 5C3YA 2QJHA 1FCUA 2VEMA 2CWNA 1GVQA 5G4EA 1F7BA 1U2XA 4KAHA 1K8ZA 3B03A 4MY1A 2GQ9A 1GTHA 1FDJA 2BXVA 2F7FA 5A5WA 1XC4A 3L2IA 4M19A 4NJHA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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