3NM1A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
539
structure length
507
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGVTLVQIREKDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPVDYIGVGTLFPTLTKKNPKKAPMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGYSATETRLLLNNLLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSTNGTSVEDIPCVAVEAGPIGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Candida glabrata
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
total genus 162
structure length 507
sequence length 539
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nm1A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nm1A02
5CGEA 1EB3A 1WAUA 5G4EA 4YWRA 3TE9A 4WXZA 1QO2A 1JCYA 1W37A 3W7CA 3O16A 3A24A 3T7VA 2C19A 1TQJA 4NJGA 1DV7A 3BW2A 4JYFA 3RT7A 4A21A 3W2UA 5D2YA 1P4CA 3W7OA 3B1OA 4WY0F 3V75A 3U8GA 1QPRA 5HJLA 3BGGA 1K7EA 1I45A 2WV8A 4OHQA 5D2VA 5AHMA 2A21A 4YL5A 5EL1A 1WQ5A 4O11A 3PB0A 1PCKA 2B7QA 3SFKA 2YCEA 3BK0A 4DPQA 5K4XA 4LV4A 5F2LA 3PL2A 3IN1A 2GVGA 2XN2A 3CM4A 3HJZA 4LNYA 3LXBA 5FF7A 3KHJA 5AOUA 3ZWTA 5LHFA 5IBXC 4R34A 2BTMA 4JTKA 1WBHA 4O57A 1P1XA 2H8ZA 2VXNA 3NQFA 3W7MA 4K8HA 3MWAA 3F1QA 3RU6A 4UTTC 4GJ1A 3QH2A 1TCDA 3HQ1A 2ZRWA 3DHFA 3FOKA 1LBMA 2ATSA 2OJPA 3S5YA 2E6AA 2NZLA 3DFOA 1RFTA 4K7VA 1F73A 2J9ZA 4A2RA 2DZUA 4NX0A 3B1QA 3IGUA 5E93A 4O10A 3PBWA 3E12A 2ZRUA 2WPBA 4QISA 3DZVA 5IM51 2QHPA 2WQPA 4QNWA 4C5LA 2RDTA 5A5WA 3UXAA 3B1PA 2NWHA 4NU7A 3QMTA 1TTPA 3NBVA 2ISSA 1SW3A 5EKYA 3TV8A 3JRKA 4KFNA 4EUMA 2CWNA 5J5RA 3GAKA 1DBTA 3IIPA 2QCGA 3G0SA 3SSJA 3LGEA 3O05A 1WOBA 1PHQA 3IRDA 4IUOA 4LV9A 3RQ2A 3C2VA 5DBTA 1L2UA 3M7WA 2WSYA 2PE4A 1P5BA 5K4ZA 5LNRA 2PKFA 2CLOA 2HS8A 1QOQA 4LBGA 4OE7A 5GVJA 5BMWA 4NXSA 5LGZA 1EKQA 3HPDA 3GDTA 5CSRA 2EHHA 4RXGA 1GVSA 2FV7A 3PUOA 4K6AA 3EKLA 1JVNA 1I2NA 4N9CA 1KTCA 1D3HA 4M7TA 4QNEA 1J4EA 1BWLA 1P0NA 4C5NA 1F6PA 2G96A 3AO0A 3FYOA 3PY2A 3G1YA 3PAJA 1X1ZA 1KYHA 1FWWA 4WY0B 3GNDA 1EWEA 2OZ0A 3HGRA 1ME9A 3TIMA 5AC7A 1LIKA 1OHLA 1O5KA 4N6FA 1LP6A 5EMUA 5K9XA 2E5CA 4EOHA 1WV2A 1FCUA 4MJMA 4N6EA 4D2JA 4MJZA 3DRWA 4UTUA 1YGKA 1FXPA 3FA5A 1GVRA 3P82A 1TRIA 3MO7A 2A2IA 2VEIA 3KRSA 3EXTA 2ZRVA 4DO6A 3LLDA 4X3ZA 1RKDA 1RZMA 4XKYA 3C8FA 1LIOA 3LHZA 1I2PA 1ZAJA 4AAJA 4L4LA 4FNUA 3PF3A 1GZGA 6ALDA 1LCOA 2TRSA 3FHXA 3RSGA 4M19A 4AWUA 3D0CA 2J9YA 3CIWA 4PL1A 5LHEA 4WXYA 1ME7A 1ZENA 3L2IA 5DXYA 1VYPX 4X8FA 3GO6A 3G0XA 3IH0A 3KRZA 3W7RA 3W75A 2YFOA 3NQMA 4JTJA 1VM7A 4E8ZA 3PS7A 2YX0A 1HG3A 3FJLA 3VAQA 1BTMA 4JEQA 5CZTA 3W2MA 4EIVA 1ZFJA 3M5VA 3OHIA 1FBAA 3GO7A 1EKKA 4ZQPA 1OABA 3IIOA 1KM1A 1UCWA 3NYZA 4MY9A 5AYYA 3E02A 3NC2A 4JY9A 4XWUA 2C4EA 1TV7A 1VGAA 1YPIA 4Y90A 4LS0A 3GX9A 1AW5A 4AEOA 3KD6A 4KAHA 2CZEA 2NV2A 3GDRA 3V1PA 3LLFA 5CPLA 4OQVA 2PRLA 3W71A 1TIMA 4O17A 3DGRA 1EUNA 3PUEA 3G22A 2WSRA 3O6YX 2Q8ZA 1TJPA 2VFFA 3LHXA 1DGMA 2QAPA 2A9ZA 3W1NA 4O14A 3N3MA 2A9YA 4OV4A 1LHRA 3DFSA 3EXSA 4GUJA 4FIRA 3G24A 4POCA 1KA9F 2VENA 5BYCA 4Q4KA 4JTSA 2DZSA 5DCDA 4TO8A 3BW4A 4BWLA 2BX7A 3CEPA 1N8FA 3P7YA 4N2YA 1DJQA 3FJ6A 3PM6A 2EPHA 4GUIA 1SUXA 3GAYA 5HWNA 4X2RA 3L68A 4O1BA 2C15A 2GJLA 1Q6OA 4H6KA 1ZAIA 1KTNA 3T78A 2AWDA 1IF2A 2ZRZA 4N4PA 3NEVA 3MYOA 5K2ZA 1J2WA 2YZRA 4B8RA 2GOUA 2GUUA 4IXHA 3W70A 2GJNA 4LC8A 4TX9A 1OX4B 3NQEA 3TNOA 1NF0A 5K7JA 4ZQRA 1W5PA 2WKJA 3NGJA 1EPXA 2JGVA 3ZS4A 2DZTA 5DY3A 4PTNA 2YR1A 2Y7DA 3RY7A 4LS2A 4UUIA 1F5ZA 4HNUA 1KM5A 5BYDA 1CW2A 2ZQ0A 1TMHA 3GVGA 3QSRA 3DFNA 3TKFA 2Y7EA 1E51A 2QAFA 3RPHA 1DKWA 3M1ZA 4AHPA 1WA3A 3QMSA 4BI5A 4OWGA 5AYZA 3JR2A 4AHOA 2R14A 3QZEA 3ABOA 4HNNA 4MKNA 5KZMA 4YWIA 5TRWA 3RS8A 3MBJA 3KVLA 3HPZA 4LRSA 3C2RA 1QPNA 4O1LA 4X22A 2A7PA 2E77A 3GDKA 3R5EA 3LX9A 3Q92A 4E69A 3GKAA 3ABSA 4MYAA 1I4NA 1XDLA 4JTEA 4HPXA 3DHDA 1B4EA 2YGYA 4DBDA 3M16A 3CLMA 2FLIA 1LHPA 1W3TA 1SZEA 5F4WA 1EIXA 4O0KA 3PVFA 4AHQA 4IXXA 1QNVA 4Z1CA 3NL6A 3W74A 1M5WA 2FDSA 3M9YA 1LORA 3UZ5A 3BPWA 4O54A 3T40A 1HUVA 1D3GA 1OFDA 1IXNA 4K8EA 5ABTA 2Y6ZA 4DF1A 4FX7A 3L0GA 2JKAA 3S5OA 2JGQA 3S1WA 2B0MA 3CTLA 2CZ5A 3E0IA 1M7PA 5HWJA 1RD5A 4O13A 1IIGA 2B7NA 2CLKA 1QOPA 3A22A 1TB3A 1XKYA 2E6DA 8TIMA 1QO5A 2ZFAA 4UC5A 1D9EA 1M7OA 3LI0A 1K8XA 2ZA3A 3O1NA 4FX8A 3WJZA 4RCXA 2A7RA 3LXCA 3L5AA 5D2WA 3VKJA 1WYIA 5KZEA 5F2IA 4FNSA 3TUUA 1G4SA 1YDVA 4AXKA 1L2LA 3CQDA 3B04A 1H51A 3C2EA 2A0NA 2R3EA 3NXFA 4UTMA 3W85A 3LHVA 3WJYA 3ATYA 3EX3A 2RHGA 5EBUA 1VR6A 1F05A 4UTWC 5K9DA 3NG3A 3Q37A 1DL3A 1F6KA 4Y6GA 1V1AA 2ZTJA 5AHIA 3L67A 2QCVA 5D37A 2A85A 1XL9A 2NX1A 2I5BA 1R2RA 4CCCA 1N55A 2QDHA 2JG5A 1RV8A 1LTDA 4GM6A 3DENA 1JCJA 3EWYA 4FNQA 2OX1A 3FFSA 1SR9A 3C52A 2WNNA 3KOFA 1RQHA 3HPSA 3LHWA 1RK2A 4NJJA 4NT0A 4YCPA 3H55A 4K36A 4MUZA 3RU3A 4EOUA 1VYRA 3QYQA 4E84A 4KWVA 4WJEA 3THAA 3NPVA 2X1SA 4DEFA 3C2OA 1BX4A 1PHWA 3G1VA 5C3YA 2P1FA 2BWGA 3W9ZA 3RSQA 4FXSA 1BWKA 4U4MA 4RZ4A 3IIVA 4XZ9A 1GTHA 3RO4A 3PBVA 1VK4A 2Z2UA 4O19A 1ZHAA 3CHVA 3RTAA 1PV8A 1TPB1 1I8JA 3HMJG 5BRBA 4U28A 3S42A 5EY5A 4MY1A 4L4MA 3LCWA 1YHJA 1MSSA 3G1AA 3UNDA 1KFKA 5TQLA 1UJPA 2WNZA 2ABQA 1U2XA 3W1LA 4FF7A 3TH6A 1FWSA 3C2FA 1QFEA 4KWWA 2NX3A 2QDGA 2NXGA 1KM4A 1G4TA 3RSFA 4LRTA 1UASA 4K8TA 1XUUA 4UBEA 2Y88A 3HGSA 4JJPA 2AAMA 2NWRA 3FLUA 3FHYA 1GVFA 5DBUA 1W54A 3TW6A 2UV8G 5HR6A 3RFAA 1H5YA 4A3UA 2C16A 3KVJA 5FF4A 1NSJA 3HYOA 1W56A 3DFQA 4IJBA 3M43A 1GYNA 4WY0A 5HUOA 3O6CA 3RM5A 4UTIA 4B8SA 2EAWA 5I3KA 5D38A 4S1HA 1WX0A 1NFBA 1ML1A 4KANA 1ESQA 3G1SA 3QF0A 3U2OA 2Q3OA 1UA4A 2RDUA 2QKFA 4NNCA 3PB2A 3OVQA 4JTGA 1SO6A 3GZ3A 1JR1A 2HW1A 5F4SA 1AK5A 1OX6A 1OFEA 2YYUA 1MEHA 2F7FA 3KX6A 3GYEA 4P61A 4XTIA 4XCKA 1FXQA 6TIMA 5C5YA 4TU1A 1UB0A 4CQAA 4GXMA 4UNKA 4K8PA 4M6QA 2J24A 1XBVA 4LUIA 2Y7FA 1MEIA 2R94A 3NZRA 2VC6A 2YW4A 3GLCA 3P61A 5FEPA 5G2WA 1WOAA 2VFHA 4BR1A 1EUAA 1B4KA 4FX6M 1VCFA 5FI8A 2ZBTA 3B1RA 5BNKA 3C6CA 3TFCA 4S1MA 4PA8A 3FKKA 4FIQA 1SW7A 3NQGA 3GXTA 3RREA 2DZVA 3IVUA 5DN1A 5LSMA 2ISVA 5KMYA 2AJRA 2EGZA 4LWWA 3TW7A 4WJMA 3UYCA 1GVQA 4HN4A 3W7PA 2CW6A 5LKYA 3G8RA 4QIUA 3KFTA 3RT9A 3UWVA 2AB8A 3DKJA 3B4UA 4HSNA 4O16A 3A23A 1S3HA 3TXVA 1ESJA 2JG1A 3EB2A 1PE1A 1OFOA 4IMGA 1Q3NA 2NXHA 3M6YA 3W7LA 5FF3A 2VFEA 1JCNA 4O50A 1IGSA 3M5ZA 2DORA 3QEZA 3I68A 3P74A 3W72A 4OT7A 3IVTA 3TSMA 2QUTA 1GEQA 4M6PA 1V5XA 3NQ8A 3GK0A 1G7VA 5HWMA 4JKSA 1S5WA 1FCBA 3DKLA 4PFMA 4WOZA 4GFSA 4N08A 5DCEA 3I3YA 4C5KA 3O06A 4EN4A 1F2JA 3TR2A 3KXQA 3B0VC 4IX0A 3PSWA 5CGQA 3NPXA 4K7YA 1A5AA 3IVSA 2VFIA 5EY7A 4C5MA 4N09A 4QSHA 3S5NA 1OK6A 4Z1BA 2F84A 3MI2A 3K5WA 3CIXA 2FPYA 3S5ZA 3QA2A 1YXYA 4IMDA 4JNMA 3N9RA 3M5YA 1YTKA 1F74A 2V2CA 3RK8A 4MFEA 5F1UA 4DBEA 1JUKA 4Z0SA 3NL2A 3OTXA 3W7IA 5CZSA 5B6AA 5G5IA 3EKZA 4CQ9A 2P10A 5H2ZA 1OX4A 2C0AA 3PG9A 5FESA 3F03K 3NO5A 4X9SA 4JICA 3WK3A 4AWTA 3LBMA 2QCCA 3LV5A 4CLMA 1H60A 1FY6A 1SO5A 4BF9A 2XN0A 3L9CA 1GQTA 4O4WA 3M47A 1VPXA 3B3LA 1KW1A 5U4NA 2TSYA 2QCHA 3PSVA 1HL2A 1SQ7A 4JX6A 1XBXA 3Q1YA 1VC4A 4K39A 4EF8A 2Z0IA 2QCDB 4JKUA 2PKNA 1JCMP 3OVPA 4CNPA 1H7NA 3ZWSA 1A5BA 3NVTA 1KM2A 1WBJA 3BLIA 3IKHA 3L0KA 3SY5A 5DY2A 2QJGA 4HSOA 2FPTA 3HIJA 1W3IA 3EWXA 1R30A 3NCAA 3MYPA 4R7JA 5L6UA 1K02A 3HG5A 3ZFHA 1GJPA 1TPWA 1JRCA 3R12A 1K8ZA 1W5OA 4KALA 4MY8A 3HF3A 5FEWA 1AW1A 1P0KA 1EP3A 1CX9A 3LDVA 4AH7A 3RTDA 2GPTA 3GIYA 1G6CA 3WJXA 3LOOA 1ALDA 3QJAA 4HT3A 3EWBX 1FWTA 3P60A 3NZ1A 4LC4A 1DHPA 2Q8LA 3LKIA 4DO4A 3GDLA 4NXKA 2E09A 3LCFA 5I3GA 3LCHA 5KZDA 4S2CA 2H3BA 4ZQMA 1R46A 4IPIA 1TV5A 3TMQA 5CM5A 4IPJA 3WFAA 4MVAA 2PRMA 4IWWA 4XF6A 2DZPA 4LW7A 1DOSA 1K7FA 2VEKA 1KFJA 3P67A 4EWND 3A9IA 2WSQA 1THFD 3DFTA 5L9FA 1KBJA 5F4XA 1O95A 3TC7A 1W5NA 5CKSA 2I1OA 4ONVA 1RKSA 2CZFA 4GRSA 4QITA 3TQ0A 3STGA 2VELA 3EWMA 1SU5A 3R8RA 5BMXA 2G97A 3LHTA 4GBUA 1NEYA 4O52A 1B9BA 3S6DA 3W2NA 2X1UA 3T55A 3QSTA 3T4CA 1LRNA 3R2GA 4IMCA 3IIZA 1H7XA 1W0MA 4O1GA 4RXFA 3L21A 3BGJA 4IMEA 3B0PA 1XC4A 4MZYA 4KADA 2V81A 2R91A 4C1KA 3CT7A 4ORMA 3MI6A 4O15A 2QCEA 1JJKA 4DF0A 3UPWA 3DH7A 4ZQCA 4E3AA 2DDWA 4WOQA 4UMCA 2BZNA 1YYAA 2QJHA 4XTDA 1H7WA 1AL7A 5CGAA 1GYLA 5KSWA 1SZNA 3HGOA 4ADUA 4O1CA 1SSDA 3NQ6A 3P80A 3W1UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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