4AZCB

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPTNLEGYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQGLKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 162
structure length 421
sequence length 421
chains with identical sequence C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azcB02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azcB01
1B3WA 3OGSA 1XSJA 1UZ1A 2W62A 4W7VA 2ZUWA 3ARPA 3WNPA 1RP9A 4IISA 3W53A 3WD3A 4A3YA 4X9YA 2EBNA 2J7EA 3VGBA 3PZVA 4U2ZA 3AS0A 1OIMA 2GJXB 2E3ZA 2DT2A 5I24A 3ARVA 4MPKA 2XFFA 3K4AA 1C92A 1HN1A 2XVGA 3AI0A 3AIBA 4JKKA 5IFPA 2O9PA 3RDKA 3ARXA 1KQYA 2EPLX 5TD4A 4W8BA 3N17A 4HOZA 2J25A 5A6JA 1XV8A 1H49A 4J28A 1MQRA 2WVSA 3CHDA 4YPJA 1S46A 2G41A 3ZT6A 3MV11 1J10A 3N04A 3TONA 2GJRA 1B2YA 1EQPA 4TOQA 4GQRA 1R7OA 3ZJKA 4ATWA 4LPCA 1AQMA 3WNNA 3MV01 1GOKA 2VZSA 1E9LA 3F4VA 1JZ2A 5LYRA 1LG2A 1MFVA 5D8ZA 1WDQA 1C91A 1J0YA 4BQ2A 3N11A 4AZ5A 2UWFA 5C70A 1UKOA 2A3HA 2WHJA 3RILA 4H2CA 3ZO9A 3OA5A 2OYLA 3GM8A 1GQJA 2PBOA 1LL7A 3AHYA 1A47A 1GONA 3VIIA 2WMKA 1MWOA 1QNRA 3G6LA 2AMGA 2DT1A 8A3HA 4EKJA 1R85A 1Z32X 4MNJA 4UQBA 3WEOA 5E6YA 3ZJ8A 1PIGA 2VQTA 1ITCA 1W9DM 3K8LA 4AXNA 4PEEA 1JL8A 2CESA 3CUJA 5EB8A 4R27A 4TVDA 3SCSA 5GNXA 4UFJA 1V6YA 1L0PA 1ZU8A 1FA2A 1G94A 2DSUA 3BLPX 1JZ8A 5HDRA 4AD0A 1QOXA 4ACZA 5KEZA 3PZOA 1B30A 2DGAA 1UR8A 4CCCA 1BQCA 2J7FA 4WK9A 1CECA 3IAPA 2Y24A 1RPKA 3CHCA 2YL5A 3VGFA 2J8GA 5LA0A 4QFUA 3CUGA 4RE3A 4AZ6A 3QHOA 1MVYA 2CXGA 1JIBA 4IM4A 4CVUA 1LL6A 3GH5A 3CLWA 3SCTA 5ECUA 2QMKA 4V27A 2OWXA 1JI2A 4W89A 3LPPA 3S2CA 3CMGA 4UTFA 4NF7A 3SUTA 3MUIA 5D9PA 4Q7NA 4JHZA 3VD3A 3N12A 1UA3A 4AZCB 2ZUVA 1KBKA 1VENA 1CZ1A 1JD7A 2GJPA 5FL0A 2PF0A 3T0AA 4BS0A 1VF8A 3AS1A 2W67A 4CCDA 1E6QM 4E8CA 2QHAA 3SCVA 1UKPA 3D3AA 1KGWA 1MW0A 1BFNA 2ZX9A 2YA1A 1FP9A 1X6LA 4XX6A 2WXDM 3GNRA 4HA1A 1WCGA 1FH9A 2DEPA 1UH4A 3II1A 3NDYA 4MADA 3DYOA 4IUGA 2WW5A 4AEEA 5JIWA 1UD3A 1QNQA 4D6GA 1PZ3A 1QBBA 3DHUA 3L4YA 1RD6A 3PN8A 3UESA 4Y7EA 1JGIA 1FP8A 1H3GA 1QBAA 1ISWA 3L4UA 3SUWA 1UD4A 3EDKA 1SMDA 2QLYA 4YHGA 1J0JA 1E0WA 3ARWA 3LMYA 3N18A 4UCFA 4M80A 4QCEA 3W0KA 4Z2HA 3FY1A 1NP0A 1KXQA 1JG9A 3MSDA 4CD7A 3FNDA 5I3DA 4ZXOA 2PWDA 2XJ7A 2WM0A 1V3JA 2ZXDA 1ZJAA 2NSXA 4NRSA 4CKQA 3J7HA 4OUEA 1HX0A 4LX4A 5A6MA 2VZOA 3EDJA 4KRUA 4GXPA 2DDXA 4YN5A 1NP2A 1F4AA 4C7DA 3TOPA 1DEDA 4MNLA 1UH3A 2VVSA 2ZX7A 5D8WA 3WDIA 3BC9A 5DT7A 3BSGA 2WC7A 1HL8A 2V3DA 4J3SA 2BY2A 3MSGA 1VFFA 1M7XA 1W2PA 2BY3A 4BQ4A 4HMEA 2J7BA 3MMDA 3K46A 3MMUA 5FD0A 1PZ2A 1VEMA 2DPEA 1E40A 1V0NA 3BAXA 2WMGA 2WVVA 4UFLA 4FLOA 2YLLA 3GYCA 3ZJ6A 3CMJA 2EPKX 1PBGA 1NH6A 1BLIA 1VFMA 3APGA 3BAWA 4B16A 3ZT7A 4HZ7A 4B9YA 1OGBA 4WSJA 3WQ8A 3GH4A 4XV0A 1BHGA 4JKLA 5ABGA 1RP8A 1VJSA 2DIEA 3SCPA 2XHYA 3THCA 1Q6DA 2PWGA 4F9JA 1KB3A 2X8RA 3ZR6A 1US2A 4HA4A 3CZLA 4CN1A 2ZWYA 4M8UA 3AIQA 1JD9A 3ZQ9A 1WO2A 4PSRA 3SCOA 1UR2A 3VX0A 4WKFA 1UA7A 1J12A 3WY1A 1LF1A 1HL9A 2V3GA 5HPOA 3AHXA 4XZBA 3A6OA 3MANA 3WEMA 1XYZA 4W8AA 3WELA 1H2JA 2XWEA 4PTWA 2CHNA 5I0DA 4F9DA 1KXTA 4PRWA 3W37A 4PMRA 2QV4A 3L4TA 4UQAA 3A4AA 3AMCA 1JF5A 5JUVA 3SIMA 3QHMA 3GXMA 5FL1A 5HNNA 2G3MA 1ISXA 1M53A 2OWCA 3L4WA 4W7WA 2D3LA 2D0FA 1SYTA 4QCFA 3VIOA 1ISVA 4D1IA 3CIVA 3U7BA 2CBUA 3U57A 4ZE5A 5DMYA 3OGRA 2CKRA 1XH1A 2ZOXA 3B9DA 8CGTA 3L2LA 3WUFA 4HMCA 1OM0A 3ARUA 3L4XA 5I77A 3IANA 1R8LA 5E09A 3WIJA 2EPMX 2J7DA 3WUGA 2GFTA 3BAJA 3WQ6A 4UFKA 2ZUUA 4J27A 1HKIA 3VIFA 1JNDA 1PX4A 1QPKA 4PUEA 1K9DA 4D1JA 3BSHA 4JCLA 1E56A 2WSPA 3UG4A 4MAVA 3WFZA 4NSBA 3VNZA 2BS9A 3DECA 3RJXA 3WBAA 1J0HA 1B1YA 1LWJA 2O9RA 2D0HA 4F79A 1E55A 1TR1A 4JHOA 2E40A 4OBRA 5JBEA 2FHCA 2F2HA 4OJYA 2OYMA 1LLOA 1Q6FA 1GORA 1UWSA 4FK9A 3M46A 4JL2A 1H0GA 3OLIA 1J18A 3O2LA 1WAWA 1D2KA 1PEZA 2WC4A 3UG3A 1XH0A 3WMBA 5CGMA 2XFYA 2VMFA 1H11A 4D6IA 3VGHA 4LYRA 3GBEA 3IAQA 1UD6A 4UOJA 3CZEA 3F5JA 4CUCA 3BMVA 1CBGA 1U33A 3QOMA 1E15A 3WD0A 4HOWA 1KXVA 1OWQA 1E0XA 4M81A 2JEQA 5IDIA 3KE0A 1XC6A 2DH3A 2WNWA 1C8YA 2YL9A 4FZOA 3WDRA 1I1WA 3OLEA 1DWFM 2QPUA 3VMOA 1XCXA 4R5EA 2WMHA 3BCFA 5CSYA 4AZHA 1JAKA 2CERA 3BXWA 4D6JA 5HPCA 1ODZA 4XUYA 5A69A 5JBFA 5A2AA 4QLLA 4KWUA 4AMCA 4XB3A 2JIEA 3DHPA 4AYSA 2YJQA 1BYCA 4H04A 3U5UA 4CD4A 4AZ7A 1TE1A 3TTQA 1UD2A 4M1RA 3AHZA 1QI4A 1TA3A 3FAWA 1B0IA 3EBVA 1VBRA 5A3HA 3PZ9A 4FMVA 5M3WA 4XZWA 1I1XA 1HJUA 2XVNA 2PWHA 2YA0A 3WF4A 3WF3A 3IJ7A 2VUYA 5IFTA 1E72M 5BROA 5CPQA 3CH9A 1BAGA 3RM8A 1UWUA 2JFEX 1D7FA 4HZ6A 3VIGA 2EO7A 2VCBA 2J74A 3PHAA 3WUBA 5FOOA 2AOSA 4P7RA 1QI3A 2Y5EA 1GOIA 4MB3A 3TP4A 1JZ3A 1MYRA 3BMWA 4F66A 1OGSA 3WNKA 2BHUA 2E9LA 1HIZA 2QMJA 1FH7A 1J0KA 1E71M 3SCUA 3MUAA 5BXPA 4D6FA 4PCSA 2WC3A 3W81A 3QHNA 1CGUA 3OZOA 4QAWA 3UEQA 3VOCA 3ZOAA 1E6SM 3WD2A 4PTVA 1JYXA 4OOUA 2JE8A 1O6IA 2O9OA 4UFIA 1XD1A 2FGZA 2F8QA 4DM1A 4HOXA 4TTUA 4JCMA 3VMPA 2VRQA 1UH2A 4UOQA 4UR9A 5A6KA 1WDPA 4PMZA 1NOUA 1ESWA 3HN3A 5GPRA 5A2CA 3K4DA 2IXVA 5A6AA 1E5NA 5AY7A 3CO4A 1CXKA 1G9HA 1B31A 5AYIA 5CLWA 2YL6A 4OZOA 4AISA 2ZUNA 2WMIA 1TMQA 3VDBA 4TVUA 3RO8A 3N1AA 1E4NA 3RPMA 2XUCA 2ZX8A 2WVUA 4UFHA 3AXIA 2J62A 2PI6A 5E6ZA 1OBAA 4TX8A 3L4ZA 2Y8KA 3I3EA 4GI9A 1XSIA 1JAEA 3RCNA 1JYWA 3VD9A 5F7UA 2ZX6A 3WNLA 3IJ9A 4Z2IA 1VEPA 4AZGA 4P7OA 1MW2A 4U5KA 3VILA 1E4LA 1WZMA 1UR4A 1UWTA 5FIPA 5C71A 3WEZA 1UZ4A 2OSXA 3EDEA 5CJ5A 2VX6A 1E4IA 5A8PA 1UWQA 3WH9A 2X1IA 1H4PA 1UYQA 4ZEPA 3RJYA 5LA1A 3AIWA 3NUKA 4Z2JA 4GO8A 4ATLA 1DWAM 3SUUA 1EIBA 2D23A 4C7FA 3RM4A 2WYSA 3M07A 2VVNA 2TAAA 1B3ZA 2BHZA 1FH8A 4AIEA 2W92A 3CZJA 3T2PA 3WQ5A 4D72A 1KQZA 3U5YA 2Y2WA 5A8MA 1CGVA 2OO2A 4J3XA 6TAAA 2WHLA 3AIRA 1WP6A 3T2QA 2YA2A 4M56A 3L2MA 4LQ1A 3WL1A 1UWIA 3CPUA 1BVNP 1FHDA 2BFGA 1MQQA 4Z2LA 4GQQA 4HP5A 1WZKA 4PMUA 2XSAA 1EOKA 2DH2A 2IUZA 4P8XA 2VNCA 1IZKA 4GIAA 4JFTA 2WWCA 3K8KA 1US3A 4JFVA 3VGEA 3BCDA 1NOWA 3WF2A 2VO5A 2C8NA 3WDPP 2W91A 2BNJA 4UQ9A 1QW9A 2FHBA 3A47A 4EK7A 4IPLA 1DWIM 1ZBKA 2WANA 3I3DA 4PSPA 3FXYA 1D3CA 2BV9A 3POCA 5AC4A 2JNKA 1NWUA 1VRXA 2ZXQA 1GHRA 4OIFA 2XIIA 2WSKA 1BG4A 2PC8A 1P6WA 1AMYA 3K1DA 2WBGA 1JZ7A 1OINA 1MXDA 4WKHA 1W9UA 3PZNA 3WH8A 1QW8A 3IJ8A 4MNKA 3GBDA 1W1VA 1CGYA 5A1AA 5HBFA 2V5CA 4WSKA 2XTKA 1UWRA 3AMKA 2PBGA 1OD8A 3RIKA 3LPGA 2ZXAA 2XYLA 1UR0A 4CN4A 2G4FA 1BGGA 1TFVA 3WBEA 2GK1B 1OT2A 5M5DA 4W88A 1OCQA 2YBTA 5ABFB 1H41A 5FCZA 4W8LA 1HJWA 3W27A 3M6DA 3ALGA 5BCAA 2JF7A 1QNPA 2XSBA 1KBBA 1UUQA 2WKLA 1UKTA 1W3JA 2VOTA 4CU8A 3ZSTA 2VR5A 2X09A 4E2OA 1CGXA 2CKSA 1HP5A 1KGXA 3CZGA 2GJXA 2V5DA 2DSKA 3UCQA 1PIFA 2VURA 2A3EA 2C0HA 2CEQA 2X2YA 4KH2A 1FHLA 3BAIA 1QVBA 3VIPA 1W1TA 4D71A 1B3YA 1CEOA 1VB9A 2FGLA 5AYBA 2XVKA 4AD3A 2F61A 1G01A 2CITA 3TTYA 1QI5A 1OD0A 2PB1A 1DWHM 1N82A 2VTFA 1DTUA 2UY3A 2WZHA 2VT0A 3E1F1 3AMGA 1QNOA 1EHNA 3ARYA 3VO0A 4QLJA 1MFUA 2XWDA 3VNYA 2JF6A 4KRTA 2D22A 4ZXLA 4JFUA 9CGTA 1YQ2A 3F5LA 2E9BA 5EBAA 1HT6A 1K9TA 1M03A 6A3HA 4AY1A 3RM9A 2CHOA 5E0CA 3W26A 5I5RA 2W5FA 3CZKA 1NOFA 4KGJA 1EDTA 3CUFA 3FN9A 3UR7A 1NWRA 2O92A 3MMWA 1VJZA 2C7FA 1GQKA 3TA9A 4LXFA 4DWSB 3ZSSA 3HJEA 3PBGA 3ALFA 3CBWA 4P7NA 2XIBA 2VCAA 3WH5A 4ZFMA 4BZYA 2X0YA 3BAYA 5A8NA 3GNPA 1H1NA 2ZUSA 2YDSA 3WNOA 3WQ4A 3UR8A 1V3MA 1CDGA 2B31A 2D3NA 3OLDA 3ZT5A 2ZX5A 2WAGA 4UZUA 6CGTA 1OT1A 5A95A 4MJ4A 3L4VA 4JKMA 2XVPA 4AZIA 3T2OA 1ECEA 3T09A 2VRKA 1ISZA 3SCNA 3UG5A 4A4AA 1IT0A 2DSVA 2GDVA 4B15A 3ARSA 4QLKA 4CVWA 4U3AA 1HVQA 4TVCA 1KR0A 3NCOA 1E5JA 1ZL1A 1TUXA 1HKJA 2A3BA 1LQ0A 2EJ1A 4D6HA 1PX3A 3ZJ7A 3D5HA 3AHVA 3WENA 1WNOA 1TVPA 1BG9A 3CZ8A 4PMVA 1MW3A 4AIOA 4TUFA 3VU2A 1AQ0A 1C7SA 5IXEA 2CBVA 1X1NA 1ZB5A 4Q22A 2GVYA 4J3WA 1WE5A 1UD5A 1WKYA 2FHFA 4TXEA 2CPUA 4HZ8A 4H7VA 1LWHA 1ZS2A 3VX1A 1GHSA 1BYAA 4HA3A 1UHVA 4AZCA 1JFHA 2GDUA 4X0NA 2WMJA 1WDRA 1XCWA 3WMSA 4PMOA 4HU8A 1JNEA 3JUGA 5BWFA 1MXGA 4FLRA 4BCEA 1EDQA 2WWDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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