4AZBA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
425
structure length
408
Chain Sequence
NEKLAKKKIVSIDAGRKYFSPEQLKEIIDKAKHYGYTDLHLLVGNDGLRFMLDDMSITANGKTYASDDVKRAIEKGTNDYYNDPNGNHLTESQMTDLINYAKDKGIGLIPTVNSPGHMDAILNAMKELGIQNPNFSYFGKKSARTVDLDNEQAVAFTKALIDKYAAYFAKKTEIFNIGLDEYANDATDAKGWSVLQADKYYPNEGYPVKGYEKFIAYANDLARIVKSHGLKPMAFNDGIYYNSDTSFGSFDKDIIVSMWTGGWGGYDVASSKLLAEKGHQILNTNDAWYYVLGRNADGQGGGNLDQGLNGIKNTPITSVPKTEGADIPIIGGMVAAWADTPSARYSPSRLFKLMRHFANANAEYFAADYESAEQALNEVPKDAIRSLDSNLSRAQQDTIDQAIAKLQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
total genus 154
structure length 408
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azbA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azbA01
4UFIA 4AMCA 4PUDA 3W28A 2PWGA 2QF8A 4AEEA 2WMJA 4UZSA 1Q6EA 3KE0A 1W2PA 3I3EA 2EO7A 3VIPA 4YN5A 5BXPA 1VFOA 1E4NA 3CZGA 4JKMA 3W6LA 1SR0A 1V3JA 2YBUA 1HXJA 3THCA 3WF2A 2VQUA 4ACZB 3CHCA 1CIUA 4JIEA 3IJ7A 4AD2A 4B9YA 3CUJA 3BMVA 1HJVA 3FHQA 2ZXBA 2WBGA 1AQMA 3SCVA 4MAVA 1B1YA 3EBVA 3MUZ1 1R87A 1BG9A 4TTGA 1NOWA 4WK9A 2W5FA 1VBRA 1E56A 1MXDA 4Z2LA 1V6WA 3W29A 2GFTA 3DYPA 3OZPA 4AD4A 5BXTA 3VINA 4AY1A 4QDMA 4CGTA 4HMDA 1X6NA 4W8BA 1LWJA 3WEOA 3VD3A 1ECEA 5CSUA 1GORA 3WF3A 1KGXA 1J0ZA 4YPJA 1XH2A 1ISWA 3CBWA 1ZBVA 4F79A 1CENA 4UFMA 4KMQA 3N1AA 1TUXA 4B15A 5AY7A 2E40A 4AZ5A 3UETA 2EPKX 4H41A 3FY1A 2OYKA 4GI8A 4JL2A 1EOKA 1FFQA 4V27A 2GK1B 4DWSD 4GO8A 3QHMA 1SMAA 4MB3A 1V3IA 1TA3B 4UCFA 1V02A 2CESA 1WDRA 4DUVA 1JFHA 1BYBA 1KCKA 4ATDA 4DWSB 1RP8A 2Z1KA 4W88A 1HJQA 1GOOA 1UKPA 5A6JA 4NRSA 1EHNA 3ZJKA 1EOMA 2XPKA 2OYLA 4PMVA 2XGBA 2VCAA 5I78A 2YLLA 3A6OA 2AOSA 7A3HA 1BAGA 1IZJA 2WNWA 1TR1A 1C7TA 4HMEA 1KB3A 3L4YA 2D0FA 3AZRA 1KR0A 1OSEA 2DSVA 4WKFA 5ABFB 3TTYA 3WH6A 1FH7A 1H4PA 3NSXA 3MMWA 3F5KA 1W9PA 3FW6A 4OJYA 3UR7A 1HL9A 2O92A 5CG0A 1AVAA 3MUY1 2WHMA 3SEPA 3WENA 2X1IA 4C7FA 3VX0A 2VZVA 2V3GA 4WLCA 4U33A 1MW1A 1E1EA 3CLWA 4UOZA 4W7WA 1Q6CA 1JZ7A 3ZQ9A 1KGWA 3W37A 2D0GA 4C7DA 2ZUMA 5AYIA 3NCOA 3B9EA 2WMKA 1BVZA 1GOMA 1V6XA 3BXWA 7CGTA 5A2BA 1E1FA 3BCFA 4E4PA 1UYQA 4QLKA 1UD5A 1MW3A 4U3AA 2ZE0A 4RL3A 4D6FA 1JZ4A 2YA1A 4R5EA 4TTUA 4BCEA 4P8WA 4W85A 4EK7A 2OWXA 5M5DA 1OGSA 1GNXA 1OGBA 2J7DA 1FOBA 4ACZA 1X1NA 3SCOA 4IISA 1MYRA 4TVUA 3CZKA 4AZCB 1U33A 2RGMA 3VIJA 4CD4A 3AIUA 1I75A 5C70A 4OOUA 4CCCA 4W8AA 3LPPA 4OUEA 2ZIDA 4JKKA 2YDSA 4GO9A 1G5AA 3WFLA 4AZGA 1B9ZA 4HOZA 4TUFA 3TTQA 2J7HA 1W9DM 4JFSA 3RCNA 5A6MA 3CZLA 1BLIA 1GVIA 4BQ2A 1EIBA 1U30A 3UG3A 1VF8A 2VC9A 4EANA 3IAQA 4AEFA 3NDZA 1OT1A 3SCNA 5CGMA 2VQTA 5EFFA 1D7FA 1PAMA 3L4XA 2DSUA 4UFHA 4UQAA 5A6KA 1CZ1A 1XSKA 3L4ZA 2E9BA 1C92A 4QFUA 4PMXA 3AJ7A 3PBGA 4H04A 5EB8A 2WZEA 3WMCA 1JZ6A 3VMNA 4DUWA 1LL4A 1KWKA 1XCWA 5FOOA 2WANA 1OIFA 2J7FA 1NWRA 3CPUA 3CUIA 1OCQA 2UWFA 4PMUA 3VDHA 5HDRA 3G6LA 5I6SA 2VZUA 1NARA 3ECQA 2W63A 2D3NA 1X6LA 4FZPA 1VEMA 1XSJA 2PWFA 2GK1A 2VOTA 2WLZA 1TCMA 1R86A 3VPLA 1UKQA 2XGIA 5A8PA 1TA3A 1UUQA 1EH9A 3MSGA 1C91A 4MAZA 1GQKA 5ABEA 3GM8A 4J3UA 3GZAA 2PWHA 4S3JA 1R7AA 4DWSA 3NIYA 1NQ6A 4B16A 1U2YA 3VM7A 4CN6A 3RMEA 3G6MA 2HVMA 2DIEA 3BAKA 3ARQA 3WD3A 1NWSA 4J3XA 3NUKA 3T0BA 2XSBA 5C8BB 3CHEA 1EGZA 5I5RA 4K68A 1KGUA 3GNOA 1ZBWA 3F5LA 2BVDA 2D3LA 4CD5A 4HPGA 4FLOA 3VDAA 3MO4A 5GNYA 2C8NA 5IHSA 1Q6GA 1B2YA 2J7EA 3PZMA 3RM4A 4NF7A 2DH3A 3VD5A 1H11A 5ABFA 1XH0A 2O9RA 5F7UA 1ITCA 2VO5A 3WQWA 3ZR6A 1JZ8A 3A47A 3N13A 1XH1A 4M29A 1E9LA 2CBIA 4PSRA 4AZBA 2CBJA 2DT1A 3K4DA 2JEQA 1M03A 2YJQA 2WVVA 3WH7A 5I2UA 2J7GA 3TONA 3AHXA 1WKYA 3VMOA 1SMDA 4AXNA 2PC8A 1WPCA 2VURA 1EXPA 2WCAA 2WMGA 4AYSA 2BY1A 4WF7A 5BROA 4JFWA 4AZHA 3W24A 2WCGA 5DT7A 1VBUA 4HOXA 3N12A 2DDXA 3CZ8A 1WDQA 4AZ6A 3WL0A 1E40A 1DWAM 1K9EA 3DHUA 2WZHA 3ARRA 4M82A 3BAJA 3VM5A 4GIAA 5FL0A 3AMLA 5I24A 4V2XA 1V6UA 1MQPA 1TMQA 4IPNB 2OO2A 4AZCA 4EKJA 2ZOXA 3WDQA 2JNKA 4N42A 2XVLA 1E5JA 1UKOA 5E0CA 4MB4A 2O9OA 4UQCA 2GDUA 4MTVA 1JFXA 1EO5A 1C93A 2NSXA 4EE9A 2ZXQA 4GZIA 4PCTA 2J79A 1V0KA 3SCPA 4S3KA 1UKSA 4LYQA 4YHEA 5DO8A 2YIHA 4UQBA 1EQPA 1B3WA 2NT1A 2WPGA 2VVSA 3SUSA 2CXGA 2WK2A 1QI5A 1UR4A 1W2VA 1MQQA 2Y24A 4TX8A 5E9AA 3OLEA 2WKLA 1HL8A 4D71A 4JFUA 4B3LA 1TZ7A 1KR1A 4HA4A 1JF5A 1W1VA 4U2ZA 3IJ8A 2JEPA 5FCZA 2J62A 4JHZA 5A6BD 2Y4SA 4WJXA 1GQJA 4A3YA 3MS8A 3K46A 4JAWA 2F61A 5FD0A 3AIWA 4LQ1A 5GQBA 3KL0A 2W67A 1KQYA 1HJXA 2WHLA 1EQCA 1H41A 3EMCA 4GKLA 4CN4A 5A8NA 1W3HA 1HJWA 3SUVA 3A4AA 1GVYA 4Q7NA 3T08A 4LPCA 3E1F1 4QCFA 3WDJA 4NI3A 5BRQA 2B31A 3OBAA 1VEOA 1G9HA 2CITA 2EQDA 3CMJA 2O9TA 1CGYA 4NZCA 2QMKA 3WNPA 2X0YA 4P7QA 1NH6A 3FAXA 3AOFA 1G94A 1TE1A 4D72A 4U5KA 2FGZA 5AC4A 2ESCA 2J78A 1B3YA 5HBFA 1MVYA 2MANA 1FH9A 3A4WA 1BGGA 2QPUA 2CYGA 1M53A 5D9OA 4HOWA 1JIBA 2WYSA 3M6DA 3ZJ7A 3TOPA 1ZL1A 2BHZA 1BG4A 5AC5A 5BXRA 1CXIA 2E9MA 2Y2WA 1UD3A 1LWHA 1XC6A 4Z2JA 2DPEA 3FAWA 2OZNB 5ABHA 1FHDA 3MKKA 4M8UA 2YLAA 1EHAA 2E4TA 3VNZA 1V6YA 1WZLA 1SFSA 4RE3A 2QV4A 4OBRA 3AS0A 5LYRA 3AIVA 5M17A 4R27A 2WAGA 1CWYA 1BTCA 1E6NA 3M07A 1K9TA 2YBTA 4GQRA 2JALA 3N04A 1E6XM 1WDPA 1UHVA 3DYMA 4QCEA 1QI2A 2WC3A 3AXHA 2OSXA 2J7CA 2DSWA 3WUEA 4WSKA 3LPFA 4J3TA 1DWFM 3LPOA 1W9UA 2NT0A 2ZXAA 1UWUA 4N0RA 3W81A 1ZB5A 3PZGA 3MV11 5JBEA 1MW2A 3OG2A 3UESA 1HJUA 3LMYA 5D4YA 1PX3A 1A47A 1V0NA 3J7HA 4BS0A 5BYWA 3CO4A 4JZ5A 1E15A 2ZX7A 2JIWA 2UY5A 1CLXA 3BGAA 4DM2A 2VNCA 4CD8A 3GH4A 1WNOA 4PUEA 2OSWA 3U5YA 1B3VA 3AMGA 3PZVA 3UCQA 5DFAA 3ZMRA 1B3XA 1RP9A 2WBKA 1V6VA 5IFPA 3AI0A 4DM1A 4L4OA 5E70A 1V08A 1W1YA 1E3ZA 1PIGA 2FDMA 1BFNA 4HMCA 4AISA 4HZ7A 3CMGA 1GZJA 3WH9A 1KFWA 2VI0A 4IUGA 1JL8A 5HPOA 3DYOA 3AMCA 2J74A 5E6YA 4UR9A 5A6LA 3WNMA 4J28A 1B30A 2WMIA 1DTUA 2D2OA 4QLJA 3SUWA 1NP0A 1PBGA 3GBDA 4BZYA 1C7SA 4UTFA 1UR0A 4JL1A 1QBAA 1H09A 2J75A 2VVNA 2Y8KA 5KZ6A 3SCTA 3K4AA 1QBBA 3AHVA 4W5ZA 2YL8A 3WQVA 3OA5A 1W1TA 3F5JA 3AZSA 5DT5A 1XV8A 1ZBKA 1NWUA 1O7AA 5BWFA 5A2CA 4U3CA 1JAEA 1WCGA 3HMCA 4Z2IA 4W7VA 2GUYA 3OLDA 4ACYA 4FF5A 2XG9A 2EPOA 2DH2A 2J77A 1IZKA 2VZSA 3ZOAA 4LYRA 2BXYA 1JNDA 3VKKA 3VVGA 3PN8A 1OWQA 1QI4A 5A6BA 2CBUA 3SCWA 1B3ZA 4MNMA 2WC7A 1ISYA 3WF0A 2J4GA 4CU7A 1XSIA 1VEPA 4D1JA 3WDIA 1E6SM 1JZ3A 5D8ZA 1CXFA 1H3GA 1LG1A 1CPUA 3N11A 4ML4A 1ODZA 1A3HA 3N18A 2XTKA 4KRUA 1H0GA 1WP6A 1PX4A 2A3BA 1QPKA 1UH2A 1UOKA 3CHFA 1CXHA 1C90A 3PZQA 4B3KA 2GJXB 1OGGA 3RM9A 2G41A 3CHDA 4MJ4A 1RD6A 8CGTA 2XSAA 1UWSA 1EDGA 3ALGA 1EDQA 5C71A 2WVVB 4ZE4A 1H49A 1C8YA 1FHLA 4H2CA 4PMNA 3BC9A 1HVXA 3VILA 4AD0A 3ARZA 5HNNA 4P8UA 1V02E 3WDRA 3ARUA 3O6AA 2CIPA 3NSMA 4TXEA 4D6IA 5TD4A 2CETA 3WDHA 1US3A 3K8KA 1UQZA 2PWDA 2WVTA 4UFKA 1KCLA 2WHJA 1UR2A 4TVDA 3ARSA 3KEHA 2DT2A 3ARPA 5CPTA 1N82A 1WZMA 2DT3A 1UWRA 1VFUA 1MFUA 1W3JA 4A4AA 1GONA 9CGTA 1E5NA 3RO8A 1CXLA 3VIGA 1HP4A 2CHNA 3EDEA 4X9YA 5D8WA 4LGXA 2WKGA 2NW0A 1B31A 1AQHA 3WKZA 3ZJ6A 2ZXDA 1NOFA 2BHUA 1ZJAA 2VTFA 1W9XA 1UA7A 2VCCA 3NSNA 4YHGA 4D1IA 4W93A 3L2LA 3WD1A 4QLLA 3PTKA 2F2HA 5A94A 3ZO9A 2ZICA 4PMOA 2XM2A 3N17A 4RE4A 2YOCA 2WSKA 2UY4A 3PHAA 1Y7VA 2WM0A 4HZ6A 2ZUTA 2W61A 3VU2A 1WZAA 4IPLA 3VDBA 1UH3A 5BXSA 1VENA 1CBGA 4A3HA 4CN1A 2OYMA 1QW9A 4MDOA 5GPRA 2EPMX 3RJYA 4AWEA 1KXHA 3MMDA 1CNVA 1YHTA 2G3MA 3CH9A 2W62A 2UY3A 1E6ZA 3KL5A 3KZSA 3FXYA 3WNNA 3S2CA 4P7LA 3GTNA 2W66A 3MMUA 4KH2A 3SCSA 3BSGA 5I77A 1J0YA 4XZWA 4FLSA 3AS1A 1I1XA 3WH5A 1BGAA 1GJWA 3OGRA 4AC1X 3T0AA 1VAHA 4PTMA 5E09A 2PBOA 3QOMA 3GXFA 1C8QA 1G01A 1HKJA 2VX4A 4BF7A 2JIEA 4F9JA 5A2AA 1J0IA 1UR8A 2D1ZA 2ZUNA 1JAKA 4OZOA 2Q8XA 4FMVA 1G1YA 4WSJA 3PTQA 4J3WA 1FA2A 1UWTA 4QP0A 4NSBA 3CUGA 4IM4A 3VGEA 1QHZA 2X09A 3U5UA 3O2LA 2E3ZA 3WNOA 2VMFA 1KWGA 4XV0A 3M7SA 2TAAA 4JCMA 1JYWA 4CD6A 3GDBA 4M56A 1BHGA 4CVUA 4Q22A 4PMDA 1F4AA 1E4IA 4UFLA 3ZR5A 1PEZA 5I23A 2XVNA 2W91A 4KGJA 1WZKA 1XYZA 3B9AA 3AHZA 1BYDA 1CECA 4BQ3A 2V5DA 3SIMA 5AYBA 1LL7A 4UOQA 2GJXA 1JXJA 2CPUA 4W86A 4E8CA 4ATLA 3W38A 3VOCA 2QPSA 4OKDA 3MV01 1QNPA 4P8VA 1ITXA 4WKAA 1E3XA 1LF1A 2PI6A 3TTSA 1LG2A 3MANA 1TVNA 3AXIA 1J01A 5M03A 2V5CA 3AMKA 3BLKA 1CXKA 1YQ2A 1C3FA 4M80A 3PZ9A 3VIHA 3WD4A 1QNQA 1FP8A 2G4FA 3PZIA 3ZT5A 1PJ9A 2F8QA 3VTRA 5CLWA 3PZNA 3DC0A 3RJXA 1HNYA 2FH8A 2DSKA 1XHGA 2J47A 3SUTA 3GXMA 2CEQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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