4AZ5A

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 172

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
434
structure length
434
Chain Sequence
NEKLAKKKIVSIDAGRKYFSPEQLKEIIDKAKHYGYTDLHLLVGNDGLRFMLDDMSITANGKTYASDDVKRAIEKGTNDYYNDPNGNHLTESQMTDLINYAKDKGIGLIPTVNSPGHMDAILNAMKELGIQNPNFSYFGKKSARTVDLDNEQAVAFTKALIDKYAAYFAKKTEIFNIGLDEYANDATDAKGWSVLQADKYYPNEGYPVKGYEKFIAYANDLARIVKSHGLKPMAFNDGIYYNSDTSFGSFDKDIIVSMWTGGWGGYDVASSKLLAEKGHQILNTNDAWYYVLGRNADGQGWYNLDQGLNGIKNTPITSVPKTEGADIPIIGGMVAAWADTPSARYSPSRLFKLMRHFANANAEYFAADYESAEQALNEVPKDLNRYTAESVTAVKEAEKAIRSLDSNLSRAQQDTIDQAIAKLQETVNNLTLTP
50100150200250300350400400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTI5 (327-330)TI'3 (367-370)TIV6 (225-228)S3 (237-239)TIV1 (181-184)TI1 (182-185)TI2 (183-186)S1 (187-193)TIV2 (193-196)TIV3 (194-197)AH1 (201-214)TI'1 (239-242)S2 (218-224)TIV4 (222-225)TIV5 (224-227)AH2 (246-260)TI3 (263-266)S4 (242-244)AH3 (271-284)S6 (314-317)TIV11 (316-319)S5 (287-294)TIV7 (293-296)AH4 (299-308)TIV8 (294-297)TIV10 (310-313)TIV13 (361-364)AH5 (331-348)TIV12 (349-352)TII1 (348-351)S8 (354-358)TIV14 (363-366)S9 (411-415)AH7 (390-408)TI6 (364-367)TI7 (365-368)TIV16 (381-384)TI10 (431-434)TII2 (387-390)TI8 (416-419)TIV17 (418-421)S7 (320-326)AH6 (371-376)TVIII1 (232-235)3H2 (421-423)TI9 (425-428)3H1 (377-379)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
total genus 172
structure length 434
sequence length 434
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4az5A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4az5A01
1KXVA 1UR2A 1J01A 4HU0A 3L4VA 4M8UA 1E1FA 3WNOA 2E3ZA 1UD6A 2J7CA 3FXYA 4UZUA 1WDPA 4ZFMA 3BAJA 3L2MA 3WNKA 1HKJA 3EMZA 4U2ZA 3AIWA 1SMAA 2WC4A 4UFLA 4HP5A 5D9PA 3UG5A 4PMUA 3QHNA 2CHOA 3AHTA 4U33A 4WK9A 3UCQA 3ARYA 4AYSA 3W6MA 1PPIA 4OIFA 1M03A 3WEZA 1WZMA 2OWXA 3OBAA 2QF8A 2VNCA 1EH9A 1V6VA 3B9EA 1XCWA 4J3UA 4EKJA 4FMVA 5I24A 3AMGA 4IPLA 1UWQA 4P7NA 2E9BA 2BHUA 2XWEA 1PX4A 5CJ5A 3AIUA 2HVMA 3AHVA 2AAAA 3QOMA 1GQKA 5D4YA 4WSKA 1KQZA 2A3HA 1E3ZA 3QOKA 1SR0A 1LG1A 1WO2A 3OLDA 3ZIZA 1BVZA 3SCSA 1QI3A 1MXDA 2J7EA 4DM2A 2WPGA 1EIBA 1NARA 3PZQA 2DT3A 2C7FA 1A47A 2EXOA 4CN1A 1KFWA 4QLJA 1EO5A 4R5EA 3PHAA 4W8LA 3AZSA 3SCNA 1HT6A 4HMDA 5A6AA 5C70A 1B3XA 1JNEA 2VUYA 3VNYA 3N1AA 1I75A 1G01A 1UWIA 1ISXA 3MANA 1E0XA 1CTNA 4MAZA 3CUJA 2WCAA 4TTUA 3KWXA 1JFXA 1UUQA 3VGEA 1PX8A 2O9RA 1UKOA 5CGMA 1ZJBA 4B16A 2V38A 3VGGA 1KXQA 4XZWA 1G0CA 4JKKA 3AS2A 1C8YA 1WE5A 5M03A 5CSUA 1GOKA 3BCFA 3EMQA 4PTVA 1BGAA 3FY1A 2PWHA 3CH9A 4RE4A 5GNXA 3DECA 3FN9A 5BXSA 3CIVA 1KBKA 3OGVA 1JD7A 2ZUWA 2OZNB 1MW1A 1XSKA 1JDAA 3DYPA 1TMQA 5LA2A 4IUGA 5CQ1A 2VZTA 4S3JA 1JGIA 1GOIA 4DWSB 4H8VA 5E70A 3A4AA 1R87A 1UKTA 2YIHA 2EO7A 3NDYA 2ZE0A 1AQHA 2B31A 3AIBA 3WKZA 1QI0A 4YHEA 1GPFA 3OG2A 3DHUA 1QHOA 5A8MA 3VMNA 4X0NA 3T2PA 1E3XA 2WBKA 2WZEA 1I1XA 3RM4A 2E9MA 1W9BM 1EQCA 1E5JA 3U5YA 2X8RA 5AC5A 1ODZA 2FHCA 3IJ9A 2G3MA 4JCLA 1BLIA 4PMNA 1CBGA 1C91A 3UR8A 5HPCA 1YHTA 2YDRA 1J0JA 2PWEA 2IXUA 2EPLX 1E6ZA 4RL3A 3OA5A 4TUFA 3VKKA 1H49A 1DWJM 3GXMA 1OBAA 5ABFB 3WDPP 5ABGA 4NF7A 1JAEA 1OT1A 2CBUA 4UTFA 4AD4A 2DT1A 2VJXA 3OZOA 2X05A 3CMJA 2DSVA 5E09A 2BXYA 2RGMA 3WH8A 5BYWA 2VURA 5C71A 4GZEA 2J7GA 2YLAA 2D1ZA 2PB1A 4NSBA 2Y8VA 4UQDA 1VFFA 2BXZA 3N13A 3SCRA 1EDQA 3ZT5A 3AHYA 2YDSA 1OWQA 3PZMA 1Q6DA 2BV9A 4Q7NA 3WY1A 3EYPA 1HF6A 1JXJA 4TVCA 4EE9A 2YKKA 4F9JA 3T08A 5A6KA 1J11A 3WBAA 3ARRA 4C7DA 4AZHA 1J9YA 1W3JA 1OD0A 2X0YA 2E8YA 1LJYA 3BMVA 1ITCA 1O7AA 5GNYA 3SURA 1D3CA 2D3LA 4OOZA 4JFWA 1V3IA 1GHRA 2DT2A 2Y5EA 3SUVA 4UOQA 4W7VA 5DF0A 2F2HA 3W28A 2WLZA 3VMOA 4CCEA 2PBGA 1US2A 2WM0A 1DP0A 4CCDA 5I78A 3WH9A 1OM0A 1TG7A 2VL4A 3BGAA 5I79A 1C7SA 1E9LA 3PTKA 1VBUA 1VEOA 1JD9A 3GNPA 5EFFA 1BF2A 2CERA 4AD0A 1TVNA 2BY0A 1UG6A 2WHLA 2JNKA 2DSUA 4CD5A 3VOCA 1IT0A 2WLYA 1DEDA 4P8WA 1BPLB 1H09A 4M24A 3EDDA 1MYRA 2W66A 2VTFA 5BROA 1UD8A 1XSIA 2GK1A 2VQTA 3W25A 4LX4A 3ZMRA 3CUFA 1E6RA 2QMJA 2ZUTA 5KEZA 1QW9A 3EDFA 1KWKA 3AMDA 1QI5A 3L2LA 3WUBA 3POHA 2J74A 4IPNB 3AXIA 3DC0A 4C7FA 2VR5A 2WMGA 1GCYA 1V3JA 3VDAA 1DTUA 3NUKA 1H4PA 3LMYA 1QNOA 2VX4A 1EDGA 1KBBA 2WZIA 4ZE5A 2ZIDA 2YA1A 4HA3A 1KGUA 3ZSTA 3AYRA 1UKPA 4AD2A 2CEQA 1OGBA 1CXKA 4RE3A 1CECA 3VO0A 3BXWA 4GQQA 1CZ1A 7CGTA 3VINA 2EJ1A 3GH5A 1E40A 5AYBA 1H2JA 1E15A 1QBAA 2VZSA 1V6XA 1FA2A 4UFJA 3GBEA 1HNYA 1VFUA 1UHVA 3QHMA 4KMQA 1V0KA 3BSGA 3GXFA 3EDJA 1HX0A 2WKGA 5D8ZA 4OOUA 3NCOA 1W3HA 3VIOA 1K6AA 1XYFA 3ZJKA 1UKSA 2AOSA 4W93A 4AIUA 4XB3A 3CO4A 1JDCA 1C8XA 1MFUA 3WF1A 2DH3A 4H8HA 1FFRA 2BY3A 2W62A 2CKRA 4WLCA 3AXXA 4DUXA 1CGTA 3W26A 2XFFA 1LLOA 4PTWA 1Q6CA 3PZ9A 4GIAA 3TP4A 1HKMA 2WW5A 4PTMA 1PIFA 1TR1A 1C7TA 3WN6A 2IXVA 3VVGA 1H3GA 3DYOA 1EOKA 4TXEA 1W3KA 2G41A 3GM8A 2WKLA 3SUWA 3F5KA 4YPJA 2D2OA 3FHQA 1E71M 3FHAA 2XSAA 4GI8A 1S46A 4H7VA 3ARXA 2E4TA 1J0KA 1YQ2A 2DEPA 2ZXQA 3SCUA 1UZ4A 1DWFM 1C92A 4JAWA 3CUGA 3WD3A 1GQIA 5M5DA 4GO8A 3AS0A 3AHXA 4PRWA 3ARVA 1E4IA 3T2QA 1BQCA 1G9HA 2Z1SA 1CXHA 2A3EA 2CESA 5C8BB 3VGHA 4CN4A 4DWSD 3A4XA 4PMVA 3ZR6A 7TAAA 5HPOA 1ODUA 1UWRA 1VFMA 1B31A 3CZLA 5A6BA 4D6DA 4KWUA 3WD4A 2J7BA 4UCFA 3PBGA 4D1IA 4MB3A 1J0IA 1GJUA 1XYZA 1PJ9A 4J3TA 1UKQA 5CLTA 3WH7A 1B0IA 1VFOA 1Y7VA 1NWUA 2XFYA 4ZENA 3UEQA 2PWFA 1E6NA 4FK9A 5KZ6A 3S6TA 2X0HA 2FH8A 5AYIA 1NWRA 1QW8A 4WKHA 4U5IA 1NP0A 4LQ1A 4OBSA 4GKLA 1VB9A 3W4RA 1TVPA 4JFTA 1HJSA 1JZ6A 4A3YA 3RPMA 3VDCA 1TUXA 5CPSA 4QFUA 1J10A 3ZSSA 1XV8A 1JYWA 5ECUA 2VZUA 3AMLA 2MANA 2YL5A 1X6LA 2CHNA 2XVPA 3WL0A 3NSMA 2J79A 2ZX8A 4HZ7A 2AMGA 4FLRA 2BVDA 3AJ7A 4NI3A 4NRSA 4U5KA 3AIEA 2NSXA 2CBVA 1EA9C 1MW3A 1VBRA 3THCA 4LYQA 1R8LA 2FGZA 5GQBA 3GBDA 2WWDA 4OJYA 3AIVA 4GZIA 2QHAA 2OSWA 1E6QM 3KEHA 1C3FA 2XVKA 1JYVA 2W67A 1UQYA 4CD6A 3ARWA 5A6JA 1SMDA 1BYDA 3UESA 5FL1A 1TE1A 2YBTA 1FFQA 1HN1A 3SIMA 1UD5A 1FHLA 1VENA 1ZBKA 1WZKA 1HVQA 2GVYA 3KL3A 2G3NA 3WFLA 3AMKA 3BMWA 3VIGA 2WB5A 2VR4A 4HZ6A 2HISA 4URIA 1FHDA 4AZCA 2WYSA 4EAMA 4PSRA 3OLGA 1M7XA 2YA0A 4QCFA 2Y24A 1NP2A 2GJRA 3GXDA 1X6NA 3WMCA 1LWHA 1JI2A 4GO9A 3WD0A 4CKQA 1QVBA 1WZLA 1BYCA 1ISZA 5GNZA 5IHRA 1OCQA 1VJSA 1GOMA 4UQEA 4TX6A 1B1YA 1XD1A 4BA0A 2XVLA 1LL7A 1OGGA 2XSBA 3VD4A 2ESCA 1UH3A 4Z2HA 2WC3A 5BXRA 1UWSA 4OUEA 3MV11 3CZJA 2CITA 3VGDA 3VIMA 4Z2JA 1XCXA 5D9NA 5A6SA 1W2VA 4W7UA 3GH7A 1HJUA 1ZL1A 3UR7A 1JXKA 2NT1A 1V0LA 3HU7A 4LPCA 1PX3A 2OWWA 1HP5A 1HKIA 2VCBA 4AD3A 2OO2A 4B3LA 1FP9A 4W85A 2JEPA 3OZPA 4W89A 3GH4A 1QHPA 1ISWA 3VD5A 1LL4A 3W81A 1R7AA 2XG9A 1J0HA 4HMEA 3WENA 3WEMA 2WMJA 4JHOA 3IJ8A 1XC6A 4CVUA 1BFNA 1BYAA 3PZOA 2CXGA 3T0DA 1XSJA 5A95A 2W4XA 5FL0A 3VDHA 1WDSA 2PF0A 4GXPA 1EDTA 2V5CA 2VI0A 3VX1A 3VD9A 5HNNA 3VIHA 3VIFA 4ACZA 4NRRA 3BLPX 5M3WA 2ZUSA 4ZEPA 1OINA 3VGFA 3CZKA 4W7WA 1XH2A 2VRJA 4AISA 3CHCA 1HJXA 2D0GA 4D71A 8CGTA 1B3WA 1RH9A 1BGGA 4PSPA 4TX8A 2YDQA 6TAAA 2VC9A 3AZTA 1V02E 5EBAA 1Q6GA 1VAHA 1HKKA 3L4UA 1MXGA 2DSKA 1AMYA 1JZ8A 2XUCA 3GTNA 3M46A 3L4TA 5FKYA 3WFZA 2XIBA 4UQCA 5E6YA 5CGTA 1VIWA 4D6JA 4TVUA 1E4MM 5CPTA 5EFDA 4PMXA 4GQRA 4E2OA 3W38A 4JFVA 4YHGA 2OYLA 5IFTA 2GDUA 2VOTA 4DWSC 1E6PA 2YL9A 2EPOA 2XJ7A 2WC7A 1FH7A 1GOOA 2WMHA 4PMQA 4Z2LA 1V03A 1WP6A 3AYSA 4BS0A 4TTGA 2D24A 1HJQA 2JIEA 3MO4A 2Y8KA 1AVAA 4UZSA 5BWFA 2XVNA 2J7FA 3S2CA 3AS3A 1BSIA 1J18A 4CVWA 4GI6A 1UR0A 3O6AA 3TA9A 4F66A 1OIMA 5LA1A 2EPKX 1NOFA 3BAKA 4ATWA 1B3VA 1KR1A 4QP0A 1QHZA 1FOBA 4D6FA 3WQ6A 3II1A 2GJXA 3AIRA 4BQ5A 1E0VA 3EDKA 5FOOA 1LG2A 4Y7EA 2DDXA 3BLKA 1VEMA 3WH5A 5JBEA 4QCEA 3N11A 2XTKA 4W5ZA 2V5DA 1UR9A 4OKDA 3SCPA 4UOJA 4Z2GA 3TOPA 4AIOA 1QNSA 1CNVA 1C8QA 2FH6A 1OB0A 1AQMA 3BAWA 3MUIA 3I3EA 4DUVA 1IV8A 5LA0A 2CKSA 1ZB5A 1V3HA 2J75A 4KGLA 2W63A 2UY4A 4BQ4A 5A69A 2VX7A 5EMYA 2CNCA 6A3HA 3AFBA 4JCMA 1CGXA 1C90A 2VVNA 3BAXA 5JBDA 2XGBA 1EXPA 1KCKA 1UD2A 2WMKA 4D1JA 5CLWA 2UY5A 3L4YA 1FP8A 1EGZA 3W53A 4Z2IA 1QNPA 2BVYA 5A2CA 1Q6EA 3WNPA 1HXJA 1V3LA 1UQZA 3W6LA 1UA7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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