2YLL | Genus

Total Genus 175

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	175
sequence length	436
structure length	436
Chain Sequence	AMNEKLAKKKIVSIDAGRKYFSPEQLKEIIDKAKHYGYTDLHLLVGNDGLRFMLDDMSITANGKTYASDDVKRAIEKGTNDYYNDPNGNHLTESQMTDLINYAKDKGIGLIPTVNSPGHMDAILNAMKELGIQNPNFSYFGKKSARTVDLDNEQAVAFTKALIDKYAAYFAKKTEIFNIGLDEYANDATDAKGWSVLQADKYYPNEGYPVKGYEKFIAYANDLARIVKSHGLKPMAFNDGIYYNSDTSFGSFDKDIIVSMWTGGWGGYDVASSKLLAEKGHQILNTNDAWYYVLGRNADGQGWYNLDQGLNGIKNTPITSVPKTEGADIPIIGGMVAAWADTPSARYSPSRLFKLMRHFANANAEYFAADYESAEQALNEVPKDLNRYTAESVTAVKEAEKAIRSLDSNLSRAQQDTIDQAIAKLQETVNNLTLTP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Inhibition of the Pneumococcal Virulence Factor Strh and Molecular Insights Into N-Glycan Recognition and Hydrolysis. pubmed doi rcsb
molecule keywords	BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
molecule tags	Hydrolase
source organism	Streptococcus pneumoniae
total genus	175
structure length	436
sequence length	436
ec nomenclature	ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date	2011-06-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00728	Glyco_hydro_20	Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1270.90	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2	AF1782-like	2yllA02
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2yllA01

4FF5A 1US2A 3L4TA 1CDGA 1G5AA 1P6WA 3VOCA 1RD6A 2JEQA 3EDJA 3AZSA 4MJ2A 4F9DA 3W0KA 4KGJA 3WSUA 2GK1A 1JDAA 2GJXA 3O2LA 1UOKA 4AY1A 2A3BA 4OBRA 4GZJA 1BTCA 2VL4A 1NARA 3RPMA 2VRJA 3FHQA 1WAWA 5CSUA 1QOXA 2W63A 2DQXA 5LYRA 2JIWA 2JF6A 4CD8A 2XGBA 2WANA 1R86A 2EBNA 3E1F1 2X0YA 4AZ6A 1WNOA 3RMEA 3U7BA 2VQTA 3PZNA 1EGZA 3THDA 4R27A 1SMAA 1MW3A 3RJYA 4FK9A 1XD1A 3POCA 4M82A 4WKAA 3SCRA 1GOKA 4ZXOA 4LQ1A 2OZNB 1E73M 4PMYA 1OIMA 4WF7A 4JIEA 3W38A 2VI0A 3WUBA 1QVBA 2WVVA 1ZJAA 2EQDA 1J11A 1B3VA 1OT1A 2BXYA 3VD3A 3BAWA 3VIPA 2JFEX 2O9OA 2VCAA 4LXFA 1B30A 2EJ1A 2V5DA 3AJ7A 4PMZA 4X0NA 2WM0A 8A3HA 4WK9A 2CBUA 3WBAA 3WNKA 2BHYA 3WDHA 3WL0A 3GZAA 4P7OA 3CUHA 2CHOA 4ACZB 2WZIA 4UFLA 5EBAA 9CGTA 4KH2A 6A3HA 2E9MA 1Q6DA 2DPEA 4NZCA 4DWSB 2D2OA 3NIYA 3CUJA 3ZT6A 1V0LA 2JIEA 1H09A 1XSIA 3B8SA 3M7SA 1D3CA 1OCQA 1E6NA 3SCTA 1CYGA 2PWDA 3ZJ7A 3W6MA 3SIMA 1MYRA 1JAKA 3WQVA 2J47A 4BQ2A 4HMDA 3OLIA 2ZE0A 2IUZA 4H8UA 2VNCA 1C93A 1KCKA 1V6YA 3KWXA 2FHFA 1JD7A 2ZX7A 5E6ZA 4DUXA 2JNKA 4HZ8A 1HXJA 1BLIA 3A4AA 4K68A 4DUWA 3OGRA 4HA3A 4MDPA 4OOUA 1XSKA 4CD7A 5A6MA 1WZAA 4AZBA 4LPCA 2QLYA 3WF2A 1NP0A 1V6UA 3HMCA 3IJ8A 3UETA 5CQ1A 1W2VA 3MU7A 3CZLA 2CBIA 3ZR6A 4QCEA 1K6AA 1WDRA 3WEMA 2CYGA 2PWFA 2WC7A 1JYNA 1KXTA 3BAXA 3F5KA 2EPNA 3SCUA 3THCA 1UWTA 2W91A 1HL9A 1E43A 1FP8A 1CGTA 3AS2A 3G6LA 3WFZA 1VRXA 4GPNA 1F4AA 1OWQA 4OIFA 5CG0A 1CPUA 1W3HA 3WEOA 2AAAA 4PSRA 3WQ6A 3BMVA 4HPGA 2ZUNA 4JFTA 4OBSA 4CCCA 3AHVA 1GPFA 1JDDA 1B31A 3UG3A 3GNRA 3QGVA 3UG5A 4WSJA 4W89A 1LWJA 2OWXA 3OGSA 4GO9A 3M46A 3FHAA 3MUAA 5FKYA 3CH9A 2VZOA 2CESA 3SUUA 4ATLA 3AFBA 2A3CA 3FAXA 2Y8VA 4BZYA 1Q6CA 2F2HA 1UR2A 2ZX5A 5I78A 1XYFA 5AYBA 2Y4SA 1MWOA 2JEPA 1W1VA 4HA1A 1UD3A 1TVPA 3A4WA 4PMQA 1V3KA 2CPUA 2F61A 5FL1A 1M53A 4GQRA 1UA7A 3DHUA 3VDAA 2EPKX 4MPKA 1BVNP 2J7GA 1H11A 1JGIA 1JZ5A 1C7SA 3A4XA 5A2BA 4B9YA 4PCSA 1TMQA 5C71A 1JZ4A 2ZUWA 3MV01 1OGSA 2A3EA 1VF8A 3ARVA 2Z1KA 2VX6A 1UWSA 3A3HA 3BAYA 1XRVA 1H2JA 2W5FA 4M29A 4TTGA 5CJ5A 5ABGA 1JFXA 5CLTA 1US3A 3GBEA 1JYWA 3NDYA 4IPNB 5A6LA 3N13A 4JCLA 3T08A 1MQPA 2WBGA 1EQCA 3A47A 1RH9A 4ML4A 3APGA 5A95A 2OSXA 5BXRA 5CPQA 3GXFA 1BHGA 1FHDA 3FNDA 4A3YA 2X1IA 1W91A 2OSWA 3AMKA 3RIKA 3WDRA 4M1RA 2D3LA 4FLSA 4J3WA 3NSMA 2XVPA 3WIJA 2YDSA 2GDUA 3RM8A 4X0VA 1SMDA 4AD5A 1TZ7A 4U3CA 5EFDA 5FD0A 4YHEA 3WNNA 1W32A 4U31A 3VDBA 1B9ZA 1FH8A 1EA9C 3WMSA 4KRUA 2WHJA 2MANA 1V3LA 1I1WA 3L2MA 1ISYA 1HP4A 3VD9A 1LG2A 1GQIA 4HA4A 3TONA 1UG6A 3W28A 3WNLA 2VJXA 3OGVA 4NRRA 4IPLA 4B16A 4DWSD 4RE2A 4QLKA 3VPLA 1E1EA 1G0CA 4Y7EA 3GYCA 3TTYA 3DC0A 3GH5A 3CUIA 1VBRA 1GOQA 2DIEA 3AIRA 3VKKA 1CECA 1JZ6A 5A6SA 2D24A 4PUDA 3ZOAA 4WJXA 4JHZA 4YPJA 4UQDA 2VZUA 1QPKA 5BXPA 4EANA 3WL1A 2QV4A 3PZGA 1KFWA 2J78A 1MFUA 3FY1A 5E0CA 4NSBA 3OLEA 1JDCA 3L4YA 3VU2A 3SUSA 4QDMA 1UD2A 1FOBA 3VNZA 1E5JA 3BSGA 1B3XA 4L4PA 4JFWA 3ARSA 4UFKA 4V27A 3CO4A 1VEPA 1HF6A 4W7WA 4B3LA 1UH3A 2VO5A 4WLCA 3MANA 3T0BA 1DWGM 2GJPA 1OD8A 2UY2A 3VMOA 4LGXA 1E0VA 3S6TA 1CGXA 5CGMA 3VMNA 3WENA 2FH6A 1IZJA 4WKFA 5KEZA 3KEHA 4E8CA 3POHA 2XUCA 2CCRA 3L4XA 3U5UA 1ISWA 2VURA 5ABFB 4AEEA 6TAAA 4P7LA 4LYPA 1R87A 2GJRA 1W3LA 1KGWA 1H3GA 1VEMA 3CUFA 2UWFA 3LPPA 3AS3A 1B0IA 1W2PA 3NSNA 3CZJA 4W8LA 5FOOA 3RM9A 1QI0A 1ZS2A 1BYCA 1EXPA 2VTFA 3PTKA 3OLDA 3N11A 3WD0A 1JNEA 1OGGA 1V02E 2E9BA 2XSBA 7A3HA 2VZVA 5CPTA 1BF2A 3W81A 1LJYA 2GSJA 2V38A 1GCYA 1X6NA 4ZE4A 4IM4A 1UKTA 3SCQA 3TTOA 2V3FA 2ZWYA 2ZIDA 1CTNA 4AEFA 4KWUA 1HL8A 2CERA 4J7RA 1E6ZA 4ZE5A 3WD4A 3TTSA 5JIPA 3K8KA 3CLWA 4QCFA 3VGGA 1BYDA 3SCVA 3WNMA 1E55A 1AMYA 4HTYA 3PZTA 4DWSC 2BHUA 4CU8A 2VVSA 5AY7A 2J7BA 1TR1A 2BVTA 1I75A 2G4FA 1EDTA 1K9FA 4Q7NA 1GQLA 3SCOA 3W24A 4PTXA 1ISVA 1CXLA 3AROA 4CKQA 1DHKA 4RE3A 2WYSA 1QI3A 2BHZA 4TVCA 1W9VA 3VGBA 4MNLA 2DDXA 3GH4A 5LA1A 2VX4A 5GNYA 1E1FA 1KQYA 1BYAA 1W9PA 3WMCA 4B15A 2XFYA 1FA2A 3WF4A 1R8LA 3BMWA 4UR9A 3AHXA 5E0FA 1DP0A 5JBDA 1HJQA 3AHYA 1WZLA 4UFMA 1S46A 4D6IA 4UZSA 4PMXA 2A3HA 2PC8A 2CNCA 4CN4A 3RJXA 5IHRA 4A4AA 1KWKA 4J3TA 3BAKA 3BC9A 2GDVA 3AIBA 4D72A 1B3ZA 3L2LA 2FDMA 3AZTA 4QFUA 3WQ4A 4JHOA 3I3DA 1W1PA 4CGTA 1H41A 3FAWA 1UR9A 4UQAA 3CZGA 3MV11 4S3JA 1K9DA 3VDHA 1H1NA 4BF7A 3UEQA 4CN6A 1PZ2A 2Y8KA 5E09A 2J75A 1JFHA 2O9RA 2V3DA 4GI8A 4C7FA 3AXIA 4GQQA 4FZOA 3AYSA 1E3ZA 3GM8A 1EHAA 2W66A 3NSXA 5A8OA 3OB8A 2AOSA 1ZL1A 2D0FA 4EAMA 1JZ8A 2PF0A 3VDCA 1C8QA 4U2ZA 2OWCA 1BG9A 1KXVA 4OZOA 3ZM8A 2VOTA 4BQ5A 1V3IA 1M01A 2G41A 5AC5A 3JUGA 3FN9A 4CD4A 2BY1A 2VUYA 5E70A 4AZCB 3GXIA 2QF8A 3OZOA 3UR8A 1NP2A 2J7DA 3OG2A 2YA2A 1CNVA 4AD0A 1DWFM 3I3EA 3WQ8A 1UR1A 2WMHA 2YDQA 2VMFA 3VGFA 3SCWA 1CXKA 2PI6A 5DF0A 5HBFA 2WBKA 1MQQA 4PMVA 2WZHA 3WUFA 3K8LA 1AQ0A 1CWYA 1KBKA 4XUYA 4KMQA 2Y24A 3O9NA 1B1YA 1X6LA 3VM5A 1E0XA 1RP9A 1W1TA 5E9AA 1BYBA 1QNOA 4KRTA 3F4VA 3SUWA 2AMGA 2ZUUA 3MSGA 4PMUA 1V08A 4L4OA 1G01A 4W87A 2VCCA 3ALFA 2WB5A 3CZKA 1VBUA 1R7OA 4PCTA 2XSAA 1OIFA 5C8BB 2D23A 2DSZA 3GXMA 3U7VA 3BCDA 3VD4A 1Q6EA 4TX8A 2VX7A 4NI3A 2DGAA 1MQRA 4UQEA 3BLKA 4XZWA 2J8GA 2DIJA 1KGXA 1G94A 4PSPA 2YBTA 1XD0A 4CCEA 1J0KA 1E6PA 3AMCA 4Z2KA 6CGTA 1ZU8A 2DEPA 4D6DA 4M80A 1OB0A 1AQHA 1NWTA 2CETA 2W92A 3W53A 2D0HA 4P8VA 2V3GA 3EMZA 1XC6A 4M81A 4PRWA 4Z2LA 5A69A 4QP0A 1EH9A 2EXOA 1WP6A 1PX8A 1E9LA 1TG7A 3LMYA 4OKDA 4UOQA 1BFNA 3K4AA 1UWIA 5GNZA 1MFVA 1ZBCA 1HP5A 4OUEA 3NDZA 3PN8A 1PJ9A 3ALGA 3B9DA 2G3MA 1U2YA 1R85A 2PWGA 3I3BA 1CBGA 3WDJA 3MUZ1 2XTKA 3WF3A 3WH5A 2WMIA 1C92A 2W61A 5HPOA 1JNDA 1RPKA 1H4PA 1XSJA 3ARRA 3T0DA 3HN3A 3AHZA 1FFRA 3MUIA 3PHAA 1ISZA 3W37A 4DUVA 3BH4A 2VZTA 3WELA 3MMWA 2E4TA 2WC3A 4F79A 4AISA 1JF5A 2WVTA 4H41A 2J74A 3HU7A 1LQ0A 3BCFA 3OZPA 1JF6A 1FFQA 4FZPA 4QLJA 4TVDA 1IV8A 5A8PA 2E8ZA 5A8QA 1QBBA 2G3JA 1WE5A 3WEZA 4EE9A 5A6JA 3WH7A 3MS8A 2CHNA 4HOXA 5M3WA 4EK7A 1XV8A 1V03A 3BSHA 4AZIA 1JG9A 4HOWA 4HPHA 1HNYA 4C7GA 2BNJA 4PMNA 5M03A 3IK2A 2WKGA 3EBVA 2FGZA 3VMPA 1QHOA 2VX5A 4JKLA 1H5VA 1B3WA 3BLPX 2PWEA 3ZQ9A 4J27A 4JFSA 2ZXDA 1GOMA 5DMYA 4KGLA 3DYPA 4AW7A 2VCBA 1CXEA 2ZICA 4W7VA 5LA2A 1KXHA 1W3KA 5D9PA 1U33A 4W93A 2J4GA 1J01A 1EDQA 4CVUA 3CHDA 3CBWA 2DSKA 3AXXA 1W1YA 2GUYA 3CGTA 5D9MA 4AIEA 2VZSA 1VJZA 1A3HA 4H7VA 5D8WA 7TAAA 3B9EA 3ZT5A 4AXNA 4H2CA 1TA3A 1W3JA 2G3NA 2UY4A 4MTVA 2XGIA 3WKZA 1QW9A 4XV0A 5DO8A 4UOJA 1F4HA 3RCNA 2D20A 2FGLA 1XGZA 1OGBA 7CGTA 2WCGA 1ZBWA 3VGDA 5BXTA 3W82A 2WC4A 1HJWA 3FW6A 4UZUA 1XH1A 4URIA 1NWRA 1X1NA 3ZT7A 5A6KA 5I24A 3VIJA 1E15A 2VQUA 3KL3A 3RDKA 2IXVA 1U30A 1SFSA 3N15A 2WMJA 4GXPA 1QHZA 4TOQA 1UA3A 2OWWA 1JI1A 4GO8A 3UESA 2GK1B 1V3JA 5GPRA 1BPLB 2GJXB 3AYRA 2YKKA 2DSWA 4PEEA 3NJ3A 3J7HA 3II1A 2WVSA 5JBEA 3BXWA 3MMUA 4PN2A 4CVWA 2UY3A 5A6AA 3ARTA 5CXPA 4UTFA 5I5RA 1LWHA 1WCGA 3ARWA 4U3AA 4XB3A 2XIBA 3O6AA 2DSUA 3CPUA 3IAQA 4NF7A 4J3UA 1Q6FA 1PIFA 3WFLA 1M03A 1E70M 2CKSA 1Q4NX 4ACZA 3AIVA 4W85A 2A3AA 2QPUA 4AIOA 1GVIA 1SYTA 4TTUA 2PMRA 2YDRA 5D9NA 3ZIZA 4DWSA 4FMVA 4JFUA 4U5IA 3T2PA 1TCMA 4AZ7A 4UOZA 5DT5A 1UZ4A 2WVVB 3VGEA 3UR7A 3QOMA 1GW1A 5M5DA 1MW0A 5CPSA 2ZXAA 5ECUA 3AMLA 1KXQA 5E6YA 3OA5A 2WCAA 1SR0A 4WKHA 3TTQA 5BROA 4TXEA 1C8XA 1JXJA 1NWUA 4PTWA 3VIOA 3W27A 3RM4A 4P7NA 1GNXA 1IT0A 3PTMA 2QMKA 2EO7A 4FLRA 3VO0A 2E3ZA 2VRKA 2XHYA 3T2QA 1GZJA 2JALA 3VVGA 3SUVA 1NWSA 3DYOA 2DT1A 2XFRA 2E8YA 1CXIA 3UERA 1E0WA 1NM9A 5FIPA 3VD7A 3QHOA 4Z2JA 2PWHA 4LYRA 4HP5A 1KR1A 4TX6A 3VUPA 4LYQA 1V0NA 3VILA 3QHMA 4MB5A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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