3NM3A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
539
structure length
510
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGVTLVQIREKDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGPDMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPDMVDYIGVGTLFPTLTKKNPMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSTKNSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGATETRLLLNNKLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSKGTNGTSVEDIPCVAVEAGPIGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Candida glabrata
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
total genus 161
structure length 510
sequence length 539
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nm3A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nm3A02
1L2UA 3GXPA 3L0KA 2V82A 3TSBA 3W4SA 3SECA 3N19B 4WJMA 4H4IA 5AC8A 1H7OA 3TJLA 4MYXA 1Z44A 4E0CA 4JTGA 4S1MA 1TREA 3TW7A 5G1TA 4BI7A 3DI0A 3MP5A 1VM7A 1WV2A 3M6YA 4WOZA 1RQBA 2QR6A 4JJPA 2BZNA 3T40A 2X1SA 2A21A 3W88A 4AEOA 3M5ZA 4O1LA 2HW1A 2HMCA 4S1IB 3ZWTA 2QEZA 3W1LA 2NWHA 1TPB1 2V9DA 3HICA 2WSYA 1SU5A 1W37A 3W7EA 1DQXA 1GT8A 3RTEA 4AHOA 3ANYA 3DAQA 3NBVA 2Y89A 3RTDA 1OYBA 4L4LA 3VFLA 2B7QA 3DHFA 3CU2A 4TMCA 2CZFA 1PS9A 1D3GA 1EPXA 1TQXA 3S6DA 1JCYA 3IE7A 3KD6A 2KZHA 4KANA 4ML9A 1VI9A 4K39A 4RZ5A 1XBXA 4OWGA 2ZZ3A 5FEZA 6TIMA 3IVSA 3LLFA 5G4EA 1F6PA 3KHJA 4E2BA 5KMYA 1RFTA 3MYPA 3KEUA 4QISA 1LM1A 3OHIA 2DDOA 1OABA 4XUGA 1G4TA 4EWND 2HS8A 1DORA 5D38A 3BLIA 3C0JA 2J6XA 3HGOA 3Q37A 2V30A 3BO9A 3N2MA 5FF2A 4MY9A 1L6YA 1VK4A 4BWLA 3E96A 3QMRA 2CLEA 2R3EA 4S1IA 3ABSA 1ADOA 1PHQA 4O0KA 2Q8LA 1VH7A 4A21A 3C2VA 3E0IA 3I6RA 3SW6A 5K3VA 1PVNA 3LBMA 4FNPA 3QMSA 4UMBA 4EUMA 3L5AA 1GJPA 2C6QA 3WJWA 2E6YA 5CZJA 2BLEA 1JQXA 1EP2A 1VYPX 1SW3A 1K7EA 3NQ2A 5AHEA 2C14A 4KALA 2OMAA 5FESA 3GDTA 4RKAA 2E68A 1PCKA 3W22A 3VCRA 1QOPA 1LROA 1W8SA 3IN1A 1TMHA 3PR2A 1YTKA 1WOAA 3LOOA 3BGGA 4LU0A 1UJPA 3LKIA 3RQ6A 3PL2A 5FF3A 1TSIA 4N6FA 4O53A 3RQ8A 4MZYA 5LNUA 3W2NA 2Q5RA 3P5ZA 2RDUA 1SFJA 1JRBA 1S3HA 4ZVJA 3GDKA 3RQXA 3RO4A 1GC5A 4ZQRA 2TRSA 3KRZA 3PSWA 3DFTA 4MZ8A 4U7XA 3HG3A 4FXSA 3STCA 3LCFA 3C52A 3NL3A 5MHBA 3G3DA 4UTWA 3T78A 1VLIA 2VFEA 2Y88A 1H7PA 3I7QA 2DZXA 3TU9A 2TYSA 3L5LA 3WK2A 5EY5A 4IMDA 1GG0A 4JICA 1JQVA 3RFAA 2GVJA 4MFEA 1BTMA 2JGYA 3N3MA 3PBWA 2PRHA 3TUUA 4OQVA 3S1UA 3W1UA 3RRJA 1BWLA 1ZY9A 2QCDB 1G7VA 3HF3A 1W5PA 4GUHA 4QAIA 3LTSA 3HOJA 3C2EA 4UCGA 1JJKA 1LDCA 3KVJA 1YLVA 3W71A 3B1QA 3EKZA 2A6LA 2UV8G 1TV7A 4Z1AA 5EMUA 1Q45A 1HO4A 4FB7A 1Z48A 1LHRA 1QPNA 2RKXA 3TMQA 4IPJA 4JX5A 2YDAA 4C5MA 3VKJA 4AWUA 4DXVA 1LORA 1XCFA 4BK9A 1JCXA 3M7WA 1SPQA 3GNNA 1B57A 1GOXA 2OT0A 1GQTA 4JTJA 3GAKA 1D3HA 3EXRA 1RKDA 4DF2A 5D03A 1GPWA 3I7SA 4FX7A 2ZZ7A 1C8VA 2E5BA 3GAYA 3N14A 1YYAA 1RFVA 2QJGA 2RH9A 4TU1A 3K9EA 1ZCOA 3RNDA 3UWVA 2GQ8A 3M5VA 2QJIA 2VFDA 1FDJA 2ZTKA 4YMZA 3KXQA 4DELA 3NGJA 2HLZA 4QNWA 5LGXA 1FCVA 4UTTA 4Z08A 3LHXA 4YCOA 3C8FA 5F4XA 3W70A 3BK0A 3CWOX 3GK0A 1KV8A 2E6FA 2ZCGA 3GDMA 3S1XA 1WBHA 1IXNA 2QCDA 1DJNA 3D0CA 1JUKA 4C1KA 3R2GA 3DI1A 3W83A 3EWBX 3KAOA 3NOEA 1DVJA 1H7RA 2QCMA 2PKKA 2FIQA 1TV5A 1Z42A 3MW7A 3QSRA 1YDOA 4IMCA 3GNDA 4CCEA 3LCGA 4NVTA 1CW2A 3M9YA 1ZNNA 2I9EA 3EX2A 3LLDA 5C6MA 5BMWA 2R14A 1G4PA 2NV2A 4CLMA 4HNNA 5CSSA 1I45A 5I3IA 3EWXA 3RK8A 4PFMA 5HWNA 1I2NA 1W5QA 3CIXA 2Y61A 4O0ZA 1BX4A 1K8XA 1AK5A 5D33A 4XDAA 3BV4A 4UNLA 3L2IA 1YDNA 4JY8A 5DCDA 4O18A 4ADUA 4MUZA 3A21A 2QCNA 4O12A 1A5CA 2WO5A 3KOFA 1VCVA 1EWEA 4QM1A 3I3YA 3STGA 2VELA 4E38A 1QOQA 3DFSA 2YSWA 3PUOA 3T55A 2VEIA 1IF2A 5AYYA 1XKYA 2TMDA 3BARA 3M5XA 4G1KA 4I7UA 5BOOA 1V1SA 1YGJA 3W7JA 1QCWA 4AXKA 1JULA 4R34A 4RR4A 2VFHA 4LOCA 1KW1A 2P10A 3NG3A 4R7JA 3B0UX 3S1VA 4GC4A 1QWGA 3DXIA 3SI9A 2H8XA 3SIZA 4A3UA 1AMKA 3G18A 3LRMA 1QO2A 4XTIA 3MWAA 4LVGA 1U2XA 1KFBA 3SZ8A 2V78A 1EIXA 1R2RA 1OX5A 3L0GA 1I2OA 4OV4A 3QZEA 4EF9A 4XCKA 4IUOA 3W2JA 1ICQA 4EBUA 3P67A 3R13A 1U5JA 4TX9A 3EX4A 3MHGA 1TD2A 5TQIA 3RQQA 3IIZA 4UFMA 1FCBA 1YPIA 4O28A 1J2WA 5FF7A 4PC8A 3MYOA 1I2QA 4IQLA 3NC9A 1XUZA 4LVAA 4DBDA 2DZVA 4PTNA 3FJLA 2F7KA 4KKXA 1YTDA 4ORMA 4O8RA 1X1OA 3OA3A 3NA8A 4XWUA 1N7KA 3OG3A 5I3KA 2PKNA 3GDRA 3JULA 2R94A 3GB6A 2BTMA 1KM5A 2NWSA 3W7NA 3TIMA 3RQ5A 3EB2A 5B6AA 4O13A 1LZOA 2HTMA 3W7KA 4HNVA 3N1CA 4X22A 3NVTA 4FNTA 1NAL1 1XDLA 3W1TA 2PKFA 5F2LA 4JTKA 4HIBA 2BXVA 1X1ZA 3H54A 3NZ1A 4WY0F 4K7YA 1TZ6A 3RRBA 4M7SA 2GVLA 4JTSA 2CLKA 3M41A 1VGAA 2BX7A 3BGJA 1R47A 5C41A 1MSSA 4AWTA 2C15A 3P5YA 3RT7A 5K2ZA 5C3ZA 2Y70A 4E3AA 2NUWA 2Z0IA 4E8YA 1T96A 1SQ7A 4UTUA 2QAPA 1P1XA 3TH6A 1JUBA 3UY8A 4O4VA 3RPZA 5CPOA 1S5VA 3A9IA 3DFNA 1WDWA 3B4UA 5HR6A 5EBUA 1GVRA 4WOQA 1IIGA 4IX0A 5DBUA 3B04A 1WYEA 1SO5A 5C40A 5HUPA 4AH7A 4AF0B 4IJBA 3IH0A 4MPQA 1VR6A 4RX0A 1L6SA 4MKNA 2NUYA 1F6KA 5CPNA 1ZAHA 2AFBA 4M19A 3B1NA 4HHPA 4KFOA 1W0MA 3FEMA 3R12A 1ZJIA 4NXKA 5CZSA 4DF0A 4IWWA 1GTEA 4JXCA 3UZ5A 5D04C 2YZRA 1OFAA 4O10A 3AJXA 3LCWA 5CG7A 3B1OA 4RZ4A 2FPYA 3GYEA 4EOUA 5F4WA 3UQ6A 3L66A 2ZFAA 1LLWA 3IVTA 1VZWA 4AB4A 3BPWA 3F4WA 5F2MA 1G6CA 4D2JA 5D32A 1OK4A 3CHVA 2WNQA 3IEBA 5AHNA 5F2GA 1H1YA 1LCOA 4UMCA 1TPEA 3B0VC 4O17A 2I1OA 2GOUA 3S5YA 3ATYA 3HMJG 4LVDA 3B1RA 2O7SA 3UMOA 3RLVA 2QDHA 4JS3A 3G1SA 3HO8A 3M47A 1XBVA 1A50A 1RKSA 3NO5A 4DU5A 1SSGA 4LUIA 3G24A 2F84A 3G0XA 4FHAA 3NEVA 2I14A 2F7FA 4NQ1A 3THAA 5E93A 1P5BA 4UBEA 1VCFA 1EP1A 2I5BA 4E69A 4AF0A 3B3LA 5IBXA 2YGYA 1LIJA 4DQWA 3QSTA 2QUVA 4GRSA 4CNOA 3QW4B 4O1AA 3UQNA 1HG3A 2G5WA 3V1PA 1EA0A 1B3OA 3LHVA 1TPC1 3NDOA 4M6VA 2V5BA 2CLMA 3G1FA 1P4CA 2JG1A 3B05A 5BYDA 5EPDA 4Y96A 1E51A 5LHFA 4TMBA 2NWRA 3C56A 1Q3NA 3SGZA 2VKZG 1VJIA 3NBWA 3RSQA 4CQAA 5DCBA 4WX2A 3NQ7A 5DELA 2E77A 1RVGA 2FLIA 3A24A 2G97A 3EEGA 5DCEA 4S1HA 4MVAA 3UNDA 4MYAA 2WSRA 3UWQA 3NXFA 3TQVA 4HNUA 3W7IA 1IXOA 1K02A 3C2RA 4LS2A 3BF5A 1OJXA 3OVPA 1J5TA 4ZZ9A 5KZEA 3OEXA 5AC6A 3LX9A 2VFGA 3CIWA 1IXQA 4AAJA 1UA4A 3CWNA 5J5DA 2Q3RA 3NPUA 3RLUA 2C13A 3KVLA 4Q33A 3C2FA 4EOHA 1T8XA 2JKEA 1TPFA 4X9SA 3LXAA 2J9XA 1OFEA 4A22A 5F1UA 5H91A 4KBEA 4WXYA 4CNNA 4Y6GA 5F4SA 1F74A 4K38A 1WBJA 4UR7A 3T44A 1Q6OA 3FLUA 3TSMA 2NZLA 3M0ZA 2ATSA 1VYSX 1KM2A 2RHGA 3S1WA 3CLMA 3QQ1A 1ML1A 4FX8A 4RZ6A 3I68A 4FXRA 3NYZA 1W54A 4ONVA 3QAIA 1C3QA 5A8GA 2VXNA 4CQ8A 4JD4A 2BWGA 1VC4A 2CZEA 1ME9A 3FA5A 5LSMA 3EX3A 2JK2A 1O4UA 3W76A 2FFCA 4K8EA 4DF1A 4GUIA 3MI6A 4E84A 2TPSA 5BMXA 3S5NA 3W3OA 1VQTA 3STFA 4IGHA 4LRSA 2Y6ZA 4BR1A 3GDLA 2E6DA 2DU2A 3MUXA 4O1BA 1ESJA 3TFXA 1OFDA 2AJPA 2ZZ5A 5C55A 3S0CA 4TR9A 4N9CA 1VS1A 3BW3A 1HTIA 3NQMA 3TMLA 5C2XA 2J9ZA 4EN4A 5BYFA 3S9YA 2CLOA 5DBTA 3W2UA 4S2CA 3PB2A 3STEA 4LV4A 3E02A 2NXGA 3QRHA 1QO5A 5D02A 3NQGA 1YGKA 3PF3A 1KBJA 2QCCA 3OVRA 4BI6A 2CW6A 4BWLC 2Q8ZA 3E9AA 1TPH1 3CEUA 5AHMA 4AVFA 3VAQA 4RXFA 3JR2A 3DKLA 5H2ZA 4TO8A 3CEPA 3GR8A 4JDBA 4XQ6A 1BWKA 3MHFA 3O05A 3L9CA 3VE7A 4UFLA 4FEZA 4K7VA 1OX4B 3L65A 1OFPA 3UWUA 3VNDA 1XUUA 3W7LA 1V1BA 2ABQA 2NX3A 4OV9A 3PUDA 1K03A 4JTLA 1M7OA 2YFNA 5F0ZA 2J24A 3NL2A 3IBQA 4N08A 4OBTA 1R2SA 2I6AA 1DBTA 3NQVA 4LS1A 5U7SA 1TPVA 2R8WA 1MXSA 1YHJA 1LLZA 1KM3A 1XBYA 2PE4A 2QDGA 1YPFA 3EWYA 4RCXA 1ZAJA 2J88A 2D73A 1KFJA 3G0UA 4LC8A 4P2VA 1QPRA 4NZJA 3W2MA 3W1NA 2LLEA 4UFIA 3W2LA 2AJRA 3RM5A 2FV7A 4IOTA 3GIYA 3NQDA 1THFD 2ZTJA 4R33A 4X2RA 4LV9A 3W73A 2TSYA 3QPYA 4O15A 1MEWA 3WJZA 5AB3A 3IV3A 3LDVA 1G7UA 3QYQA 4O11A 4O52A 1Z41A 5LZLA 5HJLA 3F4NA 4NX5A 3SFKA 1FXPA 2X1UA 1KBIA 4W9TA 4UTWC 4YWIA 1MEIA 3QC3A 1ZHAA 4JR5A 2EKCA 5FF0A 5D2WA 3FHYA 3QM3A 1FWSA 3LRKA 4HPJA 1SZNA 3RTCA 3S5OA 1U83A 2V2CA 1FX6A 3EWZA 4A2RA 3GO7A 3HGJA 4DPPA 1W3IA 3MP3A 1P0KA 4ZQMA 2P1FA 4LVFA 2ISVA 4DO5A 4U28A 3F03K 3A5VA 2VEKA 1W5MA 2H8ZA 1NSJA 1QMLA 1OX4A 4X3ZA 3KZHA 4YLWA 3DGRA 4JNMA 4MFDA 4EVZA 3HGRA 5LNWA 3MMTA 2AWDA 5TQLA 2WNNA 1M5WA 3IKHA 4FNRA 2E1DA 4I9AA 1YDVA 2AAMA 1JRCA 1N55A 3N73A 2ZRVA 1W5NA 2X1RA 5F1VA 1EEPA 1IXPA 2V2DA 4PL1A 2WQPA 3UYCA 1W3NA 3W07A 3G8RA 1LIKA 3P82A 2PURA 1FDYA 5AC7A 2QCHA 3EWMA 2JGQA 3ABRA 1PV8A 4ALDA 1F73A 4N9BA 3TXVA 1FWNA 1YADA 3O07A 5DN1A 1GEQA 1I4NA 2FDSA 2RDWA 1WYIA 3CQ0A 2PC4A 1HO1A 1VLWA 4OT7A 1KA9F 3L67A 5D2YA 3W23A 3Q2DA 3GLCA 3P84A 4O1GA 3NL5A 3G1HA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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