4AZHA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 163
50100150200250300350400020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPTNLEGYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQGLKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
total genus 163
structure length 421
sequence length 421
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azhA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azhA01
1RP9A 3OGSA 3MO4A 3KL3A 3WQWA 3WF2A 4EK7A 3SCSA 4J7RA 2W61A 3RM4A 1LL4A 1QNSA 2E40A 3L4YA 1OGBA 3W0KA 3VDCA 4H04A 3ZJ6A 3WSUA 4PUDA 2UY2A 4W8LA 1E6PA 3VTRA 5BXTA 3LMYA 4AZ5A 3BLPX 2VO5A 3FAXA 3WH6A 1XV8A 2CHNA 4UFMA 1M03A 3OLGA 3VILA 1Q6EA 3NIYA 4W84A 4PTVA 2C8NA 1ZBCA 3TTOA 1V6XA 3VIKA 5D9OA 2QHAA 4UFIA 3WL1A 3CTTA 5AC5A 1XD0A 2ZX8A 1LQ0A 1EH9A 4PMYA 4BQ4A 1UD3A 5FOOA 3ARVA 5CXPA 1HP5A 4GO9A 3B8SA 4ACZA 4WJXA 2X09A 3W6LA 4B3LA 2W62A 1EOKA 4AW7A 3EDDA 4HTYA 4F9JA 1E0WA 4X9YA 1TCMA 4M1RA 2XGIA 1JZ7A 4F9DA 4GXPA 1NWUA 1CGXA 2GVYA 1HJVA 5CPTA 3EBVA 1KWGA 1BYCA 4AEFA 1QHZA 5D9MA 1OSEA 5BYWA 1JF6A 1WDSA 5EMYA 4JHOA 4Z2KA 2WK2A 3PZGA 1XRVA 5IDIA 1B3WA 1B3ZA 2J8FA 2YDQA 2JEPA 4GO8A 2JEQA 2BY0A 2WAGA 4TVUA 2DIEA 5ABEA 2WWDA 4FMVA 1MYRA 2ZIDA 3VU2A 1SYTA 1X6NA 4AD2A 5I23A 3VIGA 4LX4A 2WC7A 5E0FA 1DWGM 4LXFA 1CLXA 2J7EA 3B9AA 1BG4A 4XB3A 2UY5A 4P7QA 4JCLA 3AFBA 1E0VA 1CECA 1WZLA 4M80A 4CD6A 1OWQA 1K6AA 3AIRA 5HDRA 3QHMA 1QBAA 3IJ8A 3RJXA 3GNPA 1BFNA 1UKOA 2XSBA 3AISA 3ZT7A 3GXFA 3SUSA 2CBIA 4L4OA 1AVAA 1CZ1A 3A4WA 3D5HA 5DEZA 4JFSA 1B90A 3VUPA 2QF8A 3SCVA 4H8VA 1E6ZA 1C8QA 3SIMA 2BY2A 3ARSA 2XTKA 3AS0A 1XH2A 3PZMA 3UR8A 1UA7A 2Y4SA 2JIEA 3UESA 2AOSA 1WZAA 2EPKX 1U30A 2BY1A 2VZUA 1GUVA 1FFRA 1C91A 2PF0A 3WD2A 1EQPA 4CVUA 3N18A 1FH8A 4PUEA 1V3MA 1NOFA 3W81A 2CEQA 3EDJA 3PZ9A 2D0FA 3WQ5A 2CITA 3VMNA 4ZE5A 3WKZA 1WKYA 1RP8A 2WVVA 5IHRA 2JE8A 2VC9A 4LGXA 3VIHA 9CGTA 1Q6CA 3GBEA 4AY1A 2G41A 1TVNA 3CPUA 1W1TA 3SCTA 5AYIA 1C7SA 2A3HA 2QPUA 4XZWA 2CHOA 1TG7A 4ATWA 4D6HA 2QLYA 3AIUA 3SUUA 5E09A 4AIOA 5ABHA 3ARXA 2CBVA 4KGLA 1C93A 1GOKA 2J7GA 2WBKA 3ALFA 5A6BD 1J0ZA 1QI4A 1NH6A 1CXIA 4B9ZA 2XPKA 3KZSA 2NSXA 1J9YA 1XCWA 3GYCA 1UKSA 3SURA 4UOQA 2XWDA 3CHFA 3VX0A 5I2UA 1LL7A 2VQUA 2D3NA 2ZOXA 2EO7A 1XH0A 2W66A 4U31A 3FNDA 3AHXA 3AS2A 1AMYA 5BROA 3NCOA 1O6IA 3VO0A 4AZIA 1ZL1A 2WM0A 3ZT6A 4QLLA 2UWFA 3J7HA 3L2MA 2W63A 4UNIA 5A8OA 1JZ3A 3CUJA 3O9NA 3WDIA 1JAEA 1E73M 4JKKA 4WLCA 3CO4A 4GIAA 5ABGA 4JFWA 7CGTA 3AJ7A 1PPIA 4JFVA 1HJQA 4R27A 5E9AA 1HXJA 1ZU8A 3WDRA 1ESWA 1J0KA 5D8WA 2X2YA 4NSBA 1HVXA 4PBGA 5CJ5A 1CGUA 4Z2LA 1JFHA 3SCNA 4UFKA 2WMIA 1R7AA 1HP4A 1FHDA 3W26A 1DWAM 4J3XA 2BY3A 3BAWA 1W3HA 2W4XA 1G5AA 3T09A 2FH6A 1NWSA 4P8WA 1ECEA 1GQIA 5CG0A 1UWTA 4M82A 4UQDA 2J47A 1H4PA 3T2QA 4TUFA 4GPNA 1WO2A 2ZUWA 2E4TA 3II1A 4A4AA 4CU6A 3HN3A 4HA4A 1K9DA 4U3CA 2FGZA 3WDHA 2ZUSA 3IJ7A 4UCFA 3AXXA 4P7LA 1EGZA 3RM9A 4AXNA 4AEEA 2ZUMA 3SCQA 3WBEA 1OT2A 4EKJA 3TP4A 4Z2JA 2D23A 4N0RA 4U33A 4W85A 1VRXA 3CMJA 5CGTA 2WBGA 1VFMA 4PEEA 2XVLA 3BCDA 4J3VA 5JBDA 3OZOA 4OOZA 4UOJA 1K9FA 3AYSA 1DP0A 2RGMA 3QR3A 4PMNA 3WQ4A 5IHSA 4QP0A 1SR0A 4GZJA 4LYRA 1JD7A 5IXEA 4P8XA 5D8ZA 4XX6A 2WVUA 2FHCA 3EMCA 4DUWA 4QCEA 4U5KA 2VVNA 2D0HA 2FH8A 4OIFA 4MNMA 4QLKA 1YHTA 4EANA 3CIVA 4AD4A 2PC8A 3N04A 2GK1B 3GNOA 1FOBA 1PAMA 3UERA 3WH8A 4J3TA 2CETA 3EMQA 1I1XA 3AHVA 3WH9A 2NT0A 3WMSA 1HF6A 1PIGA 4TX8A 1DTUA 1P6WA 3AZTA 3D3AA 1V3IA 2WB5A 3QHNA 5DO8A 1J11A 5E0CA 3N17A 4WK9A 2J62A 4JL2A 4PMXA 4CVWA 3FW6A 1NM9A 2IXUA 4X0VA 3W24A 4PMUA 1E6XM 3ARYA 1UOKA 2WLZA 1QHOA 3RDKA 2J79A 1R8LA 2DH3A 1D2KA 2JALA 5D9PA 3WEOA 1SMAA 4UQAA 1GOWA 2W91A 3PZOA 3VKKA 1H09A 1X1NA 1MXDA 1H3GA 1JF5A 3WDPP 3F5JA 2WSPA 2WMIB 3WD4A 2C7FA 3U5YA 1G0CA 2DDXA 8A3HA 2EPMX 2VCCA 5FD0A 4WKFA 3ZIZA 4ZE4A 2WXDM 1JDDA 3FY1A 2WVSA 1GQJA 3RJYA 3VX1A 3CUFA 4NRSA 3ZJ8A 1ODUA 1BVZA 2VX7A 4FLOA 3VGBA 2EEXA 4CGTA 4BA0A 5AY7A 4PMZA 1Z32X 1WDRA 3VNZA 4NI3A 3CZGA 2YBUA 4AISA 3ZR6A 4CU8A 2J75A 3VGFA 1I1WA 4UOZA 5DMYA 3MUZ1 4KGJA 2X05A 3FHQA 5HNNA 1PX4A 4DM1A 2BVTA 4C7GA 5CZKA 4GQRA 3K8LA 5M3WA 2ZX5A 2DSZA 1BHGA 1UR8A 2ZUTA 2E9LA 2CCRA 3MMWA 3T2OA 4KWUA 2WNWA 3OB8A 4ATDA 4RE3A 2XFFA 2GJXB 1B0IA 2Y8KA 1BYDA 4GKLA 1DWIM 3WMCA 4M56A 3RPMA 2W5FA 2OO2A 3OLEA 4AZ6A 4MNKA 3PZTA 2O92A 4JZ5A 3NJ3A 3IAPA 2QPSA 1AQ0A 2VNCA 5BXPA 2BXYA 2E3ZA 2E8YA 4HA3A 1MQQA 1UZ4A 3DECA 3DYPA 1V0LA 1XH1A 1HKKA 2WMFA 1CYGA 3WF4A 5CQ1A 1GORA 4ZEPA 1UD4A 1KWKA 1NOWA 3IJ9A 3WDQA 2DSWA 2ZE0A 1QNRA 3NSXA 1KXVA 1UYQA 1OIMA 5GQBA 4AZBA 2WMKA 3S2CA 3U7BA 4F79A 3VDBA 2OYLA 4GINA 3AZRA 2FHBA 1NP0A 2WKGA 1PEZA 3WH7A 1GCYA 4UFHA 1D3CA 3CLWA 4OBSA 1DHKA 1E6RA 3SUWA 1WCGA 1ZBVA 2VRKA 1M53A 3AIEA 4P7OA 1LF1A 3OLDA 2CERA 1J10A 4J3WA 2E0PA 1GVIA 1ISVA 1JFXA 4LPCA 3UEQA 2XHYA 4FLQA 2ZXDA 1BPLB 1CWYA 3PZIA 1SMDA 2G4FA 4AZHA 2G3NA 3KL5A 3BGAA 4MAVA 3SCOA 3THCA 3W6MA 1RPKA 2GJPA 1GNXA 1TR1A 1E43A 3AICA 1J0IA 5KZ6A 1UWUA 4PCTA 3AS1A 1JI2A 1XYFA 5FKYA 1GOOA 2D22A 1Q6FA 1BYBA 3WY1A 1VBUA 3VGEA 2DT0A 5ABFB 4FZOA 1BQCA 4D72A 1PIFA 2C0HA 1PX3A 4W8AA 4X0NA 3AHTA 1J0JA 3ZMRA 2F61A 1BF2A 2VX5A 4UQEA 1KCKA 2Y24A 1OD8A 1JGIA 5HPOA 3K4DA 3WF1A 2CESA 3WD1A 2ZXQA 1UR0A 1MW2A 4N42A 2OLHA 4NF7A 1WZMA 3WNKA 4TTGA 5I24A 1CNVA 1E9LA 2WLYA 3EDFA 2YKKA 4P7RA 1US2A 4KH2A 4D1IA 3M7SA 3KL0A 3MMDA 2B31A 1UWRA 3PBGA 2O9RA 2YDRA 4L4PA 2DT2A 1KQZA 2QV4A 1XSKA 2V3DA 2O9PA 1W9UA 2O9OA 4MDPA 4JFTA 3VIFA 4OUEA 4F8XA 1CENA 3W53A 3W38A 2J7BA 7TAAA 2DSKA 3MUY1 3K4AA 1GVYA 1CXKA 1BLIA 1UQYA 1ZS2A 5I78A 3BAKA 1V3KA 2JIWA 4M8UA 3GTNA 3ZSTA 1TZ7A 3EDEA 3BMVA 4HMEA 4D6IA 3NUKA 4GI8A 3L4TA 2XSAA 3WH5A 1KGUA 1NWTA 2VUYA 3JUGA 5A8NA 4IM4A 2VZSA 4B16A 3KE0A 3MSGA 2WSKA 2WVTA 1EXPA 2ZWYA 2BHZA 4WKAA 3WNLA 4QCFA 1QI3A 1Q4NX 2IXVA 1E3XA 2XGBA 5CSUA 1A3HA 4B9YA 2NT1A 3N12A 4AIUA 4DWSD 1V0KA 5IFTA 1W3LA 1MWOA 3AMGA 4GQQA 3TTQA 3GH5A 4H7VA 2V3FA 2YL8A 4RE4A 3OGVA 4ZXLA 1B1YA 2XIBA 4AZCA 4J28A 2DIJA 4HOXA 3WUBA 3BCFA 3I3EA 2J7CA 1UD5A 3PZNA 3T0DA 3DHPA 2EPNA 3RILA 4KRUA 2DH2A 2G3IA 4D6EA 1KFWA 5A6SA 3N1AA 4NZCA 2OSXA 3HJEA 1QI2A 3VM7A 5IFPA 4P7NA 3AMKA 3CZLA 1PBGA 1W1VA 2V3GA 4Q7NA 5BRQA 3EDKA 1JNDA 5M03A 2EXOA 1MW1A 3CZJA 3PN8A 3WEZA 1KBKA 3CHDA 1JI1A 3AIBA 2E8ZA 2D2OA 3O2LA 3OA5A 5A8MA 2VCAA 3U57A 2BV9A 2YOCA 1A47A 3WN6A 6A3HA 5BCAA 3TONA 5JBEA 1KXHA 3ZJKA 3APGA 4P8UA 3WNNA 5HXMA 2XVNA 1OM0A 2GK1A 4S3KA 3WFLA 1J01A 4PMDA 3SEPA 2WCAA 1D7FA 4D6DA 1MQRA 2F8QA 1B30A 5A6AA 1E4MM 3THDA 4LQ1A 1JZ4A 1HNYA 2J77A 2VR4A 1W9BM 1B31A 1CXEA 1C8YA 1F4AA 4MJ2A 4ML4A 4URIA 1ZJBA 4AMCA 1QW9A 2VZOA 1JIBA 3GH7A 2A3BA 1WE5A 1JZ5A 3BAXA 4HPHA 2J4GA 2VRJA 4PSRA 2ZX7A 5LA0A 3ZOAA 4HOWA 1PZ3A 2VMFA 2XVKA 4P8VA 4XZBA 1JL8A 3VPLA 1KXTA 5I77A 2BVDA 2PWDA 5LYRA 1HJXA 4CKQA 1LWHA 1W2PA 3OZPA 3IANA 3UG5A 1GHRA 3IAQA 4DUXA 2Y5EA 4W87A 3WEMA 3BAJA 3MMUA 3WDJA 1GPFA 3U7VA 3BAYA 3A6OA 2IUZA 2JF6A 1GHSA 1NOUA 1UKQA 5BXRA 4W5UA 1NARA 1AQMA 5FL0A 4PYSA 1QPKA 1E55A 1W3JA 4W88A 1UR1A 2A3EA 1C7TA 1W9VA 5I0DA 1JYXA 3CZ8A 2X0HA 3B9EA 1OT1A 2YA0A 4OJYA 2EPOA 2X0YA 3M07A 3ALGA 1L0PA 1E40A 4JCMA 1WPCA 2XIIA 1UWIA 1VJSA 3GBDA 4CU7A 3CH9A 4W7UA 1V6UA 3L4XA 4AZCB 4B15A 1U2YA 2VZTA 3PTQA 2PWEA 1GW1A 3SCPA 4BQ2A 4OBRA 5BRPA 3L2LA 1UKTA 2CPUA 1ZBKA 3NYDA 1E4LA 2Y8VA 1M04A 3TOPA 1PJ9A 3AROA 5CLWA 2GJXA 3F5KA 1HVQA 3MUAA 1V02E 5DT5A 2WHMA 4FF5A 1EOMA 1JNEA 4GI6A 1E4IA 3VIIA 3NSNA 3VIOA 4EE9A 2EJ1A 1ZB5A 5A6BA 1E71M 3VD4A 2UY4A 2GSJA 2ZXBA 1J0HA 4D1JA 2XWEA 4PTXA 3AMCA 4U2YA 2ZUVA 2YL5A 4U5IA 3AHYA 3WNOA 2X8RA 4NRRA 3AYRA 2E9BA 2WANA 3QHOA 4CD4A 3AMDA 4GZEA 5TD4A 2WC3A 4UTFA 1BVNP 5HOSA 1BAGA 2WYSA 1H2JA 4AC1X 3QOMA 4J27A 1UH2A 3CBWA 2OZNB 1HJSA 3GXIA 4EAMA 4CCEA 4UZSA 2YJQA 1V02A 5GNYA 3ARZA 1JZ6A 5FIPA 2WHKA 3GDBA 2DEPA 1WP6A 4GI9A 1TMQA 2CKSA 4MB3A 2XG9A 3WQVA 2JNKA 4ZXOA 1ZBWA 2XVPA 1KQYA 4CUCA 2BXZA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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