4AZCA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
419
structure length
416
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPTGYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 166
structure length 416
sequence length 419
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azcA01
2A3BA 2J8FA 3W25A 5AC5A 3MMUA 1HNYA 4NRSA 4MPKA 3POCA 3WQ8A 1E6SM 2GJXA 5TD4A 5IFTA 4PMNA 2EPLX 3W37A 1DTUA 1DEDA 1IZJA 1MW1A 4IPNB 1G1YA 3M7SA 1H49A 4PMXA 2A3AA 3W27A 1FH7A 4AC1X 2FHBA 2ZXDA 3VD4A 1BTCA 3AIVA 1UD5A 4M82A 4XB3A 4IUGA 3W26A 4PSRA 3VIGA 5CLTA 2ZX8A 1XSJA 3FW6A 2Y5EA 1ESWA 4QLLA 2XFFA 2ZIDA 5F7UA 3B8SA 4Q7NA 3WDIA 5ABGA 1OT2A 4PMOA 1MW3A 1WZMA 3TTYA 1ZJBA 1PX8A 3QHNA 3RJYA 4P8VA 1H1NA 5A2AA 1IT0A 3MMDA 4J3WA 2WHMA 1TVPA 3BSGA 4P7RA 1HJXA 2BY2A 3N1AA 4XZWA 4W86A 1E6QM 4KRUA 1TA3B 4KGJA 2FH6A 3A6OA 3FAWA 2YDQA 2ZXQA 1W3JA 1XSIA 4XUYA 1B0IA 2CYGA 3CHDA 4TX6A 1ISVA 8A3HA 1BG4A 2VC9A 3THDA 1VBRA 1WKYA 4W87A 3VOCA 1PX4A 2C0HA 2YLLA 4LX4A 4BF7A 1R86A 4CCEA 3N13A 5JBFA 1RPKA 3DYMA 4EK7A 1MVYA 2QF8A 4UQBA 2W62A 4CCDA 4W89A 2JFEX 1A3HA 1QNRA 2W67A 4M80A 3WNOA 1CPUA 2OSYA 4PEEA 3QHOA 3AIQA 2CXGA 3AZTA 1EGZA 3PZQA 3AIBA 1HIZA 1B3WA 2G3IA 5HDRA 3FN9A 3NDYA 5C70A 4JFWA 3ZT7A 2DH2A 3N9KA 3WQWA 2DT0A 2WCAA 3ZT5A 4CKQA 3PZTA 3CMJA 1ZU8A 3NYDA 5DMYA 4AXNA 7A3HA 1C8XA 1OT1A 5LYRA 3AIEA 4D72A 4U2ZA 1TMQA 2E9BA 1E15A 3WQVA 1JDDA 3ALFA 4J3UA 4LPCA 3MSGA 3UR7A 4UFJA 2WKGA 1UKPA 5D8WA 2ZUNA 4F8XA 1CXIA 1NARA 1WB0A 2OYLA 4GI8A 3U5YA 1NWUA 1VAHA 4AW7A 2X0YA 1OWQA 5EB8A 2BY0A 1P6WA 2CPUA 4FZPA 1HJQA 1W2PA 2YA2A 5KEZA 5CPQA 4WLCA 3AXIA 3AYRA 2GK1B 1R8LA 3GTNA 3ZR5A 4PMUA 3AIUA 1JXKA 2WZHA 1KXTA 1EQCA 3O2LA 1NP2A 2WYSA 2RGLA 2ZE0A 3VIKA 2EPOA 4FLRA 3VX0A 3WD2A 4AD2A 5ECUA 5HPOA 1UH2A 2W4XA 2XM1A 4HMEA 5CLWA 2ZOXA 3KL3A 3ZSSA 1EOKA 3S6TA 2JIWA 1DWAM 5DFAA 2DQXA 3UG3A 2GK1A 4AIOA 1ECEA 1UR4A 1E1FA 4CU7A 3FNDA 3BCFA 2WHJA 2WAGA 2E40A 2Y8KA 3EMQA 3NSNA 4PCSA 4LYRA 1JI1A 5CZKA 4JKLA 4EE9A 3A4WA 2G3NA 2X05A 2QLYA 1PPIA 2J79A 5M3WA 1C90A 1CLXA 4AZBA 2J8GA 4UFIA 5I79A 1H2JA 6A3HA 5M5DA 2WWCA 1JDAA 1GQIA 1UQZA 4W8BA 3W81A 3NSMA 1E0XA 2D20A 5A94A 1C92A 2OLHA 3T2OA 3EDFA 1PX3A 2CBVA 1H0GA 1FH9A 3PZGA 1K9FA 1M03A 4QCEA 1EIBA 3FHQA 4WKFA 3VUPA 4D6DA 1J12A 2YLAA 3WDHA 4N42A 3AI0A 1BSIA 4U5KA 3VKKA 1KXHA 1V0MA 1W3KA 4ZXLA 2J78A 2ZX7A 3L4XA 1W3LA 2UY5A 2EPKX 3VIMA 3ZSTA 4B3LA 5IHSA 4CU8A 3LPGA 1F4HA 3N15A 5D9PA 2XTKA 4BQ2A 2VMFA 1GOKA 1GUVA 3WFZA 1EHAA 5I6SA 1W1TA 4M1RA 3VM5A 4D6FA 4MAZA 4MTVA 2GJRA 2BHZA 5A8NA 1LL6A 3KWXA 4D6JA 2PWGA 1KFWA 1MXGA 1GW1A 3IK2A 3L4UA 2W63A 2Q8XA 6TAAA 4HA4A 3N17A 1ISZA 3WBEA 1UH3A 4D1IA 2VOTA 2J4GA 2PC8A 3MV01 2WVVB 4QLJA 3AHZA 3SURA 1JAKA 4LYQA 3RCNA 4HTYA 1J18A 3PHAA 5A3HA 4UFHA 2B31A 5DF0A 4HMCA 1E70M 1V03A 3VD7A 3GXFA 3MO4A 5AYBA 4PTMA 4ZENA 1QI3A 4LXFA 1M53A 3WBAA 2WVVA 4RE2A 3VVGA 4DWSD 3ARSA 1ZL1A 1H11A 2WLZA 1NH6A 1VEPA 1ZS2A 3QGVA 2WBKA 3WNPA 4BQ3A 5A8MA 1MQQA 4P7LA 4JCLA 2VX4A 3VX1A 4W93A 1CXLA 5ABEA 1NWSA 2W91A 1MFVA 4LYPA 4N0RA 2GFTA 3T08A 2ZUVA 3LPOA 4BQ5A 3VTRA 2BVTA 1AQHA 2YBUA 3WF0A 1BYBA 1GQLA 1OINA 1Q6FA 2VX5A 2VX7A 1W32A 3GNPA 1GOOA 1JF6A 2J7DA 4AIUA 4PN2A 1V6VA 4CN1A 1W9UA 4R27A 5FL1A 3CUJA 1FP9A 1JG9A 2WMHA 4U3AA 4U31A 1WDQA 3UETA 1CZ1A 2DT2A 5BROA 4S3KA 3BXWA 3VMOA 1DP0A 4M56A 1JNEA 2VCAA 4UOJA 1QBBA 4ATDA 4AD4A 1NP0A 1CYGA 1JZ3A 5IHRA 1LWJA 2FGLA 3IAQA 4V27A 3AHTA 4Y7EA 5CQ1A 4EKJA 3WNLA 4P7QA 1W1PA 4W85A 1E9LA 3GNOA 3M6DA 1TVNA 3ARPA 4XX6A 2CKSA 2OWWA 1LJYA 2XPKA 2XJ7A 4UQAA 2XVPA 3IJ8A 1KGXA 1D2KA 4HZ8A 2DH3A 1QNQA 3OB8A 2WZEA 1EO5A 3PN8A 4GZIA 3PZMA 1XYZA 3KEHA 4MNKA 3K8KA 4B9ZA 4JHZA 1KGWA 2YA1A 1JD9A 1UZ1A 1KR0A 3WEZA 1V0NA 3WH7A 2ZUWA 3KZSA 2WMKA 3AFBA 4JKKA 3WF4A 4OZOA 5DT7A 1ZBVA 3GH7A 3F5KA 1DWJM 5FCZA 1MFUA 4HU0A 3WFLA 1V3LA 3WD1A 3HU7A 4UCFA 2J7EA 2CESA 3A47A 2VI0A 4PTXA 4RL3A 1H41A 1CXHA 2DSZA 4QAWA 2D2OA 2FDMA 1H09A 2J7BA 3MANA 1J0YA 4GI9A 5M17A 1NOUA 1GPFA 1GHRA 2X8RA 1MW2A 1XYFA 2ZUTA 1UD2A 1OD8A 1JAEA 2IUZA 2G3MA 3TA9A 4WKHA 2VRJA 4X0VA 5DO8A 4S3JA 2CETA 4ZXOA 1PBGA 4U33A 4V28A 2BXYA 2BVDA 2OSWA 2BXZA 4CGTA 4QFUA 1MXDA 1NWRA 1UH4A 3W0KA 2VL4A 4H7VA 4F79A 4AZ6A 1Q6GA 3GXMA 1HJWA 2UY4A 4AZ5A 4CU6A 1XGZA 3CZEA 3WD3A 1NOWA 1JZ4A 3VD9A 3ARZA 1KGUA 5FOOA 1CTNA 2O9TA 4P7NA 4OKDA 3ZO9A 4D1JA 3AYSA 2PWDA 3NDZA 1HL9A 1BG9A 1XC6A 5A6SA 2WMFA 1V3KA 2WK2A 4URIA 2VNCA 1HP5A 2D24A 4PSPA 3RMEA 1UR9A 3CZ8A 4IPLA 1E4LA 1TG7A 1UKQA 1K9TA 3IAPA 1HN1A 5GPRA 1C8QA 1E40A 5A2BA 3OIHA 1HT6A 1G9HA 3FY1A 1J0ZA 3RM8A 4DM1A 3ZJ8A 1SYTA 3L4YA 3DECA 3LPFA 3SCSA 5I24A 1CENA 1I1WA 2NSXA 1UD6A 5D4YA 4J28A 1KBBA 3WUEA 4Z2JA 4MNMA 5A6JA 4M8UA 2J7HA 2JIEA 4IISA 5A6MA 1B1YA 3WQ5A 2D1ZA 1CECA 3GBDA 4JIEA 4JZ5A 1BFNA 1E6RA 2VZSA 1HKKA 1TFVA 2XSBA 1KR1A 3SUSA 3S2CA 3UCQA 3TTSA 2YKKA 4GZEA 1EDTA 3A4XA 3PZ9A 3VIIA 2QV4A 4IM4A 1UR0A 1JYXA 2V3EA 5GNXA 2WPGA 3WN6A 3AOFA 1RD6A 4DUXA 3BLPX 1EXPA 3CZGA 5I3DA 2G8ZA 2JEPA 4PMVA 3D3AA 4FF5A 1RH9A 1XD1A 3CUGA 5JBDA 2A3EA 1F4AA 1V6XA 2CKRA 3AQUA 1M7XA 1GVYA 2DIEA 2UY3A 3I3DA 1U2YA 2DEPA 3W82A 1TA3A 3RIKA 3OZPA 3ARXA 3OLEA 1PZ2A 2YJQA 4HZ7A 1CIUA 3UEQA 1ITXA 1HJVA 3HMCA 3FXYA 1CGYA 4BCEA 4QCFA 3RILA 3ZT6A 3SCPA 3AIRA 4H8UA 2WMJA 2CNCA 3OLIA 4PBGA 1JF5A 3HN3A 2TAAA 4AD0A 3MUZ1 1YHTA 2WW5A 1CBGA 1L0PA 5BWFA 2WHKA 4BZYA 1UKOA 4ATWA 4WSKA 4UZSA 4KGLA 1HP4A 4KMQA 3SCTA 1N82A 2E9LA 1WAWA 1X6LA 2EBNA 3B9DA 3T09A 1HX0A 1ISXA 3WH5A 1KB3A 1J0JA 1BGGA 3N11A 4XV0A 4DUWA 2ZX9A 4UFLA 5E0FA 1ODUA 2W66A 1UWIA 1E3ZA 3J7HA 1KWGA 4J3SA 4U3CA 3TTQA 9CGTA 1US2A 3VDBA 1JNDA 4MJ2A 1YQ2A 1QNPA 4M29A 4H04A 1OIFA 2O9OA 2J7CA 3OG2A 4MB5A 3ZOAA 1UA3A 1LL7A 3VO0A 4PRWA 2NW0A 1FH8A 4WIWA 1XV8A 1O7AA 1KQZA 2Y24A 1BVNP 3VNYA 3W28A 4OJYA 3PTMA 4K68A 3K4DA 1GOIA 2VJXA 3CBWA 1OM0A 5E6YA 3AHVA 3OGRA 2YOCA 3DYPA 3VIOA 4HPGA 4L4PA 2XUCA 3RO8A 3SCQA 4JL2A 1SR0A 1EHNA 4UNIA 1DWIM 2DSKA 1BAGA 2GUYA 2AMGA 2WC4A 1OBAA 2YL5A 2XM2A 3G6LA 2BY1A 4M24A 2OYKA 1K9EA 3SCVA 3U57A 1VENA 3CHCA 2J47A 1VFOA 1FHDA 1XCWA 2VO5A 4UFKA 2XGIA 3ARYA 1JZ8A 3A3HA 5E6ZA 2A3CA 1C7SA 2XG9A 1GZJA 1B3ZA 4TOQA 1V0LA 1VEOA 1H4PA 1BYDA 1TCMA 1AVAA 3CH9A 1LF1A 1DWHM 3NSXA 4MNJA 5AYIA 4CD7A 2XYLA 4BQ4A 4PMDA 3SCNA 4NI3A 2GSJA 3F4VA 3UG5A 3II1A 4YHGA 1E4NA 3CTTA 3POHA 1BYAA 1M04A 3T0AA 3AS3A 3VD5A 1TE1A 3GYCA 2VZVA 2D23A 3WDJA 5CSUA 1XSKA 2E8YA 2NT1A 2WANA 1IV8A 3BAXA 4J27A 3UG4A 2WHLA 1UA7A 3THCA 1EQPA 1W2VA 3SEPA 3RJXA 2XHYA 1CGUA 3SUUA 3MV11 1EOMA 3L2LA 1BVZA 1KXQA 5CG0A 3ARTA 1D7FA 1UWSA 3AMDA 3WELA 2FGZA 3BSHA 3UESA 2CIPA 2JF6A 1G94A 1NM9A 2X1IA 3NCOA 1XH2A 4H41A 2J25A 2PI6A 2DPEA 3E1F1 4JFUA 1SMAA 2XVKA 3WNMA 3AMLA 1KCKA 1GCYA 1J0IA 1E4MM 1I75A 4PCTA 3CZLA 4Z2IA 4JFTA 2FHFA 3PZVA 2OSXA 1HJUA 3WDQA 4JAWA 4B9YA 4CVWA 1CGTA 4OBSA 1L8NA 1U30A 3DHUA 1ISWA 5KZ6A 1LLOA 5EFFA 2QMKA 4JCMA 1NQ6A 3WH9A 4CCCA 3CO4A 1E56A 2VZUA 5EMYA 1IZKA 1MQRA 2DT3A 3WDPP 3GM8A 4D6HA 1WDRA 1PIFA 3GXIA 3LPPA 1LG2A 4FZOA 2QHAA 4H8VA 1RP9A 3VGGA 3N18A 3WL1A 3ZIZA 4D71A 4TTGA 1MW0A 4KWUA 5GQBA 2XVGA 5EFDA 1Q6EA 4EAMA 5AC4A 1W1VA 3WL0A 4TVCA 1W9DM 1TZ7A 5A2CA 1WP6A 2WVUA 3EDEA 3EDKA 1KBKA 2DGAA 4AZHA 3RM4A 6CGTA 1V02A 1JYWA 4GXPA 4J3TA 3N04A 1W1YA 3MUAA 4NRRA 5HXMA 4PMQA 4AISA 3BMVA 3GH5A 1I1XA 4PMYA 1AQ0A 2J74A 4R5EA 1DWGM 5CPSA 4AD3A 3B9AA 1QHZA 1V3JA 4MDPA 4AZGA 5FIPA 4CD4A 1XHGA 1B30A 1W9PA 1V6YA 3W24A 5EBAA 1VRXA 1QHOA 4C7FA 1VFFA 4XZBA 3VINA 2YL9A 5CGTA 1LWHA 1E43A 1V6UA 4TXEA 4LQ1A 1HF6A 3RDKA 1UD3A 3PZUA 4HPHA 1JXJA 4FMVA 1HVXA 5I77A 1WZAA 4ACZB 4AEFA 3GZAA 1R85A 3JUGA 2AAAA 1QW9A 3SCUA 7CGTA 1BF2A 1E72M 3AHXA 2C7FA 4C7DA 4ZEPA 2VR5A 3QOMA 2W92A 4WJXA 5BXSA 3BAJA 2EEXA 1E73M 2ZX6A 3MMWA 3U7BA 2GDUA 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